Life Sciences Université Paris-Saclay

The second French congress on Integrative Structural Biology (BSI), jointly organized by the Association Française de Cristallographie (AFC) and the Société Française de Biophysique (SFB), will take place on the Paris-Saclay campus from November 29 to December 3, 2021. The scientific program is available on the congress website. The congress can also be followed on twitter (@bsi2021). Structural biologists and biophysicists from I2BC (@I2BCParisSaclay), together with ENS-Paris-Saclay, Soleil, Ecole Polytechnic and ICSN are local organizers of the BSI202.

Intervenants

Pr Jean-Christophe Thalabard

Professeur émérite à la faculté de santé de l’Université de Paris, membre du laboratoire MAP5, UMR CNRS 8145. Ingénieur de formation initiale, tourné vers les mathématiques appliquées et les statistiques, médecin AIHP, ancien CCA, il a pratiqué la gynécologie endocrinienne jusqu’en 2016 à l’APHP. Ses domaines de recherche ont concerné le contrôle neuro- hormonal de l’axe reproductif, avec une large part d’expérimentations animales, mais également les effets des expositions hormonales prolongées sur le risque de cancer du sein à travers de larges études épidémiologiques. Il s’est également largement investi dans le domaine de la méthodologie de la recherche clinique, à travers des activités d’enseignement, de participation à des protocoles d’essais et des nombreuses activités d’expertise notamment pour l’Inserm, l’APHP, l’IFSTTAR, l’ANSEM, la LNCC.

Comment fait-on preuve en médecine ?

Les essais cliniques entre régime de preuves et logique de soins.

Résumé : Dans sa représentation courante, la pratique médicale vise à répondre à une plainte d’un patient en lui proposant une démarche diagnostique débouchant sur une prise en charge thérapeutique « efficace » adaptée. Le but est d’aider le retour à un état de « bonne santé » ou, à défaut, à empêcher une majoration du désordre ayant motivé la plainte. Cette plainte initiale, qui ne se réduit pas qu’à un désordre patho- physiologique, peut même être absente lorsque nous rentrons dans le domaine de la prévention ou de la médecine de confort. Pour remplir sa fonction, le soignant va s’appuyer sur une « science médicale », domaine protéiforme qui tient autant des sciences biologiques que des sciences sociales avec ses théories et ses pré- supposés. Son objet d’étude est, certes, le vivant biologique avec toute sa large variabilité, mais surtout un vivant singulier, capable de ressentir, penser et verbaliser, avec toute la subjectivité des relations humaines au sein d’une société donnée. Qui plus est, et la période actuelle l’illustre bien, la maladie, en tant qu’entité nosologique, est une notion dynamique qui peut apparaître, évoluer, disparaître en fonction des périodes et des contextes. L’approche thérapeutique, parfois tâtonnante et largement dépendante du contexte de soin, aux rationalités mouvantes, peut être source d’espoirs et de déceptions. Pour le soignant, elle s’inscrit dans un contexte de prises de décisions successives sur des horizons variables portant tant sur le diagnostic probable, que sur les choix thérapeutiques voire, dans certaines situations, sur les objectifs à atteindre. La définition de l’efficacité thérapeutique s’est progressivement affinée au cours des siècles en se focalisant sur des critères quantitatifs bien identifiés permettant de l’inscrire dans une logique de preuve expérimentale (efficacy), dont un des paradigmes est bien la médecine factuelle (Evidence Based Medicine). Il peut être intéressant de s’interroger sur l’évolution et la perception de cette médecine reposant sur les preuves par rapport à son dessein originel, où la question de l’efficacité en situation réelle non expérimentale (effectiveness) était clairement posée. A travers la mise en place d’un cadre réglementaire, l’imposition d’un regard social sur les pratiques de recherche thérapeutique a profondément changé, dans un sens positif, le paysage, même si des efforts pour plus de transparence restent encore à faire. Il reste, et ce n’est pas le moindre des enjeux, à maintenir si ce n’est rétablir, la confiance entre soignants, soigné et son entourage, « placebo » nécessaire à toute forme d’efficacité.

