Plant Sciences
38.2K views | +29 today
Follow
 
Scooped by Saclay Plant Sciences
onto Plant Sciences
Scoop.it!

The SCHENGEN pathway: Developmental Quality Control in Plants - Niko Geldner SPS online seminar can be viewed here

The SCHENGEN pathway: Developmental Quality Control in Plants - Niko Geldner SPS online seminar can be viewed here | Plant Sciences | Scoop.it

Based on a screen in our lab, aimed at identifying mutants with an impaired endodermal diffusion barrier in their roots, we identified a group of mutants that we termed SCHENGEN (SGN) mutants. These were idenitiifed as an LRR receptor-like kinase SGN3 (also called GSO1), a non-transmembrane kinase (SGN1), the NADPH oxidase RBOHF (SGN4), as well as TPST (SGN2) an enzyme responsible for sulfating a number of peptide ligands. I will report on our research in recent years, allowing us to place all SGN mutants into a novel signaling pathway. This pathway appears to have evolved for surveillance of diffusion barrier integrity and assists the differentiating endodermis in formation of a continuous and tightly sealed Casparian strip network. Intriguing variations of this pathway appear to be at play in the control of embryonic cuticle formation. The SCHENGEN pathway is unusual because it detects defects in subcellular structures by making use of the restricted subcellular localization of its signaling components. At the same time, the basic pathway components identified bear striking homologies to plant immune receptor pathways, prompting speculations that the pathway could represent a neo-functionalisation of ancient stress response pathways.

Saclay Plant Sciencess insight:

SPS online seminar can be viewed here

No comment yet.
Plant Sciences
Your new post is loading...
Your new post is loading...
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Jacques Tempé (1935-2020)

Jacques Tempé (1935-2020) | Plant Sciences | Scoop.it

Jacques Tempé, né près de Colmar, région à laquelle il restait très attaché, est décédé le 29 juillet 2020 à 85 ans, à Saintes.

 

A l’heure où les plantes génétiquement modifiées se développent partout dans le monde, mais restent un objet de débat en Europe, peu connaissent aujourd’hui la contribution majeure de Jacques à la découverte des transferts d’ADN des bactéries du genre Agrobacterium vers les plantes.

 

Jacques Tempé s’était passionné pour la Biochimie, alors qu’il était encore étudiant à l’Institut National Agronomique, grâce au cours et à l’écoute du Prof. Henri Heslot. Une fois son diplôme obtenu, il avait rejoint l’Ecole Polytechnique pour un contrat avec le CEA dans le but de développer de nouvelles molécules mutagènes pour modifier des semences. Ce lien entre la Biochimie et les plantes l’a rapidement amené dans l’environnement de Georges Morel à l’INRA de Versailles où il a été recruté en 1963 et a réalisé sa thèse d’état soutenue en 1982.

 

Georges Morel avait, dans le laboratoire de Roger Gautheret, montré que les cellules issues de tumeurs du collet de plantes (tabac) étaient immortalisées (elles étaient capables de se multiplier à la manière d’une tumeur, sans ajouts hormonaux) et qu’elles produisaient des molécules azotées spécifiques. Avec Arlette Goldmann-Ménagé et quelques autres collègues, Jacques Tempé a ainsi caractérisé biochimiquement un certain nombre d’opines (notamment l’octopine) molécules azotées que l’ADN transféré (ADN-T) à partir d’Agrobacterium fait produire à la plante à partir des substrats organiques produits par celle-ci. Ces opines sont ensuite métabolisées par la bactérie pour sa nutrition carbonée et azotée, la plante en étant incapable.

 

Ces résultats, combinés à ceux des travaux d’Alan Kerr en Australie, de Jeff Schell et Marc van Montagu en Belgique et Mary-Dell Chilton aux USA, allaient aboutir, par le biais de riches collaborations, à la découverte du mécanisme moléculaire à la base du cycle de vie des bactéries pathogènes du genre Agrobacterium et au «concept d’opines». De nombreuses publications (Nature, Science, Cell, PNAS…) associant ces auteurs entre 1977 et 1982 ont abouti à la maîtrise d‘un mécanisme de transfert d’information génétique dite « recombinante » vers les plantes, grâce à la possibilité de désarmer les composantes responsables des symptômes tumoraux (hormones) et de la production des opines de l’ADN-T, et de les remplacer par une nouvelle information génétique à transférer. C’était le point de départ du développement des plantes génétiquement modifiées, dont les premières ont été générées quasi simultanément en Europe (groupes de Marc Van Montagu et Jeff Schell à Gand) et aux USA (groupe Nam Hai Chua, en collaboration avec Monsanto).

 

La maîtrise de la transformation des plantes a tout d’abord révolutionné les travaux effectués dans nos laboratoires et l’analyse fonctionnelle des gènes (rôles et régulations) et de leurs produits (ARN et protéines). Elle a permis le développement rapide d’une «génomique fonctionnelle» par la création de banques de mutants d’insertion, d’abord chez la plante modèle Arabidopsis, puis dans un nombre important d’espèces cultivées. Elle constitue aujourd’hui l’un des outils de base des laboratoires en biologie, génétique et génomique végétale. La puissance de cet outil a évidemment été rapidement utilisée pour l’amélioration des plantes. Les disputes qui ont suivi, concernant les risques de l’usage des plantes génétiquement modifiées et maintenant « éditées » ont certainement limité la reconnaissance qui aurait dû être attribuée aux co-découvreurs de ce processus de transfert d’ADN à partir des bactéries phytopathogènes. Mais l’histoire reconnaitra qu’il s’agissait d’une découverte considérable, avec de vastes champs d’applications. La sole de plantes de grandes cultures génétiquement modifiées était en 2018 proche de 200 Millions d’ha (ISAAA), soit 12% des surfaces cultivées mondiales et plus que la sole cultivable en Europe !

 

Après ce travail remarquable, conduit d’abord avec Georges Morel puis par lui-même avec son équipe à Versailles, à Orsay, puis enfin à Gif sur Yvette où il a été très impliqué dans la création de l’Institut des Sciences Végétales en 1988, il a continué à animer des recherches sur les propriétés des agrobactéries. Son équipe a également travaillé sur la dynamique des micro-organismes, dont les agrobactéries et leurs exsudats, dans la rhizosphère afin de comprendre le fonctionnement et les interactions au sein du « microbiote rhizosphérique » (travaux conduits dans son équipe et ensuite sous leurs directions par Yves Dessaux, Denis Faure et leur équipe).

