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FOCUS PLATEFORME : Plateforme EvryRNA, une panoplie d’outils pour accélérer les découvertes sur les ARN non-codants !

FOCUS PLATEFORME : Plateforme EvryRNA, une panoplie d’outils pour accélérer les découvertes sur les ARN non-codants ! | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

EvryRNA est une plateforme logicielle génopolitaine qui met à disposition de la communauté scientifique des outils pour l’analyse des acides ribonucléiques (ARN) non-codants. Ces molécules ont révélé ces dernières décennies leur rôle majeur dans les mécanismes biologiques et dans diverses maladies dont les cancers. La plateforme EvryRNA, dirigée par le Pr Fariza Tahi, est hébergée au sein du laboratoire IBISC (Informatique, Bio-informatique et Systèmes Complexes - Université d’Évry Paris-Saclay). Elle fait partie des 24 plateformes et plateaux techniques mutualisés sur le biocluster Genopole.

 

L’équipe Bioinformatique des ARN dirigée par Fariza Tahi développe des algorithmes et des méthodes computationnelles dédiés à l’analyse des ARN. Il s’agit là d’identifier les ARN dans les séquences génomiques, de déterminer leur caractère codant ou non-codant, ou encore de prédire leurs conformations dans l’espace, déterminantes pour leur fonction. Les ARN ont en effet la propriété de se replier grâce aux liaisons des acides ribonucléiques qui les constituent.

 

Les ARN non-codants ouvrent un large champ scientifique. Les deux dernières décennies ont été le théâtre de la découverte d’une multitude d’ARN non-codants, issus des régions de notre génome qui ne codent pas de protéines et que l’on a longtemps pensé inutiles. Les biologistes connaissaient bien la fonction des ARN ribosomiques et des ARN de transfert pour traduire le message des gènes en protéines. Mais récemment, ils ont révélé le rôle biologique essentiel de nombreux autres ARN (micro-ARN, petits ARN interférents, longs ARN non-codants...). Ces ARN non-codants agissent comme des régulateurs de l’expression des gènes, donc comme des acteurs du développement des organismes, de l’adaptation aux changements environnementaux, etc. Ils interviennent dans les processus biologiques, mais aussi dans les maladies, notamment les cancers et les maladies neuro-dégénératives. Mieux connaître les ARN non-codants pourra notamment contribuer à mieux comprendre ces pathologies, mais aussi à envisager de nouvelles approches thérapeutiques.

 

Plateforme EvryRNA : Une vingtaine d’outils interactifs librement accessibles. Pour s’inscrire dans cette dynamique scientifique et répondre aux besoins des biologistes, le laboratoire IBISC a conçu une panoplie d’outils bio-informatiques librement accessibles sur la plateforme EvryRNA. Ils reposent pour les plus récents sur des technologies et approches algorithmiques comme l’optimisation multi-objectif, les cartes auto-organisatrices (SOM pour Self Organizing Map), les réseaux de neurones profonds, etc.

 

En plus de la performance, les chercheurs d’IBISC ont cherché à rendre l’utilisation de ces logiciels aisée et interactive. La plupart présentent ainsi de nombreux atouts : i) Une interface web intuitive ; ii) Une représentation graphique des résultats facilement interprétable ; iii) La possibilité pour le biologiste utilisateur d’agir sur les paramètres puis réexécuter le modèle pour améliorer sa performance ; iv) La possibilité d’inclure les jeux de données ou les connaissances du biologiste dans le modèle.

 

Une plateforme labellisée et soutenue par Genopole. Genopole soutient l’activité de la plateforme EvryRNA, profitable notamment à son axe stratégique des thérapies innovantes. Genopole a financé la mise à niveau de l’infrastructure informatique, notamment un serveur de calcul et des baies de stockages, à hauteur de 60 K€.

 

Contacts : Fariza.Tahi@univ-evry.fr / Julien.Picot@genopole.fr

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

 

Aussi, le 13 mai 2019 (déjà !), EvryRNA publiait son premier FOCUS PLATEFORME. Le relire ?

 

GENOPOLE / Plate-forme logicielle de bioinformatique EvryRNA. La plateforme EvryRNA est une plateforme logicielle mettant à disposition de la communauté scientifique différents logiciels dédiés aux ARN non-codants pour la prédiction de leurs structures 2D et 3D, la prédiction des structures de complexes d'ARN, la prédiction et la classification d'ARN non-codants, l'identification et la prédiction à grande échelle dans des séquences génomiques d'ARN non-codants, notamment les petits ARN : microARN, piARN, etc. Tous les logiciels disponibles sur la plateforme EvryRNA ont fait l'objet de publications scientifiques à comité de lecture.

 

A propos de Genopole : Biocluster français dédié à la recherche en génomique et aux biotechnologies appliquées à la santé et à la bioéconomie, Genopole réunit 65 entreprises, 17 laboratoires de recherche académiques, 24 plateformes technologiques et plateaux techniques mutualisés, ainsi que des formations universitaires (Université d’Évry Paris-Saclay). Son objectif : favoriser l’émergence et la croissance de sociétés de biotechnologie, le transfert d’innovations vers le secteur industriel, le développement de la recherche et l’enseignement supérieur en sciences de la vie. Dirigé par Gilles Trystram, Genopole est un Groupement d’intérêt public principalement soutenu par l’État, la Région Ile-de-France, le Département de l’Essonne, l’agglomération Grand Paris Sud, la Ville d’Évry-Courcouronnes et l’AFM-Téléthon.

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November 7, 11:35 AM
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FOCUS PLATEFORME : La biobanque du CECS I-Stem, une ressource clé au sein de StemCARE pour la recherche de nouvelles approches thérapeutiques

FOCUS PLATEFORME : La biobanque du CECS I-Stem, une ressource clé au sein de StemCARE pour la recherche de nouvelles approches thérapeutiques | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Située au cœur du biocluster Genopole, la biobanque du Centre d'Étude des Cellules Souches (CECS) I-Stem est une plateforme essentielle pour la recherche basée sur l’utilisation des cellules souches humaines. Spécialisée dans la cryoconservation et la distribution de lignées cellulaires humaines, elle offre aux chercheurs un accès privilégié à une collection unique de cellules souches pluripotentes induites (CSPi) et de cellules souches embryonnaires humaines (CSEh), ainsi qu'à leurs dérivés. En intégrant StemCARE, une plateforme technologique labellisée IBISA, la Biobanque du CECS I-Stem bénéficie d'un cadre structurant favorisant l'innovation scientifique et le développement de nouvelles thérapies.

 

La biobanque du CECS I-Stem met à disposition des ressources cellulaires de haute qualité pour les équipes académiques et industrielles du secteur des biotechnologies. Alexandra Benchoua, Directrice de recherche au CECS I-Stem, souligne : « Notre objectif est d'offrir aux chercheurs et industriels un accès à des lignées cellulaires répondant aux normes les plus exigeantes. Cette ressource unique contribue activement aux avancées en médecine personnalisée et de précision. »

 

Les missions principales de la biobanque incluent : i) la collecte et conservation des échantillons : stockage sécurisé et conforme aux réglementations en vigueur ; ii) la préparation et distribution des lignées cellulaires : gestion rigoureuse assurant une traçabilité optimale ; iii) la garantie de qualité et conformité : procédures validées par le service Assurance Qualité d'I-Stem ; et iv) Une accessibilité et offre de collaboration : ouverture aux chercheurs scientifiques et industriels pour encourager les avancées scientifiques.

