Life Sciences Université Paris-Saclay
888.7K views | +139 today
 
Scooped by Life Sciences UPSaclay
onto Life Sciences Université Paris-Saclay
September 29, 2020 7:36 AM
Scoop.it!

La moisissure blanche et duveteuse qui recouvre les fromages à pâte molle type Camembert et Brie est domestiquée et s’est diversifiée en deux variétés aux caractères distincts

La moisissure blanche et duveteuse qui recouvre les fromages à pâte molle type Camembert et Brie est domestiquée et s’est diversifiée en deux variétés aux caractères distincts | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

En séquençant une soixantaine de génomes de Penicillium camemberti - la moisissure blanche et duveteuse utilisée en fromagerie pour affiner les fromages type Camembert -, une équipe française (Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution - ESE, CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Orsay), en collaboration avec le Laboratoire universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (Université de Brest, Plouzané), a montré que cette moisissure était issue d’un réel processus de domestication, en plusieurs étapes, menant à différentes variétés. Le processus est tout à fait similaire à celui de la domestication du chien à partir du loup, générant différentes races, par sélection humaine pour différentes apparences et comportements.

 

Chez ces moisissures du fromage, un premier événement de domestication a conduit à l’émergence de la moisissure domestiquée bleue-grise nommée P. biforme, qu’on retrouve par exemple sur les fromages frais de chèvre. Un deuxième événement de domestication, plus récent, a donné la lignée clonale blanche et duveteuse si typique en surface des camemberts et bries, P. camemberti. Les bries étaient en effet bleus jusqu’au milieu du XXème siècle (cf peinture de MJ Justin), et une moisissure mutante blanche a été sélectionnée car elle apparaissait plus appétissante. Les deux espèces domestiquées P. camemberti et P. biforme montrent des caractères avantageux pour l’affinage des fromages par rapport à l’espèce sauvage proche : elles sont plus blanches, elles poussent plus rapidement sur fromage en condition de cave d’affinage de camembert, elles produisent moins ou même pas du tout d’une certaine toxine potentiellement dangereuse pour l’Homme, et elles ont une meilleure capacité d’exclusion des compétiteurs.

 

Cette étude parue dans Current Biology a aussi mis en évidence deux variétés de P. camemberti aux caractères très différents, apparemment associées aux différents types de fromage : une variété pour les fromages type Camembert et Brie, de couleur blanche et très duveteuse, qui pousse peu radialement mais beaucoup verticalement, et une autre variété pour les fromages type Saint Marcellin, plus grise et moins duveteuse, qui ne produit pas du tout de la toxine étudiée.


Cette étude n’a pas seulement un intérêt fondamental, mais aussi un impact pour les industriels.

 

Contact : jeanne.ropars@universite-paris-saclay.fr

No comment yet.
Life Sciences Université Paris-Saclay
BioSphERa • Life Sciences and Health • Health and Drug Sciences • Santé Publique • Sport Mouvement et Facteur Humain
Your new post is loading...

Popular Tags

Scooped by Life Sciences UPSaclay
May 30, 12:47 PM
Scoop.it!

FOCUS PLATEFORME : Protopia : le laboratoire de prototypage et de formulation des ingrédients fabriqués par fermentation de précision

FOCUS PLATEFORME : Protopia : le laboratoire de prototypage et de formulation des ingrédients fabriqués par fermentation de précision | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Ce jour, place à un FOCUS PLATEFORME sur Protopia, une nouvelle plateforme de prototypage avancé et de formulation d'ingrédients : un nouvel élément clé pour la bioéconomie Française ?

 

Inaugurée le 28 mai 2025 par Valérie Pécresse, présidente de la Région Île-de-France, en présence de Stéphane Beaudet, président de Genopole, Protopia représente une avancée majeure dans le paysage biotechnologique français. Située sur le campus d'Évry-Courcouronnes, cette infrastructure lancée par Genopole est dédiée à l'accompagnement des projets biotech, de l'idée au prototype. Elle offre un environnement sécurisé et flexible pour la formulation et l'analyse de bio-ingrédients, servant les secteurs de la foodtech, de la cosmétique et des biomatériaux.

 

Protopia s'intègre parfaitement dans le processus d'industrialisation des bioprocédés de fermentation, complétant ainsi l'infrastructure GATEX. Ce laboratoire de prototypage, équipé d'espaces modulaires de niveaux de confinement L1 et L2, est conçu pour soutenir les entreprises Biotech, les startups et les laboratoires du domaine de la bioéconomie. Il favorise non seulement les projets issus de la fermentation de précision mais aussi ceux basés sur des procédés d'extraction en chimie verte. En tant que pont entre la recherche fondamentale et le marché, Protopia s'inscrit dans la stratégie de Genopole et de Paris-Saclay pour créer un continuum territorial intégrant recherche, prototypage et production, renforçant ainsi une bioéconomie française responsable et autonome.

 

Quelle est l’origine du nom ? Le terme Protopia renvoie à une vision réaliste et positive de l’avenir où le monde s’améliore progressivement. Contrairement à l’utopie (monde parfait) ou la dystopie (monde catastrophique), protopia décrit un futur meilleur mais imparfait marqué par des avancées lentes et continues.

 

Quelles sont les missions de Protopia ? L’objectif premier de Protopia est d’offrir un cadre professionnel sécurisé pour transformer des ingrédients issus de procédés de fermentation en premiers prototypes. Il permet de tester la robustesse et la reproductibilité des prototypes, d’effectuer des analyses de qualité et d’ajuster les formulations avant leur industrialisation. Julien Picot, directeur adjoint délégué aux infrastructures et plateformes technologiques du GIP Genopole, souligne que « Protopia joue un rôle clé dans la chaîne d’innovation en fournissant un environnement maîtrisé pour transformer les bio ingrédients issus de fermentations de précision en prototypes industriels. Cette étape est essentielle pour garantir la qualité et la reproductibilité des produits avant la montée en échelle, et ainsi sécuriser les projets Biotech. Elle illustre parfaitement notre engagement à structurer une chaîne complète d’innovation, du laboratoire à l’industrialisation, en offrant aux acteurs de la biotech un environnement adapté pour développer et sécuriser leurs prototypes. C’est un levier majeur pour renforcer la compétitivité et la souveraineté de la filière bioéconomie  ». Protopia joue également un rôle d’acculturation à la formulation industrielle pour les chercheurs et entrepreneurs, favorisant le passage du laboratoire au prototype commercial.

 

Quels sont les équipements disponibles ? Le plateau analytique partagé de Protopia dispose d’équipements de pointe dédiés à l’analyse des formulations et de leur stabilité : texturomètre, viscosimètre, rhéomètre, réfractomètre, colorimètre, lyophilisateur, dessiccateur, tamiseuse… La cuisine professionnelle conforme aux normes HACCP permet la formulation d’ingrédients alimentaires.

 

Quels sont les services proposés ? Les utilisateurs de Protopia bénéficient d’un accompagnement complet : accès à des boxs privés et espaces mutualisés, équipements d’analyses des formulations et de leur stabilité, appui d’un Lab Manager, et prestations sur mesure selon le stade de développement. Certains projets combinent prototypage, formulation, tests analytiques et ajustements itératifs pour structurer leur offre avant industrialisation. En savoir plus ?

