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June 12, 1:29 PM
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RAPPEL ! Scientific Day GS LSH - CRISPR tools: more than a knockout | 24th June 2025

RAPPEL ! Scientific Day GS LSH - CRISPR tools: more than a knockout | 24th June 2025 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La Graduate School Life Sciences and Health (GS LSH) a le plaisir de vous annoncer l'ouverture des inscriptions à la journée scientifique : "CRISPR tools: more than a knockout" qui se tiendra le 24 juin 2025 de 8h30 à 18h dans le bâtiment Henri Moissan (amphithéâtre Olivier Kahn) de l'Université Paris Saclay.

 

Nous aurons le plaisir d'accueillir 3 keynote speakers :

 

Pour vous inscrire : cliquez ici


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July 6, 11:41 AM
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FOCUS PLATEFORME : La plateforme de cristallisation de l’I2BC évolue vers une plateforme de cristallographie : de nouveaux services proposés

FOCUS PLATEFORME : La plateforme de cristallisation de l’I2BC évolue vers une plateforme de cristallographie : de nouveaux services proposés | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La plateforme de cristallisation située dans l’Institut de Biologie intégrative de la Cellule (I2BC, Gif-sur-Yvette, Institut Joliot) a évolué vers une plateforme de cristallographie (I2BC / Plateforme de cristallographie) et propose de nouvelles prestations ainsi qu’un soutien scientifique aux clients pour tous projets en biologie structurale.

 

La cristallographie des protéines est l’approche principale pour caractériser la structure 3D de protéines liées à des candidats médicaments et pour déterminer les bases moléculaires de complexes entre les protéines solubles ou membranaires et leur partenaire (ADN, ARN, autre protéines, peptides, lipides, co-facteurs, ligands divers dont métaux). Initialement, la plateforme de cristallisation permettait de réaliser le criblage, l'analyse et l'optimisation automatisés des conditions de cristallisation des macromolécules solubles et membranaires. Dorénavant, la plateforme de cristallographie propose des prestations étendues jusqu’à la détermination et/ou l’analyse de la structure des protéines. Les étapes successives à réaliser à partir d’un échantillon de protéine d’intérêt purifié sont l’obtention des cristaux, l’enregistrement des clichés de diffraction au Synchrotron Soleil, le calcul des cartes de densité électronique, l’affinement du modèle atomique de la protéine ou du complexe d’intérêt et son analyse structurale. L'accent est mis sur l'obtention de modèles les plus précis pour l'analyse structurale la plus fructueuse. Un service AlphaFold avec l'analyse des modèles prédits est aussi disponible, s’appuyant sur les services mis en place à l’I2BC par la plateforme de bioinformatique intégrative BIOI2.

 

La plateforme est équipée de plusieurs robots de pipetage de nanovolume (y compris la phase cubique lipidique pour les protéines membranaires) et de visualisation, qui permettent de cribler à grande échelle les conditions de cristallisation à deux températures (4°C et 19°C). Les étapes de routine en amont d’un cristal de protéine sont l’obtention d’un gène d’intérêt synthétique optimisé pour une expression dans des hôtes procaryotes, l’expression et la purification de la protéine recombinante étudiée. La plateforme peut conseiller les clients sur ces différentes étapes et une collaboration/prestation peut être envisagée suivant la complexité du projet.

 

La plateforme de cristallographie de l’I2BC s’adresse à tous les scientifiques (des novices aux cristallographes expérimentés) : il faut noter que la qualité de l’échantillon protéique est un critère important ! L’échantillon doit être pur et vérifié sur un gel acrylamide dénaturant avant d’être cristallisé. N’hésitez pas à nous contacter !

 

-> Contacts : Solange Morera (solange.morera@i2bc.paris-saclay.fr) ou cristallographie@i2bc.paris-saclay.fr

 

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

 

La plateforme a déjà publié plusieurs FOCUS PLATEFORME ces dernières années. Les relire ?

 

I2BC / Plateforme de cristallographie. La cristallographie des protéines est l’approche principale pour caractériser la structure 3D de protéines liées à des candidats médicaments et pour déterminer les bases moléculaires de complexes entre les protéines solubles ou membranaires et leur partenaire (ADN, ARN, autre protéines, peptides, lipides, co-facteurs, ligands divers dont métaux). Initialement, la plateforme de cristallisation permettait de réaliser le criblage, l'analyse et l'optimisation automatisés des conditions de cristallisation des macromolécules solubles et membranaires. Dorénavant, la plateforme de cristallographie propose des prestations jusqu’à la détermination et/ou l’analyse de la structure des protéines. Les étapes successives à réaliser à partir d’un échantillon de protéine d’intérêt purifié sont l’obtention des cristaux, l’enregistrement des clichés de diffraction au Synchrotron Soleil, le calcul des cartes de densité électronique, l’affinement du modèle atomique de la protéine ou du complexe d’intérêt et son analyse structurale. L'accent est mis sur l'obtention de modèles les plus précis pour l'analyse structurale la plus fructueuse. Un service AlphaFold avec l'analyse des modèles prédits est aussi disponible. La plateforme est équipée de plusieurs robots de pipetage de nanovolume (y compris la phase cubique lipidique pour les protéines membranaires) et de visualisation, qui permettent de cribler à grande échelle les conditions de cristallisation à deux températures (4°C et 19°C). Les étapes de routine en amont d’un cristal de protéine sont l’obtention d’un gène d’intérêt synthétique optimisé pour une expression dans des hôtes procaryotes, l’expression et la purification de la protéine recombinante étudiée. La plateforme peut conseiller les clients sur ces différentes étapes et une collaboration/prestation peut être envisagée suivant la complexité du projet. Cette plateforme fait partie du pôle des plateformes de Biologie Structurale de l’I2BC qui comprend six plateformes: l’expression de protéines dans des hôtes eucaryotes (Prot-Ex), la cryo-microscopie électronique (cryoEM), la cristallographie, la résonance magnétique nucléaire (RMN), l’interactions macromoléculaires (PIM) et AlphaRep. Chaque plateforme offre un éventail complet de méthodes pour les études biochimiques, biophysiques et structurales au niveau moléculaire. Chacune bénéficie de l'expertise de scientifiques et d'ingénieurs qui conseillent, soutiennent et forment à l'utilisation d'instruments de pointe et à l'analyse des données. Le pôle de biologie structurale travaille en étroite collaboration avec le synchrotron SOLEIL, situé à proximité. La plateforme de cristallographie fait également partie de l'infrastructure nationale en Biologie Structurale FRISBI (Frisbi.eu).

 

A propos de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC - UMR 9198). L’I2BC est une Unité Mixte de Recherche (CEA, CNRS, Université Paris-Saclay), accueillant une soixantaine d’équipes de recherche et hébergeant 17 plateformes technologiques, réparties en 6 pôles. 2025 est aussi une année clé pour l’I2BC : cette unité fête ses 10 ans cette année.

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Bourse franco-australienne de recherche sur l'Antarctique

Bourse franco-australienne de recherche sur l'Antarctique | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Date limite de candidatures : 26 septembre 2025

La France et l’Australie entretiennent dans les domaines liés à l’Antarctique des liens étroits de collaborations logistique et scientifique depuis de très nombreuses années. Cette coopération concerne le ravitaillement des stations antarctiques, le transport de personnel ou la logistique du travail sur le terrain, avec par exemple les efforts récents de forage d’une carotte glaciaire pour atteindre un million d’années.

La Tasmanie sert d’escale régulière aux navires français à destination de l’Antarctique, et héberge un important contingent de chercheurs français employés dans les structures australiennes.

Afin de promouvoir le potentiel de coopération scientifique entre nos deux pays et de célébrer le protocole de Madrid qui établit l’Antarctique comme réserve naturelle consacrée à la paix et à la science, l’Ambassade de France en Australie, AFRAN Inc. et l’université de Monash dans le cadre de son programme ARC SRI de protection du futur environnemental de l’Antarctique, ont conjointement mis en place une bourse de recherche pour soutenir les collaborations scientifiques franco-australiennes.

