Life Sciences Université Paris-Saclay

Dans une étude publiée dans American Journal of Epidemiology, des équipes du Centre d’Epidémiologie et de Santé des Populations - CESP (UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Villejuif), de Santé Publique France, de l’Unité des Virus Emergents, de l’Institut Pierre Louis d’Epidémiologie et de Santé Publique, et de l’Institut de recherche interdisciplinaire sur les enjeux sociaux ont comparé le risque de symptômes post-covid selon la période de première infection aiguë : première (mars-mai 2020) ou deuxième vague épidémique (septembre-novembre 2020, voir Figure).

Leur étude s’est appuyée sur l’enquête Epidémiologie et Conditions de Vie (EpiCov), une cohorte socio-épidémiologique représentative de la population générale vivant en France lancée en mai 2020. Elles ont montré un risque plus élevé de symptômes post-covid six mois après une première infection ayant eu lieu en première vague (14,6%) plutôt qu’en deuxième vague épidémique (7,0%). Cette différence s’observait indépendamment de plusieurs caractéristiques liées à l’appartenance sociale, à l’état de santé et à la gravité de l’infection aiguë des personnes concernées.

Les deux premières vagues épidémiques ayant eu lieu avant la diffusion de vaccins contre le SARS-Cov-2 et avant l’apparition de nouveaux variants du virus en France, la différence observée ne peut s’expliquer par aucun de ces deux phénomènes. Le contexte de l’infection aiguë au SARS-Cov-2, en revanche, pourrait jouer un rôle dans la persistance de symptômes à long terme. En particulier, le manque de connaissances sur l’infection et sur son traitement, ainsi que les conséquences sanitaires et sociales d’un confinement strict, ont pu retarder la rémission de certaines personnes infectées au début de la pandémie.

Contact : anne.pastorello@inserm.fr

Une équipe du Laboratoire d'imagerie biomédicale multimodale Paris Saclay BioMaps (CEA/CNRS UMR9011/Inserm UMR1281/UPSaclay, Orsay), en collaboration avec des immunologistes de l'Université Paris-Cité, a suivi, en imagerie TEP, le métabolisme du glucose comme marqueur de l'impact cérébral de l'exposition à la fumée de cigarette et du sevrage, ainsi que les effets du NFL-101, un candidat-médicament prometteur pour le traitement du sevrage tabagique. En révélant chez un modèle murin la restauration de l'activité normale de la zone cérébrale associée à l'envie de fumer en situation de sevrage, ces résultats sont porteurs d'espoir pour l'arrêt du tabac chez l'Homme.

Ces travaux sont publiés dans ACS Chemical Neuroscience.

Lire la suite de l’Actu CEA-Joliot

Contact : sebastien.goutal@universite-paris-saclay.fr ou n.tournier@universite-paris-saclay.fr

Lorenzo Sala est chercheur au sein de l'unité Mathématiques et Informatique Appliquées de Génome à l'Environnement – MaIAGE (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas) depuis janvier 2023. Il s'intéresse particulièrement à la synergie entre les mathématiques appliquées et les sciences de la vie, notamment à travers la modélisation de la dynamique des populations et le développement de jumeaux numériques.

En 2013, après avoir étudié l'ingénierie mathématique au Politecnico de Milan, il poursuit ses études avec un master en science et ingénierie computationnelles, toujours au Politecnico, qu'il achève en 2016. Sa passion pour la recherche en biomathématiques se manifeste lors de son mémoire de master intitulé "A Cellular Scale Model of Aqueous Humour Production". Sa thèse de doctorat, soutenue en 2019 à l'Université de Strasbourg (IRMA), porte sur la modélisation mathématique du flux sanguin oculaire et le développement de techniques d'analyse numérique avancées pour la résolution de ce modèle.

De 2019 à 2020, il est Research Associate au département de mathématiques de l'Imperial College London, où il travaille sur un modèle mathématique multi-échelle décrivant l'interaction sperme-mucus. Il rejoint ensuite l'équipe SIMBIOTX à l’INRIA Saclay pour deux ans, où il se concentre sur l'analyse de sensibilité d’un jumeau numérique représentant l'hémodynamique hépatique lors d'opérations chirurgicales telles que la résection du foie.

