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November 28, 2017 4:18 PM
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Carrageenan catabolism is encoded by a complex regulon in marine heterotrophic bacteria / Découverte de la voie catabolique complète des carraghénanes chez les bactéries marine

Carrageenan catabolism is encoded by a complex regulon in marine heterotrophic bacteria / Découverte de la voie catabolique complète des carraghénanes chez les bactéries marine | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Un consortium international coordonné par l’équipe Glycobiologie Marine (UMR 8227 – CNRS / UPMC) et impliquant deux équipes de l'UPSaclay vient de publier dans Nature Communications la découverte chez les bactéries marines du système complet d’utilisation des carraghénanes, polysaccharides sulfatés majeurs des macroalgues rouges. Par une combinaison d’approches biochimique, cristallographique, transcriptomique, génétique et bioinformatique, ce système biologique complexe a été caractérisé à une échelle d’intégration inédite à ce jour en biologie marine. C’est une avancée majeure dans la compréhension des mécanismes moléculaires gouvernant le cycle du carbone dans les écosystèmes côtiers. C’est aussi une percée pour la biotechnologie bleue et notamment la valorisation de la biomasse algale. 


Les carraghénanes sont les composants majeurs de la paroi des macroalgues rouges. Ces polysaccharides sulfatés sont largement utilisés depuis plus de 70 ans dans diverses industries pour leurs propriétés gélifiantes et texturantes. Les carraghénanes et leurs oligosaccharides dérivés ont également de nombreuses propriétés biologiques prometteuses (antiviral, anticoagulant, immunomodulateur, etc). Au plan écologique, ces polymères constituent une énorme source de nutriments dans les écosystèmes côtiers, notamment pour les bactéries marines hétérotrophes qui sont les acteurs clés du recyclage de la matière organique dans les océans. Mais les mécanismes de dégradation microbienne des polysaccharides d’algues restent largement méconnus. 


Dans ce contexte un consortium international, coordonné par l’équipe Glycobiologie Marine (UMR 8227) et impliquant des équipes de l’INRA, du CEA-Genoscope-UMR8030, et deux équipes américaine et australienne, viennent de publier la découverte de la voie catabolique complète des carraghénanes chez la bactérie marine modèle Zobellia galactanivorans. Par une combinaison d’approches biochimique, cristallographique, transcriptomique, génétique et bioinformatique, ce système biologique complexe a été caractérisé à un niveau d’intégration inédit à ce jour en biologie marine. Les fonctions de pas moins de 17 nouvelles protéines ont été ainsi résolues au cours de ce travail homérique. Cet article a permis aussi d’amender la notion de « Locus d’Utilisation de Polysaccharides" (PUL en anglais). Ce dernier résultat a une portée générale, l’étude des PULs étant devenue un sujet brulant ces dernières années aussi bien dans le domaine biomédical qu’en phytopathologie. 


 Référence Ficko-Blean E, Préchoux A, Thomas F, Rochat T, Larocque R, Zhu Y, Stam M, Génicot S, Jam M, Calteau A, Viart B, Ropartz D, Perez-Pascual D, Correc G, Matard M, Stubbs KA, Rogniaux H, Jeudy A, Barbeyron T, Médigue C, Czjzek M, Vallenet D, McBride MJ, Duchaud E, & Michel G (2017) Carrageenan catabolism is encoded by a complex regulon in marine heterotrophic bacteria. Nature Communications, 8, 1685. doi:10.1038/s41467-017-01832-6 


Contact Gurvan MICHEL, Tel : 02 98 29 23 30 ; courriel : gurvan.michel@sb-roscoff.fr 



Nature Communications : https://www.nature.com/articles/s41467-017-01832-6 ;


Commentaire dans Nature Microbiology : (« behind the paper ») : https://naturemicrobiologycommunity.nature.com/users/68108-elizabeth-ficko-blean/posts/22214-perseverance-pays-off

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November 29, 2017 4:33 PM
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La génétique pour sélectionner les chevaux de compétition | Université Paris Saclay

La génétique pour sélectionner les chevaux de compétition | Université Paris Saclay | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le Salon du Cheval attire chaque année des milliers de curieux. En France, les courses hippiques représentent un chiffre d’affaires de près de 11 milliards d’euros. On imagine bien que savoir sélectionner les chevaux les plus performants pour les courses de trot, le saut d’obstacles ou encore le dressage est crucial. Les chercheurs de l’Université Paris-Saclay apportent des outils pour que les éleveurs choisissent au mieux leurs poulinières et leurs étalons pour faire naître les chevaux les plus adaptés à chaque compétition. « Pour prédire la performance d’un poulain, nous nous reposons sur des fichiers où sont inscrits les qualités des parents : en premier lieu leurs performances en course ou compétition, sa morphologie, mais aussi son "allure" : la longueur de sa foulée au trot ou au galop, sa cadence, ses accélérations, indique Anne Ricard, chercheuse au laboratoire de génétique animale et biologie intégrative à l’INRA de Jouy-en-Josas, membre de l’Université Paris-Saclay. Puis je compare ces données avec les données généalogiques sur plusieurs générations, ainsi qu'aux données génétiques. »

