Life Sciences Université Paris-Saclay

Chez Bacillus cereus, bactérie pathogène pour l’homme, l’expression des gènes de virulence est synchronisée et repose sur la capacité des microorganismes à communiquer entre eux. Des chercheurs de l’Institut Micalis (Inra/AgroParisTech) ) à Jouy-en-Josas et leurs collègues israéliens ont conçu des peptides de synthèse capables d’inhiber le système de communication intercellulaire impliqué dans ce processus. Ces travaux, publiés le 14 août 2018 dans la revue Chemical Communications, ouvrent la voie à des perspectives originales pour contrer la virulence des bactéries.

Contact : didier.lereclus@inra.fr et leyla.slamti@inra.fr

L'Agence nationale de la recherche va lancer, en collaboration avec une vingtaine d’organismes de financement, un nouvel appel à projets conjoint dans le cadre de l'ERA-NET BiodivERsA. Cette initiative a pour objectif de promouvoir des recherches transnationales sur la biodiversité. L'ouverture est prévue pour octobre 2018.

Âgé de cinquante-quatre ans, Eric Fouassier est docteur en pharmacie et docteur en droit. Professeur d’université depuis 2000, il a effectué toute sa carrière au sein de la faculté de pharmacie de Châtenay-Malabry, où il enseigne le droit et l’économie pharmaceutiques, ainsi que l’histoire de la pharmacie, ce qui lui a permis d’atteindre le deuxième échelon de la classe exceptionnelle. Il est aussi, depuis 2012, membre élu du conseil d’administration l'université Paris-Sud et, à ce titre, s’est particulièrement impliqué dans le projet Paris-Saclay.

Spécialiste du contentieux disciplinaire, du statut des produits de santé et de la responsabilité pharmaceutique, il dirige une équipe de recherche pluridisciplinaire, le GRADES (Groupe de Recherche et d’Accueil en Droit et Economie de la Santé), dont les thématiques s’articulent autour de l’accès pour tous aux produits et prestations de santé. Il a signé seul plus d’une centaine d’articles dans les plus grandes revues juridiques à comité de lecture et ses travaux de recherche lui ont permis de remporter de nombreuses récompenses, notamment les prix Vauquelin, Maurice Bouvet, ainsi que le prix de l’Ordre national des pharmaciens pour l’ensemble de ses contributions à l’étude de la législation professionnelle et de la déontologie.

Particulièrement soucieux du rayonnement de sa discipline et de son établissement à l’extérieur du milieu universitaire, il s’est impliqué dans diverses institutions. Membre titulaire de l’Académie nationale de pharmacie, il a ainsi siégé dans de nombreux conseils ou  commissions, notamment au sein de l’ancienne Afssaps, de l’Espace régional éthique de la région Ile-de-France ou de l’Ordre des pharmaciens. C’est d’ailleurs pour ses travaux au sein de l’instance ordinale qu’il se voit aujourd’hui distingué. Membre nommé au titre des universités du Conseil national de l’Ordre, il y a assuré, pendant une vingtaine d’années, la supervision de l’activité de la chambre de discipline siégeant en appel et rédigé l’intégralité des décisions rendues par cette juridiction durant toute cette période. Il a également présidé la Commission juridique de l’Ordre et eu à connaître, à ce titre, de la plupart des textes réglementaires ayant trait à la profession pharmaceutique. Principal artisan de la réforme en cours du code de déontologie pharmaceutique, il continue de suivre actuellement la finalisation de ce texte, en étroite collaboration avec les services du ministère de la santé.

Eric Fouassier est également écrivain à ces heures perdues. Il publie, notamment, aux éditions JC-Lattès, des romans policiers historiques où transparaît son goût pour l’histoire de la médecine et de la pharmacie.

Un groupe multidisciplinaire de chercheurs cubains, français et espagnols, vient de publier une étude qui fournit des pistes sur les processus biologiques liés à l'adaptation de cette race de bovins aux conditions tropicales. Cette étude intitulée “Genetic diversity and selection signatures of the beef ‘Charolais de Cuba’ breed” et coordonnée par e laboratoire GABI (UMR 1313 INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Jouy-en-Josas) vient de paraître dans la revue Scientific Reports.

