Lancée en décembre 2023, dans le cadre de la stratégie scientifique de l'université Paris-Saclay pour répondre aux enjeux prioritaires de recherche à l’horizon 2030, la série de séminaires communs entre les GS Informatique, Sciences du Numérique (GS ISN) et Santé Publique (GS SP) et l’OI Hub PASREL se poursuit. Ces séminaires ont pour but de faire émerger des projets collaboratifs dans les domaines de l'IA et de la santé numérique.

Lors de ce deuxième séminaire sera abordée l’analyse des données de parcours de soin, il se déroulera le 11 octobre de 9h30 à 17h au CESP à Villejuif.

à Programme complet et inscription sous le lien suivant, cliquez ici !

Nous avons le plaisir de vous convier à la rencontre « Campus Grand Parc : le cluster d’innovation dédié à la lutte contre le cancer » qui se tiendra le mardi 8 octobre 2024 de 14h00 à 17h15. Une série de tables-rondes sera suivie de la visite des bâtiments et d’un cocktail (de 17h30 à 19h30) sur le site Campus Grand Parc, à Villejuif.

Pourquoi participer ?

• Découvrez le quartier Campus Grand Parc à Villejuif, dédié à la lutte contre le cancer.
• Participez à des tables rondes animées par des experts et les acteurs clé de l’innovation en oncologie.
• Saisissez l’opportunité d'échanger sur vos besoins et projets pour rejoindre ce cluster unique.
• Renforcez votre réseau lors du cocktail et des visites des bâtiments Amundi, Kadans et Perelis du site.

Programme et plan d’accès :

Vous trouverez plus bas le programme détaillé de l'événement ainsi que le plan d'accès au site Campus Grand Parc.

Informations pratiques :

Un équipement de protection individuel (bottes, casque, gilet) sera fourni pour assurer votre sécurité lors des visites sur le chantier Campus Grand Parc.

Campus Grand Parc sera accessible en métro dès la fin de l’année ! D’ici-là, nous vous encourageons à utiliser les transports en taxi ou Uber pour faciliter votre venue.

Inscription :

Merci de confirmer votre présence en remplissant le formulaire suivant : Lien d'inscription

Programme et plan d'accès

Nous nous réjouissons de vous accueillir sur le site Campus Grand Parc pour vous faire découvrir ce lieu unique qui accueillera les acteurs de l'innovation contre le cancer.

Bien cordialement,

L’équipe PSCC (Paris-Saclay Cancer Cluster)

Join us on October 14, 2024, at the Maison des Polytechniciens in Paris, for the NeurATRIS General Meeting!

This year, we are offering an overview of advances in translational neuroscience, with a focus on neurodevelopmental disorders, as well as Alzheimer's, Parkinson's, and Huntington's diseases, and multiple sclerosis. The General Assembly is also an opportunity to review the achievements of the past year, present the infrastructure's perspectives, and highlight its initiatives in favor of translational research in neuroscience  and the training of young scientists. 

The event is open to all. Registration is free but mandatory before October 06, 2024.

NeurATRIS, 12 years of research against neurodegenerative and neurodevelopmental disorders

NeurATRIS is a translational research infrastructure for innovative neuroscience therapies, unique in Europe. NeurATRIS, coordinated by CEA, is a French national research infrastructure designed to accelerate the transformation of discoveries from basic research into medical innovations for the treatment of neurodegenerative and neurodevelopmental diseases.

NeurATRIS, a distributed infrastructure, brings together several public hospitals and research institutes whose expertise and skills in neuroimaging, pharmacology and biotherapies are complementary and internationally recognized.

NeurATRIS offers a continuum of translational expertise from in vitro cell models to Phase II clinical trials: patients suffering from major brain pathologies such as Alzheimer's, Parkinson's and Huntington's diseases, multiple sclerosis, and disorders of brain development.

NeurATRIS establishes collaborations with academic and private partners, providing cutting-edge services based on a range of technological, scientific, methodological and strategic expertise that is indispensable in the value chain of translational neuroscience research activities.

NeurATRIS is the French component of the European infrastructure EATRIS-ERIC; it is also the only EATRIS infrastructure to propose a structured offer specialized in neuroscience and neurology, allowing France to position itself as a major player in this field at international and European level.

NeurATRIS is a French Research Infrastructure in Biology and Health. Initially endowed with 28 M€ over 10 years in the context of the 2012 "Investissements d’avenir Programme", NeurATRIS has been awarded a complementary funding of 3.3M€ in 2020 for the period 2020-2025.