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November 29, 2017 12:32 PM
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Trois chercheurs de l'UPSaclay lauréats ERC Consolidator Grant 2017 dans le domaine SDV

Trois chercheurs de l'UPSaclay lauréats ERC Consolidator Grant 2017 dans le domaine SDV | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
L'ERC a annoncé ce 28 novembre 2017 les noms des 329 lauréats, dont 38 français, retenus dans le cadre du second tour de l'appel "Consolidator 2017". Parmi ceux-ci, trois lauréats du département SDV de l'UPSaclay :

- Rut CARBALLIDO-LOPEZ (LS3), chercheuse à l'Institut Micalis (UMR 1319, équipe ProCeD, INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, 78350 Jouy-en-Josas) dont le projet est intitulé "BACTIN : Shaping the bacterial cell wall: the actin-like cytoskeleton, from single molecules to morphogenesis and antimicrobials".
Contact : rut.carballido-lopez@inra.fr

- Brice BATHELIER (LS5), chercheur dans l'Unité Neuroscience Information et Complexité ( Laboratoire UNIC, Institut des Neurosciences Paris-Saclay, Gif sur Yvette), dont le projet est intitulé "DEEPEN : Deciphering deep architectures underlying structured perception in auditory networks" (Budget: 1980 k€). Ce projet vise à extraire de manière générique les principes computationnels du système auditif de la souris en combinant des techniques d'imagerie deux-photon à haut-débit, de manipulation optogénétique de la connectivité neuronale et de modélisation par des réseaux profonds.
Contact : brice.bathellier@unic.cnrs-gif.fr

- Julien NICOLAS (LS7) (Département CHIMIE et SDV), chercheur à l'Institut Galien Paris-Sud (Faculté de Pharmacie, UMR 8612 CNRS/UPSud, Châtenay-Malabry) dont le projet est intitulé "Nanoassemblies for the subcutaneous self-administration of anticancer drugs".

Contact : julien.nicolas@u-psud.fr

Félicitations à nos trois lauréats !
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November 30, 2017 6:34 AM
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Gabriel Perlemuter sur France Inter à l’occasion des États généraux de l’alimentation

Gabriel Perlemuter sur France Inter à l’occasion des États généraux de l’alimentation | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
A l’occasion des Etats généraux de l’alimentation, Gabriel Perlemuter (Professeur en hépato-gastroentérologie à l'université Paris-Sud/Paris-Saclay, responsable du service d'hépato-gastroentérologie et nutrition à l'hôpital Antoine-Béclère (Clamart) et d'une équipe Inserm, labellisée par la fondation pour la recherche médicale (FRM), intitulée "Microbiote intestinal, macrophages et inflammation hépatique" au sein de l'UMR-S 996) a été l'invité de France Inter ce matin, dans l'émission "Grand bien vous fasse !" d'Ali Rebeihi consacrée à "Pourquoi mangeons-nous autant de plats industriels (et pourquoi il faut en consommer beaucoup moins)?".
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December 2, 2017 2:41 PM
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Convention annuelle de l'Académie des technologies: discours de clôture de Frédérique Vidal

Convention annuelle de l'Académie des technologies: discours de clôture de Frédérique Vidal | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

"L'agroalimentaire est le premier secteur économique français avec un chiffre d'affaires de 172 milliards d'euros. Il est l’employeur industriel de plus de 427 000 salariés. Exportateur net, le secteur est cependant soumis à une concurrence internationale féroce et est donc face à une ardente obligation d’innover"...


"Les biotechnologies sont des parties prenantes naturelles de ces évolutions, il faut évaluer leurs apports potentiels et progresser sur la réflexion de leur place dans le concert des technologies, et j’y reviendrai"...


"Entre l’aventure scientifique des chercheurs et les aventures entrepreneuriales que vous menez à la tête de vos start-ups, de vos P.M.E., de vos grands groupes, il y a, pour moi, des résonances évidentes : l’audace, la créativité, l’agilité, la ténacité, sont des valeurs que vous partagez. Voilà un état d’esprit commun qui plaide en faveur d’un dialogue nourri et d’une multiplication des initiatives entre la recherche et l’innovation"...


