Get Started for FREE
Sign up with Facebook Sign up with X
I don't have a Facebook or a X account
 Your new post is loading...
Scoop.it!
Journée des métiers : zoom sur les bonnes pratiques du M2 Sciences du végétal 
No comment yet.
Sign up to comment
Scoop.it!
En 2019, l'Académie des sciences décernera plusieurs prix en biologie :
Scoop.it!
Le GREMI décerne un Prix de thèse à un jeune chercheur auteur d'une thèse soutenue en 2018 dans le domaine de l'inflammation.
Date limite de candidature : 31 décembre 2018
Scoop.it!
De l’intelligence artificielle à la génomique, en passant par les neurosciences, la médecine personnalisée, les nanotechnologies ou encore la robotique, ce tome IV propose une présentation complète et argumentée de la bioéthique aujourd’hui et constitue
Traité de bioéthique IV - Les nouveaux territoires de la bioéthique
Scoop.it!
Le Sidaction lance la 1re session de son appel d’offres scientifique et médical 2019.
Date limite de candidature : 13 février 2019
Scoop.it!
Comme dans le film « Venom » sorti récemment, dans lequel un parasite change le comportement des humains infectés, certains champignons parasites d’insectes sont capables de modifier les comportements de leurs hôtes pour maximiser leur propre transmission. Les fourmis infectées par le champignon Ophiocordyces ont des comportements de déplacement anormaux, qualifiés de « zombis » ; elles vont ensuite au plus haut de la végétation et se figent, jusqu’à ce que les fructifications et spores du champignon recouvrent l’insecte et puisse se disperser au plus loin. Une étude récente parue dans Molecular Ecology par des chercheurs du laboratoire ESE ont identifié les toxines impliquées dans la transformation des fourmis en zombis par des champignons, en recherchant dans les génomes de champignons spécialisés sur des hôtes différents les protéines qui avaient évolué très rapidement, et donc susceptibles d’être impliquées dans la course aux armements contre leur hôte.
Contact : tatiana.giraud@u-psud.fr
Bernadette Cassel's curator insight,
October 2, 2022 1:42 PM
Actualité en relation :
Parution de la leçon inaugurale de Tatiana Giraud : Dynamique et évolution de la biodiversité et des écosystèmes | Collège de France - De www.college-de-france.fr - Aujourd'hui, 19:01
Scoop.it!
La France produit 20% des denrées agricoles de l'Union européenne et est l’un des principaux exportateurs mondiaux de céréales. Pourtant, les rendements, c’est à a dire la quantité de biomasse récoltée par unité de surface cultivée stagnent. L’article de Schauberger et al. paru dans Scientific Reports avec des chercheurs du Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement (LSCE) et de l’INRA analyse un ensemble de données historiques comprenant plus de 120 000 observations de rendement de 1900 à 2016 pour dix cultures (orge, blé dur, blé dur, maïs, avoine, pommes de terre, colza, betterave à sucre, tournesol et vin) dans les 96 départements français métropolitains depuis la fin du 19ème siècle. Les rendements ont été multipliés par quatre en moyenne au cours du 20ème siècle. Alors que la variabilité absolue du rendement a augmenté, la variation relative à la moyenne a été divisée par deux – c’est à dire que les rendements moyens ont augmenté plus rapidement que leur variabilité. Le principal résultat de cette étude est de montrer que croissance des rendements a stagné depuis 1990 pour le blé d'hiver, l'orge, l'avoine, le blé dur, le tournesol sur au moins 25% des superficies cultivées, mais pas pour le maïs. Les causes peuvent être liées au changement climatique ou à une baisse d’intensification de la production due aux directives visant à limiter les engrais ou la politique des prix des denrées agricoles. Par contre, les données suggèrent que la limite des potentiels biologiques de production n’est pas la cause principale de cette stagnation récente.