Pr Elie Azria

Professeur de Gynécologie Obstétrique à l’Université de Paris, Chef de service de la maternité Notre Dame de Bon Secours du Groupe Hospitalier Paris Saint Joseph, Chercheur en épidémiologie au sein de l’équipe « Épidémiologie Obstétricale, Périnatale et Pédiatrique » (EPOPé) de l’UMR 1153, travaux orientés vers l’étude des mécanismes des inégalités sociales de santé maternelle et périnatale.

De la preuve clinique à la clinique de la preuve ou la logique évolutive de l'Evidence Based Medicine.

Résumé : La connaissance médicale, un des piliers centraux de la décision médicale, est quantitativement de plus en plus difficile à délimiter, elle est de plus qualitativement extrêmement hétérogène et d’une complexité croissante avec le temps. Un des enjeux, pour le clinicien de terrain comme pour le décideur de santé publique est de pouvoir s’y orienter et choisir dans cette somme de savoirs le plus pertinent à mobiliser pour le soin. La question « Qu’est ce qui fait preuve ? » est alors cruciale et c’est autour d’elle que s’est élaboré dans les décennies 80 et 90 le paradigme de l’Evidence Based Medicine (EBM). Basée sur une approche pédagogique, conférant à l’analyse critique du fait scientifique une place centrale, le paradigme a évolué et l’EBM est devenu le nom générique d’un système producteur et prescripteur de normes, qui par le biais de standardisation des pratiques a profondément transformé la place et le rôle du clinicien, ainsi que la relation de soin. Cette évolution qui a placé une ’’administration de la preuve’’ en surplomb de l’approche clinique, a contribué à rationaliser la pratique du soin. La nature conjecturale, limitée et provisoire de la connaissance sur la base de laquelle s’opère cette rationalisation amène à toutefois à questionner encore et toujours le rapport que la preuve issue de la recherche clinique entretien avec l’incertitude.

Organisatrice :

Annick Jacq

Directrice de recherche émérite au CNRS, microbiologiste et historienne des sciences, Unité de recherche « Etudes sur les Sciences et les Techniques » de la faculté des sciences d’Orsay de l’Université Paris-Saclay

Pour participer à la séance, merci de vous inscrire à l'adresse suivante (date limite 3 mai) : centre.dalembert@universite-paris-saclay.fr

Le lien de connexion vous sera transmis par mail la veille du séminaire.

Contacts et informations : centre.dalembert@universite-paris-saclay.fr et http://www.centre-dalembert.universite-paris-saclay.fr

Rejoignez les acteurs de l’Alliance d'universités européenne EUGLOH le 12 mai prochain pour une journée de festivités en ligne, autour d’une thématique d’actualité : explorer le monde avec les contraintes d’aujourd’hui.

Au programme : tables-rondes, interviews d’étudiants et staff sur les 5 campus, cours de cuisine en direct avec un grand chef, séance d’étirement inclusive, découvertes musicales, présentations sur l’interculturalité, résultats de 2 concours, et un quizz avant de finir la journée en musique !

Ce sera l’opportunité pour tous, étudiants et les personnels des 5 membres de l’alliance, d’échanger avec leurs homologues et collègues et découvrir l'alliance, ses campus et ses acteurs. Découvrez le programme ci-dessous et... inscrivez-vous !

Dans le cadre de l'accompagnement ERC-UPSaclay, deux sessions à destination des candidats du périmètre de l'Université Paris-Saclay (et de l'Institut Polytechnique de Paris) souhaitant postuler à l’appel ERC Advanced Grants 2021 (ou calls ultérieurs) est organisée les 4 et 5 mai 2021.