"La recherche est parfois prisonnière de craintes et de défiances qui freinent son développement. Les biotechnologies souffrent notamment de fortes réticences liées à la manipulation du vivant. Bien sûr, notre histoire des idées s’est construire sur le doute, érigé en méthode par Descartes. Mais il s’agit d’un doute fondé en raison, et non motivé par la peur"  L’Académie des technologies nous alerte sur le retard français en matière de technologies d’édition du génome et sur le fait que certains cadres réglementaires actuels sont des freins. A l’heure où les technologies évoluent de plus en plus vite, il convient comme l’a dit le Président de la République d’en finir avec l’idée que le principe de précaution entrave l’innovation : l’enjeu est bien d’être capable de produire suffisamment vite et clairement des avis de référence, appuyés sur des résultats scientifiques avérés, permettant d’éclairer la prise de décision publique, et in fine de prendre des décisions. A cet égard, je voudrais souligner que votre recommandation que soit systématiquement évaluées les conséquences d’une décision négative et non plus seulement l’impact d’une décision positive, me paraît une approche particulièrement intéressante. Et naturellement, je m’attacherai à ce que la recherche, tout en évoluant dans un cadre éthique, conjugue principe de précaution et principe d’action. 


" C’est précisément le rôle de la science de distinguer les fantasmes irrationnels des alarmes légitimes. Et c’est cette responsabilité que l’Académie assume auprès des pouvoirs publics et des plus hautes autorités nationales, mais aussi européennes. La Commission européenne a en effet fait appel aux académies pour asseoir ses décisions sur un socle de connaissances objectives en matière scientifique et technologique. Cette volonté de consolider son action en l’adossant au savoir rappelle combien la science est et doit continuer à être une boussole en pleine tempête intellectuelle et morale, c’est-à-dire lorsque le citoyen ne sait plus discerner les opinions, les croyances et les connaissances. Mais cette nécessité d’un contrepoids nous renseigne aussi sur la puissance de la vague de fausses informations qui, via la toile, déferle sur le grand public. Car l’ère du soupçon semble avoir pris le pas sur le positivisme et la confiance". 


"Il est donc urgent de restaurer le pacte de confiance entre la science et la société en revivifiant notre vision du progrès. C’est tout à fait le sens de la devise de l’Académie des technologies qui œuvre pour un progrès raisonné, choisi et partagé. Il ne s’agit pas d’un progrès aveugle et effréné, mais d’un progrès éclairé et orienté : éclairé par une réflexion collective qui convoque tous les points de vue, orienté par des valeurs partagées. Le progrès au 21ème siècle n’est ni le retour à un âge d’or disparu, ni une utopie figée dans un horizon inaccessible. C’est un projet de société, toujours en mouvement, évolutif, dynamique, qui se réinvente en permanence au fil des découvertes, des opportunités, et des renoncements. Le progrès n’a pas vocation à rejoindre un idéal qui lui préexisterait : ce sont les actes que nous posons chaque jour, ce que nous entreprenons collectivement, les choix que nous opérons ensemble qui lui donnent son vrai visage"...


Via Saclay Plant Sciences
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December 1, 2017 3:57 AM
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Fonds de dotation CSL Behring pour la recherche en immunologie et en hémostase

Fonds de dotation CSL Behring pour la recherche  en immunologie et en hémostase | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Le laboratoire CSL Behring, spécialiste des biothérapies dédiées à la prise en charge des patients atteints de maladies rares, lance un appel à projets de recherche en immunologie et en hémostase. Pour son 2ème appel à projets, le Fonds de dotation attribuera en 2018, 4 Bourses de recherche et 1 mobilité internationale, soit : 1 à 3 bourse(s) de recherche en immunologie, 1 à 3 bourse(s) de recherche en hémostase, 1 bourse de mobilité en Immunologie ou en Hémostase.


Date limite de candidature : 31 janvier 2018.

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November 30, 2017 1:13 PM
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Appel à candidature : Grand prix scientifique de la fondation Simone et Cino del Duca de l'Institut de France 2018 - Mécanismes de résistance et adaptation au stress

Appel à candidature : Grand prix scientifique de la fondation Simone et Cino del Duca de l'Institut de France 2018 - Mécanismes de résistance et adaptation au stress | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
La Fondation Simone et Cino Del Duca de l’Institut de France décerne chaque année alternativement au titre des disciplines relevant des deux divisions de l’Académie des sciences sur proposition du jury constitué de membres de l’Académie des sciences, un grand prix scientifique. Celui-ci récompense un chercheur français ou européen et son équipe, présentant un projet de recherche ambitieux sur un thème prometteur.

En 2018, le thème retenu est : Mécanismes de résistance et adaptation au stress.

Le Grand Prix est doté de la façon suivante :

a) 200 000 euros (part recherche) servent à financer les travaux de l’équipe de recherche lauréate et sont versés à l’entité administrative de référence.
b) 25 000 euros (part perso) récompensent le responsable de l’équipe de recherche.
c) 50 000 euros (part post-doc), somme maximale versée sur justificatifs, permettent le recrutement contractuel d’un post-doctorant français ou étranger sélectionné par le responsable de l’équipe, dans les deux années suivant la remise du prix.