Nous avons le plaisir de vous inviter le mardi 8 octobre prochain, de 9 heures à 12h30, aux 18es Rencontres sur le Cancer, à la Maison de la Chimie (Paris 7e), en partenariat avec l'Inserm et Gustave Roussy.

Présidées par Sonia de La Provôté, sénatrice du Calvados, vice-présidente du groupe d'études "Cancer", Florence Lassarade, sénatrice de la Gironde, présidente du groupe d'études "Cancer" et Michel Lauzzana, député de Lot-et-Garonne, ces Rencontres réuniront élus, hauts-fonctionnaires, professionnels de santé, associations de patients, chercheurs et universitaires, entreprises et think tanks. 

Nous serions très heureux de votre présence !

Inscription en ligne

Télécharger le programme 

La Fédération Hospitalo-Universitaire FHU CARE a le plaisir de vous inviter au prochain webinaire du vendredi 20 septembre 2024 à 13h30 pour la présentation du Dr. Javier Carrasco, conseiller Médical de Seqalis, inventeur de la plateforme brevetée TCR seq, Manager au Dpt d’Oncologie Translationnelle de l’Institut de Pathologie et de Génétique à Gosselies et Oncologue clinique au Grand Hôpital de Charleroi.

• Contact et plus d’info : myriam.morcel@aphp.fr ou oscar.haigh@cea.fr
• Lien visio

Dans une étude publiée dans Scientific Reports le laboratoire du Pr. Dawei Xin (Northeast Agricultural University, Harbin, Chine), en collaboration avec Pascal Ratet (équipe SYMUNITY, Institut des Sciences des Plantes Paris-Saclay - IPS2, CNRS/INRAE/UEVE/UParis/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), a montré que les graines de soja cachées sous terre pendant l'hiver par Tscherskia triton et Apodemus agrarius possèdent une concentration plus élevée de composés organiques volatils (VOCs) que celles qui restent exposées dans les champs. Cela suggère que les rongeurs sélectionnent les graines produisant les VOCs tels que le 3-FurAldehyde (Fur) et le (E)-2-Heptenal (eHep) qui inhibent la croissance de pathogènes végétaux comme Aspergillus flavus, Alternaria alternata, Fusarium solani et Pseudomonas syringae. En outre, des composés tels que le camphène (Cam), le 3-FurAldehyde et le (E)-2-Heptenal suppriment la germination des graines dans des cultures telles que le soja, le riz, le maïs et le blé. De plus, certains de ces VOCs empêchent également la germination des graines de riz avant la récolte.

Ces résultats proposent des approches simples pour la protection des semences, la réduction de la germination avant récolte ainsi que la perte de nourriture après la récolte. Ces résultats suggèrent aussi de nouvelles voies de sélection pour la réduction de l'utilisation de pesticides en agriculture.

Légende Figure : Inhibition de la croissance de champignons pathogènes par des composés organiques volatils (VOCs) présents dans les graines de Soja. (a) Test Halo montrant l’activité antifongique de six composés organiques volatils. (b) Pourcentage d'inhibition du développement de Aspergillus flavus, Alternaria alternata et Fusarium solani par les six VOCs. Les colonnes portant des lettres différentes sont significativement différentes. Phtalate de diméthyle (DP) ; Camphène (Cam); 3-FurAldéhyde (fur); (E)-2-Hepténal (eHep); Butyrate d'isobutyle (BuA); 1-Acétylimidazole (Ace).

Contact: pascal.ratet@cnrs.fr

Dans une étude publiée dans Nucleic Acids Research, des scientifiques du laboratoire Evolution, Génomes, Comportement, Ecologie - EGCE (CNRS/UPSaclay/IRD, Gif-sur-Yvette) ont développé une méthode intégrée d’annotation d’éléments génétiques mobiles de type Hélitron.

Les éléments de type Hélitron (HLE) sont des transposons d'ADN eucaryotes très répandus qui utilisent un mécanisme de transposition en cercle roulant. Malgré leur prévalence dans les génomes des champignons, des animaux et des plantes, l'identification et l’annotation des Hélitrons est longtemps restée un challenge. C’est pourquoi l’équipe du pôle Evolution et Génomes du laboratoire EGCE a développé un nouveau logiciel intitulé HELIANO, permettant d'annoter et de classer les séquences HLE autonomes et non autonomes à partir de génomes entiers.