Figure. Évolution des rendements de diverses cultures en France depuis 1900. On voit la forte augmentation due aux progrès techniques de l’agriculture entre 1960 et 2000 et pour la plupart des cultures une saturation des rendements depuis 2000. Pour le vin, la baisse récente est expliquée par la demande en qualité et non pas en quantité de produits viticoles.
Contact : philippe.ciais@lsce.ipsl.fr
Scoop.it!
Les glycosaminoglycanes (GAGs) sont, parmi les polysaccharides bioactifs, les plus difficiles à caractériser et à séquencer. Ils posent un formidable défi analytique en raison de l’immense variabilité de la sulfatation et l’acétylation, et de l’existence d’épimères tout au long des chaînes de ces polysaccharides linéaires anioniques. Les avancées récentes de la spectrométrie de masse (MS) permettent d’envisager de décrypter le large contenu informationnel exploité par la cellule et qui est renfermé dans la structure de ces GAGs. Les équipes de Régis Daniel au Laboratoire Analyse et Modélisation pour la Biologie et l’Environnement (LAMBE) de l’Université d’Evry-Val-D’Essonne et d’Isabelle Compagnon à l’Université de Lyon développent des approches analytiques multidimensionnelles basées sur le couplage de la MS avec des techniques complémentaires de séparation (chromatographie, électrophorèse, mobilité ionique) et/ou de spectroscopie. La MS en tandem MS/MS opérant la fragmentation des analytes induite par collision est d’un apport décisif dans l’élucidation structurale des polyosides. Dans une étude parue récemment dans Current Opinion in Structural Biology, les auteurs décrivent comment l’exploitation plus récente de photons dans l’ultra-violet (UV) et l’infra-rouge (IR) se révèle une alternative très prometteuse pour induire cette fragmentation en phase gazeuse. Dans le contexte des dernières avancées de la photo-fragmentation, les auteurs montrent tout l’intérêt de l’utilisation de lasers accordables pour balayer toute une gamme de longueurs d’onde, notamment de l’IR (3 µm) et incluant l’IR lointain (>10 µm). La combinaison en ligne de la MS/MS et de la fragmentation multi-étapes MSn avec la spectroscopie IR des ions fragments formés en phase gazeuse a permis de distinguer les différents monosaccharides constitutifs, de localiser les modifications fonctionnelles (sulfatation), et d’identifier la régio- et stéréochimie des liaisons osidiques. Cette approche couplée MS/IR ouvre une voie vers le séquençage des GAGs.
Contact : regis.daniel@univ-evry.fr
Scoop.it!
![Arabidopsis thaliana DGAT3 is a [2Fe-2S] protein involved in TAG biosynthesis (IJPB, SPS) | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it](https://img.scoop.it/YCO4OQqYYBYCCnYp1xP04jl72eJkfbmt4t8yenImKBVvK0kTmF0xjctABnaLJIm9)
Triacylglycerols (TAGs) are highly reduced and anhydrous storage compounds representing a widespread source of energy and carbon store in eukaryotes. They are synthetized by a specialized pathway (Kennedy pathway, 1956). The last step of this pathway is catalyzed by acyl-CoA:diacylglycerol acyltransferases (DGAT), which synthesize TAGs from sn-1,2-diacylglycerol and acyl-CoA. Three families of DGATs probably resulting from convergent evolution have been identified. DGAT1 and DGAT2 types, discovered in the late 90s, are integral membrane proteins of the endoplasmic reticulum. They participate in TAG synthesis in mammals, plants and yeasts, having presumably different physiological functions. DGAT1 mostly control seed oil content in crops producing edible oils. In several crops producing non-edible oils, members of the DGAT2 family incorporate unusual fatty acids into seed TAGs. In 2006, a new DGAT family (DGAT3) has been discovered and is plant specific. Conversely to DGAT1 and 2, DGAT3 are lacking transmembrane regions, and their carboxy-terminal contains a conserved [2Fe-2S] putative binding domain.
Surprisingly since 2006 only four reports on the biochemical characterization of enzymes from this family have been published. The DGAT activity of DGAT3 has never been observed for the enzyme of the model plant Arabidopsis thaliana. The presence of a [2Fe-2S] bound to this protein has never been demonstrated.
