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Rescooped by Loïc Lepiniec from Plant Biology Teaching Resources (Higher Education)
May 2, 2014 4:33 AM
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GM to Order - The Berkeley Science Review

GM to Order - The Berkeley Science Review | SEED-DREAM Lab info | Scoop.it
Efficient genetic engineering and the future of food

Via Mary Williams
Mary Williams's curator insight, May 1, 2014 4:21 PM

Good overview of GM technology including CRISPR/Cas9, and a timeline!

Jorge Lozano-Juste's curator insight, May 2, 2014 11:32 AM

Nice summary of GM-technologies and evolution: from Mendel experiments to CRISPR/Cas9.

Scooped by Loïc Lepiniec
May 1, 2014 11:41 AM
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A comprehensive analysis of microProteins reveals their potentially widespread mechanism of transcriptional regulation

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Scooped by Loïc Lepiniec
May 1, 2014 6:26 AM
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Modeling the evolution of molecular systems from a mechanistic perspective

Modeling the evolution of molecular systems from a mechanistic perspective | SEED-DREAM Lab info | Scoop.it
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Scooped by Loïc Lepiniec
April 28, 2014 3:29 PM
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BMC Genomics | Abstract | Integrating bioinformatic resources to predict transcription factors interacting with cis-sequences conserved in co-regulated genes

Using motif detection programs it is fairly straightforward to identify conserved cis-sequences in promoters of co-regulated genes. In contrast, the identification of the transcription factors (TFs) interacting with these cis-sequences is much more elaborate. To facilitate this, we explore the possibility of using several bioinformatic and experimental approaches for TF identification. This starts with the selection of co-regulated gene sets and leads first to the prediction and then to the experimental validation of TFs interacting with cis-sequences conserved in the promoters of these co-regulated genes.
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Scooped by Loïc Lepiniec
April 26, 2014 1:53 AM
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Workshop Ressources Génétiques 270514

Workshop Ressources Génétiques 270514 | SEED-DREAM Lab info | Scoop.it
Le groupement d’intérêt scientifique (GIS) « Biotechnologies Vertes » a pour but de créer des technologies et compétences, et de produire les connaissances nécessaires au développement de variétés innovantes.
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Scooped by Loïc Lepiniec
April 25, 2014 8:46 AM
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BMC Plant Biology | Abstract | The Theobroma cacao B3 domain transcription factor TcLEC2 plays a duel role in control of embryo development and maturation

The Arabidopsis thaliana LEC2 gene encodes a B3 domain transcription factor, which plays critical roles during both zygotic and somatic embryogenesis. LEC2 exerts significant impacts on determining embryogenic potential and various metabolic processes through a complicated genetic regulatory network.
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Scooped by Loïc Lepiniec
April 24, 2014 12:44 PM
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Controverse documentée à propos de quelques idées reçues sur l’agriculture, l’alimentation et la forêt. Épisode n° 3 : « Les agriculteurs portent atteinte à l'environnement » - Ministère de l'agric...

« En politique, ce qui est cru est plus important que ce qui est vrai » disait Talleyrand. Pour autant, il n'est pas interdit, face à des « idées reçues », de proposer des observations et des points de vue documentés qui confirment, atténuent ou infirment ces idées reçues. Cinq idées reçues sont débattues dans ce document : Nous ne pourrons pas nourrir le monde en 2050, La PAC coûte trop cher, elle doit tourner le dos au productivisme, Les agriculteurs portent atteinte à l'environnement, On mangeait mieux avant, Les forêts disparaissent, elles sont trop exploitées. Les « points de vue » documentés sur ces cinq idées reçues seront présentées successivement en cinq épisodes dans cinq numéros de la Lettre du CGAAER de février à juin 2014. Controverse documentée à propos de quelques idées reçues sur l'agriculture, l'alimentation et la forêt. Épisode n° 3 : « Les agriculteurs portent atteinte à l'environnement » (PDF - 228.3 ko) 250
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Scooped by Loïc Lepiniec
April 24, 2014 3:26 AM
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Essonne : Pose de la première pierre des nouveaux laboratoires de l’Ecole Polytechnique

Ce mercredi à 15h, la première pierre des nouveaux laboratoires de l'Ecole Polytechnique de Paris-Saclay sera posée par Geneviève Fioraso et Laurent Collet-Billon.
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Rescooped by Loïc Lepiniec from Université Paris-Saclay : revue de presse
April 23, 2014 5:06 PM
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Ecosystème Paris-Saclay : 2,5M€ attribués à 40 projets innovants du campus

Ecosystème Paris-Saclay : 2,5M€ attribués à 40 projets innovants du campus Mercredi 09 avril 2014 Dans le cadre du projet IDEX Paris-Saclay, la Fondation de Coopé...