En janvier 2023, Lorenzo Sala rejoint l'équipe Dynenvie au sein de MaIAGE en tant que chercheur. Son travail actuel porte sur la relation hôte-microbiote, avec pour objectif de développer un jumeau numérique intestinal multi-échelle afin d'étudier le microbiote digestif humain et animal. Ses recherches visent à approfondir l'intégration des données expérimentales dans la modélisation mathématique, contribuant ainsi à une meilleure compréhension des systèmes biologiques complexes.

“The book of nature is written in the language of mathematics.” - Galileo Galilei

Contact : lorenzo.sala@inrae.fr

Cerebral cortex activity is determined not only by local connectivity but also by connections between different cortical « columns », via horizontal connections (in the same brain area) or longer range cortico-cortical connections (between distant areas). In this workshop, we aim at mixing experimental and modeling contributions to understand these different connections and role in computations, in different animal species. Experiments show how cortico-cortical connectivity shapes cortical dynamics, and that this occurs at different scales, from propagating wave patterns in visual or somatosensory cortex, up to large-scale interactions over the whole brain. Models show what types of connectivity and mechanisms are needed to understand these phenomena and their possible role in cortical computations.

Finally, the workshop will give a special place to PhD students, who will constitute the majority of speakers.

Registration is free but mandatory. Please email your intention to attend to Alain Destexhe or Diego Contreras

Address: Institut des Neurosciences Paris-Saclay - NeuroPSI (CNRS/UPSaclay), 151 route de la Rotonde, 91400 Saclay, France. Albe-Fessard auditorium, ground floor.

List of speakers

• Pablo Castro (NeuroSpin, Saclay)
• Diego Contreras (U Penn, Philadelphia)
• Fred Chavane (AMU, Marseille)
• Alain Destexhe (NeuroPSI, Saclay)
• Luc Estebanez (NeuroPSI, Saclay)
• Pavel Haman (Prague University)
• Mathis Millet (ENS Lyon)
• Cyril Monier (NeuroPSI, Saclay)
• Feycal Rezaig (NeuroPSI, Saclay)
• and more to come !

Hôpital Bicêtre, Faculté de Médecine Paris-Saclay,

Bâtiment Recherche

Vendredi 24 septembre 2024

10h-16h

Entrée gratuite mais inscription obligatoire par mail : tristan.verdelet@aphp.fr ou en ligne

MICROBES and the GS Biosphera are joining forces to provide Starting Packages to newly recruited researchers and (assistant) professors joining the MICROBES community.

Deadline for applications: October 15th, 2024

MICROBES and the GS Biosphera call for interdisciplinary research proposals from researchers and (assistant) professors recruited in 2022 or later in a team contributing to MICROBES and/or Biosphera. The Starting Package of up to 15 k€ is intended to generate preliminary data allowing the applicant to apply to other national or international granting organizations. Four to five projects will be funded. The criteria for funding will be the scientific quality of the project, its interdisciplinary character, its potential for priming other funding and the collaboration with MICROBES teams other than the hosting team of the applicant.

For more information, the full text of the call and the application form, write to: peter.mergaert@i2bc.paris-saclay.fr and matthieu.jules@agroparistech.fr, mentioning in the subject line “Starting Package MICROBES – Biosphera”

La Fondation Mérieux soutient (500 000 €) des équipes de recherche qui étudient les maladies infectieuses dans les pays en développement.

• Date limite de candidature : 16 septembre 2024.
• En savoir plus (pdf)

Site de l’appel : cliquez ici

Objectif : Cet appel visera à soutenir les analyses qui permettront la caractérisation des microbiomes humains ou des interactions hôte-microbiome de sujets sains ou de patients très bien phénotypés, participant à des études cliniques ou inclus dans des cohortes existantes.

Durée : maximum 36 mois.

Aide allouée : maximum 250 000 euros (frais de gestion inclus).

Déroulement :

• Première phase : Sélective et obligatoire. Remise d’une lettre d’intention et d’un questionnaire permettant d’établir l’éligibilité technique du projet et sa pertinence scientifique.
  Période de soumission du dossier : 4ème trimestre 2024 - 1er trimestre 2025.

• Deuxième phase : Remise du projet de recherche consolidé.
  Période de soumission du dossier : 3ème trimestre 2025.