Contact: dominique.rocha@inra.fr ou yuliaxis.ramayo-caldas@inra.fr

Les Virus Géants forment un groupe fascinant et très divers de virus qui sont caractérisés par des génomes de très grande taille, certains ayant des génomes de tailles comparable à ceux des bactéries. Ces virus ont connu un succès évolutif considérable : ils sont capable d'infecter une gamme très large d'hôtes allant de minuscules microbes à des vertébrés en passant par des algues  ou des insectes. Conséquemment, on les retrouve presque partout sur terre, depuis les profondeurs marines jusqu'au tube digestif humain. Une question importante est d'essayer de comprendre pourquoi ces virus ont connu un tel succès.

Dans un récent article publié dans la revue Current Opinion in Virology, le chercheur du CNRS Jonathan Filée travaillant au laboratoire Evolution Génomes Comportement et Écologie (EGCE) à Gif-sur-Yvette a proposé l'hypothèse originale que les Virus Géants avaient établi une forme de symbiose moléculaire avec toutes une série d’éléments génétiques mobiles dans le but de faciliter la propagation conjointes de ces différentes parties. Plusieurs indices plaident en faveur de cette idée (Figure). Tout d'abord, certains de ces élément génétiques égoïstes semblent coopérer avec les Virus Géants pour détruire l'ADN des hôte cellulaires mais aussi très probablement celui des Virophages, ces fameux «virus de Virus Géants» (Figure A). De la même manière, d'autres éléments génétiques mobiles semblent être utilisés par les Virus Géants comme une arme antivirale pour dégrader l'ADN de virus compétiteurs co-infectant le même hôte (Figure B). Finalement certaines fonctions codées par des éléments transposables pourraient être utilisées par les Virus Géants afin de générer des formes dormantes du virus, sous la forme de génomes viraux intégrés dans le génome hôte.

En conclusion, ces données accréditent l'hypothèse que les Virus Géants et les éléments génétiques mobiles qu'ils abritent au seins de leurs génomes ont établi une relation de collaboration symbiotique dans laquelle chaque partie trouve son compte : les Virus Géants utilisent les fonctions codées par les éléments mobiles pour acquérir des avantages adaptatifs et se multiplier ; quant aux éléments génétiques mobiles, ils profitent de la propagation des Virus Géants pour se multiplier à leur tour en leurs seins.

Contact : jonathan.filee@egce.cnrs-gif.fr

De plus en plus d'IST en France, notamment chez les 15-24 ans. On parle, et à raison, beaucoup du SIDA, mais qu'en est-il des chlamydias, gonorrhées, syphilis et autres IST ? Nathalie Bajos, sociologue démographe, directrice de recherche à l’Inserm au Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations (CESP, INSERM/UPSud, Le Kremlin-Bicêtre), était invitée le 26 juillet sur France Culture. La chercheuse explique que l’étude de Santé publique France, au sujet de l’infection du VIH, a permis de dresser une cartographie qui montre que les zones où le Chlamydia et les Gonocoques sont les plus importantes sont aussi les zones dans lesquelles il y a le plus de VIH. Elle ajoute que 90% des femmes infectées par Chlamydia n’ont aucun signe qu’elles portent la maladie, le dépistage reste donc un problème à résoudre.

Contact: nathalie.bajos@inserm.fr

Lepoint.fr rend compte des travaux d’une équipe rassemblant des chercheurs du CEA, de l’Inserm, des universités de Versailles, Saint-Quentin-en-Yvelines, Paris Sud/Paris-Saclay, Paris-Descartes et de l’hôpital Foch, sur l’anesthésie générale, publiés dans Anesthesiology (voir notre info récente). Béchir Jarraya, qui a dirigé ces travaux avec Lynn Uhrig, explique qu’« en cas d’anesthésie générale, le réseau [cérébral] est cantonné aux axes autoroutiers. Il ne permet ni une bonne flexibilité ni une bonne répartition du flux, générant en quelque sorte des embouteillages. C’est ainsi que notre équipe a découvert une signature cérébrale universelle de l’anesthésie générale ». Le cerveau ne s’éteint pas sous anesthésie, et il continue à avoir une activité significative.