Via Univ Paris-Saclay
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Scooped by Loïc Lepiniec
April 22, 2014 9:36 AM
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Microbes Will Feed the World, or Why Real Farmers Grow Soil, Not Crops - Modern Farmer

Microbes Will Feed the World, or Why Real Farmers Grow Soil, Not Crops - Modern Farmer | SEED-DREAM Lab info | Scoop.it
It's not just better crops that will feed the world -- it's better microbes.
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Scooped by Loïc Lepiniec
April 21, 2014 5:40 AM
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Production of a Brassica napus low molecular mass acyl-CoA-binding protein in Arabidopsis alters the acyl-CoA pool and acyl composition of oil in seeds

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Scooped by Loïc Lepiniec
April 21, 2014 5:21 AM
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Modulation of flavonoid metabolites in Arabidopsis thaliana through overexpression of the MYB75 transcription factor: role of kaempferol-3,7-dirhamnoside in resistance to the specialist insect herb...

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Scooped by Loïc Lepiniec
May 1, 2014 4:03 PM
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The Modern View of Domestication Special Feature

The Modern View of Domestication Special Feature | SEED-DREAM Lab info | Scoop.it
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Scooped by Loïc Lepiniec
May 1, 2014 11:51 AM
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Molecular regulation of plant somatic embryogenesis - Springer

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Scooped by Loïc Lepiniec
May 1, 2014 11:39 AM
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Brassinosteroids control root epidermal cell fate via direct regulation of a MYB-bHLH-WD40 complex by GSK3-like kinases

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Rescooped by Loïc Lepiniec from GMOs, NBT & Sustainable agriculture
May 1, 2014 3:23 AM
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Peut-on breveter la nature ?

Peut-on breveter la nature ? | SEED-DREAM Lab info | Scoop.it
Les multinationales semencières sont presque seules à être favorables à la délivrance de brevets sur des gènes se trouvant dans la nature.

Un petit événement est survenu mardi 29 avril dans l'hémicycle du Conseil économique, social et environnemental, à Paris, où le Haut Conseil des biotechnologies organisait, pour son cinquième anniversaire, un colloque consacré au brevetage du vivant. Guy Kastler, grand défenseur de la liberté pour les agriculteurs de reproduire leurs semences, s'est félicité des « convergences » entre la Confédération paysanne, qu'il représentait, et le Groupement national interprofessionnel des semences et plants (GNIS), pourtant généralement rangé dans le camp adverse.

C'est que le sujet à l'ordre du jour, celui des défis de la politique européenne face au brevetage des gènes, fait bouger les lignes de partage habituelles. La Confédération paysanne et le GNIS avaient déjà coprésidé le groupe de travail du HCB dont les conclusions ont abouti, en juin 2013, à une recommandation mettant en garde le gouvernement français sur les dangers pour la recherche de la multiplication de brevets délivrés au niveau européen sur des plantes, et en particulier sur des gènes dits natifs, c'est-à-dire existant tels quels dans la nature.

« Il y a une quasi unanimité des acteurs contre la brevetabilité des gènes natifs, à l'exception des grosses entreprises de semences, assure François Burgaud, directeur des relations extérieures du GNIS. La science fait tant de progrès qu'il va être de plus en plus facile d'isoler tel gène correspondant à telle fonction. S'ils sont systématiquement brevetés, c'est la fin des méthodes classiques de sélection par croisement. »

Lire aussi : « Les brevets sur le vivant verrouillent l’accès aux ressources génétiques »

« REVERSER DES DROITS À LA NATURE »

On a un peu parlé de gènes humains, lors du colloque, mais surtout des laitues, poivrons, tomates ou brocolis qui font l'objet de protections délivrées par l'Office européen des brevets. Ce dernier a ainsi breveté en mai 2013 des poivrons présentant un gène de résistance à la mouche blanche. Ce gène avait été trouvé par le semencier suisse Syngenta dans une variété jamaïcaine sauvage de poivron non comestible. « Les gènes natifs ne devraient pas être brevetables, car si on les brevète, il faudrait reverser des droits à la nature », a déclaré le sociologue Michel Callon, professeur à l'Ecole des mines.

Avec une certaine bravoure, Jean Donnenwirth, directeur juridique du semencier Pioneer pour l'Europe, a appelé à ne pas affaiblir le niveau de protection apporté par le brevet aux innovateurs. « Les gènes natifs vont constituer un axe majeur de recherche dans les années à venir face aux défis qui se posent à l'humanité en termes d'alimentation et d'agriculture, a-t-il déclaré. Les exclure du champ de la brevetabilité n'inciterait pas les grands acteurs du secteur privé à investir dans ce domaine. »

OBSTACLE À L'INNOVATION ?