 

Un levier pour le développement de nouvelles thérapies. Grâce à ses collections cellulaires et à son expertise en culture et conservation de cellules souches, la biobanque facilite le développement de nouvelles approches dans plusieurs domaines. Elle contribue à la modélisation des pathologies pour mieux comprendre les mécanismes des maladies génétiques. Elle joue un rôle clé dans le criblage pharmacologique afin d'identifier de nouvelles molécules thérapeutiques. Enfin, elle participe à l'optimisation des protocoles de transplantation cellulaire dans le cadre de la thérapie cellulaire.

 

Un pilier central de StemCARE. En tant que composante essentielle de StemCARE, la biobanque joue un rôle clé dans l'écosystème. Sa capacité à fournir des ressources cellulaires de haute qualité, combinées à l'expertise scientifique d'I-Stem et au soutien technologique de StemCARE, permet d'accélérer la mise au point de nouvelles stratégies thérapeutiques. La biobanque est ouverte aux collaborations nationales et internationales pour les projets de recherche, de développement thérapeutique et d’innovation biomédicale.

 

-> Contact : Julien Picot (julien.picot@genopole.fr)

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

 

A propos de Genopole / I-Stem / Plateforme Biobanque : Les cellules souches sont des ressources incontournables pour la recherche et développement. La Biobanque de cellules du CECS/I-Stem permet de conserver et de mettre à disposition des équipes de recherche le matériel biologique indispensable pour l’étude des maladies génétiques et le développement de thérapies cellulaires. La Biobanque du CECS / I-Stem conserve une large collection de lignées cellulaires humaines, notamment des lignées de cellules souches embryonnaires (CSEh), des lignées de cellules induites à la pluripotence (CSPi) ainsi que leurs dérivés. L’ensemble des lignées est en conservation miroir sur deux sites pour plus de sécurité. Après réception des échantillons initiaux fournis par les équipes d’I-Stem, des collaborateurs externes ou des partenaires industriels, les cellules sont cultivées et qualifiées en collaboration avec la Plateforme de Biologie cellulaire et la Plateforme de Bioproduction. Du fait de son organisation et de la gestion mise en place, la Plateforme Biobanque permet aux équipes de recherche de disposer à tout moment de nombreux modèles cellulaires de maladies génétiques ainsi que de cellules saines « contrôles » de haute qualité.

 

A propos de Genopole. Premier biocluster français dédié à la recherche en génomique et aux biotechnologies appliquées à la santé et à la bioéconomie, Genopole réunit 78 entreprises, 19 laboratoires de recherche, 23 infrastructures, plateformes et plateaux techniques mutualisés, ainsi que des formations universitaires (université d’Évry, Paris-Saclay). Son objectif : favoriser l’émergence et la croissance de sociétés de biotechnologie, le transfert d’innovations vers le secteur industriel, le développement de la recherche et l’enseignement supérieur en sciences de la vie. Genopole est un Groupement d’intérêt public principalement soutenu par l’État, la Région Ile-de-France, le Département de l’Essonne, l’agglomération Grand Paris Sud, la Ville d’Évry-Courcouronnes et l’AFM-Téléthon.

 

Pour obtenir plus de renseignements sur les plateformes technologiques labellisées par Genopole, ainsi que sur les équipements mutualisés accessibles à la communauté scientifique francilienne, contactez Julien Picot (julien.picot@genopole.fr).

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Today, 6:01 AM
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Veille, sommeil et dynamique des réseaux de neurones

Veille, sommeil et dynamique des réseaux de neurones | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Bien que l'on sache que les circuits corticaux et les ganglions de la base sont nécessaires à l'apprentissage chez les mammifères et les oiseaux, on en sait peu sur les patterns d'activation neuronale spontanée au sein de ces circuits, ni sur la manière dont ils sont modulés par l'état de vigilance (veille vs sommeil).

 

Dans un article publié dans Journal of Neuroscience, des chercheu·r·ses de NeuroPSI (CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), en collaboration avec plusieurs laboratoires européens (Munich, Zürich, Bordeaux), ont réalisé chez des oiseaux chanteurs (diamants mandarins) des enregistrements électrophysiologiques au sein du réseau cortico-ganglions de la base, jouant un rôle critique pour l’apprentissage du chant, pendant les périodes de sommeil et d'éveil afin de décrire les dynamiques neurales dans ces deux états comportementaux. Dans l’aire corticale, ont été observés des événements de décharge neuronale qui rappellent fortement certaines activations décrites dans l'hippocampe des mammifères et associées à la consolidation de la mémoire.

 

Si les co-activations entre l’aire corticale et les ganglions de la base étaient plus importantes pendant le sommeil que pendant les phases d’éveil, ce qui suggère des niveaux distincts d’échange d’information entre structures cérébrales suivant les états, elles restent néanmoins faibles, ce qui pourrait être lié à une ségrégation spatiale de ces échanges entre les deux structures.

 

-> Contact : nicolas.giret@cnrs.fr

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Today, 5:42 AM
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La germinalisation de la séquence d’un nanobody diminue sa capacité à stimuler les lymphocytes T et le risque d’immunogénicité

La germinalisation de la séquence d’un nanobody diminue sa capacité à stimuler les lymphocytes T et le risque d’immunogénicité | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans mAbs, une équipe du Département Médicaments et Technologies pour la Santé - DMTS (UPSaclay/CEA/DMTS/SIMoS, Gif-sur-Yvette) du CEA de Saclay s’est intéressée à la réaction du système immunitaire face à un type particulier d’anticorps miniatures appelés « single-domain antibodies » (ou Nanobody). Dérivés des anticorps des camélidés comme les lamas ou les dromadaires, ces anticorps sont prometteurs pour de nouvelles thérapies. Leur petite taille et leur faible risque supposé de réactions immunitaires en font des candidats idéaux pour des traitements ciblés, notamment contre le SARS-CoV-2.

 

Cependant, plusieurs études ont montré que ces nouveaux formats d’anticorps pouvaient malgré tout déclencher des réactions immunitaires. Pour mieux comprendre ce phénomène, les chercheurs ont étudié la réponse des cellules T CD4, essentielles pour activer les lymphocytes B producteurs d’anticorps, face à un anticorps spécifique appelé VHH76, conçu pour reconnaître la protéine du virus responsable de la COVID-19. Ils ont comparé trois versions de cet anticorps : l’originale, une version « humanisée » plus proche des anticorps humains, et une version « germinale », encore plus fidèle à leur structure naturelle.

 

Tous les VHH76 ont déclenché une réponse des cellules T, mais celle-ci était nettement plus faible avec la version germinale. Deux zones principales de l’anticorps ont été reconnues : la boucle hypervariable CDR3, impliquée dans la reconnaissance du virus, et la région FR2, spécifique aux VHH en raison de l’absence de chaîne légère.

 

En résumé, ce nanobody même humanisé peut provoquer des réactions immunitaires, mais les résultats de cette étude offrent des pistes pour concevoir des nanobodies thérapeutiques plus sûrs et mieux tolérés.

