Dans le cadre de l'Objet Interdisciplinaire METABIODIVEX de l'Université Paris-Saclay, une journée scientifique autour des deux thématiques Biocatalyse et Valorisation de la Biomasse est organisée vendredi 16 janvier 2026 dans l'amphithéâtre de l'ICSN à Gif-sur-Yvette.

La matinée sera dédiée à la Biocatalyse et aux Enzymes en Action et l'après-midi aux Approches de Valorisation de la Biomasse. Pour chacune de ces thématiques, deux conférences plénières sont programmées. Ces conférences encadreront 4 FlashComm de jeunes chercheurs du périmètre Paris-Saclay. Des communications d'acteurs industriels et des acteurs de la valorisation des résultats scientifiques sont également programmées

En fin de journée, des tables rondes seront organisées afin de pouvoir échanger autour de ces deux thématiques.

Cette journée scientifique gratuite est ouverte à toute personne présentant un intérêt pour l’une de ces deux thématiques.

Le programme de cette journée scientifique et les inscriptions sont disponibles sur le site de SciencesConf à l’adresse : https://metabiodivex26.sciencesconf.org/

Deux FlashComm pour chacune de deux thématiques sont proposées. N’hésitez pas à postuler en écrivant aux organisateurs (erwan.poupon@universite-paris-saclay.fr / aurelien.alix@universite-paris-saclay.fr / jean-francois.betzer@cnrs.fr).

L'Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN) est situé sur le campus CNRS au 1 avenue de la Terrasse à Gif-sur-Yvette. L'amphithéâtre est situé au 1er étage du bâtiment 27. L'ICSN est facilement accessible à pied depuis la gare du RER B Gif-sur-Yvette.

Pour plus d'informations sur l'accès au campus CNRS et à l'ICSN, rendez-vous sur la page Informations Générales / Accès.

Dans une étude publiée dans PNAS, l’équipe Dynamique des Chromosomes de l’Institut des Sciences des Plantes de Paris-Saclay - IPS2 (CNRS/INRAE/UEVE/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) met en évidence l’existence d’un mécanisme global de répression de la transcription chez la plante modèle Arabidopsis thaliana.

À l’aide d’un crible génétique, les chercheurs ont montré que la protéine LUMINIDEPENDENS (LD) intervient dans la réponse au stress réplicatif. L’analyse de ses cibles, réalisée par immunoprécipitation de la chromatine et des approches transcriptomiques normalisées par spike-in, révèlent que LD agit comme un régulateur négatif de la transcription à l’échelle du génome.

L’étude de ses partenaires protéiques suggère que LD module la transcription par divers mécanismes, notamment la modification des histones, la phosphorylation de l’ARN polymérase II ou encore son recrutement sur la chromatine par le complexe Mediator.

Ainsi, LD apparaît comme un régulateur global de la transcription, dont le rôle dans la réponse au stress réplicatif pourrait s’expliquer par une réduction des conflits transcription-réplication, sources majeures de stress réplicatif et d’instabilité génomique.

-> Contact : cecile.raynaud@universite-paris-saclay.fr

Dans une étude publiée dans Journal of Experimental Botany, des chercheurs de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles), de l’Institute for Agriculture and Forestry Systems in the Mediterranean (Catania, Italie) et des Royal Botanic Gardens - Kew, (Ardingly, Angleterre) ont étudié la biosynthèse de l’huile dans la graine de Cakile maritima, une espèce halophyte sauvage de la famille des Brassicacées.

En analysant indépendamment les deux tissus zygotiques de la graine, l'embryon et l'albumen, il a été démontré que l'embryon est le principal site d'accumulation de l’huile. Il est à noter que la composition en acides gras de l’huile diffère considérablement entre les tissus zygotiques. La moitié des acides gras de l'albumen sont des monoinsaturés de type oméga-7, qui sont largement absents de l'embryon. En revanche, l'embryon présente une induction plus forte des voies de biosynthèse des acides gras de type oméga-9 et polyinsaturés, ce qui reflète une régulation spécifique des gènes du métabolisme des acides gras dans chaque tissu. En outre, les graines collectées dans différentes niches écologiques le long d'un gradient latitudinal révèlent que la température environnementale affecte la composition en acides gras de l’huile, en particulier la proportion d'acides gras polyinsaturés dans l'embryon.

Ces résultats soulignent la diversité métabolique et le potentiel d'adaptation de C. maritima, dont la teneur en huile élevée des graines, associée à la capacité de la plante à prospérer dans des environnements salins avec un minimum d'apports, sont autant de caractéristiques particulièrement intéressantes dans une optique de diversification des cultures oléagineuses.

-> Contact : sebastien.baud@inrae.fr

Dans une étude parue dans mSystems, des scientifiques de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) ont étudié un monde encore méconnu : la « spermosphère ». Cette interface entre la graine en germination et l’environnement comporte une large diversité chimique et microbienne, directement façonnée par les molécules issues des métabolismes central et spécialisé que la graine libère dès l’imbibition.

