La pharmacogénétique aide à la prescription personnalisée des traitements. Dans le contexte de la résistance aux médicaments antidépresseurs, concernant 20% des patients présentant un épisode dépressif caractérisé, des biomarqueurs sont recherchés pour mieux optimiser leur prise en charge. Le rôle des polymorphismes des cytochromes P450 (e.g., CYP2D6 et CYP2C19) est déjà bien connu, mais d’autres cibles pharmacologiques sont en cours d’exploration pour mieux expliquer la variabilité inter-individuelle de la réponse aux antidépresseurs. L’équipe MOODS (CESP UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Faculté de Médecine Paris Saclay) travaille depuis plusieurs années sur ce sujet.

Dans l’étude publiée dans Molecular Psychiatry, l’équipe a recherché l’association du polymorphisme rs1954787(T>C) de GRIK4 avec la réponse aux antidépresseurs chez des patients déprimés. Ce gène code pour un récepteur de glutamate, le neurotransmetteur excitateur du cerveau, dont la modulation peut conduire aux changements d’humeur. Une méta-analyse de l’ensemble des données publiées a été également réalisée.

Ce travail porte sur 390 patients traités par un antidépresseur et évalués à l’inclusion et après 1 (M1), 3 (M3) et 6 mois (M6) de traitement de la cohorte METADAP, une cohorte multicentrique, prospective et naturaliste de l’hôpital Bicêtre (PI : Pr Emmanuelle Corruble).

Après ajustement avec d’autres variables, les patients du génotype TT [n=98 (25%)] avaient une note d’évaluation de la dépression sur l’échelle Hamilton (HDRS) plus élevée (P=0.00022), mais aussi des taux de réponse (P=0.028) et de rémission (P=0.011) plus bas par rapport aux porteurs de l’allèle C [n=292 (75%)] avec des différences plus prononcées au cours du suivi. Dans la méta-analyse, l’association de l’allèle C à une meilleure réponse était significative (OR=1.31, P=0.014).

L’équipe montre une association entre rs1954787(T>C) de GRIK4 et la réponse aux antidépresseurs qui se renforce en cours du traitement. Ces résultats doivent être confirmés, mais ils sont en faveur d’un rôle de GRIK4 dans le mécanisme d’action des antidépresseurs et permettraient d’envisager une prescription plus personnalisée des médicaments antidépresseurs dans la dépression.

Légende Figure : Le score HDRS ou les taux de réponse et de rémission (axe Y) au cours du temps (axe X) selon le génotype du polymorphisme génétique rs1954787.

-> Contact : kenneth.chappell@universite-paris-saclay.fr

Les néoplasmes myéloprolifératifs (NMP) BCR::ABL-négatifs sont des cancers chroniques de la moelle osseuse, causés par des mutations génétiques acquises (JAK2V617F, CALR, MPL) qui affectent les cellules souches responsables de la production des cellules sanguines. Ces mutations entraînent une surproduction de cellules sanguines, augmentant le risque de thromboses et d’hémorragies à court terme, et de transformation en leucémie aiguë à long terme.

Dans une revue publiée dans Haematologica, l’équipe d’Isabelle Plo (INSERM U1287, Gustave Roussy, Université Paris Saclay) présente les bases du diagnostic des NMP, de leur complications et de la prise en charge des patients incluant l’usage de l’aspirine à faible dose et des thérapies cytoréductrices. La revue explique également comment ces maladies se développent et évoluent de manière naturelle. Un point essentiel est la découverte récente de l’apparition précoce des mutations responsables des NMP (souvent des décennies avant les premiers symptômes), ce qui ouvre la voie à un diagnostic précoce et à une meilleure prise en charge. Enfin, la revue se focalise sur un traitement prometteur, l’interféron alpha (IFNα), qui pourrait modifier l’évolution naturelle de la maladie en limitant la prolifération des cellules mutées, permettant ainsi une gestion ciblée et durable des NMP avec de possibles guérisons.

À l’avenir, une détection précoce des NMP pourrait permettre une intervention rapide et ciblée grâce à des molécules telles que l’IFNα, les inhibiteurs de JAK2V617F ou des anticorps dirigés contre la CALR mutée.