 

Jacques Tempé aimait enseigner. Alors qu’il était Directeur de Recherches de Classe Exceptionnelle à l’INRA, il a relevé le challenge de postuler à un poste de Professeur de Pathologie végétale à l’Institut National Agronomique Paris-Grignon sur la chaire préalablement détenue par Alain Coléno, poste qu’il a obtenu en 1989. Les témoignages reçus de la part de ses étudiants à la suite de l’annonce de sa disparition sont élogieux et montrent l’impact que Jacques a eu sur leur devenir professionnel. Jacques Tempé était convaincu de la nécessité de former « par et avec » la recherche. Avec Claire Neema, actuelle Professeur de Pathologie végétale à SupAgro Montpellier, ils se sont investis dans le montage d’Unités d’Enseignement par la Recherche impliquant des mini-stages en laboratoire, la construction de projets de recherche encadrés ; et surtout de stages de longue durée, sous forme de césures de 2 fois 6 mois généralement. Jacques Tempé et Claire Neema utilisaient leurs carnets d’adresses des meilleurs laboratoires du monde entier pour y envoyer les étudiants dès leur 2ème année à l’Ecole. Cette approche sera ensuite largement copiée dans l’enseignement supérieur.

 

Jacques Tempé a ainsi largement contribué à la découverte du transfert de l’ADN-T par les agrobactéries et par conséquent au développement de la génétique moléculaire végétale et à celui des Plantes Génétiquement Modifiées. Il considérait ces plantes comme un formidable outil pour le développement d’une agriculture moderne, productive et durable, basée sur des pratiques respectueuses de l’environnement et capable de répondre aux besoins croissants des populations. Par ailleurs, il s’est investi dans l’enseignement par passion, passion que les étudiant-e-s lui ont bien rendu. Il croyait énormément à un projet d’Institut des Sciences et Technologies du Vivant (ISTV), initié par André Berkaloff qu’il avait rejoint à Orsay. Il devait donc être très fier de voir le développement récent de l’Université Paris-Saclay, et la place prépondérante des sciences agronomiques et végétales au sein de cette grande Université.

 

Nous, collègues, étudiants et amis avons donc une pensée très émue pour Jacques et sa famille qui doivent être fiers du travail accompli et de son impact aussi bien en recherche et formation, qu’en agriculture.

 

M. Dron, Y. Chupeau, M. Delseny, et L. Lepiniec

 

No comment yet.
Rescooped by Saclay Plant Sciences from Plant and Seed Biology
Scoop.it!

Applications of CRISPR–Cas in agriculture and plant biotechnology

Applications of CRISPR–Cas in agriculture and plant biotechnology | Plant Sciences | Scoop.it
The prokaryote-derived CRISPR–Cas genome editing technology has altered plant molecular biology beyond all expectations. Characterized by robustness and high target specificity and programmability, CRISPR–Cas allows precise genetic manipulation of crop species, which provides the opportunity to create germplasms with beneficial traits and to develop novel, more sustainable agricultural systems. Furthermore, the numerous emerging biotechnologies based on CRISPR–Cas platforms have expanded the toolbox of fundamental research and plant synthetic biology. In this Review, we first briefly describe gene editing by CRISPR–Cas, focusing on the newest, precise gene editing technologies such as base editing and prime editing. We then discuss the most important applications of CRISPR–Cas in increasing plant yield, quality, disease resistance and herbicide resistance, breeding and accelerated domestication. We also highlight the most recent breakthroughs in CRISPR–Cas-related plant biotechnologies, including CRISPR–Cas reagent delivery, gene regulation, multiplexed gene editing and mutagenesis and directed evolution technologies. Finally, we discuss prospective applications of this game-changing technology. The newest CRISPR–Cas genome editing technologies enable precise and simplified formation of crops with increased yield, quality, disease resistance and herbicide resistance, as well as accelerated domestication. Recent breakthroughs in CRISPR–Cas plant biotechnologies improve reagent delivery, gene regulation, multiplexed gene editing and directed evolution.

Via Loïc Lepiniec
No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

What’s new at AgroParisTech ? 

What’s new at AgroParisTech ?  | Plant Sciences | Scoop.it
 

Développement durable, écologie, alimentation, bien-être animal, préservation des ressources naturelles… des enjeux de société incontournables aujourd’hui. Des enjeux sur lesquels AgroParisTech, école historiquement spécialiste des sciences du vivant, a un coup d’avance. Quelles nouveautés va-t-elle impulser cette année ? Eléments de réponse avec son directeur, Gilles Trystram.

 

LES MEILLEURS AMBASSADEURS DU DÉVELOPPEMENT DURABLE À LA FRANÇAISE

AgroParisTech ne surfe pas sur les effets de mode, les sciences du vivant sont intrinsèques à ce qu’est et ce que veut être l’école. « Je ne parle pas de sciences de la vie mais bien de sciences du vivant, un terme qui englobe la biologie bien sûr, mais aussi la chimie, l’écologie, la sociologie, l’anthropologie, les biotechs, la zootechnie… Cela constitue le socle de nos compétences et notre originalité dans les formations d’ingénieurs » insiste Gilles Trystram. Ce n’est d’ailleurs pas un hasard si AgroParisTech présente un taux d’élèves vocationnels de 20 %. « Ils ont choisi le vivant et le développement durable, un sujet dont on parle beaucoup aujourd’hui et qui constitue le cœur historique d’AgroParisTech. »

 

DES MÉTIERS QUI BOUGENT !

Et qui dit développement durable dit nouvelle économie et nouvelle sociologie. Concevoir et manager de nouveaux dispositifs de production primaire, maîtriser la chaine de valeur associée à la demande agricole alimentaire et bioéconomique et concilier préservation des ressources naturelles et besoins de populations de plus en plus urbanisées : telles seront, demain, les missions des alumni d’AgroParisTech.

 

Les 3 skills incontournables des AgroParisTech ?

#1 Diagnostiquer une situation dans une compréhension revendiquée systémique

#2 Lier intrinsèquement sciences biotechniques et sciences humaines et sociales

#3 Se projeter sur le temps long dans une démarche systémique et complexe

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Le Village des Sciences Paris-Saclay en mode « virtuel » pour la Fête de la Science 2020 ! Du 2 au 12 octobre 2020 - En ligne

Le Village des Sciences Paris-Saclay en mode « virtuel » pour la Fête de la Science 2020 ! Du 2 au 12 octobre 2020 - En ligne | Plant Sciences | Scoop.it

Rendez-vous du 2 au 12 octobre pour retrouver PLUS DE 100 VIDEOS & 20 PARTENAIRES
Comme les années précédentes, dans le cadre de la Fête de la Science, le réseau Sciences des Plantes de Saclay (SPS) participera au Village des Sciences Paris-Saclay organisé par l'association Ile de Science Paris-Saclay.

En raison du contexte sanitaire actuel, le Village des Sciences Paris-Saclay se fera cette année en mode « virtuel » !

