L’épidémie COVID-19 pose de nombreuses questions. Quels sont les liens de cette crise sanitaire avec la faune sauvage, quels sont ses liens avec l’érosion de la biodiversité que le dernier rapport de l’Ipbes a souligné, quels sont ses liens avec certains systèmes de production alimentaire et plus généralement avec l’anthropisation de la planète ? Pour les éclairer sur ces sujets, les pouvoirs publics se sont tournés vers la recherche.
Publié le 15.05.2020
"Les ministères concernés et les instituts de recherche fondateurs de la FRB ont confié à celle-ci et à son Conseil scientifique élargi à des experts extérieurs, la charge de rédiger une synthèse des connaissances sur les liens entre COVID-19, et plus généralement entre les phénomènes de zoonose – le passage d’un agent pathogène d’un élément de la faune sauvage à l’humain à l’origine d’une épidémie, et dans le cas présent d’une pandémie – et la biodiversité."
(...)
[via] FRB sur Twitter, 15.05.2020 : "[#COVIDー19 et biodiversité] Les pouvoirs publics français ont sollicité la @FRBiodiv sur la question des relations entre #zoonose et état et dynamique de la #biodiversité et des services écosystémiques. ➡️ Consulter la publication : https://t.co/5AgFRO0JXt" https://twitter.com/FRBiodiv/status/1261332808615763969
Ce sont nos pratiques qui garantissent la bonne santé du jardin et des écosystèmes qu’il renferme.
Comment faire de votre jardin un havre de biodiversité. Par Nicolas Deguines et Benoît Fontaine, 14.05.2020
Extrait :
Les changements par les interactions avec la nature
Mais comment induire un glissement vers des pratiques vertueuses à grande échelle ? Pour faire de nos jardins de véritables havres de biodiversité, une petite révolution culturelle doit s’amorcer.
Selon de nombreux travaux en psychologie environnementale, la simple fourniture d’informations ne suffit pas à provoquer des changements de comportement. Les « expériences de nature », autrement dit l’immersion dans un écosystème, l’observation attentive, les interrogations afférentes, soient un préalable nécessaire au passage à l’action.
Avec le confinement et l’arrivée du printemps, la biodiversité urbaine ne réapparait pas seulement dans les rues, elle se fait aussi entendre. Nombreuses sont les oreilles disponibles pour entendre oiseaux, insectes et même batraciens. Dont celles de centaines de scientifiques qui ont lancé un projet d’envergure appelé « silent cities ».
9 mai 2020 / Grégoire Souchay (Reporterre)
"À la veille du confinement, au guidon de son vélo, Samuel Challéat, géographe toulousain, a pris conscience tout à coup du caractère exceptionnel de la période à venir. Pour ce chercheur au laboratoire Géode du CNRS, connu jusqu’ici pour son travail sur la pollution lumineuse, l’occasion était trop belle de saisir le paysage sonore urbain…"
(...)
Par Enjeux énergies et environnement, 09.05.2020
[Image] Les sons surgissent : cliquetis du vélo roulant, oiseaux chantant, pas des marcheurs sur le macadam, bruissement des feuilles sous le vent... La disparition du vacarme automobile parisien révèle les bruits cachés de la cité.
Dans nos précédents articles consacrés aux insectes pollinisateurs, nous avons pu constater un progrès dans l’outillage des insectes pour le butinage des fleurs : nous sommes passés des coléoptères (lourdauds et parfois quelque peu barbares avec les fleurs) aux diptères, puis aux lépidoptères (plus délicats et sophistiqués envers les Sauvages). Au final, nous nous sommes peut-être posé une question : tout ce butinage permet-il une pollinisation efficace ? En d’autres termes, scarabées, mouches et papillons sont-ils les insectes les mieux équipés pour polliniser les plantes ? La réponse est négative: les champions, en la matière, ce sont les hyménoptères !
Par Olivier Pouvreau, 06/05/2020
"Cela dit, il faut nuancer notre propos. En effet, certains hyménoptères comme les guêpes, les tenthrèdes ou les fourmis, s’ils se comportent comme des insectes floricoles, s’apparentent plus à des pollinisateurs relativement «moyens». Non, la véritable pollinisation, la pollinisation scientifique, nous vient d’un insecte prolétaire, d’une petite tâcheronne obsédée par les fleurs: l’abeille."
