Life Sciences Université Paris-Saclay

La greffe du cœur est la seule véritable option thérapeutique pour améliorer la qualité et l’espérance de vie des patients atteints d’une insuffisance cardiaque sévère. Malheureusement, le nombre de greffons cardiaques disponibles est encore trop faible par rapport à une demande toujours croissante.

Il existe pourtant une solution potentielle à cette carence : l’utilisation de greffons provenant de donneurs décédés après arrêt circulatoire (DDAC). Comme les organes DDAC sont obligatoirement sujets à une ischémie chaude avant leur prélèvement, les inquiétudes liées aux dommages des tissus et à des greffons de moins bonne qualité persistent. Dans ce cadre, des stratégies de cardioprotection sous forme de reperfusions spécifiques prennent toute leur importance pour préserver la qualité du greffon lors du prélèvement de l’organe.

Dans une étude publiée récemment dans American Journal of Transplantation, le département de chirurgie cardiovasculaire de l’Hôpital Universitaire InselSpital de Berne (Suisse) en collaboration avec des chercheurs de l’unité Inserm/UPSud UMR-S 1180 (Faculté de Pharmacie UPSud, Châtenay-Malabry) ont étudié les changements mitochondriaux lorsque des stratégies en reperfusion sur greffons sont effectuées dans un modèle ex vivo de DDAC chez le rat. Ces stratégies de reperfusion sont : l’hypothermie modérée (30°C, 10 minutes), le post-conditionnement mécanique (2 cycles de reperfusion-ischémie, 30 secondes) et l’hypoxie (pas d’oxygène pendant 2 minutes).

Ces trois stratégies affectent les mitochondries de façon distincte (voir Figure). Les trois améliorent la performance cardiaque après une période d’ischémie chaude, le couplage entre la consommation d’oxygène et le travail cardiaque fourni et le contenu tissulaire de l’ATP. De plus, l’hypothermie augmente également le contenu en phosphocréatine dans le cœur, tandis que le post-conditionnement mécanique stimule l'activité du complexe 1 de la chaîne respiratoire et réduit la libération du cytochrome C (marqueur des dommages mitochondriaux). L'hypoxie, quant à elle, augmente l'expression de Pgc-1α (régulateur principal de la biogenèse mitochondriale).

Avec cette étude, les chercheurs montrent qu’en effectuant des changements physiques pendant la reperfusion des cœurs DDAC, il est possible d’améliorer leur fonction post-ischémique en conjonction avec une amélioration des fonctions mitochondriales. Dans l’avenir, des études sur le rôle de la mitochondrie dans la protection cardiaque devraient contribuer à identifier de nouvelles cibles thérapeutiques et développer des stratégies de reperfusion efficaces afin de faciliter la transplantation cardiaque avec DDAC.

Contact : anne.garnier@u-psud.fr

Les récepteurs transmembranaires de type tyrosine kinase appelés EPH (pour Ephrine), interagissent avec des ligands de type contre-récepteurs membranaires ou "éphrines" dans les contacts cellules-cellules, et jouent des rôles importants dans le développement et le cancer, mais également dans les fonctions plaquettaires et l’arrêt du saignement.

Dans une étude parue dans Blood, Marijke Bryckaert et ses collaborateurs (UMR-S 1176 INSERM/UPSud, Le Kremlin-Bicêtre) montrent pour la première fois que deux patients (frère et sœur) présentant des saignements récurrents (malgré un compte plaquettaire normal) étaient homozygotes pour une mutation faux-sens (Arg745Cys) dans le domaine tyrosine kinase d’EPHB2. Surtout, ils démontrent que les fonctions plaquettaires (agrégation, activation de l’intégrine aIIbb3 et sécrétion) activées par les récepteurs RCPG (récepteur couplé aux protéines G) de type récepteurs de la thrombine ou d'ADP, ou le récepteur d'adhérence-activation au collagène, GPVI, sont fortement affectées. Les étapes initiales de la signalisation GPVI (phosphorylation de Lyn, Syk et FcRg) sont très affectées. En revanche, la signalisation initiale des récepteurs RCPG est normale (PI3K, Ca2+), mais la signalisation distale est diminuée, notamment la phosphorylation de Src. Enfin, la surexpression de EPHB2 (WT) et mutée dans des cellules RBL-2H3 (cellules leucémiques basophiles de rat) exprimant GPVI confirme que l’autophosphorylation du récepteur est affectée chez le mutant. À noter par contre que Arg745Cys n'inhibe pas le clustering de EPHB2 par son ligand l’éphrine suggérant fortement que la mutation n’interfère pas dans le contact plaquette-plaquette. Ainsi cette nouvelle pathologie plaquettaire héréditaire montre que le récepteur EPHB2 joue un rôle important dans les fonctions plaquettaires via un “cross-talk” entre la signalisation GPVI et RCPG.