Les dossiers de candidature doivent être déposés en ligne au plus tard le vendredi 12 janvier 2018 avant minuit.
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November 29, 2017 4:30 PM
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Un master sur les agents infectieux à l'Université Paris Saclay

Un master sur les agents infectieux à l'Université Paris Saclay | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les virus et autres agents infectieux peuvent trembler : les futurs chercheurs et chercheuses chargés de les éradiquer se forment au master-2  Agents infectieux - interaction avec leurs hôtes et l'environnement (A2I) de l’université Paris-Saclay. Le premier semestre vise à donner aux étudiants des bases solides en bactériologie, virologie et parasitologie, ainsi que dans le domaine de l’épidémiologie des maladies infectieuses.

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November 28, 2017 5:18 AM
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Université Paris-Saclay, laboratoire et moteur pour l’enseignement supérieur

Université Paris-Saclay, laboratoire et moteur pour l’enseignement supérieur | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Université Paris-Saclay, laboratoire et moteur pour l’enseignement supérieur


Concilier enseignement d’excellence et formation de masse – ou, si l’on préfère, sélectivité et accès ouvert à un public large : tel est sans doute, depuis des décennies, le défi majeur auquel est confronté notre enseignement supérieur. Il est consubstantiel, notamment, au système « dual » français, avec ses universités et ses grandes écoles – même si ces deux familles ne sont pas si différentes qu’on le croit parfois : l’excellence est très présente à l’université, et les grandes écoles sont loin d’être étrangères aux préoccupations d’ouverture au plus grand nombre et de diversité sociale.

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November 28, 2017 4:53 AM
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Journée MaDICS-ReproVirtuFlow 2017, dédiée à la reproductibilité des analyses de données bioinformatiques, 12 décembre, Gif.

Journée MaDICS-ReproVirtuFlow 2017, dédiée à la reproductibilité des analyses de données bioinformatiques, 12 décembre, Gif. | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Journée MaDICS-ReproVirtuFlow 2017
12 décembre 2017

Amphithéatre du bâtiment 21, Campus CNRS, Gif-sur-Yvette

Plan d’accès

Contexte

L’objectif de cette journée est de présenter les activités de l’action ReproVirtuFlow, fondée et soutenue par le GDR MaDICS, qui s’intéresse à la problématique de reproductibilité computationnelle. La journée comportera une session dédiée à la présentation du premier ReproHackathon organisé par notre groupe, ainsi que des sessions décrivants des éléments de solutions et des retours d’expériences autour de la problématique de reproductibilité computationnelle.

Programme (provisoire)

9h30 : Café de Bienvenue

10h00 : Sarah Cohen-Boulakia : Présentation de l’Action et Bilan.

10h30 : Retour sur le ReproHackathon
Frédéric Lemoine : Présentation du pipeline d’analyse et des données, tâches à effectuer par les participants et synthèse des résultats obtenus.
Christophe Blanchet : Le Cloud de l’IFB comme support du ReproHackathon, et les environnements virtuels mis à disposition.
Philippe Veber : Reproduction de l’analyse RNA-seq avec bistro, une bibliothèque OCaml pour le développement de pipelines bioinformatiques.
12h00 : Repas

13h30 : Approches émergentes
Christophe Pradal : La reproductibilité des expériences en phénotypage haut-débit des plantes.
Konrad Hinsen : La reproductibilité des calculs numériques en HPC : problèmes et solutions existantes.
Alban Gaignard : Harmonisation de traces de provenance (ESWC workshop).
15h00 : Pause

15h30 : Discussion
S. Cohen-Boulakia, C. Blanchet : présentation des futures actions du groupe, appel à participation.
16h30 : Clôture de la journée
La journée ReproVirtuFlow 2017 est soutenue par le GDR MaDICS, par le groupe Psay CompBio de l’Université Paris-Saclay et par l’Institut Français de Bioinformatique.

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November 20, 2017 12:38 PM
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Lauriers de l'INRA 2017, des Saclaysiens récompensés pour leurs travaux : Joël Doré (Laurier d’Excellence) et  Florian Maumus (Laurier Espoir scientifique)

Lauriers de l'INRA 2017, des Saclaysiens récompensés pour leurs travaux : Joël Doré (Laurier d’Excellence) et  Florian Maumus (Laurier Espoir scientifique) | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Joël Doré, quand la science rencontre l’innovation. Un chercheur passionné fait tomber les idées reçues sur les microbes de notre corps. Projecteur sur le lauréat du Laurier d’excellence 2017, Joël Doré, directeur de recherche à l’unité Micalis et directeur scientifique de l’unité MétaGénoPolis au centre Inra Île-de-France – Jouy-en-Josas.