The predicted structure of the A. thaliana DGAT3 (At1g48300) gene has been recently revised, yielding a longer coding sequence (CDS) than the one used by former authors. Using PCR, sequence of the corresponding CDS was amplified using cDNAs from A. thaliana seeds. The protein encoded by this new CDS comprises 360 expected residues. We have detected A. thaliana DGAT3 protein in germinating seeds (Immunodetection). The apparent molecular weight of the protein detected in vivo is in accordance with the expected one. The recombinant purified protein produced from Escherichia coli exhibits a brown colour. This protein has DGAT activity in vitro. A truncated protein lacking its N-terminal putative chloroplast transit peptide, Δ46AtDGAT3, having lost DGAT activity, was more stable in vitro and permitted biochemical and spectroscopic (Electron Paramagnetic Resonance, EPR) characterization of the protein. AtDGAT3 is probably a trimer, and possess a metallic cofactor under the form of a [2Fe-2S] cluster. AtDGAT3 is the first metalloprotein described as a DGAT so far.
This work published in Scientific Reports is the results of a collaboration between Thierry Chardot, Pierre Briozzo and their collaborators from the DYSCOL team at Institut Jean-Pierre Bourgin, and Marc Fontecave and his collaborators from Laboratoire de Chimie des Processus Biologiques at Collège de France.
Contact : thierry.chardot@inra.fr
Scoop.it!
La maladie d’Alzheimer, première cause de démence au monde, et les maladies à prions, comme la maladie de Creutzfeldt-Jakob chez l’Homme et l’encéphalopathie spongiforme bovine (« maladie de la vache folle »), sont des maladies neurodégénératives d’issue fatale. Elles se propagent dans le cerveau suivant des mécanismes similaires. Des chercheurs de l’unité de recherche Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM) à l'INRA de Jouy-en-Josas et de l’Institut Curie d’Orsay, unité Stress Génotoxique et Cancer (UMR3348) étudient le rôle du stress oxydant dans les étapes précoces de ces maladies, de manière comparative.
Lire la suite.
Scoop.it!
Legeneraliste.fr rend compte des recherches menées « tous azimuts » sur le microbiote intestinal. Des travaux sont en cours en hépatologie et suggèrent que l’étude du microbiote pourrait être utilisée à visée prédictive et préventive. Ainsi, « notre équipe Inserm U996 a montré qu’en fonction du profil bactérien intestinal mais aussi du propre métabolisme de ces bactéries, il était possible de savoir si un individu allait ou non développer une maladie hépatique liée à l’alcool ou au surpoids (NASH ou stéatohépatite non alcoolique), explique Gabriel Perlemuter, chef du service d’hépato-gastro-entérologie et nutrition (hôpital Antoine Béclère, Faculté de Médecine UPSud, Clamart). Nous sommes en train de percer à jour les mécanismes par lesquels le microbiote intestinal peut protéger ou être délétère pour le foie »
Scoop.it!
Le Professeur Eric Solary, chef du département d’hématologie clinique à Gustave Roussy, est lauréat du prix Raymond Rosen 2018 de la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) pour ses travaux sur les mécanismes à l’œuvre au sein de la leucémie myélomonocutaire chronique (LMMC). Ce Prix de recherche en cancérologie, clinique et fondamentale, d'un montant de 40 000 €, est issu d’un legs de Jeanne Rosen, en mémoire de son époux.
Scoop.it!