En travaillant sur un panel de diversité génétique du haricot commun (Phaseolus vulgaris L.), les chercheurs ont analysé à la fois les métabolites libérés par les graines et les communautés de micro-organismes de la spermosphère. Ils ont découvert des métabolites exsudés par la graine, dont des acides aminés et dipeptides, des flavonoïdes et des terpènes, chacun pouvant influencer les micro-organismes qui s’installent autour de la graine. Ainsi, ils ont pu caractériser des dizaines de familles de bactéries et de champignons. Comme une véritable architecte, la graine crée donc son propre environnement, en fonction de son identité génétique et de son environnement de production. Ces échanges métaboliques entre la graine en germination et sa cohorte microbienne sont essentiels car ils contribuent à la santé et à la qualité physiologique de la future plante.

Cette découverte change notre regard. Les résultats révèlent que la graine ne subit pas passivement son environnement, mais contribue activement à façonner la communauté microbienne qui l’entoure. Ces travaux ouvrent la voie à de nouvelles stratégies de sélection variétale et au développement de traitements bio-inspirés pour améliorer la vigueur des semences. Ils participent également à l’émergence de pratiques agricoles plus durables, en misant sur la compréhension fine des alliances invisibles entre graines, molécules et microbes.

-> Contact : massimiliano.corso@inrae.fr / loic.rajjou@agroparistech.fr / chandrodhay.saccaram@inrae.fr

La reproduction sexuée est une source majeure de diversité génétique, au cours de laquelle les chromosomes homologues (parentaux) sont alternativement associés (fécondation), puis séparés (méiose). Pour que la séparation des chromosomes en méiose soit équilibrée, les chromosomes doivent se reconnaître et s’associer en paires (bivalents). Toute perturbation de cette association peut provoquer des problèmes de stérilité ou des anomalies chromosomiques majeures. La formation des bivalents s’accompagne d’une dynamique chromosomique caractéristique, impliquant leur ancrage à l’enveloppe nucléaire et des mouvements intenses au sein du nucléoplasme.

Dans une étude publiée dans Nature Plants, des scientifiques de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) ont identifié chez Arabidopsis thaliana, le complexe protéique transmembranaire qui permet cet accrochage des chromosomes à l’enveloppe nucléaire. Ce complexe est composé de plusieurs protéines de l’enveloppe nucléaire (protéines à domaines SUN constitutives et une protéine à domaine KASH spécifique de la méiose) ainsi que d’une kinésine méiotique, susceptible d’établir un lien avec les microtubules. L’absence de chacune de ces protéines aboutit à des défauts d’attachement des chromosomes à l’enveloppe nucléaire, à une absence complète de mouvement des chromosomes, à des défauts de formation des bivalents et à une stérilité marquée des plantes. Ces défauts ont été associés à des altérations profondes de la recombinaison méiotique, caractérisées par une distribution anormale des événements de recombinaison au sein du génome.

Ces résultats représentent les premières données sur le mécanisme gouvernant la dynamique des chromosomes pendant la prophase méiotique des plantes. Ils ouvrent la voie à de nouvelles investigations qui devront élucider les régulations moléculaires précises de ce processus et déterminer dans quelle mesure ces mécanismes sont conservés entre espèces.

Légende Figure : Attachement défectueux des télomères dans les mutants du complexe LINC méiotique. Les télomères sont représentés par des sphères roses (lorsqu’ils sont localisés à l’enveloppe nucléaire) ou bleues (lorsqu’ils se trouvent dans le nucléoplasme). Panneau du haut : méiocytes d’A. thaliana avec immunolocalisation des axes chromosomiques (en vert et violet). Panneau central : télomères. Panneau du bas : télomères, enveloppe nucléaire (grande sphère transparente) et nucléole (petite sphère).

-> Contact : mathilde.grelon@inrae.fr

Le prix Rozén Linné de Botanique est décerné à Catherine Bellini en reconnaissance de ses travaux de recherches et de son investissement pour la promotion de la recherche internationale. Ces prix sont décernés tous les trois ans à deux chercheurs méritants en botanique et zoologie résidant en Suède

Les missions de longue durée et les mises à disposition constituent à INRAE des dispositifs de mobilité stratégiques favorisant le développement de collaborations scientifiques au sein de laboratoires partenaires, tant en France qu’à l’étranger. Ces dispositifs représentent un levier majeur pour l’établissement et la consolidation de partenariats de recherche pérennes, notamment dans le cadre de projets de coopérations internationales. C’est dans ce contexte que Catherine Bellini a pu étendre ses activités de recherche au sein d’un laboratoire « hors les murs » mis en place dès 2005 entre l’Umeå Plant Science Centre -UPSC et INRAE.

Directrice de recherche INRAE à l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) et professeure à l'UPSC (Université d'Umeå, Suède), Catherine Bellini conduit des recherches sur deux domaines différents. A l’UPSC, son équipe étudie le développement des racines adventives, une étape clé et limitante dans la propagation végétative d'espèces d'arbres économiquement importantes. A l’IJPB, dans l'équipe "Carbone, allocation, transport, signalisation" CATS dirigée par Sylvie Dinant, elle s'intéresse au transport du sucre et à l'allocation du carbone, ainsi qu’à leur rôle dans le développement des plantes et leur interaction avec l'environnement.