Pour toutes questions, contacter : equipe@pepr-sams.fr

Pour toutes informations sur le PEPR SAMS et les autres appels, consulter le site : https://pepr-sams.fr/

La Dp71 est une dystrophine exprimée dans les astrocytes et certaines synapses neuronales. Son absence est associée à une aggravation de la déficience intellectuelle dans la myopathie de Duchenne (DMD). De récentes recherches précliniques ont montré qu’il est possible de restaurer l’expression cérébrale de certaines dystrophines par une approche de correction génique, le saut d’exon thérapeutique. Malheureusement cette approche n’est pas applicable aux mutations dans la partie distale du gène et responsables de la perte de Dp71, et des approches de « remplacement » basée sur l’expression ectopique de la protéine manquante doivent être envisagées.

Dans un article publié dans Cells, l’équipe de Cyrille Vaillend (Institut des Neurosciences Paris-Saclay - NeuroPSI, CNRS/UPSaclay, Orsay), en collaboration avec l’Institut de la Vision (Université Sorbonne, Paris), a comparé les effets d’une stratégie de restauration de l’expression de Dp71 chez une souris déficiente en Dp71, basée sur des injections de vecteur AAV9 véhiculant la séquence codante de la Dp71, en intracardiaque au cours d’une période postnatale précoce ou en intracérébral chez l’adulte. Ces méthodes ont respectivement permis une réexpression partielle ou une surexpression de Dp71 dans le cerveau au niveau glial. L’expression ectopique de Dp71 restaure partiellement la localisation de protéines partenaires de la Dp71 dans les astrocytes, notamment les canaux aquaporine impliqués dans l’homéostasie hydrique cérébrale.

L’absence d’effet de ce traitement sur les troubles comportementaux des souris Dp71-null souligne cependant les défis qui restent à relever pour améliorer les stratégies thérapeutiques visant à compenser les déficits cognitifs dans la DMD.

Contact : cyrille.vaillend@universite-paris-saclay.fr

Dans une étude publiée dans Cellular and Molecular Life Sciences, les chercheurs de l’unité Virologie et Immunologie Moléculaires - VIM (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec l’hôpital Foch, le CIML-Marseille, le CHU-Caen, ont étudié les phases initiales de l’infection par le SARS-CoV-2 dans le poumon humain, phases importantes de la physiopathologie.

Des travaux conduits avec des modèles de culture ex vivo avaient donné des résultats discordants quant aux cibles initiales pulmonaires du virus et à la réponse innée induite. Grâce à une approche originale consistant à infecter un poumon humain entier maintenu vivant ex vivo à 37°C selon une technique utilisée couramment en transplantation, l’infection initiale a été analysée pendant 10 heures, en respectant l’architecture spatiale tissulaire. Le RNA-seq sur cellule unique a révélé que les macrophages alvéolaires et les macrophages intestitiels (situés sous les cellules épithéliales) sont les cibles principales virales. Par contre, les cellules épithéliales et les monocytes pulmonaires n’étaient pas significativement associées au virus. Après dissociation de tissus pulmonaire, tri en cytométrie, et culture avec le virus, les monocytes/macrophages du poumon ont exprimé des réponses inflammatoires spécifiques en fonction des sous-types cellulaires, des souches virales et des doses, les macrophages interstitiels étant les plus inflammatoires en réponse au virus.

Ces résultats originaux mettent en lumière le rôle des macrophages à l’étape initiale de l’infection, et suggèrent que leur réponse pourrait conditionner l’apparition des lésions ultérieures associées à la gravité, en fonction de la composition initiale alvéolaire en sous populations de macrophages, de la souche virale et de la dose.

Contact : isabelle.schwartz@inrae.fr ou thien-phong.vu-manh@cnrs.fr ou e.sage@hopital-foch.com

Une équipe de l’I2BC (CNRS/CEA/UPsaclay, Gif-sur-Yvette) a exprimé in vitro la région C-terminale transmembranaire de la protéine nsp3 du SARS-CoV-2, impliquée dans la biogenèse de vésicules à double membrane, sièges de la réplication du génome viral. L'observation en microscopie électronique, complétée par une prédiction structurale avec AlphaFold, révèle une organisation hexamérique de cette région de nsp3, composant principal façonnant les pores moléculaires des vésicules. En facilitant le passage de l'ARN viral vers le cytoplasme de la cellule hôte, Nsp3 apparaît comme une cible thérapeutique prometteuse.

Ces travaux sont publiés dans Journal of Virology. Voir aussi la revue dans Médecine & Sciences.

