How do bacteria build and maintain their shape? Rod-shaped bacteria rely on the actin-like protein MreB to spatiotemporally organize the cell wall synthesis machinery responsible for cell elongation. While MreB is known to form membrane-associated filaments that guide where new cell wall material is inserted, how these filaments coordinate membrane organization with cell wall synthesis has remained unclear.

In a study published in Biophysical Journal, scientists from the Micalis Institute (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), together with collaborators from the University of Bordeaux, Aix-Marseille University and international partners, identify a previously unrecognized physical property of MreB that may contribute to this coordination. Using complementary biophysical approaches, they show that ATP-driven polymerization of MreB into membrane-bound filaments locally increases membrane fluidity. This membrane remodeling could facilitate the activity of the cell wall synthesis machinery, suggesting that MreB may influence bacterial morphogenesis not only by acting as a structural scaffold but also by locally tuning the physical properties of the membrane.

By combining atomic force microscopy (AFM), solid-state NMR (ssNRM) spectroscopy and fluorescence anisotropy, the researchers characterized the interaction between MreB, ATP and lipid membranes with unprecedented detail. Their findings provide a new biophysical perspective on how the bacterial cytoskeleton may coordinate membrane organization and cell wall synthesis during bacterial growth.

-> Contact: rut.carballido-lopez@inrae.fr

Dans une revue publiée dans Arteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology les chercheurs de l’unité Hémostase Inflammation Thrombose (UMR-S 1176 INSERM/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre) font le point sur la disponibilité des modèles murins disponibles pour évaluer un phénotype hémorragique et l’applicabilité de ces modèles pour évaluer des agents thérapeutiques dans le traitement des troubles hémorragiques héréditaires (tels que l'hémophilie A/B et la maladie de von Willebrand).

Un certain nombre de modèles existent et outre leur description, leurs avantages et inconvénients sont discutés. Ainsi, parmi les modèles disponibles, le plus fréquemment utilisé est le «tail-clip» qui consiste à amputer quelques millimètres à l’extrémité de la queue. Ce modèle est très populaire en raison de son apparente simplicité. A l’opposé, d’autres modèles tels que la ponction de la veine saphène, nécessitent davantage de compétences chirurgicales et techniques.

Un avantage est que l'hémostase murine est relativement similaire à l'hémostase humaine, ce qui constitue un atout indéniable pour la transposition en clinique. D’ailleurs les modèles murins ont fait leurs preuves en tant qu'outils précliniques et de nombreux agents qui se sont révélés efficaces dans des modèles murins de saignement ont ultérieurement démontré leur efficacité chez des patients.

Cependant, bien que performants, les modèles actuels se heurtent à plusieurs obstacles. L'absence de standardisation de la majorité d'entre eux complique notamment les comparaisons inter-laboratoires, un point auquel cette publication répond en proposant des recommandations dédiées. Par ailleurs, les limites techniques actuelles concernent la reproduction des saignements cutanéo-muqueux, le suivi par imagerie non invasive et l'intégration d'organoïdes vasculaires humains complexifiés. Le développement de modèles hémorragiques de nouvelle génération s'avère donc indispensable pour concevoir des thérapies de pointe adaptées aux patients.

Légende Figure : Exemples de modèles hémorragiques utilisés pour tester de nouvelles approches thérapeutiques

-> Contact : peter.lenting@inserm.fr

Dans une étude de preuve de concept publiée dans Journal of Cystic Fibrosis, des chercheurs de l'unité Technologies pour la Santé et le Médicament (UVSQ, UPSaclay, Montigny-le-Bretonneux) et de la plateforme Exhalomics® (Hôpital Foch) ont exploré une approche originale pour évaluer l'efficacité du traitement par modulateurs de CFTR (elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor (Kaftrio®)) chez des adultes atteints de mucoviscidose.

Si le Kaftrio® a transformé la prise en charge de la mucoviscidose, les outils habituels de suivi (épreuves fonctionnelles respiratoires et test de la sueur) ne détectent pas toujours les effets précoces du traitement. Les chercheurs ont analysé les composés organiques volatils (COV) exhalés, ces centaines de molécules chimiques que nos poumons libèrent à chaque expiration et qui reflètent les processus métaboliques de l’organisme.

Dix adultes atteints de mucoviscidose ont soufflé avant le début du traitement, puis à une semaine et à un mois directement dans un spectromètre de masse en temps réel, un instrument capable de détecter et de quantifier les COV exhalés en quelques secondes, sans prélèvement ni préparation. Dès la première semaine, des modifications significatives ont été détectées dans le profil moléculaire de l'air expiré, notamment une normalisation progressive de l'acide butyrique, marqueur de l'activité bactérienne et de l'inflammation des voies aériennes, vers les niveaux observés chez des adultes sains. Dix composés étaient en outre corrélés aux paramètres usuels (VEMS, test de la sueur).

