Life Sciences Université Paris-Saclay

Patrick Wincker a organisé et dirigé au Genoscope les programmes de séquençage de génomes aussi divers que variés : participation au séquençage du génome du poisson Tetraodon, puis du chromosome 14 humain et de plusieurs chromosomes d’Arabidopsis et du riz.

Il a ensuite pris en charge des génomes complets, comme celui de la paramécie, du rotifère Adineta vaga, de la truffe, et de nombreux génomes de plantes comme la vigne, le cacaoyer, le colza ou le rosier. A chaque fois son analyse a révélé des particularités insoupçonnées comme la présence de polyploïdie cryptique.

Plus récemment, en partenariat avec Tara Océans, il a développé des programmes de métagénomique, qui lui ont permis de caractériser nombre d’espèces inconnues. Sa contribution originale est majeure et a ouvert la voie à de nombreuses études fondamentales ou appliquées.

La recherche de nouveaux composés hautement spécifiques des cellules cancéreuses est un axe de recherche primordiale dans le développement de nouvelles chimiothérapies anticancéreuses. Le principal obstacle est lié à la redondance et à la plasticité des systèmes de signalisation intracellulaire. Le criblage de la chimiothèque de l’Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), sur le campus CNRS de Gif-sur-Yvette, a permis l’identification d’une molécule, ICSN3250, qui est 100 fois plus efficace sur les cellules humaines cancéreuses que sur les cellules humaines normales. Ce composé est cytotoxique à une concentration nanomolaire sur de nombreuses lignées de cellules cancéreuses, sans aucun effet sur les cellules normales, et tue spécifiquement les cellules cancéreuses issues de tumeurs ex vivo.

Une approche pluridisciplinaire (chimie, biochimie, biologie cellulaire et clinique) en collaboration avec de nombreuses équipes (CNRS, INSERM, Université Paris-Descartes, Université Paris-Diderot, Université de Bordeaux, Institut de Cancérologie Bergonié) a permis de démontrer son mode d’action, basé sur un nouveau mécanisme d’inhibition de l’enzyme mTOR kinase (Cancer Res., 2018, 78, 5384-5397). Cette enzyme, responsable de la survie cellulaire, est une cible privilégiée par l’industrie pharmaceutique depuis de nombreuses années pour le développement de nouveaux médicaments anticancéreux. A ce jour, il existe 3 grandes classes d’inhibiteurs de mTOR kinase, mais leurs effets en clinique restent très limités, sans doute en raison de leur faible cytotoxicité cellulaire. ICSN3250, de part son mécanisme d’action, définit une nouvelle classe d’inhibiteurs de l’enzyme mTOR kinase.

Le projet et le brevet associé (WO2014/060366) sont actuellement soutenus par la SATT IDF Innov, en phase de pré-maturation. Ce projet doit déboucher rapidement sur une phase de maturation par la synthèse d’analogues, associés à des études pharmacologique et antitumorale in vivo chez l’animal, pour conduire à un candidat médicament optimisé.

Contacts:

Pascal Collin, Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques (LCBPT), CNRS UMR 8601, Université Paris-Descartes, Paris, France (pascal.collin@cnrs.fr ; pascal.collin@parisdescartes.fr ; pascal.collin@univ-paris-diderot.fr)

Raúl V. Durán, Institut Européen de Chimie et Biologie (IECB), INSERM U1218, Université de Bordeaux, Pessac, France (raul.duran@inserm.fr ; raul.duran@cabimer.es)

Bogdan I. Iorga, Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), CNRS UPR 2301, Université Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette, France (bogdan.iorga@cnrs.fr)

Jamais en manque d’applications, les polymères investissent également la lutte contre le cancer. Des chercheurs de l’Institut Galien Paris-Sud (IGPS, CNRS/Université Paris-Sud, Université Paris-Saclay) et de l’Institut de Chimie Radicalaire (ICR, CNRS/Aix-Marseille Université) ont ainsi développé des polymères dont les deux extrémités sont occupées par des molécules de principes actifs ou des sondes fluorescentes. Ces travaux, publiés dans le Journal of Controlled Release, permettent notamment de convoyer efficacement plusieurs agents anticancéreux en même temps, pour une utilisation potentielle en chimiothérapie combinatoire.

