Life Sciences Université Paris-Saclay

Dans une étude parue dans Scientific Reports, Anne-Cécile Guyot, Charlotte Leuxe, Aloïse Mabondzo, du CEA/institut Joliot/Département Médicament et Technologie pour la Santé/SPI et leurs collaborateurs ont découvert une famille de molécules (purines dérivées de la roscovitine) à fort potentiel thérapeutique pour le traitement des maladies neurodégénératives. Ces molécules sont capables de franchir la barrière hémato-encéphalique pour être distribuées dans le tissu cérébral. L’évaluation de leurs activités pharmacologiques et en particulier d’un des dérivés puriques lead a permis de mettre en évidence sa capacité à interférer avec des éléments clés de processus physiopathologiques impliqués dans les maladies neurodégénératives. Après un mois de traitement, il a été notamment constaté une restauration des fonctions cognitives de souris âgées et de souris traitées par le LPS ou à la scopolamine, modèles des maladies neuro-inflammatoires et neurodégénératives. Cette restauration des fonctions cognitives est associée à une modulation significative de l’activation astrocytaire et de la neurogenèse, à la différence de l’action du Donépezil. De plus les chercheurs ont noté une modulation de l’activité microgliale et une inhibition de la phosphorylation de la protéine Tau. L’étude des mécanismes moléculaires a permis d’identifier une des cibles moléculaires. Il s’agit de la prohibitine, protéine d'échafaudage qui est impliquée dans de nombreuses voies de signalisation et notamment dans la neuroprotection.

L’ensemble de ces observations expérimentales laissent à penser que cette nouvelle classe de dérivés puriques pourrait être développée pour le traitement des pathologies neurodégénératives. L’exploration du potentiel thérapeutique de ces dérivés puriques se poursuit parallèlement avec la sélection de candidats médicament. 

Contact : aloise.mabondzo@cea.fr

Au cours des dernières années, une grande partie du transcriptome eucaryote qui ne code pour aucune protéine fonctionnelle, les ARN dits non-codants, sont apparus comme des régulateurs contrôlant l'expression des gènes. Cette « matière noire » du génome eucaryote, bien que non traduite en protéines, peut être transcrite en ARN non-codants fonctionnels participant à un large éventail de mécanismes moléculaires au cours de l'évolution. Au cours de travaux antérieurs, Martin Crespi et ses collègues de l'Institut des Sciences Végétales de Paris-Saclay (IPS2) ont révélé que le long ARN non-codant APOLO était capable de contrôler l’expression d’un régulateur clé de la signalisation des hormones végétales (le gène PID) en cis par la modulation de l'accessibilité du promoteur du gène PID (Ariel et al., Molecular Cell 2014). Cette année, dans un travail également publié dans Molecular Cell, la même équipe en collaboration avec des collègues de l'Institut d'« Agrobiotechnologie du Litoral » (IAL, Argentine), dans le cadre du LIA CNRS NOCOSYM (Laboratoire International Associé) ont démontré que le long ARN non-codant APOLO peut coordonner l'expression de multiples gènes distants en trans chez Arabidopsis. APOLO reconnaît ces cibles grâce à une complémentarité de séquence et à la formation de duplex d'ADN-ARN appelés « R-loops ».

En utilisant plusieurs techniques à l'échelle du génome, les auteurs ont pu montrer que, lors de la reconnaissance des cibles, APOLO peut moduler la conformation tridimensionnelle de la chromatine des loci distants afin de contrôler finement leur transcription. Cette reconnaissance, dépendante des « R-loops », peut leurrer des régulateurs épigénétiques clés (tels que la LHP1, une protéine impliquée dans les complexes liés à Polycomb) afin de moduler l’accessibilité chromatinienne de ces sites distants. Ainsi, l'activité du génome non-codant façonne dynamiquement l'organisation spatiale de l'information génétique dans le noyau à différents loci.

Cette étude a révélé un nouveau mécanisme de régulation impliquant des ARN non-codants qui pourraient contribuer à la grande diversité des profils d’expression génétique observés dans la cellule eucaryote. Ainsi dans « l’univers génomique », la « matière noire » génétique (les ARN non-codants) pourrait réguler « l’éclat » (le niveau d'expression) des « étoiles » (gènes codants des protéines).

