Dans une étude publiée dans NPJ Vaccines, des scientifiques de l’UMR-S 1184 Center for Immunology of Viral Infections and Autoimmune Diseases-IDMIT (INSERM/CEA/UPSaclay, Fontenay-aux-Roses)et du CEA de Grenoble, en collaboration avec des scientifiques de l’université d’Amsterdam, ont mis au point une approche vaccinale innovante pour contrer les virus fortement variants, tels que le SARS-CoV-2. Face à ces pathogènes, la réponse immunitaire cible souvent de manière préférentielle des régions spécifiques de leurs protéines dites "immunodominantes" qui subissent alors une forte pression de sélection. Cela favorise l’émergence de variants porteurs de mutations dans ces zones, leur permettant d’échapper partiellement au système immunitaire.

Dans l’étude considérée, le domaine RBD, site immunodominant, et donc principale cible des anticorps, a été supprimé de la protéine spike du SARS-CoV-2, afin de forcer une re-diversification du répertoire. Le vaccin expérimental s’est intégré en tant que rappel dans un schéma vaccinal hétérologue après une primo-vaccination avec un vaccin commercial dans le modèle du macaque cynomolgus. Les animaux ont ensuite été exposés à un variant omicron, contre lequel les vaccins de première génération s’avèrent moins efficaces. La vaccination expérimentale s’est révélée aussi sûre et immunogène que le vaccin commercial, et s’est traduite par une tendance à une meilleure protection du système respiratoire profond des animaux.

Au-delà du démonstrateur théorique qu’est le SARS-CoV-2, cette approche propose une stratégie puissante pour répondre à des pathologies issues de micro-organismes hypermutants, y compris ceux avec des potentiels épidémiques et pandémiques, incluant des populations déjà vaccinées.

-> Contact : helene.letscher@cea.fr

Dans une étude publiée dans Cell Death Discovery, des chercheurs de l’Institut des cellules souches pour le traitement et l’étude des maladies monogéniques – I-Stem (UMR-S 861 Inserm/UEVE, UPSaclay, Evry) et de Généthon ont identifié la galectine-3 comme nouveau biomarqueur de la glycogénose de type III (GSDIII). Cette maladie génétique rare est causée par un déficit de l’enzyme responsable de la dégradation du glycogène (GDE). En l’absence de cette enzyme, le glycogène s’accumule de façon anormale dans le foie, le cœur et les muscles squelettiques entraînant divers symptômes cliniques.

Pour mieux comprendre les mécanismes contribuant au dysfonctionnement des muscles chez les patients atteints de la GSDIII et identifier de nouveaux biomarqueurs de la maladie, les chercheurs ont réalisé des analyses transcriptomiques de deux modèles pathologiques distincts : un modèle de cellules musculaires squelettiques dérivées de cellules souches pluripotentes et un modèle de souris. Un croisement des données transcriptomiques a permis de mettre en évidence une surexpression du gène LGALS3, codant pour la protéine galectine-3, dans les conditions pathologiques. Cette observation a ensuite été confirmée dans des biopsies musculaires de patients atteints de la GSDIII.

De plus, les chercheurs ont observé que les niveaux d’expression de la galectine-3 étaient régulés dans les muscles de souris traitées par une thérapie génique en cours de développement, suggérant que le suivi de l'expression de cette protéine peut également servir à évaluer l’efficacité de traitements.

Au-delà de l’identification de galectine-3 comme biomarqueur, cette étude ouvre la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques potentielles pour la GSDIII.

-> Contact : lhoch@istem.fr

La propagation des résistances aux antibiotiques constitue un problème majeur pour le traitement des infections bactériennes. Cette propagation est en grande partie due au transfert horizontal de gènes chez les bactéries. Un des principaux mécanismes de ce transfert est la transformation naturelle, par laquelle la bactérie peut capter l’ADN présent dans son environnement et l’intégrer dans son génome par recombinaison homologue. Cette intégration dans le chromosome bactérien d’un ADN simple-brin requiert des protéines spécifiques. Chez les bactéries à Gram-négatif, une de ces protéines clés est l’hélicase ComM.

Dans une étude publiée dans PNAS, des chercheurs de l’Institut de Radiobiologie Cellulaire et Moléculaire – iRCM (CEA/UPSaclay, UP Cité, Fontenay aux Roses) et de l’I2BC (CEA/CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), en collaboration avec un laboratoire de l’Université de l’Indiana aux Etats-Unis, ont montré comment cette hélicase est recrutée pour le processus de transformation naturelle. Guidés par des analyses bio-informatiques, ils ont montré que ComM interagit directement avec une autre protéine spécifique de la transformation, DprA. Grâce aux modèles structuraux générés par AlphaFold, ils ont proposé des mutations pour perturber cette interaction. L’effet de ces mutations sur l’efficacité de transformation montre que l’interaction avec DprA est essentielle pour le rôle de ComM dans l’intégration de l’ADN exogène dans deux pathogènes bactériens d’importance clinique majeure, Helicobacter pylori et Vibrio cholerae, pour lesquels la transformation naturelle est le principal mécanisme de transfert horizontal de gènes.