Venez découvrir la Science au sens large,
avec les chercheurs et les scientifiques du Plateau de Saclay !

No comment yet.
Rescooped by Saclay Plant Sciences from Life Sciences Université Paris-Saclay
Scoop.it!

Amandine Cornille, lauréate 2020 du Prix Paoletti

Amandine Cornille, lauréate 2020 du Prix Paoletti | Plant Sciences | Scoop.it

Claude Paoletti, ancien directeur du Département des sciences de la vie du CNRS, a pris de nombreuses initiatives pour soutenir les jeunes chercheurs. Ses amis ont créé en 1996 un prix en sa mémoire et sa pérennité est assurée par l'Institut des sciences biologiques du CNRS. Ce prix, d’un montant de 5000 euros, récompense chaque année, pour leurs travaux de recherche en sciences de la vie, une chercheuse et un chercheur. 

 

Cette année, le Prix Paoletti a été décerné à Amandine Cornille.

Chargée de recherche au CNRS à l’UMR GQE-Le Moulon, Amandine Cornille dirige une équipe ATIP Avenir CNRS-Inserm sur la génomique évolutive des interactions hôte-ravageur ; son modèle est le binôme pommier-puceron. Son parcours de jeune chercheuse vient d’être distingué par le CNRS qui lui a attribué le Prix Paoletti 2020.

 

Au-delà des collaborations scientifiques, l’équipe a noué des liens avec de nombreuses structures associatives et des acteurs locaux du plateau de Saclay, ainsi que des start-up et des groupes privés, dans le cadre d’un verger conservatoire, expérimental et pédagogique sur le plateau de Saclay qu’elle a mis en place afin comprendre l’impact du changement climatique et des ravageurs sur les pommiers.

 

Contact : amandine.cornille@inrae.fr


Via Life Sciences UPSaclay
No comment yet.
Rescooped by Saclay Plant Sciences from Life Sciences Université Paris-Saclay
Scoop.it!

FOCUS PLATEFORME : SPOmics-Interactome ou comment les plantes peuvent servir la découverte de nouveaux rôles de l'ubiquitination des protéines

FOCUS PLATEFORME : SPOmics-Interactome ou comment les plantes peuvent servir la découverte de nouveaux rôles de l'ubiquitination des protéines | Plant Sciences | Scoop.it

Les interactions entre protéines sont des éléments essentiels des systèmes biologiques et leur analyse peut fournir des indications précieuses sur les fonctions des protéines. La plate-forme interactomique de l’IPS2 (SPOmics-Interactome) offre ses services aux équipes de recherche françaises et internationales.

 

Exemple choisi : Récemment, une collaboration avec l’équipe de Gregory Vert (Signalisation Cellulaire et Ubiquitination, LRSV, Toulouse) nous a permis de développer plusieurs approches à grande échelle pour caractériser la machine d'ubiquitination E2-E3 entraînant la formation de la chaîne d'ubiquitine liée à K63 chez Arabidopsis (Arabidopsis thaliana). L'ubiquitination implique l'action séquentielle de trois classes d'enzymes : les Ub-activating enzymes, les Ub-conjugating enzymes (E2s) et les Ub ligases (E3s). Les activités de ces enzymes aboutissent à la fixation covalente de l'ubiquitine-Ub à un résidu de Lys (K) dans la protéine cible. Les chaînes PolyUb présentent des topologies différentes auxquelles sont associées des fonctions biologiques diverses. La liaison K48 des fragments d'Ub déclenche, par exemple, la dégradation des protéines cibles par le protéasome 26S. On en sait beaucoup moins sur les autres liaisons des chaînes polyUb. Les chaînes Ub liées au K63 n'induisent pas de dégradation dépendante du protéasome. Les rôles de la poly-ubiquitination impliquant le résidu K63 de l'Ub ont été largement étudiés chez la levure et les mammifères, y compris les rôles dans l'endocytose des protéines plasmamembranaires, les réponses aux dommages de l'ADN et, plus marginalement, l’autophagie et la signalisation.

 

Les approches d’interactomique développées sur la plateforme SPOmics-Interactome ont permis d'identifier de nombreuses protéines qui interagissent avec les E2 UBC35/36 dédiées à la polyubiquitination K63 et leurs variantes E2 apparentées, dont plus d'une douzaine de ligases E3 et leurs cibles présumées. Les cibles de polyubiquitination K63 ont pu fournir une image plus complète des réseaux de polyubiquitine K63. Notre travail commun a permis d’identifier les enzymes conjuguant l'ubiquitine (E2) UBC35/36 comme les principaux moteurs de la formation de la chaîne de polyubiquitine K63 et mis en évidence le rôle majeur de ces protéines dans la croissance et le développement des plantes. En savoir plus ?

 

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

Contact : Dario Monachello (dario.monachello@inrae.fr)

 

SPOmics-Interactome est la plateforme d’étude des interactions protéine-protéine de l’IPS2. Les technologies qu’elle maitrise sont basée sur la seule méthode permettant la détection de ces interactions à haut débit et in vivo - le système double-hybride chez la levure (Y2H) - aujourd’hui optimisé et automatisé. A ce titre, grâce à l’utilisation de plaques 384 puits et d’un système robotisé d’une part, mais aussi d’un protocole entièrement en milieu liquide, la plateforme est capable de cribler un pool de 50 protéines hybrides (DB- X) contre la banque de protéines hybrides AD-AIM (environ 12000 protéines d’Arabidopsis) en deux mois. Le protocole généralement utilisé est le suivant : Les plasmides portant les ORFs codant pour les protéines d’intérêt fournis par nos collaborateurs dans le vecteur pDEST - DB sont utilisés pour transformer des levures, puis les protéines DB-X hybrides sont testées pour éliminer celles capables d’auto-activation. Les levures exprimant les protéines DB-X hybrides sont alors cultivées individuellement dans des milieux sélectifs, puis combinées en pools de 50 clones et criblées contre la banque AD-AIM. Après identification des protéines candidates, une analyse matricielle en Y2H est effectuée par « déconvolution » des 50 DB-proies et par tests individuels contre les candidats AD-appâts. Une étape finale de séquençage des protéines AD- et DB- permet la validation de l’identité des protéines en interaction. Chaque nouvel ORF criblé est intégré dans la banque AD- permettant une constante implémentation du réseau.