HELIANO surmonte plusieurs limitations des outils existants en termes de vitesse et de précision, comme le démontrent l'analyse comparative et son application aux génomes complexes des grenouilles (Xenopus tropicalis et Xenopus laevis) et du riz (Oryza sativa), où il a permis de découvrir de nombreux HLE non identifiés jusqu'à présent.

Dans une analyse de 404 génomes d'eucaryotes, une abondante variété d’HLEs a été trouvée parmi de nombreux phylums, avec des exceptions dans des taxons spécifiques. L’utilisation d'HELIANO a permis ainsi de découvrir de nombreux nouveaux HLE chez les plantes terrestres et d'identifier 20 domaines protéiques intégrés dans certaines familles de transposons HLE autonomes. L'utilisation future d'HELIANO promet d'améliorer l'analyse globale des transposons à travers les génomes, faisant ainsi progresser de manière significative notre compréhension de cette fascinante superfamille de transposons.

Contact : nicolas.pollet@universite-paris-saclay.fr

Dans une étude publiée dans Laboratory Investigation, les chercheurs et cliniciens du Centre Hépatobiliaire (UMR-S 1193 INSERM/UPSaclay, FHU Hepatinov, Villejuif) ont démontré sur une série de greffons l’intérêt de la spectroscopie infrarouge pour estimer rapidement la teneur en lipides dans le contexte de la transplantation hépatique et évaluer son impact sur la survie.

La stéatose, c’est-à-dire l’accumulation de lipides dans le foie, est un facteur de risque important de non-fonctionnement du greffon. L'évaluation de la stéatose est basée sur l'examen de coupes congelées pour estimer le pourcentage d'hépatocytes contenant des vésicules lipidiques. Cette évaluation visuelle est mal corrélée avec la teneur réelle en lipides. De plus, la stéatose peut se présenter sous forme de petites vésicules (stéatose microvésiculaire) ou sous forme de vacuole envahissant tout le volume de l’hépatocyte (stéatose macrovacuolaire). La stéatose microvésiculaire est encore plus difficile à évaluer et a longtemps été considérée comme ayant une faible incidence sur la reprise de la fonction hépatique.

L’étude confirme que la spectroscopie infrarouge permet de quantifier le taux de lipides sur coupes de tissus et démontre que tous les patients présentant une insuffisance hépatique post-transplantation avaient subi une transplantation avec des greffons au contenu lipidique élevé. L’étude révèle que ces greffons présentaient une stéatose microvésiculaire importante. Enfin, l’étude a établi un seuil de concentration en lipides au-delà duquel le risque d'échec après transplantation augmentait significativement, affectant 35% des patients. Les auteurs suggèrent que la mesure du taux de lipides devrait devenir un critère objectif de contrôle de la qualité des greffons.

Contact : francois.le-naour@inserm.fr ou catherine.guettier@aphp.fr

L’efficacité vaccinale a été démontrée après primo-vaccination anti-COVID-19, mais il restait chez ces personnes vaccinées un risque résiduel d’hospitalisation pour COVID-19 pour les plus âgées ou présentant des comorbidités. Dans une étude publiée dans Journal of Infection and Public Health, les chercheurs du Groupement d’Intérêt Scientifique EPI-PHARE, du Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations – CESP (UMR-S 1018 Inserm/UVSQ/UPSaclay, Montigny-le-Bretonneux) et de la faculté de pharmacie UPSaclay ont analysé les facteurs associés à ce risque résiduel après une vaccination de rappel pendant la période Omicron en France.

En utilisant les données de la base nationale française des vaccinations COVID-19 (VAC-SI) couplées au Système National des Données de Santé (SNDS), plus de 35 millions de sujets ayant reçu au moins une dose de rappel ont été identifiés, parmi lesquels on dénombre 73 989 hospitalisations pour COVID-19. Les associations entre les caractéristiques sociodémographiques et cliniques et le risque d’hospitalisation après une dose de rappel en période de circulation prédominante Omicron, du 1er janvier au 10 novembre 2022, ont été évaluées à partir de modèles de Cox.

Parmi les caractéristiques sociodémographiques, l’âge avancé, le fait d’être un homme et l’appartenance à une catégorie sociale moins favorisée étaient associés à un risque accru d’hospitalisation pour COVID-19. Et les pathologies les plus fortement associées étaient : la mucoviscidose, le cancer du poumon, la dialyse chronique, les maladies psychologiques et neurodégénératives, la transplantation d’organes, la prise d’immunosuppresseurs et de corticostéroïdes oraux.

