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May 11, 4:50 PM
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EvryRNA est une plateforme logicielle génopolitaine qui met à disposition de la communauté scientifique des outils pour l’analyse des acides ribonucléiques (ARN) non-codants. Ces molécules ont révélé ces dernières décennies leur rôle majeur dans les mécanismes biologiques et dans diverses maladies dont les cancers. La plateforme EvryRNA, dirigée par le Pr Fariza Tahi, est hébergée au sein du laboratoire IBISC (Informatique, Bio-informatique et Systèmes Complexes - Université d’Évry Paris-Saclay). Elle fait partie des 23 infrastructures et plateformes mutualisées sur le biocluster Genopole. L’équipe Bioinformatique des ARN dirigée par Fariza Tahi a développé 5 nouvelles contributions computationnelles dédiées à l’analyse des ARN qui viennent s’ajouter au panel d’outils interactifs librement accessibles sur la plateforme EvryRNA. Les outils développés permettent ainsi d’identifier les ARN dans les séquences génomiques, de déterminer leur caractère codant ou non-codant, ou encore de prédire leurs conformations dans l’espace, déterminantes pour leur fonction. Les ARN ont en effet la propriété de se replier grâce aux liaisons des acides ribonucléiques qui les constituent. Focus sur les 5 nouvelles contributions. La première, nommée MMnc, est une méthode basée sur de l’apprentissage profond permettant la prédiction et la classification des ARN non-codants. Elle exploite plusieurs sources de données (telles que la séquence, la structure secondaire et l'expression) à l'aide d'une intégration de données multimodale basée sur l'attention. Elle permet par ailleurs une représentation interprétable des résultats de classification grâce notamment aux cartes auto-organisatrices (SOM). MMnc peut être ré-entrainé sur de nouveaux sets de données. MMnc offre la possibilité d’intégrer de nouvelles sources de données pour une meilleure caractérisation des classes d’ARN. La deuxième, appelée « State-of-the-RNArt », est une revue complète des méthodes actuelles de prédiction des structures 3D d’ARN. A travers un benchmark d’une dizaine d’outils existants, les prédictions des différentes méthodes ont été comparées sur des jeux de données actuels. Un outil de visualisation est aussi disponible afin d’avoir un aperçu visuel des différentes prédictions. State-of-the-RNArt offre une visualisation des structures 3D prédites avec leurs comparaisons (alignement) avec les structures de référence ou natives. State-of-the-RNArt propose des comparaisons avec un grand nombre de métriques calculées grâce à RNAdvisor, un autre outil développé par les membres de la plateforme EvryRNA. La troisième, RNAAdvisor2, est une version web serveur de l’outil RNAdvisor pour le calcul intégré des différentes métriques d’évaluation de prédiction de structures 3D d’ARN. Dans cette version, une nouvelle fonction de notation a été ajoutée permettant de comparer entre elles les structures prédites et d’évaluer la qualité structurelle dans l'espace des angles de torsion. RNAAdvisor2 permet aux utilisateurs d'effectuer des évaluations de la qualité des structures d’ARN sans avoir à installer toutes les différentes exigences pour chaque métrique d’évaluation ou fonction de notation. RNAAdvisor2 fournit une visualisation des structures ainsi que de leurs alignements. La quatrième est AlphaFold 3 for RNAs, un travail d’évaluation et de comparaison de la dernière version d’AlphaFold, AlphaFold 3 (https://doi.org/10.1038/s41586-024-07487-w) pour la prédiction des structures 3D des ARN. Une visualisation des structures 3D prédites sur différents jeux de données et avec différentes métriques d’évaluation est fournie, ainsi que leurs alignements (superpositions) avec les structures natives ou de références. Enfin, la cinquième contribution récemment mise en ligne est RNA-TorsionBERT, un outil qui permet la prédiction des angles de torsion d’ARN à partir d’un modèle de langue pré-entraîné. La connaissance des angles de torsion des ARN pour chaque résidu peut aider à reconstruire son repliement global. RNA-TorsionBERT prédit des angles de torsion de la structure 3D à partir de la séquence seule, un atout pour la prédiction de la structure de nouveaux ARN orphelins. Les ARN non-codants ouvrent un large champ scientifique. Les deux dernières décennies ont été le théâtre de la découverte d’une multitude d’ARN non-codants, issus des régions de notre génome qui ne codent pas de protéines et que l’on a longtemps pensé inutiles. Les biologistes connaissaient bien la fonction des ARN ribosomiques et des ARN de transfert pour traduire le message des gènes en protéines. Mais récemment, ils ont révélé le rôle biologique essentiel de nombreux autres ARN (micro-ARN, petits ARN interférents, longs ARN non-codants...). Ces ARN non-codants agissent comme des régulateurs de l’expression des gènes, donc comme des acteurs du développement des organismes, de l’adaptation aux changements environnementaux, etc. Ils interviennent dans les processus biologiques, mais aussi dans les maladies, notamment les cancers et les maladies neuro-dégénératives. Mieux connaître les ARN non-codants pourra notamment contribuer à mieux comprendre ces pathologies, mais aussi à envisager de nouvelles approches thérapeutiques. Une plateforme