Ces sessions seront composées comme suit :

Une présentation générale de l'appel ERC Advanced Grant 2021 : le 4 mai (de 9h30-13h). L’objectif de cette session sera de présenter les critères d'évaluation, la procédure de soumission ainsi que les panels de la classification de l'ERC. Se tiendra également une table-ronde, à laquelle des experts, lauréats et chargés d’affaires Europe participeront. Ce moment d’échanges sera l’occasion pour vous de bénéficier de conseils de la part de différents acteurs, et de poser toutes vos questions.

Des conseils sur la rédaction d’une proposition lors d'un webinaire qui aura lieu le 5 mai ( de 9h30-13h). Ce webinaire aura pour objectif d'apporter des conseils et les meilleures pratiques pour préparer et optimiser votre candidature : parties B1 et B2. Un temps de questions/réponses est également prévu en fin de session.

Vous pourrez également bénéficier d’un entretien individuel d’une heure avec un de nos experts autour de votre idée de projet. Les entretiens auront lieu du 25 au 28 mai (ou à des dates ultérieures) et se feront par visioconférence. Merci d'indiquer dans la partie "commentaires" du formulaire si vous avez des disponibilités particulières pour le jour choisi (matin, après-midi,...).

A noter : si vous n’êtes pas disponible entre le 25 et 28 mai, vous pourrez bénéficier d’une session par Skype à une date ultérieure. Veillez à bien l’indiquer dans le formulaire d’inscription.

L’inscription est gratuite mais obligatoire, dans la limite des places disponibles. Attention, le webinaire ainsi que les entretiens individuels sont réservés aux chercheurs et enseignants-chercheurs faisant partie du périmètre de l'Université Paris-Saclay (ainsi que de l'Institut Polytechnique de Paris).

A noter : en raison de la situation liée au COVID-19, toutes les sessions se dérouleront en webinaire. Nous transmettrons le programme définitif ainsi que le lien pour vous connecter en ligne à l’ensemble des inscrits quelques jours avant la session.

Si vous avez des questions concernant l’organisation de ces journées, n’hésitez pas à contacter Izabela Faguet: izabela.faguet@universite-paris-saclay.fr

Le comité scientifique des prix Charles Oberling pour la recherche sur le cancer décerne un grand prix doté de 25 000 € à un chercheur ou une chercheuse de moins de 55 ans et un prix de thèse d'un montant de 5 000 €. 

Pour en savoir plus écrire à : jean.feunteun@gustaveroussy.fr. 

Date limite de candidature : 21 juin.

L’ANRS | Maladies infectieuses émergentes lance un second appel à projets Covid-19, dédié aux pays à revenus faibles et intermédiaires (LMIC). Cet appel cible exclusivement les projets de recherche en lien avec l’infection au coronavirus SARS-CoV-2, selon quatre axes de recherche prioritaires : 

• Dynamique de l’infection
• Impact de l’infection
• Accès aux vaccins
• Information & stratégies de communication

Les projets de recherche doivent obligatoirement impliquer une équipe française et une équipe d'un pays à revenus faibles et intermédiaires. D'autres équipes pourront être associées.

Date limite de candidature : 11 mai 2021 avant minuit
Communication des résultats définitifs : 15 juin 2021

Plus d'informations sur le site de l'ANRS

La Région Île-de-France organise la deuxième édition du "Prix des Innovateurs Île-de-France 2021". Cette démarche honore trois chercheurs et leurs équipes pour la qualité exceptionnelle de leurs travaux et leur impact dans le domaine de la santé.

Objectifs

Le "Prix des Innovateurs Île-de-France 2021" vise à mettre en lumière l’excellence des talents de son territoire et à encourager, soutenir et valoriser la recherche, le transfert de technologie et l’émergence d’innovation en santé.

Publics

Cet appel à candidatures s’adresse aux chercheurs, cliniciens, ingénieurs de recherche et à leurs équipes,  rattachés à des établissements publics ou privés à but non lucratif localisés en Île-de France, dont les travaux ont contribué ou visent à permettre l’introduction sur le marché d’une innovation en santé remarquable par sa nature ou ses impacts.