Contact: marijke.bryckaert@inserm.fr ou jean.philippe.rosa@inserm.fr

La chimiothérapie exerce une toxicité directe sur les ovaires en diminuant le stock de follicules primordiaux. Cette baisse de la réserve ovarienne et éventuellement de la fertilité est observée après l’utilisation du cyclophosphamide (Cy), un agent très gonadotoxique couramment prescrit dans le traitement du cancer du sein. Récemment, un nouveau mécanisme de déplétion folliculaire induit par le Cy appelé «effet burn-out» a été proposé. Il se traduit par une activation massive des follicules au repos qui sont ensuite détruits. L’équipe du Dr Binart de l’unité Inserm/UPSud UMR-S 1185 (Le Kremlin-Bicêtre) a récemment émis l’hypothèse qu’un traitement par l’hormone anti-müllérienne (AMH) normalement sécrétée par les follicules en croissance, pourrait limiter la perte folliculaire liée au Cy. Ces résultats ont été publiés dans le FASEB journal.

Des souris pubères ont été traitées par des injections de Cy en association, ou non, avec des injections d’AMH recombinante. L’analyse des ovaires une semaine après les injections a confirmé cet effet « burn-out ». Le nombre de follicules primordiaux des ovaires de souris traitées par AMH et Cy était plus important que celui des souris traitées par Cy seul, démontrant le rôle protecteur de l’AMH sur la perte folliculaire induite par le Cy. Un des mécanismes impliqués dans l’inhibition du recrutement folliculaire exercée par l’AMH est proposé et ferait intervenir l’autophagie.

L’AMH recombinante pourrait alors être utilisée chez les jeunes filles ou les femmes avant 40 ans, quelles que soient leur réserve ovarienne ou leurs pathologies, afin de limiter la gonadotoxicité de la chimiothérapie et ainsi favoriser les chances de grossesses spontanées à distance des traitements.

Légende de la Figure : L'AMH limite la déplétion folliculaire induite par le cyclophosphamide dans l'ovaire.

Des souris adultes reçoivent une injection intra-péritonéale de PBS (contrôle) ou de cyclophosphamide (Cy) avec ou sans AMH recombinante. L’analyse histologique des ovaires 8 jours après l'injection de Cy indique une augmentation du nombre des follicules en croissance (flèches blanches) et une réduction des follicules primordiaux (flèches noires) et montre une réversion de cet effet après traitement par l’AMH.

Contact : nadine.binart@inserm.fr

Dans Le Figaro du 14 septembre, le Dr Laelia Benoit, pédopsychiatre, chercheuse Inserm au Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP UMR-S 1178 UPSud/INSERM/UVSQ, Equipe santé mentale et santé publique), explique que « pour aller plus loin dans les connaissances de la phobie scolaire, dans le cadre de nos projets de recherche menés à l’Inserm, nous conduisons actuellement une enquête nationale qui vise à évaluer notamment les conséquences sociales de la phobie scolaire sur l’emploi des parents, les prestations de soins non remboursées ainsi que les frais restant à leur charge ». Et d’ajouter : « Parcours Phobie Scolaire 2018 est une recherche citoyenne et participative initiée par le CESP avec l’Education nationale et l’association de parents Phobie scolaire ».  

Voir également l'article du journal Le Monde du 16/09.

Contact : laelia@benoit.nom.fr

Cette journée est organisée par le pôle Systèmes et Matière Complexes (SMC) du département de Physique des Ondes et de la Matière (PHOM) de l’Université Paris Saclay, conjointement avec les labex PALM et Nanosaclay.

Héctor Valdivia est professeur de médecine interne et directeur du Centre de recherche cardiovasculaire de l'Université du Wisconsin. Sa recherche se concentre sur l’homéostasie du calcium intracellulaire et les canaux calcium ainsi que les mécanismes qui conduisent aux arythmies calcium-dépendantes. Il a une approche multidisciplinaire (moléculaire, cellulaire et sur animaux intacts) pour une étude intégrée des signaux calciques physiologiques et physiopathologiques dans le cœur.

Il est accueilli en France à l'Université de Paris-Sud par Ana María Goméz, directrice du Laboratoire de Signalisation et Physiopathologie Cardiovasculaire (UMR-S 1180 INSERM/UPSud).