labellisée et soutenue par Genopole. Genopole soutient l’activité de la plateforme EvryRNA, profitable notamment à son axe stratégique des thérapies innovantes. Plus d’information sur EvryRNA ? cliquer ici -> Contact : Fariza.Tahi@univ-evry.fr / Julien.Picot@genopole.fr Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI La plateforme a déjà publié plusieurs FOCUS PLATEFORME ces dernières années. Les relire ? GENOPOLE / Plate-forme logicielle de bioinformatique EvryRNA. La plateforme EvryRNA est une plateforme logicielle mettant à disposition de la communauté scientifique différents logiciels dédiés aux ARN non-codants pour la prédiction de leurs structures 2D et 3D, la prédiction des structures de complexes d'ARN, la prédiction et la classification d'ARN non-codants, l'identification et la prédiction à grande échelle dans des séquences génomiques d'ARN non-codants, notamment les petits ARN : microARN, piARN, etc. Tous les logiciels disponibles sur la plateforme EvryRNA ont fait l'objet de publications scientifiques à comité de lecture. A propos de Genopole. Biocluster français dédié à la recherche en génomique et aux biotechnologies appliquées à la santé et à la bioéconomie, Genopole réunit 78 entreprises, 17 laboratoires de recherche académiques, 23 infrastructures, plateformes et plateaux techniques mutualisés, ainsi que des formations universitaires (Université d’Évry Paris-Saclay). Son objectif : favoriser l’émergence et la croissance de sociétés de biotechnologie, le transfert d’innovations vers le secteur industriel, le développement de la recherche et l’enseignement supérieur en sciences de la vie. Genopole est un Groupement d’intérêt public principalement soutenu par l’État, la Région Ile-de-France, le Département de l’Essonne, l’agglomération Grand Paris Sud, la Ville d’Évry-Courcouronnes et l’AFM-Téléthon.
Le prochain café se tiendra le 23 mai 2025 en visioconférence de 13h30 à 14h. Au programme : "ARN, épitranscriptomique, cellule unique : expertises à la plateforme de séquençage à haut débit de l'I2BC" par Céline Hernandez. - Pour assister en visioconférence : ICI
- Pour devenir orateur/oratrice : ICI
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May 16, 12:08 PM
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« Tournesol » est le Partenariat Hubert Curien (PHC) mis en place avec la communauté française de Belgique. Il est mis en œuvre en France par les ministères de l'Europe et des Affaires étrangères (MEAE) et de l'Enseignement supérieur et de la Recherche (MESR), et en Belgique, par Wallonie-Bruxelles International (WBI) et le Fonds de la Recherche Scientifique (F.R.S.-FNRS). - Ouverture de l’appel : 17/03/2025
- Date limite de co-dépôt des dossiers de candidature : 16/06/2025
- Plus d’information
- ATTENTION, il s’agit ici du PHC avec la communauté française de Belgique (fédération Wallonie Bruxelles), pour le PHC avec la communauté flamande cliquez ici.
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May 16, 11:55 AM
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La Fondation Recherche Endométriose (FRE), créée en 2021 avec l’association ENDOmind et sous l’égide de la Fondation pour la Recherche Médicale, a pour mission d’accélérer la recherche sur l’endométriose. Dans le cadre de cette mission, un des objectifs majeurs de la Fondation est de soutenir financièrement des projets de recherche portés par des équipes françaises de recherche publique, via son appel à projets annnuel. Orientations stratégiques de la FRE Depuis sa création, la FRE a lancé 4 appels à projets et soutenu 14 projets de recherche. Afin d’augmenter son impact en focalisant plus ses moyens, et d’accompagner au mieux les projets et les chercheurs, le Comité Exécutif de la FRE a décidé de cadrer les thèmes de recherche, voire d’être à l’origine des projets. C’est ce qui a été fait en mettant en place et en co-finançant une collaboration avec l’Institut Curie sur la comparaison entre lésions d’endométriose et lésions du cancer de l’ovaire qui démarre cette année. La FRE a également initié une réflexion scientifique multidisciplinaire sur le lien entre les microbiotes et l’endométriose. Ce travail servira à cadrer un appel à manifestation d’intérêt afin que des travaux financés par la FRE puissent démarrer début 2026. Appel à projets 2025 Pour l’année 2025, la FRE lance un appel à projets resserré sur le thème de la compréhension et la prise en charge de la douleur et de la qualité de vie dans l’endométriose. La FRE soutiendra un projet de recherche sur l’endométriose à hauteur de 50 000 € maximum. Les approches innovantes, exploratoires, susceptibles d’améliorer la compréhension et la prise en charge de la douleur dans l’endométriose, sont particulièrement encouragées. Les projets candidats peuvent être des projets de recherche clinique (observationnelle ou interventionnelle) ou de recherche en sciences humaines et sociales. Les projets de recherche fondamentale sont exclus de cet appel à projets. Les projets intègreront de préférence un aspect de compréhension de la douleur et devront avoir un impact direct sur la prise en charge des patientes. Seront également pris en compte les éléments suivants : - Les projets réalisés en collaboration avec une équipe internationale et/ou avec une équipe d’une autre discipline, connexe à l’endométriose.
