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NeuroSpin combine IRM et Intelligence Artificielle pour développer un outil de biopsie virtuelle non invasif

NeuroSpin combine IRM et Intelligence Artificielle pour développer un outil de biopsie virtuelle non invasif | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’utilisation des très hauts champs magnétiques améliore sensiblement la résolution spatiale des données d’imagerie par résonance magnétique (IRM) sans toutefois permettre d’atteindre l’échelle microscopique qui permet de visualiser les cellules individuelles. Dans le cadre du flagship européen Human Brain Project, Cyril Poupon & Kévin Ginsburger de NeuroSpin (Institut des Sciences du Vivant Frédéric Joliot, CEA de Saclay) et leurs collaborateurs du Research Centre Juelich (Institute of Neuroscience and Medicine INM1, Juelich, Germany) développent une approche originale qui repose sur l’utilisation de simulations numériques à large échelle pour entraîner des algorithmes de machine learning afin de procéder au décodage in vivo de l’organisation cellulaire des tissus cérébraux de volontaires sains ou patients à partir de simples acquisitions d’IRM pondérées en diffusion, sensibles au mouvement microscopique de l’eau à l’intérieur des tissus.

 

L’outil de décodage repose sur plusieurs étapes de simulations nécessitant l’utilisation d’infrastructures de calcul à haute performance (HPC), parmi lesquelles une étape de simulation numérique d’une grande collection d’échantillons virtuels ultra-réalistes du tissu cérébral qui a nécessité le développement d’une nouvelle méthode que l’équipe de NeuroSpin vient de publier dans un article de la revue Neuroimage.

 

Dans cet article, l’équipe détaille le principe de ce nouvel algorithme appelé MEDUSA (pour Microstructure Environment Designer with Unified Sphere Atoms) et démontre qu’il permet de synthétiser la géométrie des membranes de populations de cellules correspondant à n’importe quelle région cérébrale. Reposant sur la prescription d’un jeu de quelques dizaines de paramètres, il permet de créer des échantillons virtuels de tissu avec un degré de réalisme encore jamais atteint in silico.

 

Ce nouvel outil permet désormais de simuler le signal IRM attendu pour toute configuration de populations de cellules à même de peupler le tissu cérébral, et donc d’apprendre la signature IRM propre à chacune de ces configurations en entraînant une méthode d’apprentissage machine. Une fois entraînée, la méthode peut alors être utilisée pour décoder l’organisation cellulaire à partir d’un jeu réduit de signaux IRM, constituant ainsi un véritable outil permettant de réaliser des biopsies virtuelles.

 

Cet outil, fondé sur l’utilisation conjointe de méthodes d’IRM et de méthodes d’intelligence artificielle (IA), vise non seulement à répondre au besoin de la recherche fondamentale sur le cerveau humain, en particulier du décodage in vivo de la cytoarchitecture du cortex cérébral, mais aussi au besoin de la recherche clinique afin de mettre à disposition des cliniciens un substitut à la biopsie qui reste un acte chirurgical très invasif.

 

L’outil développé fait d’ores-et-déjà l’objet de premières campagnes de simulation au sein du Très Grand Centre de Calcul du CEA (CCRT, Bruyères-le-Châtel), afin de démontrer qu’il était possible de quantifier précisément le gonflement des axones qui survient lors d’un accident vasculaire cérébral, et une campagne de plus grande ampleur pour simuler une dizaine de milliards d’échantillons virtuels fait actuellement l’objet d’une demande de ressources auprès du GENCI afin de permettre la cartographie in vivo de la microstructure de la substance blanche cérébrale.

 

Légende de la figure: synthèse d’un échantillon cubique de 100 micromètres de côté, représentatif de la substance blanche cérébrale, et généré à partir du simulateur MEDUSA, incluant près de 200 axones myélinisés, ainsi que de nombreux astrocytes et oligodendrocytes

 

Contact : cyril.poupon@gmail.com ou kginsburger@gmail.com

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FOCUS PLATEFORME : Expérimentation à haut débit : accélérer l’innovation en découverte et optimisation de réactions chimiques !

FOCUS PLATEFORME : Expérimentation à haut débit : accélérer l’innovation en découverte et optimisation de réactions chimiques ! | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La plateforme d’expérimentation à haut débit (HTE – High-Throughput Experimentation) du CEA Paris Saclay (Institut Joliot, département médicaments et technologies pour la santé, Service de Chimie Bioorganique et de Marquage (SCBM)), créée en 2021, est la toute première de ce type dans le paysage académique français. Spécifiquement dédiée au développement accéléré et miniaturisé de nouvelles réactions chimiques, cette toute nouvelle plateforme a su convaincre le monde académique, comme industriel, chez qui la demande d’expertise en HTE est très forte.

 

Au-delà des projets de recherche internes, la plateforme d’expérimentation à haut débit collabore avec les laboratoires de recherche Servier notamment au travers d’une première thèse CIFRE dont le démarrage est prévu début 2023. La plateforme collabore également avec des chercheurs de l’écosystème académique français, dans le périmètre de l’Université Paris-Saclay, comme l’ICSN et l’ICMMO (financement Labex Charmmmat), mais également au-delà de la région parisienne, comme au travers d’une collaboration avec l’équipe de Marc Mauduit à l’Institut des Sciences Chimiques de Rennes (ISCR) où des expérimentations en métathèses d’oléfines asymétriques sont actuellement en cours. Nous espérons ainsi accélérer drastiquement les processus d’optimisation et pouvoir ainsi identifier le meilleur catalyseur chiral pour les transformations ciblées.

 

De plus, de par l’utilisation de réacteurs au format microplaque 96 puits, l’expérimentation à haut débit est également le moyen le plus efficace de générer de grandes quantités de résultats (positifs et négatifs) de manière standardisée, non dépendant du manipulateur. Ces données de qualité représentent une formidable source pour l’élaboration d’algorithmes prédictifs de haute qualité par Machine Learning. Le laboratoire s’est donc allié à l’autres acteurs européens comme IBM, Janssen ou encore ICIQ afin de proposer des actions permettant la généralisation du développement d’algorithmes prédictifs comme puissants outils pour l’élaboration de nouvelles méthodologies de synthèse.

 

La plateforme d’expérimentation à haut débit, est ouverte à la collaboration comme à la prestation, et souhaite se positionner en avant-garde de l’innovation en Synthèse Organique et Catalyse, et venir ainsi en soutien aux laboratoires des écosystèmes académiques et industriels français et européens.

 

Eugénie Romero-Laboureur (eugenie.romero@cea.fr)

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

 

Aussi, le 25 avril dernier, la plateforme publiait son premier FOCUS PLATEFORME ! Accélérer l'innovation en découverte et l'optimisation de réactions chimiques … découvrez la toute nouvelle plateforme d'expérimentation à haut débit ! Le relire ?

