Individualized neoantigen-targeted vaccines for lung cancer

With Joline INGELS

DATE & TIME : Thursday, June 18, 2026 I 4:00 PM CET

Moderators : Samuel BITOUN, François‑Xavier DANLOS

Joline Ingels, PhD, is Head of Production at the Cell & Gene Therapy facility of Ghent University Hospital. Her work focuses on advanced therapy medicinal products, including neoantigen‑based cancer vaccines, building on her doctoral research in immunomonitoring of lung cancer patients.

This session will explore how neoadjuvant chemo‑immunotherapy reshapes the immune landscape of tumor‑draining lymph nodes in NSCLC, with emphasis on antigen‑presenting cell states, T‑cell trajectories, clonal dynamics, and spatial immune circuits.

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Depuis sa création, le Fonds Amgen France œuvre à faire émerger une recherche médicale rigoureuse, innovante, et surtout plus proche de ceux qu’elle concerne : les patients.

Dans la continuité des éditions précédentes, le Fonds Amgen France a poursuivi son engagement en faveur de projets à fort impact, à la hauteur des transformations que connaît notre système de santé qu’elles soient scientifiques, technologiques ou organisationnelles. Cette 7ème édition est restée centrée sur la thématique phare : « De la médecine de précision à l’optimisation du parcours de soins pour une expérience patient améliorée ». Elle s’est déclinée dans trois domaines : l’oncologie-hématologie, les maladies rares auto-immunes et le risque cardiovasculaire résiduel et complications métaboliques liées à l’obésité.

Dans chacun de ces champs, les projets doivent s’inscrire dans l’un des deux axes suivants : la recherche fondamentale et la recherche appliquée vers l’amélioration des parcours de soins et de la qualité de vie.

Le Fonds Amgen France pour la Science et l’Humain encourage les chercheurs, professionnels de santé, représentants de patients et lauréats d’une précédente édition à proposer des projets capables de faire évoluer durablement les connaissances et les pratiques.

Avec ce nouvel Appel à Projets, nous réaffirmons notre ambition de faire avancer une recherche à la fois scientifique, humaine et utile.

• Date limite : 17 septembre 2026
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Les projets présentés dans le cadre de l’appel à projets « Projets Fondation ARC » doivent permettre de soulever des questions nouvelles, d’explorer de nouvelles pistes de recherche, d’initier des ruptures technologiques, thématiques ou conceptuelles, d’obtenir une preuve de concept ou des résultats préliminaires.

Les projets peuvent être issus de tout laboratoire de recherche publique et relever de tous les domaines et disciplines participant à la lutte contre le cancer, depuis la recherche fondamentale et de transfert jusqu’à la recherche clinique, incluant l’épidémiologie et les sciences humaines et sociales. Pour mieux s’adapter aux évolutions du coût de la recherche la Fondation ARC a revalorisé en 2023 le soutien aux « Projets Fondation ARC » à 70 k € pour 24 mois ou 35k€ pour 12 mois.

Une attention particulière sera portée aux projets offrant à de jeunes chercheurs l’opportunité de développer ou consolider une thématique innovante dans leur équipe d’accueil (PJA1 et PJA2).

Pour les PJA3, le caractère innovant du projet présenté est central et devra être justifié (amorçage de nouvelles pistes, rupture par raport aux thématiques habituelles de l’équipe…).

Dépôt de candidature selon l’expérience du porteur de projet :

– PJA1 : Jeune Chercheur : 1 à 10 ans après la thèse

– PJA2 : Chercheur en consolidation : 11 à 20 ans après la thèse

– PJA3 : Chercheur expérimenté : plus de 20 ans après la thèse

La subvention est exclusivement destinée à financer :

– Des frais de fonctionnement (consommables, réactifs…), petits équipements (total maximum 30k €)…

– Des frais de mission (travaux d’acquisition sur le terrain et/ou participation à des colloques et des congrès) maximum 2000 € par an.

Les dossiers sont expertisés par les Commissions Nationales et par le Conseil Scientifique.

