SCIENCES DU VEGETAL
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Ressources scientifiques et techniques sélectionnées par les documentalistes du service commun de documentation d'Agrocampus Ouest sur les thématiques : Sélection variétale /Création variétale/Amélioration des plantes/ Semence / Protection des plantes et Environnement
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INRA - Voyage au royaume des champignons

INRA - Voyage au royaume des champignons | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
Les champignons jouent un rôle essentiel dans les écosystèmes forestiers. Qui sont-ils ? Comment vivent-ils ? Comment participent-ils au fonctionnement des forêts ? Quels services écologiques rendent-ils ? Découvrez les réponses aux questions que vous vous posez sur ce règne du vivant, que l’Inra suit de près.  
Agrodoc Ouest's insight:

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Interaction non-conventionnelle entre le colza et le champignon Leptosphaeria maculans

Interaction non-conventionnelle entre le colza et le champignon Leptosphaeria maculans | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it

 

La reconnaissance spécifique d’un agent phytopathogène par sa plante-hôte dépend classiquement d’une relation gène-pour-gène entre un gène d’avirulence de l’agent pathogène et un gène de résistance de la plante-hôte. Cependant, les interactions entre gènes d’avirulence et gènes de résistance se révèlent parfois plus complexes, notamment chez Leptosphaeria maculans, champignon responsable de la nécrose du collet du colza (Brassica napus). L. maculans représente un modèle de choix pour explorer la multiplicité de ces interactions et leur diversification au cours de la co-évolution avec sa plante-hôte. Le locus d’avirulence AvrLm10, reconnu par le gène de résistance Rlm10, en est un nouvel exemple.

 

En combinant clonage positionnel et données génomiques, Marie-Hélène Balesdent, Isabelle Fudal et leurs collègues (UMR BIOGER, INRA, AgroParisTech, Université Paris‐Saclay, Thiverval‐Grignon) ont identifié deux candidats pour AvrLm10. Ces deux gènes voisins et en orientation inverse codent deux petites protéines sécrétées, sont localisés dans une région génomique riche en répétitions sub-télomériques, et sont surexprimés en phase précoce d’infection.

 

Dans un article paru dans New Phytologist, les chercheurs ont démontré, par complémentation fonctionnelle et silencing, que la reconnaissance par Rlm10 nécessite la présence simultanée de ces deux gènes (AvrLm10A et AvrLm10B). Ils ont également montré qu’AvrLm10A et AvrLm10B interagissent physiquement in vitro et in planta. Enfin, ils ont identifié des homologues de ces gènes, avec une conservation de leur organisation génomique, chez d'autres champignons phytopathogènes, suggérant une fonction effectrice conservée nécessitant l'hétérodimérisation d’AvrLm10A et AvrLm10B.

 

Après la découverte chez L. maculans de plusieurs cas d’interactions non-conventionnelles (gènes d'avirulence reconnus par deux gènes de résistance, protéine d'avirulence masquant d’autres interactions), ce travail illustre un cas de figure original où deux gènes d’avirulence sont nécessaires pour induire la résistance.

 

Contact : isabelle.fudal@inra.fr ou marie-helene.balesdent@inra.fr


Via Life Sciences UPSaclay, Saclay Plant Sciences
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«Une plante est capable de "voir" ce qui l'entoure» - Libération

«Une plante est capable de "voir" ce qui l'entoure» - Libération | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
L'Institut national de la recherche agronomique a lancé un programme permettant d'analyser la place essentielle de la lumière tout au long du processus de développement d'une plante, avec l'objectif de déterminer celles capables de résister aux différentes contraintes de l'environnement.
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Trafic de gènes chez les plantes

Trafic de gènes chez les plantes | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
Il n’y a pas que les bactéries qui peuvent échanger du matériel génétique: les végétaux aussi. Un mécanisme aussi rare que mystérieux, qui pose une foule de questions, notamment concernant les plantes OGM
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Gestion des adventices : quelques enseignements du projet CoSAC

Gestion des adventices : quelques enseignements du projet CoSAC | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it

Dans le contexte de réduction de l’usage des produits phytosanitaires, une gestion des adventices maîtrisée est un enjeu fort pour les agriculteurs car la flore adventice est un facteur important de réduction de la production. Cela passe par une combinaison judicieuse de pratiques pour construire un système de culture répondant à cet enjeu. Le projet CoSAC dont le séminaire final a eu lieu début 2019 avait notamment 


Via Jean-Marc Sanchez
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Du blé et du chou enrichis en micronutriments

Du blé et du chou enrichis en micronutriments | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it

Les micronutriments, ce sont l’ensemble des vitamines, des minéraux et des oligo-éléments qui sont indispensables à la vie, notamment pour produire les protéines. Que fait-on quand la plante n’en contient pas suffisamment ?

