EntomoScience

... la peste sévit toujours dans le monde. 40 000 cas signalés ces 15 dernières années à Madagascar, en Chine ou en République Démocratique du Congo. La recherche a enfin une nouvelle finalité : prévenir le risque terroriste via une attaque bactériologique. Et éviter que l'histoire ne se répète…

Une série documentaire de Michel Pomarède, réalisé par François Teste. Première diffusion 10/04/2017

Avec Elisabeth Carniel, directrice de recherche à l'Institut Pasteur ; Danielle Jacquart, spécialiste de la médecine médiévale ; Michel Drancourt, responsable du laboratoire de microbiologie à l'Hôpital de la Timone à Marseille ; Michel Goury, auteur de « Un homme, un navire, la peste de 1720 » (éd. Jeanne Lafitte), Luc Georget, directeur du musée des beaux-arts de Marseille, Stéphan Tzortzis, archéologue et Rémi Barbieri, thésard.

Marc-André Selosse nous emmène dans un univers invisible et pourtant essentiel à la vie, celui des microbes.

Le temps d'un bivouac

Selon une estimation de l'Office fédéral de de la santé publique (OFSP), chaque années, 10'000 personnes seraient touchées par la borréliose - ou maladie de Lyme - une maladie transmise par une bactérie présente dans la salive de la tique. Les explications du Dr Gilbert Greub, médecin chef du secteur diagnostic à l'Institut de microbiologie du CHUV au micro d'Anne Baecher.

Le docteur Andrea Gamarnik est chef du laboratoire de virologie moléculaire de l’Institut Leloir et chercheur au Conseil national argentin de recherches scientifiques et techniques (Conicet). En collaboration avec son équipe, elle étudie les mécanismes moléculaires du virus de la dengue, ouvrant la voie à la découverte de nouveaux médicaments antiviraux.

Nous ne sommes pas seuls : dans notre corps cohabitent des millions de micro-organismes, et notre génome intègre des gènes provenant d'autres espèces. En quoi cela renouvelle-t-il notre compréhension de l'évolution ? Didier Raoult, professeur de microbiologie, faculté de médecine de Marseille, directeur de l’Unité de recherche en maladies infectieuses et tropicales émergentes.

Janvier 2013

• L'autre en nous - L'homme comme chimère et comme écosystème - Saison 2012-2013 - Saisons - Conférences en ligne - Ressources - Cité des sciences et de l'industrie
  http://www.cite-sciences.fr/fr/ressources/conferences-en-ligne/saison-2012-2013/lautre-en-nous/

Une équipe de chercheurs dirigée par le Pr Hamadoun Amadou Babana, responsable du laboratoire de recherche en microbiologie et biotechnologie microbienne effectue depuis quelques mois, des recherches pour créer un bio-bactéricide à base d’extraits d’essences végétales dans la lutte contre la maladie des mangues.

Maliweb. Publié le 07.06.2019

"... Des études antérieures menées par Bruno et al., en 2010 et Pruvost et al., en 2012 ont montré que les filières mangues et pommes de terre du Sahel sont confrontées à la problématique des mouches de fruits, appelées diptera tephritidae et des pathogènes microbiennes. Cependant, l’introduction et la dispersion de la bactériose, une maladie infectieuse causée par un pathogène bactérien, le Xanthomonas citri pv. Mangiferaeindicae en Afrique de l’Ouest a considérablement accentué l’importance des dégâts.

Au Mali, les régions de Koulikoro, Ségou et Sikasso font partie des zones agro-climatiques d’excellence. Pourtant, explique le Pr Hamadoun Babana, ce secteur stratégique de l’économie malienne est, actuellement, confronté à de sérieux problèmes de production liés aux insectes parasites et aux microorganismes pathogènes. « Il devenait donc indispensable de mettre à la disposition des producteurs, des techniques de lutte viables économiquement durables et respectueuses de l’environnement. Telle la formulation et l’utilisation de bio-bactéricide à base d’extraits d’essences végétales dans la lutte contre Xanthomonas citri pv. Mangiferaeindicae, ainsi que la lutte contre les mouches des fruits et les termites dans les plantations d’horticulture dans ces zones » a-t-il affirmé, le 22 mai dernier, lors de l’atelier de lancement du projet à l’Ex-Cres de Badalabougou."

... Une question qu’on pose souvent concernant les virus, c’est celle de leur position dans l’arbre du vivant. D’emblée, ça semble une tâche bien ardue puisque la plupart des chercheurs ne sont pas d’accord pour considérer que les virus sont des organismes vivants. C’est une prudence qui peut se comprendre : vu qu’on se casse déjà le cul à tenter de classer le vivant (1, 2 & 3), autant ne pas y rajouter des trucs qui n’ont rien à voir comme des silex, des trombones ou le sécateur de votre voisin.

[Image] Rhizome du Vivant

"... Des gènes de mimivirus se groupent tantôt tout seuls, tantôt chez les eucaryotes, les eubactéries ou les archées. Selon certains, ces résultats montrent que les virus, et les mimivirus en particulier, sont les rois des voleurs de gènes. Le problème c’est que ces vols de gènes, ce qu’on appelle couramment des transferts horizontaux de gènes, laissent des traces qui s’effacent au fur et à mesure de l’évolution. Même si les virus évoluent vite, force est de constater que la plupart de ces transferts sont probablement très très vieux (on trouve des transferts horizontaux récents dans leur génome, mais ils sont facilement reconnaissables).