Légende Figure : Histoire naturelle des NMP. Une détection précoce de ces maladies pourrait être envisagée afin de dépister les sujets à risque de développer ces maladies et éviter complications vasculaires précoces. Le risque de transformation pourrait être prévenu en ciblant les clones mutés à l'aide de thérapies ciblées. Cette stratégie pourrait constituer une percée dans la prévention du développement, de la progression et des complications des NMP.

-> Contact : isabelle.plo@gustaveroussy.fr

Deux études récemment publiées ont confirmé le rôle essentiel, bien que complexe, du facteur de transcription FOXO1 dans l'amélioration de l'efficacité antitumorale des cellules CAR-T (Doan et al., 2024 ; Chan et al., 2024). De manière surprenante, ces deux travaux montrent que la surexpression de FOXO1 dans des cellules CAR-T activées augmente leur efficacité, alors que des recherches antérieures ont pu établir que l'inhibition de FOXO1 dans des cellules T quiescentes permet de produire des cellules CAR-T non activées présentant une activité antitumorale supérieure à celle des cellules CAR-T activées ex vivo (Marchais et al., 2023).

Dans une nouvelle étude publiée dans Cancer Communications, Maude Marchais et Marianne Mangeney de l’UMR 9196 (CNRS/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif) proposent un modèle qui réconcilie ces résultats apparemment contradictoires en tenant compte du statut d’activation initial des cellules T. Inhiber FOXO1 dans des cellules T quiescentes dans lesquelles FOXO1 est physiologiquement actif ou surexprimer FOXO1 dans des cellules T activées, où FOXO1 est physiologiquement inactif, conduirait à un même niveau d’activation intermédiaire corrélant avec un forte activité antitumorale des cellules CAR-T. L’hypothèse est appuyée par les données expérimentales qui montrent en effet que les deux stratégies potentialisent les fonctions antitumorales des cellules.

Une identification fine du niveau d’activité de FOXO1 induisant une activité antitumorale optimum des cellules CAR-T pourrait ainsi aboutir à des améliorations de cette immunothérapie innovante.

-> Contact : maude.marchais@gustaveroussy.fr

Tau est une protéine impliquée dans la régulation des microtubules au niveau des axones des neurones. En conditions pathologiques, Tau forme des enchevêtrements fibrillaires qui sont des marqueurs moléculaires de la maladie d’Alzheimer et d’un ensemble de maladies neurodégénératives apparentées appelées tauopathies. Des structures de Tau au sein des agrégats fibrillaires ou décorant le microtubule sont maintenant connues (voir par exemple ici). Pour ce qui est de l’interaction avec la tubuline soluble, elle a été décrite comme étant dynamique et hétérogène, mais des données à haute résolution faisaient défaut.

Dans ce cadre, des chercheurs de l’équipe MiKiCa de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), en collaboration avec G. Lippens (TBI, Toulouse), ont déterminé par cristallographie aux rayons X la structure d’un fragment de Tau en complexe avec la tubuline. Ce fragment, qui comprend notamment un motif appelé PHF6 impliqué dans l’agrégation de Tau, se fixe à un site qui n’avait jusqu’ici pas été décrit. Quand on le transpose sur le microtubule, ce site correspond à un pore entre protofilaments. Il diffère donc de la fixation à l’extérieur du microtubule, le long des protofilaments, qui a été décrite à partir de données de cryo-EM de microtubules décorés par Tau.

Ces résultats soulèvent de nouvelles hypothèses sur la fonction de Tau en tant que facteur stabilisant les microtubules et sur son oligomérisation, qu’elle soit physiologique ou pathologique. Ils réconcilient des données apparemment contradictoires de la littérature, en particulier concernant la coexistence de plusieurs modes de fixation de Tau aux microtubules.

Ce travail, réalisé dans le cadre de la thèse de Liza Ammar Khodja qui a bénéficié d’une bourse de l’ED569 (Innovation thérapeutique, du fondamental à l'appliqué), vient de paraître dans PNAS Nexus.