 

Destinée aux startups, PME et laboratoires académiques, Protopia fonctionne sur un modèle locatif : réservation des espaces nécessaires (box, cuisine, laboratoire de culture, plateau analytique, etc.), formation aux équipements par le Lab Manager et proposition de services annexes. Pour obtenir plus d’informations ou venir visiter Protopia, contactez-nous via Protopia@genopole.fr

 

Protopia, un ancrage régional fort : Protopia constitue un maillon essentiel de l’écosystème Genopole et de Paris-Saclay, complétant GATEX, pour créer un continuum entre la recherche et développement, le prototypage et la montée en échelle. Installée au cœur de l’écosystème Genopole, Protopia est immédiatement connectée aux plateformes analytiques, réseaux d’experts, programmes d’accélération et aux financements régionaux. Cette articulation d’infrastructures traduit la vision conjointe de Genopole et de la Région d’un écosystème biotech intégré et souverain. Protopia participe à des initiatives européennes comme le consortium APROVALS, axé sur l’agriculture cellulaire, et s’ouvre à des partenariats internationaux pour accélérer l’innovation foodtech. À terme, Protopia vise à renforcer la compétitivité des startups dans les segments cosmétiques, biomatériaux et des protéines alternatives, un domaine émergent.

 

-> Contact : Protopia@genopole.fr

 

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

 

GENOPOLE / PROTOPIA - Plateforme de prototypage avancé et de formulation d'ingrédients. Protopia est une plateforme de prototypage avancé inaugurée par Genopole pour accompagner les start-up biotech, en particulier dans les secteurs de la fermentation de précision. La force de Protopia repose sur une intégration multidisciplinaire : elle combine des laboratoires de culture cellulaire (niveaux L1 et L2), un laboratoire de microbiologie, des espaces dédiés à la formulation et à l’analyse des ingrédients issus de procédés biotechnologiques. Ces laboratoires permettent de concevoir, tester et affiner des prototypes de produits issus de la fermentation de précision, dans des conditions proches des marchés finaux (agroalimentaire, cosmétique, nutrition-santé). Protopia dispose également d’un plateau analytique sophistiqué, équipé de très nombreux équipements tels que texturomètre, rhéomètre, viscosimètre, colorimètre, réfractomètre, analyseur d’humidité, etc., ce qui permet d’évaluer rigoureusement les propriétés physico-chimiques (aspect, texture, stabilité…) des prototypes. En complément, une cuisine professionnelle (zone HACCP) est aménagée pour préparer des formulations alimentaires testables, avec des équipements industriels (fours mixtes, friteuses, etc.). Grâce à ce dispositif, les start-ups peuvent transformer un ingrédient issu d’un procédé biotech en produit pré-commercial, sans nécessiter des investissements trop lourds dès le départ, et en réduisant les coûts et délais liés à l’externalisation. L’approche collaborative et mutualisée de Protopia favorise les synergies entre entreprises, permettant des partenariats intersectoriels (foodtech, cosmétique, biomatériaux) autour de projets communs. Protopia dispose également de cinq box d’environ 10 m² chacun, pour offrir des espaces de travail flexibles et privés. Par ailleurs, Protopia joue un rôle stratégique dans la politique France 2030, en soutenant la bioéconomie durable et la transition vers des processus biotechnologiques plus propres et décarbonés. Elle offre également un accompagnement scientifique et business à ses usagers — des conseils pour la montée en échelle, la pré-industrialisation, et le prototypage sont disponibles pour les start-ups. L’ambition de Protopia est donc de combler un maillon essentiel dans la chaîne de valeur biotech : non seulement en validant des concepts moléculaires, mais aussi en leur donnant une forme de produit tangible, prête à être testée et commercialisée. Intégrée au cœur de l’écosystème Genopole, cette infrastructure renforce l’écosystème régional d’innovation et favorise l’émergence d’une filière biotech souveraine et durable.

 

A propos de Genopole. Biocluster français dédié à la recherche en génétique et aux biotechnologies appliquées à la santé et à l’environnement, Genopole rassemble 78 entreprises de biotechnologies, 16 laboratoires de recherche, 23 infrastructures, plateformes et plateaux techniques mutualisés, ainsi que des formations universitaires (Université Évry Paris-Saclay). Son objectif : soutenir les entreprises de biotechnologies et le transfert de technologies vers le secteur industriel, favoriser le développement de la recherche dans les sciences de la vie, développer des enseignements de haut niveau dans ces domaines. Genopole est un Groupement d’intérêt public principalement soutenu par l’État, la Région Ile-de-France, l’agglomération Grand Paris Sud et l’AFM-Téléthon.

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 5, 5:42 PM
Scoop.it!

L'Université Paris-Saclay et ses partenaires à Viva Technology 2026

L'Université Paris-Saclay et ses partenaires à Viva Technology 2026 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L'événement start-up et tech numéro 1 en Europe, Viva Technology, revient cette année du 17 au 20 juin 2026 à Paris Expo, Porte de Versailles. Venez y rencontrer l'Université Paris-Saclay et découvrir des projets et start-up de son écosystème.

Événement d'envergure internationale, Viva Technology est le rassemblement des innovations et des transformations répondant aux grands enjeux sociétaux, environnementaux, économiques et humains d'aujourd'hui et de demain.

Sur son stand, 3H19, l'Université Paris-Saclay sera cette année accompagnée de l’Université d'Évry et de l’UVSQ, universités membres-associés, des quatre grandes écoles AgroParisTech, CentraleSupélec, l'École normale supérieure Paris-Saclay et l'Institut d'Optique Graduate School, de deux organismes nationaux de recherche partenaires, INRAE et Inria, ainsi que de l'incubateur IncubAlliance Paris-Saclay, de la SATT Paris-Saclay et de l’institut de recherche en intelligence artificielle DATAIA. Plusieurs start-up issues de la communauté universitaire et du territoire Paris-Saclay seront également présentes sur le stand.

Au cœur d’un cluster technologique qui représente 13 % de la R&D française, l’Université Paris-Saclay, première université en France et dans le Top 20 mondial, a fait le choix de placer l’innovation au cœur de sa stratégie, sur le même plan que la recherche et la formation, et l’intègre pleinement à ses missions.

L’université est porteuse du pôle universitaire d’innovation (PUI) Innovation Alliance Université Paris-Saclay, labellisé en juillet 2023 et regroupant l’Université Paris-Saclay, l’Université d’Évry, l’Université de Versailles - Saint-Quentin-en-Yvelines, AgroParisTech, CentraleSupélec, l’ENS Paris-Saclay, l’Institut d’Optique Graduate School, le CNRS, le Genopole, INRAE, Inria, l’Inserm, IncubAlliance Paris-Saclay, la SATT Paris-Saclay, et dix-sept partenaires, et financé par l’État dans le cadre de France 2030. Pour la troisième année consécutive depuis la labellisation de ce PUI, Viva Technology sera une nouvelle occasion pour l'université de renforcer la renommée du PUI et d'accroître sa visibilité internationale.

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 5, 5:31 PM
Scoop.it!

Le Paris-Saclay Cancer Cluster lance un fonds de 2,5 millions d'euros pour les start-up qui innovent contre le cancer

Le Paris-Saclay Cancer Cluster lance un fonds de 2,5 millions d'euros pour les start-up qui innovent contre le cancer | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Transformer les résultats de la recherche en produit industriel. A Villejuif, dans le sud de Paris, le Paris-Saclay Cancer Cluster (PSCC) est en pleine effervescence. Ce pôle d'excellence consacré à la lutte contre le cancer ne cesse de grandir. Il vient de donner un coup d'accélérateur pour aider financièrement dix start-up à franchir une étape importante de leur croissance. « L'argent, c'est le nerf de la guerre. Or, nous avons constaté un vrai déficit de l'investissement dans les biotechs, même si cela reprend un peu », remarque Eric Vivier, président du Paris-Saclay Cancer Cluster.

