Life Sciences Université Paris-Saclay

Vendredi 27 octobre à 15h20 - RNA deep sequencing: capturing the dark matter that matters, par Daniel Gautheret, Professeur à l'Université Paris-Sud et chef d'équipe à l'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule, Gif sur Yvette.

L'ARN est la première étape entre génotype et phénotype, ainsi cette molécule est systématiquement altérée dans tous les cancers et maladies génétiques. Pourtant, la diversité des ARN est telle qu'identifier ceux ayant réellement un impact ou un pouvoir prédictif dans les maladies demeure un problème majeur. La combinaison du séquençage massif et de l'apprentissage statistique pourrait bien apporter la réponse la plus pertinente à cette question.

Inscriptions (gratuites mais obligatoires) jusqu'au 1er octobre : https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/colloque-SDV

La Nuit européenne des chercheurs permet au public de venir rencontrer les chercheurs le 29 septembre dans 200 villes en Europe (12 en France). L’occasion d’interroger Armelle Regnault, directrice adjointe de la recherche de l’Université Paris-Saclay (UPSaclay), sur la politique de recherche de l’établissement.

Ci-joint l'annonce d'un forum européen sur les big data organisé à Versailles qui associe partenaires publics et privés. Il y a une session agri-food et une autre santé.

Vendredi 27 octobre à 9h25 - Les usines virales formées lors de l’infection rabique ont des propriétés d’organelles liquides par Yves Gaudin,  Directeur de recherches au CNRS, Responsable du département de Virologie de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC).

La réplication du virus de la rage s’effectue dans des usines virales baptisées corps de Negri. Dans des expériences alliant biologie cellulaire et biophysique, nous avons caractérisé la nature physico-chimique de ces structures qui hébergent la synthèse des acides nucléiques viraux et montré qu’elles se forment par séparation de phase liquide. Ces usines virales constituent donc un nouvel exemple d’organelle liquide.

Inscriptions (gratuites mais obligatoires) jusqu'au 1er octobre : https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/colloque-SDV

L’Université Paris-Saclay et la SATT Paris-Saclay lancent un nouveau moteur de recherche en ligne qui permettra aux entreprises de chercher des compétences et expertises de la recherche publique de l'Université Paris-Saclay. Le portail Plug in Labs sera inauguré le 26 septembre au WAI Massy Saclay.

Légende de la figure : profil d’inhibition de l’imatinib et du dasatinib

Les inhibiteurs de tyrosine kinases ciblant la translocation Bcr-Abl (imatinib, nilotinib, dasatinib, bosutinib, ponatinib) ont révolutionné le pronostic de la leucémie myéloïde chronique (LMC). Des complications non détectées lors des essais thérapeutiques se sont révélés avec l’utilisation au long cours de ces molécules. L’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) est définie par l’augmentation de la pression artérielle pulmonaire aboutissant à une insuffisance cardiaque droite sévère et au décès. Cette maladie est la conséquence d’un remodelage des petits vaisseaux pulmonaires.

Le Centre de Référence de l’Hypertension Pulmonaire de l'hôpital Bicêtre (Service de Pneumologie, Le Kremlin Bicêtre, Assistance Publique Hôpitaux de Paris) vient de rapporter dans un article paru dans le European Respiratory Journal l’évolution à long terme de patients ayant développé une HTAP associée à la prise de dasatinib. Dans cette étude, la prise en charge de l’HTAP associée à l’arrêt du dasatinib permettait une amélioration clinique et hémodynamique de l’HTAP. Néanmoins, près d’un tiers des malades gardaient une HTAP résiduelle témoignant du remodelage artériel pulmonaire induit par le dasatinib. Cela vient confirmer des données expérimentales réalisées au sein de l’Unité Mixte de Recherche « Hypertension Pulmonaire: Physiopathologie et Innovation Thérapeutique » (INSERM UMR-S 999, UPSud, Université Paris-Saclay, Hôpital Marie Lannelongue, Directeur: Marc Humbert) et parue dans le Journal of Clinical Investigation (https://www.jci.org/articles/view/86249) montrant que le dasatinib entrainait une dysfonction endothéliale associée au stress oxydant. Cette complication ne semble pas spécifique au dasatinib puisque des cas d’HTAP ont été récemment rapportés avec le bosutinib et le ponatinib. Les équipes de l’unité INSERM UMR-S999 espèrent que la meilleure compréhension des mécanismes à l’origine de ces HTAP médicamenteuses ouvrira de nouvelles voies thérapeutiques pour cette maladie grave.