Légende Figure : Identification d’un nouveau mode de fixation de Tau à la tubuline. (Gauche) Structure d’un assemblage Tau:tubuline. Deux autres partenaires de la tubuline (SLD1 et DARPin) complètent le complexe protéique. Le fragment de Tau est en magenta. (Droite) Quand il est transposé sur le microtubule, ce site pour la fixation de Tau correspond à une ouverture entre protofilaments. Il diffère de celui caractérisé par cryo-EM à partir de microtubules décorés par Tau (en bleu).

-> Contact : benoit.gigant@i2bc.paris-saclay.fr

Les premières données du projet QSM4SENIOR, porté par des équipes de NeuroSpin (UMR BAOBAB et UNIACT, CEA/CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) et de la société VENTIO, ont été publiées dans Frontiers in Neuroimaging. Grâce notamment à la quantification de la susceptibilité magnétique (QSM), cette première étude permet de dresser une cartographie très précise de l’évolution de la charge en fer au cours du vieillissement cérébral normal, données précieuses pour les scientifiques spécialistes des maladies neurodégénératives.

Lire la suite de l’Actu CEA-Joliot

-> Contact : alexandre.vignaud@cea.fr

Depuis 2014, Clarivate Analytics, qui gère le Web of Science (une base de références de publications scientifiques), présente une liste de scientifiques sélectionnés pour la notoriété régulière de leurs publications de recherche au cours de la dernière décennie. Les articles de ces Highly cited researchers (scientifiques les plus cités au monde) figurent ainsi parmi les plus cités dans leur discipline, dans Web of Science. En 2024, l’Université Paris-Saclay compte 24 scientifiques identifiés, dont 19 dans le domaine des Sciences de la Vie.

