Le programme Odyssee de l’Ambassade de France aux États-Unis finance les missions en France de jeunes chercheurs travaillant aux États-Unis. Ce programme permet aux jeunes chercheurs basés aux Etats-Unis de visiter des laboratoires français, d'y présenter leurs travaux, de rencontrer des chercheurs et d'explorer des opportunités de collaboration et de carrière.

• Date limite de candidature : 2 mars 2025.
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Dans une étude parue dans British Journal of Cancer Reports, une équipe du SPI/DMTS (CEA/INRAE/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) a étudié l’efficacité antitumorale d’un anticorps chimérique, le Rendomab B49 (xiRB49), conjugué à une cytotoxine, la monométhyl auristatine E (MMAE) constituant l’ADC xiRB49-MMAE.

Ciblant le récepteur B des endothélines (ETB), récepteur couplé aux protéines G, dont l’expression est surexprimée dans de nombreux cancers, le xiRB49 présente des caractéristiques remarquables. En effet, outre sa grande affinité pour ETB, il se fixe préférentiellement sur la conformation activée de ce dernier induite par la liaison de son ligand : l’endothéline 1 (ET-1). Dans les cancers pour lesquels l’axe endothéline est dérégulé, le microenvironnement tumoral est riche en ET-1. A la différence des antagonistes de ETB évalués dans de nombreux essais cliniques en oncologie dont les résultats ont été décevants, la fixation du xiRB49 sur ce récepteur n’est pas déplacée par des concentrations élevées d’ET-1.

Dans cet article, les auteurs montrent que cet ADC s’est révélé extrêmement efficace pour bloquer la progression d’un mélanome dans un modèle préclinique et que son utilisation en immunohistochimie, sur des biopsies de patients, pourrait également permettre de stratifier les malades éligibles à ce traitement.

Cet anticorps breveté est licencié à Skymab Biotherapeutics, une spin-off du CEA, qui assure son développement pour une utilisation en clinique.

-> Contact : didier.boquet@cea.fr

La polyarthrite rhumatoïde est une maladie complexe caractérisée par des douleurs articulaires, des raideurs, des gonflements et une synovite chronique, résultant de l'interaction dysrégulée entre les synoviocytes et les cellules immunitaires. Son étiologie incertaine rend difficile la recherche d'un remède. Le concept de jumeaux numériques, utilisé en ingénierie, peut être appliqué aux soins de santé pour améliorer le diagnostic et le traitement de maladies complexes comme la polyarthrite rhumatoïde. 

Deux chercheuses de l’Université de Paris Saclay (Evry, Genopole, INRIA Saclay), Anna Niarakis (PU) et Naouel Zerrouk (PhD) (Evry, Genopole), en collaboration avec Franck Augé (SANOFI Aventis R&D) via un contrat CIFRE, ouvrent la voie vers un jumeau numérique de l'articulation arthritique en construisant une grande carte modulaire des réactions biochimiques des interactions intra- et intercellulaires. Ce réseau, comprenant plus de 1000 biomolécules, est ensuite converti en l'un des plus grands modèles booléens exécutables pour les systèmes biologiques à ce jour.

Validé par les connaissances existantes et les données d'expression génique, le modèle est utilisé pour explorer les traitements actuels et identifier de nouvelles cibles thérapeutiques pour la polyarthrite rhumatoïde.

Ce travail est publié sur Nature Digital Medicine.

-> Contact : anna.niarakis@inria.fr

Dans une étude publiée dans les Annales Pharmaceutiques Françaises (organe de l'Académie Nationale de Pharmacie), les scientifiques du Laboratoire Anthropologie, Archéologie, Biologie - LAAB (UFR Simone Veil - santé UVSQ/UPSaclay, Montigny-Le-Bretonneux) présentent les résultats de l’étude chimique de résidus de pipes retrouvés dans le cadre d’une mission archéologique (mission AROMA : Archéologie de l’exercice du pouvoir royal et magico-religieux) dans les palais royaux d’Abomey (Bénin), datant du XVIIe–XIXe siècle.

La recherche de nombreux produits a été effectuée (essentiellement du tabac, du cannabis) mais n’a mis en évidence que la présence de résidus de caféine. Ce résultat est discuté et comparé aux notions de terrain et notamment aux enquêtes ethnologiques où le café était consommé à l’ancienne, fumé dans une pipe (partie périphérique ou coque, et non le grain lui-même ou les feuilles).