Florian Maumus, du jardin au laboratoire. À la découverte du jardin extraordinaire de Florian Maumus, bioinformaticien passionné de plantes et de génomique. Chercheur dans l’unité Génomique-Info au centre Inra Île-de-France – Versailles-Grignon, il reçoit le Laurier Espoir scientifique 2017.
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November 20, 2017 6:08 PM
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Des cellules souches neurales d’activité continue génèrent une organisation en couche du télencéphale dorsal chez les téléostéens

Des cellules souches neurales d’activité continue génèrent une organisation en couche du télencéphale dorsal chez les téléostéens | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Les cellules souches neurales contribuent à générer les neurones du cerveau des vertébrés, et le contrôle spatio-temporel de leur activité influe sur l’architecture des structures cérébrales. Cette architecture est spécifique de l’espèce. Dans le cortex des mammifères, par exemple, l’activité neurogénique continue de chaque cellule souche au cours du développement embryonnaire produit des neurones empilés en couches successives. Dans le cortex des oiseaux, une activité neurogénique par période et régionalisée a été décrite au sein de la population de cellules souches, conduisant plutôt à la formation de noyaux de neurones. La divergence de ces deux modèles rend difficile la formulation d’hypothèses quant au profil vertébré « ancestral » d’activité des cellules souches neurales et à l’architecture corticale correspondante. Dans un article paru le 06 novembre 2017 dans le journal Current Biology, L. Bally-Cuif, I. Foucher et leur équipe, de l’Institut Pasteur (UMR CNRS-Pasteur) et Institut NeuroPSI (UMR CNRS-UPSud), en collaboration avec l’équipe d’E. Beaurepaire (LOB, CNRS et Ecole Polytechnique, Palaiseau), ont décrypté le profil spatio-temporel d’activation des cellules souches neurales d’un poisson téléostéen, le zebrafish, et son impact direct sur l’architecture corticale. A l’aide de techniques de traçage génétique de l’origine et de la date de naissance des neurones du télencéphale dorsal (pallium), et grâce au suivi, par la technique « brainbow », de clones issus de cellules souches uniques, ces équipes ont démontré que des cellules souches individuelles étaient capables d’activité neurogénique continue sur toute la durée de vie de l’animal, générant des couches successives de neurones qui s’empilent par date de naissance. Ainsi, grâce à l’activité continue de ses cellules souches, le cortex des téléostéens se construit par « empilement » progressif et croit sans interruption à la manière d’un arbre. La simplicité de ce mode de formation suggère qu’il pourrait représenter un modèle ancestral à partir duquel ont pu évoluer les mécanismes de structuration du cortex des mammifères et des oiseaux (notamment par limitation temporelle de l’activité des cellules souches à la période embryonnaire, et, chez les oiseaux, par l’ajout supplémentaire d’une limitation spatiale).

Contact : laure.bally-cuif@pasteur.fr
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November 22, 2017 8:03 AM
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MODELE D’UNIVERSITE CIBLE PARIS-SACLAY, le pdf

MODELE  D’UNIVERSITE CIBLE PARIS-SACLAY, le pdf | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
télécharger à https://share.universite-paris-saclay.fr/index.php/s/Yu2fashjkCaNkSu

Le présent document décrit le projet d’évolution de la ComUE « Université Paris-Saclay » vers une université de plein exercice qui en conserve la marque : l’Université Paris-Saclay. Cette Université est intensive en recherche et a vocation à être classée dans le top 20 mondial ; elle répond aux aspirations des étudiants en termes d’offres diversifiées et personnalisées de parcours de formation et à celles des entreprises en termes de qualification, d’employabilité et d’innovation. Ce document rappelle le contexte et l’environnement de ce projet, décrit son ambition et la vision qui le porte, ainsi que les valeurs et principes qui sous-tendent sa mise en œuvre. La stratégie à suivre pour atteindre l’ambition est ensuite développée. Ce document sera soumis à la gouvernance de la ComUE « Université Paris-Saclay » et de ses établissements membres pour motiver les décisions d’engagement des instances délibérantes en amont de la remise du rapport d’évaluation de l’IDEX (18 décembre 2017). L’annonce par le Président de la République, le 25 octobre 2017, de la création d’un deuxième pôle enseignement supérieur et recherche sur le territoire Paris-Saclay a conduit à supposer dans ce document que le périmètre de l’Université Paris-Saclay cible impliquera les trois universités (Paris-Sud, Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines, Evry-Val-d’Essonne), 5 écoles (CentraleSupélec, ENS Paris-Saclay, IOGS, AgroParisTech, HEC), l'IHES et les 6 organismes de recherches (CNRS, CEA, INRA, INSERM, INRIA et Onera).
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November 27, 2017 6:30 AM
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Big data and the industrialization of neuroscience: A safe roadmap for understanding the brain?

Big data and the industrialization of neuroscience: A safe roadmap for understanding the brain? | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
"Science" magazine has recently published a special issue on "innovative challenges in neuroscience" with two contributions of scientists from the Paris-Saclay area.