Les résultats de cette étude pharmacovolatilomique ouvrent la voie à une nouvelle méthode de suivi non invasif, rapide et précoce de la réponse aux traitements pharmacologiques de la mucoviscidose.

-> Contact : s.grassindelyle@hopital-foch.com

Cindy Vallières est titulaire d’une Chaire de Professeur Junior CNRS à l’Institut de Chimie des Substances Naturelles – ICSN (CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette). Elle est responsable de l’axe « Machinerie mitochondriale de la biogenèse des centres fer-soufre : mécanismes moléculaires, régulation et stratégies thérapeutiques » au sein de la thématique de recherche « Stress Oxydant, Protéines Fer-Soufre et Cancer » du Département Chémobiologie.

Titulaire d’un doctorat en biologie obtenu en 2012 sous la direction de Brigitte Meunier (I2BC, Gif-sur-Yvette), Cindy Vallières s’intéresse depuis plus de 15 ans à l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques et de nouveaux traitements ainsi qu’à l’élucidation des mécanismes moléculaires impliqués dans la résistance intrinsèque ou acquise à des agents antimicrobiens. Ses travaux reposent principalement sur l’utilisation de la levure Saccharomyces cerevisiae comme organisme modèle et outil de criblage.

Après une thèse consacrée aux inhibiteurs du complexe III de la chaîne respiratoire mitochondriale, elle rejoint l’Université de Nottingham (Royaume-Uni) pour un postdoctorat dans l’équipe du Pr Simon Avery. Elle y développe de nouvelles stratégies de lutte contre les infections fongiques et parasitaires (combinaisons synergiques de composés, conception de matériaux résistants à la colonisation fongique).

En 2020, elle rejoint la start-up Phenotypeca (Nottingham, Royaume-Uni) en tant que Lead Scientist où elle pilote le développement d’une plateforme exploitant la diversité génétique de S. cerevisiae pour l’optimisation de la production de protéines recombinantes d’intérêt thérapeutique.

Elle intègre ensuite l’ICSN en 2021 grâce à une bourse Marie Skłodowska-Curie puis à un financement Passerelle de l’ARC où elle initie un programme de recherche consacré aux protéines à centres fer-soufre, un domaine pour lequel elle a développé un fort intérêt lors de son postdoctorat à l’Université de Nottingham. Présentes dans de nombreuses voies biologiques essentielles telles que la respiration, la traduction, la réplication et la réparation de l’ADN, ces protéines assurent des fonctions de transfert d’électrons, de catalyse enzymatique ou de détection de changements environnementaux. Depuis 2026, dans le cadre de sa chaire, elle s’intéresse plus particulièrement à la machinerie mitochondriale responsable de la synthèse et du transfert des centres fer-soufre. En combinant biologie et génétique moléculaire, biochimie et approches omiques, ses recherches visent à en décrypter les mécanismes encore mal caractérisés et à l’exploiter comme cible thérapeutique. En parallèle, elle identifie les cibles moléculaires de composés issus des thèques de l’ICSN par des approches omiques pour mieux comprendre leurs mécanismes d’action.

« Ne vous découragez pas ; c’est souvent la dernière clef du trousseau qui ouvre la porte. » - Paulo Coelho

-> Contact : cindy.vallieres@cnrs.fr

Dans une étude publiée dans Nature Communications, des scientifiques de l’Institut MICALIS (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) et de l'unité MaIAGE (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas) présentent une approche innovante de transcriptomique acellulaire permettant d'analyser l'expression d'un génome de bactériophage en dehors de tout organisme vivant.

En combinant apprentissage actif, optimisation bayésienne et expérimentation automatisée à haut débit, ils ont optimisé la composition des systèmes cell-free. Parmi plus de 1,6 million de combinaisons possibles, 653 formulations de tampon ont été testées, conduisant à une multiplication par 20 de la production d'ARNm.

Cette avancée a permis d'exprimer l'intégralité du génome du bactériophage T7 (environ 40 000 paires de bases) et de réaliser le premier séquençage direct de l'ARN par nanopore à partir d'un système acellulaire, tout en préservant l'intégrité des molécules d'ARN. Cette plateforme acellulaire, ouverte et modulable, a permis de reconstruire les différentes étapes de la régulation de l'expression des gènes en découplant la production, la maturation et les différent niveaux de dégradation des ARN messagers.

Ces résultats ouvrent de nouvelles perspectives pour l'étude de la régulation des génomes et pourraient rendre accessible l'analyse transcriptomique d'organismes non cultivables, qui représentent la majeure partie de la diversité microbienne mais échappent encore aux approches classiques.