Contact :  martin.crespi@ips2.universite-paris-saclay.fr

La Fièvre Aphteuse est une maladie très contagieuse à impact économique majeur chez les ruminants et porcs. Les vaccins inactivés contre le virus de la Fièvre Aphteuse sont efficaces mais difficiles à produire en raison des contraintes importantes de confinement. Des vaccins adénoviraux non réplicatifs (Ad-FMDV) représentent une alternative intéressante. L’équipe d’Isabelle Schwartz-Cornil de l’UMR-INRA-UVSQ VIM à Jouy-en-Josas, en collaboration avec l’UMR Virologie de Maisons-Alfort, a montré dans l’espèce ovine que l’Ad-FMDV, à condition d’être adjuvé, induit des taux d’anticorps neutralisants inférieurs à ceux induits par un vaccin inactivé mais compatibles avec une activité protectrice. De plus, ces 2 types de vaccins, et pas l’Ad-FMDV seul, modulent dans le sang 24h après l’injection, la réponse génique lymphocytaire T dont l’activité réduite est associée à une forte réponse anticorps à long terme.

La réponse génique précoce dans le sang post-vaccination offre donc des éléments intéressants pour la compréhension des mécanismes présidant à l’induction de bonnes réponses humorales et pour l’identification de biomarqueurs prédictifs de l’efficacité vaccinale.

Ces travaux sont parus dans NPJ Vaccines.

Contact : isabelle.schwartz@inrae.fr et luc.jouneau@inrae.fr

Dans le cadre d'une collaboration internationale, une équipe du Laboratoire de Maladies Neurodégénératives (MIRCen, CEA de Fontenay-aux-Roses)) a caractérisé les effets pathologiques de différentes souches d'agrégats d'alpha-synucléine in vivo, leurs conformations structurelles étant déterminantes dans le mode d'amplification et de propagation dans le cerveau. Ces travaux ont fait l'objet d'une publication dans Acta Neuropathologica Communications.

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Contact : nolwen.rey@cnrs.fr

Philippe Ciais, chercheur CEA au Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement (LSCE-IPSL, UMR8212 CNRS/CEA/UVSQ) vient d'être élu à l'Académie des Sciences dans la section Sciences de l'Univers.

Les travaux de Philippe Ciais portent sur de nombreux aspects du cycle du carbone et du rôle des écosystèmes continentaux dans le système climatique. Le caractère fondateur de ces travaux et leur influence dans la discipline sont largement reconnus en France et à l’étranger.

Philippe Ciais a piloté le développement d’un réseau de surveillance des gaz à effet de serre en France, qui est devenu une composante clé du Système intégré d’observation du carbone (Integrated Carbon Observation System, ICOS ) dont il a coordonné la phase préparatoire en Europe. Il a été codirecteur du Global Carbon Project à l’origine du Global Carbon Atlas et auteur principal du 5e rapport d’évaluation du Groupe intergouvernemental d’experts sur l’évolution du climat (Giec).

L’équipe iGEM de l’Université d’Évry et Genopole recrute pour le défis 2020.
Nul besoin d’être un·e expert·e en biologie … Juste l’envie de relever le challenge !
Étudiant·e·s de toutes disciplines, rejoignez-les !
Suzanne et Antoine nous parlent de leur expérience avec l'équipe iGEM.

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Du lundi 27 janvier au vendredi 31 janvier 2020 se sont déroulées les élections des représentants des personnels et des usagers (étudiants) de l’Université Paris-Saclay aux deux conseils statutaires, le Conseil d’Administration (CA) et le Conseil Académique (Cac), composé pour ce dernier de la Commission de la Recherche (CR) et de la Commission de la Formation et de la Vie Universitaire (CFVU).

Résultats des élections

Le taux de participation global de ces élections a été de 17,91%, réparti comme suit pour le Conseil d'Administration :

- Collège A : 62 % (Professeurs)

- Collège B : 41,63% (autres Enseignants-Chercheurs, Enseignants...)

- Collège C : 8,03% (Étudiants)

- Collège D : 40,77% (BIATSS)

Télécharger la décision de proclamation des résultats ICI.

L’élection du futur Président de l’Université Paris-Saclay par le nouveau Conseil d’Administration aura lieu le lundi 2 mars 2020.

C’est parti ! Fin janvier 2020, la Présidence, la Direction et les services administratifs de l’ENS Paris-Saclay déménagent dans le nouveau bâtiment situé sur le plateau de Saclay, à Gif-sur-Yvette (Essonne). Notre nouvelle adresse : 4, avenue des Sciences - 91190 Gif-sur-Yvette.