Via Life Sciences UPSaclay
No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Characterization of the resistance and cell death function of Arabidopsis CC- and CCR-type intracellular immune receptors - Farid El Kasmi (to view the video)

Characterization of the resistance and cell death function of Arabidopsis CC- and CCR-type intracellular immune receptors - Farid El Kasmi (to view the video) | Plant Sciences | Scoop.it

Characterization of the resistance and cell death function of Arabidopsis CC- and CCR-type intracellular immune receptors - Farid El Kasmi, September 7, 2020 - 11:30AM - Online
(Center for Plant Molecular Biology – ZMBP, University of Tübingen, Germany)

Plant intracellular immune receptors of the nucleotide-binding leucin-rich repeat receptor (NLR) family mediate recognition of pathogen-derived effector proteins and the induction of a strong immune response, which in many cases lead to a hypersensitive response, a type of programmed cell death of the infected cells. Based on their N-terminal domain architecture three classes of NLRs have been described in plants, Toll/Interleukin-1 receptor/resistance (TIR) NLRs (TNLs), coiled-coil (CC) NLRs (CNLs) and the RPW8-like coiled-coil (CCR) domain NLRs (RNLs). In Arabidopsis thaliana (Arabidopsis) the RNL subclass is encoded by two gene families, ACTIVATED DISEASE RESISTANCE 1 (ADR1) and N REQUIREMENT GENE 1 (NRG1). RNLs are required for immune signalling and cell death induction of many other NLRs, particularly TNLs, and therefore also considered as helper NLRs. Our research investigates the molecular mechanisms underlying CNL and RNL mediated immune signalling and cell death induction during auto-immunity and pathogen infections.

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

An unexpected CLE peptide regulates symbiotic nodulation of legume plants (coll. IPS2, SPS)  

An unexpected CLE peptide regulates symbiotic nodulation of legume plants (coll. IPS2, SPS)    | Plant Sciences | Scoop.it

An improved linkage disequilibrium-based statistical test used for Genome-Wide Epistatic Selection Scans allowed predicting a genetic interaction between a new CLE signaling peptide and the SUNN receptor

 

The quest for signatures of selection using single nucleotide polymorphism (SNP) data has proven efficient to uncover genes involved in conserved and/or adaptive molecular functions, but none of the statistical methods were designed to identify interacting alleles as targets of selective processes. In a collaborative study between the Frugier team at IPS2 and M. Bonhomme at the LRSV (Toulouse, France), published in Heredity, we propose a statistical test aimed at detecting epistatic selection, based on a linkage disequilibrium (LD) measure accounting for population structure and heterogeneous relatedness between individuals. SNP-based (Trv) and window-based (TcorPC1v) statistics both fit a Student distribution, allowing testing the significance of correlation coefficients. The use of this improved statistical test on SNP data from the Medicago truncatula symbiotic legume plant allowed to uncover a previously unknown gene coadaptation between the MtSUNN (Super Numeric Nodule) receptor and the MtCLE02 (CLAVATA3-Like 02) signaling peptide. Experimental evidence allowed to demonstrate as a proof of concept that this coadaptation signature was associated to a genetic link between these two genes, as the MtCLE02 signaling peptides regulate negatively symbiotic root nodulation depending on the MtSUNN receptor. This collaborative work was made possible thanks to the ANR project “PSYCHE” coordinated by F. Frugier at IPS2.

Contact: florian.frugier@cnrs.fr

 

 

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Natural variation at FLM splicing has pleiotropic effects modulating ecological strategies in Arabidopsis thaliana (IJPB, SPS)

Natural variation at FLM splicing has pleiotropic effects modulating ecological strategies in Arabidopsis thaliana (IJPB, SPS) | Plant Sciences | Scoop.it
Investigating the evolution of complex phenotypes and the underlying molecular bases of their variation is critical to understand how organisms adapt to their environment. Applying classical quantitative genetics on a segregating population derived from a Can-0xCol-0 cross, we identify the MADS-box transcription factor FLOWERING LOCUS M (FLM) as a player of the phenotypic variation in plant growth and color. We show that allelic variation at FLM modulates plant growth strategy along the leaf economics spectrum, a trade-off between resource acquisition and resource conservation, observable across thousands of plant species. Functional differences at FLM rely on a single intronic substitution, disturbing transcript splicing and leading to the accumulation of non-functional FLM transcripts. Associations between this substitution and phenotypic and climatic data across Arabidopsis natural populations, show how noncoding genetic variation at a single gene might be adaptive through pleiotropic effects.
No comment yet.
Rescooped by Saclay Plant Sciences from Life Sciences Université Paris-Saclay
Scoop.it!

Shanghai 2020 Ranking: Paris-Saclay University moves into 14th place worldwide

Shanghai 2020 Ranking: Paris-Saclay University moves into 14th place worldwide | Plant Sciences | Scoop.it

The 2020 Academic Ranking of World Universities (ARWU) is released today by ShanghaiRanking Consultancy. Since 2003, ARWU has been presenting the world top universities annually based on transparent methodology and objective third-party data. It has been recognized as the precursor of global university rankings and the most trustworthy one. This year, the best 1000 universities in the world are published.

 

Harvard University tops the ranking list for the 18th year. Stanford University and the University of Cambridge remain to be the No. 2 and No. 3 respectively. Other Top 10 universities are MIT(4th), Berkeley(5th), Princeton(6th), Columbia(7th), Caltech(8th) Oxford(9th) and Chicago(10th). In Continental Europe, Paris-Saclay University(14th) becomes the best at its first appearance in ARWU, followed by ETH Zurich(20th). The University of Tokyo(26th) keeps its leading position in Asia, and Tsinghua University(29th) overtakes Kyoto University(34th), becoming the second best among Asian universities. The University of Melbourne(35th) tops other universities in Oceania.

 

Six universities make their first-ever appearances in the Top 100, including four French ones, namely Paris-Saclay University(14th), PSL University(36th), University of Paris(65th) and Université Grenoble Alpes(99th), and two Chinese ones, namely the University of Science and Technology of China(73th) and Fudan University(100th). Beijing Jiaotong University and other 14 universities enter into the Top 500 list for the first time. More than 40 universities enter into Top 1000 list for the first time.


Via Life Sciences UPSaclay
No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Paris-Saclay, première université française à percer dans le classement de Shanghaï (Le Monde)

Paris-Saclay, première université française à percer dans le classement de Shanghaï (Le Monde) | Plant Sciences | Scoop.it


Les résultats de l’édition 2020 de ce palmarès mondial créé en 2003 ont été rendus publics samedi. Pour la première fois, un établissement français parvient au rang des meilleurs.

Par Soazig Le Nevé Publié aujourd’hui à 06h00, mis à jour à 08h29

C’est une première historique à l’échelle du monde universitaire : dans son édition 2020, publiée samedi 15 août, le classement de Shanghaï place en 14e position sur 1 000 l’université Paris-Saclay. Un niveau jamais atteint par aucune université française depuis la création de ce palmarès en 2003.

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Integrating multiple omics to dissect the common and specific molecular changes occurring in Arabidopsis thaliana (L.) under nitrate and sulfate chronic limitations (IJPB, IPS2, SPS...)