(...)
Les autres articles de Sauvages du Poitou consacrés aux insectes pollinisateurs :
Malgré les besoins de financements pour étudier les liens entre les écosystèmes et la santé humaine, la biodiversité souffre de l'austérité, car elle n'est pas perçue comme une priorité.
Par Olivier Monod, 30.04.2020, mis à jour le 6 mai 2020 (abonnés)
"Le financement de la recherche sur la biodiversité n’est pas à la hauteur. Il est ni à la hauteur de l’importance du sujet, ni à la hauteur de ce qu’il nous reste à découvrir.
Un exemple éclairant parmi d’autres. Il a été difficile d’ouvrir un poste d’enseignant-chercheur au Muséum national d’histoire naturelle de Paris (MNHN) sur… les abeilles, sujets d’actualité s’il en est. «Cela fait trois ans que nous attendions d’ouvrir un poste au concours pour étudier et rendre disponibles les collections d’hyménoptères du Muséum, une des plus belles au monde sur le sujet. Mais il n’y a pas assez de ressources dans le système de recherche en général, donc la biodiversité, comme les autres disciplines, est en tension», explique Philippe Grandcolas, directeur de recherche au CNRS."
TRIBUNE. L’économiste et Prix Nobel de la paix 2006 appelle, dans une tribune au « Monde », à repenser le monde de l’après. Pour lui, la reconstruction doit être sociale et écologique, pour éviter une catastrophe qui pourrait être bien pire que l’actuelle.
Publié le 05.05.2020 (abonnés)
[Image] Des employés volontaires assemblent la partie mécanique des respirateurs à l’usine PSA de Poissy (Yvelines), le 22 avril. BENJAMIN GIRETTE POUR LE MONDE
L’Institut national d’études démographiques (Ined) mobilise un large éventail de disciplines -- la démographie bien sûr, mais aussi l’économie, l’histoire, la géographie, la sociologie, l’anthropologie, la statistique, la biologie ou encore l’épidémiologie -- pour décrire et comprendre les changements à l’œuvre au sein des populations, qu’il s’agisse de fécondité, de mortalité, de migrations, de rapports de genre et d’équilibres entre les générations, ou encore d’inégalités sociales ou géographiques. Cette approche pluridisciplinaire est précieuse pour analyser l’impact de la pandémie de Covid-19 sur les populations et sur les sociétés, en France et dans le monde.
Covid-19 - États de la recherche
[via] Comité pour la science ouverte sur Twitter, 23.04.2020 : "Nous avions souligné l'importance des approches pluridisciplinaires de l'épidémie: @InedFr en est un bon exemple #Covid-19 #SHS" https://twitter.com/ouvrirlascience/status/1253350920735223814
Cette étude rapporte pour la première fois l’infection naturelle d’un chat en France (près de Paris), probablement par ses propriétaires. À ce stade des connaissances scientifiques, il semble que les chats ne sont pas aisément infectés par le virus SRAS-CoV-2 même en contact avec des propriétaires infectés comme l’a montrée une étude précédente sur les animaux des étudiants vétérinaires de l’EnvA. Toutefois, afin de protéger leur animal familier, il est conseillé aux personnes malades du Covid-19 de limiter les contacts étroits avec leur chat, de porter un masque en sa présence et de se laver les mains avant de le caresser.
Premier chat détecté porteur du SRAS-Cov-2 en France par l'UMR de Virologie. EnvA, 02.05.2020
Pour rappel, les chats ne sont pas considérés comme des acteurs de l’épidémie. Interrogée sur la transmission potentielle de la maladie Covid-19 par l’intermédiaire d’animaux domestiques, l’Anses a conclu dans un avis rendu début mars et complété le 20 avril qu’à la lumière des connaissances scientifiques disponibles, il n’existe aucune preuve que les animaux de compagnie et d’élevage jouent un rôle épidémiologique dans la propagation du virus SRAS-CoV-2.