-> Contact : olivier.borkowski@inrae.fr

Identifier de nouveaux traitements pour les maladies génétiques rares reste un défi majeur, en particulier lorsque les mécanismes moléculaires de la maladie sont mal connus. Des chercheurs de l’Institut des cellules souches pour le traitement et l’étude des maladies monogéniques – I-Stem (UMR-S 861 Inserm/AFM-Téléthon/Université Evry Paris-Saclay, Evry) ont développé une approche innovante consistant à établir une cartographie des effets moléculaires de certains médicaments pharmacologiques déjà sur le marché. Plutôt que de partir d'une maladie donnée, cette stratégie analyse les modifications de l'expression des gènes induites par des composés dans des cellules saines, puis compare ces signatures moléculaires à celles observées dans différentes maladies afin d'identifier de nouveaux candidats thérapeutiques.

En testant une bibliothèque de 50 médicaments sur des cellules souches mésenchymateuses dérivées de cellules souches pluripotentes humaines, les chercheurs ont montré que plus de la moitié des composés modifiaient significativement les profils d'expression génique, dont plusieurs impliqués dans des maladies monogéniques.

Cette stratégie a permis d'identifier la prazosine comme un candidat prometteur pour les formes de sclérose latérale amyotrophique (SLA) et de dégénérescence fronto-temporale (FTD) liées à une insuffisance de SQSTM1. Les effets du composé ont ensuite été validés dans plusieurs modèles de la maladie, incluant des fibroblastes de patients, des motoneurones dérivés de cellules souches pluripotentes humaines et un modèle de poisson-zèbre.

Réalisés en collaboration avec le Centre National de Recherche en Génomique Humaine – CNRGH (CEA-Jacob/UPSaclay, Evry), l'École normale supérieure de Lyon, l'Institut Imagine et l'Institut du Cerveau, ces travaux, publiés dans Stem Cell Reports, ouvrent la voie à une nouvelle génération de stratégies de repositionnement de médicaments, fondées sur les signatures moléculaires des composés et potentiellement applicables à un large éventail de maladies rares grâce à l'exploration de différents types cellulaires et de bibliothèques de molécules de plus grande envergure.

-> Contact : cmartinat@istem.fr

La perte progressive de masse musculaire, appelée sarcopénie, touche de nombreux patients atteints de cancer. Elle réduit leur force physique, diminue leur qualité de vie et est associée à une réponse moins favorable aux traitements ainsi qu'à une survie plus courte. Pourtant, son diagnostic repose encore essentiellement sur des examens d'imagerie médicale et des évaluations cliniques, difficiles à répéter régulièrement.

Dans une étude publiée dans Molecular Cancer, Filippo Dall’Olio, Wael Zrafi et Xinran Song de l’UMR 9018 METSY (CNRS/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif), en collaboration avec plusieurs équipes françaises et internationales, ont développé une approche innovante permettant d'évaluer la sarcopénie à partir d'une simple prise de sang. En combinant l'analyse de centaines de protéines circulantes et des méthodes d'intelligence artificielle, ils ont identifié une signature biologique capable d'estimer avec précision le risque de sarcopénie chez des patients atteints de différents types de cancer. Cette signature prédit également l'évolution clinique et le pronostic des patients.

Les chercheurs ont également identifié deux protéines, IGFBP1 et IGFBP2, qui semblent jouer un rôle actif dans le développement de la sarcopénie. Des expériences réalisées sur des cellules musculaires humaines montrent que ces protéines perturbent directement la formation des fibres musculaires en bloquant l'action du facteur de croissance IGF-1, indispensable à la régénération du muscle. Cette découverte suggère que ces protéines ne sont pas seulement des marqueurs de la maladie, mais pourraient en être des acteurs.

Ces résultats ouvrent la voie à des tests sanguins simples pour surveiller précocement l'état musculaire des patients et mieux adapter leur prise en charge. Ils identifient également de nouvelles cibles thérapeutiques susceptibles de préserver la masse musculaire et d'améliorer la qualité de vie des personnes atteintes de cancer.

Légende Figure : En haut, représentation schématique de la signature protéique sanguine permettant de prédire la sarcopénie, avec mise en évidence du rôle des protéines IGFBP1 et IGFBP2 dans l'altération de la régénération musculaire. En bas, Xinran Song, Wael Zrafi et Filippo Dall’Olio, principaux auteurs de l'article.

-> Contact : filippogustavo.dall-olio@gustaveroussy.fr / yegor.vassetzky@cnrs.fr

Dans une étude publiée dans PNAS, les scientifiques de l’Institut des Sciences des Plantes Paris-Saclay - IPS2 (CNRS/INRAE/UEVE/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) et de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) montrent qu'une famille ancestrale de facteurs de transcription, les protéines WIP, contrôle des étapes clés du développement chez la mousse Physcomitrium patens, un organisme modèle pour comprendre l'évolution des plantes terrestres.