Cette étude confirme l’utilité des modèles structuraux pour dévoiler des nouvelles interactions entre protéines et mieux comprendre les mécanismes moléculaires permettant la coordination de leurs activités.

-> Contact : Jessica.andreani@cea.fr / pablo.radicella@cea.fr

Chacun le sait, les légumes sont bons pour la santé, notamment à cause de la richesse des tissus végétaux en composés antioxydants. Les plantes fabriquent ces composés pour limiter les stress oxydants, à savoir des altérations biochimiques provoquées par des molécules réactives comme le H2O2 qui sont générées lors de processus comme la photosynthèse.

Plusieurs enzymes prennent en charge le H2O2 chez les plantes, notamment l’ascorbate peroxydase qui le transforme en eau grâce à la vitamine C (voir Figure). Il en résulte des formes oxydées de cette vitamine, dont la monodéshydroascorbate (MDHA), qui doivent être recyclées en ascorbate pour permettre la poursuite de la prise en charge du H2O2. Parmi les enzymes assurant le maintien de la vitamine C au sein des cellules végétales, on dénombre la MDHAR, codée par cinq gènes chez la plante-modèle, Arabidopsis.

Dans une étude menée par l’équipe CCARS de l’Institut des Sciences des Plantes Paris-Saclay - IPS2 (CNRS/INRAE/UEVE/UParis/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), Dongdond Xu, Lug Trémulot et collaborateurs se sont attachés à élucider l’importance des différentes MDHAR lors d’un stress oxydant. Parmi les conclusions issues de cette étude, la plus surprenante est qu’une des enzymes (la MDHAR2) assure un rôle qui serait double, étant à la fois antioxydant et pro-oxydant. Alors que cette enzyme agit pour limiter les oxydations cellulaires, son expression est également nécessaire pour la mise en place des voies de défense liées aux phytohormones qui sont déclenchées par le stress oxydant. Ces observations indiquent que l’enzyme ferait partie intégrante de la signalisation oxydante chez les plantes.

L’étude, publiée dans Plant, Cell & Environment, ouvre des perspectives intrigantes concernant les détails mécanistiques qui sont impliqués.

Légende Figure : Métabolisme du H2O2 par l’ascorbate peroxidase (APX) et régénération de l’ascorbate (vitamine C) à partir de sa forme oxydée par la monodéshydroascorbate reductase (MDHAR).

-> Contact: graham.noctor@universite-paris-saclay.fr

Les thérapies non-substitutives sont en train de changer le paradigme du traitement de l'hémophilie A, qui était auparavant dominé par la thérapie de remplacement. Cependant, l'équivalence en facteur VIII (FVIII) de ces nouvelles thérapies n'est pas claire, car les essais in vitro génèrent des réponses variables.

Dans une étude publiée dans Haematologica, les chercheurs de l’unité Hémostase Inflammation Thrombose (UMR-S 1176 INSERM/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre) ont étudié des souris hémophiles A (FVIII-déficientes) et quatre modèles différents de saignement in vivo pour comparer le FVIII à l'emicizumab et à un analogue identique en séquence de l'anticorps ciblant l’inhibiteur de la voie du facteur tissulaire (TFPI), le marstacimab (SIA-marstacimab).

La sévérité de ces modèles était variable, chacun nécessitant des doses différentes allant de 2,5 à 25 UI/kg de FVIII pour réduire la quantité de sang perdu à des niveaux comparables à ceux des souris sauvages. Il est important de noter que le traitement par FVIII a produit des caillots stables, sans re-saignements spontanés. L'emicizumab et le SIA-marstacimab (utilisés à des doses thérapeutiques de 55 mg/ml et 16 mg/ml, respectivement) ont présenté une équivalence du FVIII variable et dépendante du modèle. Il convient de noter que l'administration d'emicizumab et du SIA-marstacimab ont entraîné des re-saignements spontanés dans les modèles TVT, TAT et tail-clip, ce qui les distingue encore plus du traitement par le FVIII.

Cette étude montre qu'il est peu probable que l'emicizumab, le SIA-marstacimab et d'autres molécules similaires aient une équivalence unique en FVIII, car leur activité dépend des conditions locales et de la gravité des blessures.

-> Contact : peter.lenting@inserm.fr / caterina.casari@inserm.fr

Les petits ARNs nucléolaires sont des transcrits non-codants qui guident des modifications chimiques sur des substrats ARN et modulent l'expression des gènes aux niveaux épigénétiques et post-transcriptionnels. Cependant, l'étendue de leur potentiel régulateur et les mécanismes moléculaires associés restent mal compris.

