La moisissure utilisée dans le monde entier pour la fabrication du fromage bleu, Penicillium roqueforti, a été domestiquée, c’est-à-dire qu’il y a eu une évolution vers des caractères bénéfiques pour l’affinage du fromage, résultant d’une sélection sous pression humaine. Deux populations différentes avaient été identifiées dans des études précédentes, une présente principalement dans les fromages d’AOP Roquefort, et l’autre dans les autres fromages bleus. Ces deux populations domestiquées de P. roqueforti présentent chacune une faible diversité génétique, mais sont génétiquement très différentes. Cette faible diversité pose des problèmes pour garder une bonne viabilité des souches et pour générer de nouvelles variétés. D’ailleurs, ces populations montrent une baisse de fertilité par rapport aux populations de la même espèce trouvées dans d’autres environnements naturels, comme les aliments moisis.

Dans une étude récemment publiée dans PLOS Genetics, réalisée en collaboration avec des équipes du Laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette), de l’Université de Brest, de l’INRAe, et le Laboratoire Interprofessionnel de Production d’Aurillac, les auteurs ont réalisé des croisements entre ces populations pour régénérer de la diversité génétique et de la diversité dans les caractères importants pour l’affinage des fromages. Comme attendu, les descendances présentaient une grande variation pour de multiples caractères impliqués dans la fabrication du fromage, notamment les caractères impliqués dans l'aspect, la saveur ou la sécurité alimentaire, tels que la couleur, la lipolyse, la protéolyse ou encore la production de toxines. Les chercheurs ont détecté des déterminants génétiques pour la plupart de ces caractères, ce qui ouvre la voie à la création de nouvelles variétés. Ils ont identifié plusieurs régions génomiques qui ont un impact sur plusieurs caractères à la fois, comme c'est souvent le cas chez les organismes domestiqués.

Ces résultats contribuent à notre compréhension des mécanismes génétiques impliqués dans l'adaptation rapide à de nouveaux environnements. De plus, les chercheurs ont généré une nouvelle diversité dans la moisissure bleue utilisée pour affiner les fromages, ce qui pourra permettre une amélioration variétale, la fabrication de nouveaux types de fromages, et permet de lutter contre la perte de diversité dans les populations de moisissures affinant les fromages.

Légende Figure : Croisements entre populations distantes génétiquement de la moisissure bleue affinant les fromages bleus ; mesure des caractères chez les descendants (couleur, capacité à dégrader les gras et les sucres du lait, production de toxines, …) ; analyse de la distribution des caractères ; analyse conjointe des caractères et des données génomiques pour identifier les déterminants génétiques des caractères.

-> Contact : tatiana.giraud@universite-paris-saclay.fr

L'identification de composés chimiques régulant la croissance des plantes dans un contexte génétique peut considérablement enrichir notre compréhension des mécanismes biologiques. Dans une étude publiée dans iScience, les équipes MeioMe et Min de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (UPSaclay/INRAE/AgroParisTech, Versailles) ont mis au point une méthode de criblage chimique phénotypique à haut débit chez les plantes, afin de comparer deux génotypes et d'identifier de petites molécules induisant des phénotypes spécifiques au génotype.

Les auteurs ont utilisé Arabidopsis thaliana de type sauvage et mus81, un mutant de réparation de l'ADN, et ont criblé des médicaments brevetés de la librairie Prestwick pour identifier sélectivement les molécules affectant la croissance de mutant mus81. L'équipe a développé deux programmes complémentaires de segmentation et de classification d'images, basés sur des réseaux de neurones convolutifs (CNN), pour quantifier la croissance des plantules d'Arabidopsis. En utilisant ces approches sophistiquées, ils ont détecté qu'environ 10% des molécules de Prestwick provoquent une croissance altérée dans les deux génotypes, suggérant leurs effets toxiques sur la croissance des plantes. Ils ont identifié trois molécules de Prestwick affectant spécifiquement le mutant mus81.

Dans l'ensemble, les chercheurs ont développé une méthodologie simple, précise et adaptable pour effectuer un criblage à haut débit des bibliothèques chimiques de manière efficace, accélérant ainsi la découverte de régulateurs chimiques spécifiques au génotype de la croissance des plantes.

-> Contact : rajeev.kumar@inrae.fr

Les perturbations du rythme circadien liées à l'exposition à la lumière artificielle nocturne (LAN) sont suspectées d’entraîner un risque accru de cancer du sein. Dans une étude publiée dans Environmental Health Perspectives, des chercheurs du Centre de Recherche en Epidémiologie et Santé des Populations – CESP (UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Villejuif) ont étudié l’association entre le cancer du sein et l’exposition à la LAN provenant de l’éclairage urbain.

L’étude comportait 5222 cas de cancer du sein diagnostiqués entre 1990 et 2011 et 5222 témoins appariés sur l’âge issus de la cohorte E3N-Générations, une vaste cohorte de 100 000 femmes. Le niveau d’éclairage nocturne autour du domicile des femmes a été évalué à partir d'images satellite issues du programme américain DMSP-OLS. Dans les analyses multivariées ajustées sur les facteurs de risque hormonaux du cancer du sein, l’exposition aux polluants atmosphériques (dioxyde d’azote et particules fines PM2.5) ainsi que sur la proximité d’espaces verts mesurée par un indice de végétalisation (NDVI), une association statistiquement significative persistait entre le risque de cancer du sein et l’exposition à la LAN (augmentation du risque de 11% par interquartile d’exposition).

Les associations observées confortent l’hypothèse d’un lien entre pollution lumineuse nocturne et cancer du sein. De nouvelles études devront prendre en compte l’ensemble des sources d’exposition à la LAN intérieures et extérieures, et caractériser au sein du spectre lumineux le rôle de la lumière bleue dont l’impact sur le risque de cancer pourrait être prépondérant en raison de ses effets marqués sur la suppression du pic nocturne de mélatonine et les perturbations du rythme circadien.