 

C'est pourquoi, le cluster après deux ans de négociation avec Bercy, a mis de l'argent sur la table. Dix start-up - parmi les 78 déjà accompagnées par le PSCC - vont recevoir une somme allant de 120.000 euros à 250.000 euros. Ce fonds qui pourrait aller jusqu'à 2,5 millions d'euros doit permettre aux jeunes pousses de réaliser des tests, de passer à l'échelle, d'avancer dans leurs essais cliniques, de préparer un dossier réglementaire, ou encore de lancer un développement commercial.

 

Lire la suite de l’article dans Les Echos (sur abonnement)

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 5, 5:19 PM
Scoop.it!

Ce que les émojis racontent de la biodiversité - Tatiana Giraud dans The Conversation

Ce que les émojis racontent de la biodiversité - Tatiana Giraud dans The Conversation | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Qui n’a jamais agrémenté un message d’une petite fleur ou d’un singe moqueur ? Les émojis font désormais partie de notre quotidien, mais que disent-ils de notre rapport au vivant ? C’est la question posé par le media The Conversation à Tatiana Giraud.

 

Tatiana Giraud est Directrice de Recherche au CNRS, chercheuse en biologie de l'évolution au Laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette), elle vient de publier aux éditions Tana "La Biodiversité en Infographies. Urgence du vivant : comprendre pour agir".

 

Lire l’article

 

-> Contact : tatiana.giraud@universite-paris-saclay.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 5, 5:08 PM
Scoop.it!

Programme Danube 2027-2028

Programme Danube 2027-2028 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

En complément des sept Partenariats Hubert Curien (PHC) bilatéraux franco-autrichien (Amadeus), franco-bulgare (Rila), franco-tchèque (Barrande), franco-croate (Cogito), franco-serbe (Pavle Savić) et franco-slovaque (Stefanik), et le franco-slovène (Proteus), le PHC Danube finance conjointement des projets régionaux impliquant 3 et plus pays de la région du Danube participants (Autriche, Bulgarie, Croatie, Monténégro, République tchèque, Serbie, Slovaquie, Slovénie) et la France.

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 5, 12:52 PM
Scoop.it!

Philippe Charlier sur France 5 : "L'histoire au scalpel : Raphaël, les secrets des reliques"

Philippe Charlier sur France 5 : "L'histoire au scalpel : Raphaël, les secrets des reliques" | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Philippe Charlier s'intéresse à l'un des maîtres de la Renaissance, le peintre italien Raphaël, mort mystérieusement en pleine gloire, à seulement 37 ans. En 1520, après 15 jours de fièvre, ce peintre majeur disparaissait. Pleuré par ses contemporains, il aura droit à de grandioses funérailles au Vatican. Depuis, son corps repose dans un tombeau au cœur du Panthéon de Rome. Heureusement, un moulage de son crâne a été conservé à Urbino, sa ville natale, et des ossements ont été archivés dans un musée de Montauban, grâce à l'admiration que lui portait le peintre français Ingres. Grâce à ces reliques, Philippe Charlier va tenter de reconstituer le carnet de santé de cet artiste et éclairer les causes de sa mort.

 

Philippe Charlier est paléopathologiste : à la fois médecin, légiste, archéologue et anthropologue. Il est directeur du LAAB - Laboratoire Anthropologie, Archéologie, Biologie (UVSQ/UPSaclay), lauréat de la Chaire UNESCO "Anthropologie, Archéologie et Histoire de l'esclavage transatlantique" et Vice-Doyen (culture & patrimoine) de l’UFR Simone Veil – Santé à l’UVSQ.

 

Voir l’émission sur Raphaël et également celle sur Voltaire diffusée sur France 5.

 

-> Contact : philippe.charlier@uvsq.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 2, 4:39 PM
Scoop.it!

Rencontre-Dédicace avec Frédéric Boccard - 25 juin 2026 à Liragif

Rencontre-Dédicace avec Frédéric Boccard - 25 juin 2026 à Liragif | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Rencontre-Dédicace avec Frédéric Boccard

Le 25 Juin 2026 de 19h00 à 20h00

Librairie Liragif

15 Square de la Mairie , 91190 Gif-sur-Yvette

 

Pour Génomes, la construction du vivant

paru aux éditions CNRS

 

Une présentation des génomes, de leur séquençage et des innovations permises par leur analyse en biologie. Les auteurs exposent comment l'étude de cette information génétique permet de dévoiler les mécanismes de l'évolution, de retracer l'histoire adaptative des espèces ou encore de décrypter le fonctionnement intime des virus.

 

Frédéric Boccard est directeur de recherche CNRS, directeur de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule – I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette).

 

-> Contact : frederic.boccard@i2bc.paris-saclay.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 2, 4:13 PM
Scoop.it!

La longueur de l'espaceur PEG, déterminante pour l'activité des PROTACs dérivés de Retro-2

La longueur de l'espaceur PEG, déterminante pour l'activité des PROTACs dérivés de Retro-2 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans European Journal of Medicinal Chemistry, les scientifiques du laboratoire de biologie chimique du SIMoS et du laboratoire de chimie bioorganique du SCBM (DMTS, CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) s’intéressent aux PROTACs, des molécules bifonctionnelles capables de dégrader sélectivement des protéines, y compris celles considérées comme « non ciblables » par les approches classiques. Ces composés exploitent le système ubiquitine-protéasome en recrutant des ligases E3 telles que CRBN afin d’induire une dégradation ciblée.

 

Les chercheurs ont développé de nouveaux PROTACs basés sur des dérivés de Retro-2, une molécule connue pour son activité contre diverses toxines et pathogènes en perturbant le trafic intracellulaire. Ces nouveaux composés combinent un ligand de CRBN dérivé du thalidomide, un dérivé de Retro-2 et des espaceurs PEG de longueurs variables, en vue d'une validation mécanistique de leur mode d’action.

 

Les résultats obtenus ne confirment pas la dégradation des protéines cibles initialement identifiées, contrairement aux hypothèses de travail. Cependant, certaines molécules, notamment celles avec un espaceur court (PEG-2), provoquent la dégradation du facteur de terminaison de la traduction GSPT1, un néosubstrat de CRBN. Cette élimination par le protéasome dépend directement de la longueur de l'espaceur PEG, soulignant l’importance de ce paramètre structural dans l’efficacité des PROTACs.

 

-> Contact : julien.barbier@cea.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 2, 3:57 PM
Scoop.it!

De l’évolution des plantes aux fragrances : origine du sclaréol chez la sauge sclarée

De l’évolution des plantes aux fragrances : origine du sclaréol chez la sauge sclarée | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Nature Communications, les scientifiques de l’Institut des Sciences des Plantes Paris-Saclay - IPS2 (CNRS/INRAE/UEVE/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) ont décrypté l’origine évolutive de la biosynthèse du sclaréol chez la sauge sclarée (Salvia sclarea), une plante aromatique utilisée dans l’industrie de la parfumerie et des cosmétiques.

 

Le sclaréol est un composé naturel servant notamment à la production de l’ambroxide, une molécule très recherchée pour les fragrances ambrées. En combinant génomique de nouvelle génération, pan-génomique, analyses de chromatine et biologie fonctionnelle, les chercheurs ont montré comment la duplication d’un gène suivie de modifications enzymatiques et régulatrices a permis l’apparition de cette voie métabolique spécialisée au cours de l’évolution.