Le Figaro consacre un article à Brainvectis, une biotech parisienne en partie financée par les programmes d’investissement d’avenir (PIA), qui a pour objectif de guérir de la maladie d’Alzheimer. « Hébergé comme une quinzaine d’autres start-up de la santé au deuxième étage de l’Institut du cerveau et de la moelle épinière de l’hôpital Pitié-Salpêtrière, Brainvectis développe le travail académique de la chercheuse de l’Inserm, Nathalie Cartier », explique le quotidien. Nathalie Cartier est Directrice de Recherche Inserm au sein de l'Unité mixte Inserm-CEA-Université Paris-Sud 1169 à Fontenay-aux-Roses. « Notre objectif est d’apporter aux neurones un gène clé du métabolisme du cholestérol qui est déficient dans certaines maladies neurodégénératives. Nous le faisons via un virus qui nous sert de cheval de Troie », souligne Jérôme Becquart, le PDG de Brainvectis.
|
Scoop.it!
This list recognizes world-class researchers selected for their exceptional research performance, demonstrated by production of multiple highly cited papers that rank in the top 1% by citations for field and year in Web of Science.
Scoop.it!
L’Angelman Syndrome Alliance (ASA) composée de plusieurs associations de patients provenant de 15 pays lance son 4ème appel à projets pour la recherche sur le syndrome d’Angelman à hauteur de 350 000 €.
Date limite de candidature : 4 janvier 2019
Scoop.it!
La Fondation Charles Defforey - Institut de France remet en 2019 le grand prix scientifique "Inhibiteurs chimiques naturels ou synthétiques : outils pour la recherche et la santé", destiné à récompenser une équipe ou un laboratoire de recherche français.
Date limite des candidatures : 11 janvier 2019.
Scoop.it!
L'EIT Health finance des projets européens collaboratifs pour développer des produits ou services innovants susceptibles d'être mis sur le marché 2 à 3 ans après la fin du projet.
Montant : jusqu'à 3 000 000 € Date limite de candidature : 15 février 2019
Scoop.it!
Le Conseil européen de la recherche lance l'appel à propositions Consolidator Grant 2018 (ERC-COG-2018) qui bénéficie d'un budget indicatif de 602 millions d'euros et pourra financer environ 301 bourses. Il s'adresse à des chercheurs qui souhaitent consolider leur équipe de recherche.
Date limite de candidature : 7 février 2019
Scoop.it!
Le pathogène bactérien Agrobacterium tumefaciens provoque des galles sur les tiges et racines d’un large spectre de plantes hôtes telles les plants de tomate, peupliers, rosiers... Le mécanisme de formation des galles est connu : le pathogène transfère une partie de son ADN (appelé ADN-T) dans le noyau des cellules végétales, puis l’expression des gènes de l’ADN-T provoque la prolifération des cellules végétales et la formation des galles. Agrobacterium tumefaciens colonise la surface et l’intérieur des galles. Mais comment ce pathogène est-il capable de vivre dans les galles ? De quels nutriments dispose-t-il et comment les utilise-t-il ?
Pour répondre à ces questions, l’équipe Interactions Plante-Bactéries de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC, Gif-sur-Yvette), a combiné plusieurs approches omiques : la métabolomique, le transposon-sequencing et la transcriptomique (Gonzalez-Mula et al. in press New Phytologist). La métabolomique a permis de comparer la diversité et l’abondance des métabolites d’origine végétale (acides aminés, sucres …) présents dans les galles et les tiges saines de plants de tomate. La combinaison du transposon-sequencing et de la transcriptomique a permis d’identifier les gènes d’Agrobacterium tumefaciens qui sont nécessaires à sa croissance sur certains de ces métabolites. Enfin, des bactéries mutées pour ces gènes ont été construites et se sont avérées moins efficaces dans la colonisation des galles que la bactérie sauvage Agrobacterium tumefaciens. Ce travail révèle de nouveaux gènes et voies métaboliques importants dans la survie d’Agrobacterium tumefaciens dans les galles qu’il provoque sur les plantes.
Illustration gauche : Une galle provoquée par Agrobacterium tumefaciens sur une tige de plant de tomate.
Illustration droite : Identification par transposon-sequencing des gènes essentiels (en rouge) et non-essentiels (en vert) d’Agrobacterium tumefaciens lorsqu’il croît dans un milieu riche en nutriments.
Contact : denis.faure@i2bc.paris-saclay.fr
Scoop.it!