Légende photo : Photo satellite de pollution lumineuse.

-> Contact : pascal.guenel@inserm.fr

L’étude du développement sanguin humain in-vivo est possible grâce à des modèles de souris immunodéficientes (ID). Cependant, malgré la proximité génétique entre l’homme et la souris, la différenciation hématopoïétique humaine dans ces modèles est biaisée, produisant une hématopoïèse peu représentative de la physiologie humaine.

Une étude menée par Laurent Renou dans l’équipe de Françoise Pflumio au sein de l’UMR Stabilité Génétique, Cellules souches et Radiations - SGCSR/iRCM (UMR 1274 UParis/UPSaclay/INSERM/CEA-Jacob, Fontenay-aux-Roses), en collaboration avec des équipes de l’Institut Cochin, Curie-Paris, des équipes cliniques de l’hôpital Béclère, St Louis, et publiée dans HemaSphere, propose un modèle de tissu osseux humanisé, appelé "osselet", qui est généré après implantation et différenciation de cellules souches/stromales mésenchymateuses humaines sur le dos de souris ID. Les chercheurs de l’UMR 1274 montrent que l’osselet reproduit la structure osseuse humaine, incluant des vaisseaux sanguins, niches hématopoïétiques et matrice osseuse. Dans l’osselet, ils observent une normalisation du développement sanguin humain avec une meilleure représentation de la diversité cellulaire et un maintien accru des cellules souches après injection de cellules souches/progénitrices humaines, reproduisant les étapes de la transplantation de moelle osseuse.

Ils démontrent également que les cellules à l’origine de l’osselet peuvent être réisolées et régénérer un osselet fonctionnel.

Ce modèle de niche osseuse humanisée représente un outil standardisé pour étudier l’hématopoïèse humaine de façon plus physiologique et permet actuellement des recherches sur les interactions entre les cellules hématopoïétique pathologiques, les leucémies, et leur microenvironnement osseux. Ce travail ouvre aussi d’autres champs d’études touchant les os humains, notamment l’analyse des mécanismes impliqués dans des processus métastatiques de tumeurs solides.

-> Contact : francoise.pflumio@cea.fr / laurent.renou@cea.fr

La surcharge de pression imposée au ventricule droit (VD) de manière chronique est responsable du remodelage et de la dysfonction contractile du VD entrainant à terme l’insuffisance cardiaque droite (ICD). C’est un facteur prédictif significatif de mortalité chez les patients souffrant d'hypertension pulmonaire (HTP). Une mauvaise régulation des signaux calciques intracellulaires est la cause principale de l’altération contractile lors de l'insuffisance cardiaque gauche. Cependant, la manière dont ces signaux calciques pourrait simultanément servir de signal direct pour contrôler les capacités contractiles et la masse cardiaque reste méconnue dans le contexte de l’ICD.

Dans une étude publiée dans Circulation Heart Failure, Jessica Sabourin et Fabrice Antigny des équipes « Signalisation calcique et physiopathologie cardiovasculaire » (UMRS-1180 Inserm/UPSaclay, Orsay) et « Physiopathologie et innovation thérapeutique » (UMRS-999, Inserm/UPSaclay, Le Plessis-Robinson) ont exploré les mécanismes moléculaires et cellulaires dans un modèle porcin d’ICD secondaire à une hypertension pulmonaire thromboembolique chronique, afin de mieux comprendre la pathogenèse de l’ICD et d'identifier des cibles thérapeutiques innovantes pour lutter contre son développement.

Le modèle d'ICD chez le porc reproduit les caractéristiques hémodynamiques et fonctionnelles des patients atteints d'HTP avec décompensation de la fonction du VD, ainsi qu’une signature transcriptomique caractéristique de l’ICD avec un remodelage de nombreux acteurs de la signalisation calcique. A l’échelle cellulaire, une désorganisation des dyades, des transitoires calciques faibles et lents, une quantité de Ca2+ contenu dans le réticulum sarcoplasmique diminuée associée à une expression réduite de la pompe SERCA2a, et une baisse de la contractilité cellulaire sont observés. Une augmentation de l'entrée calcique portée par les canaux SOCs (store-operated Ca2+ channels), associée à l'expression de novo du senseur calcique, STIM1L, est également montrée dans les cardiomyocytes du VD provenant du modèle porcin d’ICD et de patients atteints d’HTP. Ces altérations de la dynamique calcique contribuent au remodelage et au dysfonctionnement du VD dans ce modèle d’ICD.

Ces résultats constituent une avancée majeure et ouvrent de nouvelles perspectives pour la compréhension moléculaire de la pathogenèse de l’ICD, grâce à un modèle porcin d’ICD proche de l'homme. Ce modèle pourrait constituer une pierre angulaire dans le développement de meilleures approches thérapeutiques pour ralentir la progression de l'ICD.

-> Contact : jessica.sabourin@universite-paris-saclay.fr / fabrice.antigny@insem.fr

Les organites sans membrane sont des condensats biomoléculaires qui organisent spatialement et temporellement l’activité de nombreuses protéines ou acides nucléiques en les concentrant localement ou en les séparant de leur partenaires. Ces condensats se forment par séparation de phase liquide-liquide de protéines intrinsèquement désordonnées. Ce sont des structures dynamiques qui s'assemblent et se désassemblent rapidement en fonction de leur environnement physico-chimique.

Les séparations de phase contrôlées par la température sont particulièrement intéressantes car elles participent aux mécanismes moléculaires de la réponse cellulaire aux stress thermiques. Par exemple, chez Arabidopsis, la protéine FRI, qui active le promoteur du locus de floraison C (FLC), forme des condensats nucléaires après une exposition au froid, la séparant de FLC et réduisant son activité transcriptionnelle.