Récompenses

• Un prix de 50 000€, réparti en un montant de 10 000€ accordé directement au chercheur, les 40 000€ additionnels venant contribuer à la réussite collective du projet porté par l’équipe de recherche du chercheur.
• Deux prix de 25 000€ chacun, répartis en un montant de 5 000€ accordés directement au chercheur, les 20 000€ additionnels venant contribuer à la réussite collective du projet porté par l’équipe de recherche du chercheur.

Calendrier

• Lancement de l’appel à candidatures : 5 avril 2021
• Date limite de dépôt des dossiers : 31 mai 2021
• Sélection : Juin 2021
• Vote des élus : Septembre 2021 (sous réserve)
• Remise du prix : Septembre 2021 

Inscrivez-vous 

Pour plus d'infos

Pour le biologiste cellulaire, la machinerie sécrétoire des plantes carnivores est un modèle expérimental étonnant, et fascinant. Comment les cellules sécrétoires des plantes carnivores concilient-elles les fonctions de « prédation » avec les caractéristiques de sécrétion des cellules végétales ? Depuis les premières expériences rigoureuses de Darwin sur les mécanismes de piégeage et de digestion des proies, les études de microscopie électronique en transmission (MET) ont toujours été un moteur pour suggérer divers scénarios de modèles de sécrétion dans les cellules sécrétoires des plantes carnivores. Cependant, le manque d'informations spatiales a toujours été un véritable chaînon manquant pour corréler les mécanismes moléculaires potentiels en jeu, les observations physiologiques et les caractéristiques ultrastructurales de la cellule sécrétrice.

Récemment, la plateforme de microscopie électronique d'Imagerie-Gif (Institut de Biologie Intégrative de la Cellule – I2BC, Gif-sur-Yvette) et ses collaborateurs ont relevé le défi de cartographier l'organisation 3D des cellules sécrétoires de la plante carnivore Dionaea muscipula. Des méthodes de cryofixation sous haute pression combinées à des approches « slice and view » sur des échantillons inclus dans des blocs de résine (tomographie ultrastructurale, microscopie électronique à balayage, corrélation et rendu de volume en microscopie confocale) ont révélé des caractéristiques subcellulaires originales des cellules sécrétoires de Dionaea. Ces observations soulignent les innovations clés dans l'organisation fonctionnelle des compartiments endomembranaires pour ce cas unique d'exocytose stimulée dans les cellules végétales. Le produit sécrétoire délivré est un fluide biologique unique, composé d’enzymes digestives et de polysaccharides. L'appareil de Golgi est utilisé soit comme usine à protéines avec la capacité de créer des réservoirs d’enzymes digestives dans l'espace périplasmique, soit comme usine à polysaccharides, selon le stade du cycle digestif. La remarquable pléiomorphie des vacuoles peuvent agir comme des signaux pour accompagner le tri et les flux entrants de la cellule. La combinaison probable de phénomènes mécaniques sous-jacents à l'organisation des cellules sécrétrices pose finalement la question de l'efficacité des pièges en biologie végétale. En savoir plus ? Boulogne et al., J. Microscopy 2020.

Cette étude consacre le savoir-faire de la plateforme de microscopie électronique dans les approches de microscopies multimodales et de reconstruction 3D. L’acquisition prochaine d’un Microscope Electronique à Balayage à canon à effet de champ équipé d’un système intégré « Focus Ion Beam » (MEB-FIB) pour réaliser de manière automatique des séries d’images en axe Z permettra à la plateforme d’aller plus loin encore dans ces approches, en alliant résolution, préservation optimale et corrélation avec d’autres approches de microscopies (co-financement SESAME IdF 2020). De beaux projets en perspectives !