Cette bourse de recherche conjointe vise à encourager et renforcer les collaborations entre scientifiques de tous les domaines scientifiques sur des projets liés à l’étude de l’Antarctique et de l’océan Austral. Le financement peut être utilisé pour faciliter les échanges de chercheurs entre l’Australie et la France ainsi que pour soutenir la recherche et le travail sur le terrain. Les candidatures doivent porter sur un projet conjoint impliquant au moins une organisation en Australie et une organisation en France.

Téléchargez l’appel à projets

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RAPPEL ! Lancement de l'édition 2025 du prix Irène Joliot-Curie

RAPPEL ! Lancement de l'édition 2025 du prix Irène Joliot-Curie | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Créé en 2001, le Prix Irène Joliot-Curie est destiné à promouvoir la place des femmes dans la recherche et la technologie en France. Depuis plus de 20 ans, le Prix Irène Joliot-Curie a distingué plus de 70 femmes scientifiques pour l’excellence de leurs contributions dans plus de 20 champs disciplinaires.

 

Action phare du ministère en faveur d’une meilleure visibilité des femmes scientifiques et de leurs travaux, ce prix contribue à multiplier les modèles de femmes scientifiques inspirantes à l’image d’Irène Joliot-Curie. Depuis 2023, le prix met à l’honneur trois jeunes femmes scientifiques au lieu d’une dans la catégorie « Jeune Femme scientifique ».

 

Catégories

 

Le Prix Irène Joliot-Curie comporte quatre catégories :

  • La catégorie « Femme scientifique de l’année » récompense une femme ayant apporté une contribution exceptionnelle dans le domaine de la recherche publique par l’ouverture de son sujet, l’importance de ses travaux et la reconnaissance dans son domaine scientifique, tant au plan national qu’international.
  • La catégorie « Jeune Femme scientifique » met en valeur et encourage trois jeunes femmes qui se distinguent par un parcours et des travaux qui en font des spécialistes de talent dans leur domaine.
  • La catégorie « Femme, recherche et entreprise » récompense une femme qui, à partir d’excellence scientifique et technique, se consacre à développer des innovations de forte portée économique et sociale en travaillant au sein d’une entreprise ou en contribuant à la création d’une entreprise.
  • Le Prix spécial de l’engagement, récompense une femme scientifique particulièrement investie dans la sensibilisation et l’orientation des jeunes filles et des jeunes en général vers les sciences. 

 

Dotation

 

Le Prix est doté de :

  • 40 000 € dans la catégorie « Femme scientifique de l’année » ;
  • 20 000 € pour chacune des trois lauréates dans la catégorie « Jeune Femme scientifique » ;
  • 20 000 € dans la catégorie « Femme, recherche et entreprise » ;
  • 40 000 € pour le Prix spécial de l’engagement

 

Organisation et jurys

Les Prix « Femme scientifique de l’année », « Jeune Femme scientifique » et « Femme, recherche et entreprise » sont accordés par le ministère chargé de l’Enseignement supérieur et de la Recherche avec le soutien de l’Académie des sciences et de l’Académie des technologies, qui sont en charge de la constitution du jury qui désignera les lauréates. Le jury de cette 24e édition sera présidé par Mme Catherine Cesarsky, astrophysicienne et membre de l'Académie des sciences.

 

Depuis 2023, le Prix spécial de l’engagement récompense une femme scientifique particulièrement investie dans la sensibilisation et l’orientation des filles et des jeunes en général vers les sciences. En effet, les disparités dans les choix d’orientation et leurs conséquences sur la sous-représentation persistante des femmes dans les filières scientifiques, constituent un enjeu majeur pour l’égalité professionnelle, économique, sociale et technologique. Le Ministère est seul en charge de la constitution et de l’organisation du jury de sélection des candidates.

 

La date de clôture des candidatures est fixée au vendredi 1er août 2025 à minuit. 


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Today, 4:46 PM
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SAVE THE DATE ! PSCC Innovation Forum - February 4, 2026

SAVE THE DATE ! PSCC Innovation Forum - February 4, 2026 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

The Paris-Saclay Cancer Cluster (PSCC) is delighted to invite you to the 3rd PSCC Innovation Forum, taking place on Wednesday, February 4, 2026, on the occasion of World Cancer Day.

 

📍 Les Esselières – Villejuif (M° Lines 7 &14)
🕘 Full-day event followed by a cocktail reception

 

Join us for a day of oncology innovation, scientific exchange, and ecosystem collaboration, bringing together the leading minds shaping the future of cancer care.

 

On the agenda:

  • Expert talks and cutting-edge insights into the latest breakthroughs in oncology
  • Dynamic networking with academia, industry leaders, investors, and public stakeholders
  • Start-up pitches from the most promising companies supported by PSCC
  • Real-world collaboration stories between SMEs, large companies and investors in biotech and medtech

 

The 2025 edition gathered over 550 participants - don’t miss your chance to be part of the next one!

 

A formal invitation with registration details will follow shortly.
In the meantime, mark your calendar!

 

Best regards,
The PSCC Team

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Today, 4:37 PM
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Atelier de microscopie confocale 2025 - 29 septembre - 3 octobre 2025 à Gif sur Yvette

Atelier de microscopie confocale 2025 - 29 septembre - 3 octobre 2025 à Gif sur Yvette | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Atelier de Microscopie Confocale 2025

Du lundi 29 Sept au vendredi 03 octobre 2025

À Gif-sur-Yvette (Essonne)

 

Date limite d'inscription: 15 septembre 2025

 

Programme et pré-inscription en ligne en suivant ce lien !

 

Lors de cette formation de 5 jours, de nombreux domaines seront abordés lors de phases théoriques et pratiques animées par des experts du domaine.

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Vieillissement des plaquettes : l’exposition du β-galactose comme marqueur de sénescence chez l’homme et la souris

Vieillissement des plaquettes : l’exposition du β-galactose comme marqueur de sénescence chez l’homme et la souris | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Des chercheurs de l’unité Hémostase Inflammation Thrombose (UMR-S 1176 INSERM/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre), en collaboration avec les équipes INSERM U1255 (Strasbourg) et U1011 (Lille), ont apporté la première démonstration directe que l’exposition progressive du β-galactose à la surface des plaquettes reflète leur vieillissement physiologique, chez la souris et chez l’humain. Ces travaux, publiés dans Haematologica, confirment une hypothèse ancienne jusqu’ici jamais validée dans des conditions physiologiques.

 

Les plaquettes sanguines ont une durée de vie limitée d’environ 10 jours. Leur élimination est assurée via des signaux encore partiellement élucidés. Si la désialylation, c’est-à-dire la perte de l’acide sialique laissant le β-galactose exposé, avait été observée dans des contextes artificiels de stockage des concentrés plaquettaires ou de maladies auto-immunes, aucune preuve directe ne permettait jusqu’à présent de l’associer au vieillissement physiologique.

 

Grâce à une approche de cytométrie de flux et à deux modèles murins expérimentaux, les chercheurs ont montré que l’exposition du β-galactose augmente avec l’âge des plaquettes, une observation reproduite chez l’humain, y compris dans des contextes cliniques comme la thrombopénie ou après traitement par agents stimulant la production plaquettaire.

 

Cette découverte ouvre la voie à de nouveaux outils de suivi de l’âge plaquettaire, utiles pour la médecine transfusionnelle, les maladies auto-immunes, et la compréhension du cycle de vie des plaquettes.

 

-> Contact : alexandre.kauskot@inserm.fr

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Today, 4:05 PM
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Stimulation de l'export du nitrate vacuolaire : un levier pour accroître la croissance chez Arabidopsis thaliana

Stimulation de l'export du nitrate vacuolaire : un levier pour accroître la croissance chez Arabidopsis thaliana | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude parue dans Journal of Experimental Botany, des chercheurs de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) et de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule – I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) ont démontré que la surexpression du transporteur vacuolaire de nitrate NRT2.7 stimule la croissance de la plante modèle Arabidopsis thaliana.