• Pour déposer une demande de financement, créez un dossier sur fondation-arc.org.
• Clôture : Mercredi 9 septembre 2026 à 15h
• Résultats : Mi-décembre 2026

En raison des spécificités du domaine des maladies rares, l’association CMT France et la Fondation Maladies Rares ont conclu un partenariat visant à soutenir et à encourager la recherche sur la CMT.

• Budget max : 25 000 €
• Durée max : 24 mois
• Date limite de soumission 25/08/2026, 17h(heure de Paris).
• Call Text
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Face aux défis alimentaire, agricoles et climatiques, Danone, entreprise leader de l’alimentation, et AgroParisTech, établissement d’enseignement supérieur des sciences du vivant et de l’environnement, ont signé le 2 juin 2026, un accord-cadre de collaboration dédié à la recherche, à l’innovation et au développement des talents. Cette coopération repose sur une ambition commune : accélérer l’émergence de solutions concrètes pour accompagner la transition des modèles alimentaires et agricoles, au service de la santé et de l’environnement, tout en renforçant les passerelles entre le monde académique et l’entreprise.

Lire la suite de l’Actu AgroParisTech

Dans une étude publiée dans BMC Nephrology par des chercheurs du LAAB - Laboratoire Anthropologie, Archéologie, Biologie (UVSQ/UPSaclay, UFR Simone Veil - Santé) et de Marseille, un nouveau pan de l'état de santé du roi Louis XIV, mort en 1715, est analysé.

S’appuyant sur une réinterprétation critique des récits contemporains et des connaissances physiopathologiques modernes, ce travail explore l’hypothèse selon laquelle la maladie terminale du "Roi Soleil" serait compatible avec une insuffisance rénale chronique et une calciphylaxie. Bien qu’une confirmation rétrospective soit impossible, la calciphylaxie demeure une hypothèse plausible, soulignant la possible sous-estimation de l’insuffisance rénale chronique et de ses complications dans les cas historiques.

Ce travail complète le diagnostic d'infection terminale fongique (chromoblastomycose) réalisé à partir d'un échantillon de sang emprisonné dans le cœur embaumé du souverain, publié quelques mois plus tôt (Charlier et al., 2026).

-> Contact : philippe.charlier@uvsq.fr

Dans une étude publiée dans Communications Biology, des scientifiques de l’Institut Micalis (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas, Equipe ChemSyBio), de l’université de Rouen Normandie/INSERM, de l’Université Aix Marseille/CNRS et du synchrotron SOLEIL ont étudié comment une nouvelle enzyme à radical SAM catalyse une modification post-traductionnelle au sein de la Methyl-coenzyme M reductase (MCR), qui est l’enzyme clé pour la biosynthèse de méthane.

Cette nouvelle enzyme, nommée QCMT, méthyle un résidu de glutamine au sein de la sous-unité catalytique de la MCR en utilisant de la S-adenosyl-méthionine, un centre fer-soufre ([4Fe-4S]) et de la vitamine B12, également appelée cobalamine.

Les chercheurs ont montré que la liaison à la vitamine B12 influence la conformation de QCMT et que cette dernière est capable non seulement de catalyser des réactions de méthylation mais également d’épimérisation, donnant lieu à la formation de nouvelles modifications post-traductionnelles. Grâce à des marquages sélectifs, il a été possible d’étudier en détail le mécanisme de QCMT et de proposer de nouvelles pistes pour le contrôle de la stéréochimie par les enzymes à radical SAM dépendantes de la vitamine B12.

-> Contact : olivier.berteau@inrae.fr

Dans une revue publiée dans Current Opinion in HIV and AIDS, les scientifiques du Département IDMIT (CEA/INSERM/UPSaclay, Fontenay-aux-Roses) présentent l’apport des modèles infectieux de primates non humains à l’étude du VIH chez le nouveau-né et de la transmission mère-enfant.