 

L’étude s’appuie notamment sur la production d’un génome complet « télomère à télomère » de la sauge sclarée ainsi que sur une pan-génomique du genre Salvia. Ces travaux apportent de nouvelles connaissances sur l’évolution des métabolismes spécialisés chez les plantes et ouvrent des perspectives pour le développement durable de molécules naturelles à haute valeur ajoutée pour les secteurs des biotechnologies végétales, de la cosmétique et des fragrances.

 

-> Contact : adnane.boualem@inrae.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 2, 6:13 AM
Scoop.it!

Neuropathies périphériques et lymphoproliférations T : une étude multicentrique précise les mécanismes en cause

Neuropathies périphériques et lymphoproliférations T : une étude multicentrique précise les mécanismes en cause | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Neurology, les scientifiques de l’AP-HP, de l’Université Paris-Saclay, de l’Inserm, du CEA et leurs collaborateurs français et suisses ont étudié les neuropathies périphériques associées aux lymphoproliférations T, une complication rare et encore mal caractérisée. L’étude rétrospective multicentrique a inclus 19 patients pris en charge dans 17 centres de référence des neuropathies périphériques.

 

Les chercheurs montrent que ces neuropathies relèvent principalement de deux mécanismes : une infiltration tumorale directe des nerfs, appelée neurolymphomatose, et des neuropathies dysimmunes. La neurolymphomatose représentait 58 % des cas et était souvent associée à des formes multifocales sévères, douloureuses, motrices ou avec atteinte des nerfs crâniens. Les neuropathies dysimmunes, plus souvent démyélinisantes, étaient notamment observées dans les lymphomes T angioimmunoblastiques.

 

Comparées aux neuropathies associées aux lymphoproliférations B, celles liées aux lymphoproliférations T étaient plus sévères au diagnostic, avec davantage de handicap fonctionnel et une proportion plus élevée de neurolymphomatose. Ces résultats soulignent l’importance d’un diagnostic précoce et d’une prise en charge adaptée au mécanisme neurologique sous-jacent.

 

-> Contact : nicolas.noel@aphp.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 2, 5:39 AM
Scoop.it!

Une analyse structurale révèle comment Ku stimule WRN

Une analyse structurale révèle comment Ku stimule WRN | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Nature Communications, des chercheurs de l’Université Paris-Saclay (I2BC, CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette ; UMR 9019 CNRS/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif), en collaboration avec plusieurs partenaires européens (l’IPBS de Toulouse, l’Institute for Research in Biomedicine de Bellinzone en Suisse, l’Istituto Superiore di Sanità de Rome et l’Université de Leicester au Royaume-Uni), ont mis en évidence comment le complexe Ku70/Ku80 (Ku), un facteur clé de reconnaissance des extrémités d’ADN lésées, stimule l’activité de l’exonucléase WRN afin de protéger les fourches de réplication soumises à un stress réplicatif.

 

WRN est une enzyme impliquée dans le maintien de la stabilité du génome au cours de la réplication et de la réparation de l’ADN. Des mutations du gène WRN sont responsables du syndrome de Werner, une maladie génétique rare associée à un vieillissement prématuré et à une forte prédisposition au cancer. Grâce à la cryo-microscopie électronique, une technique d’imagerie à haute résolution, les chercheurs ont obtenu la première structure du complexe formé entre WRN, Ku et l’ADN. Cette analyse révèle comment Ku recrute et positionne WRN sur les extrémités de l’ADN. Les chercheurs identifient également une interface d’interaction spécifique entre le domaine exonucléase de WRN et le domaine SAP de Ku70, et montrent que la perturbation de cette interaction compromet la protection des fourches de réplication contre une dégradation excessive de l’ADN.

 

Ces travaux apportent ainsi une nouvelle compréhension structurale et fonctionnelle des mécanismes qui protègent l’ADN lors du stress réplicatif, et pourraient contribuer au développement de nouvelles stratégies contre certaines maladies liées au vieillissement ou au cancer.

 

-> Contact : virginie.ropars@i2bc.paris-saclay.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
May 26, 5:15 AM
Scoop.it!

Une meilleure hydrolyse de la pipéracilline à l’origine de la diffusion des variants R214G de la carbapénèmase de type OXA-48

Une meilleure hydrolyse de la pipéracilline à l’origine de la diffusion des variants R214G de la carbapénèmase de type OXA-48 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La résistance aux antibiotiques, en particulier aux β-lactamines, représente un enjeu majeur de santé publique. Le principal mécanisme de résistance repose sur l’hydrolyse de ces antibiotiques par des enzymes appelées β-lactamases. Certaines, les carbapénèmases, inactivent les carbapénèmes, antibiotiques de dernier recours contre les infections à bacilles à Gram négatif.

 

En France, les carbapénèmases de type OXA-48 représentent 60,6% des entérobactéries productrices de carbapénèmases (EPC) isolées en 2022. Parmi elles, les variants R214G sont de plus en plus fréquemment détectés en France et dans le monde, bien que considérés comme des variants à perte de fonction et difficiles à détecter. En effet, la mutation R214G déstabilise le site actif de l’enzyme et réduit l’hydrolyse de plusieurs β-lactamines, notamment la témocilline et les carbapénèmes.

 

Dans une étude récente publiée dans Antimicrobial Agents and Chemotherapy, les chercheurs de l’équipe RESIST de l’UMR-S 1184 (INSERM/UPSaclay/CEA et CHU de Bicêtre, Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, AP-HP, Le Kremlin-Bicêtre), en collaboration avec l’Institut de Chimie des Substances Naturelles – ICSN (CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), ont montré que l’utilisation de l’association pipéracilline-tazobactam, un antibiotique à large spectre fréquemment utilisé à l’hôpital, pourrait favoriser la sélection des variants R214G. En effet, une analyse fine des propriétés enzymatiques des variants R214G a montré que la plupart des β-lactamines sont moins bien hydrolysées, à l’exception de la pipéracilline, entraînant des hauts niveaux de résistance chez Escherichia coli. Les analyses enzymatiques et les modélisations structurales ont révélé que la substitution R214G améliore le positionnement et l’hydrolyse de la pipéracilline, conférant ainsi un avantage sélectif à ces variants.

 

Légende Figure : Modélisation des interactions entre la pipéracilline et différents variants d’OXA-48 prédites par intelligence artificielle (Chai-1). (A, B) Interaction entre OXA-48 R214G (OXA-244) en vert) et la pipéracilline (cyan) : (A) représentation en surface de l’enzyme ; (B) représentation détaillée de la structure moléculaire. (C et D) Interaction entre OXA-48 (magenta) et la pipéracilline (rose) : (C) représentation en surface de l’enzyme ; (D) représentation détaillée de la structure moléculaire montrant des « clashes » avec le résidu R214, empêchant un positionnement optimal de la pipéracilline. (E) Positionnement de la pipéracilline dans le site actif d’OXA-48 : la pipéracilline (rose) présente des conflits avec le résidu R214. La position adoptée par la pipéracilline dans OXA-48 R214G (OXA-244) (cyan) est également représentée avec la surface d’OXA-48 (magenta). (F) Positionnement de la pipéracilline dans le site actif de OXA48 R214G (OXA-244) : la pipéracilline (cyan) peut se positionner plus facilement dans le site actif. La pipéracilline positionnée dans OXA-48 R214S (OXA-1167) (gris) adopte une conformation différente afin d’éviter les conflits avec le résidu S214. La surface de OXA-48 R214G (OXA-244) (bleu) avec G214 (orange).