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Quand deux génomes se rencontrent : histoire évolutive des deux sous-génomes d’une espèce polyploïde, la capselle bourse-à-pasteur - OSUR

Quand deux génomes se rencontrent : histoire évolutive des deux sous-génomes d’une espèce polyploïde, la capselle bourse-à-pasteur - OSUR | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
Sylvain Glémin (ECOBIO) est co-auteur dans PLoS Genetics d'une étude publiée en février 2019 qui retrace l’histoire évolutive des deux sous-génomes de la capselle bourse-à-pasteur (Capsella bursa-pastoris, Brassicaceae) basée sur l'analyse de la diversité génétique et les variations d’expression de ses gènes.
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Le ministère de l'Agriculture demande la destruction des cultures contaminées aux OGM

Le ministère de l'Agriculture demande la destruction des cultures contaminées aux OGM | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it

Des traces d'organismes génétiquement modifiés (OGM) ont été retrouvées dans des semences de colza commercialisés par l'entreprise Bayer : c'est le constat qu'a fait la Direction générale de la concurrence, de la consommation et de la répression des fraudes (DGCCRF) lors de son plan de contrôle pour 2018 des semences.

Auteur : Dorothée Laperche

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Culture du blé et changement climatique, les variétés sahariennes sont la solution

Culture du blé et changement climatique, les variétés sahariennes sont la solution | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it

Isolées, les caractéristiques des variétés sahariennes pourraient être transposées dans les variétés cultivées dans les grands bassins céréaliers de l’hémisphère nord pour les rendre plus résistantes au changement climatique.

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Comment les vers de terre font-ils pousser les plantes?

Comment les vers de terre font-ils pousser les plantes? | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
Un avantage à travailler sur les vers de terre est que tout le monde pense les connaître ! Mais cela n'empêche pas que ces humbles travailleurs du sol sont toujours un sujet de recherche, notamment pour comprendre quels sont les mécanismes divers et compliqués qu'ils mettent en oeuvre pour agir sur les sols et les plantes.
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INRA - Pionnier en agriculture de conservation des sols

INRA - Pionnier en agriculture de conservation des sols | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
Reportage chez Thierry Beauvais, un agriculteur qui a adopté en 2015 l’agriculture de conservation des sols, sans travail du sol et avec des couverts permanents. Un système qui l’amène à innover en permanence, en relation avec des chercheurs de l’Inra.

Via Jean-Marc Sanchez
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Editor's choice: plant genome editing

Editor's choice: plant genome editing | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
As an ever-increasing population and the threats of climate change loom, feeding the world remains a major challenge. This collection showcases advances in plant genome editing research, recently published in Scientific Reports, touching on applications of CRISPR-based editing systems and crop breeding.
Agrodoc Ouest's insight:

Face à l'augmentation constante de la population et aux menaces du changement climatique, nourrir le monde reste un défi majeur. Cette collection présente les progrès de la recherche sur l'édition du génome végétal, récemment publiée dans Scientific Reports, qui traite des applications des systèmes d'édition basés sur CRISPR et de la sélection végétale.

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[Article] SCOOP12 peptide regulates defense response and root elongation in Arabidopsis thaliana | Journal of Experimental Botany

[Article] SCOOP12 peptide regulates defense response and root elongation in Arabidopsis thaliana | Journal of Experimental Botany | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it

"A secreted peptide, a member of a Brassicaceae-specific gene family, acts on pathogen defense response and root development through the phospholipid pathway ....."

Agrodoc Ouest's insight:

Les petits peptides sécrétés sont des acteurs importants du développement des plantes et de la réponse au stress. En utilisant une approche  silico ciblée, nous avons identifié une famille de 14 gènes Arabidopsis codant pour les précurseurs de peptides endogènes riches en sérine (PROSCOOP). Les analyses transcriptomiques ont révélé qu'un membre de cette famille, PROSCOOP12, est impliqué dans des processus liés au stress biotique et oxydatif ainsi qu'à la croissance racinaire.