Dans le cadre d’une collaboration entre le département B3S et la plateforme NGS de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), la plateforme EpiRNA-seq à Nancy et le groupe Palancade à l’institut Jacques Monod, les scientifiques ont identifié chez la levure fissipare, un snoRNA conservé appelé snR107 qui est codé dans un intron non-annoté de l'ARN long non-codant mamRNA et exerce deux fonctions cellulaires indépendantes. D'une part, snR107 guide la 2'-O-methylation d'un site spécifique de l'ARNr 25S et promeut la biogénèse de la sous-unité 60S du ribosome. D'autre part, snR107 s'associe avec les protéines de liaison à l'ARN gamétogéniques Mmi1 et Mei2, contrôlant leur inhibition réciproque et limitant l'expression des gènes méiotiques pendant la différenciation sexuelle. Ces deux fonctions impliquent des motifs distincts dans snR107, notamment une séquence de ciblage de la 2'-O-methylation conservée.

Ces résultats, publiés dans Nature Communications, montrent ainsi que snR107 est un double régulateur de modification de l'ARN ribosomal et d'effecteurs de la gamétogénèse, élargissant notre vision des fonctions non-canoniques exercées par les snoRNAs dans le destin cellulaire.

-> Contact : mathieu.rougemaille@i2bc.paris-saclay.fr

Un article publié dans European Urology présente une revue narrative collaborative sur les avancées récentes dans le traitement du cancer de la prostate avancé. Coordonné par le Pr Karim Fizazi, , chef du comité génito-urinaire de Gustave Roussy (UPSaclay, Villejuif), avec des contributions de chercheurs internationaux, cet article explore les combinaisons thérapeutiques pour le cancer de la prostate localement avancé et métastatique hormono-sensible (mHSPC).

Les auteurs soulignent que le paysage thérapeutique a évolué avec l'introduction de nouvelles options comme le docétaxel et les inhibiteurs de la voie des récepteurs des androgènes (ARPI). Ces traitements visent à intensifier le traitement dès les premières phases de la maladie. Les résultats montrent que l'association d'un ARPI avec la privation androgénique (ADT), souvent associée au docetaxel est devenue le standard de soin pour le mHSPC, avec des bénéfices de survie démontrés dans plusieurs essais cliniques.

L'étude met également en lumière les défis liés à la sélection des patients pour ces traitements intensifiés et la nécessité de stratégies de désescalade pour minimiser les effets secondaires à long terme. Les auteurs insistent sur l'importance de l'imagerie de pointe, comme le PSMA-PET, pour une détection précoce et une meilleure évaluation de l’atteinte tumorale.

En conclusion, bien que les combinaisons thérapeutiques améliorent la survie, elles nécessitent une gestion minutieuse pour équilibrer les bénéfices avec les risques d’effets secondaires, tout en optimisant la qualité de vie des patients.

-> Contact : karim.fizazi@gustaveroussy.fr

Les cellules utilisent de nombreux mécanismes de contrôle-qualité au cours de la biosynthèse des protéines. Les défauts qui perturbent le décodage de l'ARN messager peuvent provoquer le blocage des ribosomes, empêchant l'expression des gènes. Ces ribosomes bloqués ne sont plus disponibles pour le processus de traduction, ce qui représente un défi à la fois pour l'homéostasie des ribosomes et la survie de la cellule.

Les cellules eucaryotes évitent l'accumulation de polypeptides aberrants potentiellement toxiques et maintiennent la disponibilité des ribosomes en employant des mécanismes de surveillance, comme le complexe de contrôle-qualité associé aux ribosomes (RQC), très conservé au cours de l'évolution. Les voies de sauvetage dissocient le ribosome bloqué, en libérant la sous-unité 40S attachée à l'ARNm et la sous-unité 60S encore attachée à un ARNt avec le peptide en élongation. RQC assure l'ubiquitination, l'extraction et la dégradation du peptide naissant aberrant. En particulier, Rqc2p recrute, à la même position que l’ARNt au site A, des ARNt chargés en alanine et en thréonine, formant des extensions C-terminales composées de ces résidus (CAT-tails). Ces CAT-tails peuvent exposer des résidus lysine cachés dans le tunnel de sortie de la 60S pour l’ubiquitination par la E3 ligase Ltn1.

En utilisant un crible génétique, les scientifiques de l’équipe Génomique, Structure et Traduction à l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) ont identifié un allèle mutant de RQC2 comme impliqué dans la libération des peptides à partir des ribosomes bloqués. Ils ont caractérisé la protéine mutante sur le plan biochimique et, en collaboration avec l’équipe de Reynald Gillet (IGDR, Université de Rennes), sur le plan structurel, en déterminant comment la mutation ponctuelle réduisait le recrutement de l'ARNt au site A, limitant ainsi la formation des CAT-tails.

Ces résultats, publiés dans Structure, permettent de mieux comprendre le rôle de Rqc2p dans le complexe de contrôle-qualité associé aux ribosomes, et le maintien de l'homéostasie des ribosomes.

-> Contact : celine.fabret@i2bc.paris-saclay.fr

La recherche sur la vie miroir et la chiralité mobilise des techniques en physico-chimie, pour mieux comprendre les mécanismes biologiques ou pour des applications à des fins thérapeutiques.