 

-> Contact : bernard.maillere@cea.fr / herve.nozach@cea.fr

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Today, 5:18 AM
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Portrait Jeune Chercheur – Abdulhadi Aljawish, Maître de Conférences en biotechnologies et procédés alimentaires

Portrait Jeune Chercheur – Abdulhadi Aljawish, Maître de Conférences en biotechnologies et procédés alimentaires | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Abdulhadi Aljawish est maître de conférences au Conservatoire national des arts et métiers (CNAM) depuis septembre 2023. Il enseigne au sein de l’Équipe pédagogique nationale Chimie-Santé-Vivant (EPN 07), dans la spécialité Industries agroalimentaires. Ses activités de recherche sont menées à l’UMR SayFood (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay), au sein de l’équipe Génie de Produits (GePro) basée à Palaiseau.

 

Après l’obtention de son diplôme d’ingénieur en sciences alimentaires, il a poursuivi un master en Biotechnologies et Bioprocédés à l’Université de Lorraine (ENSAIA, Nancy), où il s’est initié à la synthèse enzymatique de colorants naturels à partir de composés phénoliques. Il a ensuite entrepris une thèse de doctorat en Biotechnologies et Procédés alimentaires, consacrée à la modification enzymatique du chitosane par des composés phénoliques, à l’interface entre biotechnologie blanche et chimie verte. Ces travaux lui ont permis de développer une expertise approfondie dans le domaine des procédés enzymatiques et dans l’étude des propriétés physico-chimiques et fonctionnelles (antioxydantes, antibactériennes et cytotoxiques) de polymères naturels. Il a ensuite occupé deux postes d’ATER en biochimie et biotechnologies au laboratoire LIBio (Université de Lorraine), où il a poursuivi ses travaux sur la valorisation enzymatique de la pectine et la synthèse de molécules bioactives (colorants, antioxydants, tensioactifs).

 

Il a ensuite réalisé un postdoctorat à l’Université de Bourgogne (Laboratoire NUTox), en collaboration avec l’entreprise WIPAK, portant sur l’évaluation du recyclage du carton à usage alimentaire, notamment à travers l’étude des propriétés toxicologiques des substances résiduelles présentes dans le matériau. Il a poursuivi avec un second postdoctorat à l’Université de Lille (Institut Charles Viollette, équipe ProbioGem) en collaboration avec l’entreprise PIVERT, portant sur la valorisation enzymatique du glycérol, coproduit de la production de biodiesel, en esters aromatiques.

 

En 2019, Abdulhadi a rejoint l’entreprise GECCO à Lille en tant que responsable Recherche et Développement (R&D), où il a participé à la valorisation de coproduits en molécules à haute valeur ajoutée et à la gestion de projets de recherche académiques et industriels. Ses travaux ont conduit au dépôt de deux brevets portant sur la valorisation enzymatique des huiles alimentaires usagées en biodiesel à l’échelle industrielle.

 

Ses activités de recherche actuelles portent sur le développement de procédés durables et respectueux de l’environnement visant à valoriser des coproduits issus de la biomasse - tels que les huiles alimentaires usagées, le marc de café ou les biopolymères - en produits à haute valeur ajoutée, comme des biocarburants, des additifs fonctionnels ou des films bioactifs, dans une perspective de bioéconomie circulaire.

 

« La science n’a pas de patrie, parce que le savoir est le patrimoine de l’humanité » - Louis Pasteur

 

-> Contact : abdulhadi.aljawish@lecnam.net

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October 30, 5:08 AM
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Quand certaines grossesses imitent la greffe : le rejet materno-fœtal décrypté

Quand certaines grossesses imitent la greffe : le rejet materno-fœtal décrypté | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’origine de nombreuses complications obstétricales sévères, comme le retard de croissance intra-utérin, la mort fœtale in utero, les fausses couches ou la prématurité, demeure encore mal comprise. Dans une revue publiée dans The American Journal of Obstetrics and Gynecology (AJOG), une équipe pluridisciplinaire associant obstétriciens, immunologistes, fœtopathologistes et anatomopathologistes propose une approche unifiée fondée sur l’étude des syndromes histoplacentaires chroniques tels que les intervillites ou les villites.

 

Cette synthèse, menée par Pierre Hannoun sous la direction du Pr Alexandra Benachi (service de gynécologie-obstétrique de l’Hôpital Antoine Béclère AP-HP/UPSaclay, Clamart) et du Pr Julien Zuber (Hôpital Necker, Paris), montre que la chronic histiocytic intervillositis (CHI) et la villitis of unknown etiology (VUE) représenteraient deux formes de rupture de la tolérance immunitaire materno-fœtale, étroitement analogues aux rejets d’allogreffe.

 

La CHI correspond à un rejet humoral, dominé par la présence d’allo-anticorps maternels anti-HLA spécifiques du fœtus, de dépôts trophoblastiques de C4d et de la surexpression anormale de molécules HLA polymorphes, rappelant les critères de rejet humoral selon la classification internationale de Banff. La VUE, évocatrice d’un rejet cellulaire, présente un microenvironnement inflammatoire où l’expression anormale de molécules HLA polymorphes et la production de signaux chimiotactiques favoriseraient l’activation et l’expansion clonale de lymphocytes T CD8+ et de lymphocytes mémoires, en interaction avec des macrophages fœtaux.

 

En établissant ce parallèle entre immunologie de la transplantation et pathologie placentaire, les auteurs proposent un changement de paradigme dans la compréhension des complications obstétricales. Ces travaux ouvrent la voie à une médecine translationnelle de la grossesse, fondée sur l’identification de biomarqueurs immunologiques et le développement de stratégies d’immunomodulation ciblée, à l’interface entre obstétrique, immunologie et transplantation.

 

-> Contact : pierrehannoun@me.com

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October 30, 6:04 AM
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Des navettes moléculaires pour le transport de molécules d’intérêt dans les mitochondries

Des navettes moléculaires pour le transport de molécules d’intérêt dans les mitochondries | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans leur article publié dans Chemical Science, l’équipe du Dr. Arnaud Chevalier, de l’Institut de Chimie des Substances Naturelles - ICSN (CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), présente une technologie innovante de navette moléculaire intégrant un espaceur auto-immolable. Ce dispositif permet de fonctionnaliser des composés aminés d’intérêt afin de faciliter leur transport à travers la cellule jusqu’aux mitochondries, véritables centrales énergétiques du vivant. L’efficacité de cette approche a été démontrée à l’aide de sondes fluorescentes, puis confirmée par une preuve de concept reposant sur la libération intra-mitochondriale de la doxorubicine, un agent anticancéreux bien connu. Les chercheurs ont observé que cette stratégie permettait de contourner certains mécanismes de résistance dans un modèle cellulaire K562r.

 

Ce travail constitue une première étape importante vers le développement de nouvelles navettes moléculaires capables d’acheminer divers composés thérapeutiques directement au cœur des mitochondries, ouvrant ainsi la voie à de nouvelles approches ciblées en biologie cellulaire et en cancérologie.

 

-> Contact : arnaud.chevalier@cnrs.fr

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October 30, 6:20 AM
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Mieux comprendre les effets de la stimulation cérébrale non-invasive sur les réseaux cérébraux

Mieux comprendre les effets de la stimulation cérébrale non-invasive sur les réseaux cérébraux | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La stimulation transcrânienne à courant direct (tDCS) est une technique non-invasive qui utilise un faible courant électrique pour moduler l’activité du cerveau. Elle suscite beaucoup d’intérêt car elle pourrait aider à traiter certaines maladies neurologiques ou psychiatriques, comme la dépression ou les troubles de la conscience. Mais les mécanismes précis de son action restent encore mal connus.