Pour comprendre les facteurs physico-chimiques qui gouvernent la formation réversible de ces condensats, Yingmin Jiang et Tâp Ha-Duong du Groupe de Modélisation Moléculaire de BioCIS (CNRS/UPSaclay, Orsay) ont développé un modèle gros-grain de protéines intrinsèquement désordonnées permettant de simuler par dynamique moléculaire leur séparation de phase dépendante de la température. Dans leur étude publiée dans Journal of Chemical Theory and Computation, les chercheurs ont mené des simulations qui reproduisent fidèlement les deux types de séparations de phase contrôlées par la température, celles se produisant en dessous d’une température critique dite UCST (Upper Critical Solution Temperature) et celles se produisant au dessus d’une LCST (Lower Critical Solution Temperature).

Ces modélisations soulignent l’importance des acides aminés hydrophobes et chargés des protéines intrinsèquement désordonnées sur leur propriété UCST ou LCST. Elles ouvrent de nouvelles voies pour étudier l’impact des mutations et modifications post-traductionnelles sur la dynamique des condensats et leurs éventuels dysfonctionnements pathologiques.

-> Contact : tap.ha-duong@universite-paris-saclay.fr

Lorsqu'on pense aux symboles de conservation, on pense généralement à des espèces emblématiques : pandas, tigres, éléphants, ours polaires, dauphins, etc. Ces animaux emblématiques, appelés espèces porte-drapeau, sont largement utilisés dans les campagnes de conservation pour capter l'attention du public et mobiliser le soutien aux objectifs de conservation. Cependant, une nouvelle étude menée par une équipe internationale de chercheurs soutient que le concept de porte-drapeau de conservation peut et doit être beaucoup plus diversifié, en s'étendant au-delà des espèces porte-drapeau à un éventail plus large de catégories porte-drapeau.

Bien qu’une entité porte-drapeau puisse certainement être un animal, selon une étude publiée dans Biological Conservation, elle peut également être une forêt, un récif corallien, un individu « célèbre » comme la tortue « Georges le Solitaire », ou même un événement naturel spectaculaire comme la floraison massive, l’émergence d’éphémères d’une rivière ou les migrations de papillons monarques, à condition que cela aide les gens à se connecter émotionnellement à un objectif de conservation.

L'étude collaborative internationale coordonnée par Ivan Jarić du laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette) propose une feuille de route stratégique pour sélectionner et utiliser efficacement le type de campagne porte-drapeau adapté à chaque public et objectif de conservation. Elle vise à encourager les défenseurs de l'environnement à planifier leurs campagnes comme des spécialistes du marketing et à choisir leur campagne porte-drapeau en fonction des préférences du public et des valeurs culturelles. Les auteurs suggèrent que les campagnes porte-drapeau de conservation les plus efficaces ne sont pas toujours les animaux les plus grands, les plus colorés ou les plus célèbres, mais que ce qui compte le plus, c'est leur capacité à toucher des publics spécifiques.

La perte de biodiversité menaçant les écosystèmes du monde entier, il est crucial de repenser la manière dont nous suscitons le soutien du public et ce qui fait l'efficacité d'une campagne de conservation.

Légende Photo : Aperçu des différentes catégories porte-drapeau, avec l’écosystème du Grand Yellowstone comme exemple : le Grizzly 399 comme individu porte-drapeau – une femelle grizzly, considérée comme l’ours le plus célèbre de l’écosystème du Grand Yellowstone, attire énormément l’attention et stimule le tourisme ; le grizzly comme espèce porte-drapeau ; les grands prédateurs, dont l’ours noir américain, le loup et le puma, comme flotte porte-drapeau ou communauté porte-drapeau ; l’écosystème du Grand Yellowstone et le parc national de Yellowstone comme écosystème porte-drapeau ou aire protégée porte-drapeau ; l’incendie de forêt visible en arrière-plan représente un événement porte-drapeau, tandis que le dessin de l’ours Smokey Bear sur le panneau représente un porte-drapeau fictif. Illustration : Snežana Leskovar et Irena Jarić.

-> Contact: ivan.jaric@universite-paris-saclay.fr

Dans une étude publiée dans Hepatology, les scientifiques de l’UMR-S 1193 (INSERM/UPSaclay, Villejuif) ont étudié le rôle de la protéine antimicrobienne REG3A dans le cancer primitif du foie. Les auteurs révèlent que REG3A agit comme un suppresseur de tumeur en réduisant l'O-GlcNAcylation, une modification protéique favorisant le cancer, sans affecter les enzymes qui régulent ce processus. Au lieu de cela, REG3A diminue les niveaux d'UDP-GlcNAc, le substrat de l'O-GlcNAcylation, grâce à sa capacité à se lier au glucose et au glucose-6-phosphate. Dans des modèles murins et des échantillons de foie humain, une expression plus élevée de REG3A était associée à une réduction de l'O-GlcNAcylation et à un risque moindre de cancer.

Ces résultats mettent en évidence un nouveau mécanisme de régulation du cancer via l'activité de liaison aux glucides de REG3A.

-> Contact : jamila.faivre@inserm.fr

Pendant son cycle sexuel, la paramécie réorganise massivement son génome en éliminant des dizaines de milliers de séquences internes (IES) du noyau somatique en développement, grâce à l’introduction programmée de cassures double brin de l’ADN (CDB), efficacement réparées par la voie NHEJ de jonction d’extrémités non homologues. Dans ce système, la réparation des CDB nécessite non seulement les acteurs essentiels du NHEJ, Ku70/80 et Xrcc4/Lig4, mais aussi des enzymes capables de maturer avec précision les extrémités 5' de 4 bases sortantes, générées aux sites d’excision des IES.