→ Le SRAS-CoV-2 se réplique mal chez les chiens, les porcs, les poulets et les canards, mais efficacement chez les furets et les chats - From www.biorxiv.org - 3 April, 23:41
Réchauffement, précarité… La climatologue et membre du Giec Valérie Masson-Delmotte alerte pour que le jour d’après ne soit pas un jour d’avant en pire.
"Paléoclimatologue, Valérie Masson-Delmotte étudie les climats passés, mais elle se penche aussi au quotidien sur son évolution future. Confinée chez elle dans un village de l’Essonne, elle poursuit en effet son travail de coordination de 230 chercheurs du monde entier pour aboutir au sixième rapport du Giec (groupe d’experts intergouvernemental sur l’évolution du climat), prévu pour l’an prochain. Telle est sa mission depuis 2015, en tant que coprésidente du groupe 1, qui expertise les travaux existant sur le fonctionnement « physique » du climat. Aujourd’hui, cette grande voix de la discipline s’inquiète des fragilités révélées par la pandémie de Covid-19 et de ses conséquences pour la lutte contre le changement climatique."
... les mousti-ques peuvent-ils transmettre ce nouveau virus, officiellement dénommé SARS-CoV2 ? La réponse des entomologistes de l’EID-Med, des experts de l’EMCA et de l’OMS est unanime : c’est non !
EID Mediterranee, 09.03.2020
Extrait :
La petite bête
Faisons un peu de fiction : si un moustique reçoit une particule aérosol porteuse du coronavirus et le respire, sera-t-il simplement malade ? D’abord, la cuticule (couche externe protégeant ses organes) est hydrophobe (qui n’aime pas l’eau). Et les « spiracles » (les trous) permettant sa respiration sont extrêmement fins. De sorte qu’il faudrait non pas des gouttelettes mais des microgouttelettes, ainsi qu’une bonne dose de… malchance, pour qu’elles puissent franchir ces ouvertures. Et puis les moustiques n’étant pas des mammifères, le virus ne peut pas infecter leurs cellules respiratoires. Moralité, si on a des moustiques et, surtout, des gouttelettes infectées dans son environnement, il ne faut pas chercher la… petite bête. Demandons plutôt à nos proches de tousser dans leur coude. Et lavons-nous les mains !
En plantant des bandes fleuries en bordure de tunnel, les chercheurs du Grab d’Avignon ont pu observer quelles étaient les espèces qui attiraient le plus d’auxiliaires des cultures, tout en couvrant le sol pour limiter le salissement.
Journal Paysan Breton. Par Fanch Paranthoen, 26 avril 2020
Extrait :
12 espèces testées
Parmi les 12 espèces de plantes essayées dans ce protocole, trois ont retenu l’attention des chercheurs : l’achillée, le lotier et la centaurée jacée. « Elles limitent la charge de désherbage et sont très prometteuses en station expérimentale », confirme Jérôme Lambion, ingénieur d’expérimentation en maraîchage. Il se prépare à tester ces plantes sur le terrain et chez des producteurs. L’occupation du sol est satisfaisante pour ces 3 espèces, qui couvrent entre 80 et 90 % du sol et ne laissent donc que peu de place aux adventices pour se développer.
Quiconque a déjà touché un mimosa pudique sait qu’il replie ses feuilles au simple contact d’un doigt. La plante carnivore dionée attrape-mouche, quant à elle, referme ses feuilles sur les insectes qui se posent sur ses poils sensitifs.
Par Nathalie Kinnard, Agence Science-Presse, 14.04.2020
"Si peu de plantes répondent de façon aussi spectaculaire, elles sont toutes capables de percevoir des stimuli comme le toucher, la gravité ou la pression, signale Anja Geitmann, professeure et doyenne de la Faculté de l’agriculture et des sciences de l’environnement de l’Université McGill. « Mais on ne sait pas comment », avoue-t-elle.
Avec l’aide de son collègue Reza Sharif Naeini, du Département de physiologie, la chercheuse tente de comprendre les mécanismes à la base du sens du toucher végétal. « On espère ainsi pouvoir les exploiter afin de mieux protéger les cultures des insectes ou du vent, par exemple », explique-t-elle."