Avec Anne Zehnacker-Rentien, directrice de recherche CNRS à l’Institut des Sciences Moléculaires d’Orsay - ISMO (CNRS/UPSaclay, Orsay).

La chiralité est une propriété fondamentale du vivant qui concerne l’ADN comme les acides aminés. Ces deux versions gauches ou droites - les énantiomères ont les mêmes propriétés physico-chimique lorsqu’ils sont dans un environnement achiral, mais acquièrent des propriétés différentes dans un milieu chiral. Les médicaments chiraux, par exemple, ont souvent une activité thérapeutique énantiosélective, parce que leurs récepteurs dans le corps sont eux même chiraux. C’est pourquoi il est important de distinguer les deux énantiomères d’une molécule chirale. Pour y parvenir, on peut utiliser des sondes de nature chimiques ou bien physique, comme le dichroisme circulaire. Anne Zehnacker-Rentien, Directrice de recherche CNRS dévoile ces procédés spectroscopiques dans ses salles d’expérience à l’Insitut des Science Moléculaires d’Orsay.

Ecouter le podcast

Il passe une grande partie de son temps dans les airs, au-dessus de la canopée, mais il n’en a pas moins les pieds sur terre ! Daniel Berveiller, ingénieur de recherche au laboratoire Ecologie Société Evolution, est le nouveau portrait de l’IDEEV.

Lire la suite du portrait sur le site de l’IDEEV

Avec la participation de Anne Gabory, Equipe MECP2 - Mécanismes Epigénétiques, Construction et Prédiction des Phénotypes, Unité BREED - Biologie de la Reproduction, Environnement, Epigénétique et Développement (INRAE/UVSQ/UPSaclay, Jouy-en-Josas) : Epigénétique transgénérationnelle chez les mammifères : concepts, faits et controverses

La séance aura lieu à l'Amphithéâtre Marie Curie, Institut Curie, 11-13 rue Pierre et Marie Curie, 75005 Paris

Participation en distanciel via la connexion zoom

ID de réunion : 983 6211 6129 - Code secret : PF68x7

Seminar

Ludwig-Maximilians-Universität in Munich, Germany

Prof. Dr. Andrea Rentmeister

Researcher in Chemical Biology, Professor at LMU Munich
https://www.rentmeister-group.com/ 

Monday, April 28th 2025

14:30 pm

Centre de recherche - Institut Curie - Orsay, Amphitheater Nelly Riguet Bat 111 

Abstract

Alkylation is an important strategy to modulate the chemical and biological properties of nucleic acids. Selective post-synthetic methylation or alkylation can be achieved by enzymes, owing to their regio- and chemoselectivity. Prenyltransferases (PTases) rely on dimethylallyl diphosphate (DMAPP) as cofactor for the transfer of C5 units, whereas methyltransferases (MTases) utilize S-adenosyl-L-methionine (SAM or AdoMet) as cofactor for C1 transfer.

Andrea Renmeister est récipiendaire du Prix Franco-Allemand « Georg Wittig – Victor Grignard » 2024, attribué par la Société Chimique de France sur proposition de la Division de Chémobiologie SCF-ChemBio. Dans le cadre de sa tournée en France, nous la recevrons sur le campus de Paris-Saclay, à l’Institut Curie Orsay le 28/04/2025.

Dans une étude publiée dans European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging, les scientifiques du laboratoire de Mathématiques d’Orsay – LMO et de l’unité BioMaps (SHFJ, UMR CEA/CNRS/Inserm/UPSaclay, Orsay) ont utilisé un fantôme numérique haute définition du corps humain pour valider, sous conditions simulées, la fiabilité d’un logiciel de modélisation cinétique avancée en imagerie TEP qu’ils développent depuis 3 ans (Besson & Faure, 2024), projet lauréat des programmes RISE CNRS innovation 2022 et BFT Lab 2024, valorisé par l’Université Paris-Saclay (7 dépôts enregistrés actuellement à l’agence de protection des programmes).

-> Contact : florent.besson@aphp.fr

L’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) est une maladie pulmonaire rare et grave avec un pronostic vital engagé. Après plusieurs essais positifs, une dernière étude confirme l’efficacité d’un biotraitement, le sotatercept. Ses résultats porteurs d’espoirs pour les patients ont été présentés lors de la session scientifique annuelle de l'American College of Cardiology 2025 (ACC.25) par Marc Humbert, professeur à l’Université Paris-Saclay, chef du service de pneumologie de l’hôpital Bicêtre (AP-HP), directeur de l’Unité Mixte de Recherche Université Paris-Saclay/Inserm « Hypertension Pulmonaire : Physiopathologie et Innovation Thérapeutique » 999 et coordonnateur du centre de référence de l'hypertension pulmonaire (Hôpital Bicêtre, AP-HP).