Contact : Claire Boulogne (claire.boulogne@i2bc.paris-saclay.fr)

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

I2BC / Plateforme de microscopie électronique (I2BC - Plateformes Imagerie-Gif). La plateforme de microscopie électronique propose la résolution spatiale nécessaire pour étudier l'ultrastructure et la localisation cellulaire, les organisations macromoléculaires et les interactions moléculaires au sein d'une cellule ou d'un tissu. De par sa localisation au sein de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) et de l’université Paris-Saclay, la plateforme de microscopie électronique possède une forte expertise dans l’étude de modèles biologiques variés (virus, micro-organismes, cellules animales, végétales, tissus…) mais aussi dans la caractérisation de particules de synthèse organiques et inorganiques et de leurs interactions avec le vivant. Les deux microscopes électroniques en transmission possèdent des configurations variées (cryo-MET, tomographie 3D, analyse EDS) et jouxtent un laboratoire de préparation d'échantillons également ouvert aux utilisateurs. Les ingénieurs de la plateforme proposent expertises et conseils pour la réalisation de vos expériences, et vous accompagnent tout le long de votre projet scientifique, depuis l’élaboration du protocole de préparation d’échantillon, jusqu’à l’interprétation des données.

A propos de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC - UMR 9198). L’I2BC est une Unité Mixte de Recherche (CEA, CNRS, Université Paris-Saclay), constituée de 70 équipes de recherches et 15 plateformes technologiques, provenant de 8 unités de recherches (CGM, IBBMC, IGM, ISV, LEBS, VMS, SB2SM, SBiGeM). L’institut est réparti sur 3 sites de recherche (Campus d’Orsay Vallée de l’Université Paris-Saclay, Campus du CNRS de Gif sur Yvette et Campus du CEA / Centre de Saclay) au sein de 14 bâtiments jusqu’au rassemblement programmé en 2020 sur le campus du CNRS de Gif-sur-Yvette.

L'espèce de poisson Astyanax mexicanus, avec ses deux éco-morphotypes voyants et aveugles, est devenue un modèle original pour appréhender l'évolution du développement chez les vertébrés. Récemment, Sylvie Rétaux et ses collaborateurs de l’Institut des Neurosciences Paris-Saclay - NeuroPSI avaient démontré que l'évolution phénotypique peut être affectée par des événements développementaux hyper-précoces, à partir de la production d'ovocytes dans les ovaires maternels. A. mexicanus offre un modèle adapté pour tester l'influence des déterminants maternels sur les décisions relatives au destin des cellules au cours du développement précoce, mais les mécanismes par lesquels les informations contenues dans les œufs sont traduites en programmes de développement spécifiques restent obscurs en raison du manque d'outils spécifiques chez ce modèle émergent.

Dans un article paru dans Frontiers in Cell and Developmental Biology, Sylvie Rétaux et Jorge Torres-Paz décrivent des méthodes de génération de pescoïdes à partir d'explants de blastoderme sans vitellus pour tester l'influence des tissus embryonnaires et extra-embryonnaires sur les destins cellulaires, ainsi que la production d'embryons chimériques obtenus par transplantations de cellules inter-morphes pour sonder les processus cellulaires autonomes ou non autonomes. Ils montrent que les pescoïdes d’Astyanax ont le potentiel de récapituler les principaux événements ontogénétiques observés dans les embryons intacts, y compris l'internalisation des progéniteurs mésodermiques et le développement des yeux, comme suivi sur les pescoïdes générés à partir de lignées reportrices zic1:GFP. En outre, les greffes de cellules inter-morphes aboutissent à une intégration correcte des cellules exogènes dans les tissus embryonnaires, le lignage devenant plus restreint de la mid-blastula à la gastrula.

La mise en œuvre de ces approches chez A. mexicanus apportera un éclairage nouveau sur les cascades d'événements, du pré-modelage maternel de l'embryon précoce à l'évolution de la régionalisation cérébrale.

Voir aussi le preLights, avec les réponses plus précises des chercheurs sur l’intérêt de ces méthodes.