Cette étude démontre que de plus en plus, la chimie moléculaire et la pharmacologie viennent compléter les études classiques dans le domaine de l’archéologie.

-> Contact : philippe.charlier@uvsq.fr

Dans une étude publiée dans American Journal of Physiology - Heart and Circulatory Physiology, des chercheurs de l’Université Comenius (Bratislava, SLovaquie), du Centre de mathématiques appliquées Borelli (CNRS/ENS Paris-Saclay/UPSaclay/UParis-Cité/Inserm/Service de santé des armées) et du Laboratoire de Signalisation et physiopathologie cardiovasculaire (UMR-S 1180 INSERM/UPSaclay, Orsay) ont analysé le rôle des cholinestérases (ChE) dans la physiologie cardiaque. Ces enzymes, connues pour leur implication dans le système nerveux, pourraient jouer un rôle clé dans la régulation du rythme cardiaque et des réponses aux traitements cholinergiques.

L’étude a révélé une distribution spécifique des ChE dans le cœur : l’acétylcholinestérase (AChE) est principalement localisée dans les oreillettes et l’épicarde, où elle est ancrée par PRiMA ou le collagène Q. La butyrylcholinestérase (BChE), plus abondante, se retrouve majoritairement sous forme soluble dans les ventricules.

Des expériences menées sur des souris génétiquement modifiées ont montré que l’absence d’AChE ancrée réduit la modulation du rythme cardiaque par les inhibiteurs de ChE. En revanche, la suppression de BChE entraîne une hypersensibilité à ces inhibiteurs, suggérant un rôle modulateur de cette enzyme sur la transmission cholinergique.

L’impact de ces enzymes sur la réponse du cœur aux stimuli β-adrénergiques et cholinergiques met en lumière leur potentiel en tant que cibles thérapeutiques.

-> Contact: rodolphe.fischmeister@inserm.fr

Les inversions chromosomiques peuvent jouer des rôles majeurs dans l’adaptation, et les deux segments inversés peuvent être maintenus en fréquences équilibrés s’ils sont bénéfiques dans des conditions différentes. Chez les champignons pathogènes de plantes, des éléments mobiles géants viennent d’être découverts, appelés « Starships », qui peuvent transférer des gènes entre espèces.

Une récente étude a révélé que, chez le champignon pathogène du châtaignier Cryphonectria parasitica, originaire d’Asie, une inversion chromosomique est maintenue en fréquence équilibrée au sein des populations envahissantes européennes, les deux segments inversés étant très différenciés. Les deux segments inversés possèdent différents «Starships », contenant différents gènes. L’inversion est située proche du locus de type sexuel du champignon. Il est donc probable que cette inversion et les Starships qu’elle contient jouent un rôle dans l’adaptation du champignon pathogène.

Cet article vient d’être publié dans Molecular Biology and Evolution et l’étude a été menée par le Laboratoire Écologie, Systématique et Évolution -ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette), en collaboration avec l’INRAE Nouvelle-Aquitaine-Bordeaux, et deux équipes de recherche en Suisse, à l’Université de Neuchâtel et au Swiss Federal Institute for Forest Snow and Landscape Research (WSL).

Légende Figure : A. Symptômes causés par le champignon Cryphonectria parasitica sur châtaignier : chancres visibles sur le tronc et à la surface du tronc. B. Localisation de l’inversion chromosomique à proximité du locus de type sexuel du champignon. C. Schéma de l’inversion contenant des Starships.

-> Contact: fanny.hartmann@universite-paris-saclay.fr / tatiana.giraud@universite-paris-saclay.fr

La recombinaison homologue (HR) est essentielle au maintien de la stabilité du génome, en s'appuyant sur la recombinase RAD51 pour catalyser une réparation précise de l'ADN dépendant de l'homologie.

Dans un éditorial paru dans Trends in Biochemical Sciences, Rajeev Kumar de l’Institut Jean Pierre Bourgin - Sciences du végétal (IJPB, centre INRAE de Versailles-Saclay) rapporte les travaux récents de Carver et al. (2024) publiés dans Science sur un nouveau mécanisme de contrôle de la HR.

