Life Sciences Université Paris-Saclay

Ce jour, place à un FOCUS PLATEFORME sur GATEX : une plateforme destinée à transformer l’innovation Biotech en réalité industrielle !

Inaugurée en mai 2025 par Valérie Pécresse, présidente de la Région Île-de-France, en présence de Stéphane Beaudet, président de Genopole, la plateforme GATEX de Genopole se positionne comme un accélérateur clé pour l'industrialisation des biotechnologies. Cette infrastructure unique permet de franchir le cap critique entre la recherche académique et la production industrielle, en offrant des solutions complètes de criblage de souches et d'optimisation de procédés biologiques jusqu'à l'échelle pilote (30 litres, avec une extension prévue à 100 litres d'ici 2028). Véritable tremplin pour les startups et projets académiques, GATEX propose un environnement technologique de pointe pour tester et faire monter en échelle des procédés de fermentation, enzymatiques ou cellulaires, sécurisant ainsi le passage vers l'industrialisation.

GATEX, quelles sont ses missions ? Les missions principales de GATEX sont d'accompagner la montée en échelle des procédés issus de la recherche publique et privée, d'optimiser les conditions de production, de réduire les risques technologiques liés au passage à l'industrie et de proposer un encadrement scientifique et technique renforcé. Comme son nom l’indique, GATEX (acronyme de Grow And TEst à la puissance X) vise à combler un vide critique dans le parcours d'innovation, entre la preuve de concept et la fabrication industrielle comme l’explique Julien Picot, directeur adjoint délégué aux infrastructures et plateformes technologiques au GIP Genopole : « GATEX est l’infrastructure dédiée au criblage à haut débit des souches de micro-organismes, à l’optimisation des milieux de culture composés d’ingrédients industriels et à l’optimisation des bioprocédés de fermentation pour faciliter la montée en échelle jusqu’au pilote industriel. Elle permet donc de tester la robustesse des souches à produire la molécule d’intérêt pharmaceutique, cosmétique ou agroalimentaire jusqu’à l’échelle pilote, et ainsi sécuriser les projets biotech avant le cap industriel ».

GATEX apporte un soutien en ingénierie des bioprocédés et en gestion de projet, ce qui permet de réduire les investissements initiaux souvent trop élevés pour les jeunes entreprises et favorise le développement de procédés plus robustes. La plateforme joue également un rôle clé dans la formation aux exigences de la production industrielle, auprès des chercheurs, étudiants et entrepreneurs, grâce notamment au partenariat conclu le 20 juin 2025 entre Genopole et l'ARD (Agro-industrie Recherches et Développements), expert en biotechnologies industrielles basé à Reims.

GATEX, avec quels équipements ? Équipée de robots performants automatisant à la fois la préparation des microplaques et le criblage des souches, GATEX permet de tester près de 1000 conditions différentes simultanément. Les meilleures conditions de culture ainsi identifiées sont testées dans des fermenteurs de précision de capacités croissantes allant d’un volume d’un millilitre seulement jusqu’à 30 litres afin de tester la robustesse de production de la molécule d’intérêt. Une extension des capacités de production jusqu'à 100 litres est prévue pour 2028, avec des locaux spécialement aménagés pour accueillir cette montée en puissance en grade BPF et pour des souches naturelles et des OGM de types 1 et 2. Ces fermenteurs de précision permettent de reproduire des conditions proches de la production industrielle dans des volumes pilotes. Pour assurer un suivi rigoureux, l’infrastructure est équipée de systèmes de contrôle des paramètres clés (biomasse, pH, oxygène dissous, température), d'instruments de mesure en ligne et de dispositifs d'analyse physicochimiques et biologiques. Ces équipements permettent un monitoring précis et continu des processus de fermentation. En complément de ses équipements dédiés à la fermentation de précision, Genopole propose une offre de prototypage et de formulation des ingrédients issus de la fermentation. Cette prestation s'appuie sur l'infrastructure Protopia qui fera l'objet du prochain Focus Plateforme. Cette synergie entre GATEX et Protopia permet d'accompagner les projets biotech de la fermentation jusqu'à la formulation finale, offrant ainsi une solution intégrée pour le développement de produits innovants.

GATEX, pour quels services proposés ? L’infrastructure GATEX propose un accompagnement complet, depuis le criblage de souches de bactéries (aérobies ou anaérobies tolérantes), levures ou champignons, des souches naturelles ou des OGM de type 1 jusqu'à la production pilote, en passant par l'optimisation des procédés fermentaires. L'équipe de la plateforme fournit un appui en ingénierie des bioprocédés et en gestion de projet. Elle aide à identifier les verrous techniques tout au long de la montée en échelle. Une offre analytique intégrée permet de caractériser précisément les produits issus des fermentations. L'offre de GATEX permet de réduire les coûts et les délais, déterminants pour les startups et les projets en développement.

GATEX implantée au cœur de Genopole et de l'écosystème d'innovation de l'Université Paris-Saclay, fait partie de la Biofonderie de Paris, consortium d’acteurs publics porté par la Région Ile-de-France. Véritable infrastructure de service, GATEX est ouverte sans restriction aux unités de recherche, aux établissements partenaires et aux entreprises innovantes.

Pour plus d'informations sur la prestation de service ou visiter GATEX, contactez gatex@genopole.fr

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GENOPOLE / GATEX - Plateforme de screening de souches et de bioproduction pré-industrielle. GATEX (pour Grow And TEst à la puissance X) est une plateforme de bioproduction pré-industrielle inaugurée par Genopole en 2025. Elle offre un pont stratégique entre la recherche en laboratoire et la production à l’échelle pilote, avec des fermenteurs de précision allant de quelques millilitres jusqu’à 30 litres. Opérée par Genopole, cette infrastructure permet aux start-ups biotech, aux PME et aux centres de recherche d’optimiser leurs procédés de fermentation, de tester la robustesse de leurs souches (bactéries, levures, champignons) et d’affiner leurs milieux de culture composés d’ingrédients industriels. En mutualisant des équipements de pointe, GATEX réduit le coût et le risque liés à la montée en échelle. L’offre inclut du criblage haut-débit, du développement de processus, un contrôle qualité analytique et un accompagnement en ingénierie de projet. Intégrée à la Biofonderie de Paris, GATEX s’inscrit dans un écosystème collaboratif et interdisciplinaire. Grâce à ce dispositif, Genopole facilite le passage vers l’industrialisation sans nécessiter d’investissements lourds immédiats. L’extension de l’infrastructure jusqu’à 1 200 m² est déjà prévue d’ici 2028, pour augmenter la capacité de production. En soutenant l’innovation biotech, GATEX contribue à la souveraineté industrielle et écologique de la France, en phase avec les ambitions du plan France 2030.

A propos de Genopole. Biocluster français dédié à la recherche en génétique et aux biotechnologies appliquées à la santé et à l’environnement, Genopole rassemble 75 entreprises de biotechnologies, 16 laboratoires de recherche, 24 infrastructures, plateformes et plateaux techniques mutualisés, ainsi que des formations universitaires (Université d’Évry Paris-Saclay). Son objectif : soutenir les entreprises de biotechnologies et le transfert de technologies vers le secteur industriel, favoriser le développement de la recherche dans les sciences de la vie, développer des enseignements de haut niveau dans ces domaines. Genopole est un Groupement d’intérêt public principalement soutenu par l’État, la Région Ile-de-France, l’agglomération Grand Paris Sud et l’AFM-Téléthon.

Les activités enzymatiques sont des indicateurs opérationnels utilisés pour évaluer la santé des sols. Dans ce contexte, la plateforme de recherche Biochem-Env (DOI 10.15454/HA6V6Y), Infrastructure Scientifique Collective INRAE et composante de l’Infrastructure de Recherche nationale AnaEE-France, intervient dans de nombreux programmes de recherche et prestations à destination des acteurs de la recherche académique et du secteur privé (PME, ETI, associations...). Elle met en œuvre des modes opératoires normalisés qui permettent de disposer de bases de données à l’échelle nationale.

Toutefois, la qualité des résultats obtenus dépend fortement des conditions de conservation des échantillons entre leur prélèvement et le début des analyses. La plateforme souhaite ouvrir ses jeux de données portant sur l’impact des conditions de conservation à l’ensemble des acteurs potentiellement utilisateurs de ses services.

Le jeu de données que nous proposons de valoriser dans le cadre de cet AMI concerne des activités enzymatiques impliquées dans les 4 cycles biogéochimiques (b-glucosidase, uréase, phosphatase et arylsulfatase) mesurées dans des sols non contaminés ou contaminés par des éléments traces métalliques (Zinc, Plomb, Cuivre, Cadmium), soumis à différentes conditions de conservation.

Les données permettent de proposer des compromis inter-opérables et inter-sectoriels à l’ensemble des acteurs (chercheurs, laboratoires d’analyses, bureaux d’étude comme ENVISOL, disposant de nombreux de projets nécessitant notamment la mesure d’activités enzymatiques des sols, ne pouvant pas nécessairement faire réaliser les analyses immédiatement après les campagnes de prélèvement.

L’accompagnement de l’Université Paris-Saclay permettra d’améliorer la qualité du jeu de données ouvert sur https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse/biochem-env ainsi que la publication d’un data paper associé.

-> Contact : Christian Mougin et Jasna Nikolic (contact-biochemenv@inrae.fr)

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Aussi, la plateforme a déjà publié plusieurs FOCUS PLATEFORME ! Les relire ?

• FOCUS PLATEFORME : La biochimie environnementale se développe et se robotise ! (11-nov-2029)
• FOCUS PLATEFORME : Biochem-Env inaugure son Lab-Mobile (20-janv.-20)
• FOCUS PLATEFORME : Vers de nouveaux outils d’interprétation de la diversité fonctionnelle des sols (16-oct.-23)
• FOCUS PLATEFORME : La normalisation de méthodes, un enjeu pour les recherches en environnement ! (18-nov.-24)

ECOSYS / Plateforme Biochem-Env. Biochem-Env est une plateforme de recherche centrée sur le développement et la mesure d'indicateurs biochimiques dans l'environnement et les organismes des écosystèmes continentaux. Dans l'environnement (sols et sédiments), la plateforme permet la mesure d'indicateurs fonctionnels (activités enzymatiques impliquées dans les cycles biogéochimiques, métabolisme des macromolécules, activité métabolique globale, respiration…). Elle réalise également la mesure d'indicateurs biochimiques chez les invertébrés benthiques et terrestres (réserves énergétiques et macromolécules, stress oxydant, mécanismes de détoxication, exposition aux contaminants environnementaux...). Biochem-Env offrira à la communauté scientifique des jeux de données ouverts concernant les indicateurs biologiques liés à la biodiversité fonctionnelle des écosystèmes. Les informations et connaissances obtenues par la plateforme permettront le développement d'approches mathématiques et de modélisation pour évaluer et prévoir les impacts de perturbations de l'environnement sur la biodiversité fonctionnelle.

Fort du succès de sa première édition, l’Université Paris-Saclay ouvre son deuxième programme « EQUIPEMENTS » dans le cadre de son AAP Recherche & Valorisation.

Le programme « EQUIPEMENTS 2027 » concerne, comme pour la précédente édition, l’acquisition ou la jouvence d’équipements de recherche utilisés par plusieurs unités de recherche ou de service.

Ses objectifs sont : i) Encourager la mise en commun des ressources afin d’optimiser les efforts de recherche ; ii) Inciter des unités de l’Université Paris-Saclay au périmètre global à travailler ensemble autour d’équipements communs et complémentaires ; iii) Contribuer au renforcement de plateformes mutualisées existantes ; iv) Diminuer l’impact environnemental de l’instrumentation à l’Université Paris-Saclay ; et v) Promouvoir la définition et la mise en place d’une politique de gestion des données.

Le montant maximal pouvant être demandé par projet dans le cadre de cet AAP est de 120 k€. Ainsi, si une unité ou une plateforme souhaite acquérir un équipement dont le coût s’élève à 150 k€, le porteur devra trouver un ou plusieurs co-financement(s), extérieur à l’appel, pour un montant de 30 k€.

Aussi, les financements mobilisés seront à nouveau les budgets communs de l’Université Paris-Saclay (part site du préciput ANR), les budgets des Graduate School / Institut, et les budgets des établissements, avec un montant maximum financé sur les budgets communs de l’Université (part site du préciput ANR) de 66% de l’aide demandée. Ainsi, dans le cas d’un projet demandant 120 k€, seuls 79.2 k€ pourra provenir des budgets communs de l’Université Paris-Saclay (part site du préciput ANR), les 40.8 k€ restant devant provenir des GS / I et des établissements.

Ci-dessous, le rappel du calendrier pour l’Université Paris-Saclay :

• le jeudi 2 avril 2026 : Lancement de l’AAP EQUIPEMENTS 2027 par l’Université Paris-Saclay.
• le mercredi 20 mai 2026 : Date limite de candidature.

Les GS/I évalueront l’ensemble des projets soumis pour le 15 juillet 2026, avec comme l’année précédente, des réunions d’interclassement par domaines (SDV&S / S&I), puis inter-domaine à la rentrée universitaire (première ou deuxième semaine de septembre 2026). La décision d’attribution des moyens se fera lors du CODIREV du 25 septembre 2026, pour les budgets communs de l’Université Paris-Saclay, et selon les calendriers propres à chaque entité (GS/I, établissements) pour les budgets.

Toutes les informations relatives à la constitution du dossier EQUIPEMENTS 2027 sont naturellement accessibles via le portail « appels à projets de recherche et valorisation » de l’Université Paris-Saclay. A noter, parmi les critères d’évaluation de cette édition 2027, la prise en compte du référencement dans Plug in Labs Université Paris-Saclay pour une plateforme.