Il faudra environ 6 mois pour déménager les 17 laboratoires et instituts interdisciplinaires et les 12 départements d’enseignement de l’École :
- 50.000 cartons et caisses réalisés
- 20.000 étiquettes posées

Au total déménageront :
285 enseignants et chercheurs
224 personnels BIATSS
12 départements d’enseignement
14 laboratoires
3 instituts interdisciplinaires de recherche

1670 élèves normaliens et étudiants et 298 doctorants feront leur première rentrée dans ce nouveau bâtiment en septembre 2020.

L'initiative en matière de médicaments innovants lance son 20e appel à propositions.

Topics

• Topic 1: Early diagnosis, prediction of radiographic outcomes and development of rational, personalised treatment strategies to improve long-term outcomes in psoriatic arthritis
• Topic 2: Innovations to accelerate vaccine development and manufacture
• Topic 3: Academia and industry united innovation and treatment for tuberculosis (UNITE4TB)
  This topic is part of the IMI AMR Accelerator Programme. Applicants should also read the Questions and Answers on the programme (document last updated November 2019).
• Topic 4: Tumour plasticity
• Topic 5: Proton versus photon therapy for oesophageal cancer – a trimodality strategy
• Topic 6: Handling of protein drug products and stability concerns

Date limite de candidature : 21 avril 2020

La Fondation L'Oréal, en partenariat avec la Commission nationale française pour l'UNESCO et l'Académie des sciences, est heureuse de vous annoncer l'ouverture de l'appel à candidature de l'édition 2020 du programme Jeunes Talents France L'Oréal-UNESCO Pour les Femmes et la Science.

Créé en 2007, ce programme a pour objet de révéler et récompenser de jeunes chercheuses talentueuses. Au total, 265 jeunes femmes ont bénéficié d’une dotation L'Oréal-UNESCO Pour les Femmes et la Science 

En 2020, la Fondation L'Oréal remettra 35 dotations en France. Au minimum, 5 de ces dotations seront dédiées à des chercheuses effectuant leurs travaux de recherche dans les Outre-mer.

-                 d’un montant de 15 000 € chacune à des doctorantes,

-                 d’un montant de 20 000 € chacune à des post-doctorantes

Nous vous sollicitons afin de bien vouloir diffuser cet appel à candidature au sein de votre laboratoire et ainsi, encourager les chercheuses à soumettre leur dossier.

Pour cela, nous vous adressons le lien vers la  plateforme digitale du programme www.forwomeninscience.com où vous trouverez le règlement du programme, ainsi que l'affiche que vous pouvez utiliser sur vos supports de communication.  

La date limite de dépôt des dossiers de candidature est le lundi 23 mars 2020.

C’est au Service Hospitalier Frédéric Joliot (SHFJ) du CEA à Orsay (DRF/Institut des Sciences du Vivant Frédéric Joliot), dans l’UMR d’Imagerie Biomédicale Multimodale Paris-Saclay BIOMAPS, que la magie opère. Là-bas, à l’abri des regards, la plateforme de radiomarquage (SHFJ/Radiochimie) met en œuvre une étrange alchimie : elle transforme un simple atome radioactif en un outil diagnostique puissant pour l’imagerie tomographique à émission de positons (TEP). Que ce soit avec du carbone-11 (demi-vie 20,4 min) ou du fluor-18 (demi-vie 109,8 min), produits sur place avec un cyclotron médical pour radiomarquer de façon covalente de petites molécules, ou avec du zirconium-89 (demi-vie 78,4 heures) complexé avec des « biologics » (protéines, anticorps), une myriade de radiotraceurs est mise à la disposition de la science. Oncologues, neurologues, pharmaciens, biologistes se précipitent pour étancher leur soif de recherche, qu’elle soit biomédicale (chez l’Homme) ou préclinique (sur petits et gros animaux). Marquage isotopique de médicaments, traceurs de la neuroinflammation, des agrégats protéiques ou des récepteurs neuronaux, métabolisme et hypoxie tumorale, imagerie de l’infection… Voilà une liste non exhaustive des prouesses réalisées par la plateforme de radiochimie du SHFJ, à votre service. Equipées de 4 automates de synthèses, d’un laboratoire de contrôle qualité et d’une radiopharmacie toujours de garde, les petites fées de la plateforme sont parées pour exhausser vos souhaits. D’autant que la famille s’agrandit. En 2020, un nouveau laboratoire de production de radiopharmaceutiques en salle blanche verra le jour, doublant la capacité de production actuelle. De quoi ravir toute demande en radiotraceurs et radiopharmaceutiques originaux pour faire de l’imagerie TEP, l’outil diagnostique et pronostique par excellence.