 

MTS / Plateforme d’expérimentation à haut débit (HTE). L’expérimentation à haut débit (High-Throughput Experimentation - HTE) consiste en la miniaturisation et la parallelisation de réactions chimiques à une échelle standard de 10 micromoles pour la découverte ou l’optimisation de réactions, permettant un gain de temps et d’argent considérables, tout en augmentant drastiquement le nombre de combinaisons possibles (format standard : plaque 96 puits). Inspiré de la plateforme HTE de l’Université de Pennsylvanie (Philadelphie), le CEA s’est récemment doté de l’expertise et de l’instrumentation nécessaires pour permettre le développement de nouvelles méthodologies de synthèse ainsi que la résolution de transformations chimiques difficiles. La plateforme d’expérimentation à haut débit, créée en 2021, est accessible aux utilisateurs du monde académique comme industriel.

 

A propos de l’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot : L’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot (CEA-Joliot) étudie les mécanismes du vivant pour, à la fois, produire des connaissances et répondre à des enjeux sociétaux au cœur de la stratégie du CEA : la santé et la médecine du futur, le numérique et la transition énergétique. Les travaux, fondamentaux ou appliqués, reposent sur des développements méthodologiques et technologiques. Les collaborateurs du CEA-Joliot sont pour moitié impliqués dans des unités mixtes de recherche (UMR), en partenariat avec le CNRS, l'INRAE, l’INRIA, l'Inserm, l’Université Paris-Saclay et l’Université de Paris. Le CEA-Joliot est implanté principalement sur le centre CEA-Paris-Saclay. Des équipes travaillent également à Orsay, Marcoule, Caen, Nice et Bordeaux.

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Valorisation d’un nouveau procédé de concentration de liposomes

Valorisation d’un nouveau procédé de concentration de liposomes | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Sylviane Lesieur, Directrice de recherche CNRS et membre de l’Institut Galien Paris-Saclay (UMR 8612 CNRS/UPSaclay, Orsay) a développé un procédé innovant et breveté de concentration de liposomes, des vésicules lipidiques utilisées comme réservoirs et vecteurs de substances d’intérêt. L’équipe Marketing de l’Innovation de la SATT Paris-Saclay a répondu à sa demande de recherche de partenaires industriels pour exploiter cette technologie.

 

Les liposomes sont des vésicules composées de bicouches lipidiques (ou membrane) enfermant un volume aqueux de quelques dizaines de nanomètres à quelques microns de diamètre. Biomimétiques et biocompatibles, les liposomes peuvent incorporer dans leur membrane ou encapsuler dans leur volume aqueux interne une grande variété de molécules tout en préservant leur stabilité et leur activité. Ainsi les liposomes sont largement employés en tant que réservoirs ou vecteurs de substances actives dans différents domaines tels que pharmaceutique, cosmétique ou nutraceutique… Cependant, un inconvénient très souvent rencontré est la faible concentration des liposomes à l’issue du processus de fabrication.

 

Sylviane Lesieur a mis au point un procédé de concentration extemporanée et réversible préservant l’intégrité structurales des liposomes dénommé Cyclosome. Ce procédé, simple et très peu coûteux à mettre en œuvre, peut être adapté pour différentes applications. Il permet par exemple la lyophilisation des liposomes concentrés, un avantage pour leur conservation, et leur réhydratation sans altération de leur structure ou de la substance contenue. Le procédé est également compatible avec la production par nébulisation d’un aérosol : la première preuve de concept a été la mise au point d’une nouvelle forme pharmaceutique liposomale permettant l’administration par inhalation de molécules actives pour le traitement local de pathologies pulmonaires. Une seconde étude et preuve de concept a porté sur la production de liposomes concentrés pour des applications cosmétiques.

 

A l’issue de ces résultats, Sylviane Lesieur et le CNRS se sont tournés vers la SATT Paris-Saclay afin d’identifier des industriels intéressés par la valorisation de cette technologie brevetée. Cette demande a donné lieu à une étude en deux parties : la première avait pour objectif de dresser le panorama du marché et de la chaîne de la valeur des fabricants et utilisateurs de liposomes dans différents domaines applicatifs. La deuxième partie consistait à définir la proposition de valeur du procédé pour chacun de ces domaines, à identifier et contacter différents industriels pertinents et leur présenter la technologie Cyclosome en vue d’un partenariat ou d’un transfert de technologie.

 

Les conclusions de l’étude ont permis de mettre en lumière l’intérêt de différents industriels spécialistes des formulations liposomales pour cette technologie et d’initier de nouvelles discussions avec Sylviane Lesieur et le CNRS.

 

« Sylviane Lesieur dispose d’un savoir-faire unique et reconnu dans le domaine des formulations liposomales, et les preuves de concept de la technologie Cyclosome sont prometteuses. Il était important d’apporter une vue globale des besoins industriels dans différents secteurs applicatifs afin de cibler au mieux les prochains collaborateurs ou exploitants de l’innovation. Notre accompagnement a révélé l’intérêt de différents acteurs industriels et d’ouvrir de nouvelles perspectives, notamment dans le domaine de la nutraceutique. Nous espérons que ces opportunités se concrétiseront prochainement par la valorisation du brevet et du savoir-faire. »

 

Charlotte Gaultier, Cheffe de Projet Marketing de l’Innovation, SATT Paris-Saclay

 

« L’étude de valorisation menée conjointement avec la SATT a permis une mise à jour approfondie et très riche des domaines et activités susceptibles de porter un intérêt sur l’invention que nous avons co-brevetée avec le CNRS. L’accompagnement effectué par la SATT a donc constitué un apport extrêmement constructif.

Plusieurs pistes concrètes de sociétés ont été identifiées, sociétés ayant formulé leur volonté d’échanger plus profondément sur les contours de l’invention afin de pouvoir analyser un potentiel transfert de technologie ou l’intérêt d’engager l’acquisition d’une licence.

Pour illustrer les premières retombées de cette étude, parmi les sociétés identifiées, l’une d’entre elles m’a très récemment contactée et un accord de confidentialité a été signé avec le CNRS pour permettre de progresser sur une interaction contractuelle concrète en lien avec un apport de savoir-faire dans le domaine des liposomes et l’applicabilité de notre procédé de concentration aux formulations liposomales mises en oeuvre par ladite société.

Je ne peux que recommander vivement aux collègues en phase de valorisation d’une de leurs inventions de solliciter la SATT Paris-Saclay pour les accompagner dans leurs projets. » 

 

Sylviane Lesieur, Directrice de recherche CNRS, Institut Galien

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Vincent Bouhier est élu Président de l'Université d'Évry Paris-Saclay

Vincent Bouhier est élu Président de l'Université d'Évry Paris-Saclay | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Vincent Bouhier est élu président de l’Université d’Évry Paris-Saclay le 31 janvier 2023. Il succède à Patrick Curmi (2015-2023). Il a été élu président dès le 1er tour de scrutin à la majorité absolue avec 23 voix sur 34.

Docteur en droit spécialisé en droit public et droit européen, doyen de l’UFR de Droit et Science Politique, Vincent Bouhier est élu au Conseil d’Administration de l’Université d’Évry dès 2014 et devient 2d vice-président Recherche en 2019.