- L’intègration des patientes dans leur construction (approche dite patient and public involvement (PPI)).
Les documents à remplir pour postuler -> Date d’ouverture de l’AAP 2025 : 30 avril 2025 -> Date limite de soumission : 15 juillet 2025, 23h59. Plus d’informations
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May 16, 11:08 AM
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La Fondation Mérieux dispose d’un programme de subventions destiné au soutien d’initiatives locales visant à lutter contre les maladies infectieuses dans les pays en voie de développement, particulièrement les projets relatifs à la santé maternelle et infantile. Les projets sélectionnés recevront un soutien financier d’un montant maximum de 5000 euros. Deux sessions annuelles sont organisées afin d’étudier les candidatures. - Période de soumission des dossiers : du 1er mai au 1er août
- Partage des résultats : au plus tard le 1er décembre
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May 16, 10:54 AM
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The European Innovation Council (EIC) is inviting proposals through the Open Call of its EIC Transition stream, which funds innovation activities that go beyond the experimental proof of principle in laboratory. Support is available for both the maturation and validation of a novel technology in the lab and in relevant application environments as well as the development of a business case and business model towards the innovation's future commercialisation. Proposed activities must include further technology development on the results achieved in a previous project and follow user-centric methodologies to increase chances of the innovation's future success in the market. Projects should address, in a balanced way, both technology and market/business dimensions, possibly including iterative learning processes based on early customer or user feedback. The activities must in all cases address market readiness towards commercialisation and deployment (market research, business case, prospects for growth, intellectual property protection, competitor analysis etc) and other relevant aspects of regulation, certification and standardisation, aimed at getting both the technology and the business idea investment-ready. By the end of the Transition project, applicants should be ready for the next stage, which can be to apply for EIC Accelerator (for SMEs, including start-ups or spin-offs), to seek other investors or sources of funding, to enter licensing or collaboration agreements with third parties, or other routes to market deployment. Applications may be submitted by either: - A single legal entity, either an SME or a research performing organisation (university, research or technology organisation, including teams, individual Principal Investigators and inventors in such institutions who intend to form a spinout company). Larger companies that do not qualify as SMEs are not eligible to apply as a single legal entity; or
- A small consortium of a minimum of two and a maximum of five independent legal entities, which may include, for example, universities, research organisations, SMEs or larger companies, user/customer organisations or potential end-users (such as hospitals, utilities, industry, regulatory and standardisation bodies, public authorities).
A total indicative budget of €98 million is available in 2025. Grants of up to €2.5 million (or more if properly justified) are available to validate and demonstrate technology in application-relevant environment (eg TRL 3/4 to 5/6) and develop market readiness. Projects may also receive additional grants of up to €50,000 to undertake portfolio activities. Applications should be submitted by the 17 September 2025 (17:00 Brussels time) deadline. More information
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May 16, 10:40 AM
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Le Programme de recherche Mathématiques en interaction (PEPR Maths-Vives) vise à développer et renforcer les interactions entre les mathématiques et d’autres domaines scientifiques, notamment les sciences du vivant, de l’environnement et de la société. Ce programme s’inscrit dans une dynamique de collaboration pluridisciplinaire pour répondre aux défis scientifiques et sociétaux actuels. Les objectifs de Maths-Vives sont d’encourager l’intégration des mathématiques dans d’autres disciplines relevant de : Le PEPR Maths-Vives ouvre en avril 2025 un second appel à projets à court terme pour des financements de contrats doctoraux de 36 mois dans le périmètre scientifique du programme pour la rentrée 2025. - date limite de candidature : 20 mai 2025
- durée de financement : 36 mois
- contrats doctoraux : 2
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May 16, 6:54 AM
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Nominations Open: Canada Gairdner Awards
2026 Gairdner Award Nominations are now open Nominations are open worldwide for researchers at the forefront of biomedical discovery or global health science. The Canada Gairdner International Award ($250 000 per recipient) is awarded annually to five researchers who have made original contributions resulting in an increased understanding of human biology and disease. The John Dirks Canada Gairdner Global Health Award ($100 000 per award) is awarded annually to an individual/co-contributors whose scientifically-based research has improved the health and well-being of those facing health inequities worldwide. All nominations are due October 1, 2025 More information
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May 14, 4:29 AM
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Les ministères de l'Europe et de la Recherche et leurs partenaires financent les mobilités de chercheurs souhaitant construire des collaborations avec le Brésil via deux dispositifs. Dates limites : 11 juin 2025 pour la première initiative et 17 juillet 2025 pour la seconde.