• Laurence Albiges: oncologue médicale et professeure à l’Université Paris-Saclay, elle est également cheffe du département de médecine oncologique de Gustave Roussy.  Elle est membre de l’équipe Impact du microenvironnement tumoral sur la résistance tumorale et son rôle dans la plasticité tumorale et la réactivité stromale de l’unité Immunologie intégrative des tumeurs et immunothérapie des cancers (INTIM - Univ. Paris-Saclay, Institut Gustave-Roussy, Inserm, EPHE).
• Fabrice André : oncologue au sein du comité de pathologie mammaire à Gustave Roussy, il est également directeur de l’unité Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie (PMNCO – Univ. Paris-Saclay, Institut Gustave Roussy, Inserm) et responsable de l’équipe Caractérisation moléculaire des cancers gynécologiques et mammaires.
• Fabrice Barlesi : professeur de médecine à l’Université Paris-Saclay et directeur général de Gustave Roussy, il est spécialisé en cancer du poumon, en médecine de précision et en immunologie des cancers. 
• Benjamin Besse : professeur d’oncologie médicale à l’Université Paris-Saclay et directeur de la recherche clinique de Gustave Roussy, il est spécialiste de la prise en charge des cancers thoraciques. Il est membre de l’équipe Adaptation génétique aux inhibiteurs de kinases au sein de l’unité Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie (PMNCO – Univ. Paris-Saclay, Institut Gustave Roussy, Inserm).
• Claire Chenu : professeure en sciences du sol à AgroParisTech, elle est également directrice de recherche au sein du Laboratoire écologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (Ecosys – Univ. Paris-Saclay, AgroParisTech, INRAE). Claire Chenu fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Sciences de l’agriculture ».
• Franck Courchamp : écologue et directeur de recherche CNRS au laboratoire Écologie, systématique et évolution (ESE – Univ. Paris-Saclay, CNRS, AgroParisTech), Franck Courchamp est spécialiste de la dynamique des populations animales et de la biologie de la conservation. Il étudie notamment l’impact du changement climatique sur la biodiversité. Il fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Environnement et écologie ».
• Stanislas Dehaene : Neuroscientifique spécialisé en psychologie cognitive, professeur au Collège de France, directeur de recherche au sein de l'Unité de recherche en Neuroimagerie Cognitive - UNICOG (Univ. Paris-Saclay/CEA), dont il est également responsable, Stanislas Dehaene fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Interdisciplinaire ».
• Charles-Antoine Dutertre : Chercheur au sein de l’unité Immunologie des tumeurs et immunothérapie contre le cancer (ITIC – Univ. Paris-Saclay/Inserm/Gustave Roussy), Charles-Antoine Dutertre fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Interdisciplinaire ».
• Stanislav Dusko Ehrlich : il a contribué à créer le centre MetaGenoPolis (MGP – Univ. Paris-Saclay, INRAE) en 2012 et est l’ancien responsable scientifique et technique de ce projet. Stanislav Dusko Ehrlich fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Interdisciplinaire ».
• Karim Fizazi : oncologue médical spécialiste de la prise en charge du cancer de la prostate et professeur de cancérologie à l’Université Paris-Saclay, il a été chef du département de médecine oncologique de l’Institut Gustave Roussy et dirige actuellement le comité génito-urinaire de l'Institut. Il est également membre de l’équipe Résistance adaptative aux thérapies anti-cancéreuses au sein de l’unité Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie (PMNCO – Univ. Paris-Saclay, Institut Gustave Roussy, Inserm). Karim Fizazi fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Médecine clinique »
• Florent Ginhoux : directeur de laboratoire à l’Institut Gustave-Roussy, professeur adjoint invité ou associé dans de prestigieuses universités (Mount Sinai School of Medicine (MSSM) à New York, Institut d’immunologie de Shanghai, Institut d’immunologie translationnelle et Duke NUS à Singapour), et professeur associé à Gustave Roussy au sein de l’unité Immunologie des tumeurs et immunothérapie contre le cancer (ITIC – Univ. Paris-Saclay/Inserm/Gustave Roussy), Florent Ginhoux fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Immunologie ».
• Marc Humbert : professeur de pneumologie à l’Université Paris-Saclay, il est chef du service de pneumologie et soins intensifs respiratoires de l’hôpital Bicêtre, où il est responsable du centre de référence de l’hypertension pulmonaire. Il dirige le laboratoire Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique (HPPIT – Univ. Paris-Saclay, Inserm) et depuis 2023, il est le doyen de la Faculté de médecine de l’Université Paris-Saclay. Marc Humbert fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Médecine clinique ».
• Aurélien Marabelle : oncologue médical et professeur à l’Université Paris-Saclay, il est responsable du Laboratoire de recherche translationnelle en Immunothérapie (LRTI) au sein de l’unité Immunologie des tumeurs et immunothérapie contre le cancer (ITIC - Univ. Paris-Saclay, Inserm, Gustave Roussy). Il fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Médecine clinique ».
• Xavier Mariette : Chef du service d’immuno-rhumatologie à l’hôpital Bicêtre, professeur de rhumatologie à l’Université Paris-Saclay et directeur de l’équipe Autoimmunité au sein du laboratoire Immunologie des maladies virales, auto-immunes, hématologiques et bactériennes (IMVA-HB – Univ. Paris-Saclay, Inserm, CEA). Xavier Mariette fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Médecine clinique ».
• David Planchard : oncologue thoracique et professeur associé à l’Université Paris-Saclay, il est chef du comité de pathologie thoracique de Gustave Roussy, où il est responsable de la coordination de la prise en charge des patientes et patients porteurs d'un cancer du poumon, de mésothéliome pleural ou de tumeurs thymiques. Il est membre de l’équipe Adaptation génétique aux inhibiteurs de kinases au sein de l’unité Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie (PMNCO – Univ. Paris-Saclay, Inserm, Institut Gustave Roussy). Il est également président du Centre international des cancers thoraciques (CICT). David Planchard fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Médecine clinique ».
• Caroline Robert : Cheffe du service de dermatologie à Gustave Roussy, professeure à l’Université Paris-Saclay et responsable de l’enseignement de la dermatologie au sein de la Faculté de médecine de l’Université Paris-Saclay, Caroline Robert dirige également l’équipe Résistance adaptative aux thérapies anti-cancéreuses au sein de l’unité Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie (PMNCO – Univ. Paris-Saclay, Inserm, Institut Gustave Roussy). Elle fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Médecine clinique ».
• Gérald Simonneau : professeur émérite à l'Université Paris-Saclay, pneumologue au sein du laboratoire Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique (HPPIT – Univ. Paris-Saclay, Inserm), il est spécialiste de l’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) et a participé à la découverte des principaux médicaments ayant transformé le pronostic de cette maladie rare. Il fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Médecine clinique ».
• Jean-Charles Soria : oncologue médical de renommée internationale, spécialiste de la médecine de précision, de l’immunothérapie et du cancer du poumon, et professeur de médecine et d’oncologie médicale à l’Université Paris-Saclay, Jean-Charles Soria a été directeur général de Gustave Roussy, premier centre de lutte contre le cancer en Europe, de janvier 2020 à fin juillet 2021. Il fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Médecine clinique ».
• Laurence Zitvogel : oncologue médicale à Gustave Roussy et professeure d’immunologie à l’Université Paris-Saclay, elle est directrice de l’unité Immunologie des tumeurs et immunothérapie contre le cancer (ITIC - Univ. Paris-Saclay, Inserm, Gustave Roussy). Elle fait partie des scientifiques les plus cités au monde dans la catégorie « Immunologie ».