The microtubule cytoskeleton plays an essential role in the development, function and survival of neurons. Dysregulation of the microtubules have been linked to a number of neurodegenerative diseases, such as Alzheimer’s, Huntington’s and Parkinson’s disease.
In two recent papers published in EMBO Journal (Magiera et al. and Shashi et al.), researchers from the Institut Curie, CNRS UMR 3348 and University Paris Sud in Orsay have shown that neurodegeneration can be caused by deregulation of a key posttranslational modification of the microtubule cytoskeleton, polyglutamylation.
In their first study, they generate a panel of mouse models in which they modulate enzymes that add or remove this posttranslational modification. These models allowed them to demonstrate how a specific type of neurons in the cerebellum, the Purkinje cells, can be specifically and cell-autonomously induced to degenerate, or rescued from degeneration by up- or downregulating polyglutamylation. They also demonstrate that other neurons are equally susceptible to degeneration when polyglutamylation is perturbed, making this process a novel, general risk factor of neurodegeneration. Finally, they find that mitochondria transport, a microtubule-dependent process, is perturbed in neurons with upregulated polyglutamylation, which gives a first hint on the cellular mechanism of this novel type of degeneration.
In their second publication, with a network of collaborators, they describe patients with infantile-onset neurodegeneration that is caused by mutations in the very same deglutamylating enzymes they have analyzed in the mouse models. Thus, alterations of microtubule polyglutamylation is a mechanism involved in human neurodegenerative disorders. Their finding that modulating polyglutamylating enzymes can avoid degeneration in mice suggests that pharmacological inhibition of the enzymes involved in this process could become a therapeutic approach for tackling human disorders.
See editorial comment in Nature Reviews Molecular Cell Biology.
Contact: carsten.janke@curie.fr or maria.magiera@curie.fr
Scoop.it!
Les indices synthétiques de morbidité permettent l’ajustement ou la stratification sur la sévérité de l’état de santé et constituent un enjeu important pour la recherche et l’aide à la décision. Dans le cadre d’une convention Cifre de collaboration entre l’équipe d’économie de la santé du Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations (CESP) de l’Inserm/UPSud et la Direction de la Stratégie, des Études et des Statistiques de l’Assurance Maladie, les données du Système National des Données de Santé (SNDS) ont été exploitées pour élaborer et valider deux indices de morbidité.
L’originalité du travail récemment publié dans je Journal of Clinical Epidemiology est d’avoir appliqué à une population nationale (ensemble des affiliés au régime général âgés de 65 ans ou plus en 2013, soit 7.672.111 individus) un cadre méthodologique commun, pour prédire d’une part la mortalité totale à deux ans et d’autre part les dépenses totales de soins, reflet de l’intensité du recours au système de soins, à deux ans. Pour chaque indice, l’âge, le sexe et une sélection de pathologies identifiées à travers les algorithmes de la cartographie des pathologies et des dépenses issue du SNDS, ont été inclus comme prédicteurs dans un modèle adapté au résultat à prédire. Pour les deux indices, les coefficients estimés pour chaque prédicteur ont été convertis en poids, chaque unité reflétant l’effet de cinq années supplémentaires d’âge. La performance prédictive des indices, mesurée sur des observations différentes de celles ayant servi à leur élaboration, était supérieure à celle des indices comparables les plus communément utilisés, tels que l’indice de Charlson.
Plusieurs études exploitant ces indices pour mesurer l’état de santé à travers les données du SNDS sont actuellement en cours.
Figure : Représentation schématique des sources de données utilisées et des associations modélisées pour ce travail
Contact : panayotis.constantinou@inserm.fr
Scoop.it!