Au sein du Centre de Recherche Léon Duguit (CRLD), il coordonne une équipe de recherche « Particuliers, Droits international et européen ».

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L’activité de liaison de BRCA2 à l’ADN double brin permet de prévenir les gaps de réplication

L’activité de liaison de BRCA2 à l’ADN double brin permet de prévenir les gaps de réplication | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le stress réplicatif est un obstacle à l'intégrité génomique et est particulièrement critique dans les cellules en division constante, telles que les cellules cancéreuses.

 

Dans une étude parue dans Nature Communications, les chercheurs de de l’UMR 3348 (CNRS/UPSaclay/Institut Curie, Orsay) révèlent que la fonction de liaison à l'ADN double brin de la région N-terminale de BRCA2 est nécessaire pour prévenir/réparer les « ssDNA gaps » à la fourche de réplication bloquée. Des mutations de BRCA2 identifiées chez les patientes atteintes d'un cancer du sein altèrent cette fonction, suggérant sa pertinence clinique.

 

Contact : acarreira@cbm.csic.es

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Caractérisation et classification des lésions aiguës et chroniques de la sclérose en plaques à l'aide de l’intelligence artificielle

Caractérisation et classification des lésions aiguës et chroniques de la sclérose en plaques à l'aide de l’intelligence artificielle | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La sclérose en plaques (SEP) est une maladie inflammatoire chronique caractérisée par l'apparition de lésion dans le système nerveux central, notamment dans le cerveau. L'imagerie par résonance magnétique (IRM) permet de localiser ces lésions ; l’examen IRM révèle ainsi la distribution spatiale des lésions de SEP a un instant donné, mais ne permet cependant pas de distinguer les lésions formées récemment (dites « aiguës ») des lésions présentes depuis un certain temps (dites « chroniques »). Cette distinction est pertinente pour la prise en charge clinique des patients atteints de SEP, chez qui la mise en évidence d'une activité récente de la maladie peut informer le pronostique et orienter le choix du traitement.

 

Dans une étude publiée dans NeuroImage, les chercheurs de Biogen Digital Health (Biogen, Cambridge, MA, USA), du Montreal Neurological Institute (McGill University, Montreal, QC, Canada), de NeuroRx Research (Montreal, Canada), de CentraleSupélec (UPSaclay, Gif-sur-Yvette) et de TheraPanacea (Paris) ont développé un algorithme d’intelligence artificielle (IA) afin d’identifier les lésions de SEP apparues au cours des 6 mois précédents un examen IRM conventionnel.

 

Dans un premier temps, un algorithme d’inpainting génère, à partir d’une image IRM provenant d’un patient atteint de SEP, une nouvelle image IRM synthétique dans laquelle les lésions de SEP sont remplacées par du tissu non-lésionnel. Cette image synthétique offre une référence « saine » (qui ne contient pas de lésions) avec laquelle l’image « malade » (qui contient des lésions) peut être comparée dans un second temps via une analyse radiomique visant à détecter des indices texturaux permettant de distinguer les lésions aiguës des lésions chroniques.

 

Ainsi, à partir de 16 mesures radiomiques identifiées par cette méthode, les lésions aigues peuvent être distinguées des lésions chroniques avec une précision supérieure à 74%.

 

Légende Figure : Classification d’une lésion de sclérose en plaque selon son âge (aiguë, 6 mois ; chronique >6 mois) à partir d’une image IRM « malade » et de son équivalent synthétique « sain ».

 

Contact : bastien.caba@biogen.com

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Le catabolisme de la proline contrôle la qualité de la graine chez Arabidopsis en assurant une remobilisation efficace du carbone et de l’azote

Le catabolisme de la proline contrôle la qualité de la graine chez Arabidopsis en assurant une remobilisation efficace du carbone et de l’azote | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La remobilisation des nutriments chez les plantes est un phénomène qui a lieu lors de la mise en place de la phase reproductive. Il s’agit d’un transport longue distance des ressources azotée et carbonées, telles que les acides aminés et les sucres, depuis les feuilles en sénescence vers les graines en formation. Ce processus permet d’alimenter la graine en énergie et en précurseurs pour la synthèse de composés de réserve.

 

Ces dernières années, plusieurs études ont démontré l’importance du catabolisme de la proline dans la sénescence foliaire. Récemment, les travaux réalisés par les équipes de Arnould Savouré à iEES-Paris (Sorbonne Université) et de Céline Masclaux-Daubresse à l’Institut Jean-Pierre Bourgin – IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) ont mis en évidence un important défaut de remobilisation de l’azote et du carbone chez un mutant KO pour le gène codant la Pyrroline-5-carboxylate déshydrogénase, deuxième enzyme impliquée dans le catabolisme de la proline. Des expériences de marquage avec l’isotope lourd 15N de l’azote révèlent un défaut de flux azoté entre les feuilles, les hampes florales et les graines. Ce défaut de remobilisation induit la production de graines déformées qui présentent de très faibles capacités germinatives.

 

Ce travail, publié dans Journal of Experimental Botany, montre le rôle important du catabolisme de la proline dans l'efficacité de la plante à réutiliser l'azote et le carbone qui sont essentiels au rendement et à la qualité des graines. Il ouvre de nouvelles perspectives pour améliorer ou créer des variétés utilisant mieux l’azote et/ou produisant des graines de meilleure qualité.

 

Légende Figure : Représentation schématique du défaut de remobilisation de l’azote de la rosette et des hampes florales vers les graines chez le mutant p5cdh d’Arabidopsis.

 

Contact : corentin.dourmap@laposte.net, arnould.savoure@sorbonne-universite.fr ou celine.masclaux-daubresse@inrae.fr

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La radiothérapie pour augmenter l’efficacité des CAR-T cells dans les tumeurs solides : une synthèse de la littérature

La radiothérapie pour augmenter l’efficacité des CAR-T cells dans les tumeurs solides : une synthèse de la littérature | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les CAR-T cells (Chimeric antigen receptor T cell) sont des lymphocytes qui, après modification génétique, sont capables d’exprimer un récepteur spécifique d’un antigène tumoral donné. Les thérapies à base de CAR-T cells sont à l’origine d’avancées majeures dans des pathologies hématologiques réfractaires de mauvais pronostic (leucémie aiguë lymphoblastique, lymphome B diffus à grandes cellules).

 

Cependant, malgré ces résultats prometteurs en hématologie, les principaux essais expérimentant les CAR-T cells dans les tumeurs solides se sont révélés infructueux. La raison de cette inefficacité est à rechercher dans les particularités des tumeurs solides par rapport aux pathologies hématologiques : une plus grande hétérogénéité des antigènes tumoraux et un microenvironnement tumoral immunosuppressif qui restreint l’efficacité des effecteurs cellulaires.

 

Ces conditions délétères constituent un frein à la fois pour l’attraction, la rétention et l’efficacité des CAR-T cells au sein de la tumeur. La radiothérapie, en plus de son action cytotoxique directe, est capable de modifier le microenvironnement des tumeurs et de le polariser en un phénotype pro-inflammatoire et anti-tumoral. Ainsi, par la délivrance de radiations ionisantes de manière focalisée sur des lésions cancéreuses, nous pourrions augmenter l’efficacité pour l’instant décevante des CAR-T cells dans cette indication.