Alors que divers modulateurs cellulaires contrôlent la HR, cette étude révèle un mécanisme moléculaire unique utilisé par FIDGETIN-LIKE-1 (FIGNL1) qui dissocie RAD51 de l'ADN via l'extrémité RAD51 N et l'assemblage hexamère FIGNL1.

Légende Figure : Perturbation du nucléofilament de RAD51 par FIGNL1. Le monomère de FINGL1 contenant de l'ATP est recruté par les dimères de RAD51 sur le nucléofilament grâce à l'interaction du domaine FRBD. L'extrémité N-terminale du RAD51 interagit avec la boucle du pore et stimule l'activité ATPase de FIGNL1. L'hexamère de FIGNL1 se forme pour encercler le peptide N-terminal de RAD51. De plus, la translocation du peptide par l'hexamère de FIGNL1 induit des confirmations structurelles dans RAD51 pour le dissocier du nucléofilament.

-> Contact : rajeev.kumar@inrae.fr

Dans une étude publiée dans ESMO Open, des scientifiques de Gustave Roussy, du Lausanne University Hospital (Suisse), de l’Amsterdam UMC (Pays-Bas), du Cleveland Clinic (États-Unis) et d’autres institutions européennes et américaines ont analysé les différences de pharmacocinétique (PK) des médicaments anticancéreux selon le sexe.

Les chercheurs ont examiné 99 agents anticancéreux approuvés par la FDA, en excluant les hormonothérapies. À partir de 1643 articles et documents réglementaires, 112 études ont été retenues. Ils ont identifié des différences de PK significatives (>20% de variation de la clairance) pour 14 médicaments, dont le 5-fluorouracile, la doxorubicine, le paclitaxel et l’atezolizumab. Pour huit autres médicaments, les résultats étaient contradictoires.

Les femmes ayant une clairance plus faible, elles pourraient être exposées à des doses plus élevées, augmentant potentiellement la toxicité et influençant l’efficacité des traitements. Pourtant, aucune adaptation posologique en fonction du sexe n’est actuellement pratiquée.

Les auteurs de l’étude soulignent la nécessité de stratégies de dosage différenciées et recommandent des analyses pharmacodynamiques approfondies. Ils appellent à une optimisation des doses selon le sexe, en accord avec le projet Optimus de la FDA, afin d’améliorer la balance bénéfice/risque des traitements et de personnaliser la prise en charge des patients en oncologie.

Légende Figure : Exemples de facteurs susceptibles d'influencer la variabilité des réponses aux médicaments. Le sexe biologique et le genre, ainsi que l'âge, sont des facteurs primordiaux qui peuvent avoir une influence sur les réponses aux médicaments à différents niveaux.

-> Contact : olivier.mir@gustaveroussy.fr

Dans une revue parue dans Nature Reviews Immunology, des chercheurs de l’UMR-S 1015 Immunologie des tumeurs et immunothérapie (INSERM/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif) et du Centre de Recherche des Cordeliers (Paris) ont revisité la théorie du danger en immunologie, introduite par Polly Matzinger en 1994.

Cette théorie postule que les réponses immunitaires ne sont pas uniquement déterminées par la reconnaissance des antigènes mais nécessitent des signaux de danger issus du stress tissulaire, des dommages ou des infections. Les chercheurs ont approfondi les mécanismes moléculaires sous-jacents, en mettant l’accent sur les damage-associated molecular patterns (DAMPs), les microorganism-associated molecular patterns (MAMPs) et les molécules immunomodulatrices liées au stress.

La revue examine comment les cellules cancéreuses et les virus pathogènes inhibent ces signaux de danger pour échapper à la reconnaissance immunitaire. Elle met en évidence l’impact de la dysbiose intestinale sur l’immunité et explore les défauts génétiques humains qui valident la théorie du danger.

Les auteurs proposent une hiérarchisation des mécanismes de tolérance immunologique, intégrant la suppression clonale et l’anergie. Cette mise à jour de la théorie du danger ouvre des perspectives sur l’optimisation des traitements anticancéreux et des vaccins en exploitant les signaux de danger pour renforcer l’immunité.

La théorie du danger en immunologie. a. Dans des conditions normales et homéostatiques, les cellules présentatrices d'antigènes (APCs) restent au repos et ne fournissent aux lymphocytes T que le signal 1 sous la forme de peptides restreints du MHC de classe I ou du MHC de classe II. Il en résulte une absence de réponse des cellules T ou l'induction d'une tolérance immunitaire. b, Dans les tissus stressés, endommagés ou infectés, les signaux de danger déclenchent l'activation des APCs, ce qui permet l'induction d'une véritable réponse des cellules T.