L’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) se manifeste par un essoufflement progressif à l’effort puis au repos, des malaises voire des syncopes et un risque vital. Elle est provoquée par une élévation anormale de la pression sanguine dans les artères qui vont de la partie droite du cœur aux poumons. Au fil du temps, les petites artères pulmonaires s’épaississent et se bouchent en raison d’une accumulation progressive des cellules de la paroi vasculaire. Le sotatercept fonctionne comme un « piège à ligands des récepteurs de l’activine » et vise à rétablir la stabilité vasculaire pulmonaire, en empêchant l’activation excessive des voies de prolifération vasculaire.

Une étude précédente de phase 3 (permettant d’envisager une mise sur le marché) avait déjà donné des résultats positifs (lire notre précédente info), mais le nouvel essai baptisé ZENITH apporte un véritable espoir pour les patients à haut risque de mortalité malgré un traitement maximal de l’HTAP. Il vient de démontrer l’efficacité du sotatercept, un médicament commercialisé par les laboratoires Merck, en réduisant de manière significative le risque de décès, de transplantation pulmonaire ou d'hospitalisation prolongée de plus de 24 heures par rapport au placebo. Dès l’analyse intermédiaire programmée après 50% des événements prévus dans le cadre de l’étude, il a été démontré que les patients recevant le sotatercept ont bénéficié d'une réduction du risque relatif d'un ensemble d'événements majeurs de morbidité et de mortalité de 76% par rapport aux patients sous placebo. Après un suivi médian de moins d’une année, 17,4% des patients traités par le sotatercept ont présenté au moins un de ces événements, contre 54,7% dans le groupe placebo (p<0,0001).

« Cette étude a montré que l’ajout de sotatercept au traitement standard maximal toléré de l’HTAP réduisait le risque de décès ou d’événements d’aggravation clinique et améliorait la capacité à l’effort et la classe fonctionnelle par rapport aux traitements standards seuls de l’HTAP » explique le Pr Marc Humbert, directeur du centre de référence de l’hypertension pulmonaire de l’AP-HP, Université Paris-Saclay.

Sur la base de ces résultats et pour des raisons éthiques, l'étude a été interrompue par un comité de surveillance indépendant pour permettre aux patients recevant du placebo de remplacer ce dernier par le sotatercept afin de ne pas compromettre leurs chances de bénéficier d’un traitement efficace. Il est à noter que c’est la première fois dans le domaine des essais thérapeutiques de l’HTAP qu’une analyse intermédiaire nécessite l’arrêt d’une étude en raison de l’efficacité du traitement.

Ces nouveaux résultats plein d’espoirs pour les patients ont été présentés lors de la session scientifique annuelle de l'American College of Cardiology 2025 (ACC.25) et ont été publiés simultanément dans The New England Journal of Medicine.

Lire le communiqué de presse de UPSaclay

-> Contact : marc.humbert@universite-paris-saclay.fr

Dans une étude publiée dans Science of The Total Environment, des chercheurs du Centre de Recherche en Epidémiologie et Santé des Populations – CESP (UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Villejuif) et de l’Université Paris Cité ont exploré les liens entre des expositions environnementales survenues durant la période périnatale et l’enfance, et le risque d’endométriose/adénomyose chez les femmes.

Cette recherche repose sur les données de la cohorte prospective NutriNet-Santé, qui suit des dizaines de milliers de volontaires en France depuis 2009. L’analyse a porté sur 25 251 femmes ayant renseigné leurs expositions périnatales et infantiles via un questionnaire en 2019. Les associations avec l’endométriose ou l’adénomyose autodéclarées ont été évaluées à l’aide de modèles de régression logistique multivariés, ajustés sur des facteurs de confusion potentiels.

Les résultats indiquent que certaines expositions précoces sont associées à une augmentation du risque d’endométriose ou d’adénomyose, notamment un faible poids de naissance, l’exposition au tabagisme maternel pendant la grossesse, la fréquentation de la crèche, la présence d’animaux domestiques durant l’enfance, et l’exposition à la moisissure dans le logement. À l’inverse, le fait d’avoir vécu dans une ferme ou d’avoir des parents agriculteurs semblait associé à une réduction du risque.

Ces résultats soulignent l’importance des expositions environnementales précoces dans la compréhension des mécanismes de l’endométriose et de l’adénomyose, et ouvrent des pistes pour la prévention primaire de ces pathologies.

-> Contact: heleneamazouz@gmail.com / marina.kvaskoff@inserm.fr

As of September 2024, Liuba Mazzanti joined Paris-Saclay University as an Associate Professor in the BioCIS laboratory (CNRS/UPSaclay, Orsay) at the Faculty of Pharmacy. Her research primarily focuses on modeling biomolecules and their interactions through biophysical computational approaches and machine learning methods. She is initiating courses and teaching units related to artificial intelligence for pharmaceutical sciences students and teaches molecular modeling in medicinal chemistry.

After completing her studies in theoretical physics at Milan-Bicocca University, Liuba obtained her international Ph.D. at the École Polytechnique in Palaiseau and Milan-Bicocca University (2007). Her Ph.D. project tackled two aspects within the framework of string theory, one of the most studied theories unifying the description of the fundamental interactions of elementary particles. On the one hand, she studied integrable models in noncommutative geometry – a particular set of theories that can be exactly solved - within a deformed space-time geometry inspired by string theory. On the other hand, she developed a string theory model capable of capturing key cosmological features of the universe's evolution, from the Big Bang to its present expansion.