En reproduisant l’infection humaine, ces modèles permettent d’évaluer, de façon contrôlée et précoce, la dissémination du virus dans l’organisme, la mise en place des réservoirs viraux, et la vulnérabilité propre à la période néonatale. Ils rendent ainsi possible l’étude expérimentale de mécanismes biologiques difficiles à réaliser aussi finement chez le nouveau-né humain, comme l’immunité néonatale et la transmission de l’immunité maternelle in utero et par voie d’allaitement.

La revue souligne leur contribution récente à l’évaluation de stratégies thérapeutiques innovantes pour le nouveau-né, telles que la thérapie génique, les molécules immunomodulatrices ou encore la vaccination maternelle ou néonatale.

Légende Figure : Modèles de primates non-humains de l’infection à VlH chez le nouveau-né et de Ia transmission mère-enfant. Etude contrôlée de Ia réponse immune néonatale et du transfert de l'immunité maternelle / Effet du traitement antirétroviral précoce sur l'établissement des réservoirs viraux et Ia préservation immune / ldentification de marqueurs prédictifs du rebond viral après interruption du traitement antirétroviral / Plateforme préclinique ďessais thérapeutiques innovants (thérapie génique, immunomodulation, vaccin).

-> Contact : nabila.seddiki@cea.fr / claire-maelle.fovet@cea.fr

La culture hétérotrophe des microalgues, réalisée par fermentation en absence de lumière, constitue aujourd’hui une voie prometteuse pour la production industrielle de molécules d'intérêt (pigments, protéines, ...). Si cette technologie commence à émerger industriellement, l’influence de la température sur le fonctionnement des cellules reste encore largement méconnue. Afin de mieux comprendre le rôle de ce paramètre, la Chaire de Biotechnologie de CentraleSupélec (LGPM) a étudié l’impact de températures comprises entre 4 et 35 °C sur la croissance et la composition de Chlorella vulgaris en conditions hétérotrophes.

Les résultats, publiés dans Plant Physiology and Biochemistry,  montrent que la croissance est maximale entre 25 et 30°C, tandis qu’elle ralentit fortement à basse température et est totalement inhibée à 35°C. Au-delà de cet effet sur la productivité, la température modifie profondément la composition de la biomasse : les lipides sont favorisés aux températures élevées, les protéines et les glucides à des températures intermédiaires, alors que les pigments s’accumulent préférentiellement au froid. Les analyses ont par ailleurs mis en évidence une réorganisation notable des acides gras en fonction de la température, témoignant de la capacité des cellules à adapter leur métabolisme aux conditions thermiques (notamment via la conversion des oméga-3 en oméga-6).

Ces travaux apportent de nouvelles connaissances sur la physiologie et la plasticité phénotypique des microalgues cultivées par fermentation. Ils ouvrent également des perspectives concrètes pour piloter la fermentation microalgale via la température comme levier d’optimisation des procédés industriels, selon les molécules d’intérêt recherchées.

-> Contact : victor.pozzobon@centralesupelec.fr

Claire Auditeau est Maître de Conférences – Praticien hospitalier (MCU-PH) en hématologie à l’Université Paris-Saclay depuis septembre 2025. Elle travaille au sein du laboratoire d’hématologie de l’hôpital Necker-Enfants Malades, dirigé par le Pr Delphine Borgel, et est rattachée à l’unité Hémostase Inflammation Thrombose - HITh (UMR-S 1176 INSERM/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre), sous la direction du Dr Cécile Denis. Spécialiste de l’hémostase — l’ensemble des mécanismes permettant de prévenir les hémorragies tout en maintenant la fluidité de la circulation sanguine — elle consacre ses travaux de recherche aux protéines anticoagulantes physiologiques, acteurs essentiels de la régulation de ces processus. Ses recherches portent à la fois sur leur implication dans la physiopathologie de différentes maladies et sur le développement d’approches thérapeutiques innovantes fondées sur des anticorps à domaine unique ciblant ces protéines.