-> Contact : laurence.zitvogel@gustaveroussy.fr

Dans une étude publiée dans The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism, des chercheurs du Service d’Endocrinologie et des Maladies de la Reproduction (Hôpital Bicêtre, APHP-Université Paris-Saclay) et de l’UMR-S 1185 (INSERM/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre), de l’Institut de Médecine Sourasky de Tel Aviv, du Technion - Israel Institute of Technology et d’autres institutions ont identifié et caractérisé un nouveau variant du gène NR3C1, impliqué dans la résistance généralisée aux glucocorticoïdes (GGRS).

L’étude porte sur un patient de 68 ans initialement suspecté d’avoir un syndrome de Cushing, mais dont les analyses ont révélé une résistance aux glucocorticoïdes due à une mutation hétérozygote (c.1330T>G, p.Phe444Val) située dans le domaine de liaison à l’ADN du récepteur aux glucocorticoïdes. Les chercheurs ont effectué des analyses fonctionnelles in vitro sur des cellules HEK 293T transfectées, montrant que ce variant entraîne une perte d’activité transcriptionnelle malgré une translocation nucléaire normale.

Ces résultats confirment un défaut de liaison à l’ADN, expliquant la résistance hormonale et les manifestations cliniques atypiques du patient, notamment une hypertension et une hypercortisolémie sans signes classiques de Cushing.

L’étude souligne l’importance d’un diagnostic précoce pour éviter des interventions inutiles et propose que l’analyse génétique des variants du NR3C1 soit intégrée à l’évaluation des patients présentant une hypercortisolémie inexpliquée.

-> Contact : margaux.laulhe@universite-paris-saclay.fr

Deux équipes de l’Université Paris-Saclay, réunissant des chercheurs de BioMaps (SHFJ, UMR CEA/CNRS/Inserm/UPSaclay, Orsay) et de l’Institut Galien Paris-Saclay (IGPS, CNRS/UPSaclay, Orsay), en collaboration avec la startup IMESCIA, ont exploré une approche innovante pour optimiser l’efficacité de la mertansine, un agent antitumoral puissant mais hautement toxique.

En combinant la mertansine avec le polyacrylamide (PAAm), un polymère hydrophile développé par l’IGPS et valorisé par IMESCIA, ils ont conçu un pro-drogue polymère soluble (PAAm-DM1) capable de s’accumuler spécifiquement dans les tumeurs par effet passif. Pour évaluer sa distribution et son efficacité, l’imagerie par tomographie par émission de positons (TEP) a été intégrée à cette nouvelle formulation. L’approche a permis d’obtenir une accumulation tumorale significative tout en minimisant la toxicité systémique. Différentes voies d’administration ont été étudiées : une injection intraveineuse directe et une injection sous-cutanée, cette dernière permettant une libération prolongée du médicament sans toxicité cutanée. La biodisponibilité étant comparable entre les deux approches, l’injection intraveineuse a été privilégiée pour cette étude.

Bien que le PAAm-DM1 ait démontré une efficacité prometteuse, le lien entre son accumulation tumorale et son efficacité thérapeutique reste à approfondir par des investigations biologiques complémentaires. Une combinaison avec une immunothérapie ciblant CTLA-4 a également été explorée, sans démontrer de synergie significative. Une meilleure compréhension de l’influence du microenvironnement tumoral sur l’efficacité du PAAm-DM1 sera essentielle pour renforcer l’impact de son association avec l’immunothérapie et améliorer les résultats cliniques.

Ces travaux, publiés dans Journal of Controllled Release, ouvrent la voie à des formulations de chimiothérapie mieux tolérées, plus ciblées et offrant un potentiel de personnalisation des traitements pour divers types de cancers.

-> Contact : charles.truillet@cea.fr / julien.nicolas@cnrs.fr

Avec les bourses Sophie Germain, le consulat général de France à Québec promeut la mobilité de doctorants et de post-doctorants du Québec. Ce programme soutient des séjours de recherche d’un minimum d’un mois dans des organismes et des institutions en France.