Integrating multiple omics to dissect the common and specific molecular changes occurring in Arabidopsis thaliana (L.) under nitrate and sulfate chronic limitations (IJPB, IPS2, SPS...) | Plant Sciences | Scoop.it
Plants, which have fundamental dependence on nitrogen and sulfur, have to cope with chronic limitations when fertilizers are not provided. Our study aimed at characterizing the metabolomic, proteomic and transcriptomic changes occurring in Arabidopsis leaves under chronic nitrate (Low-N) and chronic sulfate (Low-S) limitations in order to compare Low-S and Low-N effects and enlighten interconnections and strategies of plant adaptation.

Metabolite profiling globally revealed an opposite effect of Low-S and Low-N on carbohydrate and amino acid accumulations. Proteomic data showed by contrast that both Low-N and Low-S resulted in the exacerbation of catabolic processes, stimulation of mitochondrial and cytosolic metabolisms and decrease of chloroplast metabolism. The lower abundances of ribosomal proteins and translation factors under Low-N and Low-S attested from growth limitation. At transcript level, the major and specific effect of Low-N was the enhancement of plant defence and immunity genes. The main effect of chronic Low-S was the decrease of transcripts involved in cell division, DNA replication and cytoskeleton and the increase of autophagy gene expressions. This was consistent with a role of the Target-of-Rapamycin kinase in the control of plant metabolism and cell growth and division under chronic Low-S. In addition, Low-S decreased the expression of several NLP transcription factors, which are master actors of nitrate sensing. Finally, both transcriptome and proteome revealed the effect of Low-S on the repression of glucosinolate synthesis, and the effect of Low-N on the exacerbation of glucosinolate degradation. This showed the importance of glucosinolate as buffering molecules for N and S management.
No comment yet.
Rescooped by Saclay Plant Sciences from News Doctoral School
Scoop.it!

Alumni's Corner: portrait of Camille CHALVIN

Alumni's Corner: portrait of Camille CHALVIN | Plant Sciences | Scoop.it
I did my PhD at IPS2; I was working on the secondary metabolism of a cultivated perfume plant, clary sage. I defended my PhD in July 2019 and since September 2019, I am a consultant in collaborative project management at D&Consultants, a small consulting company (we are 35) located at Paris Montparnasse. D&Consultants is specialized in innovation management. We help other companies to build their R&D strategies and to obtain French government funding for large R&D projects involving several partners (private companies and public research laboratories). My job starts when a collaborative project is kicked off. I support the project leader for project coordination and for the interactions with public funding organizations (Bpifrance, ADEME...). At the beginning of a project, I coordinate the negotiation of contracts governing the relationships between partners and funding organizations. Then, during the course of the project, I organize project meetings gathering all partners, I write reports describing the progress of the project and I collect from all partners the administrative documents requested by funding organizations. Something I particularly like with this job is the fact that I work on diverse and ambitious R&D projects, in all fields: medical devices, renewable energies, biotechnology, construction industry... This is intellectually very stimulating and I am happy to still work in the field of science and innovation. When I look back and try to figure out how and why I became a consultant, I think 3 things were decisive during my PhD. The first one is the non-research doctoral mission I did during the 2nd and the 3rd year of my PhD. I worked 1 day per week at the technology transfer service of the Université Paris-Sud, helping researchers to bring their technologies closer to the market by monitoring patent applications and partnerships with industry. This experience was determinant because I realized I could contribute to make R&D projects come true otherwise than by doing research. I also followed several training courses about business proposed by the Université Paris-Saclay and dedicated to PhD students. By understanding better how companies work, I progressively understood how I would like to make me useful. However, I think that the thing that helped me the most was to talk with PhDs working in the private sector. You can meet this kind of people at professional forums like the Forum BIOTechno Paris or the PhD Talent Career Fair for example. By asking them questions about their work and how they got there, it was easier for me to imagine myself in other job positions than researcher (this is also how I heard about D&Consultants...). By the way, do not hesitate to contact me on LinkedIn if you wish to!

Via Doctoral School of Plant Sciences
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Prix Nobel de chimie 2020 et avis de l’Académie d’agriculture de France sur le thème « Réécriture du génome, éthique et confiance » 

Prix Nobel de chimie 2020 et avis de l’Académie d’agriculture de France sur le thème « Réécriture du génome, éthique et confiance »  | Plant Sciences | Scoop.it

Prix Nobel de chimie 2020 et avis de l’Académie d’agriculture de France sur le thème « Réécriture du génome, éthique et confiance»
Paris, le 14 octobre 2020

Le prix Nobel de chimie 2020 est décerné à Emmanuelle CHARPENTIER et Jennifer DOUDNA pour leur découverte du système CRISPR-Cas. Cet outil très puissant pourrait trouver de multiples applications dans les domaines de l’agriculture, de l’élevage ou de la forêt. Aussi, dès 2017, l’Académie d’agriculture de France (AAF) a-t-elle initié une réflexion large et approfondie autour des pistes nouvelles ainsi ouvertes et des questions, voire des risques, que leur application pourrait entraîner, en mettant en place un groupe de travail où étaient représentées toutes les sections de l’Académie. Bertrand Hervieu et Paul Vialle, rapporteurs du groupe de travail, ont animé les débats sur ce thème très sensible.

L’avis sur la « Réécriture du génome, éthique et confiance » dans le cas des plantes cultivées, de la forêt et des animaux d’élevage a été approuvé en séance plénière de l’Académie d’agriculture de France le 8 janvier 2020 par plus de 80% des votants.

Au terme de ces travaux, l’Académie énonce 8 recommandations selon 4 principes directeurs pour guider l‘action :

Agir de façon responsable,
Respecter le principe de précaution,
Associer largement le public. Informer. Agir de façon transparente,
Procéder à des réévaluations régulières.
L’avis analyse ces technologies de réécriture du génome (dont celle de CRISPR Cas 9), plus précises, plus rapides, que les méthodes antérieures, mais dans certains cas impossibles à distinguer par la suite. Sur des exemples concrets très divers, il ressort que chaque cas est singulier, et que cette diversité doit être prise en considération tant au niveau des bénéfices que des risques éventuels.

Pendant les travaux de l’Académie, la Cour de justice de l’Union européenne, sur la base de la directive européenne 2001-18, a rendu une décision classant les produits issus de ces techniques parmi les OGM, indépendamment de l’évolution scientifique de ces 20 dernières années.

L’Académie affirme le bien-fondé d’utiliser ces techniques pour des objectifs de recherche cognitive, comme c’est déjà le cas en santé humaine. Elle est convaincue que certaines de leurs applications peuvent faire partie des solutions pour contribuer à relever les défis mondiaux urgents : biodiversité, changement climatique, évolution de la population mondiale, et qu’elles peuvent s’inscrire dans les priorités politiques actuelles, comme l’agroécologie ou le bien-être animal.