 

C’est ce que montrent les chercheurs de l’unité de Radiothérapie Moléculaire et Innovation Thérapeutique (UMR-S 1030 INSERM/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif) dans une revue parue dans OncoImmunology où ils expliquent, sur la base des connaissances actuelles, de quelle manière la radiothérapie pourrait améliorer l’efficacité des CAR-T cells chez les patients souffrant de tumeurs non-hématologiques afin qu’eux aussi puissent bénéficier de cette innovation thérapeutique majeure.

 

Contact : pierre.laurent@gustaveroussy.fr

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Webinaire de PASREL-Imagerie : Qu’est-ce que l’immuno-TEP apporte par rapport aux autres techniques d’imagerie ?

Webinaire de PASREL-Imagerie : Qu’est-ce que l’immuno-TEP apporte par rapport aux autres techniques d’imagerie ? | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

PASREL-Imagerie met en ligne gratuitement son premier webinaire consacré à l’imagerie immuno-TEP. Cette technique combine l’utilisation de tomographie par émissions de positons (TEP) et le radiomarquage d’anticorps.

 

Ce webinaire est destiné aux acteurs de la recherche médicale (managers, médecins, chercheurs, ingénieurs) désireux de comprendre et maitriser les différents aspects de l’imagerie in vivo pour améliorer l’efficacité de leur R&D. Il est le premier d’une série de webinaires d’introduction aux technologies d’imagerie médicale.

 

Lien d’inscription

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Appels à projets de recherche 2023 Fédération Française de Cardiologie

Appels à projets de recherche 2023 Fédération Française de Cardiologie | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La Fédération Française de Cardiologie lance à nouveau ses appels d'offres dédiés à la recherche pour le soutien des jeunes chercheurs et des équipes.

Liste des appels à projets (sélectionnez chaque appel pour voir les détails) :

Grands projets (projets collaboratifs)

Impulsion (aides au démarrage)

Thématiques

Dotation de recherche

Mobilité à l'étranger

Master 2


Contact : recherche@fedecardio.org

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Alimentation pro-végétale saine et moins saine, évolution des symptômes d’asthme et médiation par l’indice de masse corporelle chez les femmes âgées de l’étude française Asthma-E3N

Alimentation pro-végétale saine et moins saine, évolution des symptômes d’asthme et médiation par l’indice de masse corporelle chez les femmes âgées de l’étude française Asthma-E3N | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans le contexte de réflexion sur l’alimentation « durable », les scores alimentaires « healthy Plant-Based Diet Index » (hPDI) et « unhealthy Plant-Based Diet Index » (uPDI) permettent d’évaluer les effets sur la santé d’une alimentation pro-végétale saine et moins saine. Alors que les protéines animales semblent avoir un effet délétère sur le risque d’asthme, et que les végétaux complets auraient plutôt un effet bénéfique, on ignore l’effet des produits raffinés issus des végétaux. De plus, l’obésité pourrait moduler les associations entre types d’alimentation et asthme.

 

Des chercheurs de l’Équipe d’Épidémiologie Respiratoire Intégrative du CESP (UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Villejuif) ont étudié les relations entre ces deux scores alimentaires (hPDI et uPDI) et l’évolution des symptômes d’asthme, et l’effet médiateur potentiel de l’indice de masse corporelle (IMC).

 

Chez 5700 femmes (âge moyen 63 ans) de la cohorte E3N, une alimentation pro-végétale saine (hPDI ; riche en céréales complètes, fruits, légumes) était associée à une incidence plus faible de symptômes d'asthme, un tiers de cette association étant médié par l'IMC ; et une alimentation pro-végétale moins saine (uPDI ; riche en pain, pâtes, riz blancs) était également associée à une incidence plus faible de symptômes d'asthme mais l’association était presque entièrement médiée par l'IMC.

 

Ces résultats publiés dans Nutrients suggèrent un effet positif sur les symptômes d’asthme d’une alimentation pro-végétale par rapport à une alimentation riche en produits animaux. Cependant seule l’alimentation pro-végétale saine, riche en végétaux complets a un effet propre, celui d’un régime pro-végétal moins sain étant entièrement médié par son effet sur la réduction de l’IMC.

 

Contact : raphaelle.varraso@inserm.fr

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Lancement des appels à projets 2023 de la FRM

Lancement des appels à projets 2023 de la FRM | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La Fondation pour la Recherche Médicale a le plaisir de vous annoncer le lancement de l’édition 2023 de son appel à projets Amorçage de jeunes équipes et de ses deux appels à projets thématiques 2023 :

 

Amorçage de jeunes équipes

 

L'appel à projets Amorçage de jeunes équipes est destiné à soutenir l’installation de nouvelles équipes de recherche en France.
La notice explicative est à votre disposition pour compléter la demande.

  • Ouverture des demandes : 9/02/2023 à 15h, heure de Paris
  • Clôture des demandes : 13/04/2023 à 15h, heure de Paris
  • Sélection des demandes : mai 2023

 

Approches interdisciplinaires pour comprendre les mécanismes fondamentaux des maladies neurodégénératives

 

Les maladies neurodégénératives constituent un défi médical parmi les plus importants actuellement dans le monde. Il est indispensable d’élucider les mécanismes fondamentaux impliqués dans l’étiologie de ces maladies complexes.
Après deux appels à projets, en 2019 dédié à la maladie d’Alzheimer et aux maladies apparentées, et en 2020 élargi à l’ensemble des maladies neurodégénératives, la FRM poursuit en 2023 son action dans ce domaine et lance un nouvel appel à projets pour soutenir des approches interdisciplinaires destinées à comprendre les mécanismes fondamentaux des maladies neurodégénératives.
L’ambition de la FRM est de continuer à attirer de nouveaux acteurs dans le domaine de recherche sur les maladies neurodégénératives, à favoriser les recherches interdisciplinaires pour explorer de nouvelles hypothèses et faire émerger de nouveaux concepts.
La notice explicative est à votre disposition pour compléter la pré-demande.

  • Ouverture des demandes : 24/01/2023 à 15h, heure de Paris
  • Clôture des pré-demandes : 15/03/2023 à 16h, heure de Paris
  • Sélection des demandes : automne 2023

 

Environnement et Santé

 

L’exposition chronique à des agents environnementaux (pollution de l’air, des sols, des eaux par des agents physiques ou chimiques, infectieux, ou des contaminants alimentaires) et les conséquences du changement climatique peuvent avoir des impacts multiples sur la santé humaine.
Dans cet appel à projets, la construction d’un consortium interdisciplinaire sera encouragée avec le but de promouvoir à terme une politique de prévention des pathologies liées à l’exposition environnementale.
Ces projets doivent être portés par au moins deux équipes de recherche de disciplines différentes, dont une équipe travaillant dans le domaine des sciences humaines et sociales, contribuant ainsi au développement de recherches interdisciplinaires entre les sciences biologiques et médicales et les sciences humaines et sociales. 
La notice explicative est à votre disposition pour compléter la demande.