Les chercheurs démontrent que ces protéines agissent au cours des deux grandes phases du cycle de vie des mousses en régulant la production d'auxine, une hormone essentielle au développement végétal. Elles favorisent notamment la croissance des tissus végétatifs tout en limitant la formation de plusieurs sporophytes sur une même plante, un phénomène rare appelé polysetie.

En comparant ces mécanismes avec ceux observés chez Arabidopsis thaliana, les auteurs montrent que la fonction moléculaire des protéines WIP est largement conservée depuis les premiers végétaux terrestres, tout en ayant été adaptée au cours de l'évolution pour générer de nouvelles structures chez les plantes à fleurs.

Ces résultats apportent un nouvel éclairage sur les mécanismes génétiques qui ont accompagné la diversification des plantes terrestres au cours de plus de 450 millions d'années d'évolution.

Légende Figure : Vue d’ensemble des gamétophores du type sauvage et du mutant wip1wip2

-> Contact: abdelhafid.bendahmane@inrae.fr

Dans une étude publiée dans Nature Communications, des scientifiques de l'unité Intégrité du Génome et Cancers (UMR 9019 CNRS/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif), en collaboration avec plusieurs équipes nationales et internationales, dont l’équipe de Sergey Nikolaev (UMR-S 981 INSERM/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif) et la plateforme CIGEX (CEA de Fontenay-aux-Roses) ont mis en évidence un mécanisme inédit de régulation de l'ADN polymérase ζ (Polζ), une enzyme essentielle à la tolérance des cellules aux dommages de l'ADN.

L'ADN de nos cellules est continuellement agressé par des facteurs environnementaux (rayonnements UV, pollution, traitements anticancéreux) mais aussi par des processus naturels. Pour poursuivre leur division malgré ces lésions, les cellules utilisent des polymérases spécialisées capables de répliquer un ADN endommagé. Si ce mécanisme évite le blocage de la réplication, il favorise également l'apparition de mutations, contribuant au développement des cancers et à la résistance aux traitements.

Les chercheurs ont découvert que la sous-unité catalytique de Polζ, REV3L, doit être clivée par l'enzyme TASP1 pour devenir pleinement fonctionnelle. Ce clivage génère deux fragments qui restent associés et forment un complexe enzymatique hautement actif. Lorsque ce clivage est empêché, l'activité de Polζ diminue fortement, les mutations induites par le cisplatine sont réduites et les cellules privilégient des mécanismes de réplication de l'ADN endommagé plus fidèles.

Cette découverte révèle un nouveau mode de régulation d'un acteur majeur de la réplication de l'ADN endommagé et ouvre la voie au développement de nouvelles stratégies thérapeutiques visant à limiter l'apparition des résistances aux chimiothérapies.

-> Contact : patricia.kannouche@gustaveroussy.fr

Ana María Gómez est directrice de recherche à l'Inserm, aux commandes du laboratoire Signalisation et physiopathologie cardiovasculaire (CARPAT – Univ. Paris-Saclay/Inserm). Spécialiste mondialement reconnue de l'insuffisance cardiaque et des arythmies, elle consacre aujourd'hui une part majeure de ses recherches à un domaine longtemps négligé : les spécificités du cœur féminin. La chercheuse vient d’être distinguée pour ses travaux marqués par de nombreuses collaborations internationales et un engagement croissant pour une médecine personnalisée selon le sexe.

Lire la suite du portrait sur le site UPSaclay

-> Contact : ana-maria.gomez@inserm.fr

Le prochain café de la GS LSH se tiendra le vendredi 17 juillet 2026 en visioconférence de 13h30 à 14h.

Au programme : " Structural studies of an essential calcium transporter of P. falciparum by cryoEM" par Thibaud Dieudonné (Institut de Biologie Intégrative de la Cellule - I2BC CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette).

1. Pour assister en visioconférence : ICI
2. Pour devenir orateur/oratrice : ICI

📢 Les inscriptions sont ouvertes — PhysChemCell 2026

📅 16–18 novembre 2026
📍 LPS – Université Paris-Saclay

La conférence PhysChemCell 2026, organisée par l’Objet Interdisciplinaire BioProbe, réunira des chercheurs à l'interface de la chimie, de la physique et de la biologie afin d'échanger autour des approches innovantes pour explorer le vivant.

🔬 Conférences plénières :

Stéphanie Descroix (Institut Curie) · María García-Parajo (ICFO) · YongKeun (Paul) Park (KAIST) · Oliver Thorn-Seshold (TU Dresden)

📝 L'inscription est gratuite mais obligatoire (jusqu'au 31 octobre).

📣 L'appel à communications est ouvert pour les présentations orales et les posters (date limite : 1er octobre).

Nous vous invitons à vous inscrire dès maintenant et à diffuser cette annonce auprès de vos collègues et étudiants susceptibles d'être intéressés.