En savoir plus ? Cliquer ICI

A propos de Plug In Labs Université Paris-Saclay. Plug In Labs Université Paris-Saclay ou PILUPS pour les intimes, est le portail numérique unique retenu par l’Université Paris-Saclay pour la mise en valeur et promotions des compétences, expertises et technologies des laboratoires et plateformes technologiques de son territoire. Piloté par l’Université Paris-Saclay et la SATT Paris-Saclay, financé par l’IDEX et le Fonds national de valorisation, PILUPS est accessible à tous depuis 2017, partenaires académiques comme entreprises, en particulier les PME. Un seul site web : https://www.pluginlabs-universiteparissaclay.fr. Et une seule adresse mail : pluginlabs@universite-paris-saclay.fr.

Le 3 décembre 2025, l’Université Paris-Saclay a organisé un événement satellite dédié aux plateformes et à la gestion des données de recherche, en marge des Assises Nationales des Données de Recherche (ANDOR). Cet événement, qui a réuni chercheurs, responsables de plateformes et acteurs de la science ouverte, a rencontré un vif succès, salué tant par les participants que par la Vice-présidence Recherche, qui a exprimé sa pleine satisfaction quant à la qualité des échanges et des perspectives dégagées.

À l’issue de cette journée, un rapport a été rédigé, regroupant les bonnes pratiques identifiées, les défis partagés et les recommandations opérationnelles pour renforcer la gestion des données au sein de nos infrastructures. Ce document, déposé sur HAL et diffusé aux directions des unités de recherche, offre une vision concrète et inspirante des enjeux liés aux données de recherche, ainsi que des pistes pour les laboratoires afin d’optimiser leurs pratiques. Ce rapport a également fait l’objet d’une publication sur les réseaux sociaux de l’université, notamment sur LinkedIn, où il a suscité un intérêt marqué.

Naturellement, n’hésitez pas non plus à consulter régulièrement Plug In Labs Université Paris-Saclay (ou PILUPS pour les intimes), le portail numérique unique retenu par l’Université Paris-Saclay pour la mise en valeur et promotions des compétences, expertises et technologies des laboratoires et plateformes technologiques de son territoire. Piloté par l’Université Paris-Saclay, sur une initiative de la SATT Paris-Saclay, PILUPS est accessible à tous depuis 2017, partenaires académiques comme entreprises, en particulier les PME. Un seul site web : https://www.pluginlabs-universiteparissaclay.fr. Et une seule adresse mail : pluginlabs@universite-paris-saclay.fr.

Enfin, vous trouverez dans les 4 FOCUS PLATEFORME à suivre, une intervention des représentants de plateformes présentes à cet évènement satellite dédié aux plateformes et à la gestion des données de recherche (en marge des ANDOR), à savoir la Station de recherche forestière de Barbeau / ICOS (Integrated Carbon Observation System) et le Service d’Analyse des Médicaments et Métabolites (SAMM) pour leur participation active à la table ronde, mais aussi ECOSYS / Plateforme Biochem-Env et NEUROSPIN / Imagerie chez l’homme en MEG, lauréates de l’AMI « plateformes et data paper » de l’Université Paris-Saclay, et qui se sont présentées en première partie de cet évènement.

Vous pouvez naturellement retrouvez l’ensemble des 287 FOCUS PLATEFORME publiés à ce jour en cliquant ICI. N’hésitez pas à nous contacter pour mettre en valeurs vos travaux !

-> Contact : Frédéric Dollé (frederic.dolle@cea.fr), Rodolphe Fischmeister (rodolphe.fischmeister@universite-paris-saclay.fr)

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La Région Ile-de-France contribue régulièrement, et au travers de différents dispositifs, à renforcer les compétences scientifiques et technologiques de son écosystème. A ce titre, elle réédite cette année son AAP SESAME - SESAME 2026 - AAP visant à donner aux laboratoires de recherche de son territoire les moyens nécessaires pour développer de nouveaux projets et pour mettre en œuvre des dispositifs expérimentaux originaux de recherche (comprenez « équipements »).

Comme lors des précédentes éditions, ne sont éligibles à SESAME 2026, que des équipements dont le coût total est compris entre 0,2 M€ et 3 M€ HT. D’autre part, pour rappel, l’aide prendra la forme d’une subvention dont le taux maximum d’intervention régionale pour l’acquisition de ces équipements s’élève à 66% du montant HT du coût total du projet. Ce taux d’intervention régionale pour les projets d’équipements en sciences humaines et sociales pourra néanmoins atteindre 100% du montant HT du coût total, à condition que 3 laboratoires franciliens distincts ou plus participent au projet.

Les critères d'éligibilité et de sélection sont disponibles dans le texte de l'appel à projet SESAME 2026.

D’autre part, le dossier de candidature est à compléter en ligne sur mesdemarches.iledefrance.fr, par le porteur du projet directement, après sélection par l’Université Paris-Saclay en ce qui nous concerne. Cette sélection se fera naturellement en prenant en compte, outre les critères de la Région mentionnés dans l'AAP, la plus-value collective pour l'Université Paris-Saclay. Attention également de bien prendre connaissance des critères d'exclusion mentionnées dans l’AAP, et si cela s'applique à votre projet, de tenir compte des remarques faites par le jury de la Région en cas de soumission les années précédentes. Aussi, cette année, une lettre d’engagement à prendre en charge pour 5 ans minimum les coûts de maintenance est demandée à l’établissement bénéficiaire. De plus, la Région encourage les porteurs de projet dans cette édition 2026 à mettre en avant dans leur dossier les actions qui permettront de contribuer à la lutte contre le changement climatique et ainsi réduire l’impact du projet sur l’environnement (gestion des déchets notamment les consommables, réparabilité des équipements, économies d’énergie, recyclage des fluides…).

Ci-dessous, le rappel du calendrier, intégrant les échéances propres à l’Université Paris-Saclay :

• le mardi 3 mars 2026 : Lancement de l’appel à projets SESAME 2026 par la région Ile-de-France.

Les porteurs de projets sont invités à prévenir le plus tôt possible leur école graduée/institut (GS/I) de leur intention de préparer un dossier.

• le vendredi 17 avril 2026 au plus tard : les porteurs de projet transmettent aux GS/I concernés leur projet dans l'état le plus avancé possible, sans oublier la fiche résumé complétée (fiche UPSaclay). En parallèle, ils envoient l’ensemble par mail à l'adresse vp.recherche@universite-paris-saclay.fr (avec copie à frederic.dolle@cea.fr et mathieu.kociak@universite-paris-saclay.fr) avec mention de l'institution qui porterait le projet.
• du samedi 18 avril au vendredi 22 mai 2026 : les GS/I évaluent les dossiers qui leur sont remontés et produisent un avis (classement en trois catégories A, B, C) et le cas échéant les priorisent au sein d'une catégorie s'il y a beaucoup de projets. Le retour des évaluations des GS/I au CoDiReV est aussi attendu pour le vendredi 22 mai 2026 (au plus tard).

Aussi, comme les années précédentes, une journée d’audition des porteurs des projets relevant du domaine Sciences de la Vie & Santé (SDV&S) de l’Université Paris-Saclay, et à ses interfaces, est programmée (mardi 19 mai 2026). De manière similaire, une journée d’auditions des porteurs relevant du domaine Sciences & Ingénierie (S&I) est également programmée (lundi 18 mai 2026). Les porteurs aux interfaces de ces deux domaines seront naturellement invités à participer (et à présenter leur projet) à ces deux journées d’audition.

• le vendredi 29 mai 2026, le CoDiRev se réunira, sélectionnera les huit projets que l'UPSaclay est autorisée à faire remonter dans le cadre de cet AAP, et fera parvenir aux porteurs de projets la lettre de soutien de l’Université Paris-Saclay.
• les porteurs de projets auront ensuite jusqu’au mercredi 3 juin 2026 (17h00) – date/heure limite de dépôt – pour finaliser leur dossier et le déposer auprès de la Région IdF.

Toutes les informations relatives à SESAME 2026 sont aussi accessibles via le portail « appels à projets de recherche et valorisation » de l’Université Paris-Saclay.

Aujourd’hui, un FOCUS PLATEFORME en lien avec le SESAME 2025, dont les résultats globaux pour Paris-Saclay vous ont été présentées le 1er décembre dernier.

La biologie est au centre de nombreux défis de nos sociétés (adaptation au changement climatique, émergence de maladies infectieuses, utilisation du carbone renouvelable, biotechnologies pour la production, la dépollution et le recyclage …). Au-delà des progrès spectaculaires au niveau moléculaire (ADN), la mise à l'échelle, le comportement émergent à l'échelle de la colonie, le développement et comportement des plantes, leurs interactions avec la microbiologie reposent sur la capacité d'observer, quantifier et modéliser ces structures biologiques à différentes échelles, sans artefact et sans déshydratation.

Le projet BIO-ESEM, lauréat de l’appel SESAME 2025, permettra de relever les défis liés à ces comportements émergents. Porté par trois laboratoires de l'Université Paris-Saclay fortement impliqués à la fois en sciences de l’ingénieur et en sciences de la vie (Laboratoire Génie des procédés et Matériaux (LGPM), CentraleSupélec, SayFood, AgroParisTech et Institut des Sciences des Plantes Paris-Saclay (IPS2)), ce projet permettra l'acquisition d’un microscope électronique à balayage environnemental équipé d’un canon à émission de champ (FEG-ESEM). Le potentiel exceptionnel de ce microscope dans son utilisation en biologie réside dans le cumul de trois caractéristiques : i) l'observation de structures biologiques à forte résolution sans dégradation, sans préparation et sans déshydratation ; ii) l'observation du changement de structures dû à des itinéraires température/humidité relative choisis, y compris en cycles pour observer les irréversibilités ; et iii) l’extraction de données objectives pour la modélisation (mesures et évolution temporelle des dimensions et de la morphologie ; prédiction des propriétés macroscopiques par changement d’échelle).

Ce FEG-ESEM sera l'unique en Île-de-France entièrement dédié à l'observation du vivant. Cet instrument pourra être sollicité autant pour des projets de médecine humaine, médecine vétérinaire, et sciences de l’environnement, participant ainsi à la dynamique Planetary Health portée par l’Université Paris-Saclay. Il sera un équipement de référence pour élargir les thématiques des trois laboratoires porteurs et démarrer de nouveaux projets en partenariat académique ou privé : n’hésitez pas à nous contacter pour en savoir plus !

-> Contact : Patrick Perré (patrick.perre@centralesupelec.fr); Nathalie Ruscassier (nathalie.ruscassier@centralesupelec.fr); Giana Almeida (giana.almeida@agroparistech.fr); Adnane Boualem (adnane.boualem@inrae.fr)

Aujourd’hui, un FOCUS PLATEFORME en lien avec le SESAME 2025, dont les résultats globaux pour Paris-Saclay vous ont été présentées le 1er décembre dernier.

La plateforme PICCEL (Plateforme d’Imagerie et de Criblage Cellulaire, anciennement plateforme PARi) du Département Radiobiologie Cellulaire et Moléculaire (DRCM, UMR SGCSR Université Paris-Saclay, Université Paris-Cité, INSERM, CEA Centre de Fontenay-aux-Roses (DRF, Institut Jacob)) accompagne depuis de nombreuses années les équipes académiques et industrielles françaises dans la mise en œuvre de criblages cellulaires à haut débit. Son expertise et ses technologies ont contribué à l’identification de nouveaux biomarqueurs, voies de signalisation et petites molécules impliqués dans divers processus biologiques physiologiques ou pathologiques

En savoir plus sur les travaux du laboratoire ? Forissier V et al., Theranostics. 2025 ; Rouault CD et al., Nat Commun. 2025 ; Ariey-Bonnet J et al., EBioMedicine. 2023 ; Pina et al., Methods Cell Biol. 2022 ; Villa et al., Cell Death Dis. 2020 ; Lebraud E et al., Nucleic Acids Res. 2020.

Grâce à un financement SESAME Île-de-France porté par Karine Dubrana et Guillaume Pinna, la plateforme se dotera en 2026 d’un microscope à haut contenu et à ultra-haut débit, unique en France, renforçant sa capacité à explorer les dynamiques cellulaires à grande échelle. Cet équipement positionnera la plateforme PICCEL parmi les infrastructures nationales de pointe en imagerie cellulaire multiparamétrique et ouvrira la voie à de nouvelles approches de caractérisation fonctionnelle pour la recherche biomédicale. Il permettra notamment la recherche de nouvelles molécules radio-sensibilisantes et/ou radio-protectrices des tissus sains utilisables en radiothérapie pour lutter contre les cancers.

L’équipement sera un système d’imagerie par épifluorescence ultra-rapide conçu pour relever les défis émergents du criblage phénotypique multiparamétrique. Il permettra l’acquisition d’images en microplaques (jusqu’au format 1536 puits) dans quatre canaux de fluorescence ainsi qu’en lumière transmise. Le système sera entièrement automatisé grâce à son intégration avec un robot passeur de plaques, assurant la gestion complète du flux expérimental, depuis le stockage des microplaques jusqu’à leur acquisition et leur analyse. Associé à un logiciel avancé d’analyse d’images, il permettra le phénotypage cellulaire multiparamétrique. Dans cette configuration, le système pourra imager et quantifier jusqu’à 300 plaques 384 puits par jour, levant ainsi le principal verrou de débit des approches de crible par imagerie traditionnelles et permettant l’exploration de tests cellulaires complexes, multiplexés ou en cinétique multipoints.

Cet équipement offrira à la plateforme PICCEL la capacité d’interroger une large variété de banques de dimensions et de natures très diverses (banques de petites molécules, banques CRISPR ou ARN interférentes) pour répondre à des questions biologiques jusque-là hors de portée.

La plateforme PICCEL verra ses capacités techniques profondément transformées, donnant accès à ses partenaires à un outil unique en France pour l’imagerie cellulaire multiparamétrique à haut contenu. Au-delà des criblages, l’équipement soutiendra de nombreux projets en biologie cellulaire, radiobiologie, immunologie ou cancérologie, et permettra la formation de jeunes chercheurs à l’imagerie automatisée et à l’analyse quantitative.

La plateforme PICCEL est ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique académique et industrielle. Pour toute demande ou projet, n’hésitez pas à nous contacter.