 

-> Contact : reva.nermont@universite-paris-saclay.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
May 26, 5:28 AM
Scoop.it!

CroCoDeEL : un nouvel outil pour fiabiliser la recherche sur le microbiote

CroCoDeEL : un nouvel outil pour fiabiliser la recherche sur le microbiote | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le séquençage métagénomique permet de caractériser à haut débit des communautés microbiennes complexes telles que le microbiote intestinal humain. Cette approche demeure toutefois exposée à un biais technique majeur : la contamination croisée, un transfert accidentel d’ADN d’un échantillon à un autre lors des étapes de préparation en laboratoire. Non détectée, cette contamination conduit à attribuer à un échantillon des micro-organismes en réalité absents, compromettant la validité des résultats.

 

Pour y remédier, des chercheurs des unités MetaGenoPolis et MaIAGE (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas) et de l'IRD ont développé CroCoDeEL, un logiciel dédié à la détection et à la quantification de telles contaminations. L'outil s'appuie sur l'analyse des profils d'abondance taxonomique afin d'identifier des signatures de transfert d’espèces entre échantillons, signe de contamination. Grâce à des approches combinant modélisation statistique et apprentissage automatique, CroCoDeEL permet d'en estimer le niveau (y compris à très faibles taux) et d’identifier l’échantillon source. Publiée dans Nature Communications, l'étude associée révèle des contaminations critiques passées inaperçues dans plusieurs travaux de référence fortement cités : certains transferts microbiens mère-enfant décrits dans la littérature relèveraient ainsi d'artefacts techniques plutôt que de transmissions biologiques avérées, invitant à une réévaluation de résultats antérieurs.

 

Désormais librement accessible à la communauté scientifique internationale, CroCoDeEL constitue un dispositif de contrôle qualité simple pour renforcer la fiabilité des données métagénomiques et propose une interface web. Déjà adopté par plusieurs centres de recherche, il est mobilisé dans des projets d'envergure portés par l'INRAE, tel que French Gut, qui vise à cartographier le microbiote de 100 000 participants.

 

-> Contact : emmanuelle.lechatelier@inrae.fr / guillaume.gautreau@inrae.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 5, 5:58 PM
Scoop.it!

Clinical Trial Call 2026

Clinical Trial Call 2026 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Cet appel vise à soutenir les essais cliniques interventionnels multinationaux de phase I, I/II et II, conformes aux Bonnes Pratiques Cliniques (BPC), portant sur les maladies rares.

 

Son objectif est de générer des données cliniques robustes et, le cas échéant, des données pertinentes sur le plan réglementaire afin de faciliter les échanges futurs avec les autorités compétentes et le développement clinique ultérieur.

 

Cet appel à projets vise à répondre aux défis spécifiques des essais cliniques dans les maladies rares, où les populations de patients sont souvent petites et géographiquement dispersées, ce qui rend la collaboration multinationale essentielle.

 

Les candidatures portant sur toutes les maladies rares éligibles sont les bienvenues.

 

L’appel encourage particulièrement les propositions ciblant :

  • Maladies rares pédiatriques
  • Maladies rares à progression rapide
  • Maladies rares ne disposant pas d'options thérapeutiques approuvées ou présentant un besoin médical résiduel important non satisfait malgré les traitements existants

 

Ces domaines prioritaires ne constituent pas des critères d’éligibilité, mais peuvent être pris en compte lors de la priorisation stratégique lorsque les propositions sont par ailleurs de qualité scientifique équivalente.

 

Interventions admissibles :

  • Petites molécules, y compris les médicaments réutilisés
  • Médicaments de thérapie innovante (MTI) (à condition que le procédé de fabrication ait été développé et validé dans des conditions BPF appropriées pour une utilisation en phase I/II)
  • Produits biologiques et nouvelles entités biologiques (NEB)
  • Produits biologiques réutilisés

 

Pays participants : Autriche, Belgique, Bulgarie, Canada, Chypre, République tchèque, Danemark, Estonie, France, Allemagne, Hongrie, Irlande, Israël, Italie, Lettonie, Lituanie, Luxembourg, Norvège, Pologne, Portugal, Roumanie, Slovaquie, Espagne, Suède, Pays-Bas, Turquie et Royaume-Uni.

 

Les organismes admissibles comprennent les universités et les instituts de recherche, les hôpitaux et les centres cliniques, les organismes de recherche et les fondations à but non lucratif, les associations de défense des droits des patients et les PME (sous réserve de dispositions de financement spécifiques).

 

Chaque consortium doit désigner :

  • Un promoteur d'essai clinique
  • Une coordonnatrice ou un coordonnateur
  • Au moins un patient partenaire, représenté par une association de patients ou un autre groupe de patients organisé.

 

Le processus de l’appel se déroulera en plusieurs étapes, en commençant par une manifestation d’intérêt (MI) obligatoire (étape 0).

 

Les dates clés indicatives sont actuellement les suivantes :

  • Étape 0 – Manifestation d’intérêt (obligatoire) : du 1er juillet au 10 septembre 2026
  • Étape 1 – Proposition succincte : 15 septembre – 29 octobre 2026
  • Étape 2 – Étape de soutien : janvier – juillet 2027
  • Étape 3 – Proposition complète : juillet – septembre 2027
  • Décisions de financement : février 2028

 

En savoir plus

 

Webinaire d'information  6 juillet 2026 (de 15 h à 17 h) Inscriptions ICI.

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 5, 5:38 PM
Scoop.it!

ERC Plus Grants Offer Up to €7 Million for High-Risk Research

ERC Plus Grants Offer Up to €7 Million for High-Risk Research | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

The European Research Council (ERC) Plus Grants scheme, designed and implemented by the ERC, will provide up to €7 million per project for a maximum of seven years. The scheme targets outstanding researchers, of any nationality, with bold ideas capable of opening entirely new avenues of research and generating transformative scientific advances. 

 

The grants are open to researchers of any age and nationality who are residing anywhere in the world at the point of application, provided the research will be hosted by an institution based in an EU Member State or an associated country. Applications must be submitted by a single Principal Investigator (PI) on behalf of the Host Institution, which can be any legal entity in an EU Member State or associated country.

 

Eligible applicants include scholars at all career stages who can demonstrate an outstanding record of scientific achievement at the forefront of their field, assessed in line with career stage. A researcher may hold only one ERC Plus Grant in their lifetime. The PI must dedicate at least 30% of working time to the project and spend at least 50% of working time in the EU or an associated country. Project teams may include researchers of any nationality and team members may be located outside Europe.

 

Around 30 grants are expected to be awarded in the first call.

 

The deadline for applications is 2 September 2026 (17:00)

 

Plus d’infos

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 5, 5:26 PM
Scoop.it!

Ugo Arbieu dans "Le dessous des images" sur Arte : "Les mascottes sportives, outil de séduction massive" 

Ugo Arbieu dans "Le dessous des images" sur Arte : "Les mascottes sportives, outil de séduction massive"  | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Qu’ils soient rongeurs, fauves ou oiseaux, les animaux sont très présents dans le sport. Ugo Arbieu (post-doctorant dans l’équipe BioM du Laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette) nous éclaire sur leur représentation dans le domaine sportif dans l’émission d’Arte « Le dessous des images – Les mascottes sportives, outils de séduction massive ».