• Date limite de candidature : 21 mars 2025.
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Les allocations post-doctorales de la fondation Fyssen soutiennent toutes les approches scientifiques des mécanismes logiques du comportement chez les êtres vivants, ainsi que leur développement ontogénétique et phylogénétique.

• Date limite de candidature : 31 mars 2025
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We are pleased to organize the Thursday’s PSCC #15, which will take place on March 20th between 4:30 to 6:00 pm followed by an informal get together for the attendees. This event will be held on site (LAB116, 116 Rue Edouard Vaillant, 94800 Villejuif) & on line. Reception from 4pm onwards at the PSCC (Villejuif) and videoconferencing available (starting at 4:30pm).

If you wish to participate, please register here (limited number of seats).

We hope to see many of you at this event !

The Paris Saclay Cancer Cluster

Une étude récente publiée dans Canadian Journal of Cardiology, réalisée au Collège de France (INSERM/CNRS), au SIMoS (CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) et aux Universités Sorbonne/Créteil/Strasbourg, a exploré le potentiel thérapeutique du LIT01-196, un analogue de l’apéline-17 métaboliquement stable, dans un modèle murin d’infarctus du myocarde (IM). Deux jours après l’IM, le LIT01-196 (9 mg/kg) a été administré quotidiennement chez la souris pendant quatre semaines.

Les résultats ont révélé que le LIT01-196 améliorait de manière significative la fonction cardiaque, avec une augmentation de la fraction d’éjection du ventricule gauche (VG) et de la fraction de raccourcissement, reflétant une meilleure performance systolique. Le traitement a également limité la dilatation du VG et préservé l’épaisseur de la paroi postérieure, suggérant une réduction des processus de remodelage pathologique, associé au développement de l’insuffisance cardiaque (IC). Par ailleurs, le LIT01-196 a diminué considérablement la fibrose myocardique, un facteur clé dans l’altération de la fonction cardiaque et la rigidité ventriculaire.

Sur le plan moléculaire, l’analyse a montré une activation de l’ATPase Ca2+-2 (SERCA2) cardiaque et une phosphorylation accrue du phospholambane, ce qui améliore la contractilité et la relaxation cardiaque. De plus, le LIT01-196 a augmenté la densité vasculaire dans la zone limitrophe de l'infarctus, améliorant l'apport en oxygène et nutriments au myocarde et favorisant la réparation tissulaire. Ce traitement a permis d'obtenir ces effets bénéfiques sans induire d’hypotension, un avantage essentiel pour la gestion de l’IC.

Si ces résultats se confirment dans des essais cliniques chez l’homme, les analogues de l’apéline métaboliquement stables pourraient représenter une nouvelle avancée thérapeutique pour la prise en charge de millions de patients souffrant d’IC post IM.

Lire également l’Actu de la Fondation Recherche Cardio-Vasculaire

-> Contact : c.llorens-cortes@college-de-france.fr / catherine.llorenscortes@cea.fr

Dans une étude publiée dans Communications Biology, les scientifiques du laboratoire Structure et Activité des Biomolécules Normales et Pathologiques (SABNP, UMR-S 1204 Inserm.UEVE/UPSaclay, Evry) et de deux biothech françaises (Synsight et 4P-Pharma) ont étudié le rôle de la phosphorylation du domaine C-terminal (CTD) de la protéine TDP-43, site de plusieurs mutations pathologiques, sur la localisation subcellulaire et son impact son agrégation.

Au cours de ce travail, il a été montré que la phosphorylation du domaine CTD empêche le recrutement de TDP-43 dans les granules de stress riches en ARNm uniquement dans des conditions de stress aigues en raison d'une faible affinité pour l'ARNm, mais pas dans des conditions de stress léger. En outre, l'auto-assemblage du domaine CTD est régulé négativement par la phosphorylation dans le cytoplasme, ce qui favorise l'importation nucléaire de TDP-43.

Il a été proposé un schéma du lien entre la phosphorylation du domaine CTD de TDP-43 et sa localisation subcellulaire. Ainsi, l'état hypo-phosphorylé de TDP-43 favorise sa rétention cytoplasmique avec des condensats cytoplasmiques comme observé dans le cas du mutant hypo-phosphorylé ou en présence d'inhibiteurs de protéines kinases. En effet, l'hypo-phosphorylation de TDP-43 dans le cytoplasme régule positivement son auto-assemblage ce qui entrave l'importation de TDP-43 cytoplasmique vers le noyau conduisant à la déplétion nucléaire de TDP-43. En revanche, comme observé pour le mutant hyper-phosphorylé ainsi qu'en présence d'inhibiteurs de phosphatases, TDP-43 phosphorylée est enrichie dans le noyau.