New technologies in neuroscience generate reams of data at an exponentially increasing rate, spurring the design of very-large-scale data-mining initiatives. Several supranational ventures are contemplating the possibility of achieving, within the next decade(s), full simulation of the human brain.

In his "opinion paper" on "Big Data and Industrialization of Neuroscience", Yves Fregnac (CNRS-UNIC) questions the scientific and strategic underpinnings of the runaway enthusiasm for industrial-scale projects at the interface between “wet” (biology) and “hard” (physics, microelectronics and computer science).

His review focuses on three major issues: (i) Is the industrialization of neuroscience the soundest way to achieve substantial progress in knowledge about the brain? (ii) Do we have a safe “roadmap,” based on a scientific consensus? (iii) Do these large-scale approaches guarantee that we will reach a better understanding of the brain?

Contact : fregnac@inaf.cnrs-gif.fr
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December 1, 2017 6:50 AM
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Two interacting PPR proteins are major Arabidopsis editing factors in plastid and mitochondria

Two interacting PPR proteins are major Arabidopsis editing factors in plastid and mitochondria | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Dans un article récemment publié dans la revue PNAS, l’équipe de Claire Lurin à l'IPS2 (Institute of Plant Sciences - Paris Saclay University) révèle qu’un complexe de trois protéines PPR au moins est nécessaire à l’édition de dizaines de sites dans les ARN mitochondriaux et chloroplastiques des végétaux supérieurs.

L’édition des ARN des organites chez les végétaux convertit des centaines de cytosines spécifiques en uridines. Depuis sa découverte, cette modification post-transcriptionnelle est restée très énigmatique. De nombreuses protéines, et en particulier les protéines PPR, sont maintenant connues comme nécessaires pour l’édition. Dans ce travail, nous montrons que les membres d’une sous-famille de protéines PPR (environ 60 protéines) nécessitent une coopération avec 2 autres protéines de la famille pour former des complexes d’au moins 3 protéines PPR impliqués dans l’édition. Nos résultats s’appuient sur une analyse de génétique inverse originale couplée à une analyse fine en RNAseq du transcriptome des organites. Sur cette base, nous cherchons maintenant à identifier les pièces manquantes de l’éditosome grâce à l’identification de régulateurs et à comprendre comment l’édition des ARN des chloroplastes pourrait impacter la régulation d’un complexe photosynthétique.

Contact : claire.lurin@inra.fr
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November 29, 2017 4:18 PM
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Recherche en éducation : M. Blanquer joue la carte des neurosciences

Recherche en éducation : M. Blanquer joue la carte des neurosciences | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Stanislas Dehaene, Professeur au Collège de France, Directeur de l’unité « Cognitive Neuroimaging » INSERM-CEA-University Paris Saclay et de Neurospin, est nommé à la présidence d’un nouveau Conseil scientifique de l’éducation nationale par Jean-Michel Blanquer, ministre de l’éducation.

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December 1, 2017 5:11 AM
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Fondation Simone et Cino Del Duca - Appel à candidature 2018 pour trois subventions scientifiques en chimie, biologie et sciences médicales

Fondation Simone et Cino Del Duca - Appel à candidature 2018 pour trois subventions scientifiques en chimie, biologie et sciences médicales | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
La Fondation Simone et Cino Del Duca de l’Institut de France décernera en 2018, sur proposition d’un jury constitué de membres de l’Académie des sciences, trois subventions distinctes, d'un montant global de 125 000 € (75 000 € + 50 000 €) chacune, destinées à de jeunes équipes françaises, le chef d’équipe devant être âgé de moins de 45 ans (dans l’année d’attribution du prix), conduisant des projets de recherche dans les domaines suivants :

« Chimie ; Biologie moléculaire et cellulaire, génomique ; Biologie intégrative ; Biologie humaine et sciences médicales »

Les dossiers de candidature devront être déposés en ligne, au plus tard le vendredi 12 janvier 2018 avant minuit.
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November 29, 2017 4:41 PM
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SAVE THE DATE: Journée Genopole "Etudiant - Entrepreneur" - 18 Janvier 2018

SAVE THE DATE: Journée Genopole "Etudiant - Entrepreneur" - 18 Janvier 2018 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Des étudiants, doctorants, thésards, jeunes ingénieurs… peuvent avoir développé au cours de leurs études un concept innovant dans le domaine des biotechnologies (santé, environnement, agritech, foodtech, industrie). Mais arrivés en fin de cursus, sans lieu d’expérimentations à leur disposition, certains se trouvent dans l’incapacité d’approfondir leur projet. Toutes ces pépites en devenir, Genopole va : - les placer en immersion dans un écosystème biotech stimulant où se côtoient plus de 2 300 personnes salariées d’entreprises et de laboratoires académiques de renom - les guider sur le chemin de la création d’entreprise. Le Shaker est le premier Laboratoire exclusivement biotech en Ile-de-France : pour les jeunes porteurs de projets innovants, c’est un sésame qui leur ouvre les portes d’un laboratoire de recherche et l’accès à tout l’écosystème scientifique et technologique génopolitain avec l’appui d’une équipe de chargés d’affaires de Genopole Entreprises. Le Shaker, c’est aussi une sensibilisation à l’entrepreneuriat pour de jeunes diplômés le plus souvent éloignés des codes de l’entreprise : sept jours d’initiation leur sont offerts pour se familiariser avec les aspects économiques de la création d’entreprise, les sources possibles de financement, les questions juridiques et réglementaires, les aspects communication …
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December 3, 2017 6:16 PM
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EuroNanoMed : appel transnational