Dans une étude publiée dans Nucleic Acids Research, des chercheurs du département de Biologie des Génomes de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) ont identifié chez Paramecium tetraurelia quatre orthologues de l’ADN polymérase lambda humaine —PolXa, PolXb, PolXc et PolXd— comme acteurs-clés de la réparation des jonctions d’excision des IES. Les cellules dépourvues de ces enzymes PolX présentent de nombreux dommages dans leur génome, dont des cassures non réparées, de courtes délétions intrachromosomiques et la rétention de leurs IES. Les quatre protéines PolX sont capables de maturer les extrémités d’ADN, mais PolXa et PolXb présentent la particularité d’être spécifiquement produites au moment des réarrangements programmés du génome et portent une unique région interne qui favorise leur localisation nucléaire.

Ces travaux montrent que, contrairement à PolXc, PolXa se concentre dans des foyers nucléaires avec certains facteurs-clés du NHEJ et une enzyme de type Dicer impliquée dans la production de petits ARN spécifiques des IES, qui régulent leur excision. Ces foyers pourraient être les sites où les IES excisées sont ligaturées les unes aux autres sous forme de concatémères utilisés comme matrices pour la production de petits ARN, établissant ainsi un lien entre réparation de l’ADN et contrôle par l’ARN de la dynamique du génome.

-> Contact : mireille.betermier@i2bc-paris-saclay.fr / julien.bischerour@i2bc.paris-saclay.fr

Micheline Misrahi-Abadou est professeure émérite de biochimie et biologie moléculaire à la Faculté de médecine Paris-Saclay. Ses travaux pionniers sur les causes génétiques de l'infertilité ont ouvert la voie à une médecine de la fertilité « sur mesure », encore trop peu connue du monde médical et des patientes concernées, et lui ont valu d’être distinguée à plusieurs reprises.

Lire son portrait sur le site de UPSaclay

-> Contact : micheline.misrahi-abadou@universite-paris-saclay.fr

Dr. Tania Konry, professeure à Northeastern University (Boston), où elle dirige un programme de recherche interdisciplinaire à l’interface du génie biomédical, de la microfluidique et de l’immunologie translationnelle, donnera une conférence vendredi 23 mai de 12h30 à 13h30 sur le thème : « Microengineered Platforms for Immune Profiling and Personalized Therapeutics ».

Brief Bio:

Dr. Tania Konry is a Professor at Northeastern University, where she leads an interdisciplinary research program at the intersection of biomedical engineering, microfluidics, and translational immunology. She received her Ph.D. in Biotechnology Engineering and completed her postdoctoral training at Harvard Medical School, where she focused on single-cell analysis and clinical diagnostics. Dr. Konry’s lab develops next-generation lab-on-chip and single-cell technologies aimed at advancing diagnostic and therapeutic strategies. Her research is supported by the NIH, NSF, and ARPA-H and industry. She is a recognized leader in developing innovative tools for immune profiling, 3D tissue models, and integrated biosensing, with a strong focus on translational applications in cancer and immune-related diseases.

Talk Summary:

Dr. Konry will present her lab’s recent advances in the development of integrated microsystems for real-time immune profiling and personalized medicine. The talk will cover novel 3D tissue-engineered models and microfluidic platforms that enable dynamic single-cell analysis and functional immune monitoring. These technologies aim to replicate physiologically relevant environments to better understand disease mechanisms and therapeutic responses. Applications include immuno-oncology, infectious disease, and patient-specific treatment design, highlighting how microengineering and systems biology can converge to impact next-generation diagnostics and therapeutics.

• Le jeudi 22 mai 2025 de 12h30 à 13h30.
• Comodal : présentiel & visioconférence
• Salle 113 Bâtiment Recherche à la Faculté de Médecine Paris-Saclay
• Cliquez ici pour vous inscrire.

De nombreuses pathologies chroniques augmentent la susceptibilité aux infections bactériennes chez l’homme, en particulier à Staphylococcus aureus. La dérégulation de l’activité des macrophages et un stress oxydatif excessif exacerbent le dysfonctionnement immunitaire et l’inflammation dans ces conditions. Le facteur de transcription Nrf2 (nuclear factor erythroid 2-related factor 2) joue un rôle clé dans la régulation des défenses antioxydantes et des fonctions macrophagiques. La bardoxolone (CDDO-Me), un triterpénoïde synthétique, active la voie Nrf2, procurant des effets antioxydants et anti-inflammatoires. Cependant, le rôle précis de ce médicament dans la modulation de l’activité, de la polarisation des macrophages et la clairance bactérienne reste mal compris.

Dans une étude parue dans Frontiers in Immunology, les chercheurs de l’Unité End:icap UMR-S 1179 (INSERM/UPSaclay/UVSQ, Montigny le Bretonneux) ont évalué les effets du CDDO-Me sur la fonction des macrophages in vitro (lignées de macrophages humains THP-1 et murins RAW 264.7) et in vivo chez la souris. Les résultats montrent que le CDDO-Me active la voie de signalisation Nrf2, réduit le stress oxydatif et l’inflammation des macrophages en régulant à la baisse l’expression de cytokines pro-inflammatoires. Il module la polarisation des macrophages en diminuant l'expression des marqueurs M1 et M2, et améliore considérablement l’activité bactéricide contre S. aureus. Ces effets sont dépendants de Nrf2, comme démontré par l’utilisation de souris KO pour le gène Nrf2.

La capacité du CDDO-Me à réguler le stress oxydatif, l'inflammation, et la clairance bactérienne souligne son potentiel thérapeutique pour la prise en charge des maladies inflammatoires et infectieuses. Ces travaux s’inscrivent dans les projets de l’équipe visant à développer de nouvelles stratégies thérapeutiques pour les pathologies inflammatoires chroniques invalidantes.