➡️ Site de la conférence et inscription : https://physchemcell26.sciencesconf.org/

PhysChemCell 2026 est organisé avec le généreux soutien de l’Axe Physique des Onders et de la Matière (PhOM) de la Graduate School de Physique de l'Université Paris-Saclay, du GDR ImaBio et de la Société Française des Microscopies (Sfµ).

Dans une étude publiée dans Cardiovascular Research, les scientifiques de l’équipe 1 « Dysfonction endothéliale et Innovation thérapeutique en Hypertension Pulmonaire » du laboratoire HPPIT (UMR-S 1358 UPSaclay/Inserm, Le Kremlin-Bicêtre) ont révélé un rôle clef du facteur de croissance placentaire PlGF, un membre de la famille VEGF, dans l’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP), une maladie sévère caractérisée par l’obstruction progressive des petites artères pulmonaires.

Les chercheurs montrent que les concentrations sériques de PlGF sont augmentées chez les patients HTAP et sont associées à une évolution plus défavorable de la maladie. Chez les rats génétiquement déficients en PlGF, l’absence de ce facteur protège contre l’hypertension pulmonaire induite expérimentalement par une hypoxie chronique ou par la monocrotaline, en limitant l’augmentation des pressions pulmonaires et le remodelage des vaisseaux.

Sur le plan mécanistique, l’étude montre que PlGF se lie au récepteur VEGFR-1, dont l’expression est augmentée dans l’endothélium pulmonaire pathologique. Cette interaction active les cellules endothéliales pulmonaires, augmente l’expression des molécules d’adhésion ICAM-1 et VCAM-1 et stimule la sécrétion de médiateurs pro-inflammatoires, notamment CCL5 et l’ostéoprotégérine. Elle favorise ainsi le recrutement de cellules immunitaires et la polarisation des macrophages vers un phénotype pro-remodelant, contribuant à l’obstruction progressive des artères pulmonaires.

Ces résultats positionnent PlGF comme un biomarqueur potentiel de la sévérité de l’HTAP, mais surtout comme une nouvelle cible thérapeutique prometteuse pour freiner la progression de la maladie. Ces travaux ont été menés au sein de l’équipe 1 de l’UMR-S 1358, sous l’impulsion des Drs Vanessa Petit, Ly Tu et Christophe Guignabert, au sein de l’unité dirigée par le Pr Marc Humbert.

-> Contact : christophe.guignabert@inserm.fr

Dans une étude publiée dans The Lancet eBioMedicine, les scientifiques du Département IDMIT de l'Institut de Biologie François Jacob du CEA (UPSaclay/ Inserm/ CEA ; IDMIT/UMRS1184, Fontenay-aux-Roses), en collaboration avec le Vaccine Research Institute (VRI), ont évalué une nouvelle plateforme vaccinale ciblant le récepteur CD40, présent sur les lymphocytes B et les cellules dendritiques afin d'optimiser l'induction des réponses immunitaires contre le SARS-CoV-2.

Les candidats vaccins CD40.RBDv et CD40.Pan.CoV intègrent des mutations clés retrouvées dans plusieurs variants du SARS-CoV-2 ainsi que des antigènes conservés. Les auteurs montrent que les deux candidats vaccins, administrés sans adjuvant, induisent des réponses immunitaires systémiques et muqueuses robustes et durables, capables de neutraliser un large panel de variants du SARS-CoV-2, y compris des variants récents. Chez les animaux convalescents, précédemment infectés par le SARS-CoV-2, la modélisation mathématique prédit une persistance des anticorps induits par le vaccin sur plusieurs décennies. Ces vaccins CD40 renforcent également efficacement l'immunité induite par les vaccins à ARNm lorsqu'ils sont utilisés en rappel et confèrent une protection contre une infection par le virus SARS-CoV-2. Enfin, le contrôle de l'infection est étroitement associé à l'intensité des réponses humorales et cellulaires induites par la vaccination CD40.

Ces résultats démontrent le potentiel de la plateforme vaccinale CD40 comme stratégie de nouvelle génération pour développer des vaccins plus résistants à l'évolution des virus et transposables à d'autres agents pathogènes émergents. Les deux candidats vaccins de cette étude sont actuellement en phase d’essai clinique chez l’humain

-> Contact : romain.marlin@cea.fr / roger.le-grand@cea.fr / yves.levy@inserm.fr

Les polyhydroxyalcanoates (PHA) constituent des alternatives biosourcées et biodégradables prometteuses aux plastiques conventionnels. Toutefois, leurs mécanismes de dégradation et la diversité des micro-organismes impliqués restent mal caractérisés dans les écosystèmes marins.