 

Le nitrate constitue la principale forme d’azote absorbée par les plantes et joue un rôle clé dans leur croissance. Toutefois, son apport excessif sous forme d’engrais en agriculture a des conséquences environnementales néfastes. Le stockage du nitrate dans la vacuole, principal réservoir intracellulaire de nitrate chez les plantes, représente une stratégie prometteuse pour développer des cultures absorbant et utilisant mieux l’azote, capables de croître avec des apports d’engrais réduits. Dans cette étude, les chercheurs ont utilisé des approches de physiologie moléculaire et d’électrophysiologie pour caractériser le rôle de NRT2.7. Ils ont montré que sa surexpression favorise l’export du nitrate depuis la vacuole vers le cytoplasme, ce qui stimule la croissance de la plante en conditions de faible et forte disponibilité en nitrate.

 

Ces résultats mettent en évidence le rôle central de la remobilisation du nitrate vacuolaire dans la régulation de la croissance chez les plantes. La découverte de la fonction de NRT2.7 ouvre ainsi la voie à de nouvelles stratégies visant à améliorer l'efficacité d’utilisation de l’azote, contribuant à une agriculture plus durable.

 

-> Contact : sophie.filleur@i2bc.paris-saclay.fr / anne.krapp@inrae.fr

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Today, 3:49 PM
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Une réaction enzymatique inédite pour la biosynthèse d’un nouvel antibiotique contenant de l’arsenic

Une réaction enzymatique inédite pour la biosynthèse d’un nouvel antibiotique contenant de l’arsenic | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une nouvelle étude publiée dans The Journal of the American Chemical Society, des chercheurs de l’institut MICALIS (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec le CNRS - Univ. Aix-Marseille, ont élucidé le mécanisme d’action d’une nouvelle enzyme, ArsL, impliquée dans la biosynthèse de l’Arsinothricine, un antibiotique naturel unique contenant de l’arsenic.

 

Il a notamment été montré que ArsL appartient à la vaste superfamille des enzymes dites « à radical SAM », qui utilisent un centre [4Fe-4S] et la S-adénosyl-L-méthionine (SAM) pour catalyser des transformations biochimiques complexes. Néanmoins, contrairement aux autres membres de cette famille qui clivent la liaison C5′−S de SAM pour former le radical 5′-désoxyadénosyle (5¢-dA•), ArsL catalyse une réaction sans précédent. En effet, il a été montré que cette enzyme clive la liaison Cγ–S de la SAM, générant une nouvelle espèce radicalaire : le radical 3-amino-3-carboxypropyle (ACP•). Cette espèce radicalaire est ensuite additionnée à un atome d’arsénite (AsIII) puis convertie en Arsinothricine.

 

Par des approches de biochimie et de spectroscopie avancées, il a été possible de mieux comprendre comment ArsL utilise la SAM pour former ce radical atypique. Ces résultats mettent en évidence que la diversité structurale et fonctionnelle des enzymes à radical SAM est plus vaste qu’anticipée, et élargissent le champ des réactions catalysées par cette superfamille. Ils ouvrent également de nouvelles perspectives pour l’ingénierie enzymatique et la synthèse de composés organo-métalliques à visée thérapeutique.

 

Légende Figure : Comparaison du mécanisme des enzymes à radical SAM avec celui de ArsL.

 

-> Contact : olivier.berteau@inrae.fr / alhosna.benjdia@inrae.fr

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Today, 1:19 PM
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Un facteur clé pour l’équilibre vasculaire pulmonaire : le rôle essentiel de BMP-9 mis en lumière

Un facteur clé pour l’équilibre vasculaire pulmonaire : le rôle essentiel de BMP-9 mis en lumière | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Une étude récemment publiée dans PNAS révèle le rôle central de la protéine BMP-9, codée par le gène GDF2, dans le développement et la stabilité du réseau vasculaire pulmonaire.

 

Déjà impliquée dans des maladies vasculaires rares telles que l’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP), la télangiectasie hémorragique héréditaire (HHT) ou le syndrome hépato-pulmonaire (SHP), BMP-9 est principalement produite par le foie. Elle agit via les récepteurs ALK1 et BMPR-II pour maintenir un équilibre fin entre croissance, stabilité et remodelage du lit vasculaire pulmonaire.

 

Dans ce travail, les chercheurs montrent que l’absence de BMP-9 chez le rat entraîne une vasodilatation significative et une augmentation de la densité des vaisseaux dans les régions distales du poumon. Bien que ces altérations ne provoquent pas à elles seules une HTAP spontanée, elles rappellent certains traits morphologiques observés dans la HHT et le SHP. Fait notable, ces rats déficients en BMP-9 sont partiellement protégés contre le développement d’une HTAP sévère dans différents modèles expérimentaux, suggérant que BMP-9 régule à la fois la densité vasculaire et le tonus vasculaire pulmonaire.

 

Grâce à une approche combinant études in vivo et in vitro, l’équipe a mis en évidence que la réponse des cellules endothéliales pulmonaires à BMP-9 dépend étroitement de l’expression du récepteur ALK1. Des analyses de transcriptomique unicellulaire ont permis d’identifier plusieurs sous-populations de cellules endothéliales avec des niveaux variables d’ALK1 et des signatures transcriptionnelles spécifiques. De plus, BMP-9 inhibe l’activation de la voie proangiogénique VEGF/VEGFR2, soulignant un dialogue complexe entre ces deux grandes voies de régulation vasculaire.

 

Ces découvertes apportent un éclairage nouveau sur les mécanismes qui régulent l’homéostasie vasculaire pulmonaire et illustrent la complexité du ciblage thérapeutique de la voie BMP-9/ALK1. Elles permettent également de mieux comprendre certains effets indésirables du sotatercept — un traitement récemment approuvé pour l’HTAP — dont les effets secondaires tels que les télangiectasies et les épistaxis rappellent ceux observés dans la HHT, tandis que la dilatation anormale du lit capillaire pulmonaire évoque des caractéristiques du SHP.

 

L’étude a été menée par l’équipe « Dysfonction endothéliale et Innovation thérapeutique en Hypertension Pulmonaire », dirigée par Christophe Guignabert au sein de l’UMR-S 999 du laboratoire du Prof. Marc Humbert (Inserm/UPSclay, Le Kremlin-Bicêtre), avec le soutien, entre autres, des équipes du Dr Pascal Barbry (Université Côte d’Azur, CNRS, Inserm, IHU RespirERA, Sophia Antipolis) et du Dr Sabine Bailly (Unité Biosanté U1292, Université Grenoble Alpes, Inserm, CEA).

 

-> Contact : christophe.guignabert@inserm.fr

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July 1, 12:11 PM
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Décodage des signatures épigénomiques à travers les coupes de tissus pour révéler les changements de régulation transcriptionnelle dans un contexte spatial

Décodage des signatures épigénomiques à travers les coupes de tissus pour révéler les changements de régulation transcriptionnelle dans un contexte spatial | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Alors que les récents développements en « omique » à résolution spatiale sont en train de révolutionner la façon dont nous pouvons explorer la complexité tissulaire, la plupart des solutions disponibles se concentrent uniquement sur la détection de la présence d'ARN. Des études antérieures ont indiqué que la demi-vie des molécules d'ARN dans la cellule peut varier de 40 minutes à 9 heures, notamment en fonction de sa fonction physiologique (Tani et al. 2012), ce qui suggère qu'un test de profilage transcriptomique ne reflète pas directement l'état transcriptionnel de la cellule au moment de la mesure. De plus, par définition, une analyse transcriptomique ne peut identifier que les lectures des gènes exprimés, mais ne peut pas distinguer les gènes réprimés des gènes maintenus dans un état transcriptionnel favorable, car les deux sont transcriptionnellement inactifs.