-> Contact : Guillaume Pinna (Responsable Plateforme PICCEL) — guillaume.pinna@cea.fr; Karine Dubrana (Directrice des plateformes DRCM) — karine.dubrana@cea.fr

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DRCM / Plateforme d'Imagerie et Criblage Cellulaire (PICCEL). La Plateforme d'Imagerie et Criblage Cellulaire (PICCEL), située dans le Département de Radiobiologie Cellulaire et Moléculaire (DRCM, CEA), est dédiée au criblage à haut débit (HTS) et à haut contenu (HCS) sur modèles cellulaires. La plateforme dispose de l’expertise et de l’infrastructure nécessaires pour la conception, la miniaturisation et l’automatisation de tests cellulaires, le criblage systématique et parallèle de collections de perturbateurs biologiques (siARNs, CRISPRi/a, miRNAs, petites molécules, composés médicaments…), la quantification de systèmes rapporteurs simples ou multiplexés, ainsi que l’analyse statistique de jeux de données de grande dimension. L’imagerie à haut contenu constitue notre approche privilégiée pour le profilage phénotypique, incluant des mesures multiplexées à partir de marquages fluorescents ou label-free. En complément de ses activités de criblage, PICCEL met également à disposition ses équipements robotiques et d’imagerie pour des applications de caractérisation et d’exploration cellulaire de routine. La plateforme travaille en étroite collaboration avec les autres plateformes du DRCM pour proposer des solutions adaptées à chaque projet. L’équipe adopte une démarche qualité rigoureuse, garantissant la traçabilité et la confidentialité des résultats tout au long des projets de criblage.

Un évènement à ne pas manquer ! Le 20 février 2026, le Service Hospitalier Frédéric Joliot (SHFJ, Institut des Sciences du Vivant Frédéric Joliot, Orsay) et le laboratoire de recherche BIOMAPS (CEA, CNRS, Inserm, Université Paris-Saclay) vous invite à l’inauguration de son IRM à bas champs (Magnetom Free.max 0,55T). Cet équipement unique sur Paris-Saclay, viendra compléter l’offre de PASREL-Imagerie avec un nouvel outil clinique de pointe, et renforcer le nœud Paris-Sud de l’infrastructure nationale France Life Imaging (FLI). Cette nouvelle IRM bas champs viendra accroître les capacités technologiques et scientifiques du SHFJ pour caractériser les solutions innovantes des acteurs industriels dans différentes aires thérapeutiques.

Inscription gratuite, mais obligatoire : https://irm055t biomaps.sciencesconf.org

Ci-dessous le programme de cette journée :

9:30 – 10:00: Accueil

10:00 – 10:10 : Le mot de France Life Imaging (Régine Trébossen)

10:10 – 10:20 : BioMaps vers les bas champs (Vincent Lebon / Nicolas Tournier)

10:20 – 10:40 : Champs magnétiques : des hauts et des bas (Marie Poirier Quinot)

10:40 – 11:00 : Bas champs : the come back (Angéline Nemeth)

11:00 – 11:10 : MAGNETOM Free.Max , une IRM à 0,55 T (Siemens Healthineers)

11:10 – 11:50: L’imagerie cardiovasculaire à 0,55T (Stanislas Rapacchi)

11:50 – 12:15 : Respirer à plus bas champs (Xavier Maître)

12:15 – 13:30 Buffet et visite

-> Contact : Rose-Marie Dubuisson (rose-marie.dubuisson@universite-paris-saclay.fr)

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BIOMAPS / PASREL / Imagerie préclinique et clinique, in vivo, IRM, 0.55 T (SHFJ). L’IRM 0.55T FreeMax permet l’imagerie anatomique de la tête et du cou, du rachis, du thorax, de l’abdomen, du genoux, coude, épaule. Le principal atout de cet IRM réside en ces contrastes propres au bas champ, rendant accessible l’exploration de régions habituellement difficiles à sonder telles que celles impactées par l’hétérogénéité due aux susceptibilités magnétiques (poumon, zone avec implants magnétiques). Sa grande ouverture de 80 cm de diamètre, contre 60 cm ou 70 cm habituellement, favorise l’accueil d’une population variée, incluant les personnes claustrophobes ou à forte corpulence. Le plateau IRM bas-champ 0.55T, réservée à la recherche clinique, présente l’avantage de pouvoir passer des cohortes en journée. Il appartient aux plateformes d’imagerie clinique du SHFJ, adossée au service de médecine nucléaire, permettant un accueil approprié à un examen clinique. La diversité d’imageurs de cette plateforme facilite les études multimodales (IRM, US, …).

A propos de l’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot : L’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot (CEA-Joliot) étudie les mécanismes du vivant pour, à la fois, produire des connaissances et répondre à des enjeux sociétaux au cœur de la stratégie du CEA : la santé et la médecine du futur, le numérique et la transition énergétique. Les travaux, fondamentaux ou appliqués, reposent sur des développements méthodologiques et technologiques. Les collaborateurs du CEA-Joliot sont pour moitié impliqués dans des unités mixtes de recherche (UMR), en partenariat avec le CNRS, l'INRAE, l’INRIA, l'Inserm, l’Université Paris-Saclay et l’Université de Paris. Le CEA-Joliot est implanté principalement sur le centre CEA-Paris-Saclay. Des équipes travaillent également à Orsay, Marcoule, Caen, Nice et Bordeaux.

Les INBS débarquent sur le site web du GIS IBiSA ! Les infrastructures nationales en biologie santé (INBS) sont au cœur de la stratégie française de recherche en science du vivant. La nouvelle page « IBiSA et les INBS » dévoile les missions du GIS pour l'organisation et la consolidation des 27 INBS inscrites sur la feuille de route du Ministère. IBiSA et les INBS.

Des pages web dédiées à chacune des 27 INBS. 19 infrastructures sont déjà représentées sur le site web d'IBiSA. De nouvelles pages décrivent l'organisation de chaque INBS, précisent leurs conditions d'accès et offrent une cartographie de leurs plateformes, pour le moment limitée aux plateformes labellisées IBiSA. Les pages des 8 autres INBS seront peu à peu publiées.

Explorer les INBS.

Un annuaire spécial pour les plateformes des INBS. A partir des pages INBS et à l'instar de l'annuaire des plateformes IBiSA, le GIS lance un annuaire des plateformes INBS. Dans cette version encore en construction, vous retrouverez dans un premier temps les plateformes labellisées IBiSA. Étape suivante : créer des pages pour toutes les autres plateformes des INBS. Annuaire des plateformes INBS.

Résultats de l'appel d’offres Plateformes IBiSA 2025. En 2025, le GIS IBiSA a reçu 77 candidatures de plateformes dans tous les domaines des sciences de la vie. Après 77 visites et 130 expertises, il a décerné 25 labels et distribué 2 210 000 € de financements à 45 plateformes technologiques en biologie, santé et agronomie. Consulter les résultats.

Appel d’offres Plateformes IBiSA 2026. La prochaine édition de l'appel Plateformes IBiSA sera ouverte en janvier 2026. Les modalités de candidature seront mises à jour sur le site web. En attendant, retrouvez toute l'actualité du GIS sur les réseaux sociaux. Appel d’offres Plateformes IBiSA.

A propos d’IBISA. Le GIS IBiSA coordonne la politique nationale de labellisation et de soutien aux infrastructures de biologie, santé et agronomie. Placé sous la tutelle de 8 partenaires, il est l’unique instrument de financement commun à l’ensemble des établissements de recherche en sciences du vivant. Grâce à deux appels d’offres dédiés, les plateformes et centres de ressources biologiques (CRB) peuvent candidater à la labellisation IBiSA et accéder à des financements conséquents pour des investissements jugés nécessaires à leurs missions. Le GIS conditionne son soutien à une ouverture large à la communauté scientifique. Il encourage également la création de structures de pilotage, concertation et coopération, l'animation de réseaux thématiques et les démarches qualité. Plus d'infos sur le GIS IBiSA.

Vous souhaitez découvrir le potentiel de Paris-Saclay en termes de plateformes ? L’interface Plug In Labs Université Paris-Saclay recense et rend visible plus de 200 plateformes dans le domaine des sciences de la vie - des plateaux techniques, des plateformes technologiques, des infrastructures d’expérimentation, mais aussi des collections - en d’autres termes, des espaces de laboratoires dotés d’équipements, souvent uniques, ou de banques de ressources, associés à un fort potentiel humain, les opérant et les maintenant au meilleur niveau technologique.

A propos de Plug In Labs Université Paris-Saclay. Plug In Labs Université Paris-Saclay ou PILUPS pour les intimes, est le portail numérique unique retenu par l’Université Paris-Saclay pour la mise en valeur et promotions des compétences, expertises et technologies des laboratoires et plateformes technologiques de son territoire. Piloté par l’Université Paris-Saclay et la SATT Paris-Saclay, financé par l’IDEX et le Fonds national de valorisation, PILUPS est accessible à tous depuis 2017, partenaires académiques comme entreprises, en particulier les PME.

• Un seul site web : https://www.pluginlabs-universiteparissaclay.fr
• Une seule adresse mail : pluginlabs@universite-paris-saclay.fr

2025, année hautement radioactive ! Trois anniversaires se fêtent dans le calendrier scientifique : les 90 ans du prix Nobel des Joliot-Curie pour la découverte de la radioactivité artificielle, les 80 ans du CEA, et les 50 ans du premier cyclotron biomédical installé au Service Hospitalier Frédéric Joliot (SHFJ, Institut des Sciences du Vivant Frédéric Joliot, Orsay).

Né en 1958 au cœur de l’hôpital d’Orsay, le SHFJ incarne depuis ses débuts une volonté affirmée de rapprocher la recherche sur les radioisotopes des patients et de la clinique. À l’origine, les isotopes provenaient des réacteurs de Saclay. Mais en 1975, tout change : le SHFJ s’équipe de son propre cyclotron biomédical, construit par CGR MeV (filiale de Thomson), une première en France. L’année suivante, l’inauguration est à la hauteur de l’événement, sous le regard du ministre de l’Industrie Michel d’Ornano et de la ministre de la Santé Simone Veil. Dès lors, le SHFJ entre dans une nouvelle ère : production autonome d’isotopes, maîtrise de la radiochimie, et innovation en imagerie TEP. En 1998, coup d’éclat : avec CisBio International, le SHFJ dépose la première autorisation de mise sur le marché d’un médicament radiopharmaceutique pour la TEP — le 18F-FDG, désormais incontournable dans le diagnostic du cancer. Le tournant du siècle marque un nouveau cycle : le premier cyclotron prend une retraite méritée (il sera complètement démantelé en 2009), remplacé par une machine IBA (réceptionnée fin 2001, pour une mise en service courant 2003), semblable à celles équipant aujourd’hui les sites industriels de production de radiopharmaceutiques. En 2017, un troisième cyclotron rejoint l’aventure, en partenariat avec PMB, pour créer une chaîne de fabrication entièrement automatisée, de la production de l’isotope au conditionnement final du produit.

En un demi-siècle, le SHFJ a bâti une expertise unique dans la chimie du fluor-18 et du carbone-11, deux isotopes émetteurs beta+ à vie brève (109,8 min, et 20,38 min, respectivement), d’importance primordiale pour l’imagerie par Tomographie par Emission de Positions (TEP). Au travers de ses plateformes (BIOMAPS – CEA, CNRS, Inserm, Université Paris-Saclay) et ses partenaires, PASREL-Imagerie offre aujourd’hui à la communauté scientifique saclaysienne et au-delà un accès unique à des outils préclinique et clinique de pointe.

Mais l’histoire ne s’arrête pas là. Aujourd’hui, l’imagerie devient « théranostique », le diagnostic accompagne la thérapie grâce à de nouveaux radioisotopes à visée thérapeutique, comme le lutécium-177 (émetteur beta-) ou l’actinium-225 (émetteur alpha). Le SHFJ, fidèle à son ADN d’innovation, explore ces voies prometteuses tout en consolidant son expertise autour du fluor-18 et du carbone-11, compagnons d’imagerie diagnostique idéaux de ces radiothérapies vectorisées émergentes. Prochaine étape, un nouveau cyclotron (?) pour BIOMAPS / PASREL Tracers (SHFJ), le déménagement du SHFJ vers l’infrastructure PASREL, à proximité de l’hôpital Paris Saclay, à l’horizon 2029.

La plateforme a déjà publié plusieurs FOCUS PLATEFORME ces dernières années. Les relire ?

• FOCUS PLATEFORME : La radiochimie au SHFJ : un éventail de radiotraceurs originaux pour l'imagerie TEP clinique et préclinique
• FOCUS PLATEFORME : Le lièvre et la tortue ou la fable chimique des deux isotopes du carbone aux demi-vies diamétralement opposées courant ensemble vers de nouvelles molécules marquées
• FOCUS PLATEFORME : Où est Charlie ? Les microbes débusqués grâce à des radiotraceurs originaux et par l'imagerie par tomographie par émissions de positons (TEP)

-> Contact: Bertrand Kuhnast (bertrand.kuhnast@cea.fr)

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

BIOMAPS / PASREL Tracers (SHFJ). La plateforme PASREL tracers fabrique à façon des radiotraceurs et radiopharmaceutiques expérimentaux marqués avec des isotopes émetteurs de positons (C-11, F-18, Cu-64, Zr-89) pour une utilisation en imagerie TEP préclinique ou clinique, ainsi qu’avec du Lu-177, émetteur béta- pour la thérapie en préclinique et bientôt avec des émetteurs alpha. Ces médicaments diagnostiques (petites molécules et biomolécules) aux indications variées (oncologie, neurologie, infectiologie, etc.) peuvent être utilisés au sein de nos plateformes d’imagerie ou distribués dans votre établissement (hors C-11).

A propos de l’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot : L’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot (CEA-Joliot) étudie les mécanismes du vivant pour, à la fois, produire des connaissances et répondre à des enjeux sociétaux au cœur de la stratégie du CEA : la santé et la médecine du futur, le numérique et la transition énergétique. Les travaux, fondamentaux ou appliqués, reposent sur des développements méthodologiques et technologiques. Les collaborateurs du CEA-Joliot sont pour moitié impliqués dans des unités mixtes de recherche (UMR), en partenariat avec le CNRS, l'INRAE, l’INRIA, l'Inserm, l’Université Paris-Saclay et l’Université de Paris. Le CEA-Joliot est implanté principalement sur le centre CEA-Paris-Saclay. Des équipes travaillent également à Orsay, Marcoule, Caen, Nice et Bordeaux.