Contact : davidmontani@gmail.com

Legume plants are able to interact with rhizobia soil bacteria to establish on their root system a new organ where bacteria will be hosted. This allows this specific group of plants to use atmospheric nitrogen when soils are deprived of this essential resource thanks to a symbiotic interaction with these bacteria. This allows legume plants to survive on poor soils even in the absence of nitrogen fertilizers, and explains their ability to biologically enrich soils for example during culture rotation agronomic practices. In a recent review published in Trends in Plant Science, Florian Frugier and his team at IPS2 (Institute of Plant Sciences – Paris Saclay), CNRS, INRA, Université Paris-Sud, Université Paris-Diderot, Université d’Evry, Université Paris-Saclay, Bâtiment 630, Gif-sur-Yvette) highlight the tremendous knowledge that was gained on the recognition between the two symbiotic partners and the processes of root infection and nodule organogenesis, focusing on the key function of a plant hormone, cytokinins. This knowledge contributes to understand why atmospheric nitrogen-fixing nodule organ development is only restricted to legume roots, with the aim of biotechnologically transferring this capacity to non-legume plants such as cereals which growth relies mostly on nitrogen fertilizers inputs.

Contact : florian.frugier@ips2.universite-paris-saclay.fr

Le dimanche 10 septembre, une équipe composée de femmes des études E3N/E4N et des chercheuses de l'UMR-S 1018 - "Générations et Santé" (Centre de Recherche en Epidémiologie et Santé des Populations - CESP, INSERM/UFR de Médecine de l'UPSud, Villejuif) ont participé, avec l'association SPOON, à cette course 100 % féminine ! Les cohortes E3N et E4N constituent la plus grande étude sur la santé au sein de la famille.

http://www.idf.inserm.fr/actualites/la-parisienne-2017-les-cohortes-e3n-e4n-en-course

October 9-10, 2017, Gif-sur-Yvette Auditorium IMAGIF, building 21, Campus CNRS

The workshop is dedicated to studies using the MinION. This sequencer can sequence DNA fragments up to hundreds of kb allowing unprecedented possibilities in genomics, metagenomics and epigenomics. Internationally renowned experts will present their work and share their expertise in these fields.

Registration is free but mandatory and is limited to 150 participants, on a first-come basis.

Contact : mireille.betermier@i2bc.paris-saclay.fr

Vendredi 27 octobre, 11h35 – 12h50 / Agro-Sciences, Ecologie, Bioéconomie – 1ère partie.

Claire Rogel-Gaillard, Directrice de Recherches à l’INRA, est responsable de l’UMR Génétique Animale et Biologie Intégrative (UMR1313 GABI, INRA-AgroParisTech, http://www6.jouy.inra.fr/gabi) basée à Jouy-en-Josas. Elle coordonne l’Institut Sciences Animales Paris-Saclay (http://saps.paris) et l’initiative de recherche stratégique PREDICT. Responsable adjointe du département Sciences de la Vie de l’UPSaclay, elle est l’une des deux animatrices de l’axe « Agro-Sciences, Ecologie et Bioéconomie ». Elue au Conseil académique de l’UPSaclay, elle est membre de son bureau. Ses activités de recherche actuelles portent sur la caractérisation de la capacité immunitaire chez le porc, afin d’identifier des marqueurs génétiques et des biomarqueurs prédictifs de réponses vaccinales et de la sensibilité/résistance à des pathogènes.

Inscriptions (gratuites mais obligatoires) jusqu'au 1er octobre : https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/colloque-SDV

Jeudi 26 octobre à 17h30 - Holistic metagenomics in marine plankton communities par Patrick Wincker

Patrick Wincker est directeur de recherche au CEA et directeur du Genoscope. Il coordonne le séquençage et l’analyse génomique du projet Tara Océans. L’expédition Tara Oceans, co-dirigée par Eric Karsenti (chercheur CNRS, détaché à l’EMBL) et Etienne Bourgois, a navigué sur tous les océans, pour étudier les écosystèmes marins planctoniques. Comparée aux autres programmes de métagénomique, l’originalité principale de Tara Oceans tient dans son échelle globale. Il ne s’agit plus de comprendre un groupe particulier, comme les bactéries, les virus ou les organismes eucaryotes, mais de les décrire tous en même temps. En effet, il existe de nombreux modes d’interaction entre espèces, comme la symbiose, le parasitisme ou la compétition, qui expliquent la dynamique des communautés microbiennes et ne peuvent être compris qu’en étudiant l’ensemble des acteurs. Les premiers résultats obtenus indiquent que la diversité génétique de ces communautés est globalement très sous-estimée. Le contenu en gènes des différents groupes phylogénétiques est étudié par métagénomique et métatranscriptomique, permettant d’aborder la complexité génique à l’échelle globale et sa variabilité.

Inscriptions (gratuites mais obligatoires) jusqu'au 1er octobre : https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/colloque-SDV