Mardi 26 novembre 2024, l’Académie des sciences a célébré l’excellence scientifique lors d’une deuxième séance de remise des prix, organisée au palais de l’Institut de France.

Directeur de recherche INRAE au sein de l’équipe Génétique et génomique bovine du laboratoire de Génétique Animale et Biologie Intégrative – GABI (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), Didier Boichard est lauréat du prix Dujarric de la Rivière pour l’ensemble de ses travaux sur la génétique bovine, portant plus particulièrement sur l’analyse du génome, le déterminisme génétique des caractères et la gestion des populations.

Le prix Dujarric de la Rivière est un prix biennal créé en 1970 de biologie appliquée à l’économie rurale ou à l’art vétérinaire.

Suivre pas à pas l'état de santé et les modes de vie de familles françaises volontaires, sur plusieurs générations, pour mieux comprendre ce qui expose à certaines maladies, ou en protège: lancé il y a plus de 30 ans, un vaste projet de recherche français continue de grandir.

Tout commence en 1990, quand 100.000 femmes, nées entre 1925 et 1950 et adhérentes à la mutuelle de l'Education nationale (MGEN), acceptent de participer à une étude sur leur santé, à l'initiative d'une chercheuse de l'Inserm, Françoise Clavel-Chapelon.

"L'objectif original était d'étudier les liens entre les facteurs reproductifs et hormonaux, le mode de vie, en particulier l'alimentation, et la survenue de maladies, notamment le cancer", a retracé Gianluca Severi (Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations – CESP, UMR-S 1018 Inserm/UVSQ/UPSaclay, Villejuif), coordinateur actuel de la cohorte E3N-Générations, lors d'une récente journée scientifique.

Là où les cohortes de malades sont centrées sur une pathologie, les cohortes prospectives en population apportent des informations de santé en général.

Cancers, maladies cardio-vasculaires, diabète, obésité, maladie de Parkinson, asthme, maladies inflammatoires chroniques de l'intestin, dépression ou endométriose, cette cohorte -coordonnée par l'Inserm, l'université Paris-Saclay et l'institut Gustave-Roussy- explore de nombreuses pathologies chroniques.

Lire la suite de l’article dans la Dépêche

We are delighted to invite you to the upcoming Paris-Saclay Life Science Talks on Next Generation Antibodies. 

We will explore how biotech is revolutionizing innovation across both industrial and academic sectors. This event will feature the experts Emilia McLaughlin, CEO of Kyrion.Bio, and Claus Haase, Senior Vice President, Symphogen A/S - A Servier Company. They will share valuable insights into how industrial companies are advancing antibody research and development. 