Après des études de pharmacie à l’Université Paris Saclay, elle se spécialise en biologie médicale et réalise son internat à l’Assistance Publique des Hôpitaux de Paris. Au cours de cette formation, elle choisit de s’orienter vers l’hématologie. À l’issue de son internat, elle obtient la médaille d’argent au concours de l’année médaille, distinction qui lui permet d’initier une thèse de sciences au sein de l’unité HITh UMR-S 1176 sous la direction du Pr Delphine Borgel. Elle poursuit ensuite ses travaux grâce à un poste d’Assistante Hospitalo-Universitaire. Sa thèse, soutenue en mars 2025, porte sur le rôle de la protéine S, un anticoagulant majeur, dans la physiopathologie de la drépanocytose. Ces travaux ont notamment permis de mettre en évidence une nouvelle propriété cellulaire de cette protéine dans l’élimination des eryghosts, formes lytiques des globules rouges. À la suite de cette soutenance, elle est recrutée comme MCU-PH à l’Université Paris Saclay.

Depuis son recrutement, elle poursuit ses travaux à l’interface entre l’hémostase et les globules rouges, en se focalisant sur les eryghosts et leur potentiel pathogène. Elle évalue également le potentiel thérapeutique d’un anticorps à domaine unique dirigé contre la protéine S mais potentialisant son activité dans la drépanocytose. En parallèle de ses activités de recherche fondamentale, elle participe à plusieurs projets de recherche appliquée liés à ses fonctions hospitalières, principalement consacrés au diagnostic et au traitement des maladies hémorragiques. Elle est également investie dans l’enseignement au sein du département d’hématologie de l’Université Paris Saclay, où elle s’attache notamment à faire découvrir aux étudiants la diversité des pratiques de la biologie médicale : laboratoire privé ou hospitalier, biologie délocalisée, officine ou encore prise en charge au domicile du patient.

« La logique vous mènera d’un point A à un point B, l’imagination vous mènera absolument partout. » - Albert Einstein

-> Contact : claire.auditeau@aphp.fr

L’hypertension porto-pulmonaire (HTPoP) est une complication rare et sévère de l’hypertension portale. Si les traitements de l’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) améliorent l’hémodynamique et le pronostic, leur impact sur les échanges gazeux reste mal connu.

Dans un article publié dans Chest, Thomas Lacoste-Palasset et Laurent Savale, du Centre National de Référence de l’Hypertension Pulmonaire sévère (service de Pneumologie et Soins Intensifs Respiratoires de Bicêtre, AP-HP), associés à l’UMR-S 1358 (INSERM/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre) ont évalué l’effet des traitements de l’HTAP sur les échanges gazeux chez des patients atteints d’HTPoP.

Les auteurs ont analysé une cohorte rétrospective multicentrique issue du registre français de l’hypertension pulmonaire ainsi qu’une cohorte prospective monocentrique. Tous les patients avaient bénéficié d’une analyse des gaz du sang avant puis dans l’année suivant l’initiation du traitement. Dans la cohorte prospective, une échocardiographie avec contraste recherchait également des dilatations vasculaires intra-pulmonaires.

Au total, 107 patients ont été inclus dans la cohorte rétrospective. Après quatre mois de traitement, le gradient alvéolo-artériel en oxygène (A–aDO₂) restait globalement stable malgré une importante variabilité individuelle, sans impact sur les paramètres fonctionnels ni la survie. Parmi les 28 patients inclus prospectivement, 39% présentaient des dilatations vasculaires intra-pulmonaires, sans influence sur l’évolution du gradient A–aDO₂ sous traitement.

Cette étude illustre une nouvelle fois la complexité des interactions physiopathologiques entre maladies hépatiques et intégrité de la vascularisation pulmonaire, soulignant la nécessité d’une utilisation prudente et individualisée des traitements vasodilatateurs dans l’HTPoP.

-> Contact : laurent.savale@aphp.fr

Un article de revue publié dans Journal of Molecular Biology par l’équipe ARNClo à l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) présente les découvertes récentes sur le rôle des ARN non codants et des petites protéines, en particulier dans les interactions entre bactéries et phages avec des nouvelles fonctions communes.