Les résultats sont tombés le 21 novembre 2025 : ce sont cinq projets d’équipements de l’Université Paris-Saclay qui sont lauréats de l’AAP SESAME 2025, dont deux « cœur de métier » du domaine Sciences de la Vie & Santé (SCOUT et ScreenFast), et deux « à ses interfaces » (BioALTO, BioESEM), le dernier projet (MasqLE) relevant du domaine Sciences & Ingénierie. Ces 5 projets seront subventionnés par la région Ile-de-France, dans le cadre de cet AAP, à hauteur de 66% du coût du projet.

Vous avez dit SESAME ? Le dispositif SESAME (pour « Soutien aux Équipes Scientifiques pour l’Acquisition de Moyens Expérimentaux » vise à cofinancer des équipements scientifiques nécessaires au fonctionnement des laboratoires de recherche publics franciliens pour mener des projets d’envergure dans des champs thématiques autres que les Domaines de recherche et d’Innovation Majeurs (DIM) et les Questions d’Intérêt Majeur (QIM), et hors du périmètre d’intervention du Genopole et des projets inscrits au Contrat de Plan État-Région 2021-2027.

SESAME 2025 : Demande de subventions versus montants alloués par la région ? Sur les 33 projets de recherche éligibles et évalués par la Région Ile-de-France (représentant un total de 30,5 millions d’euros HT de demandes de subvention), seuls 13 ont été sélectionnés via SESAME 2025, et ceci pour un montant de financement HT de 5,5 millions d’euros. Ces 13 projets recouvrent différentes thématiques scientifiques, dont 7 en biologie et santé, 2 en environnement et agrosciences, 2 en matériaux, 1 en physique et électronique, et 1 en informatique et sciences humaines et sociales.

SESAME 2025 : Comment se positionne l’Université Paris-Saclay ? Sur ces 13 projets, 5 sont portés par l’Université Paris-Saclay, soit une petite moitié (38%) ! Un projet relève du domaine Sciences & Ingénierie : MasqLE (masqueur de lithographie électronique), C2N (Centre de Nanosciences et de Nanotechnologies, UMR 9001 - CNRS, UPSaclay, pour 1 M€ de subvention et un projet à 3,2 M €), et quatre relèvent directement ou indirectement du domaine Sciences de la Vie & Santé : SCOUT et Screen-Fast (SDV&S « cœur de métier »), et BioALTO et BioESEM (SDV&S « à ses interfaces ».

Ci-dessous les premières informations concernant ces quatre projets SDV&S « cœur de métier » mais aussi « à ses interfaces », projets que vous découvrirez par ailleurs plus en détails dans les prochaines semaines via des FOCUS PLATEFORME dédiés.

SCOUT | subvention = 500 000 € (IPSIT - Ingénierie et Plateformes au Service de l'Innovation Thérapeutique, UMS UPSaclay US31 Inserm, UAR3679 CNRS et 2I - Infection et Inflammation, UMR 1173 – INSERM, UVSQ, UPSaclay) – Cytométrie spectrale pour la caractérisation optimale, l’analyse non supervisée, et le tri d’éléments individuels.

Screen-Fast | subvention = 260 000 € (SGCSR - Stabilité Génétique, Cellules Souches et Radiations, UMRE E008 - U1274 - INSERM, CEA, Univ. Paris, UPSaclay) – Technologie de rupture pour l’identification par criblage à haut contenu de nouveaux biomarqueurs et médicaments pour la santé.

BioALTO | subvention = 197 183 € (IJCLab, UMR 912 - CNRS, Univ Paris-Cité, UPSaclay) – Plateforme expérimentale à ALTO pour la recherche préclinique en hadrothérapie.

BioESEM | subvention = 260 000 € (LGPM - Laboratoire de Génie des Procédés et Matériaux, EA 4038 – CentraleSupelec, UPSaclay) - Observation en haute résolution des structures biologiques à conditions variables d’hydratation.

A suivre donc !

-> Contact : Frédéric Dollé (frederic.dolle@cea.fr)

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Plug In Labs Université Paris-Saclay. Plug In Labs Université Paris-Saclay ou PILUPS pour les intimes, est le portail numérique unique retenu par l’Université Paris-Saclay pour la mise en valeur et promotions des compétences, expertises et technologies des laboratoires et plateformes technologiques de son territoire. Piloté par l’Université Paris-Saclay et la SATT Paris-Saclay, financé par l’IDEX et le Fonds national de valorisation, PILUPS est accessible à tous depuis 2017, partenaires académiques comme entreprises, en particulier les PME. Un seul site web : https://www.pluginlabs-universiteparissaclay.fr. Et une seule adresse mail : pluginlabs@universite-paris-saclay.fr.

CATI est une plateforme de services universitaires française, désormais labellisée unité de service multi-institutions US52-UAR2031. CATI a apporté son soutien à la partie neuroimagerie d'environ 60 études multicentriques sur des troubles neurologiques et psychiatriques (maladie d'Alzheimer, maladie de Parkinson, maladie de Huntington, ataxie spinocérébelleuse, sclérose latérale amyotrophique, troubles bipolaires, schizophrénie, etc.), dont plusieurs essais interventionnels, et participe actuellement à des études multicentriques en néonatologie et en neuro-oncologie.

Créée en 2011, la plateforme vise à rendre la gestion multicentrique de la neuroimagerie accessible à tout projet à un coût raisonnable. À ses débuts, la plateforme s'appuyait sur un large éventail d'expertises provenant de plusieurs équipes de recherche, au sein de NeuroSpin (Institut des Sciences du Vivant Frédéric Joliot, Centre CEA Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette), telles que les équipes en place CEA et INRIA, mais aussi d’équipes de l'ICM (CNRS - SU - Inserm - SU - Inria) et du LIB (SU - Inserm - CNRS). S'appuyant sur un vaste réseau d'installations d'imagerie standardisées, la plateforme collecte et contrôle les acquisitions et effectue un traitement systématique des images à partir d'un large portefeuille couvrant la plupart des modalités IRM / TEP / SPECT. Des besoins spécifiques peuvent être pris en charge à la demande (nouvelle séquence IRM, radiotraceur TEP ou pipeline de traitement d'images) grâce à des liens étroits avec les laboratoires de recherche environnants et un réseau de collaborations (par exemple, le réseau REMI, le réseau FUN …). Les données brutes et les analyses peuvent être mises à la disposition du consortium de l'étude via un service web sécurisé, selon les demandes du chef de projet. Grâce aux efforts de standardisation entre les études et les pathologies, la plateforme favorise les collaborations afin d'accélérer l'émergence de projets de recherche sur le cerveau à l'échelle du big data et dans un cadre visant à l’émergence de solutions innovantes en santé numérique.

-> Contact : Jean-François Mangin (jean-francois.mangin@cea.fr), Marie Chupin (marie.chupin@icm-institute.org)

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

NEUROSPIN / CATI. Créée en 2010, le CATI, Centre d'acquisition et de traitement des images, est une plateforme nationale dédiée aux études de neuro-imagerie multicentriques. Cette infrastructure a pour objectif de faire émerger des protocoles standardisés d'acquisition et d'analyse d'images, le tout pour obtenir un parc des données aux caractéristiques harmonisées sur les centres d'imagerie partenaires, avec un contrôle qualité systématique. À cette fin, ce centre est mis à disposition de l'ensemble de la communauté des cliniciens et des chercheurs étudiant la maladie d'Alzheimer et autres démences neuro-dégénératives. Il s'agit de promouvoir le travail en réseau et de parvenir à un gain de temps dans la détection et le suivi de la maladie. La qualité des équipements et des images ayant beaucoup progressé ces dernières années, le CATI a également pour mission d'assurer le transfert des technologies qu'il met au point vers le milieu hospitalier. Et, de fait, permettre à l'industrie pharmaceutique d'avoir accès à des cohortes de patients bien identifiées.

À propos de NeuroSpin. NeuroSpin est une infrastructure de recherche sur le cerveau exploitant des grands instruments d'imagerie. NeuroSpin offre à la communauté scientifique publique et privée la possibilité de faire progresser la connaissance du cerveau, et particulièrement du cerveau humain, en proposant un accès à des méthodologies de pointes en imagerie cérébrale et en neuro-informatique. NeuroSpin développe et met à la disposition de la communauté des instruments uniques, notamment en imagerie très hauts champs et dans le domaine des big data. Cette offre s'inscrit dans le cadre des missions spécifiques de NeuroSpin qui sont : i) analyser les fonctions du cerveau humain, leur développement dans l'enfance, et l'impact de la culture et de l'éducation ; ii) identifier les marqueurs et les mécanismes de maladies neurologiques, psychiatriques et neurodéveloppementales ; iii) comparer le cerveau humain et celui d'autres espèces animales ; développer et tester des méthodes d'imagerie à toutes les échelles d'observation : par résonance magnétique (IRM), par électro- et magnétoencéphalographie (EEG et MEG), et par électrophysiologie massivement parallèle ou l'imagerie photonique et v) développer des logiciels spécialisés dans le traitement et la modélisation des grands jeux de données en neuroimagerie.

À propos de l’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot : L’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot (CEA-Joliot) étudie les mécanismes du vivant pour, à la fois, produire des connaissances et répondre à des enjeux sociétaux au cœur de la stratégie du CEA : la santé et la médecine du futur, le numérique et la transition énergétique. Les travaux, fondamentaux ou appliqués, reposent sur des développements méthodologiques et technologiques. Les collaborateurs du CEA-Joliot sont pour moitié impliqués dans des unités mixtes de recherche (UMR), en partenariat avec le CNRS, l'INRAE, l’INRIA, l'Inserm, l’Université Paris-Saclay et l’Université de Paris. Le CEA-Joliot est implanté principalement sur le centre CEA-Paris-Saclay. Des équipes travaillent également à Orsay, Marcoule, Caen, Nice et Bordeaux.

Les iPSC, des cellules reprogrammées pour explorer les maladies humaines. Encore peu connues du grand public, les cellules souches pluripotentes induites (iPSC) révolutionnent la recherche biomédicale : elles permettent de créer des modèles expérimentaux uniques et complexes pour étudier les maladies humaines. En France, plusieurs plateformes IBiSA, comme iPSC et stemCARE, s'organisent pour structurer une communauté sur ce thème. Lire l'article.

Les nouvelles thérapies au sein du GIS IBiSA. Les plateformes spécialisées sur les iPSC font partie d'un ensemble de structures IBiSA tournées vers les nouvelles thérapies. Celles-ci couvrent un champ de recherche large comprenant les iPSC, les organoïdes, la bio-impression de tissus, les thérapies géniques vectorisées et la génération d'anticorps, dont les nanobodies. Les plateformes nouvelles thérapies.

Des candidatures en hausse lors des appels IBiSA. Avec le temps, les plateformes impliquées dans les nouvelles thérapies sont de plus en plus nombreuses à candidater aux appels IBiSA. En 2025, elles sont 11 à avoir demandé un label ou un financement, ce qui représente 12% des candidatures reçues ! Le bureau d'IBiSA se réunira courant décembre pour délibérer. Les plateformes nouvelles thérapies.

Appel d’offres Plateformes IBiSA 2026. La prochaine édition de l'appel d’offres Plateformes IBiSA sera ouverte en janvier 2026. Les modalités de candidature seront mises à jour sur la page dédiée du site web. Appel d’offres Plateformes IBiSA.

A propos d’IBISA. Le GIS IBiSA coordonne la politique nationale de labellisation et de soutien aux infrastructures de biologie, santé et agronomie. Placé sous la tutelle de 8 partenaires, il est l’unique instrument de financement commun à l’ensemble des établissements de recherche en sciences du vivant. Grâce à deux appels d’offres dédiés, les plateformes et centres de ressources biologiques (CRB) peuvent candidater à la labellisation IBiSA et accéder à des financements conséquents pour des investissements jugés nécessaires à leurs missions. Le GIS conditionne son soutien à une ouverture large à la communauté scientifique. Il encourage également la création de structures de pilotage, concertation et coopération, l'animation de réseaux thématiques et les démarches qualité. Plus d'infos sur le GIS IBiSA.

Vous souhaitez découvrir le potentiel de Paris-Saclay en termes de plateformes ? L’interface Plug In Labs Université Paris-Saclay recense et rend visible plus de 200 plateformes dans le domaine des sciences de la vie - des plateaux techniques, des plateformes technologiques, des infrastructures d’expérimentation, mais aussi des collections - en d’autres termes, des espaces de laboratoires dotés d’équipements, souvent uniques, ou de banques de ressources, associés à un fort potentiel humain, les opérant et les maintenant au meilleur niveau technologique.

A propos de Plug In Labs Université Paris-Saclay. Plug In Labs Université Paris-Saclay ou PILUPS pour les intimes, est le portail numérique unique retenu par l’Université Paris-Saclay pour la mise en valeur et promotions des compétences, expertises et technologies des laboratoires et plateformes technologiques de son territoire. Piloté par l’Université Paris-Saclay et la SATT Paris-Saclay, financé par l’IDEX et le Fonds national de valorisation, PILUPS est accessible à tous depuis 2017, partenaires académiques comme entreprises, en particulier les PME. Un seul site web : https://www.pluginlabs-universiteparissaclay.fr. Et une seule adresse mail : pluginlabs@universite-paris-saclay.fr.