 

L'utilisation de stratégies d'immunoprécipitation de la chromatine (utiliser des anticorps pour capturer des protéines associées à l’ADN) pour interroger la présence de modifications d'histones à travers le génome est devenue la méthode de référence pour interroger l'état de régulation de la transcription au moment « t » dans des prélèvement des échantillons (Bannister & Kouzarides, 2011). Cette stratégie, plus récemment déclinée dans sa version enzymatique « Cut&Tag » (basée sur l'utilisation d'une protéine A recombinante et de la transposase Tn5 : PA-Tn5) (Kaya-Okur et al., 2019) a permis un gain de sensibilité en réduisant le nombre de cellules requises de millions à quelques milliers, atteignant même l'échelle de la cellule unique (Bartosovic et al., 2021). Ainsi, il est possible de capturer des histones (les protéines utilisées pour compacter l’ADN), ayant des modifications associées à l’état de régulation de l’expression de gènes.

 

Dans une nouvelle étude parue dans Genome Research, Marco Mendoza et ses collaborateurs du laboratoire Genoscope (CEA/CNRS/UEVE/UPSaclay) présentent une nouvelle méthode permettant la capture de signatures de modification d'histones de manière spatialement résolue, grâce à une puce d'ADN présentant des barcodes moléculaires uniques à une résolution de 100 micromètres. Cette technologie, basée sur l’utilisation de la protéine recombinante PA-Tn5, permet de cliver la chromatine et l’immobiliser par la création d’un pont covalent avec les sondes d'ADN de la puce. Ainsi, les auteurs ont validé cette méthodologie sur des cerveaux de souris adulte ainsi que sur du matériel biologique osseux préalablement décalcifié et conservé dans de blocs de paraffine (FFPE). En effet, le matériel biologique conservé en « FFPE » est considéré comme difficilement lisible par de méthodes de transcriptomique car l’ARN est mal conservé dans ces conditions ; phénomène qui est encore accentué avec des procédures de décalcification. Par ailleurs, les chercheurs ont démontré la possibilité de combiner plusieurs lectures de modifications d’histones collectées sur des sections consécutives d’embryon de souris, afin de révéler état épigénétique de promoteurs comme un moyen efficace de prédire leur état transcriptionnel.

 

Après les travaux du professeur Rong Fan à l’Université de Yale, cette technologie correspond à la seconde tentative mondiale pour cartographier les modifications d’histones sur des section de tissus. Bien que la technologie ne soit pas aussi résolutive que la méthodologie du professeur Fan (canaux microfluidiques de 20 microns : Deng et al. 2022), la flexibilité de fabrication de puces d'ADN couvrant des surfaces personnalisées à moindre coût, grâce au nombre combinatoire de sondes requises, rend cette approche extrêmement performante pour l'analyse d'un grand nombre de coupes de tissus, même de grandes dimensions.

 

Dans cette étude, les scientifiques ont également souligné la nécessité de collecter des coupes consécutives pour acquérir des signatures distinctes de modifications d'histones, lesquelles peuvent ensuite être combinées afin de révéler les signatures d'état de la chromatine et de les comparer dans un contexte spatial. Cette stratégie devrait gagner en puissance dans les années à venir grâce à une diminution des coûts de séquençage, permettant ainsi de collecter plusieurs coupes consécutives pour reconstruire des vues volumétriques des signatures d'état de la chromatine qui régissent l'architecture tissulaire. Un brevet sur la stratégie de fabrication des puces, la procédure de coupure de la chromatine et l’obtention des libraires de séquençage a été déposé (Marco Mendoza ; no. EP24307128).

 

-> Contact : mmendoza@genoscope.cns.fr

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July 1, 12:31 PM
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Les origines des archées DPANN dévoilées par la phylogénomique

Les origines des archées DPANN dévoilées par la phylogénomique | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Nature Microbiology, des scientifiques du Laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette) ont clarifié les origines évolutives des archées DPANN, un groupe longtemps énigmatique. Ces microorganismes, aux génomes extrêmement réduits et aux cellules minuscules, sont des symbiontes d’autres archées, qui leur fournissent toutes les molécules (acides aminés, nucléotides, phospholipides, etc.) qu’ils ne peuvent pas synthétiser eux-mêmes. Les archées DPANN ont été découvertes il y a une vingtaine d’années, mais leur place dans l’arbre du vivant restait vivement débattue.

 

Dans cette analyse, les chercheurs ont utilisé plus de 300 génomes d’archées, dont la totalité des phylums DPANN connus, et 126 marqueurs protéiques ultra-conservés. Grâce à des approches phylogénomiques innovantes, permettant de corriger les artefacts liés à la vitesse d’évolution et aux biais de composition en acides aminés, ils ont pu démontrer que les DPANN forment un groupe monophylétique, très probablement issu d’un ancêtre libre appartenant à la grande lignée des euryarchées. Ces résultats réfutent l’idée que la monophylie des DPANN résulterait d’artefacts phylogénétiques et révèlent que plusieurs protéines clés de ces archées proviennent d’anciens transferts horizontaux de gènes depuis des bactéries également symbiotiques, comme les Patescibacteria et les Omnitrophota. Ces acquisitions ont pu jouer un rôle déterminant dans l’adaptation des DPANN à une vie symbiotique, en facilitant par exemple l’adhésion aux cellules hôtes.

 

Ces résultats renforcent l’idée que la symbiose, en favorisant la réduction génomique et l’interdépendance, a été un moteur puissant de diversification chez ces archées encore largement méconnues. Ils illustrent aussi l’importance des transferts de gènes entre les différents domaines du vivant dans l’évolution des modes de vie, un processus qui pourrait être beaucoup plus fréquent qu’on ne le pensait.

 

-> Contact : david.moreira@universite-paris-saclay.fr

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July 1, 3:20 PM
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Dépression, antidépresseurs et risque de cancer du sein : résultats de la cohorte E3N

Dépression, antidépresseurs et risque de cancer du sein : résultats de la cohorte E3N | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Psychiatry and Clinical Neurosciences, les équipes MOODS et Exposome et Hérédité du Centre de Recherche en Epidémiologie et Santé des Populations – CESP (UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Villejuif) ont étudié les liens entre dépression, traitement antidépresseur et incidence du cancer du sein. La population étudiée incluait 47 791 femmes de la cohorte E3N (Etude Epidémiologique auprès de femmes de la Mutuelle Générale de l'Education Nationale), nées entre 1925 et 1950 et suivies pour l’incidence du cancer du sein de 2005 à 2014.

 

La dépression était définie par un score ≥17 à l’auto-questionnaire Center for Epidemiologic Studies-Depression Scale (CES-D), rempli par les participantes en 2005. L’exposition aux traitements antidépresseurs était évaluée à partir des données de remboursements de médicaments, disponibles depuis 2004. Les associations entre le risque de cancer du sein et la dépression ainsi que la prise d’antidépresseurs (Hazard Ratios [HR] et leurs intervalles de confiance [IC] à 95%) étaient ajustés sur les facteurs de risque de cancer du sein.

 

Durant les 7,2 années de suivi en moyenne, 1365 cancers du sein ont été diagnostiqués. La dépression était associée à une incidence plus élevée de cancer du sein (HR : 1,14, IC 95% : 1,01-1,29) tandis que l’exposition aux traitements antidépresseurs était associée à une moindre incidence (HR : 0,85, IC 95% : 0,74-0,98).

 

Ces résultats suggèrent que dépression et traitement antidépresseur exercent des effets opposés sur l’incidence du cancer du sein. Bien qu’une réplication soit nécessaire, ils constituent un argument supplémentaire pour traiter par antidépresseurs les femmes souffrant d’un trouble dépressif.