Les coauteurs de cette étude ont pu montrer que malgré une efficacité du rappel vaccinal et une circulation généralement moins virulente du variant Omicron, un risque résiduel existait toujours, en particulier pour les populations plus vulnérables.

Légende Figure : A) Hazard ratio et intervalles de confiance à 95% entre l'âge et l'hospitalisation pour COVID-19 pendant toute la période Omicron, estimés à partir d'un modèle de Cox entièrement ajusté, du 1er janvier 2022 au 10 novembre 2022, en France. B) Hazard ratio et intervalles de confiance à 95% entre toutes les caractéristiques sociodémographiques et cliniques (sauf l'âge) et l'hospitalisation pour COVID-19 pendant toute la période Omicron, estimés à partir d'un modèle de Cox entièrement ajusté du 1er janvier 2022 au 10 novembre 2022, en France.

Contact : jeremie.botton@ansm.sante.fr

Situé à proximité du futur bâtiment PASREL, l’EPA Paris-Saclay vous fait découvrir le domaine de Corbeville le dimanche 22 septembre de 9h à 17h30.

Balades à pied ou à vélo à travers un escape game grandeur nature, dégustation de produits locaux, jeux sur l’agriculture, l’alimentation et la transition écologique… :  ces Échappées Vertes sont une occasion à ne pas manquer pour aller à la rencontre d’un patrimoine naturel et culturel local foisonnant au sud du Grand Paris.

Plus d'informations

Dans le cadre de sa deuxième assemblée générale et pour poursuivre sa mission de pédagogie autour de l’innovation en santé, le Hub PASREL vous invite à son séminaire « Paris-Saclay : quels atouts pour amener les innovations en santé aux usagers ? » ouvert à toutes et tous.

Il sera l’occasion d’aborder certains aspects importants à prendre en compte dans le développement d’innovations technologiques en santé comme les données en santé, le design, les plateformes technologiques ou encore les formations à l’entreprenariat.

Ce séminaire est organisé en collaboration avec l’Institut Pascal et se tiendra dans leurs locaux (530 Rue André Rivière, 91400 Orsay) le jeudi 28 novembre de 13h30 à 17h30.

Inscription gratuite mais obligatoire, cliquez ici !

Cette année, le champ de l’appel se structure autour de deux grands axes thématiques et d’un axe spécifique :

1. Axe thématique 1 : Prévention primaire et promotion de la santé ;

1. Axe thématique 2 : Services de santé : Organisation et financement ;

1. Axe spécifique 3 : Prévention des infections et de l’antibiorésistance.

Les projets devront s’inscrire exclusivement dans les thématiques spécifiées dans chacun des axes et telles que détaillées dans le texte.

Cet appel à projets repose sur des objectifs résolument tournés vers l’éclairage des politiques publiques et la prise de décision fondée sur des preuves scientifiques. Il concerne un large périmètre de disciplines, comme celles des sciences sociales, de l’épidémiologie, de la santé publique ou encore des sciences médicales et paramédicales. Il promeut la pluridisciplinarité et la collaboration.

Cet appel à projets propose trois modalités de soutien :

1. Soutien à des projets de recherche pilotes

1. Soutien à des projets de recherche complets

1. Soutien à la mise en place d’un projet européen

Soumission  des candidatures en une seule phase sur  : https://eva3.inserm.fr/login

• Date butoir : 18 novembre 2024 à 12h
• Texte de l'appel
• Guide du candidat
• Dossier de candidature
• Annexe financière
• Lettre d’engagement équipe coordinatrice
• Lettre d’engagement équipes partenaires
• Lauréat(e)s_2024
• Jury 2024
• Webinaire de présentation mardi 08 octobre 2024 de 14h à 15h30 via ce lien.

Cet appel à projets doit permettre de soutenir des projets d’envergure autour d’objectifs de santé publique, mettant en œuvre des dispositifs innovants dans le champ de la prévention, intégrant des technologies et produits de santé, pouvant faire intervenir des combinaisons d’innovations (techniques, biotechnologiques, diagnostiques, numériques, organisationnelles ou interventionnelles). Ces projets doivent être accompagnés d’un protocole permettant de démontrer la valeur apportée par ces dispositifs en vie réelle en vue d’un déploiement si cette démonstration de la valeur est avérée.