  • Ouverture des demandes : mi-février 2023
  • Clôture des demandes : mi-mars à 16h
  • Sélection des demandes : automne 2023

 

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Didier Samuel, un hépatologue à la tête de l’Inserm

Didier Samuel, un hépatologue à la tête de l’Inserm | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans les tout prochains jours, Didier Samuel sera nommé à la tête de l’Institut national de la santé et de la recherche médicale (Inserm). La nomination de cet hépatologue a été approuvée, jeudi 26 janvier, par le Parlement (30 voix pour, 18 voix contre). Mais députés et sénateurs se sont opposés : les premiers ont voté pour, les seconds contre, dénonçant « un nouveau fait du prince venu de l’Elysée », Emmanuel Macron ayant refusé de reconduire Gilles Bloch pourtant candidat à un second mandat. Dans un tweet, le sénateur des Hauts-de-Seine Pierre Ouzoulias (Parti communiste) a tenu à préciser que « ni la personne de Didier Samuel ni ses compétences ne sont remises en cause » par ce vote. Sa nomination devrait être entérinée lors d’un prochain conseil des ministres.

 

Lire la suite de l'article paru dans Le Monde.

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Les "Lundis de l'IPSIT" - Lundi 6 mars 2023 à 9h15

Les "Lundis de l'IPSIT" - Lundi 6 mars 2023 à 9h15 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Séminaire des Lundis de l'IPSIT le
Lundi 6 mars 2023, de 9h15 à 12h15,
Université Paris-Saclay - Bâtiment Henri Moissan - 17, avenue des Sciences, 91400 ORSAY
(Salle 4000 - HM1 recherche - 4e étage) 
Thème : CARDIO-ONCOLOGY

Pour vous inscrire, envoyer un mail à :  nadine.belzic@inserm.fr

Organisatrice : Véronique Leblais (Université Paris-Saclay, UMR-S 1180, Orsay)
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Résultats de l’appel à projet «Maturation / Pré-maturation» de France 2030

Résultats de l’appel à projet «Maturation / Pré-maturation» de France 2030 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’ETAT ALLOUE 275 M€ A 17 CONSORTIA

« MATURATION – PREMATURATION »

DONT 9 AUXQUELS LA SATT PARIS-SACLAY PARTICIPE.

 

 

 

Le 9 janvier 2023, Sylvie Retailleau, ministre de l'Enseignement supérieur et de la Recherche, et Roland Lescure, ministre délégué à l’Industrie ont annoncé les nouvelles actions du gouvernement pour accélérer l’émergence de start-up issues de la recherche.

 

Parmi ces mesures, l’attribution via les résultats de l’appel à projet « Maturation / Pré-maturation » de 275 M€ à 17 consortiums portés par les SATT et leurs partenaires pour intensifier l’accompagnement de projets d’innovation à fort potentiel et accélérer leur transfert vers le monde socio-économique, au bénéfice des stratégies nationales d’accélération.

 

La SATT Paris-Saclay a le plaisir d'être partie prenante de 9 consortia lauréats de cet appel dont 1 en tant que leader maturation : le projet ASTRAGAL porté par l'INRAE et axé sur la Stratégie Nationale d'Accélération (SNA) "Alimentation durable et favorable à la Santé". 

 

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L’ENS Paris-Saclay et le CNRS recrutent une nouvelle équipe de recherche en biologie

L’ENS Paris-Saclay et le CNRS recrutent une nouvelle équipe de recherche en biologie | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’école normale supérieure Paris-Saclay et le CNRS recrutent pour 2023 un ou une jeune scientifique pour développer une équipe de recherche et un projet en biologie ou situé aux interfaces avec la chimie et/ou la physique. Implantée depuis 2020 au cœur de l’Université Paris-Saclay, l’équipe bénéficiera à l’ENS Paris-Saclay d’un site exceptionnel en matière de technologies, d’innovations et de recherche; les chercheuses et chercheurs seront encouragés et accompagnés pour développer des partenariats académiques et industriels.


La personne sélectionnée intégrera le Laboratoire de biologie et pharmacologie appliquée (LBPA), unité mixte de recherche de l'École Normale Supérieure Paris-Saclay et du CNRS (UMR 8113).

 

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ComPaRe Endométriose : comment améliorer la prise en charge du point de vue des patientes

ComPaRe Endométriose : comment améliorer la prise en charge du point de vue des patientes | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Sous l’impulsion de chercheurs et enseignants-chercheurs du Centre d’Epidémiologie Clinique (AP-HP), des unités CESP (Inserm/Université Paris-Saclay/UVSQ/Gustave Roussy) et CRESS (Inserm/Université Paris Cité), ComPaRe, la Communauté de Patients pour la Recherche de l’AP-HP, a mené une étude de science citoyenne pour recueillir les idées des patientes souffrant d’endométriose en vue d’améliorer leur prise en charge. Les 1000 participantes de l’étude ont répondu à la question suivante : « Si vous aviez une baguette magique, que changeriez-vous dans votre prise en charge ? ». 2487 idées ont été proposées et regroupées en 61 axes d’amélioration. Menée par Solène Gouesbet, doctorante à l’Université Paris-Saclay, et supervisée par le Dr Viet-Thi Tran, épidémiologiste et co-investigateur de ComPaRe (Université Paris Cité / AP-HP), l’étude a fait l’objet d’une publication scientifique dans la revue Journal of Women’s Health le 19 janvier 2023.

 

Lire le communiqué de presse UPSaclay-AP-HP-Inserm-Université Paris Cité.

 

Contact : marina.kvaskoff@inserm.fr

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Régulation de voies phytohormonales par le stress oxydant

Régulation de voies phytohormonales par le stress oxydant | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les ROS (Reactive Oxygen Species) comme le H2O2 font partie intégrante des réponses des plantes aux stress, conditions contraignantes qui altèrent la croissance végétale et affectent les rendements agricoles. Longtemps vus comme des « molécules-voyou » qu’il faut contrôler voire éliminer complètement, les ROS sont maintenant considérés comme des signaux cellulaires indispensables aux nécessaires modulations en réponse à divers stimuli. Pour accomplir ce rôle, les ROS interagissent notamment avec des messagers plus stables comme les phytohormones.

 

Dans un article paru dans Free Radical Biology and Medicine, Caroline Lelarge-Trouverie, Mathias Cohen et collaborateurs rapportent que l’augmentation de la teneur en H2O2 dans les feuilles d’Arabidopsis provoque une activation des voies associées à deux phytohormones qui interviennent dans la défense des plantes contre beaucoup d’agents pathogènes, à savoir l’acide salicylique et l’acide jasmonique. En conjuguant une approche transcriptomique et une étude de profilage métabolique (voir figure), l’article met en évidence la fine complexité de la régulation des voies phytohormonales induites par le H2O2. Il démontre notamment qu’une induction d’enzymes spécifiques permet de limiter les conséquences délétères pour la plante d’une activité biologique excessive des deux phytohormones en les convertissant en divers métabolites transformés ou conjugués.