 

Dans une étude parue dans eLife, une équipe rassemblant des chercheurs et cliniciens du CEA (NeuroSpin Unicog, Inserm/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), de l’Hôpital Foch, de l’Université de Saint-Quentin-en-Yvelines, de l’ICM et de NeuroPSI (CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) s’est intéressée aux effets de la tDCS sur le cerveau de primates non-humains, grâce à l’imagerie par résonance magnétique fonctionnelle.

 

Les scientifiques ont appliqué la stimulation sur la région préfrontale du cortex lors de deux états de vigilance : pendant l’éveil ou sous anesthésie profonde. Leurs résultats montrent que les effets de la tDCS dépendent non seulement de la polarité et de l’intensité de la stimulation, mais aussi de l’état de conscience. Certaines stimulations ont un impact remarquable sur la dynamique de la connectivité fonctionnelle et sur les signatures de la conscience, tandis que d’autres n’ont que peu d’effet.

 

Ces travaux apportent un nouvel éclairage sur la façon dont la stimulation cérébrale influence l’activité du cerveau et pourraient aider à concevoir des protocoles de stimulation plus efficaces pour traiter les troubles neuropsychiatriques.

 

-> Contact : guylaine.hoffner@inserm.fr

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November 2, 10:43 AM
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Les gènes égoïstes façonnent l’évolution de la détermination du sexe et de la reproduction

Les gènes égoïstes façonnent l’évolution de la détermination du sexe et de la reproduction | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une revue publiée dans Current Opinion in Insect Science, des chercheuses et chercheurs du laboratoire Évolution, génomes, comportement, écologie - EGCE (UMR 9191 CNRS/IRD/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) proposent une synthèse sur le rôle des systèmes de distorsion de ségrégation méiotique, des gènes égoïstes qui favorisent leur propre transmission lors de la formation des gamètes, souvent au détriment de la fertilité des individus porteurs. Loin d’être anecdotiques, ces éléments génétiques peuvent bouleverser l’évolution des chromosomes sexuels en déclenchant de véritables courses aux armements entre gènes distorteurs et suppresseurs.

 

Cette revue met en lumière l’interaction dynamique entre les distorsions méiotiques et l’évolution des chromosomes sexuels, soulignant que ces phénomènes peuvent catalyser la divergence chromosomique, induire des transitions de détermination du sexe, voire conduire à la formation de nouvelles espèces. De plus, les distorteurs peuvent influencer les traits reproductifs et la sélection sexuelle : ils peuvent réduire la fertilité mâle en détruisant certains gamètes, ce qui favorise l’apparition d’adaptations compensatrices. L’influence réciproque de la sélection sexuelle et du comportement reproducteur sur la fréquence des distorteurs illustre la complexité de ces interactions.

 

Ce travail de synthèse propose ainsi une vision intégrée, reliant génétique, écologie et comportement, pour mieux comprendre comment les conflits intragénomiques peuvent façonner l’évolution du vivant.

 

-> Contact : cecile.courret@universite-paris-saclay.fr

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November 5, 4:45 PM
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Rotations culturales : un levier mondial pour rendement, nutrition et revenus

Rotations culturales : un levier mondial pour rendement, nutrition et revenus | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Une étude internationale impliquant INRAE (MIA-Paris-Saclay INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau) et coordonnée par l’Université agricole de Chine montre que la pratique de rotation des cultures est plus performante que la pratique de monoculture en termes de rendement, de qualité nutritionnelle des produits et de revenus pour les agriculteurs. Des résultats basés sur plus de 3 600 données issues de 738 expérimentations réalisées dans des conditions agricoles sur 5 continents, publiés dans Nature Communications.

 

Lire la suite du communiqué de presse de l'INRAe

 

-> Contact : david.makowski@inrae.fr

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November 5, 4:35 PM
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Nathalie Chaput-Gras et David Castel, lauréats du 14e appel à projets de la Fondation Bristol Myers Squibb pour la recherche en immuno-oncologie

Nathalie Chaput-Gras et David Castel, lauréats du 14e appel à projets de la Fondation Bristol Myers Squibb pour la recherche en immuno-oncologie | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La Pr Nathalie Chaput-Gras et le Dr David Castel, tous deux chercheurs à Gustave Roussy, figurent parmi les lauréats du 14e appel à projets de la Fondation Bristol Myers Squibb pour la recherche en immuno-oncologie.

 

Depuis 2015, la Fondation Bristol Myers Squibb soutient la recherche en immuno-oncologie en France afin d’améliorer la prise en charge des patients traités par immunothérapie et de développer de nouvelles connaissances. Un comité scientifique indépendant sélectionne chaque année une dizaine de projets en recherche fondamentale, recherche clinique et translationnelle, recherche en oncologie pédiatrique et recherche en santé publique et parcours de soins.

 

Parmi les lauréats de cette année figurent deux chercheurs de Gustave Roussy, qui vont ainsi voir leur projet soutenu financièrement par la Fondation BMS :

 

  • Pr Nathalie Chaput-Gras - Ciblage des lymphocytes T sénescents (Tsen) pour améliorer l’efficacité de l’immunothérapie en oncologie ; Axe recherche clinique et translationnelle

 

  • Dr David Castel - Syngenic-DMG : une plateforme d’étude pour analyser les interactions longitudinales entre la tumeur et le microenvironnement immunitaire dans les gliomes diffus de la ligne médiane pédiatriques ; Axe recherche en oncologie pédiatrique

 

Lire la suite de l'Actu Gustave Roussy

 

-> Contact : nathalie.chaput@gustaveroussy.fr / david.castel@gustaveroussy.fr

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November 5, 9:55 AM
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Clément Gilbert sur France Culture - Cleptomanie génétique : cet insecte vole des gènes aux plantes pour mieux les manger

Clément Gilbert sur France Culture - Cleptomanie génétique : cet insecte vole des gènes aux plantes pour mieux les manger | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Pour se défendre des insectes, certaines plantes ont concocté des toxines qu'elles sécrètent, mais l'aleurode du tabac, un petit hémiptère, a réussi à voler le matériel génétique qui code pour l'antidote. Ce larcin lui permet aujourd'hui de se nourrir de plus de 900 plantes différentes.

 

Avec

 

En l'état actuel de nos connaissances, l'aleurode du tabac est la championne du monde animal pour voler des gènes aux plantes. On a retrouvé dans son matériel génétique 49 gènes qui proviennent de différentes plantes et ont été acquis par transfert horizontal de gènes — un mécanisme biologique permettant des échanges génétiques entre des individus qui ne sont pas parents, qui est très courant dans le monde bactérien, mais joue aussi un rôle dans le monde animal et végétal.

 

Le portrait de notre cleptomane à six pattes est le suivant : hémiptère, c'est-à-dire insecte de la même famille que les punaises ; corps vert et ailes blanches ; long d'environ un millimètre ; polyphages, c'est-à-dire capable de manger des aliments très variés (l'aleurode du tabac peut se nourrir de plusieurs centaines de plantes, dont certaines plantes de culture et ornementale, et il est ainsi considéré comme l'un des plus grands ravageurs du monde).

 

Le larcin génétique commis par cet insecte n'est pas sans intérêt. Certains des gènes dérobés aux plantes permettent à l'aleurode du tabac d'être immunisé contre les toxines de défenses sécrétées par les végétaux dont il se nourrit.