Légende Figure : Des pescoïdes d’A. mexicanus. La procédure consiste à séparer les cellules embryonnaires du vitellus par microdissection délicate, et à cultiver ces explants, aussi appelés « gastruloïdes », in vitro. La cicatrice de dissection va se refermer, formant une cavité assimilée au blastocèle embryonnaire. Puis le pescoïde va s’allonger selon son axe antéro-postérieur, de façon très similaire à ce que fait l’embryon entier. En bas, les photos en microscopie confocale montrent un surfoïde (=un pescoïde généré à partir d’un embryon de poisson de surface) et un cavoïde (=un pescoïde généré à partir d’un embryon cavernicole), marqué par hybridation in situ pour le gène notail, un marqueur de mésoderme axial (n, notochorde). Dans les deux cas, l’élongation a eu lieu, le mésoderme s’est internalisé, comme pendant la gastrulation « normale ».

Contact : sylvie.retaux@cnrs.fr et jorge.torres-paz@cnrs.fr

Les maladies de Charcot-Marie-Tooth (CMT) sont des maladies génétiques des nerfs périphériques qui affectent soit la gaine de myéline des nerfs, soit les axones qui transportent l’influx nerveux. Elles touchent jusqu’à une personne sur 2500. Elles provoquent un problème dans la transmission de l’influx nerveux, des atrophies musculaires au niveau des extrémités des membres et le plus souvent des déformations des mains et des pieds et un handicap à la marche. D’autres symptômes comme la scoliose et la surdité peuvent aussi exister. En dehors de la chirurgie orthopédique et de la physiothérapie il n’existe pas de traitements pour ces maladies.

Nicolas Tricaud (ISTEM, Evry et IRMB, Montpellier) et ses collaborateurs ont évalué l’utilisation du vecteur de thérapie génique AAV pour l’introduction d’une molécule « médicament » dans les cellules de Schwann du nerf qui forment la gaine de myéline. Le vecteur est introduit localement dans le nerf sciatique des membres inférieurs dont la dégénération induit la majorité des symptômes. Ce vecteur AAV s’est montré capable de s’introduire dans une grande quantité de cellules de Schwann. Les chercheurs ont alors introduit dans le vecteur une molécule « médicament » pour la principale des maladies CMT, la CMT1A, et ce vecteur candidat « médicament » a été injecté dans les nerfs de jeunes rats mimant la maladie. Le vecteur a permis d’empêcher l’apparition de la maladie chez ces rats pendant au moins un tiers de leur vie. Ce traitement local provoque relativement peu des effets secondaires habituellement observés en thérapie génique à base d’AAV. Les chercheurs ont aussi pu valider un certain nombre de biomarqueurs de la peau qui, en combinaison avec des mesures de l’activité motrice, permettent de prédire l’efficacité du traitement chez le rat.

Cette découverte permet d’envisager le développement d’un traitement de thérapie génique à injection locale pour la large part des maladies CMT qui touchent la gaine de myéline.

Voir aussi le Communiqué de Presse.

Contact : nicolas.tricaud@inserm.fr

La protéine modulaire photoactive Orange Caroténoïde (OCP), qui joue un rôle crucial dans la photoprotection des cyanobactéries, a suscité un grand intérêt ces dernières années en raison de sa capacité à agir comme un photoswitch moléculaire et de sa translocation suppressive de 12 Å du caroténoïde lors de la photoactivation. Lors de l'absorption de la lumière bleue, la forme orange inactive (OCPO) se convertit en un état rouge actif (OCPR) qui est capable d'interagir avec le phycobilisome, l'antenne cyanobactérienne, et de diminuer l'énergie arrivant aux centres photochimiques. En raison de sa fonction dans la dissipation thermique de l'excès d'énergie, l'expression de l'OCP doit être étroitement contrôlée pour éviter une perte d'énergie dans des conditions non stressantes et pour augmenter cette dissipation dans des conditions stressantes. Dans un article récent publié dans The Plant Cell, un groupe de chercheurs de l'I2BC, en collaboration avec un groupe de l'Université de Freiburg, a découvert le premier facteur moléculaire impliqué dans la régulation de l'expression de l'OCP. De plus, ils démontrent pour la première fois qu'un petit ARN (ARNs) ajouté à un long ARNm d'opéron fonctionne dans le réseau de régulation des cyanobactéries.