EuroNanoMed : appel transnational | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Joint Transnational Call for Proposals (2018) for “European Innovative Research & Technological Development Projects in Nanomedicine”

EuroNanoMed (ENM) is an ERA-NET on Nanomedicine established since 2008 as a platform for funding agencies and ministries to coordinate research and innovation programmes with the goal of creating and funding collaborative research and innovation projects that can convert research in nanotechnology into practical gains in medicine. Through 8 successful Joint Transnational Calls launched from 2009 to 2017, EuroNanoMed has allocated about 67 Million euros to fund 76 transnational projects in nanomedicine.

Under the umbrella of EuroNanoMed III, the 9th Joint Transnational Call will be launched for funding multilateral innovative research projects on nanomedicine. Opening of the submission system: 14th December 2017 Submission deadline for pre-proposals: 16th January 2018 Submission deadline of full proposals: 30th May 2018.
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December 1, 2017 11:28 AM
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3 Appel à projets du DIM 1Health

3 Appel à projets du DIM 1Health | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Le domaine d'intérêt majeur (DIM) 1HEALTH a pour objectif de faire émerger un réseau fort en infectiologie « One Health » unique en France et de dimension européenne, qui permette de répondre aux défis en santé publique. Il a en particulier pour objectif le développement de nouveaux concepts, notamment en vaccinologie, thérapie anti-infectieuse, diagnostic et l’intégration d’une dimension sociale et économique à la santé.

Le DIM 1HEALTH Lance aujourd'hui 3 appels d'offres :
- AAP PROJET COLLABORATIF
- AAP EQUIPEMENT
- AAP MANIFESTATIONS SCIENTIFIQUES

La date de clôture pour cet appel à projets est le 30 janvier 2018 à minuit.
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November 28, 2017 5:21 AM
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L'université Paris-Saclay a sa feuille de route

L’université Paris-Saclay a sa feuille de route
Par Julien Monier mardi 28 novembre 2017 à 03:23 (Mise à jour mardi 28 novembre 2017 à 08:41)

L'université Paris-Sud, ex-Paris 11 Orsay, se transformerait en l'université Paris-Saclay au 1er janvier 2020 (JM/EI)Une université de plein exercice en 2020, ayant vocation à figurer dans le top 20 du classement de Shanghaï : c’est la trajectoire posée pour Paris-Saclay avant le dépôt de son dossier auprès du jury international de l’Idex.

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November 28, 2017 5:06 AM
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Vote et avis favorables du CAc de l'UPSaclay sur le projet IDEX

Bonjour J'ai le plaisir de porter à votre connaissance deux délibérations importantes récentes du Conseil Académique relatives au projet IDEX.

 1) Avant cela, voici le lien où vous pourrez lire ce projet , au cas où il ne vous aurait pas été communiqué https://indico.lal.in2p3.fr/event/4679/contributions/15312/attachments/12591/14941/MODELE_UNIVERSITE-CIBLE_UPSACLAY-21nov.2017.pdf

 2) Le Conseil Académique a été invité par le Président de l'Université Paris- Saclay à rendre un avis sur ce texte. Comme il s'agit d'une version figée envoyée à l'identique à l'ensemble des Membres de la COMUE pour délibération lors de leur Conseil d'Administration, le Conseil Académique procède alors de la façon suivante : une analyse contenant les points poitifs et négatifs du texte proposé est présentée et débattue, Cette discussion est suivie d'un vote concernant un avis favorable ou non au texte proposé, L'analyse enrichie par les débats en séance et précédée d'une synthèse est alors proposée à un deuxème vote en vue de son adoption. 

3) les résultats sont donc les suivants: 3.1 "Le Conseil Acdadémique a donné un avis favorable au projet IDEX (58 voix pour, 22 voix contre, 22 abstentions)" 3.2 Le Conseil Académique a adopté la synthèse et l'analyse disponible sur https://indico.lal.in2p3.fr/event/4679/contributions/15312/attachments/12591/14945/Projet_Idex_final_final_002.pdf par 86 voix pour, 22 voix contre et 16 abstentions. 