 

-> Contact : romain.colle@aphp.fr

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July 1, 3:44 PM
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Évaluation de l'interaction entre les vésicules extracellulaires de Campylobacter jejuni et l’hôte à l'aide d'une plateforme microfluidique avec Caco-2 Spheroides-on-Chip

Évaluation de l'interaction entre les vésicules extracellulaires de Campylobacter jejuni et l’hôte à l'aide d'une plateforme microfluidique avec Caco-2 Spheroides-on-Chip | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les sphéroïdes-sur-puce et les organoïdes-sur-puce sont des systèmes de culture cellulaire en 3D qui reflètent certaines propriétés fonctionnelles des organes ou des tissus. Les sphéroïdes formés par les cellules épithéliales intestinales sont plus simples que les organoïdes, mais offrent néanmoins des caractéristiques physiologiques essentielles pour la recherche, car ils permettent aux cellules d’interagir dans toutes les directions et de former des jonctions serrées.

 

Dans un article récemment publié dans ACS Biomaterials Science & Engineering, des chercheurs de l’institut MICALIS (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec la société EdenTech (Paris), la plateforme MIMA2 et l’Université d’Udine (Italie), ont développé un dispositif microfluidique pour étudier le rôle des vésicules extracellulaires dans la pathogenèse de Campylobacter jejuni. La plateforme a été intégrée à un capteur impédimétrique afin de surveiller les interactions entre les vésicules et les cellules en temps réel.

 

Lorsque les cellules épithéliales sont cultivées dans ce dispositif, elles subissent une morphogenèse spontanée en sphéroïdes. En combinant la spectroscopie d’impédance et l’observation microscopique, la plateforme a permis de suivre la croissance spatiale des cellules et de détecter de manière sensible les interactions des vésicules bactériennes avec les sphéroïdes, mettant en évidence le rôle protecteur de l’organisation cellulaire en 3D. Cette étude a suggéré que les vésicules de Campylobacter diffusaient par voie paracellulaire.

 

Le dispositif microfluidique développé constitue une plateforme prometteuse pour l’étude des interactions hôte-bactérie et pourrait avoir un impact majeur sur la recherche biomédicale liée aux gastro-entérites.

 

-> Contact : jasmina.vidic@inrae.fr

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ERC Work Programme 2026

ERC Work Programme 2026 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La structure générale du formulaire de candidature pour les appels ERC restera la même ; toutefois, les candidats seront invités à structurer leur proposition de projet comme suit : 

  • La première partie de la proposition scientifique (anciennement le synopsis détaillé) doit décrire l'idée générale du projet de recherche proposé, notamment l'état actuel des connaissances et la contribution de la recherche au domaine, les questions scientifiques auxquelles le projet tentera de répondre, les objectifs du projet et l'approche ou la stratégie de recherche globale pour les atteindre. Comme par le passé, cette section sera limitée à cinq pages.
  • La partie II de la proposition scientifique doit décrire en détail la mise en œuvre : la méthodologie de recherche, le plan de travail, l’évaluation des risques et les mesures d’atténuation, la justification du budget et des ressources demandés, ainsi que tout autre élément d’information nécessaire non inclus dans la partie I. La longueur de cette section sera désormais limitée à sept pages pour les demandes de subventions de démarrage, de consolidation et avancées, et à dix pages pour les demandes de subventions Synergie. Cette limite de pages ne s’applique pas à la justification du budget et des ressources demandés. Pour les demandes de subventions Synergie, cette section doit également expliquer les modalités de collaboration permettant au groupe de subventions Synergie de mener à bien le projet.

 

Évaluation

 

La partie I de la proposition scientifique, ainsi que le CV et les antécédents du candidat (c'est-à-dire la partie B1 du formulaire de candidature), seront évalués à l'étape 1, tandis que les deux parties de la proposition scientifique, le CV et les antécédents, ainsi que les ressources et le temps consacrés seront évalués à l'étape 2 de l'évaluation. Les candidats seront avant tout évalués sur l'ambition de leur idée de faire progresser les connaissances actuelles dans le domaine, sur la base de la partie I de la proposition scientifique. Seuls ceux ayant présenté une proposition convaincante à l'étape 1 passeront à l'étape suivante de l'évaluation, au cours de laquelle la méthodologie et la mise en œuvre (y compris la faisabilité) de la recherche proposée ainsi que l'allocation des ressources seront évaluées conjointement avec les informations déjà examinées à l'étape 1. 

 

La faisabilité ne sera plus évaluée à l'étape 1 ; ainsi, la partie I de la proposition scientifique ne devra plus détailler la faisabilité de l'approche scientifique, mais présenter une stratégie de recherche globale convaincante. Tous les aspects relatifs à la faisabilité devront être abordés dans la partie II de la proposition scientifique. 

 

Financement supplémentaire

 

Comme  annoncé récemment , les chercheurs actuellement basés hors d'Europe (veuillez consulter ici(pour obtenir la liste actualisée des pays associés à Horizon Europe) et sollicitant une subvention de démarrage, de consolidation ou avancée, pourront solliciter jusqu'à 2 millions d'euros de financement supplémentaire pour faciliter la relocalisation de leur laboratoire ou de leur équipe vers l'Union européenne ou un pays associé au volet ERC du programme Horizon Europe. Les candidats déjà basés dans un État membre de l'UE ou un pays associé resteront éligibles à un financement supplémentaire pouvant atteindre 1 million d'euros. Le montant maximal de financement supplémentaire pouvant être sollicité par les candidats à une subvention Synergy reste inchangé (jusqu'à 4 millions d'euros). 

 

À compter de 2026, le financement supplémentaire pourra également être utilisé pour les frais de personnel et, comme auparavant, les candidats sont invités à définir et justifier le besoin de financement supplémentaire dans leur proposition. La décision d'attribution du financement demandé appartient au comité d'évaluation.

 

Nouvel instrument de financement

 

Le Conseil scientifique du CER travaille actuellement sur un nouvel instrument visant à offrir aux chercheurs ambitieux un financement substantiel sur une période pouvant aller jusqu'à sept ans, dans le cadre de l'  initiative « Choose Europe for Science » . De plus amples détails sur les modalités suivront prochainement. Ce nouvel instrument de financement sera intégré dans une version modifiée du programme de travail 2026 du CER, qui devrait être adoptée d'ici fin 2025.

 

Admissibilité des candidats aux subventions de démarrage et de consolidation

 

Les candidats victimes de violences sexistes ou de toute autre forme de violence pourront obtenir une prolongation de la période suivant leur doctorat, leur permettant ainsi de postuler aux bourses de démarrage et de consolidation. De plus, une référence explicite au congé parental sera ajoutée aux motifs de prolongation de la période d'éligibilité, aux côtés des congés de maternité et de paternité. 

 

Restrictions de resoumissions

 

 Une restriction de soumission s'appliquera aux candidats à la subvention Synergy ayant obtenu la note « B » à l'étape 1 de l'appel à propositions Synergy Grant 2025. Ces candidats ne sont pas admissibles à l'appel à propositions Synergy Grant 2026. 

 

Les candidats déjà titulaires d'une subvention ERC en cours et souhaitant déposer une nouvelle demande en 2026 doivent s'assurer que leur projet actuel se termine dans les deux ans suivant la date limite de l'appel à projets 2026. Dans des cas exceptionnels, les prolongations accordées au projet en cours après la date limite de l'appel à projets n'affecteront pas l'éligibilité de la nouvelle demande.

 

Programme de travail du CER 2027

 

Compte tenu de la diversité des parcours universitaires actuels, le Conseil scientifique a décidé d'élargir la période d'éligibilité à ses programmes de bourses de démarrage et de consolidation. À partir de 2027, les chercheurs pourront déposer une demande de bourse de démarrage immédiatement après la soutenance de leur thèse, et à tout moment au cours des dix années suivantes. Les candidats à une bourse de consolidation pourront déposer une demande entre cinq et quinze ans après la soutenance de leur thèse. Toutes les politiques actuelles de prolongation des périodes d'éligibilité resteront en vigueur. Toutefois, les chercheurs ne pourront bénéficier que d'une seule bourse de démarrage et d'une seule bourse de consolidation au cours de leur carrière.