Event Details:

• Date:December 2, 2024
• Time:12:00 PM - 2:00 PM
• Location:Lumen – 8 Av. des Sciences, 91190 Gif-sur-Yvette

Key Speakers:

• Emilia McLaughlin – CEO of Kyron.Bio: Startup innovating antibodies for cancer and autoimmune diseases.
• Claus Haase – Senior Vice President at Symphogen A/S (Servier partner): Driving next-generation antibody innovation for human health.
• Bernard Maillère – Research Director in Immunology at Université Paris-Saclay: Insights into antibody innovation through academic excellence and the ACCREDIA project (ANR funded).

Moderated by Estefania Tumbaco, PhD student at Servier, supervised by Marc Pallardy. The panel will focus on cutting-edge antibody development solutions.

Networking Opportunity with Industry Leaders:

This is the perfect opportunity to meet top experts and members of La BioTeam, including our incubator Spartners, Genopole, IncubAlliance, Kadans, and the Paris-Saclay Development Authority.

Agenda:

12:00 PM - 12:45 PM

• Opening Speech: Stéphanie TEA, Investment Project Manager – Paris-Saclay Development Authority.
• Panel Discussion (Moderated by Estefania Tumbaco):
• Emilia McLaughlin (Kyron.Bio)
• Claus Haase (Symphogen A/S – Servier)
• Bernard Maillère (Université Paris-Saclay)

12:45 PM - 2:00 PM

• Networking Session: A chance to connect with leaders in the biotech industry and the Paris-Saclay cluster.

This event is powered by La BioTeam Paris-Saclay—a unique alliance of Genopole, Spartners by Servier & BioLabs, IncubAlliance, Kadans, and Paris-Saclay Land Planning Authority—this event brings together key incubators and biotech leaders dedicated to accelerating innovation. La BioTeam Paris-Saclay provides comprehensive support to biotech startups, offering access to state-of-the-art incubation facilities, funding, and industry connections.

Save your spot now!: [Eventbrite link]

Le Réseau Thématique de Recherche PLASTnet du CEA a le plaisir de vous inviter à participer à son colloque annuel qui se tiendra le 18 décembre 2024 au Totem, à Paris.

Intitulé PLASTIQUES ET ECOSYSTEMES : DE L'IMPACT A L'INNOVATION POUR UNE GESTION DURABLE, ce colloque vise à rassembler la communauté plastique française autour des quatre thématiques scientifiques du réseau, qui sont i) l’écoconception et le recyclage, ii) la transformation des plastiques et leur dégradation, iii) la toxicité et l’écotoxicité des plastiques, et iv) les méthodes de caractérisation des plastiques.

Venez nombreux nous rejoindre autour des conférenciers invités et des chercheurs, doctorants et post-doctorants impliqués dans le réseau. 

Voir programme ci-dessus.

Inscription gratuite mais obligatoire

Une imprimante dans une cuisine ? Cela peut paraître à première vue un peu incongru. Incongru et pourtant possible aujourd’hui : c’est tout le sujet de ce troisième podcast de la série Parlons Sciences ! En compagnie de David Blumenthal et de Valérie Guénard-Lampron, tous deux enseignants chercheurs à AgroParisTech et membres de l’équipe de recherche IHAC (Interaction homme-aliment conception au sein de l’UMR SayFood, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau) partons à la découverte de leur dernier projet de recherche consacré à l’élaboration d’aliments personnalisés grâce à l’imprimante 3D. 

Lire la suite de l’Actu AgroParisTech

Un centre d’innovation unique en Europe a ouvert à Orsay (Essonne) avec des équipements de pointe. Douze projets ont déjà été lancés pour élaborer de futurs produits alimentaires meilleurs pour la santé, moins coûteux et moins nocifs pour l’environnement, grâce aux ferments, des micro-organismes aux nombreuses propriétés.

Yaourt, pain, vin, bière, kéfir, saucisson, choucroute, mais aussi café, chocolat, olives… Vous ne le savez peut-être pas, mais les ferments s’invitent dans vos assiettes depuis fort longtemps. Procédé ancestral de conservation des aliments, la fermentation pourrait occuper une place de choix dans l’alimentation de demain. Sur le plateau de Saclay, en Essonne, une équipe de chercheurs est mobilisée sur le sujet au sein du centre d’innovation Ferments du futur qui vient d’être inauguré.