L'hypothèse du monde à l'ARN attribue à la fois le traitement de l'information génétique et des fonctions catalytiques aux ARN anciens. Dans le monde moderne, les protéines ont remplacé les ARN dans de nombreux processus cellulaires essentiels. Cependant, les ARN ont conservé des rôles clés dans les réseaux de régulation et diverses fonctions enzymatiques et structurelles. Des ARN à double fonction, découverts chez pro- et eucaryotes, agissent à la fois comme des ARN régulateurs non codants et aussi codent des courts peptides fonctionnels.

Les progrès récents méthodologiques, notamment Ribo-seq et cryo-EM, ont conduit à des découvertes fascinantes concernant une grande diversité de protéines très courtes ou d’ARN de grande taille structurés chez tous les organismes vivants. De nouveaux systèmes de défense anti-phages remettent en question le dogme traditionnel avec des mécanismes de codage protéique cryptique ou l'oligomérisation de petites protéines ou d'ARN en grands complexes supramoléculaires. Le paysage actuel des séquences exprimées est en constante évolution avec la naissance de gènes de novo à partir de séquences non codantes et de l'émergence d'ARN non codants à partir de séquences codantes.

Ce large éventail fonctionnel des séquences non codantes et codantes ouvre des nouvelles perspectives pour les applications dans les domaines de la biotechnologie et de la santé.

-> Contact : olga.soutourina@i2bc.paris-saclay.fr

Face au défi de transition alimentaire, la Chlorelle blanche -une microalgue- suscite de nombreux intérêts. Des scientifiques de SayFood (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau) explorent des procédés lui permettant d’exprimer des propriétés texturantes. Leur but : rendre possible le développement d’un ingrédient durable, texturant et n’altérant ni le goût ni la couleur des aliments.

Astrid Pénicaut est rédactrice de cette actualité web. Les recherches qu’elle présente sont réalisées dans le cadre de sa thèse de doctorat à l’unité SayFood, au sein de l'équipe GéPro (Génie des Produits). Elle s’intitule : « Caractérisation des propriétés physicochimiques des extraits brut de Chlorella Vulgaris ». 

Lire la suite de l’Actu SayFood

-> Contact : astrid.penicaut@agroparistech.fr

Dans le cadre de la stratégie d’accélération « Maladies infectieuses émergentes et Menaces nucléaires, radiologiques, biologiques et chimiques » (SA MIE MN), soutenue par le plan France 2030, l’ANRS MIE pilote le Programme et équipements prioritaires de recherche « Maladies infectieuses émergentes » (PEPR MIE) soutenant la recherche sur les maladies infectieuses émergentes.

L’appel à projets (AAP) 2026 du PEPR MIE s’inscrit dans la continuité des appels précédents en donnant la priorité au soutien de projets ayant un fort potentiel translationnel et des perspectives concrètes d’application opérationnelle face aux menaces infectieuses émergentes. Cette orientation concerne aussi bien le développement de contre-mesures médicales que non médicales.

L’AAP 2026 du PEPR MIE bénéficie d’une enveloppe prévisionnelle de 10,4 millions d’euros. Il vise des projets de recherche d’envergure d’une durée de 2 à 3 ans et pour une demande de financement minimum de 1 M€. La multidisciplinarité ainsi que les collaborations interinstitutionnelles seront fortement encouragées afin de favoriser l’émergence de projets ambitieux et structurants

Attention : Les priorités scientifiques ont été précisées. Nous vous remercions de lire attentivement le règlement (disponible ci-dessous).

Périmètre

Comme pour les précédents appels, l’AAP 2026 cible les trois catégories de maladies infectieuses émergentes ou ré-émergentes présentant un risque élevé de crise sanitaire en France :

• Les arboviroses ;
• Les fièvres hémorragiques virales ;
• Et les viroses respiratoires.

Les approches transversales sont également fortement encouragées.

Calendrier :

• Ouverture : 8 juin 2026
• Clôture : 8 septembre 2026 à 23h59 (heure de Paris)

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En raison des spécificités du domaine des maladies rares, l’Association AMS-ARAMISE et la Fondation Maladies Rares (FMR) ont convenu d’un partenariat afin de soutenir et de stimuler la recherche fondamentale, translationnelle et clinique sur l’atrophie multi-systématisée. Toutes les disciplines biomédicales sont éligibles à cet appel à projets.