Le brevet constitue-t-il un frein ou un moteur de l'innovation ? Chacun est resté sur ses positions mais Sophie Joissains, sénatrice (UMP) des Bouches-du-Rhône, a rappelé que son assemblée avait voté, en janvier, une résolution s'inquiétant notamment des risques de blocage de l'innovation du fait du brevetage des gènes natifs.

La question semble faire consensus sur le plan politique : dans un discours de clôture du colloque, le ministre de l'agriculture, Stéphane Le Foll, a finalement pris position contre les brevets sur les plantes et appelé à faire évoluer les pratiques de l'Office européen des brevets. Il n'a cependant pas été jusqu'à annoncer de texte de loi, sur le modèle de celui voté le 15 avril par l'Assemblée nationale, qui interdit la culture des organismes génétiquement mofidiés sur le sol français.


Via Christophe Jacquet
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Scooped by Loïc Lepiniec
April 26, 2014 2:45 AM
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Cloning of TTG1 gene and PCR identification of genomes A, B and C in Brassica species - Online First - Springer

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Scooped by Loïc Lepiniec
April 26, 2014 1:48 AM
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Petit Pois Déridé 2014 - Paris Sud - Accueil

Petit Pois Déridé 2014 - Paris Sud - Accueil | SEED-DREAM Lab info | Scoop.it
Loïc Lepiniec's insight:

Petit Pois Déridé 201436ème réunion du Groupe d'Etude de Biologie et Génétique des Populations
Du lundi 25 au jeudi 28 août 2014
Université Paris Sud (Orsay)  

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Scooped by Loïc Lepiniec
April 25, 2014 2:23 AM
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A propos du Conflit de canard...

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Scooped by Loïc Lepiniec
April 24, 2014 12:43 PM
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Le déploiement des nanotechnologies et de la biologie de synthèse dans l’industrie française - Ministère de l'agriculture, de l'agroalimentaire et de la forêt

Le déploiement des nanotechnologies et de la biologie de synthèse dans l’industrie française - Ministère de l'agriculture, de l'agroalimentaire et de la forêt | SEED-DREAM Lab info | Scoop.it
Une mission interministérielle a été chargée d'évaluer le potentiel industriel des nanotechnologies et de la biologie de synthèse en France. Elle propose les modalités selon lesquelles l'État français pourrait en susciter le développement et en assurer le contrôle.250
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Scooped by Loïc Lepiniec
April 24, 2014 3:25 AM
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Polytechnique crée 8000m² de laboratoires

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Scooped by Loïc Lepiniec
April 23, 2014 3:50 AM
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Subcellular and supracellular mechanical stress prescribes cytoskeleton behavior in Arabidopsis cotyledon pavement cells

Subcellular and supracellular mechanical stress prescribes cytoskeleton behavior in Arabidopsis cotyledon pavement cells | SEED-DREAM Lab info | Scoop.it

Although it is a central question in biology, how cell shape controls intracellular dynamics largely remains an open question. Here, we show that the shape of Arabidopsis pavement cells creates a stress pattern that controls microtubule orientation, which then guides cell wall reinforcement. Live-imaging, combined with modeling of cell mechanics, shows that microtubules align along the maximal tensile stress direction within the cells, and atomic force microscopy demonstrates that this leads to reinforcement of the cell wall parallel to the microtubules. This feedback loop is regulated: cell-shape derived stresses could be overridden by imposed tissue level stresses, showing how competition between subcellular and supracellular cues control microtubule behavior. Furthermore, at the microtubule level, we identified an amplification mechanism in which mechanical stress promotes the microtubule response to stress by increasing severing activity. These multiscale feedbacks likely contribute to the robustness of microtubule behavior in plant epidermis.

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Scooped by Loïc Lepiniec
April 21, 2014 6:19 AM
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Transcription factor-dependent nuclear localization of a transcriptional repressor in jasmonate hormone signaling

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Scooped by Loïc Lepiniec
April 21, 2014 5:33 AM
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Frontiers | Ovule development, a new model for lateral organ formation | Plant Evolution and Development

In spermatophytes the ovules upon fertilization give rise to the seeds. It is essential to understand the mechanisms that control ovule number and development as they ultimately determine the final number of seeds and, thereby, the yield in crop plants. In Arabidopsis thaliana, ovules arise laterally from a meristematic tissue within the carpel referred to as placenta. For a correct determination of the number of ovules, a precise establishment of the positions where ovule primordia emerge is needed, and a tight definition of the boundaries between ovules is therefore also required. In the last decades, few factors have been identified to be involved in the determination of ovule number. Recently, plant hormones have also been revealed as fundamental players in the control of the initiation of ovule formation. In this review we summarize the current knowledge about both the molecular and hormonal mechanisms that control ovule formation in Arabidopsis thaliana.
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