Légende Figure : représentation schématique des voies modulées par la bardoxolone dans les modèles d’infection de macrophages.

-> Contact : marcel.bonay@aphp.fr

Dans un article publié en 2017 dans Science, une équipe de chercheurs Nord-américains et Norvégiens avait montré, à l’aide d’une analyse épidémiologique dans des bases médico-administratives et de modèles expérimentaux in vitro, que l’utilisation d’agonistes bêta-adrénergiques (bêta-agonistes pour le traitement de l’asthme) seraient associés à un risque diminué de maladie de Parkinson, tandis que l’utilisation de bêta-bloquants (traitement principalement à visée cardiovasculaire) serait associée à un risque augmenté. L’analyse épidémiologique souffrait de deux limites importantes : pour les bêta-agonistes, les auteurs n’ont pas pu prendre en compte un biais de confusion par le tabagisme (associé à un risque diminué de maladie de Parkinson et un risque augmenté de consommation de ces médicaments) ; pour les bêta-bloquants, les auteurs n’ont pas pu éliminer un biais de causalité inverse lié au fait que ces médicaments peuvent être utilisés pour traiter un tremblement qui peut être présent dans les années précédant le diagnostic de maladie de Parkinson.

Une étude récente publiée dans Journal of Parkinson’s Disease, menée par Thi Thu Ha Nguyen de l’équipe « Exposome et Hérédité » du Centre de Recherche en Epidémiologie et Santé des Populations – CESP (UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Villejuif), en collaboration avec l’équipe de « Biostatistiques en grande dimension » du CESP, a eu pour objectif d’étudier la relation entre la consommation de bêta-agonistes et de bêta-bloquants et le risque de maladie de Parkinson dans la cohorte de femmes E3N, tout en prenant en compte les limites décrites ci-dessus.

La consommation des médicaments a été évaluée à partir de bases de délivrances de médicaments disponibles depuis 2004 ; les chercheurs ont distingué parmi les bêta-agonistes, ceux à demi-vie courte (SABA) ou longue/ultra-longue (LABA/ultra-LABA), tandis que parmi les bêta-bloquants, ils ont distingué le propranolol (principal traitement du tremblement) des autres bêta-bloquants non-sélectifs et des bêta-bloquants sélectifs. Afin d’éviter un biais d’utilisateur prévalent, les analyses ont été restreintes aux participantes ayant initié un traitement au cours du suivi. Les chercheurs ont utilisé des modèles de Cox multivariés (ajustés notamment sur le tabac) pour des expositions dépendantes du temps, avec un décalage de 5 ans entre l’exposition et l’incidence (lag) pour prendre en compte la causalité inverse ; des analyses sans lag ou avec un lag de 2 ans ont également été réalisées. De plus, les trajectoires des délivrances annuelles des médicaments (échelle de temps rétrospective) ont été examinées dans une étude cas-témoins nichée à l'aide de modèles logistiques mixtes.

Les analyses ont inclus près de 80 000 femmes, dont environ 550 ont développé une maladie de Parkinson au cours du suivi (2004-2018) ; sur cette période, 15 169 femmes ont débuté un traitement bêta-agoniste et 13 081 un traitement bêta-bloquant.

Bêta-agonistes : La fréquence des délivrances annuelles de bêta-agonistes, en particulier de LABA/ultra-LABA, était plus élevée chez les cas que chez les témoins tout au long de la période pré-diagnostique (Figure 1A). L'incidence de la maladie de Parkinson était inférieure de 36% (rapport de risque = 0,64, intervalle de confiance à 95% = 0,41-0,98 ; p-tendance = 0,04 pour le nombre de délivrances) chez les utilisatrices de LABA/ultra-LABA par rapport aux non-utilisatrices. Il n'y avait pas d'association pour les bêta-agonistes en général et les SABA.

Bêta-bloquants : La fréquence des délivrances annuelles de bêta-bloquants, en particulier de propranolol, devenait plus élevée chez les cas que chez les témoins uniquement dans les 5 ans avant le diagnostic (Figure 1B).L'incidence de la maladie de Parkinson était similaire chez les femmes ayant débuté un traitement par bêta-bloquants et chez celles n'en ayant jamais pris dans les analyses avec un décalage de 5 ans ; en revanche, elle était plus élevée dans les analyses avec un décalage de 2 ans ou sans décalage, surtout pour le propranolol.

En conclusion, ces résultats sont cohérents avec l'hypothèse selon laquelle les LABA/ultra-LABA pourraient être associés à un risque plus faible de maladie de Parkinson chez les femmes. Les mécanismes qui sous-tendent cette association restent à élucider. Inversement, ces résultats montrent clairement que l'association entre les bêta-bloquants et la maladie de Parkinson est liée à la causalité inverse.

-> Contact : alexis.elbaz@inserm.fr

Dans une revue publiée dans Journal of Experimental Medicine, des chercheurs de l’UMR-S 1015 Immunologie des tumeurs et immunothérapie (INSERM/Gustave Roussy/UPSaclay, Villejuif) font le point sur les méthodes émergentes modulant le microbiote intestinal pour optimiser les immunothérapies par blocage des points de contrôle immunitaire.

En effet, malgré l’efficacité des immunothérapies dans le traitement du cancer, la résistance thérapeutique et les toxicités liées au système immunitaire demeurent des préoccupations majeures. De même, il est démontré que la dysbiose intestinale, c’est-à-dire une altération de la composition et la fonction microbienne, impacte négativement l’efficacité des immunothérapies, tandis qu’un microbiote intestinal diversifié et la présence de bactéries bénéfiques sont corrélés à des meilleurs taux de réponse thérapeutique.