 4) Ces résultats et recommandations ont été transmises à la présidence de l'Université de l'Université paris-Saclay, à son Conseil d'Administration , au conseil des Membres et aux autres instances de l' Université. N'hésitez pas à les diffuser autour de vous, si vous le jugez utile. 

 5) Je remarque pour ma part avec satisfaction que le taux global de soutien du Conseil Académique à la future Université Paris-Saclay est très voisin de celui enregistré lors de notre sondage à grande échelle de début 2017. Le Conseil Académique est donc en bonne phase avec la communauté qu'il représente. 

 Bien amicalement Guy Wormser Président du Conseil Académique de l'Université Paris-Saclay 

 PS Suite à la consultation des différents Conseils d'Administration des Membres de la COMUE, il sera possible à la fin de l'année de faire la liste exacte des porteurs de ce projet IDEX. Le Conseil Académique restera quant à lui avec l'ensemble de ses membres actuels, participant ou non à ce projet, l'instance formelle de l'actuelle COMUE et assumera ces fonctions jusqu'à la fin de son mandat (été 2019) ou jusqu'à la dissolution de la COMUE si celle-ci devait précéder cette date. Le Conseil académique en tant que tel ne sera pas une instance délibérative de la phase intérimaire du projet IDEX ou de tout autre projet ne relevant pas de la COMUE.
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November 24, 2017 6:12 PM
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Hadia Moindjie lauréate du Prix Kerner de la fondation ARC

Hadia Moindjie lauréate du Prix Kerner de la fondation ARC | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Hadia Moindjie, post-doctorante dans l'équipe "Microtubules et cancer" dirigée par Clara Nahmias au sein de l'UMR-S 981 (INSERM/UPSud/Gustave Roussy, Villejuif, Direcetur Fabrice André), est lauréate du Prix Kerner qui récompense un effort de vulgarisation scientifique. Le prix Kerner est attribué par un jury de journalistes présidé cette année par Hugo Jalinière, de Sciences et Avenir, aux meilleurs articles de vulgarisation scientifique. Titre de son article : "Trafic intracellulaire : journée noire pour les cellules cancéreuses". Le prix lui a été remis le vendredi 17 novembre 2017 au cours de la 21eme Journée des Jeunes Chercheurs (JJC) de la fondation ARC.

Toutes nos félicitations !
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November 22, 2017 11:47 AM
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Senescence is a Spi1-induced anti-proliferative mechanism that limits leukemic transformation

Senescence is a Spi1-induced anti-proliferative mechanism that limits leukemic transformation | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Increasing evidence points to a critical role for cellular senescence as a barrier to malignant transformation. This tumor suppressive mechanism is activated when cells are exposed to exogenous or endogenous stresses such as oncogenic signaling. Oncogene-induced senescence (OIS) is an early mechanism that limits cell hyper-proliferation through a stable cell cycle arrest process, thus blocking the expansion of cells at the pre-cancerous stage in solid tumors. Although the role of OIS protecting against the progression of solid tumorigenesis is now well characterized, the role of OIS in primary hematopoietic cells and its protective effect against leukemic processes have yet to be fully explained.

In an article published in Haematologica, Christel Guillouf and her colleagues from Institut Gustave Roussy (UMR-S 1170 INSERM/UPSud, Villejuif) explored cellular senescence induced by a major transcription factor of hematopoiesis, called Spi1/PU.1. Using in vitro and in vivo experiments, they show that 1) Spi1 triggers cellular senescence both in primary fibroblasts and several types of hematopoietic cells; 2) The mechanistic underpinnings of this response are distinct for the two cell types; 3) Early response to Spi1 activation in hematopoietic progenitors of Spi1 transgenic mice is the anti-proliferative senescence program; 4) Later on, in older mice, this process is lost and leukemia progresses towards a full malignancy. This work reveals senescence as a Spi1-induced anti-proliferative mechanism that may be a safeguard against the development of acute leukemia.

Contact : christel.guillouf@gustaveroussy.fr
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November 21, 2017 4:28 AM
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Evidence for rRNA 2′-O-methylation plasticity: Control of intrinsic translational capabilities of human ribosomes

Evidence for rRNA 2′-O-methylation plasticity: Control of intrinsic translational capabilities of human ribosomes | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Translational control is a cornerstone of gene-expression regulation in physiological and pathological contexts. The contribution of nonribosomal factors, including messenger RNAs (mRNAs) and mRNA-bound factors, to translational control have been extensively studied. Recently, the hypothesis of a ribosome-mediated regulation emerged, which proposes that cells produce ribosomes of different composition and displaying different translational properties. This work reveals that ribosomal RNA 2′-O-methylation can be modulated in human ribosomes, including at key functional sites for translation, and that changes in the 2′-O-methylation pattern control the intrinsic capabilities of ribosomes to translate mRNAs. This work directly demonstrates the existence of composition-modified ribosomes and their associated change in translational activity as conceptualized by the specialized ribosome concept.

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