Le marquage isotopique est un outil indispensable à l’étude des molécules biologiques et pharmaceutiques, notamment pour analyser leur devenir, leurs interactions ou leurs propriétés pharmacocinétiques. En permettant un suivi précis au sein de systèmes complexes, les isotopes de l’hydrogène et du carbone fournissent des données essentielles, de la recherche fondamentale au développement thérapeutique. Historiquement lié à l'industrie du médicament pour sa sensibilité, ce procédé s'appuie sur des traceurs de référence : les isotopes radioactifs (3H, 14C) pour les études in vivo, et les isotopes stables (2H, 13C) pour des applications complémentaires. Néanmoins, l’incorporation d’isotopes radioactifs ou stables au sein de molécules d’intérêt demeure un défi méthodologique et technologique.

La Plateforme de marquage isotopique du CEA (Département Médicaments et Technologies pour la Santé (DMTS / Institut Joliot, CEA Paris-Saclay, UPSaclay, Gif-sur-Yvette) s’appuie sur une expertise reconnue en chimie du marquage isotopique et sur des infrastructures dédiées à la manipulation de radioéléments, offrant un accompagnement complet des projets, depuis la définition du besoin scientifique jusqu’à la livraison des composés marqués. Implantée au cœur de l’écosystème scientifique de Paris-Saclay, elle contribue activement au développement de projets collaboratifs à l’interface entre chimie, biologie et santé, et ouvre des perspectives prometteuses pour le déploiement de nouvelles stratégies de marquage isotopique.

Au cours de sa première année d’activité, la Plateforme de marquage isotopique a accompagné neuf projets menés en collaboration avec des partenaires académiques, en particulier avec des laboratoires de l’Université Paris-Saclay (principalement via le PEPR biothérapies et bioproductions de thérapies innovantes (BBTI) et son projet lauréat ACCREDIA) mais aussi les Universités de Clermont Auvergne, Nantes, Grenoble Alpes, et Paris-Est Créteil. La plateforme a aussi réalisé des prestations et collaborations de recherche avec des partenaires industriels (en France et à l’international).

La plateforme est particulièrement sollicitée pour le radiomarquage de molécules d’intérêt biologique, notamment dans le cadre de l’étude de leurs propriétés pharmacocinétiques et de leur biodistribution in vivo, en lien étroit avec la plateforme d’imagerie ex vivo (bêta imagerie) (DMTS / Institut Joliot également, CEA Paris-Saclay). Un travail collaboratif mené avec l’Université Clermont Auvergne porte sur une nouvelle molécule aux propriétés antalgiques. Le radiomarquage tritium de ce composé permet d’en suivre précisément la distribution, l’accumulation dans les tissus cibles ainsi que son élimination. La détermination de ces paramètres est cruciale pour mieux comprendre le profil pharmacologique de la molécule, optimiser son développement et sécuriser son passage vers des phases d’évaluation plus avancées.

Les composés radiomarqués synthétisés par la plateforme ont été, ou seront, utilisés pour diverses applications, telles que la synthèse d’anticorps conjugués à un médicament (ADC) marqués, l’étude des propriétés pharmacocinétiques et de la biodistribution de candidats médicaments, la détermination de constantes de dissociation lors d’interactions protéine–ligand, ou encore le développement et l’évaluation de nouvelles méthodologies de marquage radioactif. Ces projets illustrent la diversité des problématiques adressées grâce au marquage isotopique et son rôle central dans l’analyse fine du devenir des molécules.

Besoin d’une expertise sur ces sujets, ou envie d’une collaboration ? N’hésitez pas à nous contacter !

-> Contact: Maxime Jay (maxime.jay@cea.fr)

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

La plateforme a déjà publié plusieurs FOCUS PLATEFORME ces dernières années. Les relire ?

• FOCUS PLATEFORME : Le marquage isotopique : Une activité unique sur Paris-Saclay au service du développement du médicament ! (30-mars-20)
• FOCUS PLATEFORME : Le lièvre et la tortue ou la fable chimique des deux isotopes du carbone aux demi-vies diamétralement opposées courant ensemble vers de nouvelles molécules marquées (5-oct.-20)
• FOCUS PLATEFORME : Une nouvelle méthode de marquage au tritium de candidats médicaments, puissante et simple à mettre en œuvre ! (19-avr.-21)
• FOCUS PLATEFORME : Un nouveau procédé de synthèse disponible pour la préparation de molécules deutérées et tritiées (5-juin-22)
• FOCUS PLATEFORME : Le double marquage isotopique : Une stratégie prometteuse au service de l’évaluation préclinique de conjugués protéine-médicament, ADC notamment ! (3-avr.-23)
• FOCUS PLATEFORME : Le marquage au tritium au service du développement d’une nouvelle voie d’administration de chimiothérapies (27-nov.-23)
• FOCUS PLATEFORME : Le radiomarquage isotopique se développe activement : Photo-catalyse avec le dioxyde de carbone – un voyage à un ou deux électrons (29-avr.-24)
• FOCUS PLATEFORME : Marquage isotopique : Une nouvelle méthode permettant l’incorporation multi-site d’isotopes de l’hydrogène dans des molécules complexes (2-déc.-24)
• FOCUS PLATEFORME : La radioluminescence au service de la photobiomodulation intracranienne (8-déc.-25)

MTS / Plateforme de marquage isotopique. Cette plateforme possède une expertise (unique sur Paris-Saclay) en synthèse de composés marqués avec des isotopes stables (2H / deutérium et 13C / carbone-13) et par des isotopes radioactifs de type bêta (3H / tritium, 14C / carbone-14 et 125I / iode-125). Forte de son expertise dans la préparation (synthèse, contrôle de qualité) et formulation de molécules marqués, elle assure régulièrement des prestations et collaborations, académiques comme industrielles, dans le domaine du (radio)marquage moléculaire. Elle offre également à la demande, son expertise et environnement unique de travail (laboratoires « chauds », équipements dédiés) pour l’analyse et la caractérisation d’échantillons radioactifs : mesure de puretés chimique et radiochimique par HPLC, détermination d'enrichissements isotopiques et d'activités spécifiques par SM, analyse et détermination structurale par RMN liquide comme solide, mesure d’activités radioactives par comptage à scintillation. Enfin, la plateforme propose des solutions pour le traitement de déchets liquides radioactifs, en particulier ceux contenant du carbone-14 et du tritium.

A propos de l’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot : L’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot (CEA-Joliot) étudie les mécanismes du vivant pour, à la fois, produire des connaissances et répondre à des enjeux sociétaux au cœur de la stratégie du CEA : la santé et la médecine du futur, le numérique et la transition énergétique. Les travaux, fondamentaux ou appliqués, reposent sur des développements méthodologiques et technologiques. Les collaborateurs du CEA-Joliot sont pour moitié impliqués dans des unités mixtes de recherche (UMR), en partenariat avec le CNRS, l'INRAE, l’INRIA, l'Inserm, l’Université Paris-Saclay et l’Université de Paris. Le CEA-Joliot est implanté principalement sur le centre CEA-Paris-Saclay. Des équipes travaillent également à Orsay, Marcoule, Caen, Nice et Bordeaux.

Le Service d’Analyse des Médicaments et Métabolites, plateforme de spectrométrie de masse de l’UMS IPSIT représentée par sa responsable Audrey Solgadi, a participé à la table ronde « Les données de la recherche – bonnes pratiques et défis », le 3 décembre dernier, en marge des assises nationales des données de la recherche (ANDOR 2025 – 1-2 décembre 2025) et organisée par la Direction de la Recherche et de la Valorisation. Cet évènement a été l’occasion de rappeler les difficultés rencontrées par les plateformes dans la gestion des données produites.

Le Service d’Analyse des Médicaments et Métabolites (ou SAMM) est une plateforme instrumentale de spectrométrie de masse (MS) spécialisée dans l’analyse structurale et la quantification des petites molécules ainsi qu’au profilage lipidomique. Elle offre à la communauté scientifique un accès à des instruments couplés à des techniques séparatives sous forme liquide ou utilisant un fluide supercritique (LC-MS ou SFC-MS). Les données générées sont des fichiers complexes regroupant un nombre très important de mesures avec plusieurs niveaux d’information : mesures précise de plusieurs milliers de rapports masse sur charge (m/z) des ions produits à l’entrée dans l’instrument sur une large gamme de masse, avec une fréquence d’acquisition pouvant aller jusqu’à 100 Hz sur toute la durée d’un couplage LC-MS (5 à 60 min voire plus), mais aussi des spectres de fragmentation apportant des informations structurales précieuses, représentant plusieurs milliers de spectres supplémentaires. Chaque analyse est contenue dans un fichier « brut » de taille importante pouvant aller jusqu’à plusieurs centaines de Mo pièce. Quand on sait qu’une séquence d’injections varie de quelques unités à plusieurs dizaines d’échantillons, le stockage de ces données, que ce soit sur le PC de pilotage ou sur des espaces de sauvegarde, est une des premières problématiques rencontrées. Le SAMM s’appuie sur des espaces de serveurs loués par l’unité auprès de l’Université Paris-Saclay, avant de transmettre, in fine, les données brutes à leurs propriétaires, les utilisateurs. Ces derniers deviennent alors responsables du stockage à long terme. Parmi les autres problématiques rencontrées : le verrouillage des données MS par le format propriétaire du fabricant qui nécessite, pour être exploitées, l’utilisation de logiciels spécifiques, le plus souvent sous licence commerciale. Cela rend alors difficile le partage de ces données que ce soit lors de la soumission d’un article ou le dépôt sur des plateformes d’Open Data. La conversion en formats libres tels que mzML est alors nécessaire.

Si le SAMM n’a pas encore de plan de gestion des données (PGD) formalisé, une réflexion plus globale est entamée dans le cadre de la démarche qualité menée au sein de l’UMS IPSIT pour rédiger un PGD entité en interaction DatASaclay, l’atelier de la donnée UPSaclay.

-> Contact : Audrey Solgadi (audrey.solgadi@universite-paris-saclay.fr)

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Aussi, en mars et décembre 2021, la plateforme publiait ses premier FOCUS PLATEFORME ! Les relire ?

• FOCUS PLATEFORME : SM@BPC : une plateforme de spectrométrie de masse sur Paris-Saclay à la hauteur des enjeux du pôle Biologie – Pharmacie – Chimie (BPC) de l'Université Paris-Saclay !
• FOCUS PLATEFORME : AAP SESAME 2021 : Un premier succès pour la communauté Paris-Saclay et le consortium SMaCS « Spectrométrie de Masse pour la Chimie et la Santé » !

IPSIT / Service d'Analyse des Médicaments et Métabolites (SAMM). Le Service d'Analyse des Médicaments et Métabolites (SAMM) est une PF instrumentale de spectrométrie de masse spécialisée dans l'analyse structurale et la quantification des petites molécules ainsi qu'au profilage lipidomique. Il est l’une des plateformes technologiques de l’unité mixte de service « Ingénierie et Plateformes au Service de l'Innovation Thérapeutique » (UMS-IPSIT). Le SAMM met à la disposition des chercheurs des spectromètres de masse couplés à des techniques séparatives (HPLC, SFC) dans le cadre de libre utilisation ou de prestations de service. Il fournit également savoir-faire nécessaire à l'utilisation de ces instruments et à l'interprétation de leurs résultats. Activités de la plateforme : i) Quantification de médicaments ou de métabolites dans des milieux biologiques complexes ; ii) Caractérisation structurale de molécules de synthèse, de produits de dégradation de médicaments ; iii) Profilage lipidomique non ciblé (phospholipides, lipides totaux) : séparation des lipides par classes, détection des espèces par HRMS et caractérisation grâce aux informations obtenues par fragmentation.

La station de recherche forestière de Barbeau, représentée par son directeur Daniel Berveiller, a participé à la table ronde « Les données de la recherche – bonnes pratiques et défis », le 3 décembre dernier, en marge des assises nationales des données de la recherche (ANDOR 2025 – 1-2 décembre 2025) et organisée par la Direction de la Recherche et de la Valorisation. Cet évènement a été l’occasion de rappeler l’importance de tracer et documenter les jeux de données produits par les plateformes.

La station de recherche forestière de Barbeau a en effet lancé son Plan de Gestion de Donnée (PGD) il y a un an. Ce document décrit comment l’entité, ici une plateforme, est structurée pour organiser la collecte, le stockage et la pérennisation des jeux de données qu’elle produit. Le PGD est un document évolutif qui s’adapte aux changements et aux nouvelles acquisitions et il permet d’anticiper les éventuels problèmes qui pourrait subvenir.

La station produit essentiellement des séries temporelles 24h/24 et 7j/7 à des fréquences d’acquisition variant de 0.05s (20Hz, données brutes de flux de gaz à effet de serre) à 1h (images de la canopée). La majorité des données produites suivent un dataflow bien défini, notamment dans le cadre de l’IR* ICOS : les systèmes d’acquisition envoient quotidiennement les données au centre thématique européen en Italie avant d’être contrôlées, stockées et « DOIsées » sur le Carbon Portal localisé en Suède. D’autres données transitent par le laboratoire, subissant des modifications de format (en-tête, comblement de trous, etc.), via des algorithmes automatisés, avant d’être envoyées. Chaque matin, nous recevons un email résumant la bonne (ou non) réception des fichiers de la veille. Les données issues des campagnes de prélèvements d’échantillons nécessitent quant à elles une déclaration manuelle (via des fichiers .csv) ainsi que toutes les métadonnées indispensables au suivi qualité des datasets produits (installation/désinstallation ou maintenance/étalonnage de capteurs par exemple). Un élément important pour notre plateforme est l’utilisation d’un outil de monitoring qui affiche en quasi temps réel (30 min) tout ce qui se passe sur la plateforme ce qui permet d’assurer une haute qualité des données. L’ensemble des jeux de données produits par la plateforme sont décrits et disponibles sur la page dédié du site internet.

-> Contact : Daniel Berveiller (daniel.berveiller@universite-paris-saclay.fr)

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Aussi, en janvier 2023 et avril 2025, la plateforme publiait ses premier FOCUS PLATEFORME ! Les relire ?

• FOCUS PLATEFORME : La station de recherche forestière de Barbeau-Fontainebleau : un site exceptionnel pour étudier le fonctionnement de la forêt
• FOCUS PLATEFORME : La Station de recherche forestière de Barbeau récompensée : Best ICOS Ecosystem Station Award 2025 !