During her subsequent postdoctoral appointments (École Polytechnique, 2007-2009; University of Santiago de Compostela, 2009-2012; Utrecht University, 2012-2014), she built and studied string theory models to describe the quark-gluon plasma, a largely unknown state of matter obtained at very high energies, for which standard elementary particle theories are less suitable. She analyzed its thermodynamic and transport properties to make predictions for experiments.

Becoming progressively more interested in real-world applications, she turned to the life sciences, fascinated by their complexity and by the possibility of contributing her formal expertise. At the Institut de Biophysique Chimique (2014-2017), she began modeling RNA molecules, improving a coarse-grained force field and developing structural analysis tools to describe the folding of these dynamic and multi-conformational molecules. As she gained specialized programming skills for computational biochemistry, Liuba built a multi-language interface between the in-house suite of global optimization programs at the University of Cambridge (2017-2019) and the renowned simulation program GROMACS. Upon returning to Paris, she developed an integrative protocol that incorporated experimental data into coarse-grained molecular dynamics simulations of RNA folding at CiTCoM, Paris Cité, where she worked as an ATER (2019-2020).

Liuba then joined Paris-Saclay University, first as an ATER (2021-2022), then as a Research Associate (2022-2024), and finally as an Associate Professor. Here, she first developed a protocol to evaluate membrane permeability for peptides using biophysical computational methods and applied it to several other molecules, such as PROTACs and foldamers. To further integrate her interdisciplinary expertise, her research interests now also include protein-protein interactions, intrinsically disordered proteins, lipid membranes, and RNA-binding protein assemblies, applying and developing computational biophysics and machine learning methods.

"If you thought that science was certain - well, that is just an error on your part." - Richard P. Feynman

-> Contact : liuba.mazzanti@universite-paris-saclay.fr

Dans une revue publiée dans Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics, des chercheurs du laboratoire « Trafic de lipides et sites de contact membranaires », au sein du département de Biologie Cellulaire de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), font le point sur les avancées récentes dans l’étude des sites de contact membranaires (MCS). Ces zones, où les membranes de deux organites sont étroitement apposées, facilitent l’échange de petites molécules telles que les lipides et les ions. Longtemps sous-estimés, ces contacts apparaissent aujourd’hui comme des acteurs essentiels de la communication inter-organites, en particulier pour des structures comme les mitochondries et les gouttelettes lipidiques, qui échappent au transport vésiculaire classique.

Grâce aux progrès en imagerie et en biologie moléculaire, des études récentes ont montré que ces contacts membranaires sont plus complexes qu'on ne le pensait initialement. Ils peuvent impliquer plus de deux organites simultanément, formant ainsi des associations à trois. Cette organisation fine joue un rôle crucial dans des processus cellulaires majeurs, tels que la biogenèse des gouttelettes lipidiques et la division mitochondriale.

Les auteurs mettent également en lumière les avancées récentes en imagerie super-résolution, qui permettent d’explorer ces interactions complexes avec une précision inédite. La recherche dans ce domaine, stimulée par les innovations technologiques, promet de dévoiler de nouveaux mécanismes régissant ces connexions subcellulaires et leurs implications pour la santé et les maladies.

-> Contact : francesca.giordano@i2bc.paris-saclay.fr

Dans une étude publiée dans Journal of Immunology, des scientifiques des unités Virologie et Immunologie Moléculaires – VIM (INRAE/UVSQ/UPSaclay, Jouy-en-Josas) et Génétique Animale et Biologie Intégrative – GABI (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) ont étudié le rôle de certaines protéines de la famille prion dans la réponse immunitaire lors d’une infection par le virus de la grippe. Les auteurs se sont intéressés à trois protéines : la protéine prion cellulaire (PrPC), Shadoo et Doppel. Pour mieux comprendre leur contribution, ils ont généré des souris génétiquement modifiées pour ne pas produire l’une ou l’autre de ces protéines.

Les résultats ont montré que l’absence de PrPC (Prnp-/-) ou de Doppel (Prnd-/-) rendait les souris plus sensibles à l’infection, entraînant une morbidité accrue. Fait notable, l’absence de Doppel n’affectait pas directement la réplication du virus, contrairement à ce qui avait été observé pour PrPC. Les analyses du tissu pulmonaire n’ont pas mis en évidence de différences majeures dans les lésions pulmonaires entre souris normales et souris dépourvues de Doppel. En revanche, des analyses transcriptomiques ont révélé une réponse immunitaire particulière chez ces dernières, marquée par un afflux massif de neutrophiles confirmé par des lavages bronchoalvéolaires. En réduisant expérimentalement le nombre de neutrophiles, les chercheurs ont pu atténuer les symptômes et restaurer partiellement un profil proche de celui des souris normales.