Vous êtes intéressés mais vos activités semblent trop éloignées d’Orsay ? Pas de panique ! Grâce à notre service de livraison Express, nous livrons à domicile ces produits de qualité pharmaceutique en un temps record.

La plateforme de Radiochimie du SHFJ (SHFJ / Radiochimie) a pour vocation de synthétiser des radiotraceurs pour la recherche biomédicale, en particulier pour l’imagerie par tomographie d’émission de positons, à partir d’émetteurs de positons produits sur site (Carbone 11, Oxygène 15, Fluor 18) ou importés (par exemple Zirconium 89).

Contact : fabien.caille@cea.fr

Le cortex somatosensoriel primaire (S1) des rongeurs est devenu un modèle majeur pour l'étude du traitement cortical des informations sensorielles tactiles. Une large portion de cette aire corticale est dédiée au traitement des informations en provenance des moustaches (vibrisses) de la face de l’animal. Cependant, lors d’une stimulation mécanique des vibrisses, les informations tactiles atteignent d'abord S1 mais aussi, presque simultanément une aire corticale adjacente, le cortex somatosensoriel secondaire (S2). Pour mieux comprendre le rôle de S2 dans la perception du toucher, il est essentiel de bien caractériser les réponses neuronales évoquées par des stimuli tactiles dans cette aire corticale.

Des chercheurs de l’institut des Neurosciences Paris-Saclay (NeuroPSI) ont décrit comment les réponses sont organisées spatialement au sein de S2 à l’aide de l’imagerie sensible au potentiel. Cette technique permet d’enregistrer l’activité neuronale au niveau du cortex avec une excellente résolution spatio-temporelle. L'analyse des propriétés spatiales des réponses induites par la stimulation individuelle de 22 à 24 vibrisses a révélé qu'elles sont topographiquement ordonnées dans l'espace au sein d’une carte symétrique, en miroir, par rapport aux réponses neuronales en S1. S’il existe un court délai (~3 ms) entre l'activation précoce de S1 et S2, les signaux évoqués dans ces deux aires sont étroitement corrélés, et d’amplitude similaire. Enfin, les propriétés spatio-temporelles des réponses de S2 sont susceptibles de favoriser l'intégration des stimuli multi-vibrissaux et l’émergence d’un percept global à partir de séquences complexes de stimulations mécaniques comme celles que l’animal génère lors de l’exploration de son environnement proche.

Ces résultats ont fait l’objet d’une publication dans Scientific Reports.

Contact : isabelle.ferezou@cnrs.fr

Le système endo-lysosomal est nécessaire à de multiples fonctions cellulaires telles que l'endocytose, le tri et la dégradation des protéines et l'autophagie. De nombreuses toxines et agents pathogènes exploitent ce système pour pénétrer dans les cellules hôtes et y exercer leurs effets délétères. La modulation de la voie endo-lysosomale de l'hôte peut limiter l'intoxication par des toxines ainsi que l'infection par des agents pathogènes. La molécule ABMA, sélectionnée lors d’un criblage à haut débit contre l’action de la ricine, présente une activité antitoxine et anti-pathogène à large spectre.

Dans un article paru dans le FEBS Journal, Julien Barbet, Daniel Gillet et leur collaborateurs du Département Médicaments et Technologies pour la Santé (DMTS, CEA-Joliot, Gif‐sur‐Yvette, membre du LabEx LERMIT) montrent qu’ABMA retient des toxines endocytées aux endosomes tardifs et retarde ainsi leur trafic intracellulaire. ABMA altère également le flux autophagique par une fusion excessive des endosomes tardifs et des autophagosomes. Son action sur la voie endo-lysosomale et le flux autophagique sont distinctes d’inhibiteurs connus tels que la bafilomycine A1, l'EGA ou la chloroquine. En plus d'être un inhibiteur à large spectre des toxines et d’agents pathogènes, ABMA pourrait servir d'outil moléculaire pour disséquer la physiologie cellulaire et les mécanismes de la pathogenèse liés au système endo-lysosomal.