Les projets attendus doivent proposer un dispositif innovant en prévention intégrant un ou des produits ou technologies de santé innovant ou présumé innovant pouvant être combinés à d’autres innovations qu’elles soient notamment numériques ou organisationnelles, permettant en particulier de réduire la prévalence de pathologies ou prédire leur incidence dans la population, d’optimiser ou personnaliser les prises en charge thérapeutiques, prévenir des complications, améliorer l’adhésion, en favorisant entre autre la participation des patients avec les patient reported outcome, et l’observance aux traitements et dépistages…

Les projets devront porter sur l’une des thématiques prioritaires suivantes :

• Lutte contre l’infertilité,
• Santé de l’enfant,
• Prévention de la perte d’autonomie,
• Maladie chroniques (cancers, diabètes, maladies cardio-neurovasculaires et cardiométaboliques, maladies neurodégénératives …),
• Promotion des comportements favorables à la santé : éducation à la santé, alimentation, activité physique (incluant l’APA), addictions (tabac, alcool, drogues…), sommeil, écrans, éducation à la vie affective et santé sexuelle
• Vaccination et prévention des maladies infectieuses
• Maladies rares, notamment dépistage néonatal et diagnostic des maladies rares avec une inclusion précoce dans un parcours de soins adapté

Les projets attendus dans le cadre de cet appel à projets devront être déployés sur le marché français prioritairement.

Ce dispositif soutient des projets :

• Mono-partenaire exclusivement portés par une PME au sens de la réglementation européenne8 ; ou une ETI, fabriquant ou exploitant le produit ou technologie de santé objet de la démonstration. Les GE (grandes entreprises) ne peuvent pas porter de projet individuel mais peuvent être incluses dans un consortium.
• Portés par un consortium dont la structure « cheffe de file » est une entreprise PME/ETI ou un « organisme de recherche et assimilés ».

Le consortium rassemble notamment des partenaires industriels de toute taille ou des partenaires de recherche, académiques, universitaires, établissements de santé, fondations, associations d’usagers, des pôles de compétitivité ayant une valence « santé », accélérateurs de projets innovants en santé, des collectivités territoriales. Les projets collaboratifs sont limités à 6 partenaires

NB : En cas de consortium, le projet inclut obligatoirement l’entreprise (PME ou ETI) fabricant/exploitant du produit/technologie de santé concerné.

Compte tenu de la nature de l’appel à projets, le portage du projet par un consortium est fortement attendu

Modalités de soutien : 

• Les projets doivent présenter une assiette de dépenses indicative de l’ordre de 5 à 10 M€
• Durée indicative du projet comprise entre 12 et 48 moi
• Pour les entreprises, la modalité d’attribution de l’aide respecte la répartition forfaitaire suivante :
• 60% maximum de l’aide attribuée sous la forme de subventions ;
• 40% de l’aide attribuée sous la forme d’avances remboursables ; le montant des avances remboursables ne pourra pas être inférieur à 100 k€ par partenaire.

Pour les établissements de recherche, l’aide sera apportée sous forme de subventions.

Soumission sur  PLATEFORME PICXEL.

L’appel à projets est ouvert jusqu’à fin 2028 avec 4 relevés intermédiaires

• 10 décembre 2024 à 12h00
• 17 juin 2025 à 12h00
• 20 janvier 2026 à 12h00
• 16 juin 2026 à 12h00

Documents à télécharger

• Cahier des charges Challenge Prévention
• Dossier de candidature Challenge Prévention

Contact : strategies-acceleration@bpifrance.fr

En 2023, la Société Française de Radiologie, la Société Française d’Imagerie Abdominale et Digestive, ainsi que CentraleSupélec ont lancé leur 14ème data challenge pendant les Journées Francophones de Radiologie (JFRs), marquant une nouvelle avancée dans l'utilisation de l'intelligence artificielle (IA) en radiologie. Ce défi ambitieux avait pour objectif de détecter des nodules pancréatiques et de prédire leur malignité à partir de plus de 1000 scanners abdominaux anonymisés, provenant de 18 centres de santé français.

Le cancer du pancréas, troisième cause de décès par cancer, est l'un des plus meurtriers avec un taux de survie à cinq ans de seulement 7 à 8%. Souvent détecté tardivement en raison de symptômes discrets, la détection précoce de petites tumeurs, principalement par scanners abdominaux, est cruciale pour améliorer les chances de survie.

Les participants étaient réunis en équipes composées de radiologues, data scientists et ingénieurs. Les scanners ont été classés en trois catégories : absence de lésion, masse bénigne ou tumeur maligne. Malgré la difficulté particulière à différencier les lésions bénignes des tumeurs malignes, certaines équipes ont réussi à obtenir de très bons scores.