Ces résultats révèlent que la protéine Doppel joue un rôle clé dans la régulation de la réponse inflammatoire à l’infection grippale, en limitant le recrutement excessif de neutrophiles, ce qui contribue à protéger l’individu infecté.

-> Contact : ronan.le-goffic@inrae.fr / jean-luc.vilotte@inrae.fr

L'hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) est une maladie rare et grave caractérisée par l’obstruction progressive des petites artères pulmonaires distales, entraînant un dysfonctionnement du ventricule droit et, à terme, une insuffisance ventriculaire droite et le décès. Malgré les progrès thérapeutiques, l'HTAP reste incurable et la transplantation bipulmonaire est la seule option thérapeutique définitive. L'HTAP est multifactorielle et implique plusieurs types cellulaires de la circulation pulmonaire (cellules endothéliales et musculaire. Les canaux ioniques impliqués dans l'homéostasie du potassium (K+) et du calcium (Ca2+) sont apparus depuis plusieurs années comme des acteurs cruciaux dans la pathogenèse de l'HTAP.

À première vue, l'HTAP et le cancer ne semblent pas liés. Le cancer est un vaste groupe de maladies définies par une croissance et une prolifération cellulaires incontrôlées. L'HTAP et le cancer présentent plusieurs similitudes importantes, telles que l'altération de la communication cellulaire et de l’angiogenèse, l’apparition de phénotypes proprolifératifs et de résistance à l’apoptose, de changements métaboliques, l'implication du système immunitaire. Cependant, contrairement aux cellules cancéreuses, les cellules vasculaires pulmonaires de l'HTAP ne sont pas invasives et ne produisent pas de métastases.

Les similitudes entre cancer et HTAP offrent aux chercheurs et aux cliniciens de nouvelles possibilités d'appliquer les stratégies de traitement. Une revue parue dans Trends in Molecular Medicine explore les parallèles complexes entre l'HTAP et le cancer, et met l'accent sur leurs similarités aux niveaux moléculaire, cellulaire et clinique. Les auteurs discutent également des implications potentielles de ces similitudes pour le développement de nouveaux traitements.

Les canaux K+ et Ca2+ sont essentiels à la progression l'HTAP et des cancers et offrent des cibles thérapeutiques prometteuses pour ces deux pathologies. Les connaissances acquises sur l'une des maladies pourraient éclairer le traitement de l'autre, notamment compte tenu de l'impact bidirectionnel potentiel de l'HTAP et du cancer par le biais de canalopathies chevauchantes. Les recherches futures devraient explorer le lien fonctionnel entre les canaux K+ et Ca2+ dans l'HTAP en s'appuyant sur les concepts démontrés dans le cancer. L'étude des interactions entre les canaux ioniques mitochondriaux et membranaires plasmiques pourrait révéler de nouvelles stratégies thérapeutiques pour le cancer et l'HTAP. Le ciblage de voies moléculaires communes ouvre des perspectives de repositionnement de médicaments et pourrait être porteur d'espoir pour ces maladies.

Cette étude collaborative implique le Dr Fabrice Antigny et le Dr Véronique Capuano de l’unité l’UMR-S 999 « Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique » (INSERM/UPSaclay), le Dr David Crottès, Dr Christophe Vandier et le Dr Maxime Guéguinou de l’UMR-S 1O69 (INSERM/Université de Tours.

-> Contact: fabrice.antigny@inserm.fr

Dans une étude publiée dans Communications Medicine, les scientifiques du laboratoire Édition Thérapeutique du Génome, dirigé par le Dr Mario Amendola au sein de l’Unité Integrare (UMR-S 951 Inserm/UEVE/UPSaclay) de Généthon (Evry), ont développé une thérapie génique innovante pour traiter le déficit en lipase lysosomale acide (LAL-D), une maladie génétique rare et sévère causée par des mutations dans le gène LIPA. Cette pathologie entraîne une accumulation anormale de lipides dans plusieurs organes (foie, rate et intestin), souvent fatale chez les nourrissons, et pour laquelle il n’existe pas encore de traitement curatif.

Dans ce but, les chercheurs ont conçu un traitement correctif basé sur l’injection d’un vecteur viral recombinant (rAAV8) codant pour le gène humain LIPA, sous le contrôle d’un promoteur spécifique aux hépatocytes. Ce vecteur a été évalué dans un nouveau modèle murin Lipa-/-, reproduisant les symptômes de la forme sévère de la maladie.

Les résultats montrent qu’une dose minimale de rAAV8 suffit à prévenir la mortalité liée à la maladie et à corriger l’accumulation de cholestérol et de triglycérides dans les organes et le sang. Des analyses transcriptomiques et biochimiques ont également révélé un dysfonctionnement mitochondrial chez les souris malades, restauré après traitement.

Ces travaux ouvrent la voie à une nouvelle approche thérapeutique durable pour les patients atteints de LAL-D.