 

En savoir plus

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Appel à projets : Innovation organisationnelle et recherche action au service de la santé des femmes | Agence régionale de santé Ile-de-France

Appel à projets : Innovation organisationnelle et recherche action au service de la santé des femmes | Agence régionale de santé Ile-de-France | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Date butoir : 17 septembre 2025

 

L’appel à projets est doté d’une enveloppe de 200 000 € qui sera répartie entre les 2 à 3 projets retenus.

 

L’objectif de cet appel à projets est de soutenir les innovations organisationnelles et/ou les démarches de recherche action en lien avec les structures de santé qui contribuent à améliorer l’accès à la santé des femmes, ainsi qu’à favoriser le développement des connaissances sur la santé des femmes.

 

Cet appel à projets vise à soutenir des expérimentations concrètes, ancrées dans les territoires et s’appuyant sur des coopérations entre professionnels de terrain, chercheurs, acteurs institutionnels, acteurs associatifs et usagères.

 

Les thématiques gynécologie et périnatalité, qui font l’objet d’actions spécifiques, sont exclues du présent appel à projets.

 

Cet appel à projets n’est pas ciblé sur les innovations numériques, qui font l’objet d’un appel à projets spécifique. Des solutions numériques peuvent être intégrées à la proposition d’organisation, mais le financement de l’appel à projet ne couvrira pas cette dépense

 

Pour être éligibles au présent appel, nos projets doivent respecter les conditions suivantes.

 

Priorités thématiques

 

Afin d’impulser les innovations en santé dans le cadre de cet appel à projets, la priorité est donnée aux projets permettant d’améliorer l’accès à la santé ainsi qu’à favoriser le développement des connaissances sur la santé des femmes, et notamment :

  • De favoriser les partenariats entre des secteurs cloisonnés autour des enjeux d’inclusivité en santé pour améliorer la connaissance par les professionnels de santé (actuels et en devenir) des pathologies touchant fortement les femmes et des symptomatologies spécifiques aux femmes, puis pour les sensibiliser/former à la réalisation de prises en charge plus inclusives et intersectorielles, notamment pour les femmes les plus vulnérables.
  • De réduire l’impact des expositions sociales, professionnelles et environnementales qui pèsent plus particulièrement sur les femmes (rythmes de travail, transports, rythmes de vie, situation d’aidant, monoparentalité etc.) ;
  • De renforcer l’accès des patients à un parcours de santé (autour de la prévention et du soin) toujours mieux construit sur le territoire 
  • De pallier une difficulté d’accès aux soins dans un territoire, notamment les territoires prioritaires définis dans le cadre du zonage des médecins ou en grande couronne
  • De permettre aux professionnels de santé de mettre en place de nouvelles organisations, coopérations interprofessionnelles ou pratiques innovantes 
  • De favoriser les formations
  • De renforcer les compétences et connaissances sur l’ouverture de la focale vers la santé des femmes pour un meilleur accès la santé ;
  • De mieux impliquer les patientes / usagers / aidants dans les parcours de soins (expérience patient).

 

Objectifs et enjeux

 

Cet appel à projet vise à sélectionner des porteurs de projets répondant aux enjeux d’amélioration de la connaissance sur la santé des femmes et de l’accès des femmes à la santé.

  • Renforcer les compétences et connaissances sur la santé des femmes (ex : pathologies cardiovasculaires, santé mentale, santé au travail, addictions …) pour un meilleur accès à la santé (prévention, dépistage, accès au premier recours, accès aux urgences, prise en charge, suivi au long terme, renforcement de l’autonomie…). Les projets pourront contenir un aspect recherche action.
  • Améliorer l’accès à la santé et la santé des femmes dont la santé est susceptible de se dégrader en raison de difficultés spécifiques (ex : aidantes, monoparentalité, travail en horaires décalés, victimes de violence, vulnérabilités spécifiques…)

 

Les projets innovants au service de la santé des femmes pourront être abordés par une approche par les déterminants biologiques et/ou par une approche par les facteurs socio-culturels et économiques.

 

Le projet doit avoir pour objectif :

  • De tester en conditions réelles une solution organisationnelle innovante et ou une recherche action,
  • De co-construire et/ou d’adapter la solution organisationnelle expérimentée en tenant compte des remontées de terrain,
  • De mesurer l’impact d’organisations innovantes, en particulier sa capacité à répondre au besoin et/ou à la problématique ciblée, les freins et leviers à son déploiement,
  • De partager en toute transparence les travaux réalisés, les résultats obtenus et les difficultés rencontrées à des fins de capitalisation et de généralisation des pratiques
  • De co-produire des connaissances en utilisant des méthodes d’intelligence collective

 

Le projet devra être porté par :

  • Une ou plusieurs structure(s) expérimentatrice(s) francilienne(s) appartenant aux secteurs suivants (santé et coordination de la santé) :
  • Établissements de santé ;
  • Établissements et/ou services médico-sociaux ;
  • Structures juridiques porteuses d’une Structure d’Exercice Collectif (Maison de Santé Pluri-professionnelle ou Centre De Santé) ou d’un cabinet de groupe ;
  • Associations (par exemple CPTS) portant un projet de santé territorialisé ;
  • Dispositifs d’Appui à la Coordination (DAC)

 

Pouvant s’associer de manière facultative à d’autres partenaires :

  • Associations de patients
  • Collectivités territoriales
  • Education
  • Monde du travail
  • Universités, laboratoires de recherche

 

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Les Lundis de l'IPSIT - Lundi 15 septembre 2025 : « Canaux Ioniques »

Les Lundis de l'IPSIT - Lundi 15 septembre 2025 : « Canaux Ioniques » | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Intervenants :

  • Dr Olivier Mignen (UMR 1227, "Lymphocytes B, Autoimmunité et Immunothérapies", Brest)
  • Dr Alexandre Hinzpeter (Institut Necker Enfants Malades (INEM), Equipe "Protéinopathies dans les maladies épithéliales respiratoires", Paris)
  •  N... : à venir

 

Programme détaillé à venir.

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RAPPEL ! École d'Automne 2025 de l'OI HEALTHI - Innovation Thérapeutique - du 07 au 09 octobre 2025

RAPPEL ! École d'Automne 2025 de l'OI HEALTHI - Innovation Thérapeutique - du 07 au 09 octobre 2025 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L'Objet Interdisciplinaire Health and Therapeutic Innovation (HEALTHI) de l'Université Paris-Saclay organise sa 5ème École d'Été-Automne "Innovation Thérapeutique" du 07 au 09 octobre 2025 au Domaine de Saint Paul à Saint-Remy-Lès-Chevreuse en Île-de-France.

 

Pendant deux jours et demi des sujets variés seront proposés autour de l'innovation thérapeutique et du médicament avec des intervenants du domaine aussi bien académique qu'industriel. Le programme sera communiqué prochainement.

 

L’École d’été de HEALTHI est ouverte aux doctorants, post-doctorants, chercheurs et enseignants-chercheurs dans la limite des places disponibles. 

 

Les participants peuvent être du monde académique ou privé. 

 

La participation à l’École d’Automne pourra être validée comme module d’enseignement pour les Doctorants.

 

Les frais d’hébergement et de restauration sont fixés à 50 euros pour les doctorants, 100 euros pour les Enseignants-Chercheurs et Chercheurs Académiques et 300 euros pour le secteur privé.

 

Dates clé :

  • Avant le 23 juillet 2025 : Envoi du dossier de candidatures (CV et lettre de motivation) à l'adresse :  healthi@universite-paris-saclay.fr
  • Le 25 juillet 2025: Renvoi à chaque candidat de l'information relative à l'acceptation ou pas de sa candidature.
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Comment utiliser les ressources génétiques cryoconservées pour les populations animales en sélection et en conservation ?