• Budget max : 100 000 €
• Durée max : 24 mois
• Date limite de soumission 25/08/2026, 17h(heure de Paris).
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Les bactéries Gram-négatives communiquent avec leur environnement grâce à la libération de vésicules de membrane externe (OMVs), nanostructures capables de transporter une grande diversité de molécules, dont des facteurs de virulence et des acides nucléiques. Si leur contenu luminal en ARN a été largement décrit, leur organisation en surface reste encore peu explorée.

Dans une étude parue dans Journal of Extracellular Vesicles, les scientifiques du Laboratoire Léon Brillouin – LLB (UMR 12 CEA/CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) mettent en évidence un mode inédit d’association des ARN aux membranes des OMVs, montrant que les ARN peuvent être exposés à la surface des vésicules et ne sont pas strictement confinés au lumen. Cette observation repose sur une approche technique originale, le dichroïsme circulaire sur synchrotron orienté (SR-O-CD), développée au synchrotron SOLEIL, technique permettant une analyse fine de l’organisation moléculaire à la surface des OMVs.

Grâce à cette méthodologie, les auteurs démontrent que cette localisation membranaire des ARN est dépendante de la protéine Hfq, un régulateur central impliqué dans la biologie des ARN chez les bactéries. Leurs résultats suggèrent ainsi que Hfq contribue non seulement à l’encapsulation des ARN dans les vésicules, mais également à leur ancrage et à leur présentation à leur surface. Ce mode d’organisation inédit ouvre la perspective d’un transfert direct d’ARN exposés vers les cellules hôtes, élargissant ainsi les modes de communication connus entre bactéries et hôtes. Au-delà du contenu interne des OMVs, leur surface apparaît donc comme une interface fonctionnelle, dont l’étude révèle une complexité jusqu’ici sous-estimée dans les mécanismes de signalisation intercellulaire.

-> Contact : veronique.arluison@cea.fr

Les exopolysaccharides (EPS) produits par les bactéries lactiques (BLs) sont associés à leurs propriétés technologiques et à leurs bienfaits pour la santé. Ces EPS sécrétés dans le milieu environnant contribuent aux propriétés rhéologiques des produits laitiers fermentés, avec l'avantage d'être produits in situ dans la matrice alimentaire. Chez les BLs commensales, les EPS participent au dialogue bactérie-hôte au niveau de la muqueuse intestinale, par leurs propriétés immunomodulatrices ou par la modulation de la composition du microbiote intestinal.

Dans une étude publiée dans Carbohydrate Polymers, des chercheurs de l’Institut Micalis (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) ont développé une méthode simple et efficace de sélection de lactobacilles surproduisant des EPS, fondée sur leur faible vitesse de sédimentation en milieu de culture semi-liquide. Des variants spontanés capables de libérer une grande quantité d’EPS ont été isolés à partir de plusieurs souches de différentes espèces de lactobacilles. En étudiant en détail les mutants isolés chez Lacticaseibacillus rhamnosus, les chercheurs apportent un éclairage sur les mécanismes moléculaires régissant l'ancrage ou la libération des polysaccharides bactériens après leur biosynthèse. Les mutants sélectionnés surproduisant des EPS présentent une mutation au niveau du site catalytique d’une tyrosine kinase, qui régule la biosynthèse des polysaccharides au niveau post-traductionnel. Les mutations observées empêchent l'autophosphorylation de la kinase et l'inactivent. En collaboration avec l’Université du Littoral Côte d’Opale (ULCO, Boulogne-sur-mer) et le NRC (Ottawa, Canada), les chercheurs ont établi que les EPS libérés par les variants surproducteurs proviennent de la couche externe de polysaccharide, liée de manière covalente au peptidoglycane, présente dans la souche parentale.

D'un point de vue appliqué, la méthode de sélection en milieu semi-liquide permet d'isoler des variants non OGM de BLs surproduisant des EPS de structure variée, présentant un fort potentiel d'application en tant qu'ingrédients alimentaires et en tant que composés pré- ou postbiotiques.