 

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Lipases associated with plant defense against pathogens - ScienceDirect

Lipases associated with plant defense against pathogens - ScienceDirect | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
When facing microbe invaders, plants activate genetic and metabolic defense mechanisms and undergo extracellular and intracellular changes to obtain a certain level of host resistance. Dynamic adjustment and adaptation occur in structures containing lipophilic compounds and cellular metabolites. Lipids encompassing fatty acids, fatty acid-based polymers, and fatty acid derivatives are part of the fundamental architecture of cells and tissues and are essential compounds in numerous biological processes. Lipid-associated plant defense responses are mostly facilitated by the activation of lipases (lipid hydrolyzing proteins), which cleave or transform lipid substrates in various subcellular compartments. In this review, several types of plant defense-associated lipases are described, including their molecular aspects, enzymatic actions, cellular functions, and possible functional relevance in plant defense. Defensive roles are discussed considering enzyme properties, lipid metabolism, downstream regulation, and phenotypic traits in loss-of-function mutants.
Agrodoc Ouest's insight:

Face aux envahisseurs microbiens, les plantes activent les mécanismes de défense génétiques et métaboliques et subissent des changements extracellulaires et intracellulaires pour obtenir un certain niveau de résistance de l'hôte. L'ajustement et l'adaptation dynamiques se produisent dans les structures contenant des composés lipophiles et des métabolites cellulaires. Les lipides englobant les acides gras, les polymères à base d'acides gras et les dérivés d'acides gras font partie de l'architecture fondamentale des cellules et des tissus et sont des composés essentiels dans de nombreux processus biologiques. Les réponses de défense des plantes associées aux lipides sont principalement facilitées par l'activation des lipases (protéines hydrolysant les lipides), qui clivent ou transforment les substrats lipidiques dans divers compartiments subcellulaires. Dans cette revue, plusieurs types de lipases associées à la défense des plantes sont décrits, y compris leurs aspects moléculaires, leurs actions enzymatiques, leurs fonctions cellulaires et leur pertinence fonctionnelle possible dans la défense des plantes. Les rôles défensifs sont discutés en tenant compte des propriétés enzymatiques, du métabolisme lipidique, de la régulation en aval et des traits phénotypiques chez les mutants ayant perdu leur fonction.

 

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Le Cirad met au point Handa, une nouvelle variété de vanille [vidéo]

Le Cirad met au point Handa, une nouvelle variété de vanille [vidéo] | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
C'est peut-être de l'île de La Réunion que viendra l'avenir de la vanille. Une maladie liée à la prolifération d'un champignon, le fusarium, met fortement à mal les plants de vanille traditionnelle. C'est pourquoi des chercheurs du Cirad cherchent à mettre au point une nouvelle variété de vanille. Plus résistante que la vanille classique, Handa promet également de réelles qualités gustatives.
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La vie secrète des sols français

La vie secrète des sols français | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
Saviez-vous que sous vos pieds des milliards de bactéries vivent et rendent des services incroyables ? Une équipe a relevé le pari fou de recenser toutes ces espèces partout en France.
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La pluie, agent de transmission des pathogènes des plantes

La pluie, agent de transmission des pathogènes des plantes | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
Les gouttes de pluie provoquent des micro-tourbillons sur les feuilles des plantes qui peuvent contribuer à la diffusion de spores pathogènes.

Via Hubert MESSMER @Zehub on Twitter, Jean-Marc Sanchez
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Alternatives aux pesticides : place aux odeurs ! | Techniques de l'ingénieur

Alternatives aux pesticides : place aux odeurs ! | Techniques de l'ingénieur | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
A l’occasion du Salon de l’agriculture qui vient tout juste de fermer ses portes, l’Inra et l’Irstea ont présenté leur plan de recherches pour développer des alternatives aux produits phytosanitaires. Parmi les voies originales de biocontrôle, les odeurs occupent une place de choix.
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Mooc : Semences végétales, quels enjeux pour notre avenir ?

Mooc : Semences végétales, quels enjeux pour notre avenir ? | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
Le « MOOC Semences » est une formation généraliste, accessible à tous, pour découvrir et comprendre les semences végétales.

Que l'on savoure un pain frais, des légumes de saison, une bière, ou que l'on joue au football sur une pelouse... tout cela est possible, grâce aux semences.

Pourtant, que sait-on vraiment des semences ? Que connaît-on de ce secteur dynamique et innovant qui fait de la France le premier exportateur mondial de semences agricoles ? Sait-on qu'il emploie sur le territoire plus de 15 000 personnes ?