L’AAF maintient la nécessité d’une autorisation préalable dans le cadre de l’article 7 de la directive 2001-18 instaurant une procédure différenciée - apparemment jamais utilisée - mais avec des dossiers mieux calibrés et un suivi des autorisations, limitées dans le temps et révocables, auxquelles il pourrait être mis fin sans irréversibilité. Pour éviter le décalage entre science, droit et société, elle propose une révision tous les 7 ans des textes régissant ces domaines, comme pour le Conseil consultatif national d’éthique.

L’Académie demande avec insistance aux pouvoirs publics de sortir d’une position attentiste. Enfin, elle souhaite contribuer à cette évolution et, pour ce faire, est prête à solliciter et accompagner les législateurs, en lien avec d’autres académies françaises et européennes.

===

Pour accéder à l'avis cliquer ci-après :

https://www.academie-agriculture.fr/publications/publications-academie/a...

Pour télécharger le communiqué au format pdf , cliquer ci-dessous : 

20201014communiqueaafavisrerecrituredugenome.pdf

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

The French Academy of Agriculture insists on the vital nature of research

The French Academy of Agriculture insists on the vital nature of research | Plant Sciences | Scoop.it


The solemn session of the French Academy of Agriculture is mainly intended to reward laureates who have enriched scientific knowledge and debate in all fields related to agriculture, food and the environment. On 23 September 2020, it awarded 10 silver medals to young doctors, 5 gold medals to renowned scientists and some 20 other prizes and various scholarships to young researchers.

This event coincides with the adoption by the National Assembly on 24 September of the draft law on multi-year research programming, and the publication of the government's recovery plan on 3 September 2020. These three actions focus attention on the importance of research for economic and social development. However, France has slowed down its research efforts for some time now and is in danger of falling behind its partners, while the Covid-19 crisis is exacerbating the need for transformation.

The agro-ecological transition requires new knowledge

Strong investment is essential in our agriculture, food and environment sectors. The agro-ecological transition requires new knowledge: to produce better by protecting the soil, to reduce inputs by using synergies between plants, to better appreciate the needs of animals, to perfect high-precision equipment. These scientific advances are also necessary to ensure food safety and to respect the environment in densely populated regions. It is therefore not a question of promoting research in a single discipline. We need advances in the human and social sciences just as much as in the exact sciences (chemistry, pedology, medicine, biology, computer science, etc.). The main societal challenges require active collaboration between disciplines, especially between the human and social sciences and the so-called "hard" sciences.

Science is constantly evolving

Agricultural research, which is already very active through cooperation between the public and private sectors, needs additional resources. The government's recovery plan has taken into account the need for financial support for the implementation of innovations in agriculture. A final obstacle to these transformations is the lack of public confidence in farmers and scientific results. This opinion, reflected in the media, demands certainty, while science is constantly evolving, with each advance calling into question what was thought to have been achieved. It is therefore normal for opinions to diverge and controversy is a major instrument in this scientific quest.

The Academy is well within its role to know and encourage the results of research, to disseminate innovations, to shed light on controversies arising from scientific doubt, in a spirit of tolerance, and to verify that innovations are real economic and social progress.

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Balade à la découverte de la biodiversité du Campus Paris-Saclay

Balade à la découverte de la biodiversité du Campus Paris-Saclay | Plant Sciences | Scoop.it

Dans le cadre des semaines européennes du développement durable, l’Etablissement public d’aménagement Paris-Saclay propose une balade à la découverte de la biodiversité du campus urbain et des mesures mises en œuvre pour la préserver, en présence d’un écologue du bureau d’études et de conseil en environnement Confluences, le samedi 10 octobre 2020 à 11h.
 

Garant de qualité de vie pour ses habitants, ressource économique avec une agriculture réputée des plus fertiles d’Île-de-France, sujet de recherches scientifiques au cœur de grands enjeux que sont la santé, l’alimentation ou le climat, l’environnement naturel est l’un des atouts majeurs de Paris-Saclay. Les grandes étendues agricoles du plateau comme les étangs, rivières et rigoles, les espaces boisés soulignant les coteaux comme les parcs et jardins des zones urbanisées constituent autant d’écosystèmes qui abritent une faune et une flore remarquables
 
Port du masque et respect des distances de sécurité obligatoires.
Chaussures confortables nécessaires. 
 

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Differential Activation of Partially Redundant Δ9 Stearoyl-ACP Desaturase Genes is Critical for Omega-9 Monounsaturated Fatty Acid Biosynthesis During Seed Development in Arabidopsis  (IJPB, SPS)

Differential Activation of Partially Redundant Δ9 Stearoyl-ACP Desaturase Genes is Critical for Omega-9 Monounsaturated Fatty Acid Biosynthesis During Seed Development in Arabidopsis  (IJPB, SPS) | Plant Sciences | Scoop.it
The spatiotemporal pattern of deposition, final amount, and relative abundance of oleic acid (cis-ω-9 C18:1) and its derivatives in the different lipid fractions of the seed denote an abundant synthesis of omega-9 monoenes in this organ. Accordingly, four Δ9 stearoyl-ACP desaturase (SAD)-coding genes (FAB2, AAD5, AAD1, and AAD6) are transcriptionally induced in seeds. The three most highly expressed ones are directly activated by the WRINKLED1 transcription factor. The thorough characterization of a collection of 30 simple, double, triple, and quadruple mutants affected in SAD-coding genes has revealed the functions of these desaturases all along seed development. First, production of oleic acid by FAB2 and AAD5 appears to be critical at the onset of embryo morphogenesis. Double homozygous plants from crossing fab2 and aad5 could never be obtained, and further investigations revealed that the double mutation results in the arrest of embryo development before the globular stage. During later stages, these two SADs, together with AAD1, participate in the elaboration of the embryonic cuticle, a barrier essential for embryo-endosperm separation during the phase of invasive embryo growth through the endosperm. This study finally demonstrates that the four desaturases redundantly contribute to storage lipid production during the maturation phase.
No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Functions and control of the versatile protein Serrate in Arabidopsis - Xiuren Zhang, SPS online seminars, to view the video

Functions and control of the versatile protein Serrate in Arabidopsis - Xiuren Zhang, SPS online seminars, to view the video | Plant Sciences | Scoop.it

Functions and control of the versatile protein Serrate in Arabidopsis - Xiuren Zhang