 

Ecouter ou réécouter le podcast

 

-> Contact : clement.gilbert1@universite-paris-saclay.fr

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November 5, 4:11 PM
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Forum de l'Industrie pharmaceutique - 12/13 novembre 2025

Forum de l'Industrie pharmaceutique - 12/13 novembre 2025 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les 12 et 13 novembre 2025, l'Association pour la Promotion auprès de l'Industrie des Etudiants en Pharmacie organise la 40ème édition du Forum de l'Industrie Pharmaceutique, dans le bâtiment Bouygues de Centrale Supélec, sur le plateau de Saclay. 

 

Au programme : 

  • De nombreux laboratoires, des agences de recrutement et de consulting, des associations et des écoles de commerce et d'ingénieur seront présents pour échanger avec vous, pour vous permettre de discuter avec des professionnels afin de trouver un stage, un futur emploi ou pour confronter votre CV à une lecture critique et bienveillante lors de simulations d'entretiens.
  • Une dizaine de conférences seront également organisées pour vous permettre d'approfondir votre connaissance du monde pharmaceutique et d'affiner votre projet professionnel. Elles seront animées par des industriels et des professeurs de masters.
  • Vous pourrez également vous rendre sur une zone spécialement dédiée aux masters de la Mention Sciences du médicament et des produits de santé de la Graduate School Health and Drug Sciences de l'Université Paris-Saclay pour vous accompagner et vous guider dans le choix de votre formation en accord avec votre projet professionnel.

 

Lieu : 

Centrale Supélec, Bâtiment Bouygues
9 rue Joliot Curie, 91190 Gif-sur-Yvette
 

Contacts : 

Mail : forum.apiep@gmail.com

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November 5, 8:10 AM
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Évolution des sources alimentaires en nutrition humaine - 26 novembre 2025

Évolution des sources alimentaires en nutrition humaine - 26 novembre 2025 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Evolution des sources alimentaires en nutrition humaine

Journée bi-académique de l'Académie Nationale de Médecine et l'Académie

Vétérinaire de France

Mercredi 26 Novembre 2025

Salle de séance de l'Académie Nationale de Médecine

Retransmission en Visioconférence Zoom

16 Rue Bonaparte, Paris

 

*** Inscription au préalable obligatoire ***

 

Programme

 

  • 09H30 - Introduction - Dr vét Jean Deregnaucourt (Président AVF)
  • 9H40 - Sécurité et qualité des aliments en Europe - tout ne peut pas être fait ou se dire hors du cadre réglementaire ! - Pr Catherine Magras
  • 10H00 - Comment élever des animaux de production en répondant aux attentes éthiques, sociétales et environnementales ? - Dr vét Aurélien Madouasse
  • 10H40 - Transformation des aliments : Où en est-on ? - Dr vét Vanessa Jury
  • 11H00 - Micro-nutriments et sources alimentaires animales et végétales : quel impact pour la santé ? - Dr Jean-Louis Guéant
  • - BUFFET -
  • 14H00 - Sources en protéines animales vs végétales en santé humaine - Pr François Mariotti (unité Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire - PNCA (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau)
  • 14H40 - Aliments ultratransformés - définition et risque de maladies non-transmissibles: Obésité, Diabète, Maladie cardiovasculaire et Cancer. - Pr Jacques Delarue
  • 15H00 - Y a-t-il un bénéfice à remplacer les produits d'origine animale par des végétaux chez l'enfant ? - Pr Patrick Tounian
  • 15H40 - Peut-on valoriser la viande de sanglier en tant que source alimentaire par la solution de la cuisson lente sous vide à basse température ? - Pr Jeanne Brugère-Picoux
  • 16H00 - Conclusions - Pr Jean-Noel Fiessinger (Président ANM)

 

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Today, 6:14 AM
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Une enzyme de bactérie thermophile candidate pour la thérapie anticancéreuse

Une enzyme de bactérie thermophile candidate pour la thérapie anticancéreuse | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les méthionine gamma-lyases (MGL) sont des enzymes à cofacteur phosphate de pyridoxal (PLP). Elles inhibent la prolifération tumorale en diminuant la méthionine circulante. Les premières MGL bactériennes en développement thérapeutique ont été abandonnées en raison de réactions allergiques chez le macaque et d’une faible stabilité dans le plasma humain.

 

Dans un article publié dans International Journal of Biological Macromolecules, une équipe de chercheurs de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) et de l’Unité UMR-S 1310 « Modèles de cellules souches malignes et thérapeutiques » (INSERM/UPSaclay, Hôpital Paul Brousse, Villejuif) ont identifié chez la bactérie thermophile Thermobrachium celere une nouvelle MGL (TcMGL). Sa structure cristallographique met en évidence un domaine mobile qui pourrait réguler l’accès du PLP au site actif. L’enzyme s’est révélée particulièrement efficace pour dégrader la méthionine à 37°C.  Elle est plus stable in vitro dans le plasma humain que la MGL la plus étudiée précédemment, celle de la bactérie Pseudomonas putida. De plus, la demi-vie plasmatique de TcMGL est fortement augmentée par l’addition de doses de PLP utilisables in vivo. L’enzyme exerce un effet cytotoxique marqué sur des lignées cancéreuses humaines. Elle a fait l’objet d’une demande de brevet européen (INSERM-INRAE, fév. 2025).

 

Des expériences de modification chimique (pégylation) ou d’encapsulation de l’enzyme sont en cours. La vectorisation dans des globules rouges humains, qui pourraient être à terme ceux des malades eux-mêmes, apparaît prometteuse. Des essais sur un modèle souris seront réalisés afin de valider le potentiel thérapeutique de cette nouvelle enzyme dégradant la méthionine.

 

Légende Figure : Demi-vies des enzymes TcMGL et PpMGL dans le plasma humain in vitro, et effet de l’ajout de cofacteur PLP. La structure 3D cristallographique du tétramère de TcMGL est également représentée, avec le PLP en sphères.

 

-> Contact : pierre.briozzo@inrae.fr

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Today, 5:55 AM
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Physiologie de la dentinogenèse et physiopathologie de la dentinogenèse imparfaite : impact sur la structure de la dentine et ses propriétés biomécaniques

Physiologie de la dentinogenèse et physiopathologie de la dentinogenèse imparfaite : impact sur la structure de la dentine et ses propriétés biomécaniques | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une revue publiée dans Acta Biomaterialia, Elsa Vennat du LMPS (UPSaclay/Centrale Supélec/ENS Paris-Saclay/CNRS, Gif-sur-Yvette) et ses collaborateurs proposent une analyse approfondie des processus biologiques, structuraux et biomécaniques de la dentine physiologique, ainsi que des conséquences de l’atteinte pathologique de la dentinogenèse imparfaite.

 

La dentine est un tissu composite minéralisé, formé d’une matrice extracellulaire contenant des cristaux d’hydroxyapatite (partie minérale, 70% de la masse) dans un réseau de collagène de type I. Sa structure hautement organisée autour d’un réseau poreux tubulaire fournit à la dent ses propriétés mécaniques, et notamment sa résistance aux forces de mastication.

 

La dentinogenèse imparfaite (DI) est une maladie génétique rare altérant la formation de la dentine. Elle peut être isolée, liée à un variant du gène DSPP, ou syndromique dans le cadre de l’ostéogenèse imparfaite (OI) associée à des variants des gènes COL1A1 et COL1A2. Des anomalies sont alors visibles à toutes les échelles : macroscopique (couleur de la dent), microscopique (désorganisation du réseau tubulaire) et nanoscopique (perturbation du dépôt minéral et des fibres de collagène). Les conséquences biomécaniques sont majeures, notamment une usure rapide des dents, une diminution de la résistance aux fractures et de la dureté et une perte de l’émail.  