Dans une étude publiée dans Journal of Hazardous Materials, les scientifiques de plusieurs laboratoires, dont celui de Génomique Métabolique du Genoscope (CEA-Jacob/CNRS/UEVE/UPSaclay, Évry), ont utilisé du poly(3-hydroxybutyrate) (PHB) marqué au 13C et combiné le marquage isotopique stable de l'ADN (DNA-SIP) à la métagénomique pour identifier et caractériser fonctionnellement les bactéries dégradant activement le PHB dans l'eau de mer. Les auteurs ont identifié trois génomes assemblés à partir de métagénomes (MAG) affiliés au genre Agarilytica, présentant une expansion exceptionnelle de gènes codant pour des dépolymérases extracellulaires de PHA à chaîne courte (ephaZscl), jusqu’à 14 copies par génome, dépassant largement la ou les deux copies généralement rapportées.

Des analyses génomiques et structurelles comparatives ont révélé des événements de duplication et de fusion de gènes, donnant naissance à des dépolymérases en tandem ou chimériques susceptibles d'accroître la diversité catalytique et l'accessibilité au substrat. La modélisation structurelle en trois dimensions a confirmé que ces protéines de fusion conservaient des domaines catalytiques fonctionnels, dotés d'une activité potentiellement coopérative ou indépendante. Une telle redondance génomique et diversification structurelle confèrent probablement un avantage adaptatif pour la biodégradation du PHB en milieu marin.

Dans leur ensemble, les résultats apportent un éclairage nouveau sur les stratégies écologiques et évolutives des micro-organismes marins dégradant le PHB et soulignent la puissance de la métagénomique couplée au DNA-SIP.

-> Contact : vbarbe@genoscope.cns.fr

Dans une étude publiée dans Gut Microbes, des chercheurs de l’équipe ProbiHôte de l’Institut MICALIS (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec le Centre de Recherche Saint-Antoine (Inserm, Sorbonne Université, AP-HP) ont révélé que les bactéries du genre Sutterella, fréquemment présentes dans le microbiote intestinal humain, peuvent aggraver l’inflammation intestinale en perturbant une voie essentielle de protection de la muqueuse.

Les travaux révèlent que ces bactéries inhibent l’activation du récepteur d’aryl hydrocarbone (AhR), un acteur clé de la réponse immunitaire intestinale, ce qui réduit la production d’interleukine-22 (IL-22), une cytokine indispensable au maintien de l’intégrité de la barrière intestinale. L’analyse d’une cohorte de patients atteints de la maladie de Crohn a montré par ailleurs une abondance plus élevée de Sutterella chez les patients en poussée inflammatoire.

Ces résultats mettent en lumière un nouveau mécanisme d’interaction entre le microbiote et le système immunitaire intestinal et ouvrent des perspectives pour le développement de stratégies thérapeutiques visant à restaurer la signalisation AhR/IL-22 afin de préserver l’homéostasie de la muqueuse intestinale.

-> Contact : marie-laure.michel@inrae.fr

Dans une étude publiée dans PLOS Pathogens, une équipe internationale, coordonnée par INRAE (BioinfOmics/URGI et IJPB) et le CIRAD (UMR PVBMT), a exploré les génomes de 93 espèces végétales représentatives des grandes lignées de plantes terrestres afin de retrouver des séquences virales endogènes, traces d’infections anciennes intégrées dans l’ADN des hôtes. Les chercheurs ont identifié plus de 47 000 séquences dérivées des Caulimoviridae, une famille de virus végétaux, et mis en évidence 35 nouvelles lignées évolutives, dont un groupe inédit limité à certains conifères.

Leurs résultats suggèrent que plusieurs lignées de Caulimoviridae ont évolué parallèlement aux plantes vasculaires pendant des centaines de millions d’années. Cette histoire comporte toutefois des changements d’hôtes et des disparitions de lignées virales, possiblement associés aux grandes crises biologiques de la fin du Permien et de la fin du Crétacé.

L’étude montre ainsi que les génomes végétaux constituent des archives naturelles précieuses pour reconstituer l’évolution profonde des virus et leurs interactions avec les plantes.

Légende Figure : Les traces de Caulimoviridae sont abondantes dans les génomes de conifères (ici, Sequoiadendron giganteum).

-> Contact : florian.maumus@inrae.fr

Dans un article paru dans Journal of Hepatology Reports des chercheurs de l’UMR-S 1193 (INSERM/UPSaclay, Orsay) ont rapporté des résultats originaux ouvrant une nouvelle piste thérapeutique au cours de la stéatose hépatique associée aux désordres métaboliques (MASLD).

La MASLD, associée à l’obésité et au diabète de type 2, est devenue une cause majeure de maladie chronique du foie, débutant par une stéatose (surcharge lipidique) simple, évoluant vers une stéato-hépatite (inflammation et fibrose) puis vers la cirrhose qui fait le lit du cancer. Il n’existe que très peu de traitements spécifiques de la MASLD, de sorte que la seule solution thérapeutique à un stade avancé reste la transplantation du foie, dont elle est une des premières indications.