 

https://presse.inserm.fr/pourquoi-perdons-nous-conscience-lors-dune-anesthesie-generale/32217/

 

http://www.lepoint.fr/editos-du-point/anne-jeanblanc/anesthesie-generale-pourquoi-on-perd-conscience-21-08-2018-2244708_57.php

 

https://www.sciencesetavenir.fr/sante/cerveau-et-psy/pourquoi-perd-on-conscience-pendant-une-anesthesie-generale_126844

 

https://www.pourquoidocteur.fr/Articles/Question-d-actu/26604-Anesthesie-generale-perdons-nous-conscience

 

https://www.topsante.com/medecine/votre-sante-vous/sante-pratique/le-mecanisme-d-anesthesie-generale-decrypte-627576

 

https://www.maxisciences.com/anesthesie/pourquoi-perd-on-conscience-lors-d-une-anesthesie-generale_art41409.html

https://www.dcnews.ro/anestezia-generala-cercetatorii-au-descoperit-ce-se-intampla-in-creier_609287.html

 

https://www.leprogres.fr/france-monde/2018/08/25/pourquoi-perd-on-conscience-sous-anesthesie-generale

Des médecins-chercheurs de Gustave-Roussy à Villejuif (UMR-S 1030 INSERM/UPSud), et des ingénieurs de CentraleSupélec ont appris à un logiciel à analyser des scanners et à prédire l’efficacité des futurs traitements, rapporte Le Parisien. Les chercheurs expliquent que la signature dite radiomique, créée en analysant des images de scanner grâce à un algorithme, « détermine un score prédictif de l’efficacité de l’immunothérapie chez un patient ». « Tout l’enjeu est de donner le plus rapidement possible la meilleure thérapeutique à des patients avec un cancer avancé (…) », explique le Pr Eric Deutsch, chef du département médical de radiothérapie à Gustave-Roussy et auteur principal de l'étude. Ces travaux viennent d'être publiés dans The Lancet Oncology.

Contact : eric.deutsch@gustaveroussy.fr

Dans l’entretien qu’il nous a accordé, Human Rezaei, directeur de recherche au département santé animale de l’Inra et co-responsable de l’équipe « Macro-Assemblages Protéiques et Maladies à Prions » de l’unité Virologie et Immunologie Moléculaire VIM à Jouy-en-Josas, fait le point sur les maladies à prion. Il expose les spécificités de cet agent pathogène et les points communs avec certaines maladies neurodégénératives liées au mauvais repliement des protéines et à leurs agrégations. Les perspectives thérapeutiques sont également abordées. Ses recherches portent essentiellement sur les maladies à prion. Il étudie particulièrement la structure des prions et leurs mécanismes de propagation.

L'ITMO Santé pubique et l'IReSP lancent un appel pour la construction d’un projet de recherche interventionnelle en santé publique sur la vaccination contre le papillomavirus.

Date limite de candidature : 12 septembre 2018

Âgée de 54 ans, Laurence Zitvogel a été initialement formée comme oncologue à l'Université Paris 7, puis est devenue Directrice scientifique du programme d'Immuno-Oncologie de Gustave Roussy (Villejuif), Directrice de l’UMR-S 1015 INSERM/UPSud à Gustave Roussy, co-directrice du Centre d’Investigations Cliniques IGR/Curie, Professeur PU-PH en Immunologie-Biologie à l’UFR de Médecine de l'UPSud, et enfin membre correspondant de l’Académie Nationale de Médecine.

Après un post-doctorat à l'Université de Pittsburgh, à la Biomedical Science Tower, Pittsburgh Cancer Institute, le Prof. Zitvogel est devenue une experte indiscutée du domaine de l’immunologie anti-tumorale, du développement des vaccins thérapeutiques et des biomarqueurs immunologiques en cancérologie. Sa carrière a été rapidement ascendante avec la mise en évidence de l’immunogénicité de microparticules exocytées par les cellules dendritiques, i.e. « les exosomes ». Les exosomes, dont la découverte du pouvoir immunitaire a conduit son équipe (en partenariat étroit avec des chercheurs de l'Institut Curie) à conduire une phase I et II dans les tumeurs bronchiques et les mélanomes avec des résultats très prometteurs, sont actuellement largement étudiés de part le monde pour leur capacité à véhiculer des miRNA ou des protéines exogènes.