Ce défi confirme que l'intégration de l'IA dans la détection des lésions pancréatiques est non seulement possible mais aussi prometteuse. Cependant, des efforts supplémentaires seront nécessaires pour distinguer avec précision les différents types de lésions.

Photo : Nathalie Lassau, Professeure des universités-praticienne hospitalier de l'Université Paris-Saclay en radiologie à l’Institut Gustave Roussy et directrice adjointe du Laboratoire d'imagerie biomédicale multimodale Paris Saclay BioMaps (CEA/CNRS UMR9011/Inserm UMR1281/UPSaclay, Orsay), présentant les résultats de l’étude publiée dans Diagnostic and Interventional Imaging.

Contact : theodoreaouad@gmail.com

Le réseau EFOR est ravi de vous annoncer la reprise de ses séminaires ! La nouvelle édition, co-organisée avec le FC3R, est dédiée à la règle des 3R avec un focus sur les organismes modèles aquatiques.

Le séminaire aura lieu :

le mardi 1er octobre 2024 à Paris, au FIAP Jean Monnet

30 Rue Cabanis, 75014 Paris

Métro 6 Glacière ou RER B Denfert-Rochereau

(http://www.fiap.asso.fr/). 

Vous trouverez ci-dessus le programme (qui peut subir quelques changements). Le séminaire est valable pour votre formation continue pour l’utilisation des animaux à des fins scientifiques (une attestation vous sera fournie par la suite si vous avez émargé à l’accueil).

Les frais d’inscriptions sont les suivants (frais de restauration inclus) :

• Participant des instituts publiques et université : 60€
• Participant d’entreprises : 100€
• Cliquez ICI pour vous inscrire !

Le comité organisateur : Athanassia Sotiropoulos (FC3R), Jean-Pierre Levraud (TEFOR Paris-Saclay) et Johanna Djian-Zaouche (TEFOR Paris-Saclay)

Direction Haïti, aux sources du mythe du zombi. Loin de « Walking Dead » et « World War Z », l'exposition dévoile les fantasmes, croyances et craintes nichés derrière la figure du « non-mort » le plus célèbre au monde.

Cette exposition, dont le commissaire est Philippe Charlier, directeur du Laboratoire Anthropologie, Archéologie, Biologie - LAAB (UFR Simone Veil - santé UVSQ/UPSaclay, Montigny-Le-Bretonneux), aura lieu du 8 octobre 2024 and 16 février 2025 au musée du quai Branly.

Plus d’infos

Jeudi 3 octobre2024, le GIS Autisme et troubles du neurodéveloppement et l'Inserm organisent un webinaire. Il sera consacré aux appels à projets européens collaboratifs et thématiques du Cluster Santé susceptibles d'intéresser le réseau du GIS et ses partenaires en 2025.

En savoir plus

Les études épidémiologiques sur la relation entre l’indice de masse corporelle (IMC) et la maladie de Parkinson (MP) ont montré des résultats divergents. L’une des explications possibles est un biais de causalité inverse, lié à la perte de poids qui peut précéder la MP de nombreuses années avant le diagnostic.

La randomisation mendélienne (RM) est une approche d’inférence causale permettant de s’affranchir des biais de confusion non mesurée et de causalité inverse sous certaines hypothèses d’application. Elle consiste à utiliser des polymorphismes génétiques (ou SNP) fortement associés à une exposition (ici l’IMC), pour estimer l’association non biaisée entre cette exposition et une maladie (ici la MP). La pléiotropie représente l’une des principales limites de cette approche et des méthodes statistiques dites robustes ont été développées pour estimer des associations non biaisées par la pléiotropie. Il est aussi possible de réaliser une analyse permettant d’étudier la relation bidirectionnelle entre une exposition et une maladie (Figure).

Dans le cadre du consortium international Courage-PD et de sa thèse d’épidémiologie sous la direction de Alexis Elbaz (équipe Exposome, hérédité, cancer et santé, UMR-S 1018 CESP Inserm/UVSQ/UPSaclay, Villejuif), Cloé Domenighetti a réalisé une analyse par RM à deux échantillons pour étudier la relation bidirectionnelle entre l’IMC et la MP dont les résultats ont été publiés dans Neurology. Pour étudier l’effet de l’IMC génétiquement prédit sur la MP, les auteurs ont réalisé une RM à deux échantillons en utilisant 501 SNPs associés à l’IMC issus d’une étude pangénomique (N=806 834). L’association entre ces SNPs et la MP a été estimée à partir de 8919 cas et 7600 témoins du consortium Courage-PD. Pour étudier l’effet de la prédisposition génétique à la MP sur l’IMC, les auteurs ont réalisé une analyse de RM inversée grâce à 33 SNPs issus d’une étude pangénomique réalisée par le consortium iPDGC.