L’étude des chercheurs de l’UMR-S 1193 s’est focalisée sur le récepteur-canal purinergique P2X4R, exprimé sur la membrane lysosomale des hépatocytes (principales cellules du foie). Les résultats in vitro (hépatocytes primaires) et in vivo (modèles murins de stéatose hépatique) montrent que l’inhibition spécifique de ce récepteur active la lipolyse cytosolique, réduit les processus de lipophagie des petites gouttelettes lipidiques (qui de ce fait s’accumulent dans le foie, remplaçant les grosses gouttelettes), et s’associe à une réduction des lésions et de l’inflammation hépatiques.

Ainsi une réduction de la taille des gouttelettes lipidiques du fait de l’inhibition de P2X4R est associée à une hépato-protection, ouvrant des pistes potentielles de traitement des patients présentant une MASLD.

-> Contact : thierry.tordjmann@inserm.fr

Dans une étude publiée dans Nature Communications, les scientifiques de l’Institut des Sciences des Plantes Paris-Saclay - IPS2 (CNRS/INRAE/UEVE/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) ont étudié l’origine génétique d’une résistance majeure aux virus chez le haricot commun (Phaseolus vulgaris), une culture essentielle pour l’alimentation humaine au niveau mondial.

Depuis près d’un siècle, un gène appelé I protège efficacement le haricot commun contre plusieurs potyvirus responsables de graves pertes de rendement, notamment le virus de la mosaïque commune (BCMV) et le virus de la mosaïque nécrotique (BCMNV). Malgré son importance agronomique, l’identité moléculaire de ce gène restait inconnue.

En combinant des assemblages de génomes de haricot de haute qualité et l’analyse de mutants ayant perdu la résistance aux potyvirus, les chercheurs ont identifié et cloné le gène I présent chez le haricot commun. Ils ont montré qu’il code une protéine appartenant à la grande famille des récepteurs immunitaires NLR, qui jouent un rôle central dans la reconnaissance des agents pathogènes chez les plantes.

Le gène I se situe dans une région du génome particulièrement dynamique, riche en gènes NLR et sujette à d’importantes variations structurales. Selon les variétés, le nombre de gènes NLR peut varier fortement (de 1 à 34), témoignant d’une évolution rapide de cette région impliquée dans la reconnaissance des agents pathogènes.

Ces travaux permettent de mieux comprendre les bases génétiques d’une résistance emblématique et fournissent des outils précieux pour développer de nouvelles variétés de haricot plus résistantes aux maladies virales.

Légende Figure : Le cluster I de résistance chez le haricot commun : variation du nombre de copies de gènes NLR (en rose) entre différents génotypes de haricot.

-> Contact : valerie.geffroy@inrae.fr

Les petites GTPases de la superfamille Ras agissent comme des interrupteurs moléculaires en alternant entre un état inactif lié au GDP et un état actif lié au GTP. Leur activité ne dépend toutefois pas uniquement de la fixation du GTP, mais d’un cycle continu d’activation et d’inactivation, régulé par les protéines GEF et GAP. Si les mutations de la glycine 12 (Gly12) sont bien connues pour rendre les protéines Ras constitutivement actives, leurs effets au sein de la famille des GTPases Rho restaient largement méconnus.

L’équipe IMPA, dirigée par Agata Nawrotek au LBPA (UMR1183 CNRS/ENS-Paris-Saclay/UPSaclay, Gif-sur-Yveyye), a étudié une variante de RhoG, RhoGG12E, répertoriée dans la base ClinVar et identifiée chez un patient atteint d’un trouble immunitaire. RhoG appartient à la sous-famille Rac et joue un rôle essentiel dans le remodelage du cytosquelette d’actine, la formation de protrusions membranaires et la migration cellulaire via la voie de signalisation ELMO–DOCK.

Publiée dans Biochemical Journal, l'étude montre que la mutation G12E abolie l’hydrolyse du GTP, qu’elle soit intrinsèque ou stimulée par les GAP, entraînant une accumulation de RhoG sous sa forme liée au GTP et interagissant avec son effecteur ELMO-1. Contrairement aux attentes, cette forme « active » ne renforce pas la signalisation de RhoG. Les cellules exprimant RhoGG12E présentent une profonde réorganisation du cytosquelette, un étalement accru, une augmentation des adhérences focales et une diminution de leurs capacités migratoires, des caractéristiques évoquant plutôt une perte de fonction de RhoG qu’une hyperactivation.

Ces travaux soulignent l’importance du cycle dynamique d’activation/inactivation de RhoG pour assurer ses fonctions cellulaires et invitent à la prudence dans l'utilisation de variants Gly12, qui ne doivent pas être considérées systématiquement comme des formes constitutivement actives.