Les avancées pour déchiffrer l’architecture fonctionnelle des génomes eucaryotes ont été facilitées par les progrès technologiques récents dans les techniques de séquençage, qui permettent une représentation plus appropriée non seulement des gènes codants, mais aussi des éléments répétés et des ARN non-codants dans les assemblages de séquences génomiques. Des équipes du LIPM, Toulouse, et de l’IPS2 Paris-Saclay, ont utilisé le séquençage PacBio pour réaliser un meilleur assemblage du génome de la plante légumineuse modèle Medicago truncatula A17, utilisée notamment pour l’étude des endosymbioses, permettant ainsi d’identifier des réarrangements génomiques entre différents génotypes à une résolution proche de la base nucléotidique. L’annotation de ce nouveau génome de M. truncatula a permis pour la première fois une analyse globale des éléments transposables et de leur dynamique, ainsi que l’identification de nouveaux éléments associés au développement des nodosités symbiotiques, et en particulier 1037 ARNs non-codants longs (lncRNA) induits dans ces organes. Les chercheurs ont aussi identifié une proportion substantielle (~35% et 38%, respectivement) des gènes induits dans les nodules ou exprimés dans leur zone de différentiation qui co-localisent dans des “clusters” génomiques (270 et 211, respectivement), nommés “ilots symbiotiques”. Ces ilots contiennent de nombreux gènes de lncRNA exprimés et présentent à la fois des marques différentielles de méthylation de l’ADN et d’histones. Les régulations épigénétiques et les lncRNAs semblent ainsi de nouveaux éléments attractifs pour orchestrer l’expression des gènes symbiotiques chez M. truncatula.
Contact: martin.crespi@u-psud.fr
Scoop.it!
Minbiao Ji, Michal Arbel, Lili Zhang, Christian W. Freudiger, Steven S. Hou, Dongdong Lin, Xinju Yang, Brian J. Bacskai, X. Sunney Xie
One of the key pathological features of Alzheimer’s disease (AD) is the existence of extracellular deposition of amyloid plaques formed with misfolded amyloid-β (Aβ). The conformational change of proteins leads to enriched contents of β sheets, resulting in remarkable changes of vibrational spectra, especially the spectral shifts of the amide I mode. Here, we applied stimulated Raman scattering (SRS) microscopy to image amyloid plaques in the brain tissue of an AD mouse model. We have demonstrated the capability of SRS microscopy as a rapid, label-free imaging modality to differentiate misfolded from normal proteins based on the blue shift (~10 cm−1) of amide I SRS spectra. Furthermore, SRS imaging of Aβ plaques was verified by antibody staining of frozen thin sections and fluorescence imaging of fresh tissues. Our method may provide a new approach for studies of AD pathology, as well as other neurodegenerative diseases associated with protein misfolding.
Science Advances, 16 Nov 2018: Vol. 4, no. 11, eaat7715 Open Access : http://advances.sciencemag.org/content/4/11/eaat7715/tab-pdf Via RIC Paris-Saclay
Scoop.it!
Les macrophages résidents tissulaires ou ceux qui ont pour origine des monocytes circulants régulent l’homéostasie cardiaque en conditions physiologiques mais aussi pathologiques. La présence de macrophages résidents au sein du nœud auriculo-ventriculaire distal a été révélée par des études récentes réalisées chez la souris et chez l’homme. Ces macrophages expriment la connexine-43, une protéine de jonction intercellulaire, et augmentent la conduction auriculo-ventriculaire en accélérant la repolarisation des cardiomyocytes interconnectés. La compréhension fine et exhaustive du rôle de ces macrophages dans la conduction électrique cardiaque pourrait conduire à de nouvelles approches thérapeutiques reposant sur la modulation des fonctions macrophagiques dans le cœur arythmique.
Voir revue dans Médecine & Sciences parJean-Sébastien Silvestre et Grégoire Vandecasteele, responsable d'équipe au sein de l'UMR-S 1180 (INSERM/UPSud, Faculté de Pharmacie de Châtenay-Malabry).
Contact : gregoire.vandecasteele@u-psud.fr
Scoop.it!
Stéphane Vinit, enseignant-chercheur reçoit le Prix de la recherche fondamentale en Neurosciences 2018 de la Fondation Medisite sous la Fondation de France.
|