 

Ce travail de synthèse est le résultat d’un travail pluridisciplinaire entre biologistes, cliniciens et biomécaniciens. Si la physiologie de la dentine est aujourd’hui bien connue, les mécanismes biologiques et les conséquences biomécaniques de la DI restent mal compris. Les auteurs appellent à des études multi-échelles et multidisciplinaires, combinant analyses génétiques, structurales et mécaniques, afin de mieux établir les liens génotype-phénotype et améliorer la prise en charge clinique des patients.

 

-> Contact : elsa.vennat@centralesupelec.fr

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Today, 5:34 AM
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Cancer du poumon non à petites cellules de stade III non résécable: état de l’art et défis

Cancer du poumon non à petites cellules de stade III non résécable: état de l’art et défis | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une revue récente publiée dans Nature Reviews Clinical Oncology, Jordi Remon et Antonin Levy de l’Université Paris-Saclay (Gustave Roussy et UMR-S 1030 INSERM/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif), ainsi que leurs collaborateurs, ont indiqué que malgré les avancées de l’immunothérapie, le cancer du poumon non à petites cellules (CPNPC) de stade III non résécable demeure une maladie particulièrement difficile à traiter, avec seulement un tiers des patients atteignant une survie sans progression (PFS) à long terme. Bien que la stratégie PACIFIC (durvalumab en consolidation après chimioradiothérapie) reste le standard de traitement, de nouvelles approches sont urgemment nécessaires pour surmonter les mécanismes de résistance et optimiser la sélection des patients.

 

Les stratégies émergentes incluent les immunothérapies de nouvelle génération, le double blocage des points de contrôle immunitaires, ainsi que la personnalisation du traitement guidée par les biomarqueurs. De même, dans le CPNPC non résécable porteur d’une mutation EGFR, l’essai LAURA a confirmé l’importance d’une approche personnalisée dans ce contexte.

 

Par ailleurs, la surveillance de la maladie résiduelle minimale (MRD) basée sur l’ADN tumoral circulant (ctDNA) émerge comme un outil prometteur pour adapter la durée du traitement et les stratégies d’intensification thérapeutique. Les nouvelles techniques de radiothérapie, notamment les approches immune-sparing et dose-adaptive, visent à renforcer la synergie avec l’immunothérapie tout en limitant la toxicité.

 

Enfin, le rôle de la chimio-immunothérapie d’induction dans le CPNPC de stade III non résécable, dans le but de rendre ces tumeurs résécables, est actuellement débattu et exploré dans des essais en cours.

 

Dans cette revue, les auteurs décrivent le domaine en rapide évolution du CPNPC de stade III non résécable, en offrant une synthèse actualisée abordant des thématiques complexes telles que les biomarqueurs, la personnalisation des traitements et la réutilisation de l’immunothérapie.

 

-> Contact : jordi.remon-masip@gustaveroussy.fr

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November 2, 8:46 AM
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Les récepteurs β-adrénergiques cardiaques ont des fonctions différentes selon qu’ils sont localisés sur la membrane de surface ou dans les tubules transverses

Les récepteurs β-adrénergiques cardiaques ont des fonctions différentes selon qu’ils sont localisés sur la membrane de surface ou dans les tubules transverses | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les myocytes cardiaques possèdent une membrane de surface et un réseau dense de tubules transverses (TT), qui sont des invaginations de la membrane de surface qui pénètrent à l'intérieur de la cellule. De nombreuses protéines membranaires sont localisées à la fois dans la membrane de surface et dans la membrane des TT : c’est le cas notamment des récepteurs β-adrénergiques (β-ARs) qui régulent la fonction cardiaque lors de la stimulation sympathique. Mais on ignore si la localisation des β-ARs dans les TT ou à la membrane de surface modifie leur fonction.

 

Dans le cadre d’un projet financé par l’ANR rassemblant quatre laboratoires de UPSaclay, le laboratoire de Signalisation et Physiopathologie Cardiovasculaire (UMR-S 1180 Inserm/UPSaclay, Orsay), l’Institut Galien Paris-Saclay (IGPS, CNRS/UPSaclay, Orsay), le laboratoire BioCIS – Biomolécules : Conception, Isolement, Synthèse (CNRS/UPSaclay, Orsay) et le Service d’Ingénierie Moléculaire pour la Santé – SIMoS (DMTS CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), les scientifiques ont développé une technologie basée sur l'exclusion de taille afin d'étudier la fonction des β-AR situés dans la membrane de surface. Pour cela, ils ont synthétisé une molécule (PEG-Iso) en liant de manière covalente l'isoprénaline (Iso) à une chaîne de polyéthylène glycol (PEG) de 5000 Da afin d'augmenter la taille de l'agoniste β-AR et de l'empêcher d'accéder au réseau des TT.

 

L'affinité du PEG-Iso et de l'Iso pour les récepteurs β1- et β2-AR a été mesurée à l'aide d'un radioligand. Des simulations de dynamique moléculaire ont été utilisées pour évaluer les conformations du PEG-Iso et quantifier l'impact du PEG sur l'accessibilité de l’Iso au solvant. À l'aide de la microscopie confocale, les scientifiques ont montré que la PEGylation contraint les molécules à l'extérieur du réseau de TT des myocytes ventriculaires adultes de rat en raison de la présence du glycocalyx extracellulaire. L'activation des récepteurs β-AR de la membrane de surface avec PEG-Iso produit une stimulation plus faible de l’AMPc cytosolique que l'Iso, mais une stimulation plus importante de la PKA cytosolique à des niveaux équivalents d’AMPc et des effets similaires sur les paramètres du couplage excitation-contraction. Cependant, le PEG-Iso produit une stimulation beaucoup plus faible de l’AMPc et de la PKA nucléaires que l'Iso.

 

La conclusion de cette étude publiée dans eLife est que les récepteurs β-AR cardiaques situés dans la membrane de surface contrôlent principalement la voie cytosolique AMPc/PKA et la contractilité, tandis que les récepteurs β-AR de la membrane localisés dans les tubules T contrôlent principalement la voie AMPc/PKA nucléaire et la phosphorylation des protéines nucléaires qui en résulte.

 

La stratégie d'exclusion par taille utilisant la PEGylation des ligands offre ainsi une approche unique pour étudier la fonction des récepteurs, canaux ioniques, transporteurs et enzymes membranaires présents à la surface des cellules cardiaques en comparaison avec leurs homologues présents dans les tubules transverses.

 

-> Contact : rodolphe.fischmeister@inserm.fr / laurence.moine@universite-paris-saclay.fr / nicolas.tsapis@universite-paris-saclay.f / tap.ha-duong@universite-paris-saclay.fr / xavier.iturrioz@cea.fr

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October 30, 5:57 AM
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Les taux plasmatiques des métabolites de la kynurénine augmentent après un traitement antidépresseur chez les patients déprimés

Les taux plasmatiques des métabolites de la kynurénine augmentent après un traitement antidépresseur chez les patients déprimés | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les métabolites de la voie de la kynurénine régulent des systèmes physiologiques impliqués dans la dépression. L’équipe MOODS du Centre de Recherche en Epidémiologie et Santé des Populations – CESP (UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre) a montré que leurs taux plasmatiques sont plus faibles chez les patients souffrant d’un épisode dépressif caractérisé, comparés aux témoins sains. Toutefois, leur évolution sous traitement antidépresseur n’avait pas été évaluée. De même, le lien entre l’évolution de leur taux plasmatique et l’amélioration clinique après traitement antidépresseurs restait à préciser.