-> Contact : marie-pierre.chapot-chartier@inrae.fr / saulius.kulakauskas@inrae.fr

Bien que sujettes à la condensation, de nombreuses protéines de liaison à l'ARN (RBP) ne forment pas de grands condensats dans les cellules. Cette question reste largement débattue, notamment parce que l'agrégation de RBP, comme FUS, est caractéristique de certaines maladies neurodégénératives.

Dans une étude publiée dans Cell Reports, les chercheurs du laboratoire Structure et Activité des Biomolécules Normales et Pathologiques - SABNP (UMR-S 1204 INSERM/Univ Evry-Paris-Saclay, Evry), en collaboration avec les sociétés Revitty et IKTOS, ont étudié le rôle de la diversité des RBPs dans la formation et composition de condensats riches en ARNm en utilisant la technologie du laboratoire SABNP, la « MT bench » qui se sert des microtubules comme nanoplateformes pour explorer des interactions moléculaires dans les cellules à haut débit. Ainsi, des diagrammes d’interactions entre plusieurs RBPs et l’ARNm ont pu être obtenus. Leurs analyses ont révélé que FUS, une protéine de liaison à l’ARN impliquée dans la maladie de Charcot et ses partenaires forment des compartiments distincts lorsqu'ils sont analysés individuellement. Cependant, une diversité accrue de partenaires de FUS atténue sa séparation de phase.

De plus, les chercheurs ont constaté que les résidus d'arginine fréquemment mutés et localisés dans le signal de localisation nucléaire (NLS), à l'extrémité C-terminale, favorisent le mélange de FUS avec plusieurs partenaires. Par conséquent, les mutations pathologiques du NLS de FUS altèrent non seulement son importation nucléaire active, mais régulent également la séparation de phase de FUS, avec des conséquences potentielles sur l'apparition et la progression des maladies neurodégénératives liées à FUS.

Contact : david.pastre@univ-evry.fr

Micheline Misrahi est professeure de biochimie et biologie moléculaire à la Faculté de médecine Paris-Saclay. Elle appartient au groupe « Etique et Génétique » de la Fédération française de génétique humaine –FFGH. Les objectifs de ce groupe sont de pouvoir améliorer les connaissances des personnes issues de la population générale en termes de génétique médicale et ainsi leur autonomie vis-à-vis des analyses génétiques.

Dans le cadre de la révision de la loi de Bioéthique, le groupe a travaillé sur les tests génétiques en accès libre, pour l'instant interdits en France, et est auteur d'une Tribune dans le journal Le Monde sur ce sujet.

Lire l’article du Monde (sur abonnement)

-> Contact : mmisrahiabadou@gmail.com

Dans le cadre d’une étude publiée dans Nature Communications, deux équipes du département de Virologie de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), en collaboration avec le synchrotron SOLEIL et l’équipe de Kay Grünewald au CSSB à Hambourg, ont mis au point un protocole appliqué à la virologie bactérienne et associant la préparation de lamelles minces par cryo-FIB-milling à la cryo tomographie aux électrons. Les observations couplées à des approches génétiques permettent d’étudier la réorganisation spatiale induite par le siphovirus SPP1 pendant l’infection de la bactérie hôte Bacillus subtilis dans des conditions proches de l'état natif. La caractéristique la plus marquante est la formation d'un compartiment viral dépourvu de membrane, au sein duquel s'effectuent les transactions de l'ADN et dont les ribosomes sont exclus.

L’imagerie cellulaire a montré que les intermédiaires d’assemblage de la particule virale suivaient une partition spatiale spécifique au sein de la cellule infectée et remodelée. Il est à noter que des précurseurs de la procapside virale sont retrouvés ouverts au niveau de la membrane cytoplasmique. La découverte de ces structures suggère un mécanisme dans lequel la protéine de portale de la procapside liée à la membrane bactérienne sert à initier la copolymérisation unidirectionnelle et curviligne des protéines d'échafaudage et des protéines majeures de la capside. La fermeture de la procapside icosaédrique autour de la portale favoriserait le départ de la membrane vers le compartiment d'ADN viral dans lequel s'effectue l'empaquetage du génome. Les capsides remplies d'ADN viral quittent ensuite le compartiment pour se lier à la queue et être stockées dans des « warehouses ».