Station de recherche forestière de Barbeau / ICOS (Integrated Carbon Observation System). Depuis 2003, l'équipe Ecophysiologie végétale du laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette) travaille sur un site expérimental forestier situé dans la forêt domaniale de Barbeau, à 53 kms au Sud-Est de Paris. La forêt de Barbeau est une forêt de chênes sessiles (Quercus petraea), dominants, avec un sous étage de charmes (Carpinus betulus). Les activités de recherche de la station sont centrées sur la compréhension des processus qui gouvernent le fonctionnement de l'arbre et de l'écosystème forestier dans son ensemble. Depuis 2005, un fort investissement est entrepris sur le site, notamment au travers d'une station de mesure située en haut d'un pylône de 35 mètres de hauteur et dédiée en partie à la mesure des échanges de dioxyde de carbone (CO2) et de vapeur d'eau entre la forêt et l'atmosphère. La plateforme est labellisée station Classe 1 dans l'Infrastructure de Recherche européenne ICOS (www.icos-ri.eu).

La Plateforme Métabolisme Métabolome de l’Institut des Sciences des Plantes Paris-Saclay (IPS2) est un plateau technique de pointe vous permettant de réaliser vos analyses avec un large panel de techniques complémentaires : GC/MS, LC/MS/MS, RMN, EA/IRMS et chromatographie liquide ou ionique.

Aujourd’hui, la plateforme nous présente un exemple choisi d’application en RMN (Résonance Magnétique Nucléaire) : la mesure dynamique de l’activité enzymatique !

La phosphoglycolate phosphatase (PGLP1) et glutamine synthetase (GS) sont des enzymes primordiales du métabolisme végétal, assurant une régulation contrôlée des flux de carbone et d’azote. PGLP1 intervient dans la photorespiration en convertissant le phosphoglycolate en glycolate, prévenant ainsi l’accumulation de ce métabolite toxique. La GS quant à elle, catalyse l’assimilation de l’ammonium en glutamine, molécule centrale pour la biosynthèse des composés azotés. La mesure précise et dynamique de l’activité de ces enzymes est essentielle pour comprendre l’allocation des pools de carbone et d’azote. Les différentes isoformes, les mutations ou encore les variations de l’environnement cellulaire (ex l’état d’oxydation-réduction) peuvent fortement modifier leurs efficacités et perturber l’équilibre C/N de la plante.

La RMN (Résonance Magnétique Nucléaire) constitue une approche élégante et compétitive par rapport aux kits spectrophotométriques commerciaux, en permettant des cinétiques in situ directement dans le tube avec une haute résolution temporelle. Aussi, en RMN on peut s’affranchir de réactions couplées et monitorer réellement les molécules d’intérêt. Elle permet également de garder le tampon physiologique aqueux de la plante car le signal de l’eau peut être facilement et efficacement supprimé par présaturation garantissant une excellente sensibilité.

L’activité de PGLP est suivie par le monitoring du singulet (4,21ppm) correspondant à l’apparition du glycolate, tandis que celle de la glutamine synthetase est mesurée via le signal CH₂ (2,21ppm) caractéristique de l’apparition de la glutamine. L’ajout contrôlé d’agents oxydants (H₂O₂) ou réducteurs (DTT) permet d’analyser finement les effets redox sur le site actif de l’enzyme PGLP et par conséquent les effets sur sa performance catalytique. L’intégration des aires des pics RMN, corrélée aux concentrations des réactifs ou de leur évolution au cours du temps, permet d’accéder aux paramètres cinétiques de l’enzyme, notamment au Km. Cette approche RMN rapide, quantitative et résolutive fournit une vision intégrée et réaliste du fonctionnement enzymatique, facilitant la compréhension des régulations métaboliques et de la plasticité du métabolisme des plantes.

En savoir plus ? Mauve et al., Methods Mol Biol 2024 mais ausi … Mauve et al., Plant Physiol Biochem 2016

-> Contact : Caroline Mauve (caroline.mauve@universite-paris-saclay.fr), Françoise Gilard (francoise.gilard@universite-paris-saclay.fr), Bertrand Gakiere (bertrand.gakiere@universite-paris-saclay.fr)

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Aussi, la plateforme a déjà publié deux FOCUS PLATEFORME. Les relire ?

• FOCUS PLATEFORME : La Plateforme Métabolisme Métabolome (IPS2) au service de l'étude et de l'optimisation de la biosynthèse de métabolites spécialisés chez les végétaux;
• FOCUS PLATEFORME : La Plateforme Métabolisme-Métabolome (IPS2) au service de la compréhension des mécanismes des phytohormones

IPS2 / Plateforme Métabolisme Métabolome. La plateforme offre des services d'analyse métabolomique ou isotopique et sert de support aux recherches sur les métabolismes primaires (carboné, azoté et soufré) et secondaires des plantes et leurs réponses aux contraintes environnementales. Notre double spécialité permet de combiner la métabolomique et la fluxomique pour une meilleure compréhension des réseaux métaboliques au sein de la cellule végétale. Nos outils permettent d'effectuer le phénotypage métabolique rapide des lignées végétales afin d'interpréter les conséquences des mutations génétiques spécifiques, de déterminer l'efficacité d'utilisation du carbone, de l'azote et de l'eau ainsi que les flux métaboliques dans les organes végétaux. Ces recherches s'inscrivent dans un objectif d'optimisation du métabolisme végétal vers la production de matière première utilisable dans l'agroalimentaire avec un apport d'engrais minimum. Au-delà des collaborations locales, notre plateforme est ouverte aux laboratoires publics, privés, locaux, nationaux ou internationaux. Elle offre ses services dans le cadre de collaborations ou de prestations. Dans les deux cas, la plateforme offre une expertise allant du design expérimental aux analyses statistiques des données.

La plateforme conjointe de Cryo-Microscopie Électronique de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC, Gif-sur-Yvette, Institut Joliot, CEA, Saclay) et du Synchrotron SOLEIL renforce son expertise avec l’arrivée de Heddy Soufari, recruté en tant qu’ingénieur-chercheur CEA. Spécialisé en biologie structurale et en cryo-microscopie électronique (cryo-EM), il consacre l’essentiel de son activité au développement méthodologique et au soutien scientifique des utilisateurs régionaux et nationaux sur les sites de SOLEIL et de l’I2BC.

Docteur en biologie structurale de l’Université de Bordeaux, Heddy Soufari a orienté ses recherches vers la compréhension de la structure et de la dynamique des complexes macromoléculaires. Après un parcours académique entre la France et le Canada, il a acquis une solide expertise en cryo-microscopie électronique appliquée à l’étude de systèmes biologiques complexes. Il a notamment contribué à la caractérisation de ribosomes de mitochondries et de complexes protéiques chez différents modèles eucaryotes, avant de rejoindre la société NovAliX où il dirige le pôle Cryo-EM et met la microscopie au service du structure-based drug design (SBDD) sur des cibles thérapeutiques.

Depuis son recrutement au CEA en septembre 2024, il accompagne les chercheurs de l’I2BC et de la région dans leurs projets de cryo-EM, de la préparation d’échantillons à l’analyse des reconstructions tridimensionnelles. Il développe parallèlement une activité méthodologique centrée sur la cryo-tomographie électronique (cryo-ET) et l’imagerie corrélative cryo-CLEM, avec pour objectif d’étudier l’organisation et la dynamique de complexes macromoléculaires in situ. Sa vision scientifique repose sur une approche multi-échelle, allant de la molécule unique à la cellule entière, afin d’explorer la tridimensionnalité des systèmes biologiques dans toute leur complexité.

Avec l’arrivée d’Heddy Soufari, la plateforme renforce sa capacité à développer de nouvelles méthodologies et pipelines pour la tomographie cellulaire, l’analyse d’images 3D et la corrélation optique-électronique. Ces efforts visent à faire de la plateforme un pôle de référence pour la visualisation in situ des architectures cellulaires et des complexes macromoléculaires à haute résolution.

-> Contact : Stéphane Bressanelli (plt-cryoem@i2bc.paris-saclay.fr)

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Envie de (re)lire leurs précédents FOCUS PLATEFORME ?

• 17 février 2020 FOCUS PLATEFORME : Des analyses par cryo-microscopie électronique révèlent les mécanismes d'auto-assemblage de l'α-synucléine, une protéine impliquée notamment dans la maladie de Parkinson
• 4 décembre 2023 FOCUS PLATEFORME : Un assemblage protéique à façon visualisé par cryo-microscopie électronique et reconstruction 3D

I2BC / Plateforme de cryo-microscopie électronique (CRYO-EM). La plateforme pour la cryo-microscopie électronique I2BC met à disposition une large gamme d’instruments et de services pour la biologie structurale : vitrification d’échantillons (Vitrobot, Leica GP2), microscope Tecnai Spirit (120 kV) pour les expériences préliminaires, microscopes de dernière génération Glacios (200 kV) pour les expériences à haute résolution, ainsi qu’un microscope confocal cryogénique Stellaris pour les approches corrélatives optique-électronique. La plateforme a la capacité de préparer et d’imager des échantillons biologiques de niveau de sécurité 2. Elle s’est associée au mésocentre de calcul Paris-Saclay pour l’hébergement des serveurs de stockage et d’analyse des images produites. La plateforme CryoEM de l’I2BC est associée à SOLEIL dans le cadre de la plateforme conjointe CryoEM@Paris-Saclay. Les images obtenues en cryo-microscopie électronique sur le microscope Glacios, ainsi que les moyens de calcul disponibles sur la plateforme, permettent le crible de grilles et la détermination de structures 3D à des résolutions dépassant fréquemment 3 Å et pouvant atteindre 2 Å. Ces premières structures permettent si nécessaire d'accéder aux microscopes plus puissants, notamment le Titan Krios G4 (300 kV) à SOLEIL, mais aussi les microscopes Titan Krios de l'ESRF, de l’IBS (Grenoble) ou de l'IGBMC (Strasbourg), menant aux résolutions atomiques. La plateforme CryoEM de l’I2BC permet aussi l'observation de complexes in situ (protéines à la surface d'organites purifiés ou de virus enveloppés, protéines membranaires reconstituées dans des liposomes...) par cryo-tomographie électronique. La plateforme accueille des projets issus de la recherche académique, institutionnelle et industrielle, et s’inscrit dans le réseau des infrastructures nationales en biologie structurale et intégrative (FRISBI). Ses missions couvrent la préparation d’échantillons, la collecte de données, le traitement d’images, la formation et l’accompagnement des utilisateurs. Cette plateforme fait partie du pôle des plateformes de Biologie Structurale de l'I2BC qui comprend six plateformes : cristallographie, RMN, CryoEM, mesures d'interactions macromoléculaires (PIM), expression de protéines recombinantes en systèmes eucaryotes (Prot-Ex) et sélection sur mesure de protéines artificielles comme ligands spécifiques de toute protéine d’intérêt (AlphaRep). D’autre part, les plateformes CryoEM, cristallographie, PIM et AlphaRep sont aujourd’hui labélisées IBISA sous la bannière BioStruct@UPSAY.

A propos de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC - UMR 9198). L’I2BC est une Unité Mixte de Recherche (CEA, CNRS, Université Paris-Saclay), accueillant une soixantaine d’équipes de recherche et hébergeant 17 plateformes technologiques, réparties en 6 pôles. 2025 a aussi été une année clé pour l’I2BC : cette unité a fêté ses 10 ans !

Aujourd’hui, un FOCUS PLATEFORME en lien avec le SESAME 2025, dont les résultats globaux pour Paris-Saclay vous ont été présentées le 1er décembre dernier.

Le projet BioALTO vise à développer une plateforme expérimentale dédiée à la recherche préclinique de pointe dans le domaine de l’hadronthérapie et de la radiobiologie. Le nouvel ensemble expérimental sera développé sur l’installation ALTO (Accélérateur Linéaire et Tandem à Orsay) au Laboratoire de Physique des 2 Infinis Irène Joliot-Curie (IJCLab), pouvant fournir un ensemble d’ions d’intérêts en hadronthérapie avec notamment des protons, des ions héliums, carbones ou encore oxygènes. Cette large gamme d’ions permet à la plateforme BioALTO de se distinguer des autres plateformes nationales d’irradiation et d’étudier expérimentalement l’efficacité biologique relative pour tous les ions d’intérêts, sur une unique installation.

La plateforme BioALTO va répondre à la demande croissante de faisceaux d’ions par la vaste communauté engagée dans la recherche de thérapies innovantes et dans la R&D pour le traitement du cancer en Île-de-France. Le projet porté par le laboratoire IJCLab, regroupant les pôles Physique Santé et Physique des accélérateurs va bénéficier de l’implication forte des équipes de Gustave Roussy dont l’expertise en oncologie, physique médicale et radiobiologie est reconnue, et de collaborations internationales avec, notamment, l’Institut de Microélectronique de Barcelone en Espagne.

Le projet BioALTO est lauréat de l’appel à projets régional SESAME 2025 avec une subvention de la région Île-de-France à hauteur de 197 k€ qui va permettre l’optimisation d’une ligne de faisceau d’accélérateur et l’équipement d’une station d’irradiation pour mener des expériences de radiobiologie. Ce développement va être complété par l’installation d’une salle de culture cellulaire à proximité de la ligne d’irradiation pour la préparation, le stockage et l’analyse des échantillons biologiques. Cet ensemble expérimental sera unique en France, grâce aux nouveaux équipements qui seront installés et à la variété de faisceaux d’ions et d’énergies disponibles à ALTO, actuellement absents des autres plateformes d’irradiation.