Lors de l’événement du 16 octobre, le directeur de la Commission franco-américaine, M. Roujou de Boubée, présentera la Chaire Tocqueville-Fulbright. Le professeur Étienne Augé, vice-président Recherche & Innovation de l'Université Paris-Sud, et le professeur Marc Pallardy, Doyen de la Faculté de Pharmacie, introduiront la leçon.

La leçon sera donnée en anglais et sera intitulée “That which does not kill us makes us stronger: the hidden salutary effect of scorpion toxins”.

Lieu : Faculté de Pharmacie de l'Université Paris-Sud (Salle EH25/27) à Châtenay-Malabry
Dete et heure : le 16 octobre 2018 à 11h

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iGEM, crée en 2004 par la MIT, est une compétition internationale d’étudiants ayant pour but de promouvoir une nouvelle discipline, la Biologie de Synthèse. Cette année, l’équipe GO Paris Saclay encadrée par des chercheurs de l’I2BC est constituée de 12 étudiants dont des mathématiciens, biologistes et pharmaciens. Leur objectif est de dégrader des médicaments anti-cancéreux dans les eaux usées des hôpitaux en seulement 3 étapes (1) une entrée efficace de ces molécules dans la cellule bactérienne, via des canaux et des transporteurs spécifiques. (2) Une dégradation appropriée par des enzymes (e.g. carboxypeptidase G2, cytochrome P450…) et (3) le fonctionnement à long terme du bioréacteur à travers une population hétérogène de bactéries à comportement bimodal, « à cellules souches », réduisant le besoin d'un réensemencement régulier.

Cancer Campus, adossée à Gustave Roussy (centre de lutte contre le cancer à Villejuif), est une association en charge du développement d’un cluster dédié à l’innovation en santé et oncologie. L’une de nos missions est le soutien à la création d’entreprises en santé avec des applications en oncologie. 

Pour ce faire, Cancer Campus et Creative Valley lancent l'appel à projet de la 5ème édition du programme OncoEntrepreneur, visant à sensibiliser et à accompagner tout porteur de projets vers la création d’entreprise biotech, medtech et services d'aide aux patients.

Les deux partenaires se rendant compte des formidables opportunités actuelles dans les secteurs associant santé et numérique, leur association vise à promouvoir cette alliance santé et numérique dans des projets d'entrepreneuriat. C'est ainsi qu'en collaboration avec Microsoft, nous lançons également la toute première édition du programme OncoNumérique, une déclinaison d'oncoEntrepreneur dédié aux projets associant TIC et santé.

Ces deux programmes offrent aux porteurs de projets des mastersclass spécialisées avec des intervenants de qualité, un coaching personnalisé pour chaque projet, une proximité avec les patients et cliniciens et une présentation devant un comité d'investisseurs ainsi que le label « ONCOENTREPRENEUR » ou « ONCONUMERIQUE » pour les meilleurs projets.

These programs should favor brainstorming that leads to innovative advances. Hence, the Institut Pascal (IPa) encourages programs that dedicate large slots of time to interactions of small to medium-size groups of researchers.

The IPa provides this facilitating platform, welcoming all Université Paris-Saclay’s laboratories and partners. The institute supports programs attracting scientists and students from all over the world and can host up to 60 (inter)national visitors in excellent conditions, having 30 offices dedicated to this end and multiple lecture rooms for plenary meetings.

Scientific Themes
The thematic programs may fall within any of the scientific fields covered by the Université Paris-Saclay, be they theoretical or experimental. They include for instance astronomy, biology, chemistry, climate science, computer science, earth science, engineering, mathematics, and physics. Propositions with a component in the humanities or social sciences are also welcome.

Selection
The Scientific Council of the IPa, consisting of internationally recognized scientists, will evaluate the program proposals based on:
- Scientific importance of the topic, timeliness, intellectual challenges
- Recognized leadership of the program organizers and participants
- Overlap with the research activities carried out in the Paris-Saclay environment
- Size of the community in the Ile de France area that the program can attract.

DEADLINE 10 DECEMBER 2018
Pre-deadline 20 November 2018

L’entreprise Cevidra commercialise depuis le mois de juillet 2018 Cevidra® Calixarene, le premier traitement local d’urgence pour une contamination cutanée par un actinide (uranium, plutonium, américium, etc.). Ce traitement, une crème lavante très simple d’utilisation, qui empêche l’uranium de passer la barrière de la peau à plus de 95 % si elle est appliquée immédiatement, a été mis au point au cours de deux thèses dans le laboratoire de recherche en radiochimie, spéciation et imagerie (LRSI)  de l’IRSN en partenariat avec l’Institut Galien Paris Sud (UMR CNRS 8612) et la Direction Générale de l’Armement (DGA).