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May 14, 3:53 AM
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Pendant son cycle sexuel, la paramécie réorganise massivement son génome en éliminant des dizaines de milliers de séquences internes (IES) du noyau somatique en développement, grâce à l’introduction programmée de cassures double brin de l’ADN (CDB), efficacement réparées par la voie NHEJ de jonction d’extrémités non homologues. Dans ce système, la réparation des CDB nécessite non seulement les acteurs essentiels du NHEJ, Ku70/80 et Xrcc4/Lig4, mais aussi des enzymes capables de maturer avec précision les extrémités 5' de 4 bases sortantes, générées aux sites d’excision des IES. Dans une étude publiée dans Nucleic Acids Research, des chercheurs du département de Biologie des Génomes de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) ont identifié chez Paramecium tetraurelia quatre orthologues de l’ADN polymérase lambda humaine —PolXa, PolXb, PolXc et PolXd— comme acteurs-clés de la réparation des jonctions d’excision des IES. Les cellules dépourvues de ces enzymes PolX présentent de nombreux dommages dans leur génome, dont des cassures non réparées, de courtes délétions intrachromosomiques et la rétention de leurs IES. Les quatre protéines PolX sont capables de maturer les extrémités d’ADN, mais PolXa et PolXb présentent la particularité d’être spécifiquement produites au moment des réarrangements programmés du génome et portent une unique région interne qui favorise leur localisation nucléaire. Ces travaux montrent que, contrairement à PolXc, PolXa se concentre dans des foyers nucléaires avec certains facteurs-clés du NHEJ et une enzyme de type Dicer impliquée dans la production de petits ARN spécifiques des IES, qui régulent leur excision. Ces foyers pourraient être les sites où les IES excisées sont ligaturées les unes aux autres sous forme de concatémères utilisés comme matrices pour la production de petits ARN, établissant ainsi un lien entre réparation de l’ADN et contrôle par l’ARN de la dynamique du génome. -> Contact : mireille.betermier@i2bc-paris-saclay.fr / julien.bischerour@i2bc.paris-saclay.fr
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May 14, 3:27 AM
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Dans une étude publiée dans Hepatology, les scientifiques de l’UMR-S 1193 (INSERM/UPSaclay, Villejuif) ont étudié le rôle de la protéine antimicrobienne REG3A dans le cancer primitif du foie. Les auteurs révèlent que REG3A agit comme un suppresseur de tumeur en réduisant l'O-GlcNAcylation, une modification protéique favorisant le cancer, sans affecter les enzymes qui régulent ce processus. Au lieu de cela, REG3A diminue les niveaux d'UDP-GlcNAc, le substrat de l'O-GlcNAcylation, grâce à sa capacité à se lier au glucose et au glucose-6-phosphate. Dans des modèles murins et des échantillons de foie humain, une expression plus élevée de REG3A était associée à une réduction de l'O-GlcNAcylation et à un risque moindre de cancer. Ces résultats mettent en évidence un nouveau mécanisme de régulation du cancer via l'activité de liaison aux glucides de REG3A. -> Contact : jamila.faivre@inserm.fr
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May 13, 5:20 PM
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Lorsqu'on pense aux symboles de conservation, on pense généralement à des espèces emblématiques : pandas, tigres, éléphants, ours polaires, dauphins, etc. Ces animaux emblématiques, appelés espèces porte-drapeau, sont largement utilisés dans les campagnes de conservation pour capter l'attention du public et mobiliser le soutien aux objectifs de conservation. Cependant, une nouvelle étude menée par une équipe internationale de chercheurs soutient que le concept de porte-drapeau de conservation peut et doit être beaucoup plus diversifié, en s'étendant au-delà des espèces porte-drapeau à un éventail plus large de catégories porte-drapeau. Bien qu’une entité porte-drapeau puisse certainement être un animal, selon une étude publiée dans Biological Conservation, elle peut également être une forêt, un récif corallien, un individu « célèbre » comme la tortue « Georges le Solitaire », ou même un événement naturel spectaculaire comme la floraison massive, l’émergence d’éphémères d’une rivière ou les migrations de papillons monarques, à condition que cela aide les gens à se connecter émotionnellement à un objectif de conservation. L'étude collaborative internationale coordonnée par Ivan Jarić du laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette) propose une feuille de route stratégique pour sélectionner et utiliser efficacement le type de campagne porte-drapeau adapté à chaque public et objectif de conservation. Elle vise à encourager les défenseurs de l'environnement à planifier leurs campagnes comme des spécialistes du marketing et à choisir leur campagne porte-drapeau en fonction des préférences du public et des valeurs culturelles. Les auteurs suggèrent que les campagnes porte-drapeau de conservation les plus efficaces ne sont pas toujours les animaux les plus grands, les plus colorés ou les plus célèbres, mais que ce qui compte le plus, c'est leur capacité à toucher des publics spécifiques. La perte de biodiversité menaçant les écosystèmes du monde entier, il est crucial de repenser la manière dont nous suscitons le soutien du public et ce qui fait l'efficacité d'une campagne de conservation. Légende Photo : Aperçu des différentes catégories porte-drapeau, avec l’écosystème du Grand Yellowstone comme exemple : le Grizzly 399 comme individu porte-drapeau – une femelle grizzly, considérée comme l’ours le plus célèbre de l’écosystème du Grand Yellowstone, attire énormément l’attention et stimule le tourisme ; le grizzly comme espèce porte-drapeau ; les grands prédateurs, dont l’ours noir américain, le loup et le puma, comme flotte porte-drapeau ou communauté porte-drapeau ; l’écosystème du Grand Yellowstone et le parc national de Yellowstone comme écosystème porte-drapeau ou aire protégée porte-drapeau ; l’incendie de forêt visible en arrière-plan représente un événement porte-drapeau, tandis que le dessin de l’ours Smokey Bear sur le panneau représente un porte-drapeau fictif. Illustration : Snežana Leskovar et Irena Jarić. -> Contact: ivan.jaric@universite-paris-saclay.fr