Ainsi, manipuler le microbiote intestinal pourrait restaurer ou améliorer l’efficacité thérapeutique.

-> Contact : simon.thomas@gustaveroussy.fr / andrew.almonte@gustaveroussy.fr

La Société européenne de médecine de soins intensifs (ESICM) et la Société européenne de soins intensifs pédiatriques et néonatals (ESPNIC) viennent de publier les premières recommandations internationales, “evidence-based", concernant l'utilisation de l'échographie pulmonaire quantitative chez l'adulte, l'enfant et le nouveau-né. Le Pr. Daniele De Luca, PUPH en réanimation néonatale à la Faculté de Medicine UPSaclay et membre de l’UMR-S 999 « Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique » (INSERM/UPSaclay) en est le dernier auteur et concepteur.

Grâce à un effort interdisciplinaire unique, les deux sociétés européennes de réanimation ont publié des recommandations pour une utilisation optimale de l'échographie pulmonaire quantitative, une technique qui a révolutionné l'imagerie au lit du patient gravement malades de tout âge confondu, partout dans le monde. Conscientes de l'importance de cette technique et de son développement rapide, l'ESICM et l'ESPNIC ont souhaité créer ce projet afin d'optimiser son utilisation et d'éviter les interprétations erronées ou la création de scores échographiques non validés. Ce projet a bénéficié de la participation de 22 leaders provenant de la réanimation des adultes, enfants ou nouveau-nés, dont des représentants des pays en voie de développement et deux méthodologistes. La transdisciplinarité a constitué une vraie valeur ajoutée significative, permettant de mutualiser les connaissances pour créer un consensus véritablement actualisé qui s'est traduit en 46 recommendations (4 seulement pour patients adultes, 4 pour nouveau-nés et 38 pour toute catégorie de patients).

Ce travail va guider la pratique clinique de tous les réanimateurs pendant de nombreuses années et a été publié, après 2 ans d'efforts, dans Intensive Care Medicine, revue officielle de l'ESICM et principale revue au monde dans le domaine de la réanimation.

-> Contact : daniele.deluca@aphp.fr / daniele.de-luca@universite.paris.saclay.fr

Julien Pernier est chargé de recherche INRAE, depuis 2024, dans l’unité BIOGER (INRAE/UPSaclay) à Palaiseau, au sein de l’équipe Effecteurs de la Communication Cellulaire à l’interface champignon - Plante. Il s’intéresse aux mécanismes de synthèse et de libération des vésicules extracellulaires fongiques produites par des phytopathogènes.

Il a effectué sa thèse à l’Université Pierre et Marie Curie (Paris) en biochimie pour déterminer le rôle de résidus clés dans l’activité enzymatique de l’aminopeptidase B. Il a ensuite réalisé différents post-docs de 2011 à 2024. Il a tout d’abord rejoint le LEBS (Gif-sur-Yvette) pour travailler sur les régulateurs de la dynamique du réseau d’actine. Puis il a rejoint l’Institut Curie (Paris) pour étudier le rôle d’un moteur membranaire sur l’organisation du cytosquelette en utilisant des systèmes membranaires biomimétiques. Il a ensuite développé à l’I2BC (Gif-sur-Yvette) des systèmes de reconstitution d’adhésions focales pour comprendre les mécanismes contrôlant leurs formations. Enfin, à l’Institut Gustave Roussy (Villejuif), il a voulu savoir comment un moteur membranaire participe à la régulation de l’autophagie en intervenant dans la maturation de vésicules intracellulaires, les lysosomes, lors de la progression du cancer de la vessie.

Depuis son arrivée à l’INRAE, Julien a pour but de comprendre comment des champignons phytopathogènes produisent et libèrent les vésicules extracellulaires. Peu d'informations sont actuellement disponibles sur les vésicules extracellulaires fongiques. Son hypothèse est que différentes protéines homologues à celles caractérisées chez les mammifères contrôlent la production des vésicules extracellulaires fongiques. Il propose une étude interdisciplinaire et multi-échelle, incluant des approches de surexpression et de délétion de protéines, la dynamique de la membrane des cellules vivantes, l'isolement et l'analyse des vésicules extracellulaires et le développement de systèmes biomimétiques in vitro, afin d’identifier le rôle de ces différentes protéines. A plus long terme ces protéines pourront servir de marqueur des vésicules extracellulaires pour leur suivi lors de l’infection des plantes.

« Il faut avoir de la persévérance, et surtout de la confiance en soi. Il faut croire que l'on est doué pour quelque chose, et que, cette chose, il faut l'atteindre coûte que coûte. » - Marie Curie

-> Contact : julien.pernier@inrae.fr

Eric Vivier, président du Paris-Saclay Cancer Cluster et spécialiste des « Natural Killers », des cellules clés de l'immunité innée, travaille sur de nouvelles générations d'anticorps thérapeutiques contre le cancer. Plusieurs font l'objet d'essais cliniques.

Les cellules « Natural Killer » (NK) ont été découvertes dans les années 1970 et représentent entre 5 et 20% des lymphocytes, qui comptent eux-mêmes pour 20% à 40% de la masse des globules blancs. Que sait-on d'elles ?

Ces cellules sont de redoutables prédateurs sélectifs qui tuent les cellules soumises à un stress et rien d'autre. Elles font partie du système immunitaire inné et n'ont besoin d'aucune des signalétiques d'intrusion de cellules antigènes pour actionner leur mode cytotoxique.

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Le cancer primitif du foie est une maladie grave, et l’une des principales solutions curatives reste la chirurgie: on retire la partie du foie atteinte. Mais ces opérations sont complexes et comportent des risques importants. Aujourd’hui, il est difficile de prédire précisément la difficulté d’une intervention avant qu’elle ait lieu.