Dans son ensemble, cette étude fournit une information mécanistique sur la voie d'assemblage viral complète du siphovirus SPP1 dans la cellule infectée et réorganisée. Cette caractérisation des étapes d'assemblage dynamiques et transitoires, dont les intermédiaires sont inaccessibles à la purification pour une analyse structurale in vitro, souligne l'importance du domaine émergent de la biologie structurale cellulaire pour améliorer notre compréhension des interactions entre les virus et leur hôte.

-> Contact : emmanuelle.quemin@i2bc.paris-saclay.fr / paulo.tavares@i2bc.paris-saclay.fr

Dans une étude publiée dans Nature Communications, des chercheurs de l’Université Paris-Saclay (I2BC, CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette ; UMR 9019 CNRS/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif), en collaboration avec plusieurs partenaires européens (l’IPBS de Toulouse, l’Institute for Research in Biomedicine de Bellinzone en Suisse, l’Istituto Superiore di Sanità de Rome et l’Université de Leicester au Royaume-Uni), ont mis en évidence comment le complexe Ku70/Ku80 (Ku), un facteur clé de reconnaissance des extrémités d’ADN lésées, stimule l’activité de l’exonucléase WRN afin de protéger les fourches de réplication soumises à un stress réplicatif.

WRN est une enzyme impliquée dans le maintien de la stabilité du génome au cours de la réplication et de la réparation de l’ADN. Des mutations du gène WRN sont responsables du syndrome de Werner, une maladie génétique rare associée à un vieillissement prématuré et à une forte prédisposition au cancer. Grâce à la cryo-microscopie électronique, une technique d’imagerie à haute résolution, les chercheurs ont obtenu la première structure du complexe formé entre WRN, Ku et l’ADN. Cette analyse révèle comment Ku recrute et positionne WRN sur les extrémités de l’ADN. Les chercheurs identifient également une interface d’interaction spécifique entre le domaine exonucléase de WRN et le domaine SAP de Ku70, et montrent que la perturbation de cette interaction compromet la protection des fourches de réplication contre une dégradation excessive de l’ADN.

Ces travaux apportent ainsi une nouvelle compréhension structurale et fonctionnelle des mécanismes qui protègent l’ADN lors du stress réplicatif, et pourraient contribuer au développement de nouvelles stratégies contre certaines maladies liées au vieillissement ou au cancer.

-> Contact : virginie.ropars@i2bc.paris-saclay.fr

Dans une étude publiée dans Neurology, les scientifiques de l’AP-HP, de l’Université Paris-Saclay, de l’Inserm, du CEA et leurs collaborateurs français et suisses ont étudié les neuropathies périphériques associées aux lymphoproliférations T, une complication rare et encore mal caractérisée. L’étude rétrospective multicentrique a inclus 19 patients pris en charge dans 17 centres de référence des neuropathies périphériques.

Les chercheurs montrent que ces neuropathies relèvent principalement de deux mécanismes : une infiltration tumorale directe des nerfs, appelée neurolymphomatose, et des neuropathies dysimmunes. La neurolymphomatose représentait 58 % des cas et était souvent associée à des formes multifocales sévères, douloureuses, motrices ou avec atteinte des nerfs crâniens. Les neuropathies dysimmunes, plus souvent démyélinisantes, étaient notamment observées dans les lymphomes T angioimmunoblastiques.

Comparées aux neuropathies associées aux lymphoproliférations B, celles liées aux lymphoproliférations T étaient plus sévères au diagnostic, avec davantage de handicap fonctionnel et une proportion plus élevée de neurolymphomatose. Ces résultats soulignent l’importance d’un diagnostic précoce et d’une prise en charge adaptée au mécanisme neurologique sous-jacent.

-> Contact : nicolas.noel@aphp.fr