 

Cette étude est issue d’une collaboration entre une équipe de l’Institute of Plant Sciences Paris-Saclay - IPS2 (CNRS/INRAE/UEVE/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) et des chercheurs du VIB-UGent Center for Plant Systems Biology (Belgique). Elle identifie plusieurs gènes candidats méritant des analyses approfondies lors d’études ultérieures, afin d’établir leur importance biologique ainsi que leur potentiel en tant que cible dans le but d’améliorer la gestion des stress par les plantes.

 

Contact : graham.noctor@universite-paris-saclay.fr

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Le registre REISAMIC de Gustave Roussy rapporte une nouvelle catégorie d'événements indésirables avec les inhibiteurs de point de contrôle immunitaire : les œdèmes généralisés immuno-médiés

Le registre REISAMIC de Gustave Roussy rapporte une nouvelle catégorie d'événements indésirables avec les inhibiteurs de point de contrôle immunitaire : les œdèmes généralisés immuno-médiés | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Une étude du registre REISAMIC, un registre de pharmacovigilance crée à Gustave Roussy pour surveiller les effets secondaires des immunothérapies anticancéreuses, et des cas étudiés et rapportés à Gustave Roussy pour l’aide de la gestion des toxicités liées à l’immunothérapie (RCP immunotox), à porté sur plus de 6000 patients. Au total, 20 patients ont été identifiés avec un œdème généralisé lié à l’immunothérapie (immune-related generalized edema ; ir-GE). Selon le registre prospectif REISAMIC, la fréquence des ir-GE était de 0,19% des patients traités par immunothérapie (3 cas sur 1598 patients dépistés). Les 20 patients avec ir-GE avaient un âge médian (intervalle) de 62 (26–81) ans, les types de tumeurs les plus courantes étaient le mélanome (n=9 ; 45%) et le cancer du poumon (n=6 ; 30%). Les localisations les plus fréquentes de l'œdème étaient les membres périphériques (n=17 ; 85%), pleurales (n=13 ; 65%) et péritonéales (n=10 ; 50%). Une polysérite a été observée chez 11 (55%) patients. Le gain de poids médian (fourchette) par patient était de 9 (2–30) kg (cf Figure).

 

Les signes et symptômes associés répondaient aux critères du syndrome de fuite capillaire (n=4 ; 20%), du syndrome d'obstruction sinusoïdale/maladie veino-occlusive (SOS/MVO) (n=3 ; 15%) ou d’un syndrome auto-immun ou dysimmunitaire sous-cutané (n=2 ; 10%). Des corticoïdes ont été administrés à 15 patients ; parmi eux, 10 (67%) se sont améliorés cliniquement après corticoïdes. D'après l’échelle de sévérité internationale CTCAEV5.0, la gravité la plus élevée d'ir-GE était de grade ≥ 4 chez 11 (55%) patients et quatre (20%) patients sont décédés des suites d'ir-GE.

 

Cette étude, publiée dans European Journal of Cancer, montre que l'œdème généralisé lié au système immunitaire est une nouvelle catégorie d'événements indésirables à considérer avec les inhibiteurs de point de contrôle immunitaire et est souvent associé à une sévérité significative. La physiopathologie peut dans certains cas être liée à des dysfonctionnements endothéliaux, tels que les obstructions sinusoïdale/maladie veino-occlusive (SOS/MVO) ou le syndrome de fuite capillaire.

 

Contact : Jean-marie.michot@gustaveroussy.fr

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Evolution des chromosomes sexuels : des mutations délétères peuvent s’accumuler près de locus de type sexuel même sous autofécondation

Evolution des chromosomes sexuels : des mutations délétères peuvent s’accumuler près de locus de type sexuel même sous autofécondation | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les chromosomes sexuels sont souvent très différenciés, comme chez l’être humain, à cause de la suppression de recombinaison entre le chromosome X et le chromosome Y. Une nouvelle étude théorique étaye une théorie récente permettant d’expliquer l’arrêt de la recombinaison entre chromosomes sexuels, basée sur l’abritement des mutations délétères qui ségrègent naturellement dans les génomes, plutôt que sur les différences entre mâles et femelles. Cet article a été publié dans Peer Community Journal et recommandé par Peer Community in Evolutionary Biology. Il résulte d’une collaboration entre les laboratoires Ecologie Systématique et Evolution - ESE (CNRS/AgroParisTech/UPSaclay, Gif-sur-Yvette, Evo-Eco-Paléo (CNRS, Université de Lille) et MAP5 (CNRS, Université Paris Cité).

 

Il est connu depuis longtemps que, chez les mammifères et d’autres animaux, les chromosomes sexuels déterminant le sexe (mâle ou femelle) sont fortement différenciés, le Y étant très réduit. Cependant, la raison de cette forte différenciation est toujours débattue. Une hypothèse se basant sur les caractères sexuels secondaires différents entre mâles et femelles a prévalu pendant plusieurs décennies. Les nombreuses études sur le sujet n’ont cependant pas réussi à valider cette théorie. De plus, cette hypothèse n’explique pas l’existence de chromosomes de type sexuel différenciés chez les champignons, car ils ne sont pas associés à des fonctions mâles ni femelles. Une nouvelle théorie a été développée pour expliquer l’évolution des chromosomes sexuels, basée sur l’abritement des mutations délétères par la sélection d’inversions chromosomiques qui suppriment la recombinaison et assurent une hétérozygotie permanente quand elles sont liées à un gène de détermination du sexe ou du type sexuel (Jay et al. 2022). Les mutations délétères capturées par l’inversion sont alors maintenues à l’état hétérozygote, ce qui limite leur expression.

 

Cette théorie est corroborée par une corrélation observée entre suppression de recombinaison et cycle dicaryotique plutôt qu’haploïde chez les champignons, ce qui permet d’abriter les mutations délétères à l’état hétérozygote. Cependant, ces champignons montrant une suppression de recombinaison autour de leurs gènes de types sexuels sont aussi auto-fécondants, ce qui devrait aider à purger les mutations délétères efficacement, et ainsi déjà limiter leur effet. Une nouvelle étude théorique, basée sur des processus stochastiques, démontre cependant que les mutations délétères peuvent en fait être maintenues étonnamment longtemps dans les populations avant d’être purgées, et pourraient donc s’accumuler près des gènes de type sexuel, où elles sont en partie abritées de la sélection (Tezenas et al. 2023). C’est particulièrement le cas sous un mode particulier d’autofécondation, l’automixie ou auto-fécondation intra-tétrade, qui est justement le mode de reproduction des champignons montrant une suppression de recombinaison autour de leurs gènes de type sexuel.

 

Cette étude apporte donc des éléments en faveur de l’hypothèse d’abritement des mutations délétères pour expliquer l’évolution des chromosomes sexuels et de types sexuels.