Ce facteur est le premier exemple chez les cyanobactéries d'un ARNs dérivé d'un ARNm polycistronique régulant au moins un autre ARNm en trans. Les chercheurs ont démontré que ApcZ, un ARNs provenant de l'extrémité 3' de l'opéron apcABC codant pour les protéines centrales du phycobilisome, est responsable de la répression de la traduction de ocp dans des conditions de non stress. La transcription de l'opéron apcABC diminue dans la plupart des conditions de stress et, par conséquent, la concentration d'ApcZ (libre et en tant que partie du transcrit de l'opéron entier) diminue, entraînant une dé-répression de la traduction de l'ARNm ocp.

Ainsi, la captation de la lumière et la photoprotection sont reliées directement et de manière inverse par un seul ARNs régulateur. Si, dans des conditions de stress, moins d'énergie doit arriver aux centres photochimiques, la transcription des gènes du phycobilisome diminue et la synthèse d'OCP augmente. Ainsi, la concentration d'OCP est contrôlée d'une manière simple et élégante.

Contact : diana.kirilovsky@cea.fr

À travers plus de 20 présentations et d'ateliers, partez à la découverte de divers domaines tels que la génétique, les virus, l'étude de maladies majeures, les biotechnologies ... ou encore familiarisez-vous avec la faune dans son aspect scientifique.

Plus de détails et inscription ICI.

L'Université de Szeged organise une action EUGLOH intitulée "Joint Innovation Challenges".

Joint Innovation Challenges

Through the 8 weeks of the Joint Innovation Challenge, students will work in a multidisciplinary and international team to solve one of the 10 real-life cases in the area of both mental and physical health.

Date: 06 May 2021 — 30 May 2021

Location: Online

Target Group: Students and researchers (BA/BSc, MA/MSc, PhD), Your field of studies doesn't matter, we are looking for a versatile team to bring different views to the table.

Host: University of Szeged

Registration Deadline: 30 Apr 2021

More information: https://www.eugloh.eu/events/joint-innovation-challenges

Procope est le partenariat Hubert Curien franco-allemand d'échanges scientifiques et technologiques pour chercheurs et doctorants. Il est mis en œuvre par les ministères français des Affaires étrangères et de la Recherche, et par le Deutscher Akademischer Austausch dienst.

Le programme Procope plus soutient l’organisation de colloques scientifiques et de rencontres d’experts. 

Date limite de candidature : 29 juin.

Les gliomes représentent la forme la plus fréquente des tumeurs cérébrales chez l’homme. La forme avec le plus haut grade de malignité est le glioblastome. La protéine translocatrice de 18 kDa (TSPO) est un biomarqueur de l’activation gliale. Des radioligands ciblant TSPO ont été développés pour étudier la neuroinflammation grâce à l’imagerie tomographique par émission de positons (TEP). Les chercheurs de BioMaps (Université Paris-Saclay/CEA-Joliot/CNRS/Inserm, Orsay) ont été largement impliqués dans la mise en œuvre d’une recherche translationnelle utilisant la TEP TSPO pour étudier la composante neuroinflammatoire des maladies cérébrales chez l’animal comme chez l’Homme.

TSPO est fortement exprimée dans le glioblastome, à la fois par les cellules cancéreuses, mais également par son environnement stromal (y compris par la microglie activée). Les chercheurs de BioMaps, en collaboration avec plusieurs équipes internationales, ont défini les conditions expérimentales qui permettent l’évaluation et la quantification des composants cellulaires du microenvironnement tumoral des gliomes par imagerie TEP TSPO. Ces travaux menés notamment dans cadre du consortium européen FP7 INMiND, on fait l’objet d’un article de revue publié dans le European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging.