Xiuren Zhang
(Department of Biochemistry and Biophysics, Texas A&M University, USA)

miRNAs are a group of small noncoding RNAs that are widely present in eukaryotes. miRNAs are loaded into AGO proteins to form RNA-induced silencing complexes (RISCs) to repress gene expression through target cleavage and/or translational repression. In metazoan miRNAs target more than 50% transcripts. Similarly in plants, they regulate essentially every aspect of growth and development as well as biotic and abiotic stress responses. Therefore, precise control of miRNA production and fine-tuning of homeostasis of miRNA accumulation warrants the functional accuracy and targeting efficacy of miRNAs. miRNAs originate from primary transcripts (pri-miRNAs), which feature stem-loop structures. The pri-miRNAs are sequentially cleaved by Microprocessor that minimally consists of Dicer-like 1 (DCL1), a double-stranded (ds)RNA-binding protein, Hyponastic leaves 1(HYL1), and Serrate (SE) to eventually produce miRNA. In the past years, our lab has extensively studied functions and mechanisms of SE protein in miRNA biogenesis. To our surprise, we have discovered that SE is a scaffold protein that functions at the interface between microprocessor and epigenetic machinery that includes SWI2/SNF2 chromatin remodel factors and histone methyltransferases. Moreover, the accumulation of SE protein itself is also tightly controlled through 20S proteasome to survey proper RNA metabolism. In my seminar, we will learn about SE-centered regulatory network in multiple molecular processes.

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Covid-19 et agriculture : Une opportunité pour la transition agricole et alimentaire ? | Académie d'Agriculture de France

Covid-19 et agriculture : Une opportunité pour la transition agricole et alimentaire ? | Académie d'Agriculture de France | Plant Sciences | Scoop.it

L'Académie d'agriculture de France, s'est posé la question et s'est efforcé d'y répondre dans le nouvel ouvrage collectif, qu'elle publie aux Presses des Mines, en cette rentrée 2020,.

Pour ce faire, quelque soixante membres de l'Académie d'agriculture de France ont mené "leurs propres réflexions", au sein de chacune des 10 sections de la Compagnie. 

Ils ont confronté et fait progresser leurs idées au sein d'un forum numérique animé par Michel Dron, secrétaire de la section "Productions végétales" et Philippe Kim-Bonbled, directeur du développement et de la communication de l’Académie.

Puis, ils ont entamé la rédaction de l'ouvrage, en un temps record, qui comporte les trois parties suivantes  : 

  1. La pandémie et ses réalités agricoles, 
  2. Les vulnérabilités agricoles mises en évidence par la pandémie, 
  3. L’après-pandémie agricole. 

Pour illustrer les chapitres écrits par leurs consoeurs et confrères, des membres engagés au quotidien dans différents secteurs d’activités font, par ailleurs, part de "la manière dont ils ont vécu la pandémie, comment ils ont dû s’y adapter et quelles leçons ils en tirent pour l’avenir"

Pour commander l'ouvrage, télécharger le fichier PDF, ci-dessous :

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

ABSCISIC ACID-DEFICIENT4 has an essential function in both cis-violaxanthin and cis-neoxanthin synthesis (IJPB, SPS)

ABSCISIC ACID-DEFICIENT4 has an essential function in both cis-violaxanthin and cis-neoxanthin synthesis (IJPB, SPS) | Plant Sciences | Scoop.it

Abscisic acid (ABA), a plant hormone synthesized from carotenoids, functions in seed germination and abiotic stress responses. ABA is derived from the cleavage of 9-cis isomers of violaxanthin and neoxanthin, which are oxygenated carotenoids, also called xanthophylls. Although genes encoding enzymes responsible for most steps of the ABA biosynthesis pathway have been identified, the enzymatic reactions leading to the production of these cis-isomers from trans-violaxanthin remain poorly understood. Two mutants that lack trans and cis-neoxanthin were previously identified: tomato (Solanum lycopersicum) neoxanthin-deficient1 (nxd1) and Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) ABA-deficient4 (aba4); only aba4 exhibited ABA-deficient phenotypes. No enzymatic activity was detected for ABA4 and NXD1 proteins, and their exact function remained unknown. To further investigate ABA4 and NXD1 function in Arabidopsis, we compared phenotypes of single and double mutants, and analyzed the effect of ABA4 overexpression on ABA and carotenoid accumulation in wild type and mutant backgrounds. We provide convergent evidence that ABA4 is not only required for the formation of trans and 9'-cis-neoxanthin from trans-violaxanthin, but also controls 9-cis-violaxanthin accumulation. While nxd1 produces high amounts of 9-cis-violaxanthin and ABA, aba4 nxd1 exhibits reduced levels in both leaves and seeds. Furthermore, ABA4 constitutive expression in nxd1 increases both 9-cis-violaxanthin and ABA accumulation. Subcellular localization of NXD1 protein in transient expression assays suggests that production of the NXD1-derived factor required for neoxanthin synthesis takes place in the cytosol. Finally, we postulate that ABA4, with additional unknown cofactor(s), is required for, or contributes to trans to cis violaxanthin isomerase activity, producing both cis-xanthophyll precursors of ABA.

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Dynamic control of the high-affinity iron uptake complex in root epidermal cells (I2BC/LRSV, SPS/TULIP)

Dynamic control of the high-affinity iron uptake complex in root epidermal cells (I2BC/LRSV, SPS/TULIP) | Plant Sciences | Scoop.it

In plants, iron uptake from the soil is tightly regulated to ensure optimal growth and development. Iron absorption in Arabidopsis root epidermal cells requires the IRT1 transporter that also allows the entry of certain non-iron metals, such as Zn, Mn, and Co. Recent work demonstrated that IRT1 endocytosis and degradation are controlled by IRT1 non-iron metal substrates in an ubiquitin-dependent manner. To better understand how metal uptake is regulated, we identified IRT1-interacting proteins in Arabidopsis roots by mass spectrometry and established an interactome of IRT1. Interestingly, the AHA2 proton pump and the FRO2 reductase, both of which work in concert with IRT1 in the acidification-reduction-transport strategy of iron uptake, were part of this interactome. We confirmed that IRT1, FRO2, and AHA2 associate through co-immunopurification and split-ubiquitin analyses, and uncovered that they form tripartite direct interactions. We characterized the dynamics of the iron uptake complex and showed that FRO2 and AHA2 ubiquitination is independent of the non-iron metal substrates transported by IRT1. In addition, FRO2 and AHA2 are not largely endocytosed in response to non-iron metal excess, unlike IRT1. Indeed, we provide evidence that the phosphorylation of IRT1 in response to high levels of non-iron metals likely triggers dissociation of the complex. Overall, we propose that a dedicated iron-acquisition protein complex exists at the cell surface of Arabidopsis root epidermal cells to optimize iron uptake.