-> Contact : agata.maalouf@ens-paris-saclay.fr / franck.gesbert@ens-paris-saclay.fr

Quentin Rougemont est chargé de recherche au CNRS depuis la fin de l’année 2025. Il effectue ses recherches à l’Institut Diversité Ecologie et Evolution du Vivant - IDEEV (CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) dans le laboratoire Écologie, société et évolution - ESE (UPSaclay/CNRS/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette). Après un BTS et une école d’ingénieur agronome, il poursuit en thèse à l’INRAE de Rennes ou il s’intéresse aux mécanismes de spéciation chez les lamproies d’Europe sous la supervision de Guillaume Evanno et Sophie Launey. Ses travaux mettent en évidence le faible isolement reproducteur des espèces. Ils révèlent des régions génomiques impliquées dans les stratégies de vie et soulignent l’importance de reconstruire l’histoire démographique des espèces (c’est-à-dire des tailles de populations, temps de divergence, taux de migrations) avant d’inférer quelles régions sont potentiellement sous sélection.

Il poursuit ses recherches à l’Université Laval à Québec, au sein du laboratoire de Louis Bernatchez sur diverses espèces de poissons, comme le saumon atlantique, le saumon coho, le capelan, les sébastes ou encore le homard d’Amérique. Il met en évidence le rôle crucial de l’histoire démographique sur les patrons de diversité génétique de ces espèces. Il démontre les conséquences de la démographie en montrant des différences d’efficacité de sélection et de fardeau génétique entre populations de saumon coho situées à la limite septentrionale de l’air de répartition et celles plus au sud. Une partie de ces travaux porte sur l’étude de la sélection et de l’adaptation locale.

De retour en France dans l’équipe de Mathieu Joron (CEFE, CNRS), il délaisse les poissons pour s’intéresser aux papillons du genre Heliconius, un groupe d’espèce possédant une très grande diversité à la fois phénotypique, écologique et génétique. Ces travaux révèlent que des processus d’introgression (échange de gènes) peuvent avoir lieu entre espèces très fortement divergentes.

Arrivée fin 2022 au sein de l’équipe GEE, il étudie l’évolution des chromosomes sexuels et leur dégénération, à la fois sur les plantes du genre Silène, mais aussi sur les champignons du genre microbotryum qui infectent ces plantes. Ces travaux portent sur la quantification de la dynamique de perte et gain de gènes au cours du temps dans les chromosomes sexuels. Plus récemment, il a commencé un retour à sa passion, à savoir l’inférence de la spéciation et l’identification des régions génomiques impliquées dans l’isolement reproducteur, qualifiées de régions « barrières ». En particulier, il s’intéresse à quantifier la vitesse à laquelle ces barrières s’accumulent à l’échelle micro-évolutive (sur des temps cours) afin de tester si cette vitesse d’accumulation est prédictive de la vitesse de spéciation mesurée à une échelle macro-évolutive (sur des temps longs). À l’heure actuelle ce lien entre micro- et macro- évolution reste mal connu alors même que la micro-évolution devrait apporter des éléments de réponses quant à la nature de ce lien.

“Nothing in Biology Makes Sense Except in the Light of Evolution” - Theodosius Dobzhansky

“Nothing in evolution makes sense except in light of population genetics” - Michael Lynch

-> Contact : quentin.rougemont@universite-paris-saclay.fr

Décerné par le Cancer Research Institute (CRI), le William B. Coley Award for Distinguished Research in Basic and Tumor Immunology, a été attribué au Pr Éric Vivier, titulaire de la Chaire Cellules Natural Killer (NK) de la Fondation Gustave Roussy et président du Paris-Saclay Cancer Cluster. Cette distinction, l'une des plus prestigieuses en immunologie du cancer, récompense l'ensemble de ses travaux qui ont profondément transformé la compréhension de l'immunité antitumorale et ouvert la voie à de nouvelles approches thérapeutiques.

Lire la suite de l’Actu Gustave Roussy

Les grands modèles linguistiques (LLM) transforment progressivement la recherche en sciences de la vie bien au-delà d’une simple amélioration de la productivité, et s’imposent comme une nouvelle norme avant même que les scientifiques ne se soient mis d’accord sur les limites de leur utilisation. Une étude internationale menée par Ivan Jaric, chercheur au Laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette), décrit ce phénomène comme la « normalité rampante » de l’intelligence artificielle (IA) générative, un processus dans lequel des changements profonds finissent par être acceptés parce qu’ils se produisent de manière progressive, par petites étapes subtiles.

« Alors que l’IA générative s’est rapidement intégrée aux flux de travail quotidiens de nombreux chercheurs, ses effets à long terme sur presque tous les aspects de la science ont fait l’objet d’une attention relativement limitée », explique Ivan Jarić, auteur principal de l’étude. « Le recours systématique à ces outils pourrait remodeler en profondeur les fondements de la pratique et de la culture scientifiques », ajoute-t-il.

Lire la suite de l’actu ESE et l’article paru dans Frontiers in Ecology and the Environment.

-> Contact : ivan.jaric@universite-paris-saclay.fr