 

Contact : tatiana.giraud@universite-paris-saclay.fr

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Etude de la tolérance à la chaleur des bovins par l’étude des interactions entre génotype et indice température-humidité sur la production et la santé de la mamelle chez les bovins laitiers

Etude de la tolérance à la chaleur des bovins par l’étude des interactions entre génotype et indice température-humidité sur la production et la santé de la mamelle chez les bovins laitiers | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’évolution du climat attendue dans les prochaines décennies dans les zones tempérées va modifier fortement les conditions d’élevage : température, systèmes alimentaires, nouvelles pathologies... Elle va ainsi induire des stress de chaleur, aigus ou chroniques, en élevage, en particulier pour les bovins. Des travaux au sein de l’UMR GABI (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) et l’UMT eBIS ont permis d’estimer l'effet de l'indice température-humidité (THI) sur la production et la santé de la mamelle des vaches laitières mais aussi d’identifier les animaux les mieux adaptés pour faire face aux hausses des températures attendues.

 

Pour chacun des caractères étudiés les performances de plus 50 000 vaches laitières ont été associées au THI moyen des trois jours précédant le jour de contrôle laitier dans la commune de l’exploitation et analysées grâce à des modèles de normes de réaction.

 

Ces travaux ont montré que le THI permettant les performances optimales varie selon le caractère considéré mais qu’il est toujours inférieur ou égal à 55 (soit une température moyenne quotidienne comprise entre 12 et 13°C). L’étude des interactions entre génétique et THI montre qu’il y a peu de variabilité dans la réponse individuelle aux différents THI, la corrélation génétique entre conditions de THI dépassant 0,9. Néanmoins, en condition de stress thermique (THI élevé), quelques reclassements entre animaux ont été mis en évidence, indiquant que certains animaux seraient plus adaptés que d’autres à produire malgré des températures élevées.

 

Ces travaux, publiés dans Genetics Selection Evolution, utilisent la base Safran de Météo France et ont été financés par l’Union Européenne et par Apis-Gene.

 

Légende Figure : Effet moyen de l’indice température-humidité (THI) sur la quantité de lait produite par jour en première et deuxième lactation en race Montbéliarde.

 

Contact : aurelie.vinet@inrae.fr

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Séminaire Hub PASREL : « Innovations technologiques en santé : quelles attentes, quels écueils, quels soutiens ? » - 21 mars 2023 – Fontenay-aux-Roses

Séminaire Hub PASREL : « Innovations technologiques en santé : quelles attentes, quels écueils, quels soutiens ? » - 21 mars 2023 – Fontenay-aux-Roses | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans le cadre de sa première assemblée générale, ouverte à toutes et tous, le Hub PASREL organise un séminaire intitulé « Innovations technologiques en santé : quelles attentes, quels écueils, quels soutiens ? ». Le programme de ce séminaire est construit pour répondre aux questions fréquemment rencontrées par les porteurs de projets que le Hub PASREL accompagne.

 

Ce séminaire est organisé en partenariat avec Vallée Sud BIO PARC et se tiendra dans leurs locaux, à Fontenay-aux-Roses, le mardi 21 mars de 13h30 à 17h30.

 

Retrouvez toutes les informations et inscrivez-vous (inscription gratuite mais obligatoire) ICI.

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Portrait Jeune Chercheur - Pierre-Antoine Précigout, chercheur en agroécologie

Portrait Jeune Chercheur - Pierre-Antoine Précigout, chercheur en agroécologie | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Pierre-Antoine Précigout est chargé de recherche INRAE dans l’équipe « Écophysiologie et physico-chimie des interactions biosphère-atmosphère » (Eco&Phy) de l’UMR Écologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes – ECOSYS (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay) depuis Septembre 2021.

 

Pierre-Antoine Précigout a suivi une formation de biologie générale à l’École Normale Supérieure de Paris, à l’issue de laquelle il a passé l’agrégation de Sciences de la Vie et de la Terre à l’Université Paris-Sud, devenue Paris-Saclay. Il s’est ensuite spécialisé en écologie puis en écologie évolutive appliquée à l’agroécologie. Son travail de doctorat, encadré par Corinne Robert (INRAE ECOSYS) et David Claessen (ENS Ulm) a porté sur les possibles réponses épidémiologiques et évolutives de la rouille brune à des variations de niveau de fertilisation du blé qu’elle attaque. Il montre que si une baisse du niveau de fertilisation permet de limiter les épidémies de rouille, ce bénéfice pourrait n’être que ponctuel car le pathogène pourrait s’adapter à ce nouvel environnement nutritif, notamment en changeant la durée de son cycle infectieux.

 

A l’issue de son doctorat en 2018, Pierre-Antoine Précigout a souhaité poursuivre son travail de recherche en écologie théorique et continuer de s’intéresser aux interactions entre les plantes cultivées et les champignons pathogènes qui les attaquent, vus comme des systèmes ressource-consommateur. Lors d’un premier post-doc en continuité de sa thèse, réalisé au Rothamsted Research Centre en Angleterre, il a montré qu’à l’échelle d’un paysage, l’hétérogénéité spatiale de niveau de fertilisation pouvait conduire à l’apparition de variants du pathogène, chacun plus adapté à un niveau de fertilisation donné. 

 

Après s’être concentré sur un pathogène, la rouille brune, et une pratique agricole, la fertilisation des cultures, il a souhaité élargir la gamme des processus pris en compte dans ses modèles. Dans un second post-doc en collaboration avec le Centre d’Écologie Fonctionnelle et Évolutive de Montpellier, il a comparé l’impact de différentes pratiques de diversification des cultures (mélanges de variétés, mosaïques de cultures, rotation de cultures) sur deux espèces de pathogènes aux cycles de vie contrastés et dans différents contextes climatiques. Dans un troisième post-doc au sein de l’UMR ECOSYS, il s’est intéressé également à la diversification des paysages agricoles, et plus spécifiquement aux services écosystémiques de régulation que peuvent fournir certains éléments semi-naturels tels que les haies. L’ensemble des résultats obtenus souligne l’importance de prendre en compte les interactions entre les caractéristiques des organismes étudiés, les conditions météorologiques et les échelles spatiales et temporelles des pratiques pour réfléchir à la diversification agroécologique de nos paysages agricoles.

 

La recherche de Pierre-Antoine Précigout au sein de l’UMR ECOSYS vise à comprendre et prédire comment, à l’échelle du paysage, la diversification des cultures et des pratiques agricoles peuvent permettre de réguler durablement les pathogènes des cultures. En combinant approches de modélisation mathématique, analyse de données, observations de terrain et expérimentation, il cherche à mieux connaître les dynamiques épidémiologiques et évolutives des pathogènes des cultures dans des contextes ou des scénarios agroécologiques diversifiés zéro-pesticides. Étudier les capacités d’adaptation des pathogènes aux pratiques agroécologiques est fondamental pour s’assurer de leur durabilité.