 

Voir l’émission

 

-> Contact : ugo.arbieu@universite-paris-saclay.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 5, 5:13 PM
Scoop.it!

Parution « No(s) limite(s) – Etudier et enseigner face aux limites planétaires »

Parution « No(s) limite(s) – Etudier et enseigner face aux limites planétaires » | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Depuis septembre 2025, sept des neuf limites planétaires définies par le Stockholm Resilience Centre pour garantir la stabilité du système Terre sont franchies. Ces dépassements marquent une rupture historique mettant en péril les conditions d’habitabilité de la planète qui ont permis le développement des sociétés humaines depuis l’Holocène. Dans cette situation d’urgence, comment apprendre, enseigner, expliquer, débattre ?

 

Ce manuel, rédigé par des spécialistes reconnus dans leur domaine sur les plans national et international (dont Nathalie Frascaria-Lacoste, professeure AgroParisTech, directrice du Laboratoire Ecologie Société Evolution - ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette)), propose une approche pluridisciplinaire et critique pour répondre à ces enjeux.

 

Editions La Découverte

 

-> Contact : nathalie.frascaria@universite-paris-saclay.fr

No comment yet.
Rescooped by Life Sciences UPSaclay from Life Sciences Université Paris-Saclay
June 5, 5:03 PM
Scoop.it!

RAPPEL ! Conférence Thérapies innovantes et combinatoires #5 - 2 juillet 2026 à Genopole, Evry

RAPPEL ! Conférence Thérapies innovantes et combinatoires #5 - 2 juillet 2026 à Genopole, Evry | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Genopole, l’Université Evry Paris-Saclay et le LBEPS (Laboratoire de Biologie de l’Exercice pour la Performance et la Santé) vous invitent à la 5e édition de la conférence sur les thérapies innovantes et combinatoires.

 

L’innovation thérapeutique est un enjeu de santé publique. Elle doit répondre à l’urgence de traiter la pluralité des pathologies humaines mais aussi de prendre en compte les spécificités des populations touchées. Les maladies neuromusculaires illustrent cette complexité par la variété des tissus touchés, des causes et de l’âge d’apparition des symptômes, bien qu’elles affectent toutes la fonction motrice. Concevoir des traitements adaptés à chacune représente un défi scientifique, technologique et économique.

 

Les progrès des connaissances sur ces pathologies hétérogènes ouvrent des perspectives fondées sur des approches pharmacologiques, cellulaires, génétiques et physiothérapeutiques dont la mise en œuvre croisée et/ou combinée pourrait s’avérer très prometteuse.

 

Cette journée d’échanges scientifiques fera le point sur ces avancées et discutera de l’évolution des stratégies thérapeutiques avec des spécialistes de la recherche pré-clinique et clinique, et des biotechs du secteur. Elle soulèvera les questions du potentiel et du déploiement des approches combinatoires.

 

Au programme :

  • Session 1 : Maladies neurodégénératives
  • Session 2 : Neuropathies et maladies de la jonction neuromusculaire
  • Session 3 :  Myopathies
  • Table ronde : Quelles sont les avancées concernant le potentiel des thérapies combinatoires ? Comment parvenir à les mettre en œuvre ?

 

Lieu:

Bibliothèque universitaire
Salle des Lumières (Bâtiment 3 sur le plan d’accès)
2 rue André Lalande
91000 Évry-Courcouronnes

Plan d’accès >>

 

Comité d’organisation:

  • Olivier Biondi, professeur, LBEPS, Université Évry Paris-Saclay
  • Roxane Brachet, responsable Partenariats académiques, Genopole
  • Aude Brianto-Escande, directrice de la Communication, Université Évry Paris-Saclay
  • Christophe Lanneau, directeur Recherche & Plateformes, Genopole
  • Véronique Le Boulc’h, responsable Partenariats formation et Promotion scientifique, Genopole
  • Cécile Martinat, directrice, I-Stem

 

Inscription :

L’inscription est gratuite mais obligatoire pour vous accueillir au mieux ☺️

No comment yet.
Rescooped by Life Sciences UPSaclay from Life Sciences Université Paris-Saclay
June 4, 12:00 PM
Scoop.it!

RAPPEL ! École d'Eté 2026 de l'OI HEALTHI - Innovation Thérapeutique - DATE LIMITE DE CANDIDATURE 25 JUIN !

RAPPEL ! École d'Eté 2026 de l'OI HEALTHI - Innovation Thérapeutique - DATE LIMITE DE CANDIDATURE 25 JUIN ! | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L'Objet Interdisciplinaire Health and Therapeutic Innovation (HEALTHI) de l'Université Paris-Saclay organise son École d'Été "Innovation Thérapeutique". Pendant deux jours et demi des sujets variés seront proposés autour de l'innovation thérapeutique et du médicament avec des intervenants du domaine aussi bien académique qu'industriel. Le programme sera communiqué plus tard, mais vous pouvez envoyer votre candidature dès à présent.

  • Date: du 06 au 08 juillet 2026 (2,5 jours)
  • Lieu: Domaine de Saint Paul à Saint-Rémy-Lès-Chevreuse en Île-de-France.
  • Participantsdu monde académique ou privé (dans la limite des places disponibles) : 
    Doctorants, Post-doctorants,
    Chercheurs, Enseignants-Chercheurs et Ingénieurs.
    La participation à l’École d’Eté pourra être validée comme module d’enseignement pour les Doctorants.
  • Tarifs(inscription, hébergement et restauration) :
    50 euros pour les Doctorants et Post-doctorants,
    100 euros pour les Enseignants-Chercheurs et Chercheurs Académiques
    300 euros pour le secteur privé.

 

Dates clé :

  • Avant le 25 juin 2026 : Envoi du dossier de candidatures (CV et lettre de motivation) à l'adresse : healthi@universite-paris-saclay.fr  
  • Au plus tard le 28 juin 2026: Renvoi à chaque candidat de l'information relative à l'acceptation ou pas de sa candidature.

 

Grand témoin : Pr Sylvie Retailleau, Université Paris-Saclay ; Présidente d’Universcience. Ancienne Ministre de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche. Ancienne Présidente de l’Université Paris-Sud et de Paris-Saclay.

 

Pré-Programme (les intervenants mentionnés ont déjà donné leurs accords)

 

L'industrie pharmaceutique : état des lieux et principaux enjeux

François Ballet, MEDICEN

 

Session Innovation thérapeutique dans le domaine de la dépression et des maladies neurodégénératives

Denis David (INSERM), Delphine Joseph (CNRS)

 

Session Innovation Thérapeutique dans le domaine cardiaque

Marie-Christina Zennaro (INSERM), Mathias Mericskay (INSERM), Michel Azizi (AP-HP, CHU HEGP)

 

Session « du développement à la clinique »

Henri Caplain (EUFEMED), Marc Pallardy (Université Paris-Saclay), Lamie Grimaldi (CHU Raymond-Poincaré), Ségolène de Retz (Fondation A.R.CA.D)

 

Session « L’environnement réglementaire et économique »

Philippe Motté, CELESTIAL Consulting ; Isabelle BORGET (Institut Gustave Roussy, Université Paris-Saclay)

 

Session « Transfert de technologies et valorisation des partenariats public-Privé »

Mathieu Gutmann (SATT Paris-Saclay), Franck Mouthon (Inserm)

 

Table-Ronde « Les métiers du médicament et de la santé après un doctorat »

Raquel Diaz-Lopez (SATT Paris-Saclay), Joël Vacus (Drugabilis)

 

Table-Ronde « Le recrutement et la recherche d’emploi métiers du médicament »

Chantal Vernis (ABG -Association Bernard Gregory), Grégoire Prevost (CIPREVO), Stéphanie Blanc (GENSEARCH Consulting)

 

L’école d’automne débutera à 9h30 le lundi 6 juillet pour se terminer le mercredi 8 juillet à 14h après le déjeuner.