Alternativement, d’autres chercheurs proposent un autre angle d’approche pour expliquer ce bordel génétique : l’hybridation, et les transferts génétiques. Comme on l’a vu lors de l’interview de Marc-André Sélosse, les transferts de gènes et autres cochoncetés génétiques sont légions entre les 3 domaines du vivant. Du coup, face à la figure classique de l’arbre du vivant, ces chercheurs évoquent maintenant la possibilité de représenter les relations de parenté où les branches peuvent s’anastomoser comme un système de racine, ou comme les bras des cours d’eau près d’un delta : une sorte de rhizome du vivant, pour utiliser l’expression de Didier Raoult qui est le premier à avoir proposé ce scénario…"

(...)

___________________________________________________________________

POUR EN SAVOIR PLUS :

→ Et si Darwin s'était trompé... - Le Point
https://www.lepoint.fr/debats/et-si-darwin-s-etait-trompe-12-12-2011-1406407_2.php

C'est l'un des plus grands chercheurs français en microbiologie. Le professeur Didier Raoult dirige l'unité de recherche en maladies infectieuses et tropicales émergentes à la faculté de médecine de Marseille. On lui doit des découvertes fondamentales comme celle des virus géants et peut-être même d'une nouvelle forme de vie. Dans son dernier livre, Dépasser Darwin (Plon), Didier Raoult explique pourquoi le darwinisme, érigé en dogme, est en train de voler en éclats.

Le Point : Vous racontez que, dans leurs laboratoires, les chercheurs en biologie sont en train de révolutionner la vision du monde. Aujourd'hui, Copernic n'a pas l'oeil collé à une lunette astronomique, mais à un microscope électronique ?

Didier Raoult : Quand Copernic puis Galilée affirment que la Terre tourne autour du Soleil, c'est la façon dont nous avons ordonnancé le monde dans nos têtes qui vole en éclats. L'homme n'est plus au sommet de la création, le centre d'un univers immuable. Avec la révolution génomique, nous vivons les débuts de la biologie. On découvre que l'homme est un écosystème à lui tout seul, un monde dans lequel cohabitent des millions de micro-organismes. Cet écosystème ambulant évolue dans d'autres écosystèmes qu'il modifie et qui le modifient. Tous les êtres vivants passent leur temps à s'échanger des gènes. Pas uniquement par la reproduction, mais aussi par les virus et les bactéries. Le monde du vivant est une immense orgie collective. On sait aujourd'hui que 8 % de l'ADN humain est constitué de vestiges de gènes qui nous ont été transmis par des virus.

C'est pourquoi vous dites que l'homme est une "chimère" ?

Pendant longtemps, on a pensé que nous descendions d'un ancêtre commun : le Sapiens. En mai 2010, coup de théâtre : les résultats d'une analyse de l'ADN prélevé sur des os de néandertaliens ont révélé que 1 à 4 % de nos gènes viennent de Neandertal. Que cela nous plaise ou non, nous sommes apparentés à ce lourdaud, et non pas uniquement à Sapiens"l'intello". Les deux se sont rencontrés et métissés. L'arbre généalogique de l'espèce humaine est anti-darwinien parce que notre ancêtre est tout à la fois Sapiens, néandertalien, une bactérie et un virus !

Vous avez récemment affirmé que quatre formes de vie, et non pas trois comme il a toujours été admis, sont apparues il y a plus d'un milliard d'années. De quoi mettre en ébullition les spécialistes de l'évolution !

Le virus géant mimivirus que mon équipe a découvert en 2003, et dont nous avons décrypté le génome, me permet d'émettre l'hypothèse selon laquelle, à côté des trois grandes formes de vie acceptées - bactéries, eucaryotes et Archaea -, il en existerait une quatrième : celle des grands virus à ADN. Mimivirus en fait partie, tout comme trois autres virus dont nous avons aussi révélé l'existence. Ce monde de virus géants constitue un quatrième groupe entièrement parasitaire, distinct des trois autres. Cela suscite un large débat chez les scientifiques. Ce n'est pourtant qu'une étape dans la remise en question nécessaire du classement darwinien du vivant. Les virus en sont aujourd'hui exclus, alors que ce sont les entités biologiques les plus abondantes et la source de plus de la moitié des gènes de l'univers connu !

D'après vous, il faudrait abattre l'"arbre de Darwin" ?

L'arbre darwinien n'existe pas. C'est un fantasme. L'idée du tronc commun avec les espèces qui divergent comme des branches est un non-sens. Un arbre de la vie, pourquoi pas, mais alors planté la tête en bas, les racines en l'air ! Si les espèces s'étaient définitivement séparées il y a des millions d'années, il n'y aurait en fait plus d'espèces vivantes sur la planète. Chacune aurait dégénéré dans son coin faute d'avoir pu suffisamment renouveler son patrimoine génétique. Pour survivre, il faut savoir s'encombrer de gènes inutiles. Ne pas être économe.

(...)