Comment utiliser les ressources génétiques cryoconservées pour les populations animales en sélection et en conservation ? | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Journal of Animal Breeding and Genetics, des chercheurs du laboratoire Génétique Animale et Biologie Intégrative – GABI (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), et d’Eliance se sont intéressés à l’utilisation des ressources cryoconservées afin de maintenir la diversité génétique des populations animales.

 

La diversité génétique est essentielle pour la durabilité des systèmes d’élevage, notamment dans un contexte de transition agroécologique afin de maintenir leurs capacités adaptatives. Les banques de gènes ont pour mission de cryoconserver du matériel reproductif avec pour principal objectif de reconstituer une population disparue. Cependant, ces ressources pourraient aussi être mobilisées pour éviter la disparition de ces populations. Cette question a été abordée en utilisant des simulations mimant des situations variées, populations en conservation ou en sélection, afin de proposer des recommandations d'utilisation adaptées à chaque cas.

 

Pour les populations en conservation, une réintroduction régulière de semences cryoconservées à chaque génération est une stratégie pertinente pour maintenir la diversité génétique. En revanche, pour les populations en sélection, une utilisation ciblée et ponctuelle de ces ressources génétiques est suffisante pour accroître la variabilité génétique additive, essentielle à la réponse à la sélection. De plus, les ressources cryoconservées constituent un levier important pour répondre aux changements d’objectifs ou d'environnement, en offrant une meilleure réponse à la sélection.

 

Ainsi, cette étude montre que les ressources génétiques cryoconservées ne sont pas uniquement un outil de conservation passif, mais présentent également un potentiel pour la gestion des populations animales « sur pieds ».

 

-> Contact : alicia.jacques@eliance.fr

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Today, 4:11 PM
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L'histoire des chromosomes : un héritage complexe de nos ancêtres archées

L'histoire des chromosomes : un héritage complexe de nos ancêtres archées | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Cell Reports, une équipe internationale de scientifiques, incluant des chercheurs du Laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette), a retracé l'histoire évolutive des complexes protéiques qui organisent nos chromosomes. Ces machines moléculaires, appelées complexes SMC, sont essentielles à la stabilité et à la ségrégation de l'ADN dans tous les domaines du vivant.

 

L'étude révèle que le dernier ancêtre commun de tous les eucaryotes (ou LECA) possédait déjà les quatre types de complexes SMC que l'on retrouve aujourd'hui, suggérant une sophistication cellulaire bien plus ancienne qu'on ne le pensait. Au cours de l'évolution, l'un de ces complexes, la condensine II, a été perdu plus de 30 fois de manière indépendante, ce qui en fait l'une des machines moléculaires "clés" les plus fréquemment perdues chez les eucaryotes.

 

De manière remarquable, les chercheurs démontrent que l'origine de cette machinerie remonte à une duplication génétique survenue chez un ancien ancêtre archéen des eucaryotes. Cette découverte implique qu'une organisation chromosomique complexe prédatait l'émergence des cellules eucaryotes. Ces travaux éclairent d'un jour nouveau les mécanismes qui ont permis l'établissement de la complexité génomique et cellulaire qui caractérise les eucaryotes modernes.

 

-> Contact : laura.eme@universite-paris-saclay.fr

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Today, 3:57 PM
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Les télomères bloquent l’extrusion de boucle d’ADN par la condensine

Les télomères bloquent l’extrusion de boucle d’ADN par la condensine | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Cell Reports, des chercheurs de l’UMR Stabilité Génétique, Cellules souches et Radiations - SGCSR/iRCM (UMR 1274 UParis/UPSaclay/INSERM/CEA-Jacob, Fontenay-aux-Roses) et de l’université technologique de Delft (Pays-Bas) révèlent que les télomères peuvent stopper l’extrusion de boucle d’ADN par le complexe SMC condensine.

 

Grâce à des approches in vitro et in vivo, les auteurs montrent que les séquences télomériques liées par des protéines bloquent l’extrusion : l’efficacité du blocage dépend de la longueur et de la densité de la couverture protéique. Dans les cellules en anaphase, ce blocage de la progression de la condensine entraîne une décompaction locale de la chromatine, ce qui facilite la résolution des chromosomes dicentriques issus de fusions entre télomères.

 

Ces résultats suggèrent que les protéines fixées sur l’ADN jouent un rôle actif dans la régulation de l’organisation chromosomique, avec des implications pour la biologie des télomères, la transcription, la réparation de l’ADN et la stabilité génomique.

 

-> Contact : stephane.marcand@cea.fr

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Maladie de Sjögren : examen des besoins non satisfaits, des mesures des résultats, des progrès thérapeutiques et de l'impact sur l'économie de la santé

Maladie de Sjögren : examen des besoins non satisfaits, des mesures des résultats, des progrès thérapeutiques et de l'impact sur l'économie de la santé | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une revue publiée dans Annals of Rheumatic Diseases, la revue numéro 1 de rhumatologie, l’équipe du consortium européen Necessity coordonnée par le Pr Xavier Mariette (UMR 1184 /IMVA-HB, Inserm/CEA/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre) présente une revue détaillée de tous les besoins non couverts concernant de la maladie de Sjögren.

 

La maladie de Sjögren est un modèle de maladie auto-immune systémique dont la prévalence est d’environ 1/1000, pouvant être isolée ou associée à d’autres maladies auto-immunes et exposant à un surrisque de lymphome multiplié par 10 à 20.

 

Le consortium européen Necessity a pour ambition de créer un nouveau score composite d’évaluation de la maladie appelé STAR (Figure), de le valider dans un essai clinique et enfin de trouver de nouveaux biomarqueurs diagnostiques et théranostiques.

 

Les recherches physiopathologiques actuelles, dont beaucoup développées dans l’équipe des maladies auto-immunes du Pr Xavier Mariette se focalisent sur le rôle des cellules épithéliales comme inductrices de la maladie, la réalisation d’organoïdes des glandes salivaires, l’origine de la signature Interféron et l’évaluation de nouvelles thérapeutiques ciblant essentiellement l’activation trop importante des lymphocytes B.

 

-> Contact : xavier.mariette@aphp.fr

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July 8, 5:50 PM
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Portrait Jeune Chercheuse – Evolène Deslignière, Chercheuse en chimie analytique pour la protéomique structurale

Portrait Jeune Chercheuse – Evolène Deslignière, Chercheuse en chimie analytique pour la protéomique structurale | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Evolène Deslignière est chargée de recherche au CNRS depuis janvier 2025. Elle a intégré l’équipe de spectrométrie de masse au sein du département Chimie et Biologie Structurales et Analytiques de l’Institut de Chimie des Substances Naturelles - ICSN (CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette). Ses recherches portent sur le développement de méthodes en spectrométrie de masse pour la caractérisation de complexes protéiques et acides nucléiques.

 

Après l’obtention de son diplôme d’ingénieur de l’École européenne de chimie, polymères et matériaux (ECPM) en 2018, Evolène effectue sa thèse de doctorat en chimie analytique à l’Université de Strasbourg. Sous la direction du Dr. Sarah Cianférani, elle développe de nouvelles approches en spectrométrie de masse native et mobilité ionique, notamment pour l’étude de protéines à visée thérapeutique comme les anticorps monoclonaux. Ses travaux, réalisés en collaboration avec des entreprises biopharmaceutiques, permettent d’assurer une meilleure fiabilité des traitements administrés aux patients.

 

En 2022, elle rejoint l’équipe du Pr. Albert Heck à l’Université d’Utrecht, aux Pays-Bas. Durant son post-doctorat, elle s’intéresse à des produits thérapeutiques beaucoup plus larges et hétérogènes que des anticorps. Ces produits ne peuvent pas être étudiés avec une analyse traditionnelle de spectrométrie de masse native, c’est pourquoi Evolène a travaillé sur d’autres techniques dites à particules uniques, comme la spectrométrie de masse à détection de charge ou la photométrie de masse. Grâce à ces développements, il a été possible de caractériser de façon plus fine des complexes protéiques et acides nucléiques extrêmement hétérogènes, tels que l’ARN messager et les virus adéno-associés, qui sont de plus en plus présents dans le paysage pharmaceutique.