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May 13, 4:56 PM
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Les organites sans membrane sont des condensats biomoléculaires qui organisent spatialement et temporellement l’activité de nombreuses protéines ou acides nucléiques en les concentrant localement ou en les séparant de leur partenaires. Ces condensats se forment par séparation de phase liquide-liquide de protéines intrinsèquement désordonnées. Ce sont des structures dynamiques qui s'assemblent et se désassemblent rapidement en fonction de leur environnement physico-chimique. Les séparations de phase contrôlées par la température sont particulièrement intéressantes car elles participent aux mécanismes moléculaires de la réponse cellulaire aux stress thermiques. Par exemple, chez Arabidopsis, la protéine FRI, qui active le promoteur du locus de floraison C (FLC), forme des condensats nucléaires après une exposition au froid, la séparant de FLC et réduisant son activité transcriptionnelle. Pour comprendre les facteurs physico-chimiques qui gouvernent la formation réversible de ces condensats, Yingmin Jiang et Tâp Ha-Duong du Groupe de Modélisation Moléculaire de BioCIS (CNRS/UPSaclay, Orsay) ont développé un modèle gros-grain de protéines intrinsèquement désordonnées permettant de simuler par dynamique moléculaire leur séparation de phase dépendante de la température. Dans leur étude publiée dans Journal of Chemical Theory and Computation, les chercheurs ont mené des simulations qui reproduisent fidèlement les deux types de séparations de phase contrôlées par la température, celles se produisant en dessous d’une température critique dite UCST (Upper Critical Solution Temperature) et celles se produisant au dessus d’une LCST (Lower Critical Solution Temperature). Ces modélisations soulignent l’importance des acides aminés hydrophobes et chargés des protéines intrinsèquement désordonnées sur leur propriété UCST ou LCST. Elles ouvrent de nouvelles voies pour étudier l’impact des mutations et modifications post-traductionnelles sur la dynamique des condensats et leurs éventuels dysfonctionnements pathologiques. -> Contact : tap.ha-duong@universite-paris-saclay.fr
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May 16, 12:33 PM
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Seulement 2% des produits alimentaires consommés en Île-de-France sont locaux. Une réalité qui interpelle quand on sait que la région est par ailleurs une terre agricole qui exporte par exemple ses céréales. Pourrait-on dès lors remédier à cette situation ? L’Île-de-France, région la plus riche du pays, concentre 30 % du PIB et une forte proportion de diplômés, tout en jouissant d’une réputation internationale. Cependant, elle est presque totalement dépendante de l’extérieur pour son alimentation, avec seulement 2 % des produits alimentaires provenant de la région selon une étude de 2017 et 5 à 7 jours d’autonomie en cas de crise. Ces chiffres posent à la fois des questions de sécurité, de souveraineté et d’autosuffisance, et interrogent l’ensemble du système alimentaire, de la production à la consommation. Du champ jusqu’à l’assiette, comment peut-on l’expliquer et comment, surtout, pourrait-on rendre l’Île-de-France plus autonome sur le plan alimentaire ? Lire l’intégralité de l’article dans The Conversation rédigé par Agnès Lelièvre (Maître de conférences en agronomie, AgroParisTech/UPSaclay), Christine Aubry (Fondatrice de l’équipe de recherche INRAE « Agricultures urbaines », UMR Sadapt AgroParisTech/UPSaclay), Clotilde Saurine (Animatrice de réseau sur le sujet de l'alimentation, AgroParisTech/UPSaclay), Doudja Saïdi-Kabeche (Enseignante-Chercheuse en siences de Gestion, AgroParisTech/UPSaclay) et Fanny Provent (Ingénieure agronome).
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May 16, 12:15 PM
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May 16, 12:02 PM
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This program seeks to advance the development of innovative molecular MRI (mMRI) techniques that directly quantify molecular and cellular events in Parkinson’s disease (PD). Full proposals that focus on the following molecular and cellular pathways associated with PD are invited to apply: - Endolysosomal Dysfunction: Approaches to detect disruption in lysosomal activity, pathological protein accumulation, autophagy, etc.
- Mitochondrial Impairment: Methods to measure mitochondrial bioenergetics, oxidative stress, metabolic changes and track mitochondrial dysfunction in-vivo.
- Neuroinflammation & Immune System Dysregulation: Strategies to detect and visualize inflammatory markers, quantify blood-brain barrier integrity, etc.