Lire la suite de l’Actu CEA-Joliot

Contact : virginie.gervais@i2bc.paris-saclay.fr ou marion.babot@universite-paris-saclay.fr

Professeure des universités-praticienne hospitalier de l'Université Paris-Saclay en radiologie à l'Institut Gustave Roussy  et directrice adjointe du Laboratoire d'imagerie biomédicale multimodale Paris Saclay BioMaps (CEA/CNRS UMR9011/Inserm UMR1281/UPSaclay, Orsay), Nathalie Lassau a été nommée au grade de Chevalier de la Légion d’Honneur lors du décret du 3 Juillet 2024.

Cette spécialiste des centres de lutte contre le cancer dirige, depuis 2014, l’Institut de formation supérieure biomédicale (IFSBM), un département de la faculté de médecine de l’Université Paris-Saclay. L'IFSBM permet aux étudiant.es ingénieur.es des grandes écoles de se former au milieu de la santé grâce à une collaboration avec CentraleSupélec, l'Institut d'Optique, l'ENS Paris-Saclay, Polytechnique, AgroParistech et Polytech Paris-Saclay. Nathalie Lassau est Vice-présidente de la Société française de radiologie (SFR) en charge des innovations. Elle est également Membre du conseil pédagogique de CentraleSupélec, membre de la CSS7 de l’INSERM, et nouvellement nommée membre de la commission Recherche de l’Université Paris-Saclay, membre du Collège des enseignants en radiologie (Cerf), Membre de l'American Institute of Ultrasound in Medicine (AIUM) et de la Radiological Society of North America (RSNA). Nathalie Lassau est l’auteur de plus de 180 publications. Elle est également à l’origine du premier data challenge, organisé lors des Journées francophones de radiologie 2018. Cet événement comprenait cinq défis simultanés en intelligence artificielle appliquée à l'IRM, au scanner et aux ultrasons. Plus de 5 000 patients ont été inclus en quatre mois par 50 centres publics et privés, avec la participation de 25 équipes pluridisciplinaires composées d'étudiants, de radiologues, d'ingénieurs et d'entreprises. Elle a à son actif plus de 14 Data challenges en Intelligence artificielle organisés avec la Société française de radiologie. Ses travaux de recherche en Intelligence artificielle lui ont permis durant le COVID de menée l’étude SCanCOVIA incluant 1 000 patients et publiée dans Nature.com.

Contact : nathalie.lassau@gustaveroussy.fr

La prochaine séance de la Société de Biologie aura lieu le mardi 24 septembre 2024 à 14h dans l’amphithéâtre Hélène Martel-Massignac à l’Institut Curie, 11-13 rue Pierre et Marie Curie, 75005 Paris. Il sera également possible de la suivre à distance par zoom.

La séance est organisée par Catherine Llorens-Cortes (LPEM CEA-Joliot/UPSaclay SIMoS/DMTS) et aura pour thème « Les nouveaux traitements de l’insuffisance cardiaque ».

Lien Zoom pour participer à la séance en distanciel

Chaque séance de la Société de Biologie fait l’objet de publication d’articles dans la revue « Biologie Aujourd’hui » (EDP Sciences).

-> Nouveau site de la Société de Biologie

SayFood Research Unit (Paris-Saclay Food and Bioproduct Engineering, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau) ce sont 5 équipes de recherche, une halle technologique, des expertises nombreuses, transdisciplinaires et variées … et des travaux en proximité avec les acteurs de la production fromagère !

Pour la première fois la diversité microbienne des fromages AOP et des laits associés à l’échelle du territoire français a été étudiée par une équipe de recherche, composée de chercheurs d’INRAE dont SayFood Research Unit, du CEA, du Conseil National des Appellations d’Origine Laitières (CNAOL) et du Centre National Interprofessionnel de l'Economie Laitière (CNIEL).

C’est dans le cadre du projet MetaPDOcheese*, et grâce à la forte mobilisation des acteurs des filières AOP, que les chercheurs ont analysé des échantillons collectés auprès de 386 producteurs fermiers et fromageries répartis dans toute la France, tout en recueillant des informations détaillées sur les modes de production. Au final, plus de 2 000 échantillons de fromages français portant le label AOP et les 400 laits associés ont été séquencés au CEA par des chercheurs du Genoscope.