 

« Observer la nature est à la fois source d’émerveillement toujours renouvelé et d’inspiration pour la recherche. »

 

Contact : pierre-antoine.precigout@inrae.fr

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La protéine P du virus de la rage se lie à la kinase TBK1 et interfère avec la formation de condensats liquides liés à l'immunité innée

La protéine P du virus de la rage se lie à la kinase TBK1 et interfère avec la formation de condensats liquides liés à l'immunité innée | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les virus doivent surmonter la réponse antivirale médiée par l'interféron (IFN) pour se répliquer et se propager dans leur hôte. Ainsi, la phosphoprotéine P du virus de la rage (RABV) est connue pour inhiber l'induction de l'interféron en bloquant la phosphorylation du facteur de transcription IRF3.

 

Dans un article publié dans Cell Reports, les chercheurs de l’équipe Rhabdovirus de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) et de la plateforme Imagerie Gif ont étudié les bases moléculaires de cette inhibition. Pour cela, ils ont profité du phénotype distinct de deux souches de RABV (SAD et CVS) par rapport à leur capacité à inhiber l'induction d'IFN. Ils ont démontré que P-SAD, mais pas P-CVS, inhibe l'induction de l'IFN. Une seule substitution de résidu d'acide aminé en position 179 est responsable de la différence de phénotype observée entre les deux souches. Par conséquent, un virus recombinant SAD-S179P (dans lequel P-SAD est remplacée par sa version S179P non inhibitrice) présente un défaut de croissance dans des cellules productrices d'IFN.

 

En utilisant la spectrométrie de masse, les chercheurs ont identifié TBK1 comme une protéine qui interagit préférentiellement avec les formes inhibitrices de P. TBK1 est la kinase qui phosphoryle IRF3, elle se situe au carrefour de nombreuses voies d'induction d'interféron. Les mutations des sites de phosphorylation de TBK1 abolissent sa liaison à la protéine P.

 

Plus important encore, ils démontrent que lors d'une infection par RABV ou d'une détection d'ARNdb par les senseurs de l'immunité innée, TBK1 et ses protéines adaptatrices NAP1 et SINTBAD forment des condensats cytoplasmiques dynamiques qui ont des propriétés liquides. Ces condensats peuvent former des agrégats plus grands ayant des structures annulaires dans lesquelles NAP1 et TBK1 présentent un mouvement localement restreint. La liaison de P à TBK1 interfère avec la formation de ces structures.

 

Ce travail démontre que les protéines de la voie de signalisation induisant l’IFN forment de façon transitoire des condensats liquides pouvant être ciblés par des virus.

 

Contact : yves.gaudin@i2bc.paris-saclay.fr ou cecile.lagaudriere@i2bc.paris-saclay.fr

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Conférence "Négociations internationales sur le climat et la biodiversité, de quelle agriculture parle-t-on ?" - 6 février 2023 à 18h - Campus Agro Paris-Saclay & VISIO

Conférence "Négociations internationales sur le climat et la biodiversité, de quelle agriculture parle-t-on ?" - 6 février 2023 à 18h - Campus Agro Paris-Saclay & VISIO | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La délégation COP climat d'AgroParisTech et Marius Ruchon (jeune délégué biodiversité au Ministère de la Transition Ecologique) vous invitent à parler agriculture et négociations internationales sur le climat et la biodiversité avec des expert.e.s de divers horizons

le lundi 6 février de 18h à 19h30

à Saclay (Amphi B1-01) ou en direct sur Youtube (chaîne Les Agros à la COP & AgroParisTech Alumni)

 

Négociations internationales sur le climat et la biodiversité, de quelle agriculture parle-t-on ?

 

avec

 

Introduction par Laurent Buisson

 

Philip Roche, Directeur de recherche à l'INRAE et chargé de mission biodiversité au Ministère de l'Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l'Innovation

 

Morgan Ody, Coordinatrice générale de la Confédération paysanne

 

Patricia Larbouret, cheffe du bureau changement climatique et biodiversité au Ministère de l’agriculture et de l’alimentation

 

La COP15 sur la biodiversité s’est terminée à Montréal en décembre dernier après la COP27 sur le climat à Sharm-el-Sheik en novembre. Avec des expert.e.s du sujet, nous allons nous questionner sur la place du secteur agricole dans ces discussions, les connexions entre les enjeux environnementaux et l'agriculture et enfin le type d’agriculture vers lequel les pays s’engagent au travers de leurs accords internationaux.

 

Si vous souhaitez assister à la conférence sur place, inscrivez-vous sur ce lien,

 

À très bientôt !

 

Auriane Meiller, Anna Antraygues (délégations AgroParisTech COP climat) et Marius Ruchon (jeune délégué biodiversité MTE)

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Les "Lundis de l'IPSIT" - Lundi 13 mars 2023 à 9h15

Les "Lundis de l'IPSIT" - Lundi 13 mars 2023 à 9h15 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Séminaire des Lundis de l'IPSIT le :

Lundi 13 mars 2023, de 9h15 à 12h15,
Université Paris-Saclay - Bâtiment Henri Moissan - 17, avenue des Sciences, 91400 ORSAY
(Salle 4000 - HM1 recherche - 4e étage) 

Thème : Photochimie, composés «cagés»


Pour vous inscrire : envoyer un mail à  : nadine.belzic@inserm.fr


Organisatrice : Christine Tran (MCU, Laboratoire BioCIS, Equipe CoSMIT, UMR 8076, ORSAY - 91)

 

Intervenants :

  • Alexandre SPECHT (Directeur de recherche au CNRS, Laboratoire de Conception et Application de Molécules Bioactives, Équipe CNM, UMR 7199 CNRS/Unistra, ILLKIRCH - 67)
  • Ludovic JULLIEN (PASTEUR, Département de chimie, École normale supérieure, PSL University, Sorbonne Université, CNRS, Paris 5e - 75)
  • Laetitia MONY(Chargée de Recherche, INSERM, Institute of Biology, École Normale Supérieure, INSERM U 1024, CNRS UMR 8197, Paris 5e - 75)
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GS Biosphera  - "Scientific publishing: publication models, scientific integrity & Open Science" - 27 mars 2023

GS Biosphera  - "Scientific publishing: publication models, scientific integrity & Open Science" - 27 mars 2023 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

The GS Biosphera invites the PhD fellows of Université Paris-Saclay to participate in the seminar "Scientific publishing: publication models, scientific integrity & Open Science".


The seminar will take place on 27 March 2023 from 9am to 1pm on the AgroParisTech campus Agro Paris-Saclay (amphitheater A-1).


The participants will be sensitized on Open Science practices and motivated to engage on the Open Science movement. The seminar is intended first to PhD candidates of the GS Biosphera but is open to the entire community of the GS Biosphera and UPSaclay (i.e., researchers, professors), provided that places are available.


The information of the program is in the following ADUM link.

 

PhD fellows can use the ADUM link for registration. UPSaclay colleagues who are not PhD candidates can register HERE.

 

In addition, other training sessions dealing with various aspects of open science are organised during 2023 Spring: further information here (the courses are already on ADUM and polls will be sent in due time for colleagues).

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