-> Contact : Amélia Maia Leite , Quentin Mouchard (bioalto@ijclab.in2p3.fr)

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Accélérateur Linéaire et Tandem à Orsay (ALTO). L'installation ALTO est principalement constituée de deux accélérateurs : une machine électrostatique, un tandem MP de 15MV et un accélérateur linéaire d'électrons de 50 MeV. ALTO offre ainsi la possibilité de produire, au même endroit, des faisceaux d'agrégats pour la physique interdisciplinaire, des faisceaux stables et radioactifs pour l'astrophysique et la physique nucléaire, ainsi que des faisceaux de neutrons mono énergétiques de quelques MeV. L'installation abrite aussi deux laboratoires de R&D et de fabrication de cibles de carbure d'Uranium (UCx) et de couches minces. Elle dispose d'une plateforme lasers, de séparateurs d'isotope en ligne et hors ligne, de banc de tests pour les sources stables, et de dix lignes expérimentales. Les faisceaux fournis sont dédiés à un large éventail de programmes de physique allant de la structure nucléaire à la physique atomique, la physique des clusters, la biologie, la nanotechnologie et des prestations industrielles.

A propos de la plateforme BioALTO… La plateforme BioALTO en développement au sein de la plateforme de recherche ALTO (Accélérateur Linéaire et Tandem à Orsay) au Laboratoire de Physique des 2 Infinis Irène Joliot-Curie (IJCLab), vise à offrir au domaine de la radiobiologie un outil nouveau et unique, exploitant des faisceaux de protons et d'ions plus lourds de l'ordre de dizaines de MeV pour la recherche en hadronthérapie expérimentale à différents débits de dose. La ligne d’irradiation est actuellement en cours d’adaptation et d’amélioration permettant une interopérabilité avec l’installation ALTO et de garantir les conditions d’irradiations nécessaires pour les études radiobiologiques. En savoir plus sur BioALTO ? Amélia Maia Leite, Quentin Mouchard, Philippe Lanièce. BioALTO platform. Ecole Joliot Curie : Radiations for health, Sep 2024, Saint-Pierre d'Oléron, France. ⟨hal-04700410⟩.

Aujourd’hui, un FOCUS PLATEFORME en lien avec le SESAME 2025, dont les résultats globaux pour Paris-Saclay vous ont été présentées le 1er décembre dernier.

Les plateformes de cytométrie en flux et immuno-monitorage CYM (UMS Ingénierie et Plateformes au service de l’Innovation Thérapeutique (IPSIT), Faculté de Pharmacie Paris-Saclay) et CYMAGES (Département de Biotechnologies de la Santé, UFR Simone Veil - Santé à Montigny-le-Bretonneux, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines) sont au service des projets ambitieux en recherche fondamentale, translationnelle et clinique des communautés de chercheurs du plateau de Saclay et de l’UFR Simone Veil – Santé.

Afin de répondre aux besoins de leurs utilisateurs en termes d’accroissement du nombre de paramètres pour l’analyse et le tri d’éléments uniques, de gestion de l’auto-fluorescence cellulaire et d’accès à des éléments de très petite taille, CYM et CYMAGES ont conçu le projet SCOUT (Spectral Cytometry for Optimal characterization, Unsupervised analysis and sorting of single elemenTs), pour se doter, respectivement, d’un cytomètre trieur et d’un cytomètre analyseur à la pointe de la technologie spectrale.

Ces cytomètres, équipés de 5 lasers, permettront de discriminer plus de 35 marqueurs fluorescents de façon simultanée, en dépit de l'autofluorescence. Ils assureront ainsi la caractérisation fine et le tri de cellules eucaryotes comme procaryotes, tout en rendant possible l’analyse de vésicules extracellulaires et de nanoparticules. De plus, la possibilité d’analyser le spectre de fluorescence complet facilitera l’utilisation de sondes fluorescentes non conventionnelles.

SCOUT vient d’être lauréat de l’appel à projet régional SESAME 2025. La région Île-de-France apporte ainsi à ce projet une subvention de 500 k€ (50 % du montant des équipements souhaités) qui, ajoutée à des co-financements dont plusieurs doivent encore être obtenus, devrait permettre l’acquisition de ces instruments pour un budget total de 1 000 k€. Le trieur spectral sera placé dans un laboratoire de niveau 2 sur la plateforme CYM et l’analyseur spectral sur la plateforme CYMAGES, et les équipes de CYM et CYMAGES espèrent vous accueillir prochainement pour mettre en pleine lumière les caractéristiques de vos échantillons les plus précieux !

-> Contact : Géraldine SCHLECHT-LOUF (geraldine.schlecht-louf@universite-paris-saclay.fr), Marie-Laure AKNIN (marie-laure.aknin@inserm.fr), Simon Glatigny (simon.glatigny@uvsq.fr)

Plug In Labs Université Paris-Saclay : CYM, cliquer ici, CYMAGES, cliquer ICI

IPSIT / Plateforme de Cytométrie H.Moissan (CYM). La plateforme de cytométrie en flux (CYM) de l'Unité Mixte de Service, Ingénierie et Plateformes au Service de l'Innovation Thérapeutique (UMS-IPSIT), située au rez-de-chaussée du bâtiment Recherche Henri Moissan (HM1) offre ses services aux équipes de recherche académiques du territoire Paris-Saclay ainsi qu'aux industriels. Le personnel de la plateforme est à votre disposition pour vous aider à réaliser des projets de recherche fondamentale et préclinique, ainsi que des protocoles de recherche clinique. Son personnel est aussi à votre service pour la mise au point de nouvelles techniques utilisant la cytométrie en flux. Les équipements de cytométrie en flux de la plateforme permettent le phénotypage des cellules par la détection de molécules membranaires et intracellulaires (biomarqueurs) mais aussi des études fonctionnelles telles que la détection de phosphorylation des protéines, la prolifération cellulaire, la quantification de cytokines excrétées ou la détection d'ARN. Enfin, des tris cellulaires à haut débit sont également proposés par la plateforme (contact pour la cytométrie : marie-laure.aknin@universite-paris-saclay.fr). En parallèle, CYM met à votre disposition un appareil de mesure de haute technologie, le QuickPlex® SQ 120 (Meso Scale Discovery, MSD) permettant l’analyse multiplex de biomarqueurs par électrochemiluminescence (contact pour le MSD : sophie.viel@universite-paris-saclay.fr). Les activités de CYM peuvent être réalisées en collaboration avec celles d'autres plateformes de l’UMS-IPSIT, favorisant les analyses transcriptomiques sur cellules triées ou l'identification de nouveaux biomarqueurs.

Département Biotechnologie Santé / Plateforme d'imagerie et cytométrie (CYMAGES). La plateforme d'imagerie et cytométrie CYMAGES, créée en septembre 2012 avec le soutien de la Région Ile-de-France, du Conseil Général des Yvelines, et de la Communauté d'agglomération de communes de Saint-Quentin-en-Yvelines, a pour objectif d'offrir à la communauté scientifique académique et industrielle des équipements d'imagerie et de cytométrie à la pointe de la technologie, ainsi que conseil et assistance. La plateforme CYMAGES propose un parc technologie composé de sept équipements de pointe en Imagerie et cytométrie photonique : Microscope confocal Leica SP8X (laser blanc) / Microscope confocal Leica SPE / Microscope plein champs HCS Olympus ScanR / Cyto-imageur Cytek Imagestream / Cytomètre analyseur Becton Dickinson Fortessa (18 paramètres) / Trieur cellulaire Becton Dickinson Aria III (13 Paramètres), lecteur multiplexe (MSD). La plateforme offre également des prestations d’analyse de données en imagerie et cytométrie.

6 mois déjà… En effet, le 30 juin 2025, s’est déroulée l’inauguration officielle de la plateforme de radiochimie de MIRCen (CEA Centre de Fontenay-aux-Roses, DRF, Institut de biologie François Jacob), spécialisée dans la recherche et développement de radiotraceurs à visée préclinique dans le contexte de maladies neurodégénératives (mécanismes, thérapies, imageries).

Plus de 120 invités se sont réunis au CEA de Fontenay-aux-Roses sur le site historique de la première pile atomique française Zoé. Parmi ces invités se trouvaient plusieurs partenaires de NeurATRIS, la composante française de l'infrastructure européenne de recherche translationnelle EATRIS-ERIC, spécialisée en neurosciences et en neurologie (hôpitaux Henri Mondor, Bicêtre, Robert Debré ; INRAE, ICM), plusieurs partenaires de PASREL-Imagerie, structure qui fédère les principaux acteurs de l’imagerie en Ile de France, plusieurs industriels (Lilly, Roche, Sanofi, Servier, UCB, Xing Imaging), des spécialistes de la radiochimie des universités françaises du territoire Paris-Saclay et de Lyon, mais aussi universités européennes (Bruxelles, Amsterdam).

Doté d’un cyclotron biomédical, d’enceintes blindées et d’automates de radiosynthèse versatiles, la plateforme est capable d’utiliser des méthodologies de marquage isotopique très variées, maximisant ainsi les probabilités de succès du marquage. Elle a pour mission de développer et de fournir des radiotraceurs de nouvelle génération marqués au carbone-11 (demi-vie 20,4 min) ou au fluor-18 (demi-vie 109,8 min) pour les activités de recherche et développement du CEA et celles de ses partenaires, des acteurs académiques et des industriels. La plateforme répond également à des demandes de prestation et de collaboration ponctuelles.

En étudiant le comportement in vivo de nos traceurs, les interactions ligand/cible, l’équipe TEP (MIRCEN / imagerie TEP, IRM et Optique) fournit des informations utiles pour le développement de nouveaux outils de diagnostic précoce des maladies neurodégénératives (Parkinson, Huntington, Alzheimer). Quand le marquage isotopique est réalisé sur une molécule candidat-médicament, nos études permettent d’accélérer le processus de développement de nouveaux médicaments : à titre d’exemples, l’étude de la biodistribution in vivo de la molécule permet d’évaluer sa spécificité, et de prédire d’éventuels effets secondaires ; la détermination de la pharmacodynamie et de la pharmacocinétique in vivo du traceur participe à estimer la dose efficace et la posologie du futur médicament.

E> Contact : yann.bramoulle@cea.fr

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MIRCEN / Radiochimie. La plateforme de radiochimie de MIRCEN produit des radioisotopes émetteurs de positons, le carbone-11 et le fluor-18, puis les incorpore dans des molécules pour en faire des radiotraceurs destinés à l’imagerie préclinique par Tomographie par Emission de Positons (TEP). Ces radiotraceurs peuvent également être distribués à l’extérieur du laboratoire.

L’unité mixte de service UMS-IPSIT (Ingénierie et Plateformes au Service de l’Innovation Thérapeutique, Faculté de Pharmacie, Bâtiment Henri Moissan, Orsay) s’est engagée depuis plusieurs années dans une démarche qualité ambitieuse visant à optimiser la performance de ses plateformes technologiques et à renforcer leur visibilité.

Portée par deux référents qualité — Claudine Deloménie (responsable de la plateforme de transcriptomique ACTAGen) et Séverine Domenichini (responsable de la plateforme d’imagerie MIPSIT) — cette initiative structurante a bénéficié en 2020 d’un financement « Moyens de Recherche Mutualisés » (MRM) de 18 k€ accordé par l’Université Paris-Saclay. Ce soutien a permis d’intégrer à la démarche un accompagnement professionnel par un qualiticien expert.

Grâce à une mobilisation collective, cette démarche a abouti à la formalisation d’un système de management de la qualité (SMQ) partagé, incluant des indicateurs annuels de performance et de suivi, et à l’identification de priorités stratégiques pour le développement des services de l’unité.

Ces efforts ont porté leurs fruits : en 2024, le SMQ de l’UMS-IPSIT a passé avec succès un audit de pré-certification conduit par le Réseau Inserm Qualité. Ce résultat marque une étape clé vers l’objectif de certification ISO 9001, envisagée dès 2026. Ce succès collectif témoigne de l’engagement constant de l’équipe de l’IPSIT en faveur de l’excellence opérationnelle et de l’amélioration continue de l’UMS.

-> Contacts : Valérie Domergue (valerie.domergue@universite-paris-saclay.fr) / Claudine.Delomenie (claudine.delomenie@universite-paris-saclay.fr) / Séverine Domenichini (severine.domenichini@universite-paris-saclay.fr)

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A propos de l’IPSIT. L’IPSIT (Ingénierie et Plateformes au Service de l’Innovation Thérapeutique) est une Unité Mixte de Service placée sous les tutelles conjointes de l’UPSaclay (UMS-IPSIT), l’Inserm (US31) et le CNRS (UAR3679). L’IPSIT regroupe 10 plateformes techniques, organisées en deux pôles technologiques (IMCELLF et OMICS) et quatre plateformes. L’IPSIT se veut résolument à l’interface de la chimie, de la biologie et de la clinique en établissant le lien entre la cible pathologique et le médicament. L’IPSIT est adossée à une Structure Fédérative de Recherche (SFR) qui rassemble l’UMS et 25 équipes de recherche. Enfin, l’IPSIT participe à l’animation scientifique et à la formation des étudiants et des personnels tout en contribuant au rapprochement d’équipes d’horizons différents et à la transdisciplinarité des collaborations. Voir aussi ses FOCUS PLATEFORME décrivant toutes ses expertises !

La radioluminescence ? Une R&D innovante aussi prise en charge par la plateforme de marquage isotopique du CEA (Service de Chimie Bioorganique et de Marquage (SCBM, Département Médicaments et technologies pour la Santé, Institut Joliot, CEA, Centre de Paris-Saclay).