Plus important, ses travaux de 2003 à 2015 dans le domaine de la mort immunogénique lui valent une aura internationale car ils montrent que les traitements conventionnels du cancer (certaines chimiothérapies et les agents ciblant les tyrosine kinases) tiennent une grande part de leur efficacité à l’activation du système immunitaire et suggèrent fortement que les guérisons générées par ces thérapies n’auraient pas lieu sans réponses immunitaires anti-tumorales. Il s’agit d’un changement de paradigme car ses travaux débouchent sur la sélection de traitements à vertu  immunogènes, sur l’association de ces thérapies classiques avec des vaccins et/ou des immunomodulateurs tels que les anticorps anti-PD1/PD-L1, et sur des biomarqueurs pronostics ou prédictifs immunologiques. Elle a reçu de nombreuses distinctions internationales pour cette découverte faite en partenariat avec le Pr Kroemer de l'HEGP/Les Cordeliers (Prix Baillet-Latour de Belgique, Prix Brupbacher suisse, Prix Jakob Herz, d'Erlangen).

Enfin, ces 7 dernières années, elle s’est intéressée à l’importance de la flore intestinale dans les réponses immunes aux traitements contre le cancer, créant ce domaine de novo, en partenariat avec l'INRA et l'Institut Pasteur. Son équipe vient de publier quatre articles pionniers dans Science (Viaud et al. Science 2013, Vétizou et al. Science 2015, Routy et al. Science 2018, Zitvogel et al. Science 2018), tous concomitamment adossés à d’autres articles américains corroborant ses données. Ses travaux montrent que notre écosystème intestinal bactérien comprend certains commensaux capables de restaurer et mobiliser l'immunité des patients contre leur cancer et démontrent que les antibiotiques à large spectre portent préjudice à l'efficacité maximale des anticorps anti-PD1 utilisés en thérapie contre de multiples cancers. L’identification des « bactéries commensales adjuvantes » indispensables à une réponse immunitaire anti-tumorale pendant un traitement cytotoxique et sensibilisant la muqueuse intestinale permettrait en théorie d’envisager des compensations par probiotiques spécifiques et/ou une alimentation permettant leur ancrage dans les niches intestinales importantes. Une nouvelle ère est née : celle de l’importance du mutualisme hôte-bactéries commensales pendant les traitements du cancer. Ce changement de pensée a provoqué un champ d’investigations au niveau des Biotech et groupes pharmaceutiques tout récemment et aura pour conséquence d’élargir les options thérapeutiques et leurs résultats en cancérologie moderne. Le Prof. Zitvogel a reçu le premier grand Prix "Immuno-Oncology" de l'ESMO (European Society of Medical Oncology) appelé Prix Georges Mathé pour cette découverte. Encouragée par ces résultats et l'enthousiasme des cliniciens à participer à l'étude de la métagénomique intestinale en oncologie, son équipe et son réseau français (TORINO-LUMIERE) et européen (ONCOBIOME) ont reçu un soutien financier de type RHU en 2016 et grant H2020 en 2018 pour permettre l'envol de ce nouveau concept créé et développé à l'UPSud /UPSaclay.