Les avancées récentes dans la compréhension de la régulation des activités fonctionnelles des globules blancs tueurs par des récepteurs inhibiteurs, tels que CTLA-4 et PD-1, exprimés à la surface de ces lymphocytes T et bloquant leurs fonctions effectrices, ont conduit à de nouvelles approches très prometteuses en immunothérapie anticancéreuse. Ainsi, des thérapies fondées sur l’utilisation d’anticorps monoclonaux neutralisants, comme anti-CTLA-4 et anti-PD-1, ont montré un bénéfice clinique dans plusieurs cancers, y compris le cancer pulmonaire et le mélanome. Néanmoins, bien que ces traitements aient permis d’améliorer la survie de certains patients, les taux de réponse restent limités. Un enjeu majeur en oncologie est donc d’identifier des biomarqueurs de prédiction de ces réponses afin de sélectionner les patients éligibles à ces thérapies et améliorer l’efficacité des traitements. Des études réalisées dans l’unité UMR-S 1186 INSERM/UPSud/Gustave Roussy (Villejuif), rassemblées dans deux revues qui viennent de paraitre dans le Journal for ImmunoTherapy of Cancer et dans Frontiers in Immunology, ont montré qu’une sous-population de cellules T, appelées cellules T mémoires résidentes dans le tissu (TRM), infiltre souvent les tumeurs pulmonaires humaines et correspond à un facteur de bon pronostic de survie. Ces cellules représentent aussi un biomarqueur d’efficacité de vaccins anticancéreux, et un nombre limité de ces cellules parmi les lymphocytes infiltrant la tumeur (TIL) semble corréler avec l’échec des immunothérapies ciblant des « checkpoints » immunitaires chez la plupart des patients.

Les TRM sont des cellules T très activées résidant dans plusieurs tissus périphériques, notamment l’intestin, le cerveau, la peau et le poumon, et sont capables de déclencher une réponse spécifique très rapide suite à une réinfection virale. Ces lymphocytes T, définis en particulier par l’expression membranaire de l’intégrine CD103 (aE(CD103)b7), expriment souvent les récepteurs « checkpoints » CTLA-4 et PD-1, permettant une tolérance périphérique. Il est maintenant admis que le TGF-b contribue à la formation et la persistance des TRM, au moins en partie en induisant CD103 (la chaine aE). Des données récentes semblent indiquer que les TRM jouent un rôle clé dans les pathologies immunitaires et inflammatoires humaines, y compris les pathologies cancéreuses. Des chercheurs de l’U1186 ont démontré que des cellules T CD8+CD103+ infiltrent souvent les cancers bronchiques non à petites cellules (CBNPC) humains et possèdent des profils phénotypique et moléculaire caractéristiques des TRM. Ces cellules infiltrent aussi les tumeurs de l’ovaire et de la vessie, et correspondent à un marqueur de bon pronostic. Les chercheurs ont démontré aussi que les TRM CD8+ sont capables de tuer les cellules tumorales autologues après neutralisation de l’interaction PD-1/PD-L1 avec des anticorps anti-PD-1 bloquants. De plus, une forte expression de CD103 corrèle avec une infiltration accrue des TIL dans les amas tumoraux. Dans ce contexte, l’équipe du Dr. Fathia Mami-Chouaib a démontré que CD103 est essentielle à l’activité cytotoxique des lymphocytes T CD8 infiltrant la tumeur. CD103 régule aussi la sécrétion de cytokines en augmentant les forces d’interaction entre le lymphocyte T cytotoxique (CTL) et sa cible. L’interaction CD103/E-cadhérine déclenche également le recrutement du récepteur de chimiokine CCR5 dans la synapse immunologique entre le CTL et sa cible tumorale inhibant ainsi la migration des TIL CD103+ vers un gradient de chimiokine CCL5. Ces résultats sont en accord avec un rôle de CD103 dans la rétention des TRM spécifiques de l’antigène dans la tumeur épithéliale. Enfin, les chercheurs ont démontré que les cellules T CD103+ (TRM) migrent plus efficacement du stroma vers les îlots tumoraux que les cellules CD103- et que CD103 participe directement à leur recrutement et à la signalisation précoce intra-tumorale. Ces résultats justifient comment la rétention des TRM au site tumoral résulte à un pronostic plus favorable et suggèrent leur implication dans le succès des immunothérapies anticancéreuses.