La radioluminescence, mais dans quel contexte ? La maladie de Parkinson est une pathologie neurodégénérative qui touche aujourd’hui plus de 8 millions de personnes dans le monde, avec un nombre de nouveaux cas en constante augmentation. En France, on dénombre environ 25 000 nouveaux cas chaque année. Les traitements actuellement disponibles permettent uniquement de soulager les symptômes, sans agir sur les causes profondes de la maladie. Dans ce contexte, la photobiomodulation représente un espoir prometteur pour le développement de traitements véritablement curatifs. Depuis plusieurs années, un projet de recherche innovant mené par les chercheurs de Clinatec (CEA, Grenoble) a mis en évidence l’effet de l’illumination de la substance noire sur l’évolution de la maladie dans différents modèles animaux. Actuellement, un essai clinique est en cours chez l’être humain et plusieurs patients ont déjà été implantés. Le dispositif utilisé (voir illustration, en haut à gauche, représentation schématique de l’implant actuel), se compose d’une batterie implantée sous la clavicule, d’un boîtier optique placé dans la boîte crânienne et d’une fibre optique insérée dans les ventricules cérébraux. Bien que cette approche soit prometteuse, l’implantation de la batterie et du câble la reliant à la fibre optique est invasive et donc lésionnelle pour le patient. Ainsi, le développement d’un implant autonome capable d’émettre de la lumière rouge, apparaît hautement souhaitable

Et quel lien avec la plateforme de marquage isotopique ? C’est dans cette perspective qu’un projet financé par le CEA a été récemment conduit, réunissant les expertises complémentaires des chercheurs et ingénieurs de trois laboratoires du CEA de Grenoble (Clinatec, LITEN et LETI) et du laboratoire de marquage isotopique de l’Institut JOLIOT (CEA Centre de Paris-Saclay) et plus particulièrement sa plateforme de marquage isotopique. Ce projet a permis de démontrer qu’il était possible d’exploiter la radioluminescence pour concevoir de tels dispositifs (voir illustration, partie basse, principe de la radioluminescence). Les résultats obtenus ont montré que différents types de luminophores, dispersés dans des aérogels de silice ou de cellulose, peuvent être excités par les électrons issus de la désintégration du tritium (isotope radioactif de l’hydrogène, émetteur beta-moins), ouvrant ainsi la voie à la conception de nouveaux implants répondant aux exigences de compacité, d’autonomie et de puissance optique (voir illustration, en haut à droite, photographie d’un capillaire radioluminescent conçu sur la plateforme). De plus, toujours dans le cadre de ce projet, un dispositif expérimental unique a été développé au sein de la plateforme de marquage isotopique. Ce banc de mesure permet de mesurer en temps réel l’intensité lumineuse émise par un objet radioluminescent placé dans une atmosphère contrôlée. Ces travaux préliminaires très prometteurs qui ont fait l’objet d’un dépôt de brevet (FR 2113125) et d’une publication récente (Muñoz Velasco et al, 2025), seront approfondis dans le cadre du projet ANR Radiolight, dont les objectifs sont 1) d’optimiser les performances de ces implants tout en réduisant la quantité de tritium utilisée ; 2) d’étudier les effets du vieillissement sur ces matériaux ; 3) de développer de nouveaux concepts visant à générer des matériaux radioluminescents purement organique.

-> Contact : Grégory Pieters (gregory. pieters@cea.fr)

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MTS / Plateforme de marquage isotopique. Cette plateforme possède une expertise (unique sur Paris-Saclay) en synthèse de composés marqués avec des isotopes stables (2H / deutérium et 13C / carbone-13) et par des isotopes radioactifs de type bêta (3H / tritium, 14C / carbone-14 et 125I / iode-125). Forte de son expertise dans la préparation (synthèse, contrôle de qualité) et formulation de molécules marquées, elle assure régulièrement des prestations et collaborations, académiques comme industrielles, dans le domaine du (radio)marquage moléculaire. Elle offre également à la demande, son expertise et environnement unique de travail (laboratoires « chauds », équipements dédiés) pour l’analyse et la caractérisation d’échantillons radioactifs : mesure de puretés chimique et radiochimique par HPLC, détermination d'enrichissements isotopiques et d'activités spécifiques par SM, analyse et détermination structurale par RMN liquide comme solide, mesure d’activités radioactives par comptage à scintillation. Enfin, la plateforme propose des solutions pour le traitement de déchets liquides radioactifs, en particulier ceux contenant du carbone-14 et du tritium.

A propos de l’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot : L’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot (CEA-Joliot) étudie les mécanismes du vivant pour, à la fois, produire des connaissances et répondre à des enjeux sociétaux au cœur de la stratégie du CEA : la santé et la médecine du futur, le numérique et la transition énergétique. Les travaux, fondamentaux ou appliqués, reposent sur des développements méthodologiques et technologiques. Les collaborateurs du CEA-Joliot sont pour moitié impliqués dans des unités mixtes de recherche (UMR), en partenariat avec le CNRS, l'INRAE, l’INRIA, l'Inserm, l’Université Paris-Saclay et l’Université de Paris. Le CEA-Joliot est implanté principalement sur le centre CEA-Paris-Saclay. Des équipes travaillent également à Orsay, Marcoule, Caen, Nice et Bordeaux.

Cette semaine, un FOCUS PLATEFORME dédié aux activités du SOERE-PRO, l’Observatoire de recherche en environnement rattaché à ECOSYS (UMR INRAE / AgroParisTech) !

Cet observatoire, unique, a pour objectif d’évaluer les effets agronomiques et les potentiels risques du retour au sol de divers produits résiduaires organiques (PRO) : effluents d’élevage, composts de déchets organiques urbains, digestats de méthanisation, etc. Créé au début des années 2000, il compte actuellement 8 sites expérimentaux. Depuis 2014, les sites QualiAgro, PROspective, EFELE, La Réunion et son système d’information sont intégrés à l’infrastructure de Recherche AnaEE-France. En 2018, les sites QualiAgro, PROspective et EFELE ont été labellisés en tant qu'Infrastructure Scientifique Collective INRAE (renouvellement en cours en 2025).

L’originalité du SOERE-PRO tient dans la mise en place d’expérimentations de longue durée au champ dans différents contextes pédoclimatiques où l'évolution de la qualité des sols, des cultures, de l'eau et de l'air est mesurée après l'application répétée de PRO et la dynamique de ces évolutions est reliée aux caractéristiques des PRO appliqués (origine x traitement) ainsi qu’aux conditions pédoclimatiques. Le SOERE-PRO fournit des services d'Observation à la communauté scientifique : accès aux sites dans le cadre de programmes de recherche, fourniture d’échantillons (sol, PRO, plantes), fourniture de données (sol, PRO, plantes, eaux, GES).

L’enjeu pour ce réseau de longue durée est de maintenir ses capacités d’expérimentation et de suivis (monitoring) ainsi que la motivation de son personnel scientifique et technique dans le temps. Pour cela, une coordination avec des responsables techniques et scientifiques a été mise en place dès le départ. Des temps d’échanges, de rencontres lors d’assemblées générales, de comités techniques, de groupes de travail notamment, rythment la vie du réseau. Des outils tels que des bulletins de veille presse et médias sur les PRO (publiés tous les deux mois), un site web dont la mise à jour complète a été réalisée de 2023 à 2025 (une version anglaise est en projet), un espace de partage institutionnel Nextcloud fournissent aux acteurs du réseau et aussi à la communauté scientifique, de précieuses informations scientifiques et techniques sur les dispositifs.

N’hésitez pas à visiter le site web de cet observatoire pour mieux connaître ses objectifs, ses dispositifs, les suivis ainsi que les productions : https://valor-pro.hub.inrae.fr/. Aussi, si vous souhaitez en savoir plus et en quelques clics sur les travaux de recherche menés sur les dispositifs du SOERE PRO, n’hésitez pas… Michaud et al., Science of The Total Environment 2025 ; Jacquin et al., Agriculture, Ecosystems & Environment 2025; Didelot et al., Agriculture, Ecosystems & Environment 2025; Mora-Salguero et al., Front Microbiol 2025 ; Chen et al., Soil Use and Management 2024

-> Contact : Christophe Montagnier (christophe.montagnier@inrae.fr)

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ECOSYS / SOERE PRO : Observatoire de recherche en environnement étudiant le recyclage agricole des Produits Résiduaires Organiques (PRO). Le SOERE PRO est un Observatoire de recherche en environnement composé de 8 dispositifs expérimentaux au champ de longue durée, étudiant les effets agronomiques et les potentiels risques du retour au sol de Produits Résiduaires Organiques (PRO). Cinq sites sont instrumentés pour suivre les PRO épandus, les compartiments de l'agrosystème, les émissions de gaz à effet de serre, le climat du sol, les eaux et la météo (Qualiagro en Ile de France, PRO'spective Grand-Est, EFELE en Bretagne, SOERE PRO - Réunion et SOERE PRO - Sénégal). Trois sites associés, sont peu ou pas instrumentés (La Bouzule Grand-Est, Couhins Nouvelle Aquitaine, MetaMetha Centre-Val de Loire). Le SOERE PRO a été labellisé en 2011 et 2015 par ALLENVI, 4 sites sont intégrés à ANAEE-France. En 2018, l'observatoire a été labellisé en tant qu'infrastructure scientifique collective (ISC) par INRAE. Les évolutions des agro-systèmes sont mesurées, à l'échelle de la parcelle agricole, au fur et à mesure d'apports de PRO issus d'activités urbaines et agricoles et de différentes filières de traitements. Les suivis de monitoring sont harmonisés entre les sites (PRO, sol, plante, eau, air) : éléments majeurs, rendements cultures, contaminants chimiques/organiques, pathogènes humains, reliquats azotés, propriétés physiques du sol. Les résultats du SOERE PRO sont intégrés dans des analyses multi-critères globales associant bénéfices et risques. Ils permettent de développer des modèles utilisés pour tester des scénarios d'insertion des PRO dans les systèmes de cultures pour optimiser leur usage. Les travaux contribuent également à l'accueil de nombreux projets de recherche (27 projets en cours en 2025) ainsi qu'à la formation d'étudiants (masters, doctorats).

Située au cœur du biocluster Genopole, la biobanque du Centre d'Étude des Cellules Souches (CECS) I-Stem est une plateforme essentielle pour la recherche basée sur l’utilisation des cellules souches humaines. Spécialisée dans la cryoconservation et la distribution de lignées cellulaires humaines, elle offre aux chercheurs un accès privilégié à une collection unique de cellules souches pluripotentes induites (CSPi) et de cellules souches embryonnaires humaines (CSEh), ainsi qu'à leurs dérivés. En intégrant StemCARE, une plateforme technologique labellisée IBISA, la Biobanque du CECS I-Stem bénéficie d'un cadre structurant favorisant l'innovation scientifique et le développement de nouvelles thérapies.

La biobanque du CECS I-Stem met à disposition des ressources cellulaires de haute qualité pour les équipes académiques et industrielles du secteur des biotechnologies. Alexandra Benchoua, Directrice de recherche au CECS I-Stem, souligne : « Notre objectif est d'offrir aux chercheurs et industriels un accès à des lignées cellulaires répondant aux normes les plus exigeantes. Cette ressource unique contribue activement aux avancées en médecine personnalisée et de précision. »

Les missions principales de la biobanque incluent : i) la collecte et conservation des échantillons : stockage sécurisé et conforme aux réglementations en vigueur ; ii) la préparation et distribution des lignées cellulaires : gestion rigoureuse assurant une traçabilité optimale ; iii) la garantie de qualité et conformité : procédures validées par le service Assurance Qualité d'I-Stem ; et iv) Une accessibilité et offre de collaboration : ouverture aux chercheurs scientifiques et industriels pour encourager les avancées scientifiques.

Un levier pour le développement de nouvelles thérapies. Grâce à ses collections cellulaires et à son expertise en culture et conservation de cellules souches, la biobanque facilite le développement de nouvelles approches dans plusieurs domaines. Elle contribue à la modélisation des pathologies pour mieux comprendre les mécanismes des maladies génétiques. Elle joue un rôle clé dans le criblage pharmacologique afin d'identifier de nouvelles molécules thérapeutiques. Enfin, elle participe à l'optimisation des protocoles de transplantation cellulaire dans le cadre de la thérapie cellulaire.

Un pilier central de StemCARE. En tant que composante essentielle de StemCARE, la biobanque joue un rôle clé dans l'écosystème. Sa capacité à fournir des ressources cellulaires de haute qualité, combinées à l'expertise scientifique d'I-Stem et au soutien technologique de StemCARE, permet d'accélérer la mise au point de nouvelles stratégies thérapeutiques. La biobanque est ouverte aux collaborations nationales et internationales pour les projets de recherche, de développement thérapeutique et d’innovation biomédicale.

-> Contact : Julien Picot (julien.picot@genopole.fr)

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A propos de Genopole / I-Stem / Plateforme Biobanque : Les cellules souches sont des ressources incontournables pour la recherche et développement. La Biobanque de cellules du CECS/I-Stem permet de conserver et de mettre à disposition des équipes de recherche le matériel biologique indispensable pour l’étude des maladies génétiques et le développement de thérapies cellulaires. La Biobanque du CECS / I-Stem conserve une large collection de lignées cellulaires humaines, notamment des lignées de cellules souches embryonnaires (CSEh), des lignées de cellules induites à la pluripotence (CSPi) ainsi que leurs dérivés. L’ensemble des lignées est en conservation miroir sur deux sites pour plus de sécurité. Après réception des échantillons initiaux fournis par les équipes d’I-Stem, des collaborateurs externes ou des partenaires industriels, les cellules sont cultivées et qualifiées en collaboration avec la Plateforme de Biologie cellulaire et la Plateforme de Bioproduction. Du fait de son organisation et de la gestion mise en place, la Plateforme Biobanque permet aux équipes de recherche de disposer à tout moment de nombreux modèles cellulaires de maladies génétiques ainsi que de cellules saines « contrôles » de haute qualité.

A propos de Genopole. Premier biocluster français dédié à la recherche en génomique et aux biotechnologies appliquées à la santé et à la bioéconomie, Genopole réunit 78 entreprises, 19 laboratoires de recherche, 23 infrastructures, plateformes et plateaux techniques mutualisés, ainsi que des formations universitaires (université d’Évry, Paris-Saclay). Son objectif : favoriser l’émergence et la croissance de sociétés de biotechnologie, le transfert d’innovations vers le secteur industriel, le développement de la recherche et l’enseignement supérieur en sciences de la vie. Genopole est un Groupement d’intérêt public principalement soutenu par l’État, la Région Ile-de-France, le Département de l’Essonne, l’agglomération Grand Paris Sud, la Ville d’Évry-Courcouronnes et l’AFM-Téléthon.

Pour obtenir plus de renseignements sur les plateformes technologiques labellisées par Genopole, ainsi que sur les équipements mutualisés accessibles à la communauté scientifique francilienne, contactez Julien Picot (julien.picot@genopole.fr).