Les mécanismes de réparation des lésions de l’ADN sont essentiels à la survie des cellules exposées aux radiations ionisantes. Parmi eux, la recombinaison homologue (RH) joue un rôle central dans le maintient de la stabilité des génomes des cellules irradiées. Ce mécanisme est conservé chez tous les organismes vivants, des bactéries à l’homme. La protéine clef de ce processus, la recombinase Rad51, forme des oligomères sur l’ADN lésé. Ces oligomères scannent le génome à la recherche d’une séquence d’ADN de séquence identique, utilisée comme matrice pour assurer une réparation fidèle de la lésion. Ce mécanisme complexe est étroitement contrôlé par des protéines qui surveillent la formation correcte des oligomères de Rad51 et la recherche d’homologie. Nous travaillons avec un organisme modèle, la levure de boulanger Saccharomyces cerevisiae, très fréquemment utilisé dans l’étude fine de divers mécanismes biologiques. Le contrôle de la RH est aujourd’hui mieux cerné chez cet organisme, où des acteurs positifs et négatifs ont été identifiés. La protéine Rad52 est essentielle au recrutement de Rad51 au niveau des lésions, mais son devenir après la formation des oligomères était inconnu jusqu’à présent. Srs2 est un régulateur négatif des oligomères qui a la capacité de déplacer Rad51 de l’ADN. L’inactivation de cette protéine conduit à une sensibilité marquée des cellules exposées aux radiations ionisantes, soulignant le caractère essentiel du contrôle qu’elle exerce sur les oligomères Rad51. Nos derniers travaux montrent que Rad52 reste associée aux oligomères qu’elle a contribués à former, participant ainsi à leur stabilisation et à leur protection face à l’activité déstabilisatrice de Srs2. Ainsi, les assemblages de Rad51 conduit dans le cadre d’un programme de réparation bien contrôlé seraient protégés par Rad52 alors que les assemblages « anarchiques », indépendants de Rad52, seraient supprimés par Srs2. Le gène RAD52 est conservé chez l’homme, mais c’est le gène suppresseur de tumeur BRCA2 qui est principalement impliqué dans le recrutement de Rad51 aux lésions. Nos travaux offre une piste de recherche intéressante quand au rôle de Rad52, sachant que cette protéine est considérée comme une cible thérapeutique sérieuse dans le traitement de certains cancers du sein et des ovaires.

Voir article dans eLife associant des équipes du CEA de Fontenay-aux-Roses, de l'UMR 8126 CNRS/UPSud de Gustave Roussy (Villejuif) et de l'I2BC de Gif-sur-Yvette.

Contact : eric.coic@cea.fr

De nombreuses études suggèrent que certains symptômes comportementaux ou émotionnels pendant l'enfance pourraient être associés à l'apparition de troubles psychopathologiques chez l'adulte. Intervenir sur ces symptômes dès l’enfance pourrait être efficace pour prévenir l’apparition de troubles mentaux. Cependant, de telles interventions sont difficiles à imaginer tant que les symptômes à cibler spécifiquement pendant l'enfance ne sont pas connus. Dans une étude qui vient de paraitre dans JAMA Psychiatry, Alexandra Rouquette et ses collègues du Centre de Recherche en Épidémiologie et Santé des Populations (CESP, INSERM/UPSud UMR-S 1018) ont utilisé une approche méthodologique innovante, l’analyse de réseau. Dans cette approche, les symptômes sont conceptualisés comme des entités distinctes pouvant s’influencer mutuellement et faisant partie de chaines causales où leur renforcement mutuel peut aboutir à des cercles vicieux et culminer en maladies.

Les chercheurs ont analysé le réseau entre symptômes émotionnels et comportementaux (déficit de l'attention, hyperactivité, opposition, anxiété, dépression, etc.) observés chez 932 filles âgées de 6 ans en 1986. Certains symptômes, "irritable", "blâme les autres", "pas aimée par les autres enfants", "pleure souvent" et "solitaire", occupaient une place particulière dans ce réseau. Appelés « bridge symptoms », ils constituent des chemins pouvant relier différents troubles mentaux et donc expliquer l’apparition de comorbidités. L’étude des liens entre ce réseau au cours de l'enfance et la survenue de troubles anxieux à l'adolescence a montré que ces « bridge symptoms » étaient les plus associés à la survenue ultérieure de troubles anxieux.

En soulignant le rôle central des « bridge symptoms » dans le processus de développement des troubles anxieux à long terme, cette étude permet de proposer aux cliniciens évaluant de jeunes patients de potentielles cibles d’interventions précoces de prévention de l’anxiété ou de promotion de la santé mentale.

Contact : alex.rouquette@gmail.com

Avec 220 millions d’hectares, le blé tendre (Triticum aestivum L.) est la céréale la plus cultivée dans le monde. Nourriture de base pour 30% de la population mondiale, le blé est également, avec le riz, la céréale la plus consommée en alimentation humaine, fournissant en moyenne 20 % des besoins alimentaires journaliers moyens. Le génome du blé est particulièrement complexe par sa taille (cinq fois plus gros que le génome humain et 40 fois plus gros que celui du riz) et sa composition (hexaploïdie, 85% d’éléments transposables). Fruit du travail de plus de 200 scientifiques issus de 73 instituts de recherche de 20 pays, la première séquence de référence du blé effectuée par le Consortium international de séquençage du génome du blé (IWGSC) vient d’être publiée dans la revue Science.