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 2, 4:20 PM
Scoop.it!

Cibler le facteur SP1 pour limiter la plasticité tumorale et restaurer la sensibilité thérapeutique dans le cancer du foie

Cibler le facteur SP1 pour limiter la plasticité tumorale et restaurer la sensibilité thérapeutique dans le cancer du foie | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le carcinome hépatocellulaire (CHC), principale forme de cancer primitif du foie, reste associé à un mauvais pronostic malgré les progrès thérapeutiques récents. Une des principales causes d’échec des traitements réside dans la présence de cellules souches cancéreuses (CSCs), capables de maintenir la croissance tumorale, favoriser les métastases et induire des résistances aux thérapies ciblées.

 

Dans une étude publiée dans Cells, des chercheurs de l’UMR-S 1193 (INSERM/UPSaclay, Villejuif) ont étudié le rôle du facteur de transcription SP1 dans l’agressivité et le caractère souche du CHC. En utilisant la mithramycine A, une molécule capable d’interférer avec des réseaux transcriptionnels dépendants de la famille SP, les chercheurs montrent une diminution de plusieurs propriétés associées à la progression tumorale. Le traitement inhibe notamment la prolifération et la migration cellulaires, tout en réduisant l’expression de marqueurs du stemness (NANOG, SOX2, OCT4, CD133 et CD24) et plusieurs fonctions associées aux CSCs, comme l’activité ALDH et le phénotype side population.

 

L’étude met également en évidence un effet particulièrement intéressant sur la réponse thérapeutique. La mithramycine A restaure la sensibilité au sorafénib — traitement utilisé dans les formes avancées de CHC — y compris dans des cellules devenues résistantes. Cette re-sensibilisation s’accompagne d’une diminution des mécanismes d’efflux médicamenteux et d’une augmentation de l’apoptose.

 

Ces travaux soulignent l’intérêt de cibler les réseaux transcriptionnels contrôlant la plasticité tumorale et ouvrent de nouvelles perspectives pour lutter contre les résistances thérapeutiques dans les cancers du foie.

 

-> Contact : julien.giron-michel@inserm.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 2, 4:05 PM
Scoop.it!

Imagerie FRET-FLIM quantitative pour analyser l’organisation des protéines dans la membrane du réticulum endoplasmique

Imagerie FRET-FLIM quantitative pour analyser l’organisation des protéines dans la membrane du réticulum endoplasmique | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le réticulum endoplasmique (RE) est un compartiment hautement dynamique qui établit de nombreux sites de contact membranaires avec d’autres organelles et la membrane plasmique en apposant leurs deux membranes. Ces sites de contact sont essentiels dans les échanges lipidiques et l’homéostasie du calcium. Les protéines membranaires du RE des familles VAP, ORP et ESYT sont des acteurs clés de ces contacts.

 

Dans une publication du Journal of Biological Chemistry quatre scientifiques de l’Institut de chimie physique - ICP (CNRS/Université Paris-Saclay, Orsay) ont étudié l’interactome de ces protéines dans des cellules vivantes en couplant une analyse du transfert résonant d’énergie de type Förster (FRET) entre des paires de protéines marquées par des protéines fluorescentes (FP) avec une détection par microscopie de durée de vie de fluorescence (FLIM).

 

Cette approche quantitative permet de sonder si les protéines se regroupent dans les mêmes nano-domaines membranaires et si elles interagissent directement. Les chercheurs ont perturbé leur organisation par des mutations et ont observé des interactions dans toutes les familles. L’importance des domaines dit « coiled-coil » de ORP5 et ORP8 dans la formation de complexes homomériques et hétéromériques a aussi été mise en évidence. L’approche permet également de détecter des changements conformationnels intramoléculaires suite à des modifications de l’environnement, comme des variations en [Ca2+] pour ESYT1. Des organisations inter-familles nouvelles ont aussi été observées, notamment entre VAPB et ORP8, ainsi que ESYT2 et ORP5/8. Enfin, cette approche met en évidence le vaste réseau d’interactions des protéines VAPA/B.

 

Cette méthodologie FRET-FLIM ouvre la voie pour l’exploration de l’organisation de protéines dans les membranes intracellulaires et de leurs interactions à l’échelle nanométrique.

 

-> Contact : marie.erard@universite-paris-saclay.fr / oliver.nusse@universite-paris-saclay.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 2, 3:50 PM
Scoop.it!

Des frontières floues entre les ARN codants et non codants

Des frontières floues entre les ARN codants et non codants | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Un article de revue publié dans Journal of Molecular Biology par l’équipe ARNClo à l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) présente les découvertes récentes sur le rôle des ARN non codants et des petites protéines, en particulier dans les interactions entre bactéries et phages avec des nouvelles fonctions communes.

 

L'hypothèse du monde à l'ARN attribue à la fois le traitement de l'information génétique et des fonctions catalytiques aux ARN anciens. Dans le monde moderne, les protéines ont remplacé les ARN dans de nombreux processus cellulaires essentiels. Cependant, les ARN ont conservé des rôles clés dans les réseaux de régulation et diverses fonctions enzymatiques et structurelles. Des ARN à double fonction, découverts chez pro- et eucaryotes, agissent à la fois comme des ARN régulateurs non codants et aussi codent des courts peptides fonctionnels.

 

Les progrès récents méthodologiques, notamment Ribo-seq et cryo-EM, ont conduit à des découvertes fascinantes concernant une grande diversité de protéines très courtes ou d’ARN de grande taille structurés chez tous les organismes vivants. De nouveaux systèmes de défense anti-phages remettent en question le dogme traditionnel avec des mécanismes de codage protéique cryptique ou l'oligomérisation de petites protéines ou d'ARN en grands complexes supramoléculaires. Le paysage actuel des séquences exprimées est en constante évolution avec la naissance de gènes de novo à partir de séquences non codantes et de l'émergence d'ARN non codants à partir de séquences codantes.

 

Ce large éventail fonctionnel des séquences non codantes et codantes ouvre des nouvelles perspectives pour les applications dans les domaines de la biotechnologie et de la santé.

 

-> Contact : olga.soutourina@i2bc.paris-saclay.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 2, 5:51 AM
Scoop.it!

Effet des traitements de l’hypertension artérielle pulmonaire sur les échanges gazeux des patients avec hypertension portopulmonaire

Effet des traitements de l’hypertension artérielle pulmonaire sur les échanges gazeux des patients avec hypertension portopulmonaire | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’hypertension porto-pulmonaire (HTPoP) est une complication rare et sévère de l’hypertension portale. Si les traitements de l’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) améliorent l’hémodynamique et le pronostic, leur impact sur les échanges gazeux reste mal connu.

 

Dans un article publié dans Chest, Thomas Lacoste-Palasset et Laurent Savale, du Centre National de Référence de l’Hypertension Pulmonaire sévère (service de Pneumologie et Soins Intensifs Respiratoires de Bicêtre, AP-HP), associés à l’UMR-S 1358 (INSERM/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre) ont évalué l’effet des traitements de l’HTAP sur les échanges gazeux chez des patients atteints d’HTPoP.