Les auteurs de l’étude proposent que la réduction de l'auto-assemblage de domaine CTD de TDP-43 dans le cytoplasme pourrait être une stratégie intéressante pour inverser la déplétion nucléaire de TDP-43 dans les maladies neurodégénératives.

-> Contact : ahmed.bouhss@univ-evry.fr

Le prochain café se tiendra le 14 février 2025 et sera l’occasion d’écouter Bertrand Duvillié, chercheur à l'institut Curie U1021 qui nous présentera ses travaux de recherche sur "La modélisation du médulloblastome grâce à des organoïdes de cervelet humain ".

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L'insuffisance cardiaque (IC) se caractérise par une élévation de noradrénaline et d’adrénaline circulantes qui activent les récepteurs β-adrénergiques et ainsi la synthèse de l’adénosine monophosphate cyclique (AMPc), un stimulateur puissant de la fonction cardiaque. Si en aigu l’augmentation de ce nucléotide cyclique est bénéfique pour permettre l’adaptation du cœur aux besoins accrus de l’organisme lors d’un effort ou un stress, en chronique elle favorise le remodelage hypertrophique et les arythmies. C’est pourquoi les β-bloquants sont indiqués pour traiter l’IC, car ils limitent les effets délétères à long terme de la suractivation sympathique. Malgré les traitements actuels, la mortalité de 50%, 5 ans après diagnostic des patients, oblige à trouver de nouvelles stratégies thérapeutiques.

Dans une étude publiée dans Journal of the American Heart Association, les chercheurs de l’unité UMR-S 1180 (UPSaclay/INSERM, Orsay), du Molecular Biotechnology Center de l’Université de Turin et de l’institut du Thorax de Nantes Université, démontrent le potentiel thérapeutique de la surexpression d’une isoforme particulière des phosphodiestérases (PDEs), ces enzymes cruciales qui dégradent l’AMPc pour limiter et mettre fin à la stimulation du cœur. Grâce à une thérapie génique réalisée dans des modèles murins d’IC, grâce à des virus adéno-associés de sérotype 9 à fort tropisme cardiaque codant la PDE2A, ils démontrent que l’augmentation aigue de l’activité de cette enzyme réduit l’hypertrophie du ventricule gauche, la fibrose et la dysfonction cardiaque induites par des sympathomimétiques. De plus, comparée à la surexpression de la PDE4B, une autre phosphodiestérase aux effets cardioprotecteurs, la PDE2A se révèle plus efficace pour prévenir les tachycardies ventriculaires déclenchées lors d’un stress. La PDE2A agirait ainsi comme un "modulateur de sécurité" des niveaux d’AMPc en conditions pathologiques.

Cette étude ouvre la voie au développement d’activateurs de PDEs ou l’optimisation de stratégies de thérapie génique ciblée pour lutter contre l’IC et ses complications rythmiques.

Légende Figure : A, Thérapie génique avec la PDE2A de l’insuffisance cardiaque (IC) induite par les catécholamines et question posée. B, Évolution temporelle des rapports du poids du ventricule gauche (LVW) sur le poids corporel (BW) et de la fraction d'éjection (EF) chez les souris contrôles surexprimant la luciférase (AAV9-LUC) ou injectées avec l’AAV9 codant la PDE2A (AAV9-PDE2A) implantées avec des minipompes osmotiques sous-cutanées délivrant soit de l’isoprénaline et de la phényléphrine (Iso+Phe) ou bien le véhicule (NaCl). C, Images représentatives de la fibrose interstitielle révélée en bleu par coloration au trichrome de Masson et des noyaux apoptotiques en vert grâce au marquage terminal de la désoxynucléotidyl transférase dUTP (TUNEL). En bas les graphiques représentent les quantifications de la fibrose et des noyaux apoptotiques qui sont diminués grâce à la thérapie génique avec la PDE2A dans le modèle d’IC (Iso+Phe). D, Exemples représentatifs d'enregistrements simultanés d'électrocardiogrammes (ECG) de surface et intraventriculaire obtenus chez une souris injectée avec l’AAV9-LUC et perfusée de manière chronique Iso+Phe. L’histogramme montre le pourcentage de souris qui ont déclenché une tachycardie ventriculaire dans les trois groupes (NaCl-LUC, Iso+Phe-LUC, Iso+Phe-PDE2A) avant (baseline) et après un stress induit par injection d'isoprénaline et d’atropine (Iso+Atropine). 