Contact : fathia.mami-chouaib@gustaveroussy.fr

Le médulloblastome est la tumeur cérébrale maligne la plus fréquente chez l’enfant. Malgré des progrès considérables ces vingt dernières années, une fraction importante de ces tumeurs reste encore mal caractérisée. Une étude publiée dans la revue Cancer Cell décrit comment une analyse multi-omiques (génome, transcriptome et protéome) a permis une meilleure caractérisation des médulloblastomes.

Dans le but de mieux caractériser les mécanismes impliqués dans la biologie du médulloblastome, des chercheurs du CNRS, de l’Institut Curie (Orsay), de l’Inserm et de l’Université Paris-Sud (UMR 3347/UMR-S 1021) ont réalisé une étude innovante qui a consisté à décrypter le médulloblastome par une approche multi-omiques intégrant la génomique, la transcriptomique et la protéomique (Méthylation du génome, séquençage de l’ARNm, analyse du protéome et du phosphoprotéome par spectrométrie de masse). Un des objectifs majeurs de cette étude était de déterminer si le protéome/phosphoprotéome était capable de révéler la présence d’acteurs et/ou de voies de signalisation, spécifiquement enrichis à l’échelle protéique, qui pourraient être impliqués dans la formation et/ou la maintenance tumorale. A la suite d’une analyse bioinformatique intégrative les chercheurs ont mis en évidence des voies de signalisation uniquement visibles au niveau protéique. En effet, les résultats montrent pour la première fois une activation de la voie des récepteurs à tyrosine kinase spécifiquement dans un sous-groupe du médulloblastome, permettant d’entrevoir la possibilité de nouvelles stratégies thérapeutiques. En conclusion, grâce à une approche multi-omiques les chercheurs ont pu apporter une meilleure connaissance de cette tumeur pédiatrique.

Contact : olivier.ayrault@curie.fr

Les consortiums PREDICT et Psay-CompBio vous invitent à participer au workshop Deep Learning et Génomique, Mardi 9 Octobre 2018, Inra IdF Jouy-en-Josas, Amphithéâtre bât. 440, 14:00-17:40.

An introduction to neural Networks.

Warith Harchaoui (Université Paris Descartes)

Large-scale machine learning for metagomics.

Romain Menegaux (Mines ParisTech)

Apprentissage profond pour la prédiction de phénotypes à partir de données d'expression.

Blaise Hanczar (Université d'Evry)

Application d'approches de deep learning aux données de génomique.

Magalie Houée (Agrocampus Ouest)

Participation gratuite sur inscription.

Contact : psaycompbio@services.cnrs.fr

Le Centre Français d’Innovation Culinaire (CFIC) est le fruit de la collaboration originale entre le Chef étoilé Thierry Marx et le chercheur physico-chimiste Raphaël Haumont. Cette collaboration va au-delà de  l’interaction « science-cuisine » puisqu’elle initie un lien nouveau entre le monde de l’artisanat et le monde universitaire. "Quelle cuisine pour 2050?" est au cœur de a chaire universitaire portée par le CFIC-UPSud.

Journée " Roberto Improta " 

Cérémonie Alembert / Montage d'un Réseau Européen

5 octobre 2018, Amphithéâtre Claude Bloch, bâtiment 772-74

CEA Orme de Merisiers, 91191 Gif-sur-Yvette

Inscription (gratuite mais souhaitée pour des raisons pratiques)

Matin : Inaugural Lesson Chaires d’Alembert Université Paris-Saclay

11h00 - 11h05 : inauguration au nom de l’Université Paris-Saclay par la Direction de la Recherche

11h05 - 11h15 : présentation du laboratoire d’accueil par Philippe Martin (LIDYL)

11h15 - 11h45 : présentation vulgarisée du travail entrepris en commun par Roberto Improta

11h45 - 12h00 : questions

12h00 - 13h00 : cocktail – buffet 

Après-midi : Réseaux Européens, comment monter un projet

13h00 – 13h30 : présentation de l'appel 2019 par Samuel Costantin, UPSaclay

13h30 – 14h00 : présentation du réseau LightDynamics par Roberto Improta

14h00 – 15h00 : discussion, table-ronde avec plusieurs intervenants ; Sandrine Lacombe (ISMO), Ruxandra Gref (ISMO), Fabien Gatti (ISMO), ….