Pour tirer au mieux profit de cette séquence de référence (IWGSC RefSeq v1.0, assemblage de 14.5 Gb, super-scaffolds N50 de 22.8 Mb), l’équipe URGI de l’INRA de Versailles-Grignon Université Paris-Saclay a développé le portail Wheat@URGI.

Le portail est la ressource officielle de l’IWGSC pour accéder aux données massives de génomique du blé (assemblages, annotations, cartes physiques, données d’expression, données de variations, etc.) et les étudier via le système d’information GnpIS. Différents outils bioinformatiques sont disponibles pour que les chercheurs puissent analyser le génome, comme BLAST (475000 recherches effectuées en 2017), JBrowse et InterMine. De plus, l’URGI a développé la base de données GnpIS-coreDB pour l’intégration des données génétiques et phénomiques obtenues dans le cadre de différents projets nationaux et européens depuis 2003. Le système d’information GnpIS permet donc de lier les données génomiques de la séquence de référence avec les données de génétique et de phénomique du blé, facilitant le passage d’un gène vers un QTL et des expériences de génétiques d’association ou de phénotypage.

Ces travaux ont été publiés dans la revue Genome Biology conjointement à la publication du génome, par l’Université Paris-Saclay, l’Université Clermont Auvergne et le consortium IWGSC.

Contact : michael.alaux@inra.fr

L’hémophilie A est une maladie hémorragique constitutionnelle causée par des mutations dans le gène codant pour le facteur VIII (FVIII) de la coagulation. Le traitement actuel est basé sur une thérapie de substitution consistant à injecter les patients avec du FVIII recombinant ou plasmatique. Ce traitement est associé à un certain nombre d’inconvénients, tels que le développement d’auto-anticorps chez 20-30% des patients ainsi que la nécessité de procéder à des injections intraveineuses fréquentes (2-3 fois/semaine). Ces deux aspects de la biologie du FVIII sont modulés par une autre protéine plasmatique, le facteur Willebrand (VWF). Le FVIII et le VWF circulent sous forme d’un complexe non covalent de forte affinité (330 pM). Une portion de FVIII (2-5%) circule libre, non lié au VWF. Le FVIII libre a une demi-vie environ 6 fois plus courte que celle du FVIII lié au VWF. De plus, le FVIII libre est également davantage susceptible d’être endocytosé par les cellules présentatrices d’antigène, favorisant ainsi le développement d’inhibiteurs.

Dans une étude parue dans la revue Blood, l’équipe de l’UMR_S1176 à la faculté de médecine de l’UPSud au Kremlin-Bicêtre, a eu l’idée de générer un variant de FVIII visant à réduire la présence de FVIII libre. Cette molécule a été créée en remplaçant un domaine non fonctionnel du FVIII (le domaine B) par deux fragments d’anticorps à domaine unique (nanobody ou VHH) se liant au VWF. Ce nouveau variant de FVIII (FVIII-KB013bv) a une affinité pour le VWF 25 fois plus haute (13pM) que le FVIII de base tout en préservant sa fonction de cofacteur de la coagulation in vitro et in vivo. La proportion de FVIII libre est ainsi réduite de 3.3% à 0.14%.

La caractérisation du FVIII-KB013bv a révélé que l’augmentation de sa liaison au VWF résulte en une amélioration substantielle de sa pharmacocinétique. D’autre part, une forte réduction de l’immunogénicité du FVIII-KB013bv par rapport au FVIII a pu être mise en évidence (88% des souris déficientes en FVIII exposées au FVIII développent des anticorps contre 13% des souris exposées au FVIII-KB013bv).

Cette nouvelle molécule pourrait donc représenter un nouvel outil permettant d’optimiser le traitement de l’hémophilie A.

Contact : cecile.denis@inserm.fr