-> Contact : jerome.leroy@universite-paris-saclay.fr

Thomas Guérin is a molecular biologist who joined the CEA/FAR/IRCM (Fontenay-aux-Roses) in December 2023 as a CEA researcher in the laboratory of genome Instability and Nuclear Organization led by Karine Dubrana.

In 2018, Thomas obtained his PhD from the Paris-Saclay University in the team of Stéphane Marcand. His research focused on dicentric chromosomes (i.e. Chromosome with two centromeres) that form anaphase bridges breaking during cytokinesis at specific positions. These breakage positions depend on the ability of a Structural Maintenance of Chromosome (SMC) protein complex, condensin, to compact DNA during late mitosis.

After defending his PhD, Thomas pursued his interest in chromosome organization by joining the team of Frank Uhlmann at the Francis Crick Institute in London. During his postdoctoral work, he characterized the interplay between transcription and chromosome organization mediated by another SMC complex, cohesin. To achieve this, he used genome-wide technics such as high-resolution chromosome conformation capture (MicroC), Chromatin immunoprecipitation, and sequencing (Guérin et al. 2024).

This work on cohesion sparked his interest in cohesin’s primary role in the establishing and maintaining sister chromatid cohesion during the cell cycle and after DNA damages. Since cohesin was first described as essential for protecting the genome against radiation, Thomas’s current project aims to unravel the multifaceted contributions of cohesin in DNA repair processes.

In addition to his research, Thomas is a member of the Directory Board of ANDès (Association Nationale des docteurs), an organization dedicated to promoting the recognition of PhD degrees and the professional contribution of doctorate holders in France.

« Ne jugez point, afin que vous ne soyez point jugés. Car on vous jugera du jugement dont vous jugez, et l'on vous mesurera avec la mesure dont vous mesurez ». Mathieu 7:1-2

-> Contact : thomas.guerin2@cea.fr

Dans une étude publiée dans Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology, les scientifiques du Laboratoire Anthropologie, Archéologie, Biologie - LAAB (UFR Simone Veil - santé UVSQ/UPSaclay, Montigny-Le-Bretonneux) et du SPI/DMTS (CEA-Joliot/INRAE/UPSaclay, site de Marcoule) ont identifié les agents infectieux encore présents dans des résidus minéralisés à l'intérieur de la baignoire de l'empereur Napoléon Ier dans sa dernière demeure de Longwood, sur l'île de Sainte-Hélène (Atlantique Sud). Il s'agit principalement d'une bactérie (Bacillus idriensis) pouvant être impliquée dans l'infection dermatologique chronique dont ce patient a été atteint depuis le siège de Toulon (1793) jusqu'à sa mort (1821). En outre des éléments protéiques en rapport avec les traitements pharmaceutiques pris par l'empereur ont été objectivés dans les mêmes résidus, à base de thé noir, eau de mer, boue/tourbe, orge et paprika.

Ainsi sont démontrés l’importance et la précision de la paléo-protéomique en paléo-pathologie et pour l’examen et l’identification de la nature précise de résidus sur échantillons anciens.

-> Contact : philippe.charlier@uvsq.fr

Dans une étude publiée dans Plant, Cell & Environment, des chercheurs du Laboratoire Écologie, Systématique et Évolution -ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette), de l’UMR EcoSys (Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau), de l’Université d’Angers, du Max Planck Institute for Biogeochemistry (Allemagne), de l’ETH Zurich et d’autres institutions internationales ont analysé l’impact de la nutrition azotée sur la composition isotopique du CO₂ respiré par les plantes.

L’équipe a étudié deux espèces, l’épinard (Spinacia oleracea) et le haricot (Phaseolus vulgaris), cultivées sous différentes proportions d’ammonium et de nitrate. Leurs analyses isotopiques ont révélé que plus la proportion d’ammonium augmentait, plus le CO₂ respiré par les feuilles était appauvri en ¹³C, tandis que la respiration des racines était peu affectée. L’étude a démontré que ces variations étaient principalement dues aux changements dans le métabolisme des acides organiques, notamment le malate et le citrate.