 

Dans une étude publiée dans Brain, Behavior, and Immunity, l’équipe a examiné l’évolution des métabolites kynuréniques chez 173 patients suivis pendant 6 mois dans la cohorte METADAP, évalués à l’inclusion et après 3 et 6 mois de traitement. Ces données ont été comparées à celles de 214 témoins sains appariés issus de la cohorte VARIETE.

 

Les taux de plusieurs métabolites ont augmenté au cours du traitement, de façon significative pour l’acide kynurénique (PFDR=0.000014), l’acide hydroxy-3-anthranilique (PFDR=0.034) et l’acide picolinique (PFDR=0.0097). Toutefois, le ratio kynurénine/tryptophane et les taux d’acide kynurénique restaient inférieurs à ceux des témoins. Des augmentations du ratio kynurénine/tryptophane (coef=-1.08, IC95% [-1,92–-0,23], PFDR=0.045) et de la kynurénine (coef=-2.37, IC95% [-3,83–-0,91], PFDR = 0.0011) étaient associées à une réduction des scores à l’échelle Hamilton (HDRS), indiquant une amélioration clinique.

 

Ainsi, l’étude montre que certains métabolites de la voie de la kynurénine augmentent sous traitement antidépresseur, et que l’élévation de la kynurénine est associée à l’amélioration clinique après traitement antidépresseur. Cibler ces métabolites pourrait être pertinent pour de nouvelles approches thérapeutiques dans le trouble dépressif unipolaire.

 

Légende Figure : Les associations du score HDRS (Hamilton Depression Rating Scale) (axe Y) aux changements au cours du traitement du ratio kynurénine/tryptophane (A) et les taux de la kynurénine (B ; axes X). Les boites textuelles montrent les coefficients, les intervalles de confiance de ces métabolites [IC95%] et les valeurs P (non-corrigées et corrigées).

 

-> Contact : romain.colle@aphp.fr

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October 30, 6:11 AM
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Le dysfonctionnement lysosomal identifié comme cible thérapeutique dans la dystrophie musculaire de Duchenne

Le dysfonctionnement lysosomal identifié comme cible thérapeutique dans la dystrophie musculaire de Duchenne | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Science Advances, les chercheurs de l’équipe des Dystrophies Musculaires Progressives à Généthon (UMR-S 951 Integrare Inserm/UEVE/UPSaclay, Généthon, Evry) ont mis en évidence que la fonction lysosomale est fortement altérée dans le muscle dystrophique de patients atteints de la myopathie de Duchenne (Duchenne Muscular Dystrophy ou DMD) et de modèles animaux. Cela est mis en évidence notamment par le recrutement de Galectine-3, un biomarqueur de perméabilisation de la membrane lysosomale, sur des lysosomes endommagés. Ces altérations touchent la structure, le nombre et la capacité de récupération fonctionnelle des lysosomes. De plus, ces dommages ont été associés à des perturbations du métabolisme du cholestérol ; l’accumulation de cholestérol dans les lysosomes étant aggravée par un régime riche en graisses chez les souris dystrophiques.

 

L’étude montre également que la thérapie génique par microdystrophine ne corrige pas complètement ces anomalies, tandis que son association avec le tréhalose, un disaccharide protecteur des lysosomes, améliore significativement la fonction musculaire, l’histologie et le transcriptome chez les souris dystrophiques.

 

Ces résultats ouvrent de nouvelles perspectives thérapeutiques en soulignant l’importance des lysosomes dans la DMD et d’autres dystrophies musculaires, comme le montre l’observation de dommages lysosomaux similaires dans une dystrophie musculaire des ceintures (LGMDR5).

 

-> Contact : israeli@genethon.fr

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October 30, 6:27 AM
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Nouvelle technique pour caractériser les vésicules extracellulaires selon leur point isolélectrique: la focalisation isoélectrique capillaire

Nouvelle technique pour caractériser les vésicules extracellulaires selon leur point isolélectrique: la focalisation isoélectrique capillaire | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Talanta, des scientifiques de l’équipe Protéines et Nanotechnologies en Sciences Analytiques (PNAS) de l’Institut Galien Paris-Saclay – IGPS (CNRS/UPSaclay, Orsay) ont mis au point une technique permettant pour la première fois l’analyse de vésicules extracellulaires (VEs) selon leur point isolélectrique (pI) par focalisation isoélectrique capillaire (cIEF). Pour cela, ils ont utilisé la cIEF couplée à une détection par imagerie de l’intégralité des zones focalisées dans le capillaire (WCID) et la cIEF conventionnelle couplée à la détection par fluorescence induite par laser (après marquage par un fluorophore des VEs) et à l’UV.

 

L’étude révèle que les VEs présentent une agrégation significative lors de leur migration vers la zone de leur pI, mais qu’elles sont relativement préservées de la lyse. En optimisant des paramètres clés tels que la tension, l'ajout de solubilisants, la distance de focalisation, les scientifiques ont réussi à réduire ce problème. Leurs résultats démontrent qu’il est possible de distinguer différentes sous populations d’VEs de même origine, mais aussi que les VEs isolées de différentes sources présentent des pI différents : celles de lait bovin étant les plus acides (pI~4,0-4,1), tandis que les VEs de plasma porcin et humain montrent des pI plus basiques (4,7-4,9 et 5,8-6,7, respectivement).

 

Leur étude révèle la nécessité d'une optimisation de la cIEF pour chaque source de VE. L'utilisation d'un capillaire court (< 10 cm), de la cIEF par imagerie, d'un faible champ électrique et de solubilisants (e.g. Tween 80) est recommandée pour préserver l'intégrité des VE lors des analyses.

 

-> Contact : myriam.taverna@universite-paris-saclay.fr

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November 5, 7:48 AM
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Reconstruire des molécules à partir de leurs empreintes numériques

Reconstruire des molécules à partir de leurs empreintes numériques | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La représentation ECFP (Extended-Connectivity Fingerprint) d’une molécule est l’un des empreintes numériques les plus utilisés pour exprimer ses propriétés physicochimiques ou structurales sous une forme exploitable par les algorithmes. Cependant, cette transformation s’accompagne d’une perte d’information, soulevant un défi de taille : peut-on reconstruire une molécule à partir de son vecteur ECFP ?

 

Les chercheurs de l’équipe Bio-RetroSynth de l’Institut Micalis (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) ont relevé ce challenge dans un article publié dans Journal of Cheminformatics dans le cadre du PEPR B-BEST sur la bioproduction. Ils y présentent un algorithme mathématique déterministe capable de reconstituer exhaustivement des graphes moléculaires à partir de leurs ECFPs. Cette approche a été comparée à un modèle d’intelligence artificielle génératif de type Transformer, entraîné à reconstruire les molécules au format SMILES à partir des mêmes ECFPs, atteignant un haut niveau de performance (95% de précision top-1).