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-> Contact : catherine.bellini@umu.se / catherine.bellini@inrae.fr

"Flavonoid metabolites dye many plant organs such as flowers, fruits, seeds, leaves or tubers. Over the past 150 years, tracking flavonoid-related colour changes in plants has shaped the foundation of many modern biology questions. This includes ground-breaking discoveries such as Gregor Mendel’s law of inheritance (using white and purple pea flowers), Barbara McClintock’s identification of transposable elements (through her research on variably coloured maize kernels) or Carolyn Napoli’s description of co-suppression (based on her observations of altered and novel flower colouration in petunia). In recent decades, the intricate, diverse and finely tuned flavonoid pathway has been unravelled and the understanding of this pathway across various plant species owes much to the characterization of mutants disrupted in the biosynthesis, transport and storage of flavonoids that similarly displayed modified flower and seed pigmentation (Winkel-Shirley 2001; Koes et al. 2005; Lepiniec et al. 2006). The model plant A. thaliana provided a wealth of such mutants (transparent testa mutants, tt) exhibiting altered seedcoat colours (Fig. 1) (Koornneef 1990; Shirley et al. 1992; Lepiniec et al. 2006). Their characterization enabled researchers to associate genes or loci with flavonoid-related functions. However, although their visual and non-lethal phenotypes were easy to identify and offered insight into the disrupted gene functions, further investigation was required to confirm these functions. Beyond colour, to fully unravel this pathway, it has become essential to individually characterize the seed flavonoids, determine their spatial and temporal distribution, and their diversity. This laid the groundwork for validating locus functions, characterizing novel gene roles, and identifying as well as quantifying flavonoid accumulation in other plants".

One of MASC’s major goals is to strengthen international cooperation. Through the combined efforts promoted by MASC, more progress in Arabidopsis research is achieved and redundancy is reduced. Since 1990, Arabidopsis researchers and representatives from community projects and resources regularly report their progress and reccommend future directions in Arabidopsis research. Since 2002 the annual Multinational Arabidopsis Steering Committee (MASC) report is compiled by MASC chairs and coordinator and published at the International Conference on Arabidopsis Research (ICAR).

Dans une étude publiée dans The Plant Journal, l’équipe « Facteurs de Transcription et Architecture » de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) s’est intéressée aux réseaux génétiques contrôlant le développement des plantes et à leur reconfiguration. La manière dont ces réseaux peuvent être modulés entre différents organes au sein d’un même organisme, en particulier pour les gènes pléiotropes exerçant plusieurs fonctions, reste encore mal comprise.

Pour explorer cette question, l’équipe a étudié, par des approches génétiques et d’analyse d’expression des gènes, les interactions entre les facteurs de transcriptions NGATHA-LIKE (NGAL), CUP-SHAPED COTYLEDON (CUC) et le cytochrome P450 KLUH dans différents organes de la plante modèle Arabidopsis thaliana. Ils montrent ainsi que le module de régulation NGAL/CUC/KLUH est remanié de manière organe-spécifique. Par exemple, la régulation de la croissance dans les pétales dépend majoritairement de l’action des NGAL sur KLUH, tandis que dans les feuilles caulinaires, les gènes CUC et KLUH fonctionnent parallèlement en aval des NGAL. De façon intéressante, ces différences de dialogue génétique s’expliquent en partie par les patrons d’expression spatiale distincts des gènes CUC, KLUH et NGAL dans chaque organe, reflétant des contraintes ou des dynamiques développementales spécifiques.

Ce travail met ainsi en lumière une modulation et une reconfiguration des différents réseaux génétiques associés au module NGAL/CUC/KLUH. Cette flexibilité des réseaux de régulation facilite la pléiotropie génétique et contribue à l’innovation évolutive et à la robustesse développementale chez la plante.

-> Contact : patrick.laufs@inrae.fr

Plus d'informations sur le site de l'évènement

-> Contact : alice.vayssieres@inrae.fr

Seed development in Arabidopsis thaliana is largely controlled by a set of transcription factors (TFs) called LAFL, including LEAFY COTYLEDON 2 (LEC2). In this study, we investigated the structure/function relationships of the protein LEC2 outside the well-described B3 DNA-binding domain. The results presented here unveil the presence of transcription activation domains (ADs) within the unstructured ends of the protein that are conserved in eudicots. Expression in both yeast and moss protoplasts of deleted and mutated versions of LEC2 confirmed the transcriptional activity of these ADs. Surprisingly, the expression of LEC2 variants lacking their ADs restored a wild-type seed phenotype in lec2 mutant, showing that these ADs are not essential for LEC2 function in seed development. Moreover, ZmAFL2/ZmABI19, a maize B3 factor related to LEC2 but deprived of N-ter AD, can also complement lec2 seed phenotype and induce abnormal vegetative development when overexpressed in Arabidopsis, supporting this observation. This work suggests that LEC2 can act both as a classical transcriptional activator or without transactivation activity, probably through its interaction with the pioneer factor LEC1. Taken together, the results provide important insights into the function of the LAFL master regulators during seed development, from cell differentiation to storage accumulation in seed.