Le GNIS et AGROCAMPUS OUEST, soutenus par Agreenium, ont décidé de vous apporter les éclairages indispensables pour comprendre, découvrir ou redécouvrir le monde des semences à travers le « Mooc Semences végétales : quels enjeux pour notre avenir ? », à suivre sur Fun MOOC.

« Le Mooc Semences » c’est :

  • 6 semaines, 1 h 30 de cours par semaine, avec des vidéos, un forum et des webinars pour échanger, questionner et partager...
  • Plus de 60 experts de tous les horizons : agriculteurs, entreprises, enseignants-chercheurs, jardiniers, organisations professionnelles et institutions publiques...
  • Les grands sujets des semences : diversité cultivée, sélection des variétés, production des semences, contrôle et certification, droit des semences, expériences et besoins des utilisateurs...
  • Toutes les semences : certifiées, fermières, paysannes, en conventionnel et en bio, pour l’alimentation, la biodiversité, l’environnement et l’agroécologie...
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Une espèce de spartine utile à la phytoremédiation ? - OSUR

Une espèce de spartine utile à la phytoremédiation ? - OSUR | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
Le succès écologique des espèces polyploïdes (i.e. qui possèdent plus de 2 lots complets de chromosomes) se traduit souvent par de meilleures capacités à coloniser des environnements contraignants, généralement associés à des niveaux de tolérance aux stress plus larges comparativement aux espèces diploïdes apparentées (i.e. possédant deux lots de chromosomes homologues (2n = 2x). Chez les espèces allopolyploïdes (polyploïdes d’origine hybride) caractérisées par la réunion et la duplication de génomes divergents, la combinaison des mécanismes d’hybridation et de polyploïdie est responsable d’un « choc » et d’une redondance génomique. Ces deux évènements induisent des changements sur les plans génétiques et épigénétiques, susceptibles de produire de nouveaux phénotypes (ensemble des caractères apparents d'un individu) potentiellement adaptatifs.
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Biocontrôle des productions agricoles, les insectes vont-ils remplacer les pesticides ?

Biocontrôle des productions agricoles, les insectes vont-ils remplacer les pesticides ? | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it

Le biocontrôle est une solution alternative à l’usage de pesticides et de produits phytosanitaires, destiné à lutter contre les nuisibles s’attaquant aux cultures agricoles.

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Grasses can acquire genes from neighbouring plants

Grasses can acquire genes from neighbouring plants | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it

In plants and animals, natural selection primarily operates on genes passed down from one generation to the next. This paradigm has been challenged, however, by an international team including Guillaume Besnard, CNRS researcher at the “Evolution et diversité biologique” laboratory (CNRS/IRD/Université Toulouse III – Paul Sabatier). Published in the 18 February 2019 edition of Proceedings of the National Academy of Sciences, the study reveals that the genome of Alloteropsis semialata, a grass found in Australia, contains nearly 60 genes acquired from at least nine donor grasses species. Some of these transferred genes code for enzymes involved in photosynthesis, or for proteins involved in disease resistance or soil adaptation. "

Agrodoc Ouest's insight:

Chez les plantes et les animaux, la sélection naturelle agit principalement sur les gènes transmis d'une génération à l'autre. Ce paradigme a cependant été remis en cause par une équipe internationale comprenant Guillaume Besnard, chercheur CNRS au laboratoire "Evolution et diversité biologique" (CNRS/IRD/Université Toulouse III - Paul Sabatier). Publiée dans l'édition du 18 février 2019 des Actes de l'Académie nationale des sciences, l'étude révèle que le génome d'Alloteropsis semialata, une graminée trouvée en Australie, contient près de 60 gènes acquis d'au moins neuf espèces d'herbes donneuses. Certains de ces gènes transférés codent pour des enzymes impliquées dans la photosynthèse ou pour des protéines impliquées dans la résistance aux maladies ou l'adaptation du sol

 

Source : Lateral transfers of large DNA fragments spread functional genes among grasses. Luke T. Dunning, Jill K. Olofsson, Christian Parisod, Rimjhim Roy Choudhury, Jose J. Moreno-Villena, Yang Yang, Jacqueline Dionora, W. Paul Quick, Minkyu Park, Jeffrey L. Bennetzen, Guillaume Besnard, Patrik Nosil, Colin P. Osborne, and Pascal-Antoine Christin. Proceedings of the National Academy of Sciences, February 18, 2019.

https://www.pnas.org/content/early/2019/02/19/1810031116

 

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Un nouveau pas en matière de recherche pour développer les alternatives aux produits phytosanitaires