 

À l'interface de la chimie biologique et analytique, les développements méthodologiques d’Evolène peuvent s’appliquer non seulement au domaine biopharmaceutique, mais également à la biologie structurale. C’est en ce sens qu’elle souhaite poursuivre ses travaux à l’ICSN, afin de permettre une meilleure caractérisation structurale de complexes multiprotéiques, en combinaison avec d’autres approches analytiques de biologie structurale.

 

“All that glitters may not be gold, but at least it contains free electrons.” – John Desmond Bernal

 

-> Contact : evolene.desligniere@cnrs.fr

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July 1, 12:24 PM
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L’hypertension pulmonaire artérielle, une complication rare mais sévère de la maladie de Still

L’hypertension pulmonaire artérielle, une complication rare mais sévère de la maladie de Still | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Annals of the Rheumatic Diseases, des médecins des réseaux PulmoTension (dédié à l’hypertension pulmonaire, AP-HP/UPSaclay, Service de Pneumologie, Le Kremlin-Bicêtre) et CRI-IMIDIATE (dédié aux maladies inflammatoires systémiques et ostéoarticulaires) ont décrit la plus large cohorte adulte d’hypertension pulmonaire artérielle (HTAP) associée à la maladie de Still. Cette complication rare mais grave s’est développée chez 16 patientes, dont 72% étaient porteuses de l’allèle HLA-DRB1*15. Ces patientes présentaient une forme particulièrement active de la maladie de Still, tant au moment du diagnostic de l’HTAP qu’au cours du suivi. Comparées à une cohorte témoin de 111 patients atteints de maladie de Still sans HTAP, elles présentaient plus fréquemment un syndrome d’activation macrophagique (62%) et une hyperéosinophilie (68%). La mortalité était significativement plus élevée dans le groupe HTAP (37,5% contre 0,9%, p<0,001), tous les décès étant liés à une poussée de la maladie.

 

L’étude montre que, dans la maladie de Still, l’HTAP peut survenir indépendamment d’une atteinte interstitielle pulmonaire, souvent sur un fond d’hyperinflammation. Les auteurs insistent sur l’intérêt d’un dépistage échocardiographique en cas de dyspnée inexpliquée, notamment chez les patientes à haut risque (femmes, HLA-DRB1*15+, SAM récurrents, hyperéosinophilie). Le traitement associant biothérapies (IL-1/IL-6) et immunosuppresseurs ciblant les lymphocytes T semble améliorer les paramètres hémodynamiques.

 

Ces résultats renforcent le lien entre HLA-DRB1*15 et les formes sévères de la maladie de Still, et suggèrent que cet allèle pourrait constituer un biomarqueur de risque utile à intégrer dans la stratégie de suivi et de dépistage précoce.

 

-> Contact : athenais.boucly@aphp.fr

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July 1, 3:01 PM
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Des filaments d'ADN extracellulaire associés au polysaccharide de surface II confèrent à la matrice du biofilm de Clostridioides difficile une structure en réseau

Des filaments d'ADN extracellulaire associés au polysaccharide de surface II confèrent à la matrice du biofilm de Clostridioides difficile une structure en réseau | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Clostridioides difficile est une bactérie responsable d’infections intestinales, souvent récidivantes (15 à 25% des cas), en raison de sa persistance sous forme de spores ou de biofilm. Bien que la présence de biofilms in vivo reste à démontrer, plusieurs indices soutiennent cette hypothèse.

 

Dans une étude publiée dans npj Biofilms and Microbiomes, des chercheurs de l’équipe BaPS (Institut MICALIS INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Orsay), de la plateforme MIPSIT (INSERM/UPSaclay, Orsay) et du Laboratoire Matériaux et Santé (UPSaclay, Orsay) ont caractérisé la structure et la composition des biofilms formés in vitro par quatre souches de C. difficile : une souche clinique (R20291), une souche de laboratoire (630∆erm) et deux mutants altérés dans la motilité (∆fliC) ou la couche S (∆cwp84).

 

Les résultats révèlent une matrice exopolymérique dominée par les polysaccharides. D’autres composants, comme des protéines et de l’ADN extracellulaire (ADNe), sont présents en plus faible quantité. L’imagerie par microscopie confocale met en évidence une organisation tridimensionnelle : bactéries vivantes en surface, mortes à la base, incluses dans une matrice dense. Une découverte majeure est la visualisation de filaments d’ADNe formant un réseau en toile d’araignée, assurant la cohésion du biofilm. La DNAse I détruit ce réseau et disperse les biofilms.

 

Ce maillage s’associe à des composants de surface, tels que le polysaccharide II et la lipoprotéine CD1687, suggérant un rôle dans la stabilité du biofilm. Le mode de libération de ces constituants reste inconnu. Des structures proches de vésicules extracellulaires ont été observées et ces données ouvrent de nouvelles perspectives sur la caractérisation des biofilms de C. difficile.

 

-> Contact : sylvie.bouttier@universite-paris-saclay.fr

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July 1, 3:34 PM
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Épuisement des lymphocytes T spécifiques du polyomavirus BK chez les transplantés rénaux : Le blocage des récepteurs inhibiteurs améliore leur fonctionnalité

Épuisement des lymphocytes T spécifiques du polyomavirus BK chez les transplantés rénaux : Le blocage des récepteurs inhibiteurs améliore leur fonctionnalité | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La néphropathie associée au polyomavirus BK (BKPyV) représente une complication majeure et fréquente de la transplantation rénale, caractérisée par une réplication virale plasmatique élevée et une diminution de la survie du greffon. À ce jour, il n’existe pas de traitement spécifique disponible et la principale approche thérapeutique consiste en une réduction de l’immunosuppression afin de rétablir une réponse immunitaire efficace.

 

Dans une étude publiée dans Transplantation, les chercheurs de l’UMR-S 1186 (Inserm/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif) ont étudié les fonctions lymphocytaires T de 28 transplantés rénaux présentant une ADNémie détectable de BKPyV. Après une réduction significative du traitement immunosuppresseur, deux groupes de malades ont pu être identifiés. Un premier groupe, le groupe Contrôleur (C), chez qui une rapide clairance du virus a pu être observée (n=13) et un second groupe, groupe Non Contrôleur (NC) qui a  présenté une réplication virale persistante, traduisant une réponse immune insuffisante. Les traitements immunosuppresseurs d’induction et d’entretien étaient comparables entre les deux groupes. Une altération de la fonction rénale a été plus importante dans le groupe NC (p<0,055) et dans les 2 groupes la moitié des malades a développé un rejet cellulaire.

 

Sur le plan immunologique, les réponses des lymphocytes T spécifiques du BKPyV, en termes de prolifération et de production de cytokines, étaient significativement altérées dans le groupe NC. Cette altération fonctionnelle s’accompagnait d’une surexpression de plusieurs récepteurs inhibiteurs (PD1, TIGIT, TIM3), témoignant d’un phénotype épuisé des lymphocytes T CD4+ et CD8+ spécifiques du BKPyV. Le blocage d’un seul de ces récepteurs n’a pas permis de restaurer les fonctions effectrices ; en revanche, l’inhibition combinée des voies PD1 et TIM3 ex vivo a permis une restauration significative des fonctions des lymphocytes T CD8+ (p < 0,05).

 

Ces résultats montrent qu’une ADNémie à BKPyV persistante , malgré une réduction de l’immunosuppression, est associée à un épuisement fonctionnel des lymphocytes T spécifiques du virus. La restauration ex vivo de ces fonctions par un double blocage immunitaire (PD-1 et TIM3) ouvre la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques ciblées pour améliorer le contrôle du BKPyV après transplantation rénale.

 

-> Contact : antoine.durrbach@inserm.fr

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