Application Process: Funding Schedule: - Full Proposals Due: July 14, 2025, 5 p.m. US ET
- Anticipated Award Announcement: November 2025
- Anticipated Funding: December 2025
Funding Details: Duration: 6 months to 2 years Award Amount: Up to $400,000 The budget should be commensurate with the work proposed. More information
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May 16, 11:30 AM
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La Ligue nationale contre le Cancer (LNCC), la Fondation ARC pour la recherche sur le cancer et l’Institut national du cancer (INCa) ont souhaité œuvrer ensemble afin de développer et soutenir un nouveau PAIR dédié au dépistage des cancers de la prostate. Cet appel à projets, centré sur le dépistage des cancers de la prostate, concerne des projets ayant pour ambition de répondre à des questions potentiellement issues de toutes les disciplines qui seront abordées par une approche transversale et intégrative afin d’améliorer les connaissances et la prise en charge de ces cancers. Plusieurs axes de réflexions ont été identifiés (détaillés ci-dessous) et les questions posées pourront s’inscrire dans ces différentes problématiques, en respectant autant que possible une dimension pluridisciplinaire et transversale. - Axe 1 : Amélioration des connaissances sur les facteurs de risque des cancers de la prostate
- Axe 2 : Optimisation des outils existants & Recherche de nouveaux outils – Stratification des patients
- Axe 3 : Sciences Humaines et Santé publique
L’ambition de ce PAIR est de pouvoir demain dépister de façon plus précise, en connaissant mieux les personnes à risque élevé, avec de nouveaux outils de dépistages, de nouvelles technologies moins invasives, plus facilement acceptables, et plus fiables que les tests actuels. À l’occasion de la publication de cet appel à projets, vous pouvez retrouver ici les présentations faites lors du séminaire de lancement de ce PAIR le 9 décembre 2024. Date d'ouverture de l'appel à projets : 30 avril 2025 Date limite de soumission : 5 septembre 2025 à 12:00 Documents
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May 16, 11:02 AM
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AAP type 1 diabetes (T1D) research
Breakthrough T1D has released two new Requests for Application under its Early Detection of type 1 diabetes (T1D) research portfolio to support research aiming to improve detection and diagnosis of T1D. The calls are operating a parallel application schedule and focus on early detection of adult onset T1D and improving genetic risk assessment for screening. Applicants must first submit a Letter of Intent by the deadline on 10 June 2025. More information
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May 16, 10:44 AM
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Le PHC Galilée est le Partenariat Hubert Curien franco-italien. Il est mis en œuvre par le Ministère de l’Europe et des Affaires étrangères (MEAE) et le Ministère chargé de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche (MESR) et dans le pays partenaire par le Ministero dell’Università e della Ricerca (MUR).
Les appels à candidatures de ce programme sont lancés sur un rythme annuel.
Date limite de dépôt des dossiers de candidature : 21/05/2025 Plus d'informations
Huit postes sont ouverts au recrutement de doctorantes et doctorants dans le cadre de l'appel STAND UP FOR SCIENCE dans les domaines suivants : changement climatique, sciences environnementales, santé globale, sciences humaines et sociales et transition énergétique. Public concerné pour candidater en France : étudiantes et étudiants résidant aux Etats-Unis en 2025, éligibles pour préparer un PhD, ayant un diplôme américain équivalent à un Bac +5. Sont également éligibles les étudiantes et étudiants résidant aux Etats-Unis en 2025 ayant débuté un doctorat aux Etats-Unis très récemment. Le calendrier de la campagne - Du 25 avril au 30 juin 2025 : dépôt de projets doctoraux sur ADUM par les directeurs et directrices de thèse
- Dans l'interface ADUM du directeur de thèse Rubrique "Propositions de thèse"
- Sélection : type de Financement du projet doctoral "PhD call Stand up for Science UPSaclay"
- Du 1er juillet au 31 août 2025 : dépôt des candidatures par les étudiantes et étudiants sur les sujets via la page web et la plateforme ADUM
- Septembre 2025 : audition des candidats par les Ecoles Doctorales et sélection des lauréats par la commission mise en place par le collège doctoral
- A partir de janvier 2026 : inscription des doctorantes et doctorants et mise en place des contrats doctoraux
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May 16, 6:41 AM
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L’appel se clôturera le 10 septembre 2025 et devrait financer 1650 projets MSCA post doctoral Fellowships 2024 : la France affiche un taux de succès de 17,4% (contre 16,6% à l’échelle européenne) avec l’obtention de 160 projets sur 932 propositions déposées Taux de succès par panel Les 1614 projets financés L'appel est ouvert aux candidatures dans tous les domaines scientifiques Les bourses comprennent - Bourses postdoctorales européennes, ouvertes aux chercheurs de toute nationalité pour mener à bien un projet personnalisé dans l'Union européenne (UE) ou dans les pays associés à Horizon Europe pendant une durée maximale de 24 mois