Un nouveau pas en matière de recherche pour développer les alternatives aux produits phytosanitaires | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it
Frédérique Vidal, ministre de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation et Guillaume Boudy, Secrétaire général pour l’investissement, se sont vus remettre par Philippe Mauguin, Président directeur général de l’INRA le rapport définissant les lignes directrices du programme prioritaire de recherche intitulé « Cultiver et Protéger Autrement ». Ce programme dont le principe avait été annoncé en juillet 2018 sera doté de 30 millions d’euros provenant du 3e Programme d’investissement d’avenir. Le rapport propose une feuille de route claire et ambitieuse pour que la communauté scientifique élabore avec les acteurs du monde agricole de nouvelles pratiques alternatives à l’utilisation des produits phytosanitaires.
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[Article] Cell geometry determines symmetric and asymmetric division plane selection in Arabidopsis early embryos (IJPB, SPS)

[Article] Cell geometry determines symmetric and asymmetric division plane selection in Arabidopsis early embryos (IJPB, SPS) | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it

Plant tissue architecture and organ morphogenesis rely on the proper orientation of cell divisions. Previous attempts to predict division planes from cell geometry in plants mostly focused on 2D symmetric divisions. Using the stereotyped division patterns of Arabidopsis thaliana early embryogenesis, we investigated geometrical principles underlying plane selection in symmetric and in asymmetric divisions within complex 3D cell shapes.


Via Saclay Plant Sciences, Loïc Lepiniec
Agrodoc Ouest's insight:

L'architecture des tissus végétaux et la morphogenèse des organes dépendent de la bonne orientation des divisions cellulaires. Les tentatives précédentes de prédiction des plans de division à partir de la géométrie cellulaire des plantes portaient principalement sur les divisions symétriques 2D. En utilisant les modèles de division stéréotypés de l'embryogenèse précoce d'Arabidopsis thaliana thaliana, nous avons étudié les principes géométriques qui sous-tendent la sélection du plan en divisions symétriques et asymétriques dans des formes cellulaires 3D complexes.

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The new potato

The new potato | SCIENCES DU VEGETAL | Scoop.it

On a bleak, brown hill here, David Ellis examines a test plot of potato plants and shakes his head. “They're dead, dead, dead,” he says. Pests and lack of rain have laid waste to all 17 varieties that researchers had planted.

It is a worrying sign for Ellis, the now-retired director of the gene bank at the International Potato Center (CIP) in Lima. People have grown potatoes in this rugged stretch of the Andes for thousands of years. In recent years, that task has gotten tougher, in part because of climate change. Drought and frost are striking more often. The rains come later, shortening the growing season. And warmer temperatures have allowed moths and weevils to encroach from lower elevations.

To find potatoes that can cope with those challenges, researchers and Peruvian farmers are testing dozens of the 4350 locally cultivated varieties, or landraces, kept in CIP's refrigerated storage. The plants in this plot fell short. “Native landraces evolved over time,” Ellis says. But, he says, climate change is happening “too fast for these varieties to adapt.


Via Loïc Lepiniec
Agrodoc Ouest's insight:

Sur une colline sombre et brune, David Ellis examine une parcelle d'essai de plants de pommes de terre et secoue la tête. "Ils sont morts, morts, morts, morts", dit-il. Les ravageurs et le manque de pluie ont mis à sac les 17 variétés que les chercheurs avaient plantées.

C'est un signe inquiétant pour Ellis, le directeur aujourd'hui retraité de la banque de gènes du Centre international de la pomme de terre (CIP) à Lima. Depuis des milliers d'années, les gens cultivent des pommes de terre dans cette région sauvage des Andes. Ces dernières années, cette tâche est devenue plus difficile, en partie à cause des changements climatiques. La sécheresse et le gel frappent plus souvent. Les pluies arrivent plus tard, ce qui raccourcit la saison de croissance. Et les températures plus chaudes ont permis aux mites et aux charançons d'empiéter à partir des basses altitudes.

Pour trouver des pommes de terre capables de relever ces défis, les chercheurs et les agriculteurs péruviens testent des douzaines des 4 350 variétés cultivées localement, ou races locales , conservées dans les entrepôts réfrigérés du CIP. Les plantes de cette parcelle n'ont pas été à la hauteur. "Les races autochtones ont évolué au fil du temps, dit Ellis. Mais, dit-il, le changement climatique se produit "trop rapidement pour que ces variétés puissent s'adapter.

 

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