L’IMC génétiquement prédit était significativement et inversement associé à la MP (odds ratio pour 1 déviation standard [4,8 kg/m²]=0,82, intervalle de confiance à 95%=0,70-0,97, P=0,012) sans hétérogénéité significative entre les SNPs ni arguments en faveur d’une pléiotropie (P=0,20). Il existait une association inverse non significative entre la prédisposition génétique à la MP et l’IMC, mais l’instrument génétique présentait une grande hétérogénéité (p<0,001) suggérant ainsi un potentiel biais lié à la pléiotropie. Les méthodes permettant de corriger les effets de la pléiotropie horizontale ont toutes montré une association inverse et significative.

Ces résultats sont en faveur d’une association inverse causale entre l'IMC et la MP et sont cohérents avec des résultats récent obtenus dans la cohorte de femmes E3N montrant une diminution du risque de MP chez les femmes présentant une obésité (Portugal et al., 2023) ; les mécanismes à l’origine de cette association inverse demeurent inconnus à ce jour. De plus, ces résultats suggèrent également que la prédisposition génétique à la MP pourrait être associée à un IMC plus faible, ce qui pourrait contribuer à expliquer la perte de poids observée dans la MP.

Contact : alexis.elbaz@inserm.fr

La reproduction sexuée repose sur l’alternance de phases où les chromosomes parentaux s’associent (fécondation) puis se séparent (méiose, formation des gamètes). Pour une séparation équilibrée des chromosomes lors de la méiose, il est essentiel que les chromosomes parentaux (homologues) se reconnaissent et s’associent en paires. Toute perturbation de cette association peut entraîner de graves problèmes de stérilité chez les parents ou des anomalies chromosomiques chez la descendance. La manière dont les chromosomes parentaux se reconnaissent dans un espace nucléaire encombré de chromosomes non homologues et s’associent sans provoquer d’enchevêtrements délétères reste un grand mystère.

Dans une étude publiée dans Nature Communications, des scientifiques des équipes « Mécanismes de la Méiose » et « Modélisation et Imagerie Numérique » de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) ont révélé, pour la première fois chez la plante Arabidopsis thaliana, que les chromosomes sont animés de mouvements extrêmement rapides lors de cette phase de recherche et d’association, comme s’ils étaient secoués violemment dans l’espace nucléaire. En testant l’impact de mutations affectant divers aspects de la machinerie cellulaire (recombinaison, structure des chromosomes, composants de l’enveloppe nucléaire), ces chercheurs ont découvert que les mouvements des chromosomes durant la prophase méiotique dépendent avant tout de l’accrochage des chromosomes par leurs extrémités (télomères) à l’enveloppe nucléaire.

Ces résultats démontrent la conservation de ces mouvements chromosomiques méiotiques chez les plantes et établissent A. thaliana comme une nouvelle espèce modèle pour leur étude fonctionnelle.

Contact : mathilde.grelon@inrae.fr

Les Polluants Organiques Persistants (POPs) sont une famille de substances chimiques qui se dégradent très lentement dans l’environnement, et peuvent se bioaccumuler dans les organismes humains et animaux. Malgré les réglementations mises en place, la population française y reste largement exposée. Dans une étude parue dans Environmental Research, les chercheus du Centre d’Epidémiologie et de Santé des Populations - CESP (UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Villejuif) ont mesuré les biomarqueurs de différents POPs dans des échantillons sanguins prélevés entre 1994 et 1999, chez 468 femmes âgées de 45 à 73 ans et suivies dans la cohorte française E3N.

Au total, 28 substances per- et polyfluoroalkyles, 27 pesticides organochlorés, 14 polychlorobiphényles et 4 polybromodiphényléthers ont été mesurés. Parmi les 73 biomarqueurs mesurés, 41 ont été quantifiés dans plus de 75% des échantillons. Les taux sanguins de polluants ont été comparés à ceux mesurés dans deux études françaises plus récentes menées par Santé Publique France, les études ENNS et Esteban, conduites en 2006-2007 et 2014-2026, respectivement. Cette comparaison a montré que les niveaux de la plupart des polluants pour lesquels la comparaison était possible (c’est à dire, qui ont également été mesurés dans les études Esteban et/ou ENNS) ont diminué au fil du temps. Une analyse en composantes principales a été réalisée sur les 41 POPs qui étaient quantifiés dans au moins 75% des échantillons, afin d'identifier les principaux profils d'exposition. Six profils d'exposition aux POPs ont été mis en évidence, expliquant 62,1% de la variance totale. Les effets sur la santé des profils identifiés pourraient être évalués dans de futures études.