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

The lncRNA MARS modulates the epigenetic reprogramming of the marneral cluster in response to ABA (IPS2, SPS)

The lncRNA MARS modulates the epigenetic reprogramming of the marneral cluster in response to ABA (IPS2, SPS) | Plant Sciences | Scoop.it
Clustered organization of biosynthetic non-homologous genes is emerging as a characteristic feature of plant genomes. The co-regulation of clustered genes seems to largely depend on epigenetic reprogramming and three-dimensional chromatin conformation. Here we identified the long noncoding RNA (lncRNA) MARneral Silencing (MARS), localized inside the Arabidopsis marneral cluster, and which controls the local epigenetic activation of its surrounding region in response to ABA. MARS modulates the POLYCOMB REPRESSIVE COMPLEX 1 (PRC1) component LIKE-HETEROCHROMATIN PROTEIN 1 (LHP1) binding throughout the cluster in a dose-dependent manner, determining H3K27me3 deposition and chromatin condensation. In response to ABA, MARS decoys LHP1 away from the cluster and promotes the formation of a chromatin loop bringing together the MARNERAL SYNTHASE 1 (MRN1) locus and a distal ABA-responsive enhancer. The enrichment of co-regulated lncRNAs in clustered metabolic genes in Arabidopsis suggests that the acquisition of novel noncoding transcriptional units may constitute an additional regulatory layer driving the evolution of biosynthetic pathways.
No comment yet.
Rescooped by Saclay Plant Sciences from Life Sciences Université Paris-Saclay
Scoop.it!

Classement de Shanghai 2020, l’Université Paris-Saclay entre à la 14ème place mondiale

Classement de Shanghai 2020, l’Université Paris-Saclay entre à la 14ème place mondiale | Plant Sciences | Scoop.it

Chaque année, le 15 août, l’Université Jiao Tong de Shanghai publie son classement des 1000 premières universités au monde. Pour son entrée dans ce classement, l’Université Paris-Saclay rejoint le TOP 20 des établissements reconnus à l’international

.

L’édition 2020 du classement de Shanghai a été mise en ligne ce jour, désignant les meilleurs établissements du monde entier en matière de recherche, toutes disciplines confondues. L’Université Paris-Saclay, créée en janvier 2020, est donc pour la première fois prise en compte dans l’ARWU (Academic Ranking of World Universities) et devient ainsi le 1er établissement français de ce classement.

 

« Notre première place mondiale en mathématiques ainsi que nos très belles performances avec 10 autres domaines dans le TOP 50 lors du classement thématique de juillet, laissaient présager cette nouvelle reconnaissance internationale. Je suis particulièrement heureuse car l’entrée, dès cette année, à cette 14ème place mondiale rend hommage à celles et ceux qui, depuis des années, croient en ce nouveau modèle d’université que nous venons de créer pour que s'exprime à sa juste valeur le potentiel de l'ESR français », précise Sylvie Retailleau, Présidente de l’Université Paris-Saclay. « Je pense évidemment à nos composantes universitaires, grandes écoles et Organismes Nationaux de Recherche partenaires qui sont au coeur de cette reconnaissance scientifique avec l’ensemble des laboratoires et des formations. Je n’oublie pas nos 2 universités membres-associées qui, dans la trajectoire de fusion, seront prochainement incluses dans le périmètre du classement de l’Université Paris-Saclay. Je veux également remercier le Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation pour son engagement afin de faire reconnaitre ces nouveaux modèles d’université à l’international. Tous ceux qui, de près ou de loin, ont accompagné la construction de l’Université Paris-Saclay, responsables politiques, collègues académiques-administratifs et techniques, étudiants, partenaires industriels et associatifs … peuvent se réjouir de cette reconnaissance, un atout non seulement pour notre Université et ses étudiants, mais aussi pour nos partenaires et globalement pour la formation et la recherche françaises. Le rayonnement de la qualité académique nationale est un impératif pour pouvoir coopérer efficacement au niveau international. »

 

Créé en 2003, le classement de Shanghai distingue les principaux établissements d'enseignement supérieur parmi plus de 17 000 universités répertoriées dans le monde. Il prend en compte six critères, dont le nombre de prix Nobel et de médailles Fields, les chercheurs les plus cités (Highly Cited Researchers) ou encore le nombre de publications dans les revues scientifiques Nature et Science. L’Université Paris-Saclay recense 2 prix Nobel et 10 médailles Fields de la Faculté des Sciences d’Orsay et de l’IHES ainsi que 35 chercheurs parmi les plus cités dans leur discipline, affiliés à la Faculté des Sciences d'Orsay, la Faculté de Médecine de Kremlin Bicêtre, l’Institut Gustave Roussy, la Faculté de Pharmacie de Chatenay Malabry, CentraleSupélec, au CEA, au CNRS et à l’INRAE.


Via Life Sciences UPSaclay
No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Current status of the multinational Arabidopsis community 

Current status of the multinational Arabidopsis community  | Plant Sciences | Scoop.it

The multinational Arabidopsis research community is highly collaborative and over the past thirty years these activities have been documented by the Multinational Arabidopsis Steering Committee (MASC). Here, we (a) highlight recent research advances made with the reference plant Arabidopsis thaliana ; (b) provide summaries from recent reports submitted by MASC subcommittees, projects and resources associated with MASC and from MASC country representatives; and (c) initiate a call for ideas and foci for the “fourth decadal roadmap,” which will advise and coordinate the global activities of the Arabidopsis research community.

No comment yet.
Scooped by Saclay Plant Sciences
Scoop.it!

Involvement of Arabidopsis BIG protein in cell death mediated by Myo -inositol homeostasis (IPS2, IJPB, SPS)

Involvement of Arabidopsis BIG protein in cell death mediated by Myo -inositol homeostasis (IPS2, IJPB, SPS) | Plant Sciences | Scoop.it

Programmed cell death (PCD) is essential for several aspects of plant life. We previously identified the mips1 mutant of Arabidopsis thaliana, which is deficient for the enzyme catalysing myo-inositol synthesis, and that displays light-dependent formation of lesions on leaves due to Salicylic Acid (SA) over-accumulation. Rationale of this work was to identify novel regulators of plant PCD using a genetic approach. A screen for secondary mutations that abolish the mips1 PCD phenotype identified a mutation in the BIG gene, encoding a factor of unknown molecular function that was previously shown to play pleiotropic roles in plant development and defence. Physiological analyses showed that BIG is required for lesion formation in mips1 via SA-dependant signalling. big mutations partly rescued transcriptomic and metabolomics perturbations as stress-related phytohormones homeostasis. In addition, since loss of function of the ceramide synthase LOH2 was not able to abolish cell death induction in mips1, we show that PCD induction is not fully dependent of sphingolipid accumulation as previously suggested. Our results provide further insights into the role of the BIG protein in the control of MIPS1-dependent cell death and also into the impact of sphingolipid homeostasis in this pathway.

No comment yet.