Des chercheurs du centre hépatobiliaire AP-HP Paul Brousse (UMR-S 1193 INSERM/UPSaclay, FHU Hepatinov, Villejuif), d'Inria et de Guerbet ont développé un outil basé sur l’intelligence artificielle (IA) pour relever ce défi. À partir de simples scanners réalisés avant l’opération, ils créent un modèle 3D du foie, des tumeurs et des vaisseaux sanguins. Grâce à ce “jumeau numérique”, l’IA analyse la position des tumeurs par rapport aux zones sensibles du foie.

Un nouveau cadre anatomique a été mis en place pour évaluer la complexité réelle de l’intervention. L’outil a été testé sur 145 patients et s’est montré plus précis que l’estimation faite par les chirurgiens, avec une prédiction fiable dans près de 80% des cas.

Cette avancée, publiée dans Annals of Surgery,  pourrait transformer la manière dont les chirurgiens planifient leurs interventions. À terme, cela permettrait d’orienter les patients vers les hôpitaux les mieux équipés selon la complexité prévue de leur opération, tout en réduisant les risques et en améliorant les chances de succès.

-> Contact : irene.vignon-clementel@inria.fr / eric.vibert@aphp.fr

Les stéréo-isomères sont des molécules qui possèdent le même nombre et types d’atomes, mais orientés différemment dans l’espace. Dans les peptides et les protéines, il existe un cas particulier de stéréoisomérie : l’isomérisation cis/trans de la proline. Cette isomérisation, et les interconversions conformationnelles associées, affectent de nombreux processus cellulaires. Malgré l’implication de la proline dans le repliement, la stabilité et l'agrégation des protéines, la discrimination des isomères cis et trans de la liaison peptidique Xaa-Pro n'avait jamais été montrée à l'échelle de la molécule unique avec un nanopore.

Le laboratoire LAMBE (Laboratoire Analyse, Modélisation, Matériaux pour la Biologie et l'Environnement, UMR 8587 UEVE/UPSaclay/CNRS/Cergy Paris Université, Evry‑Courcouronnes), spécialisé, en particulier, dans la détection de biomolécules et peptides par nanopore, a démontré l’identification et la discrimination des isomères cis et trans de la proline. En particulier, dans un fragment de 19 acides aminés riche en proline de la protéine Dynamin 2, une de protéines impliquées dans la myopathie centro-nucléaire, la troisième proline de la séquence a été substituée par des fluoro-prolines stéréo-isomériques. Grace aux expériences réalisées par nanopores, l’influence de la fluoration sur l’équilibre entre les conformères cis/trans par rapport à la proline naturelle a été montrée et confirmée par spectroscopie RMN en collaboration avec l’Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire et l’École Supérieure de Biotechnologie de l’Université de Strasbourg . Ces travaux ont été publiés dans Chemical Science.

L'aérolysine est donc un excellent détecteur pour caractériser des états conformationnels cis/trans de l’acide aminé proline et pourrait être utilisée pour l’étude de prolines impliquées dans des maladies.

-> Contact : juan.pelta@univ-evry.fr / benjamin.cressiot@cyu.fr

Les antibiotiques de la classe des β-lactamines sont les antibiotiques les plus prescrits dans le monde. Ils agissent en inhibant l'assemblage du peptidoglycane de la paroi cellulaire, ce qui aboutit à la lyse de la bactérie. Le peptidoglycane est une macromolécule polymérique composée de chaînes glycanes réticulées par de courts peptides. Ce pontage interpeptidique est le plus souvent catalysé par des enzymes de type d,d-transpeptidases. Ces enzymes appartenant à la famille des protéines liant la pénicilline sont reconnues par les β-lactamines qui les inactivent. Cependant, le peptidoglycane de Clostridioides difficile fait figure d’exception car il est principalement polymérisé par l’action d’une autre classe d’enzymes, les l,d-transpeptidases, qui sont insensibles aux β-lactamines.

Dans une étude publiée dans iScience, des chercheurs de l’I2BC (CEA/CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) et de l’Institut Micalis (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) ont étudié le rôle de la voie de l,d-transpeptidation dans la résistance aux β-lactamines. C. difficile est résistant a de nombreuses β-lactamines mais les chercheurs ont montré que les l,d-transpeptidases ne sont pas impliquées dans ce processus.

Cette étude a permis d’établir que la résistance est en fait due à une faible affinité des d,d-transpeptidases de C. difficile pour cette classe d’antibiotiques. Cette étude a également révélé que la voie de l,d-transpeptidation est la cible principale desβ-lactamines. Les l,d-transpeptidases utilisent exclusivement des précurseurs du peptidoglycane modifiés qui sont générés par des d,d-carboxypeptidases. L’exposition de C. difficile à des concentrations subinhibitrices de différentes β-lactamines ont permis aux chercheurs de montrer que ces antibiotiques inactivent les d,d-carboxypeptidases ce qui prive les l,d-transpeptidases de leur substrat et limite la résistance de la bactérie contre ces antibiotiques. Ainsi, ces travaux révèlent un mécanisme d’action original des β-lactamines chez C. difficile.

-> Contact : johann.peltier@i2bc.paris-saclay.fr

L'ADN ancien offre une opportunité unique d'étudier l'histoire et la propagation des maladies infectieuses. Dans une étude publiée dans Journal of Infectious Disease, une équipe du Laboratoire Anthropologie, Archéologie, Biologie - LAAB (UFR Simone Veil - santé UVSQ/UPSaclay, Montigny-Le-Bretonneux), en association avec l'Institut Pasteur et le Muséum National d'Histoire Naturelle, a analysé 21 échantillons d'une collection d'étuis péniens du XXe siècle, provenant de Papouasie-Nouvelle-Guinée, de Papouasie (Indonésie) et du Vanuatu, et conservée au Musée du quai Branly-Jacques Chirac à Paris.