Thierry Pasquerault, entomologiste forensique de la Gendarmerie Nationale, répond aux questions de passion-entomologie au sujet de cette spécialité méconnue
[via] Benoît GILLES sur Twitter, 24.04.2020 : "Thierry Pasquerault est un expert en entomologie forensique de la Gendarmerie Nationale, ses travaux permettent de d'estimer la date de décès d'un cadavre... Il a accepté de répondre aux questions de passion-entomologie : https://t.co/Y6lgASUwGl @Gendarmerie #IRGCN #gendarmerie" https://twitter.com/PassionEntomo/status/1253629509384966145
Le 13 mai, la plateforme intergouvernementale scientifique et politique sur la biodiversité et les services écosystémiques (IPBES) a annoncé organiser un atelier portant sur le lien entre les pandémies et la biodiversité.
Par Philippe Collet, 14.05.2020
IPBES Guest Article: COVID-19 Stimulus Measures Must Save Lives, Protect Livelihoods, and Safeguard Nature to Reduce the Risk of Future Pandemics | IPBES, 27.04.2020 https://ipbes.net/covid19stimulus
TRIBUNE. Les trois stratégistes préconisent dans une tribune au « Monde », une prise en compte plus systématique et transparente de la science dans la décision politique, afin de renforcer la résilience des sociétés démocratiques.
Publié le 12 mai 2020 (abonnés)
Extrait :
Un décalage entre les sciences et les politiques
C’est ce qui nous est apparu en croisant les publications de quatre revues scientifiques de référence (Science, Nature, The Lancet et le British Medical Journal) avec les communiqués officiels de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) et l’action du gouvernement. Des hiatus et des discontinuités temporelles apparaissent de façon indéniable et ce, au moins à trois niveaux.
L'apparition de la métamorphose complète chez les insectes demeure en partie une énigme pour la science, une explication est proposée dans cet article
Par Benoît GILLES, 06.05.2020
"La métamorphose est l’une des stratégies de vie les plus répandues chez les animaux. Les fortes différences morphologiques et physiologiques entre les formes larvaires et adultes impliquent l’exploitation d’habitats et de ressources alimentaires différentes, induisant des adaptations extrêmes pour des fonctions spécifiques telle que la dispersion."
[Image] Etapes possibles dans la transition d’un cycle de vie hémimétabole à holométabole et leur relation avec le moment de la production de JH (barre bleu) et la croissance dirigée vers la forme imaginale (adulte) (triangles noirs). Les stades pronymphal (PN), protolarval (PL) et larvaire (L) sont en jaune, les stades nymphal (N) et pupal sont en vert. Les bourgeons alaires, les disques imaginaires des ailes et les ailes sont en violet (Source : Truman & Riddiford, 1999)
La métamorphose est un processus biologique particulièrement complexe, peut-être vous demandez vous comment cela a-t-il pu se mettre en place au cours de l'évolution ? Cet article apporte quelques éléments de réponse.
Dans notre dernier article consacré aux insectes pollinisateurs, nous avons exploré le monde des diptères (mouches et moustiques) et constaté que ceux-ci ont fait mieux que la mâchoire des coléoptères en adoptant un outil plus perfectionné pour butiner : la langue. Cela dit, si la langue est un progrès, on peut encore faire mieux. Comment ? Par un instrument plus long et précis: la trompe. D’où vient-elle ? Des papillons.
Sauvages du Poitou
Par Olivier Pouvreau, 23/01/2019
[Image] En guise d'illustration, ce Vulcain (Vanessa atalanta) accepte de vous tirer la trompe, dont les deux parties (galéas) sont bien visibles, crochetées ensemble tel un système de fermeture Éclair.
Gérante d’épicerie, proviseur de lycée, factrice… “Télérama” donne la parole à ceux qui se mobilisent durant la pandémie. Chercheur à l’Institut Pasteur, Jean-Claude Manuguerra dirige une unité mobilisée pour la traque du Covid-19. Après deux mois de recherche intense, il se sent toujours comme un combattant.