Les chercheurs ont ensuite développé un modèle métabolique expliquant 73% de la variance de δ¹³C dans le CO₂ respiré, en intégrant la dynamique d’utilisation et de remobilisation des acides organiques. Ces résultats soulignent le rôle central de la nutrition azotée dans la régulation du métabolisme respiratoire des plantes et son impact sur le cycle global du carbone.

Cette étude ouvre de nouvelles perspectives sur l’influence de l’azote sur les échanges isotopiques de CO₂, avec des implications potentielles pour l’agriculture et la modélisation du climat.

Légende Figure : Modèle à deux boîtes utilisé pour calculer la différence isotopique entre le CO2 respiré et les sucres (Δδ¹³CR).

-> Contact : jaleh.ghashghaie@universite-paris-saclay.fr

Dans une étude publiée dans Journal for ImmunoTherapy of Cancer, des chercheurs du Gustave Roussy et de CentraleSupélec ont exploré le lien entre la réponse immunitaire antivirale et l’efficacité des inhibiteurs de points de contrôle immunitaire (ICBs) chez les patients atteints de cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC).

Les scientifiques ont analysé les sérums de 387 patients traités par ICBs, chimiothérapie seule (CT) ou une combinaison CT-ICBs, en utilisant la technologie VirScan pour profiler les anticorps antiviraux. Ils ont observé que les patients présentant un plus grand nombre de peptides viraux reconnus par leurs anticorps (tUP) avaient une meilleure survie sous ICBs (HR 0.43, p=0.006). En revanche, cet effet n’était pas significatif pour les autres groupes de traitement.

L’étude révèle que la positivité aux anticorps contre le rhinovirus est associée à une amélioration de la survie sous ICBs, suggérant que l’immunité antivirale pourrait refléter une meilleure aptitude du système immunitaire à répondre aux traitements anticancéreux.

Ces résultats ouvrent la voie à de nouveaux biomarqueurs basés sur la réponse immunitaire antivirale pour prédire l’efficacité des ICBs et affiner les stratégies thérapeutiques en oncologie.

Légende Figure : Courbes de Kaplan-Meier pour la survie globale en fonction de la réponse aux anticorps antiviraux.

-> Contact : benjamin.besse@gustaveroussy.fr

Une étude collaborative menée par des chercheurs de l’unité Infection & Inflammation – 2I (UMR-S 1173 Inserm/UPSaclay/UVSQ, Département de Biotechnologie de la Santé, Montigny-le-Bretonneux), l’Hôpital Foch (Exhalomics) et l’Hôpital Necker-Enfants Malades (INSERM U1151, AP-HP) et publiée dans Journal of Cystic Fibrosis a exploré l'impact précoce du traitement par modulateurs de CFTR (Elexacaftor/Tezacaftor/Ivacaftor (ETI)) sur le profil métabolique de l'air expiré chez des enfants de moins de 12 ans atteints de mucoviscidose.

L'analyse des composés organiques volatils (COVs) dans l'air expiré a été réalisée par chromatographie en phase gazeuse bidimensionnelle couplée à la spectrométrie de masse avant, une semaine et un mois après l’initiation du traitement. Les résultats ont montré des modifications métaboliques significatives dès la première semaine. Parmi les 12 COVs identifiés, certains tels que le diméthylsulfide ou le tétradécène étaient corrélés à l'amélioration de la fonction respiratoire. Ces résultats suggèrent que l’analyse de l’air expiré pourrait constituer un outil non-invasif innovant pour évaluer la réponse aux modulateurs CFTR et suivre l’évolution de la maladie en population pédiatrique, tout en apportant des éclairages mécanistiques sur l'impact métabolique du traitement. Cette approche est d’autant plus pertinente que les enfants traités par ETI présentent une réduction des expectorations, rendant les biomarqueurs traditionnels moins accessibles.

Ces résultats préliminaires ouvrent la voie à des études plus approfondies sur des cohortes plus grandes afin de confirmer la pertinence clinique et la valeur prédictive des COVs d’intérêt.

-> Contact : stanislas.grassin-delyle@uvsq.fr