En croisant leurs données avec les informations recueillies sur les pratiques de production, les chercheurs ont montré que le facteur AOP (qui englobe aussi bien la zone géographique, la topographie de la région ou encore les facteurs humains) a un impact sur la diversité microbienne retrouvée dans les fromages et les laits. Cela démontre la contribution du savoir-faire régional à l’élaboration du microbiote fromager.

L’ensemble des résultats a été publié le 06 août 2024 dans la revue ISME Communications.

Lire le Communiqué de presse

Le programme Samuel de Champlain soutient la formation et l'amorçage de collaborations entre équipes françaises et québécoises, à hauteur de 20 000 € pour la partie française et de 30 000 $ canadiens sur deux ans.

• Date limite de candidature : 18 septembre 2024
• En savoir plus

Le Comité de Pilotage Stratégique du PEPR SantéNum a le plaisir de vous informer du lancement officiel de l'Appel à Projets du PEPR SantéNum.

Cet appel à projets constitue la seconde action du PEPR SantéNum et vise à ouvrir de nouvelles perspectives en lien avec les évolutions du domaine et à renforcer les thèmes de recherche existants, tout en respectant l’esprit du document de cadrage du PEPR.

Les thèmes ciblés pour cet appel à projets sont :

• Méthodes et concepts innovants, incluant notamment des approches IA.
• Capteurs multi-échelles pour des applications en santé.
• Jumeaux numériques multi-échelles pour la thérapie personnalisée.
• Jumeaux numériques multi-échelles pour des solutions d’assistance en situation de handicap.
• Jumeaux numériques multi-échelles pour des systèmes de soins intégrés.

Le processus se déroulera en deux phases :

• Le dépôt des lettres d’intention avant le 15 octobre 2024.
• La finalisation des candidatures et la soumission des dossiers complets en février 2025, avec une sélection finale prévue pour juin 2025.

Le texte de l'AAP ainsi que les informations complémentaires sont disponibles sur les 2 sites web dédiés :

• Site PEPR SantéNum
• Site ANR

Contact : PEPR-SanteNum@agencerecherche.fr

Notre appel à projets pour l'année 2024 est ouvert !
 

Retrouvez les règlements de chaque prix et bourse sur notre site web et soumettez votre dossier de candidature dès à présent.
 

Date limite de dépôt des candidatures : Lundi 14 octobre 2024
 

Nous aurons le plaisir de recevoir les lauréats à l'occasion d'une cérémonie officielle de remise des Prix & Bourses lors des Journées Européennes de la SFC qui auront lieu du mercredi 15 au vendredi 17 janvier 2025 à Paris.

Consulter la liste des prix

Consulter la liste des bourses 

Pour toute question, merci de bien vouloir écrire à prix-bourses@sfcardio.fr

Dans un article publié dans Antibiotics, Benjamin Davido (unité Infection & Inflammation – 2I UMR-S 1173 Inserm/UPSaclay/UVSQ, Montigny-le-Bretonneux) et ses collaborateurs des hôpitaux Raymond Poincaré (Garches) et Ambroise Paré (Boulogne) se sont penchés sur la question de la pénurie de certains antibiotiques.

Dans un contexte très particulier de rupture répétée de médicaments à l’échelle mondiale, et notamment d’antibiotiques, il existe un enjeu démontré de santé publique, à la fois lié à la perte de chance d’un traitement par rapport à un autre, mais aussi cela pose la question de la gestion de crise de ce type de rupture. Cela a été le cas récemment en 2022 avec une forte tension sur la pénicilline dans un contexte d’augmentation des cas d’infection invasive à streptocoque avec risque épidémique. L’utilisation des médicaments périmés (ayant dépassé leur date recommandée d’utilisation) a déjà été pratiquée dans des situations préalables par l’armée américaine depuis 1986. Cette stratégie pourrait s’avérer intéressante, tant sur le plan économique mais aussi écologique ; dans un contexte d’augmentation de la résistance aux antibiotiques obligeant au spectre antibiotique le plus adapté.

Les données présentées dans l’article supportent que si les médicaments ont été conservés dans les bonnes conditions de température et d’humidité, la plupart des antibiotiques restent efficaces et sans danger dans l’année qui suit la date recommandée d’expiration, et jusqu’à 5 ans selon le médicament. Il faudrait probablement réfléchir à un système de stockage dans l’année de ces médicaments afin d’éviter tout gaspillage et se préparer à des situations de tension en médicaments avec des risques de crises sanitaires de plus en plus fréquentes.

Contact : benjamin.davido@aphp.fr