Par Valérie Lehoux
Publié le 06/05/2020. Mis à jour le 06/05/2020 à 19h09 (abonnés)
[Image] Jean-Claude Manuguerra : « Nous n’avons toujours pas de réponse nette à la grande question : les malades atteints du Covid développent-ils des anticorps capables de les protéger ? »
"Ceci est la traduction de l’entretien mené par Ulrich Herb auprès du journaliste scientifique Leonid Schneider à propos des paper mills, ces entreprises (« usines ») où l’on peut commander des articles falsifiés pour une publication dans des revues scientifiques."
04/05/2020 Joachim Schöpfel
"[Ulrich Herb] M. Schneider, vous avez étudié les dysfonctionnements du système scientifique, en particulier dans le domaine de l’édition, pendant de nombreuses années sur votre blog forbetterscience. Le phénomène des paper mills représente une nouvelle curiosité. Pourriez-vous nous expliquer brièvement en quoi consistent ces « usines d’articles » ?
[Leonid Schneider] Une paper mill est un prestataire de services, tout comme les sociétés de rédaction qui vendent des mémoires et thèses falsifiés aux étudiants (essay mills). Mais les clients des paper mills sont des universitaires et des médecins. En tant que client, ils y commandent un article scientifique qui correspond à un thème de leur domaine de recherche. L’article, écrit par des ghost writers, propose des résultats scientifiques complètement inventés et des données totalement erronées."
"Né du partage d'intérêts entre le monde des bibliothèques et de la recherche, Dlis est un carnet de recherche collaboratif publié avec le soutien de l'Enssib par Catherine Muller (Enssib), Hans Dillaerts (Univ. Montpellier 3) et Benoît Epron (HEG Genève). Il est dédié aux transformations numériques des sciences de l’information et des bibliothèques. Il se veut ouvert à tous chercheurs, ingénieurs, designers, étudiants et professionnels de l’information qui souhaitent partager et confronter leurs questionnements."
La science ouverte pourrait être un changement majeur de paradigme dans le partage du savoir scientifique : ne plus le faire payer, partager tout simplement.
Par Bruno David, Président du Muséum national d'Histoire naturelle, Muséum national d’histoire naturelle (MNHN), 09.04.2020
"... Des premières sociétés savantes jusqu’aux sciences participatives qui aident à enrichir les inventaires et bases de données contemporaines, l’histoire naturelle s’est co-construite avec des amateurs et des passionnés de tout bord sans qui les collections, matériau essentiel de la recherche, n’auraient jamais pu être assemblées ni décrites.
Bref, bien avant la révolution numérique qui a été un formidable accélérateur de ces échanges, on faisait de la science ouverte sans le savoir. Car la notion même de science est fondamentalement indissociable de l’ouverture des esprits, qui conditionne celle des publications et des données.
Science ouverte ! Ce devrait donc être un pléonasme, mais cela fait des décennies que cela ne l’est plus. Comment en est-on arrivé là alors que pendant des siècles la communauté scientifique avait réussi à échanger, à s’organiser à travers de multiples réseaux ?
Quand le privé s’accapare et monétise le savoir
Disons que le coup de grâce est venu de l’archange "bibliométrie". Les éditeurs privés, non contents de créer, voire de récupérer moult revues, ont forgé des outils comme l’impact factor (indice qui quantifie la qualité d’une revue à partir du nombre moyen de citations de ses articles) ou le H-index (autre indice qui quantifie la réputation d’un chercheur sur la base des citations de ses articles) sur lesquels les scientifiques eux-mêmes se sont précipités pour s’évaluer entre eux.
Magie d’une arithmétique simpliste qui, en dépit de critiques bien étayées, continue d’être utilisée et qui a cadenassé la science en lui fournissant une liste des « bonnes » revues, les plus chères bien sûr dont les abonnements pour 12 numéros peuvent coûter plusieurs milliers d’euros, voire dépasser les 10 000 euros.
Seulement voilà, après avoir demandé aux scientifiques, la plupart du temps payés par les pouvoirs publics, d’écrire leurs articles, de les éditer, de valider gratuitement ceux de leurs pairs, puis de payer pour les lire, les éditeurs ont aussi souhaité faire payer pour publier, simplement en proposant des accès facilités et accélérés à la publication contre rétribution.