 

Les auteurs ont analysé une cohorte rétrospective multicentrique issue du registre français de l’hypertension pulmonaire ainsi qu’une cohorte prospective monocentrique. Tous les patients avaient bénéficié d’une analyse des gaz du sang avant puis dans l’année suivant l’initiation du traitement. Dans la cohorte prospective, une échocardiographie avec contraste recherchait également des dilatations vasculaires intra-pulmonaires.

 

Au total, 107 patients ont été inclus dans la cohorte rétrospective. Après quatre mois de traitement, le gradient alvéolo-artériel en oxygène (A–aDO₂) restait globalement stable malgré une importante variabilité individuelle, sans impact sur les paramètres fonctionnels ni la survie. Parmi les 28 patients inclus prospectivement, 39% présentaient des dilatations vasculaires intra-pulmonaires, sans influence sur l’évolution du gradient A–aDO₂ sous traitement.

 

Cette étude illustre une nouvelle fois la complexité des interactions physiopathologiques entre maladies hépatiques et intégrité de la vascularisation pulmonaire, soulignant la nécessité d’une utilisation prudente et individualisée des traitements vasodilatateurs dans l’HTPoP.

 

-> Contact : laurent.savale@aphp.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
June 2, 5:27 AM
Scoop.it!

Portrait Jeune Chercheuse – Guillemette Fouquet, Maître de conférence – Praticienne hospitalière en hématologie

Portrait Jeune Chercheuse – Guillemette Fouquet, Maître de conférence – Praticienne hospitalière en hématologie | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Guillemette Fouquet est maître de conférences – praticienne hospitalière à l’Université Paris Saclay, un poste qui lui permet d’allier soins, recherche et enseignement. Elle exerce au sein du service d'hématologie clinique adultes du Centre Hospitalier Sud Francilien (CHSF), établissement impliqué dans un ambitieux projet d'universitarisation, et mène ses travaux de recherche à l'Institut Gustave Roussy, au sein de l’UMR-S 1287 (INSERM/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif) dirigée par Isabelle Plo.

 

Médecin de formation, elle se forme en parallèle à la recherche avec un intérêt marqué pour l’hématologie. Elle réalise une thèse de sciences à l'Institut Imagine, dans le laboratoire du Pr Olivier Hermine, où elle s'intéresse à l'érythropoïèse, ce processus remarquable qui permet à notre organisme de produire deux millions de globules rouges par seconde. Ses travaux explorent le rôle des récepteurs à la transferrine et d'un phytoestrogène, le Curcuma comosa, sur la régulation de l’érythropoïèse.

 

Elle poursuit ses recherches à l'Institut Cochin, dans l'équipe de Carole Peyssonnaux, aux côtés de Francine Côté. Elle y étudie le rôle insoupçonné de la sérotonine périphérique en hématologie et contribue à des travaux démontrant que cette hormone, principalement connue comme neurotransmetteur, favorise la prolifération et la survie des globules rouges, et accélère la récupération médullaire après irradiation ou chimiothérapie.

 

Aujourd'hui, ses recherches se concentrent sur les néoplasies myéloprolifératives, des cancers du sang peu agressifs mais chroniques et incurables, caractérisés par une prolifération incontrôlée des cellules sanguines. Elle a rejoint l'équipe d’Isabelle Plo à l’Institut Gustave Roussy, experte reconnue dans ce domaine, pour s’investir dans des projets visant à mieux comprendre ces pathologies et à développer de nouveaux traitements ciblés.

 

Elle poursuit également son activité clinique en hématologie au CHSF, où elle s’occupe de patients porteurs de maladies du sang, dont les néoplasies myéloprolifératives. Elle fait partie d’une équipe dynamique et bienveillante, tournée vers la qualité des soins, ainsi que la recherche clinique. Cette activité lui permet de développer des projets de recherche translationnelle, qui portent directement sur les cellules issues du sang des patients, souvent désireux de contribuer à la recherche.

 

A la Faculté de Médecine du Kremlin-Bicêtre, elle participe à l’enseignement d’hématologie pour les étudiants en médecine, principalement sur le thème des anémies. Elle s'implique également dans les ECOS (Examens Cliniques Objectifs Structurés), épreuve orale du concours de médecine, aussi bien dans le cadre universitaire qu'au sein du CHSF, permettant d’entraîner les étudiants en médecine à cette épreuve relativement nouvelle et anxiogène.

 

« Ce livre est le beau récit d’une extraordinaire aventure scientifique… Il nous permet de ressentir ce que la recherche scientifique peut avoir de plus exaltant. Un étrange mélange d’intuition, de rêve, et de confrontation à la réalité. Fait d’attentes, d’obstination, de doutes, d’extrême rigueur, de plongées dans l’inconnu, de découvertes étonnantes. Et de rencontres. La vie intense des équipes, les discussions, les collaborations, les échanges et la compétition. Et il est aussi, comme tous les grands récits d’aventure, un récit d’apprentissage. Un récit de vie ». - Jean Claude Ameisen, préface du libre « Néandertal : à la recherche des génomes perdus »

 

-> Contact : guillemette.fouquet@gustaveroussy.fr

No comment yet.
Scooped by Life Sciences UPSaclay
May 26, 5:22 AM
Scoop.it!

dAMN : prédire la dynamique de croissance bactérienne grâce à un modèle hybride neuronal–mécanistique

dAMN : prédire la dynamique de croissance bactérienne grâce à un modèle hybride neuronal–mécanistique | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Bioinformatics, des chercheurs de l’Institut Micalis (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec l'Université de Wageningen (Pays-Bas), ont développé dAMN (dynamic Artificial Metabolic Networks), un modèle hybride combinant réseaux de neurones artificiels et analyse dynamique des flux métaboliques à l'échelle du génome, pour prédire comment des bactéries croissent dans des environnements nutritionnels variés.

 

Un défi central en biologie est de modéliser avec précision la croissance cellulaire en fonction de la composition du milieu de culture. Les approches mécanistes classiques peinent à se généraliser à de nouveaux milieux et ne capturent pas les phases de latence initiales — ce délai d'adaptation observable avant que les bactéries commencent à se diviser activement. dAMN surmonte ces limitations en intégrant des réseaux de neurones (ResNet) au sein d'un cadre contraint par la stœchiométrie du réseau métabolique complet de l'organisme.

 

Entraîné sur des données de croissance d'Escherichia coli et de Pseudomonas putida dans des centaines de milieux combinatoires, dAMN prédit avec précision les dynamiques temporelles et se généralise à des milieux non vus lors de l'apprentissage (R² moyen ≥ 0,9). Le modèle reproduit spontanément des phénomènes biologiquement pertinents tels que la déplétion des substrats, le débordement d'acétate ou encore les croissances diauxiques — sans avoir été explicitement supervisé sur ces comportements.

 

Le logiciel, les modèles et les données sont disponibles librement sur GitHub et Zenodo (DOI : 10.5281/zenodo.17908125).

 

Légende Figure : Architecture de dAMN (figure tirée de l'article original). Le modèle combine deux réseaux de neurones — l'un prédit les paramètres de la phase de latence, l'autre les flux métaboliques — au sein d'une boucle d'intégration mécanistique contrainte par la stœchiométrie du réseau métabolique complet du microorganisme. L'ensemble est entraîné par rétropropagation en minimisant simultanément l'écart aux concentrations mesurées, les contraintes stœchiométriques et la positivité des flux.

 

-> Contact : jean-loup.faulon@inrae.fr

No comment yet.