Lorsque des médicaments anticancéreux sont administrés pour soigner des tumeurs, leur zone d’action doit être soigneusement circonscrite, dans l’espace et le temps, afin de limiter les dommages collatéraux causés aux tissus sains. Or les méthodes actuelles d’encapsulation de principes actifs, au sein des nanoparticules, n’embarquent que de faibles quantités à la libération souvent incontrôlable. En quête de nouvelles solutions, des chercheurs de l’Institut Galien Paris-Sud (IGPS, CNRS/Université Paris-Sud, Université Paris-Saclay) et de l’Institut de Chimie Radicalaire (ICR, CNRS/Aix-Marseille Université) ont conçu des polymères fonctionnalisés à leurs extrémités par des molécules d’intérêt, puis les ont formulés en nanoparticules.

Les chercheurs proposent une méthode simple, en très peu d’étapes de synthèse, pour positionner des molécules aux extrémités du polymère : un principe actif et une molécule fluorescente pour l’imagerie, ou deux principes actifs différents. Cette seconde combinaison, une première mondiale, présente un réel intérêt en chimiothérapie combinatoire. La méthodologie permet également de convoyer davantage de principe actif par nanoparticule, limitant ainsi la quantité de nanoparticules administrées. Avec cette approche, les propriétés anticancéreuses des molécules ne sont activées qu’après rupture de leur liaison avec le polymère, ce qui améliore le contrôle de leur action.

Ces travaux ont été réalisés dans le cadre du projet Européen H2020 NABBA (Action Marie Skłodowska-Curie Innovative Training Network).

Contact : julien.nicolas@u-psud.fr

Vu dans Sciencesetavenir.fr : pour la première fois, des chercheurs ont réussi à réadministrer une thérapie génique en contournant le système immunitaire du patient.

C'est une première scientifique ! Les thérapies géniques avaient jusque-là une limite importante : elles ne pouvaient pas être administrées plus d'une fois, en raison des défenses immunitaires constituées lors de la première injection. Bonne nouvelle : des chercheurs de Généthon, de l’AFM-Téléthon et de l’Inserm ont réussi à résoudre ce problème, d'après de nouveaux travaux sur l'animal parus dans Nature Communications.

Les sciences du végétal ont désormais leur école universitaire de recherche (EUR) au cœur de Paris-Saclay. Né dans la continuité du LabEx SPS, réseau de recherche en biologie végétale de Paris-Saclay depuis 2011, ce projet de « Graduate School » à la française a été sélectionné dans le cadre du Programme d’Investissement d’Avenir 2017.

Séminaire itinérant du Centre d'Alembert
 

"La sélection dans tous ses états : fonctions, processus, conséquences"

Les séminaires reprennent dès le 13 novembre avec une première séance autour de la sélection – naturelle et artificielle – dans les sciences du vivant.

La sélection semble partout, dans la nature comme dans la société. Elle est souvent présentée comme l’outil idéal pour obtenir la meilleure adéquation entre souhaits et possibilités, besoins et ressources. C’est par la sélection qu’émergerait l’excellence. Est-ce le mode de fonctionnement optimisé de toutes les organisations ou un mode de gestion en situation de pénurie ? S’agit-il d’un processus rationnel pour obtenir des résultats interprétables ou d’une contingence ayant modelé l’évolution des espèces ? Comment fonctionne la sélection et existe-t-il des alternatives ? Nous réfléchirons sur les critères et les méthodes de sélection, qu’ils soient automatisés ou non,  et au-delà nous interrogerons l’impact de la sélection sur le fonctionnement de nos disciplines scientifiques, sur l’établissement des normes, et sur l’organisation de nos sociétés. Pour cela, le Centre d’Alembert fera intervenir des collègues de différents domaines dans le cadre de ce séminaire : science de l’éducation, sciences de la vie, sciences et techniques des activités physiques et sportives, économie, informatique, physique…

Afin de toucher l’ensemble de la communauté universitaire sur le périmètre Paris-Saclay, tant d’un point de vue disciplinaire que géographique, le Centre d’Alembert propose un « séminaire itinérant ».

Le thème annuel de réflexion du Centre, « La sélection dans tous ses états : fonctions, processus, conséquences », sera décliné en six séminaires, relevant de domaines spécifiques, et traités au sein de différents laboratoires locaux.
 

• Séance 1 : Mardi 13 novembre 2018 de 14h à 16h – Campus d’Orsay
  autour de la sélection – naturelle et artificielle – dans les sciences du vivant
  
  Intervenants : Guillaume Achaz, enseignant-chercheur UPMC, Muséum national d’Histoire naturelle et Isabelle Goldringer, chercheuse INRA, Génétique Quantitative et Évolution – Le Moulon
  Organisateurs : Julien Gargani, Centre d’Alembert et Annick Jacq, I2BC (Institut de Biologie Intégrative de la Cellule).