Contact : alexandra.winkeler@cea.fr

Les Streptomyces sont des bactéries qui possèdent un grand chromosome linéaire (6 à 12 Mb, selon les souches et les espèces) constitué d'une région centrale conservée flanquée de régions variables couvrant plusieurs mégabases.

Afin de comprendre l'évolution du chromosome de ces bactéries au cours du temps, des chercheurs de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) et de l’Université de Lorraine (INRAE, DynAMic, Nancy) ont sélectionné un panel représentatif de 125 espèces de Streptomyces dont les chromosomes sont complètement séquencés et assemblés. Si l’ensemble de ces espèces présentent une grande diversité génétique, la liste des gènes conservés (pan-génome) a néanmoins pu être déterminée et un positionnement relatif de ces gènes a permis de déduire que les gènes du pan-génome forment une organisation hautement conservée, limitée à la seule partie centrale du chromosome. Cette distribution semble refléter l'existence d'un squelette chromosomique ancestral. L’utilisation d’indices permettant d’étudier l’évolution de la plasticité génomique le long du chromosome (Figure) a montré que lorsque l’on classe les espèces, selon une distance évolutive croissante (du plus proche au plus éloigné), non seulement la conservation génétique diminue entre les espèces, mais les extrémités des chromosomes sont enrichies en gènes non conservés et évoluent donc plus rapidement que la région centrale. Cette asymétrie d’évolution serait due à l'effet combiné des réarrangements et de l'apport de nouveaux gènes provenant de transferts horizontaux.

Au sein d'une population bactérienne, la variabilité génétique des régions chromosomiques terminales contribuerait ainsi majoritairement à la diversification du pool génétique des Streptomyces. Ces travaux font l’objet d’une étude parue dans Microbial Genomics.

Légende Figure : Conservation de l’ordre des gènes le long du chromosome lorsque les espèces sont classées selon leur proximité évolutive. Les zones bleues indiquent une grande conservation de la nature et de l’ordre des gènes tandis que les zones rouges traduisent une faible conservation.

Email de contact : olivier.lespinet@i2bc.paris-saclay.fr

L'acétylation des résidus lysines (Kac) des protéines est bien connue chez les histones. Histone Kac affecte la structure de chromatine et la régulation épigénétique de l’expression des gènes. En plus des histones, la Kac est également détectée dans un grand nombre de protéines de diverses fonctions biologiques. Cependant la fonction et la régulation de la Kac ne sont pas claires pour la plupart de ces protéines non-histones.

Dans un crible des effets de mutations chez le riz sur l’acétylome protéique, Dao-Xiu Zhou (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay - IPS2, CNRS/INRAE/UPSaclay, Orsay) et ses collaborateurs du National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement (Huazhong Agricultural University, Wuhan, Chine) ont constaté qu’au moins 2 histones désacétylases (HDAC) contrôlent la Kac des protéines non-histone, parmi lesquelles les protéines ribosomales(r-protéines). Des expériences in vitro et in vivo ont permis de montrer qu’une des HDAC, HDA714, interagit avec les r-protéines, réduit leur niveau de Kac, mais augmente leur stabilité. L’analyse avec la méthode de Ribo-seq a révélé que la mutation de l’enzyme HDA714 augmente la fréquence de stagnation des ribosomes sur des ARN messagers, entravent l’efficacité de la traduction.

Ces résultats, parus dans Nucleic Acids Research, révèlent que la Kac, contrôlé pas des HDAC, joue un rôle non seulement dans la régulation épigénétique de l’expression des gènes, mais aussi dans le contrôle traductionnel des RNA messagers.

Contact : dao-xiu.zhou@universite-paris-sacaly.fr