- Bourses postdoctorales mondiales, ouvertes aux ressortissants de l'UE et des pays associés à Horizon Europe ou aux résidents de longue durée souhaitant travailler avec des organisations dans des pays tiers pendant une période de 12 à 24 mois, avant de retourner en Europe pendant 12 mois
Les deux types de bourses peuvent également inclure des détachements de courte durée n'importe où dans le monde pendant la durée de la bourse (sauf pendant la phase de retour d'une bourse mondiale). Afin de créer des passerelles entre le secteur académique et non académique, les chercheurs peuvent bénéficier d'un soutien supplémentaire pour effectuer un stage d'une durée maximale de six mois dans une organisation non académique basée dans un État membre de l'UE ou un pays associé à Horizon Europe. Ce stage doit avoir lieu à la fin de leur bourse. Conditions pour les chercheurs et les organisations Les bourses postdoctorales MSCA sont ouvertes aux chercheurs postdoctoraux du monde entier, de toute nationalité et à tout stade de carrière, avec un maximum de 8 ans d'expérience en recherche après leur doctorat. Certaines exceptions et conditions spécifiques s'appliquent, par exemple pour les bourses postdoctorales mondiales. Les chercheurs doivent élaborer une demande avec leur futur superviseur et postuler avec leur futur organisme d'accueil, qui peut être - Une université
- Une institution ou un établissement de recherche
- Une entreprise, une petite ou moyenne entreprise
- Un hôpital ou une ONG
- Un gouvernement, une institution publique ou un organisme
- Toute autre organisation basée dans un État membre de l'UE ou dans un pays associé à Horizon Europe+Suisse
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May 14, 4:12 AM
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Jérôme Le Pavec, Lauréat du Grand prix ISHLT 2025 dédié à l'immunomodulation par la photophérèse extracorporelle en transplantation pulmonaire
Le Pr Jérôme Le Pavec du Service de Chirurgie Thoracique, Vasculaire et Transplantation Cardio-pulmonaire et UMR-S 999 (Inserm/UPSaclay, Hôpital Marie-Lannelongue, Le Plessis-Robinson) s’est vu remettre le grand prix du congrès mondial de transplantation pulmonaire pour la recherche en immunomodulation par la photophérèse extracorporelle le 30 avril dernier à Boston. Ce prix couronne une équipe dont le projet est considéré comme le plus innovant et alloue 90 000 $ à ses bénéficiaires. La dysfonction chronique du greffon pulmonaire (CLAD) reste la principale cause de mortalité à long terme après transplantation pulmonaire, malgré des traitements immunosuppresseurs standards. La photophérèse extracorporelle (PEC) apparaît comme une option prometteuse, mais son efficacité reste insuffisamment évaluée par des essais cliniques robustes dans cette indication. Le projet BIO-ECP a pour but principal d’évaluer l'impact de la PEC sur la charge de l’ADN libre circulant dérivé du donneur (dd-cfDNA), un biomarqueur émergent reflétant l'agression du greffon. L’étude vise aussi à mieux comprendre les facteurs prédictifs de réponse à la PEC et à observer son effet sur la fonction pulmonaire et la qualité de vie des patients. Cette récompense décernée par la communauté internationale de transplantation pulmonaire constitue une reconnaissance majeure pour la qualité du projet et l'expertise des équipes impliquées dans le projet (Service de Transplantation pulmonaire de Foch et Marie Lannelongue). Ce prix apporte par ailleurs une pierre financière significative à l'édifice scientifique du projet agissant comme un levier pour une mise en place prochaine du projet. Il s'agit d'un travail collaboratif avec l'équipe de transplantation de Foch illustrant la pleine synergie des 2 services de transplantation et l'implication sans réserve dans la recherche translationnelle au service des patients. -> Contact : j.lepavec@ghpsj.fr
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Life Sciences UPSaclay
May 14, 3:43 AM
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L'ADN ancien offre une opportunité unique d'étudier l'histoire et la propagation des maladies infectieuses. Dans une étude publiée dans Journal of Infectious Disease, une équipe du Laboratoire Anthropologie, Archéologie, Biologie - LAAB (UFR Simone Veil - santé UVSQ/UPSaclay, Montigny-Le-Bretonneux), en association avec l'Institut Pasteur et le Muséum National d'Histoire Naturelle, a analysé 21 échantillons d'une collection d'étuis péniens du XXe siècle, provenant de Papouasie-Nouvelle-Guinée, de Papouasie (Indonésie) et du Vanuatu, et conservée au Musée du quai Branly-Jacques Chirac à Paris. Malgré la présence d'espèces environnementales, ils ont identifié des bactéries associées à l'homme mais également une trace génétique d'une forme ancienne du virus d'Epstein-Barr (EBV). L'analyse phylogénétique a placé cette souche au sein d'un groupe de Papouasie-Nouvelle-Guinée-Indonésie. Ces résultats mettent en évidence le rôle précieux des collections de musées comme réservoirs de données génétiques, offrant un aperçu historique de l'évolution et de la propagation des agents pathogènes humains. -> Contact : philippe.charlier@uvsq.fr
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Life Sciences UPSaclay
May 14, 3:17 AM