Contact : daniel.gillet@cea.fr

Oriane Della-Negra, doctorante à l'Université d'Évry mène sa thèse sur le Chlordécone, un pesticide largement utilisé en France malgré sa haute toxicité, au sein du laboratoire de Génomique Métabolique (GM). Elle cherche une solution naturelle pour faire disparaître ce pesticide de l'environnement.

Son travail de recherche a été choisi pour être travaillé sous forme de Bande Dessinée dans le livre "Sciences en Bulles" à l'occasion de la Fête de la Science.

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Vous ne le savez pas encore, mais vous pouvez tout faire grâce à la microscopie électronique. Ne ratez pas l’occasion de le découvrir : inscrivez-vous !!!

Cette formation organisée avec l’IFSEM aura lieu du 25 au 27 mars à Gif-sur-Yvette, sur les plateformes de microscopie électronique de l’I2BC (cryo-microscopie et Imagerie-Gif).

Voici le lien pour voir le programme détaillé et pour l’inscription (inscription jusqu’au 15 février) : https://formation.ifsem.cnrs.fr/training/445/1074

Exemple choisi. Equipée des technologies Illumina et Nanopore, la plateforme de transcriptomique de l’IPS2 (POPS) est impliquée dans un large projet d’analyses omiques avec les équipes du professeur Marc-André Selosse du Muséum National d’Histoire Naturelle de Paris et de l’Université de Gdansk (Pologne) visant à comprendre les relations complexes qu’entretiennent les orchidées européennes avec leur partenaires mycorhiziens. On observe en effet chez cette famille de plantes un large gradient de comportements trophiques, allant d’une symbiose classique où la plante et le champignon échangent des nutriments, au parasitisme où la plante reçoit tous ses nutriments du champignon. Dans ce dernier cas, l’orchidée a perdu sa capacité à faire de la photosynthèse. Etudier cette transition évolutive au laboratoire est impossible. Ainsi plusieurs centaines d’échantillons correspondant à 10 espèces d’orchidées différentes ont été prélevés aux printemps 2018 et 2019 sur des sites naturels polonais.

En collaboration avec la plateforme Métabolisme-Métabolome de l’IPS2, le transcriptome et le métabolome de ces échantillons ont été analysés. Un des verrous majeurs à une analyse de transcriptome pertinente dans ces plantes est l’absence de génome séquencé disponible. Sans génome, il est impossible de connaitre quels sont les gènes qui sont activés dans une condition donnée. Sur la base des données de séquençage de transcriptome Illumina, il est possible d’assembler une liste de gènes exprimés mais cette liste reste très fragmentaire. Cela rend extrêmement complexe la comparaison des transcriptomes de ces 10 espèces. En les combinant avec des données de séquençage Nanopore, la plateforme POPS a réalisé des assemblages « hybrides » des transcriptomes qui s’avèrent de bien meilleure qualité que les assemblages basés uniquement sur les données Illumina. En associant dans un deuxième temps ces données transcriptomiques aux données métabolomiques, il devient alors possible de comparer la physiologie de ces 10 espèces d’orchidées. Bien que le gros des analyses soit encore en cours, les premiers résultats suggèrent que le cœur de cette transition évolutive se situe dans la plasticité métabolique des plantes et dans les capacités d’échanges entre le champignon et sa plante hôte (Lallemand et al. Plant J. 2019). Ce travail ouvre également de nouvelles perspectives pour l’analyse et la comparaison du transcriptome d’espèces d’intérêt mais qui ne sont pas des modèles de laboratoire.

La plateforme de transcriptomique POPS est localisée à l’IPS2 à Gif-sur-Yvette (plateau du Moulon). Elle réalise des projets d’étude du transcriptome en collaboration avec des équipes de recherche nationales et internationales. Elle offre une expertise pour l’analyse de l’expression comparative des gènes par l’utilisation du séquençage à haut débit de l’ARN, ou RNA-seq. Cette offre est complétée par l’analyse bio-informatique et statistique des données brutes permettant l’analyse quantitative du transcriptome. POPS est certifiée ISO 9001 :2015, labélisée IBiSA et est membre des Réseaux GENOPS et SPS.

Contacts : Ludivine Soubigou-Taconnat et Etienne Delannoy (pops.ips2@u-psud.fr)

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