Cancer Campus, adossée à Gustave Roussy (centre de lutte contre le cancer à Villejuif), est une association en charge du développement d’un cluster dédié à l’innovation en santé et oncologie. L’une de nos missions est le soutien à la création d’entreprises en santé avec des applications en oncologie. 

Pour ce faire, Cancer Campus et Creative Valley lancent l'appel à projet de la 5ème édition du programme OncoEntrepreneur, visant à sensibiliser et à accompagner tout porteur de projets vers la création d’entreprise biotech, medtech et services d'aide aux patients.

Les deux partenaires se rendant compte des formidables opportunités actuelles dans les secteurs associant santé et numérique, leur association vise à promouvoir cette alliance santé et numérique dans des projets d'entrepreneuriat. C'est ainsi qu'en collaboration avec Microsoft, nous lançons également la toute première édition du programme OncoNumérique, une déclinaison d'oncoEntrepreneur dédié aux projets associant TIC et santé.

Ces deux programmes offrent aux porteurs de projets des mastersclass spécialisées avec des intervenants de qualité, un coaching personnalisé pour chaque projet, une proximité avec les patients et cliniciens et une présentation devant un comité d'investisseurs ainsi que le label « ONCOENTREPRENEUR » ou « ONCONUMERIQUE » pour les meilleurs projets. 

La participation à ces 2 programmes est également ouverte aux entreprises déjà créées, qui accéderont directement à la phase d'accélération.

Le facteur Willebrand (VWF) est une protéine plasmatique qui joue un rôle clé dans la formation du thrombus plaquettaire lors d’une blessure vasculaire. La structure du VWF est complexe avec une organisation en domaines arrangés dans l’ordre suivant : D’D3-A1-A2-A3-D4-C1-C2-C3-C4-C5-C6-Ck. Chacun de ces domaines a une fonction spécifique. Le domaine C4 dont la structure n’a pas été identifiée jusqu’à présent contient le site de liaison du VWF à l’intégrine plaquettaire aIIbb3 (séquence RGD).

Dans une étude parue dans Blood, l’équipe de l’UMR-S 1176 à la faculté de médecine au Kremlin-Bicêtre a participé à une étude collaborative menée par le Pr. Matthias Wilmanns (EMBL, Hambourg) visant à élucider la structure 3D du domaine C4 par spectrométrie RMN à haute fréquence. Cette technologie a permis de mettre en évidence la flexibilité du domaine de liaison à aIIbb3 ainsi que la localisation des ponts disulfures. Une articulation autour de la Valine 2547 a aussi été identifiée, permettant une exposition différente du motif RGD ce qui suggère une régulation conformationnelle de l’interaction VWF-aIIbb3.

Finalement la présence de la mutation (p.Y2561Y) identifiée chez des patients avec un phénotype pro-thrombotique ne semble pas induire de différence dans la conformation du domaine C4. Il est donc probable que le phénotype prothrombotique de cette mutation s’exerce en modifiant l’arrangement spatial entre le domaine C4 et les domaines voisins plutôt qu’en modifiant l’exposition du motif RGD.

Contact : peter.lenting@inserm.fr ou cecile.denis@inserm.fr

Information about the world around us is gathered through our senses and processed in the sensory areas of our brain. In order to perceive and recognize objects, a vast array of defining properties, or features, need to be identified and analyzed by the nervous system. In the visual system, decades of work has elucidated many different types of features in the environment and how they are encoded in different areas of the brain. In the tactile system however, these regional specializations have only been theorized and not observed through experimental study.

The paper published in the journal Nature Communications by Matías A. Goldin, Evan R. Harrell and collaborators (UNIC, CNRS Gif-sur-Yvette) presents the first evidence that maps the representation of different tactile feature sets to the two largest somatosensory cortical regions in the rat brain. They show that the primary and secondary somatosensory brain regions contain specialized representations that likely support complementary and interdependent aspects of tactile sensation.

Roughness, global shape, and object motion are examples of tactile features that are best extracted using multiple vibrissae (i.e. the whiskers on the snout of the rat) and sampling across extended windows of time. The secondary somatosensory cortex is specialized for extracting these kinds of global features, and understanding how this fits with what is already known about primary cortical areas gives useful insights into how rodents parse the tactile world. This information can then be used for implementing brain machine interfaces involving sensory feedback.

Image: Christophe Lebedinsky/CNRS Photothèque. Rodent’s whiskers help palpate, recognize objects and navigate the world.