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Les antibiotiques de la classe des β-lactamines sont les antibiotiques les plus prescrits dans le monde. Ils agissent en inhibant l'assemblage du peptidoglycane de la paroi cellulaire, ce qui aboutit à la lyse de la bactérie. Le peptidoglycane est une macromolécule polymérique composée de chaînes glycanes réticulées par de courts peptides. Ce pontage interpeptidique est le plus souvent catalysé par des enzymes de type d,d-transpeptidases. Ces enzymes appartenant à la famille des protéines liant la pénicilline sont reconnues par les β-lactamines qui les inactivent. Cependant, le peptidoglycane de Clostridioides difficile fait figure d’exception car il est principalement polymérisé par l’action d’une autre classe d’enzymes, les l,d-transpeptidases, qui sont insensibles aux β-lactamines. Dans une étude publiée dans iScience, des chercheurs de l’I2BC (CEA/CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) et de l’Institut Micalis (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) ont étudié le rôle de la voie de l,d-transpeptidation dans la résistance aux β-lactamines. C. difficile est résistant a de nombreuses β-lactamines mais les chercheurs ont montré que les l,d-transpeptidases ne sont pas impliquées dans ce processus. Cette étude a permis d’établir que la résistance est en fait due à une faible affinité des d,d-transpeptidases de C. difficile pour cette classe d’antibiotiques. Cette étude a également révélé que la voie de l,d-transpeptidation est la cible principale desβ-lactamines. Les l,d-transpeptidases utilisent exclusivement des précurseurs du peptidoglycane modifiés qui sont générés par des d,d-carboxypeptidases. L’exposition de C. difficile à des concentrations subinhibitrices de différentes β-lactamines ont permis aux chercheurs de montrer que ces antibiotiques inactivent les d,d-carboxypeptidases ce qui prive les l,d-transpeptidases de leur substrat et limite la résistance de la bactérie contre ces antibiotiques. Ainsi, ces travaux révèlent un mécanisme d’action original des β-lactamines chez C. difficile. -> Contact : johann.peltier@i2bc.paris-saclay.fr
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May 13, 5:07 PM
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Les stéréo-isomères sont des molécules qui possèdent le même nombre et types d’atomes, mais orientés différemment dans l’espace. Dans les peptides et les protéines, il existe un cas particulier de stéréoisomérie : l’isomérisation cis/trans de la proline. Cette isomérisation, et les interconversions conformationnelles associées, affectent de nombreux processus cellulaires. Malgré l’implication de la proline dans le repliement, la stabilité et l'agrégation des protéines, la discrimination des isomères cis et trans de la liaison peptidique Xaa-Pro n'avait jamais été montrée à l'échelle de la molécule unique avec un nanopore. Le laboratoire LAMBE (Laboratoire Analyse, Modélisation, Matériaux pour la Biologie et l'Environnement, UMR 8587 UEVE/UPSaclay/CNRS/Cergy Paris Université, Evry‑Courcouronnes), spécialisé, en particulier, dans la détection de biomolécules et peptides par nanopore, a démontré l’identification et la discrimination des isomères cis et trans de la proline. En particulier, dans un fragment de 19 acides aminés riche en proline de la protéine Dynamin 2, une de protéines impliquées dans la myopathie centro-nucléaire, la troisième proline de la séquence a été substituée par des fluoro-prolines stéréo-isomériques. Grace aux expériences réalisées par nanopores, l’influence de la fluoration sur l’équilibre entre les conformères cis/trans par rapport à la proline naturelle a été montrée et confirmée par spectroscopie RMN en collaboration avec l’Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire et l’École Supérieure de Biotechnologie de l’Université de Strasbourg . Ces travaux ont été publiés dans Chemical Science. L'aérolysine est donc un excellent détecteur pour caractériser des états conformationnels cis/trans de l’acide aminé proline et pourrait être utilisée pour l’étude de prolines impliquées dans des maladies. -> Contact : juan.pelta@univ-evry.fr / benjamin.cressiot@cyu.fr
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May 13, 4:44 PM
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Le cancer primitif du foie est une maladie grave, et l’une des principales solutions curatives reste la chirurgie: on retire la partie du foie atteinte. Mais ces opérations sont complexes et comportent des risques importants. Aujourd’hui, il est difficile de prédire précisément la difficulté d’une intervention avant qu’elle ait lieu. Des chercheurs du centre hépatobiliaire AP-HP Paul Brousse (UMR-S 1193 INSERM/UPSaclay, FHU Hepatinov, Villejuif), d'Inria et de Guerbet ont développé un outil basé sur l’intelligence artificielle (IA) pour relever ce défi. À partir de simples scanners réalisés avant l’opération, ils créent un modèle 3D du foie, des tumeurs et des vaisseaux sanguins. Grâce à ce “jumeau numérique”, l’IA analyse la position des tumeurs par rapport aux zones sensibles du foie. Un nouveau cadre anatomique a été mis en place pour évaluer la complexité réelle de l’intervention. L’outil a été testé sur 145 patients et s’est montré plus précis que l’estimation faite par les chirurgiens, avec une prédiction fiable dans près de 80% des cas. Cette avancée, publiée dans Annals of Surgery, pourrait transformer la manière dont les chirurgiens planifient leurs interventions. À terme, cela permettrait d’orienter les patients vers les hôpitaux les mieux équipés selon la complexité prévue de leur opération, tout en réduisant les risques et en améliorant les chances de succès. -> Contact : irene.vignon-clementel@inria.fr / eric.vibert@aphp.fr
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