Bref, une forme d’asservissement consenti s’est installée, où il fallait passer trois fois à la caisse. Certes, il faut reconnaître le travail et la valeur ajoutée de l’éditeur qui a des compétences propres à la valorisation et à la diffusion de l’activité scientifique : éditer, structurer et diffuser un livre, une revue, une base de données, a un coût et un entrepôt de PDF est loin d’être une revue scientifique. Encore faut-il apprécier et monnayer ce travail à son juste prix, et dans bien des cas, les comptes ne sont plus bons.
Refaire circuler librement les connaissances
À trop vouloir gagner, un vent contraire s’est levé, celui de la science ouverte. À l’heure des réseaux et du numérique, pourquoi la connaissance scientifique, bien de tous, ne pourrait-elle pas circuler librement ? Poser la question, c’est y répondre, surtout à une époque où l’acquisition de nouvelles données et connaissances n’est plus le coup d’éclat de quelque savant isolé, mais le fruit de collaborations multiples. La connaissance avance comme une vague collective où tout se partage et où chacun bénéficie de l’influence de tous. Dans un monde économiquement fracturé, la libre circulation des connaissances scientifiques est un indéniable levier de rééquilibrage et de développement, y compris dans les rapports Nord-Sud. Tout ce qui facilite les échanges fait donc sens et est même devenu une nécessité impérieuse.
L’avènement du numérique permet cela : au-delà des publications, le croisement et l’agrégation des données de la recherche issues de silos disciplinaires variés permet d’accélérer les possibilités de calcul, de fouille et d’analyse par l’utilisation des machines et de l’intelligence artificielle. Pour que l’innovation scientifique se déploie à cette nouvelle échelle, encore faut-il que les données soient ouvertes et interopérables, tant techniquement que juridiquement."
[via] Cosciences sur Twitter, 01.05.2020 : "#live #Science nous parlons de perte de biodiversité à 18h en compagnie de Gérard Duvallet, directeur de recherche en écologie et Stanislas Rigal, doctorant en écologie. Peut-on sauvegarder la #biodiversite dans un système capitaliste ?"
La dengue est une infection virale transmise par les moustiques. Elle provoque un syndrome de type grippal et peut évoluer à l’occasion vers des complications potentiellement mortelles, appelées dengue sévère.
En cas de dégradation d’un espace naturel, comment reconstituer toute la complexité du vivant ?
Dans la plaine de la Crau, près de Arles dans les Bouches du Rhône, c’est grâce à l'action de fourmis que les scientifiques ont pu rétablir la biodiversité d'un écosystème dégradé par les activités humaines suite à la rupture d'un oléoduc au coeur d'une réserve naturelle.
Histoire réussie d’une approche novatrice, l’ingénierie écologique, qui s'inspire du vivant, avec le chercheur Thierry Dutoit du CNRS et de l'IMBE.
Qu'est-ce que la santé publique? Comment est née l’épidémiologie moderne? Quelles approches nouvelles ont pu inaugurer les grandes études sur le tabagisme (y compris passif ) et celles sur les risques cardiovasculaires? Quels sont les niveaux de preuve et de causalité en épidémiolog[...]
L’attirance est mesurée, j’ai constaté que toutes les fleurs ouvertes déclenchaient soit des visites approfondies avec parcours à l’intérieur de la corolle, soit des passages furtifs sans attirances, comment expliquer ces phénomènes ?
Par Marcel .bÉguÉ, 14.04.2020
"Au plan énergétique, l’insecte doit repérer rapidement la fleur riche en nectar et pollen et s’éloigner de celle qui semble » pauvre en sucre ou protéine « .
Les capacités innées à reconnaitre la fleur par son odeur, sa forme et sa couleur aident l’insecte à diminuer son temps de recherche et d’optimiser son prélèvement.Les fleurs survolées traduisent une absence de « butin » car déjà visitées ou la présence de signaux déposés par d’autres insectes .
La fleur est composée, d’une corolle à 5 pétales protégeant les organes mâles , les étamines et l’organe femelle , le pistil.
En observant les abeilles, on s’aperçoit qu’elles cheminent sur ces « pointes végétatives, souples et dociles » en récoltant sur leurs poils, les fines particules de pollen, qui seront déposées par contact sur le pistil, une fécondation très efficace avec des fruits garantis."
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