-> Contact : mamendola@genethon.fr / mlaurent@genethon.fr

Elise Lucotte is an evolutionary geneticist whose research focuses on the evolution of sex chromosomes and biological differences between the sexes, particularly in humans, and their impact on health. She was recruited has a CNRS “chargée de recherche” in October 2024 within the Laboratoire Écologie, Systématique et Évolution -ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette), in the GEE team.

After completing her studies at Paris Saclay University, Elise joined the Musée de l'Homme for her PhD on the evolution of genetic differences between the sexes in humans, co-directed by Evelyne Heyer and Bruno Toupance. In 2016, she joined Mikkel H. Schierup's team at the Bioinformatic Research Center (University of Aarhus), where she worked as a postdoc for three and a half years on sex chromosome genomics. During this time, she collaborated with the deCODE genetics institute in Iceland. In 2019, she returned to France for a postdoctorate at the CESP (INSERM/UPSaclay). She specialized in gene-disease associations, under the supervision of Thérèse Truong, by identifying common genetic risk factors between breast and thyroid cancers. Finally, in 2021, she joined the ESE research unit and the GEE team for a third post-doctorate where she studied mating-type chromosomes in Microbotryum anther-smut fungi under the supervision of Tatiana Giraud and Ricardo Rodrigues de la Vega. These diverse experiences have enabled her to make her mark in the field of sex chromosome genomics and sexually antagonistic selection, and to obtain a position as CNRS CR in section 21 in 2024.

Elise attaches a particular importance to workplace mental health and well-being, work-life balance and diversity of profiles in research. She is convinced of the invaluable impact of the considerate mentoring she has received throughout her career. With this in mind, she now makes a point of being an attentive mentor to trainees, PhD students and post-docs.

“Life is about using the whole box of crayons.” – RuPaul

-> Contact: elise.lucotte@cnrs.fr

A l’occasion de la cérémonie de remise des prix de la Fondation pour la Recherche sur le Cancer (ARC), qui a eu lieu le 15 avril 2025 à Paris, Léa Montégut, lauréate du 2e Prix de Thèse Oberling-Haguenau Fondation ARC, et Eric Vivier, lauréat du 53e Prix Fondation ARC Léopold Griffuel, étaient les invités de la matinale de France Inter le 16 avril 2025 dans l’émission « Le grand entretien ».

Léa Montégut a réalisé sa thèse à l’UPSaclay, à Gustave Roussy, sous la direction de Guido Kroemer et de Isabelle Martins, sur le « Rôle de la protéine ACBP dans les maladies liées à l'âge et le cancer ». Elle est actuellement post-doctorante à l’hôpital Mont-Sinaï à New-York.

Eric Vivier est Professeur à l’Assistance Publique Hôpitaux de Marseille, Aix-Marseille Université, spécialiste en immunologie des cancers et l’un des fondateurs d’Innate Pharma, une société de biotechnologies au stade clinique, spécialisée en immuno-oncologie. Il est Président du Paris-Saclay Cancer Cluster.

Ecouter l’émission

Voir aussi l'Actu Gustave-Roussy

Philippe Charlier est médecin légiste, anthropologue, archéologue, auteur, maître de conférences, directeur du Laboratoire Anthropologie, Archéologie, Biologie - LAAB à l'Université Paris-Saclay, Université de Versailles, Saint-Quentin-en-Yvelines. Directeur de la collection Terre humaine chez Plon et rédacteur en chef de la revue numérique Ethics Medecine and Public Health, Philippe Charlier est aussi familier avec la sphère physique et les corps qui la peuplent qu'avec le monde de l'invisible et ses manifestations.

Ancien directeur du Département de la recherche et de l'enseignement du Musée du Quai Branly, membre cofondateur de la Fondation Anthropologie, Archéologie, Biologie de l'Institut de France et praticien hospitalier à l'APHP, il est l'auteur de nombreux ouvrages consacrés au surnaturel, aux zombies, au vaudou, aux momies, aux vampires et aux esprits. Il vient de publier chez Hazan, l'ouvrage richement illustré Fantômes yôkai dédié aux apparitions et démons japonais accompagnés d'estampes de grands-maîtres comme Hokusaï.

-> Contact : philippe.charlier@uvsq.fr

Comment repousser les limites de la microscopie optique avec un équipement standard ?

Le comité de pilotage du réseau des microscopistes INRAE a le plaisir de vous proposer un webinaire de découverte de la microscopie d'expansion qui permet d'améliorer la résolution en agissant sur les échantillons.

Pour en apprendre plus sur ses les différentes modalités et la mise en œuvre de cette technique, merci de vous inscrire.

La microscopie d'expansion

Lundi 23 juin 2025 à partir de 10h

Programme du Webinaire

1. 10h00 - Introduction
2. 10h05 - La microscopie d'expansion, une alternative abordable aux techniques classiques de super-résolution - Mónica Fernández-Monreal, Bordeaux Imaging Center, UAR 3420 CNRS - Université de Bordeaux

1. 10h35 - Découvrir le noyau des cellules en méiose grâce à la microscopie d'expansion - Laurence Cromer, Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (UPSaclay/INRAE/AgroParisTech, Versailles)