 

À titre de démonstration, les auteurs ont inversé les ECFPs de près de 10 000 médicaments, obtenant des résultats prometteurs pour le de novo drug design. Fait remarquable : ils ont découvert un ECFP dont la reconstruction déterministe produisait 3 558 molécules distinctes partageant exactement le même fingerprint.

 

Les ECFPs sont des outils incontournables pour la représentation moléculaire, largement utilisés en chemo- et bio-informatique pour la modélisation QSAR/QSPR, la recherche de similarité, le virtual screening et la rétrosynthèse. Cette étude montre qu’ils peuvent aussi servir à l’exploration de l’espace chimique et au de novo molecular design, grâce aux techniques de rétro-ingénierie présentées.

 

-> Contact : philippe.meyer@inrae.fr / jean-loup.faulon@inrae.fr

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October 30, 4:05 AM
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Portrait Jeune Chercheur – Cyril Thomas, Maître de Conférences en histoire du sport

Portrait Jeune Chercheur – Cyril Thomas, Maître de Conférences en histoire du sport | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Cyril Thomas est historien du sport au sein de l’équipe « Corps, Sport, Genre et Rapports de Pouvoir » au laboratoire Complexité, Innovation, Activités Motrices et Sportives (CIAMS) à la Faculté des sciences du sport de l’Université Paris-Saclay.

 

Ses recherches portent sur l’étude des relations internationales dans le champ sportif, principalement entre la France et certains pays africains. Sous la coupe des Postcolonial studies, sa thèse de doctorat en STAPS envisage la construction des relations entre la France et le Kenya en courses de fond comme un processus postcolonial singulier. Bien que les deux nations n’aient pas eu de liens coloniaux, l’évolution de leurs relations athlétiques reprend des modes de domination ou de fonctionnement similaires aux rapports de domination coloniaux ou postcoloniaux caractérisant l’ex-empire colonial français au sein d’un espace sportif mondialisé.

 

Ses recherches actuelles explorent également les relations postcoloniales, au sens plus « conventionnel » du terme, entre la France et les pays d’Afrique francophone en athlétisme, s’intéressant notamment à l’institutionnalisation de la Francophonie dans le champ sportif au sein d’un processus ambivalent oscillant entre poursuite d’un rapport de domination culturelle et « aide au développement » dans une perspective émancipatrice.

 

Cyril Thomas s’intéresse enfin aux questions raciales dans le champ sportif, notamment en coorganisant le séminaire Sport et racialisation, en partenariat avec la Maison des Sciences de l’Homme Paris-Saclay et le laboratoire Printemps de l’UVSQ, au sein duquel interviennent divers·es chercheuses et chercheurs analysant l’expression de la race dans le champ sportif dans une perspective intersectionnelle. Il analyse lui-même les processus de racialisation concernant l’évolution des représentations des journalistes ou des responsables fédéraux français sur la domination kényane dans les courses de fond qu’il met en relation avec les représentations sur la domination chinoise en tennis de table dans une démarche comparative, révélant différentes appréhensions de la racialisation selon les populations et les activités sportives concernées.

 

S’appuyant sur son expérience professionnelle antérieure d’enseignant spécialisé dans les 1er et 2nd degrés, il co-dirige la Licence Staps éducation et motricité 1er degré, préparant les étudiant·es au concours de recrutement des professeurs des écoles.

 

Lien vers les publications : https://cv.hal.science/cyrilthomas

 

« S’intéresser aux représentations de l’altérité du point de vue de l’Histoire, c’est contribuer à défaire les images qu’elle a figées ».

 

-> Contact : cyril.thomas@universite-paris-saclay.fr

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November 5, 4:24 PM
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Céline Chevaleyre, lauréate du Prix Pharmacie « toutes spécialités » de la Chancellerie des universités de Paris

Céline Chevaleyre, lauréate du Prix Pharmacie « toutes spécialités » de la Chancellerie des universités de Paris | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le 3 novembre 2025, la Chancellerie des universités de Paris a annoncé les lauréates et lauréats des prix solennels de thèse 2025. Pour cette nouvelle édition, ce sont 53 prix qui ont été décernés par la Chancellerie. Huit ont récompensé des docteures et docteurs de l’Université Paris-Saclay, parmi lesquels Céline Chevaleyre a obtenu le Prix Pharmacie « toutes spécialités ». Docteure de l’Université Paris-Saclay, elle est récompensée pour sa thèse « Intégration de la modélisation pharmacocinétique dans l'étude par imagerie immunoTEP de la réponse du glioblastome à l’immunothérapie combinée aux ultrasons thérapeutiques » effectuée au laboratoire d'imagerie Biomédicale multimodale Paris-Saclay (Biomaps – Univ. Paris-Saclay/Inserm/CEA/CNRS), sous la direction de Charles Truillet, chercheur spécialiste d’immunoTEP et directeur de l’équipe Imagerie en oncologie du laboratoire Biomaps.

 

-> Contact : celine.chevaleyre@universite-paris-saclay.fr

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November 5, 9:46 AM
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Un cours de biodiversité avec Franck Courchamp - C'est pas du vent sur RFI

Un cours de biodiversité avec Franck Courchamp - C'est pas du vent sur RFI | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Tout ce que vous avez toujours voulu savoir sur la biodiversité sans jamais oser le demander, c’est ce que nous vous proposons avec l’écologue Franck Courchamp qui vient de réaliser sa leçon inaugurale au Collège de France. (Rediffusion du 03/04/25)

 

Mais pourquoi s'intéresser à la biodiversité ? Ce ne sont que des plantes et des animaux ? Et bien pas uniquement, il y a des organismes vivants extraordinaires que nous ne voyons pas mais surtout la biodiversité est essentielle aux processus qui soutiennent toute la vie sur Terre, y compris celle des humains. Nous faisons partie de cette grande toile du vivant. Par exemple, nous abritons dans et sur notre corps des champignons, des bactéries et des virus qui sont directement reliés à ceux qui nous entourent. Donc si les organismes qui vivent autour de nous sont malades, il y a des risques que nous le soyons aussi...

 

Avec l'écologue Franck Courchamp, directeur de recherche 1re classe au CNRS, à l’Institut national d’écologie et environnement. Il dirige à l’Université Paris-Saclay, une équipe de recherche sur la dynamique de la biodiversité et les impacts des activités humaines sur les écosystèmes et les espèces (Laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE, CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette). Il est professeur au Collège de France sur la Chaire Biodiversité et écosystèmes.

 

-> Contact : franck.courchamp@cnrs.fr

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November 5, 9:19 AM
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Journée Scientifique ITAC 2025

La Journée Scientifique du DIM ITAC est de retour pour sa seconde édition le lundi 1er décembre 2025 à partir de 13h30.

 

Un programme riche (visible ci-dessus) vous attend, porté par les équipes de recherche financées par le DIM ITAC qui y présenteront l’avancée de leurs travaux de recherche.

 

Ouverte à la communauté scientifique francilienne, cette journée se veut également un espace d’échange autour des thématiques du DIM ITAC : cancer, auto-immunité, immunothérapies.

 

📅 Lundi 1er décembre 2025, 13h30 - 18h

 

📍 Auditorium du bâtiment de Recherche, Faculté de Médecine - Université Paris-Saclay, 63 Rue Gabriel Péri, 94270 Le Kremlin-Bicêtre

 

🚇 Le Kremlin-Bicêtre (ligne 7) ou Hôpital Bicêtre (ligne 14)

 

📄 Programme préliminaire

 

Inscription gratuite mais obligatoire

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