Contact : francesca.mancini@gustaveroussy.fr ou pauline.frenoy@inserm.fr

L’autophagie est un processus de dégradation et recyclage lysosomal des constituants intracellulaires. Elle joue un rôle déterminant dans l’adaptation et la survie des cellules lors des carences nutritionnelles. Dans une étude publiée dans Nature Communications, des scientifiques de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) ont identifié un nouveau mécanisme d’induction de l’autophagie lors de la carence en soufre. Les auteurs ont découvert qu’une carence totale en nutriments soufrés chez la levure modèle S. cerevisiae entraine une induction rapide de la transcription des gènes de l’autophagie (appelés ATG). Ils montrent que cette réponse dépend principalement de l’activateur transcriptionel Met4, connu pour son rôle dans la régulation des gènes du métabolisme soufré. L’inactivation de Met4 entraine un défaut majeur d’autophagie lors d’une carence en soufre, soulignant l’importance de cette régulation transcriptionnelle.

En utilisant des mutants métaboliques touchés dans différentes étapes du métabolisme soufré, les auteurs ont observé que des carences en cystéine, méthionine et S-adénosylméthionine (SAM) induisent chacune individuellement l’autophagie. Cependant, seule la carence en SAM conduit à une forte activation transcriptionnelle des gènes ATG associée à une réponse autophagique pleinement fonctionnelle.

Ces résultats mettent donc en évidence une nouvelle voie de régulation de la réponse autophagique impliquant l’activateur Met4 et utilisant la SAM comme métabolite de signalisation. La double inactivation de Met4 et de l’autophagie entraine une chute de viabilité cellulaire dans des conditions de carence en soufre, soulignant la nécessité d’une coopération entre le métabolisme soufré et l’autophagie pour assurer la survie cellulaire en absence de nutriments soufrés.

Contact : laurent.kuras@i2bc.paris-saclay.fr ou renaud.legouis@i2bc.paris-saclay.fr

Camille Coron est chercheuse en probabilités appliquées à l’évolution et l’environnement. Après 4 ans d’études à l’Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay et une thèse en probabilités appliquées réalisée à l’Ecole Polytechnique, elle a été lectrice Hadamard puis maîtresse de conférences au Laboratoire de Mathématiques d’Orsay et à l’IUT de Sceaux. Elle a ensuite rejoint l’Unité Mathématiques et Informatiques Appliquées - MIA-Paris-Saclay (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau), en septembre 2024.

Passionnée par la modélisation probabiliste pour les sciences du vivant, elle s’est notamment spécialisée dans l’étude de l’évolution génétique des populations biparentales d’une part, et la combinaison de jeux de données de différentes qualités avec des applications à l’écologie et l’environnement d’autre part. Elle co-encadre en particulier la thèse d’Emma Thulliez, à l’INSA de Rouen, qui porte sur la réalisation de cartes de pollution, à partir de combinaison de sorties de modèles physico-chimiques et de mesures de concentration de différentes qualités. Ses travaux récents ont déterminé la loi de la probabilité qu’un gène soit issu d’un ancêtre donné, dans une population biparentale, et l’impact d’un environnement périodique sur l’équilibre entre mutations et sélection.

Son projet de recherche à l’INRAE porte sur la modélisation probabiliste du contrôle de populations d’insectes par lâchers de mâles stériles, avec des applications en santé et en agronomie, et l’étude de l’impact des modes de reproduction sur la composition et l’évolution génétique des populations. Elle collabore avec des généticiens des populations, des biologistes de la conservation, des statisticiens, des analystes et des probabilistes, qui travaillent à Paris, Toulouse, Lyon, Grenoble.

Elle enseigne par ailleurs les probabilités dans le Master 1 Mathématiques fondamentales, les modèles mathématiques en écologie et évolution dans le M2 Biodiversité Ecologie et Evolution, et est responsable du Master 2 Mathématiques pour les sciences du vivant.

« N'ayez pas peur de faire des maths ! »

Contact : camille.coron@inrae.fr