Contact: daniel.shulz@unic.cnrs-gif.fr

Dans un article de revue récemment accepté dans Advanced Drug Delivery Reviews, Alexandre Bordat, Tanguy Boissenot, Julien Nicolas et Nicolas Tsapis (Institut Galien Paris-Sud, CNRS/UPSaclay, Faculté de Pharmacie) décrivent l’état de l’art concernant l’utilisation de polymères thermosensibles pour l’encapsulation et la libération de substances actives. Afin de contrôler finement leur libération sous l’effet d’une augmentation de température (hyperthermie), deux familles de polymères existent :  ceux possédant une température critique inférieure de solubilité (lower critical solution temperature - LCST) et ceux possédant une température critique supérieure de solubilité (upper critical solution temperature - UCST). Les polymères LCST sont solubles à une température inférieure à la LCST et deviennent insolubles au-delà, tandis que les polymères UCST sont insolubles en-dessous de l'UCST et solubles au-dessus. Les polymères LCST ont été étudiés depuis environ deux décennies et ont été formulés en nanoparticules thermosensibles mais leur passage en clinique n’est pas encore acté car une partie de la substance active reste piégée après application de l’hyperthermie (Figure, gauche). L’étude des polymères UCST (Figure, droite) est plus récente car jusqu’à peu ils n’étaient pas solubles dans l’eau. Si les données de la littérature montrent souvent que l'hyperthermie améliore la libération de la substance active in vitro ou in vivo, les auteurs omettent souvent les contrôles non thermosensibles permettant de comprendre comment la température influe sur la diffusion de la substance active à partir de la matrice polymère. Afin que les nanoparticules polymères thermosensibles puissent atteindre les essais cliniques, leur conception nécessite la synthèse de matériaux biocompatibles et biodégradables, mais aussi une bonne communication entre chercheurs de différentes domaines et cliniciens afin d’adapter les nanosystèmes développés aux exigences des modalités d'application de l'hyperthermie en clinique.

Contact : nicolas.tsapis@universite-paris-saclay.fr

Ouvrir à toute la communauté scientifique les données d’imagerie cérébrale de primates obtenues dans les laboratoires : c’est l’objectif de la base de données PRIME-DE , créée par un consortium international de 22 équipes travaillant avec des macaques, dont six équipes du CNRS, de l’Inserm et du CEA. En raison d’une organisation cérébrale très proche de la nôtre, le macaque reste un modèle essentiel pour l’étude du fonctionnement du cerveau humain et de ses pathologies. Cette initiative, décrite dans la revue Neuron le 27 septembre 2018, permettra d’augmenter la pertinence statistique des résultats obtenus et de diminuer le nombre d’animaux utilisés.

Claire Giry devient chargée par intérim des fonctions de présidente de l'Inserm. Elle remplace Yves Lévy, nommé "conseiller d'État extraordinaire" depuis le 12 octobre 2018. Claire Giry est directrice générale déléguée de l'Inserm depuis décembre 2017.

EXTENDED REGISTRATION DEADLINE: 23rd October 2018

The first international symposium organized by France Génomique and Genoscope entitled
"International Symposium on Environmental and Agronomical Genomics",
will take place from 5 to 7 November 2018,  in  Paris

Agenda and registration:     https://www.france-genomique.org/symposium2018/

For any question, do not hesitate to contact: biodiversity2018@france-genomique.org

Digitization in healthcare generates massive databases which have allowed the implementation of new AI-based solutions. This technological shift brings new scientific, economic and political
opportunities and challenges in our healthcare systems. AI in health has thus become a top priority in European public policy as well as in the private sector. It represents a paradigm shift towards 6Pmedicine (predictive, preventive, proof-based, patient-centric, personalized and precise) which will have an impact on well-being.

France and Germany have both acknowledged the importance of AI and are joining forces to make Europe a leader in this field. The cooperation between both countries in the health sector is already
one of the most intense. Hence we would cordially like to invite you to our joint conference

“Artificial Intelligence in Health: French-German perspectives”
November 5th 2018, from 1 pm to 7:30 pm.

This conference is co-organized by the Smart Data Forum and the Embassy of France in Germany, with the support of the French-German University and the Berlin FrenchTech Hub and the Berlin Science Week.

The conference will be opened by Federal Minister of Health Jens Spahn (CDU) in presence of the Ambassador of France, Anne-Marie Descôtes. It will explore aspects regarding public policy
as well as medical, industrial, scientific and ethical stakes of the development of AI in the health sector and will showcase French & German start-ups.

The number of seats of the conference is limited. Please register using the following link.