Malgré la présence d'espèces environnementales, ils ont identifié des bactéries associées à l'homme mais également une trace génétique d'une forme ancienne du virus d'Epstein-Barr (EBV). L'analyse phylogénétique a placé cette souche au sein d'un groupe de Papouasie-Nouvelle-Guinée-Indonésie.

Ces résultats mettent en évidence le rôle précieux des collections de musées comme réservoirs de données génétiques, offrant un aperçu historique de l'évolution et de la propagation des agents pathogènes humains.

-> Contact : philippe.charlier@uvsq.fr

Leïla Bechtella, Maître de conférences au département de chimie de l’université Evry Paris-Saclay, travaille au sein du LAMBE (Laboratoire Analyse, Modélisation, Matériaux pour la Biologie et l'Environnement, UMR 8587 UEVE/UPSaclay/CNRS/Cergy Paris Université, Evry‑Courcouronnes) dirigé par Régis Daniel. Elle est rattachée à l’équipe 1 : « Structure-réactivité de biomolécules : complexes organométalliques et macromoléculaires », où elle conduit ses travaux de recherche sur l’analyse structurale de la glycosylation des protéines par des techniques de spectrométrie de masse et mobilité ionique.

Leïla a une formation en chimie et en chimie biologique et une expérience de recherche en chimie analytique appliquée aux biomolécules. Son parcours scientifique s’est orienté autour de l’analyse structurale de peptides et de polysaccharides. Elle a accompli une formation d’ingénieure chimiste, complétée par un Master de recherche en biotechnologie, et a ensuite rejoint Sorbonne Université pour réaliser une thèse de doctorat au Laboratoire des BioMolécules (UMR 7203). Sous la direction d’Emmanuelle Sachon et Astrid Walrant, son projet doctoral portait sur l’analyse des interactions de peptides membranotropes avec des membranes lipidiques. Après un premier postdoctorat au laboratoire Cobra à Rouen, avec Carlos Afonso et Marie Hubert-Roux, elle a rejoint le groupe de Kevin Pagel à l’université libre de Berlin pour travailler sur l’analyse structurale de O-glycanes de type mucine grâce à la spectrométrie de mobilité ionique de haute résolution.

Ces travaux ont permis le développement de méthodes en spectrométrie de masse et couplages pour l’analyse structurale de peptides et de glycanes, et ce dans le contexte d’applications thérapeutiques et biomédicales. À l'interface de la chimie biologique et analytique, ses travaux ont permis l'élucidation structurale des biomolécules et l'étude de leurs interactions en utilisant la synthèse peptidique, le photomarquage et la dérivatisation des glycanes couplés à la chromatographie, à la mobilité ionique et à la spectrométrie de masse. Leïla a appliqué ces méthodes de chimie à l'étude des mécanismes de défense et de perméabilité aux interfaces biologiques : interaction lipide/peptide membranotrope ; rôle des O-glycanes de type mucine dans les dynamiques mucus-pathogène.

Dans son projet de recherche actuel, elle cherche à élucider à l’échelle moléculaire la glycosylation des protéines, une modification post-traductionnelle qui entraîne une variabilité exponentielle du protéome et peut avoir un impact majeur sur la fonction biologique des protéines. Pour cela, elle étudie le comportement et la fragmentation de glycopeptides en phase gazeuse, afin de proposer des solutions analytiques accessibles et facilement intégrables en glycoprotéomique.

« Dans l’art et dans la science, l’essentiel est de saisir nettement les objets, et de les traiter conformément à leur nature. » - J. W. von Goethe

-> Contact : leila.bechtella@univ-evry.fr

Le Pr Jérôme Le Pavec du Service de Chirurgie Thoracique, Vasculaire et Transplantation Cardio-pulmonaire et UMR-S 999 (Inserm/UPSaclay, Hôpital Marie-Lannelongue, Le Plessis-Robinson) s’est vu remettre le grand prix du congrès mondial de transplantation pulmonaire pour la recherche en immunomodulation par la photophérèse extracorporelle le 30 avril dernier à Boston. Ce prix couronne une équipe dont le projet est considéré comme le plus innovant et alloue 90 000 $ à ses bénéficiaires.

La dysfonction chronique du greffon pulmonaire (CLAD) reste la principale cause de mortalité à long terme après transplantation pulmonaire, malgré des traitements immunosuppresseurs standards. La photophérèse extracorporelle (PEC) apparaît comme une option prometteuse, mais son efficacité reste insuffisamment évaluée par des essais cliniques robustes dans cette indication. Le projet BIO-ECP a pour but principal d’évaluer l'impact de la PEC sur la charge de l’ADN libre circulant dérivé du donneur (dd-cfDNA), un biomarqueur émergent reflétant l'agression du greffon. L’étude vise aussi à mieux comprendre les facteurs prédictifs de réponse à la PEC et à observer son effet sur la fonction pulmonaire et la qualité de vie des patients.

Cette récompense décernée par la communauté internationale de transplantation pulmonaire constitue une reconnaissance majeure pour la qualité du projet et l'expertise des équipes impliquées dans le projet (Service de Transplantation pulmonaire de Foch et Marie Lannelongue). Ce prix apporte par ailleurs une pierre financière significative à l'édifice scientifique du projet agissant comme un levier pour une mise en place prochaine du projet.

Il s'agit d'un travail collaboratif avec l'équipe de transplantation de Foch illustrant la pleine synergie des 2 services de transplantation et l'implication sans réserve dans la recherche translationnelle au service des patients.

-> Contact : j.lepavec@ghpsj.fr