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Dans une revue publiée dans Journal of Investigative Dermatology, Gabriela Cuesta-Margolles et ses codirectrices de thèse Géraldine Schlecht-Louf et Françoise Bachelerie de l’unité Inflammation, Microbiome and Immunosurveillance – MI2 (UMR-S 996 Inserm/UPSaclay, Orsay) font la synthèse des données récentes qui identifient l'importance du contrôle exercé par l'axe de signalisation formé par la chimiokine CXCL12 et son récepteur couplé aux protéines G, CXCR4, dans les processus homéostatiques de la peau.

Elles examinent notamment son rôle dans la cicatrisation des plaies résolutives et son importance dans le choix entre les réponses fibrotiques cicatricielles ou régénératives qui sont actionnées différentiellement en fonction de l'âge. Elles décrivent leur importance dans le contrôle des infections et les interactions de l’hôte avec son virome cutané. Enfin, elles discutent aussi de la régulation de la distribution spatiale de CXCL12 qui prend place au sein et entre les différents compartiments cutanés, notamment en lien avec le contrôle des processus inflammatoires.

Dans ce contexte, les chercheuses proposent qu'ACKR3, le récepteur atypique de CXCL12, pourrait jouer un rôle important à travers ses fonctions de "scavenger" qui lui confèrent, après sa liaison de haute affinité à CXCL12, la capacité d'internaliser la chimiokine et de la diriger vers des systèmes de dégradation protéolytiques régulant ainsi sa bio-disponibilité. Plus généralement, compte tenu de la surexpression d'ACKR3 dans certaines maladies de la peau, elles discutent de son rôle potentiel dans leur pathogenèse qui évolue comme conséquence d'une inflammation chronique. ACKR3 est-il l'ami (a)typique qui aime manquer la fête, ou bien devons-nous y regarder de plus près ?

Légende Figure : CXCL12 contrôle différentiellement la réparation cutanée en fonction de l'âge. En réponse à une blessure, les kératinocytes de jeunes adultes produisent du CXCL12 (A), les fibroblastes dermiques entrent dans un état d'activation (B), entrainant la restauration des adipocytes du tissu sous-cutané (C) et la résolution de la plaie et sa cicatrisation (D). Dans la peau âgée, on observe une diminution de la production de CXCL 12 dans l'épiderme, ce qui empêche la formation rapide de cicatrices et facilite la régénération de l'architecture cutanée d'origine. Bien que ces mécanismes ne soient pas entièrement compris, les effets bénéfiques du blocage de CXCR4 et le rôle encore inexploré d'ACKR3 indiquent des voies à étudier chez les individus âgés. La coexistence de réponses fibrotiques et régénératives au sein d'un seul organisme mammalien, illustré par le Renne, laisse entrevoir la possibilité d’une situation similaire dans diverses régions du corps humain (créé avec BioRender.com).

-> Contact : francoise.bachelerie@universite-paris-saclay.fr

Dans un article récemment publié dans Current Opinion in Plant Biology, les chercheurs du laboratoire BioCIS (CNRS/UPSaclay, Orsay) présentent les dernières avancées techniques qui ont permis de faire progresser l’investigation des voies de biosynthèse des métabolites spécialisés d’origine végétale. Des techniques telles que le séquençage génomique de nouvelle génération, le développement de plateformes analytiques toujours plus sensibles (notamment en LC-MS/MS et en RMN) et la création de réseaux moléculaires et de réseaux métabolites-transcrits permettent désormais une exploration plus fine et précise des mécanismes biosynthétiques complexes.

Ces progrès ont un impact direct sur la compréhension des enzymes et des voies de biosynthèse impliquées dans la production de métabolites spécialisés. L’étude des voies biosynthétiques est devenue stratégique, car elle offre la possibilité de reconstituer ces mécanismes dans des organismes hôtes, permettant ainsi la production à grande échelle de molécules naturelles avec des applications thérapeutiques. Cette approche permettrait de surmonter les défis liés à l’approvisionnement en plantes et à la production synthétique de ces métabolites.

Bien que ce domaine soit interdisciplinaire, les auteurs se concentrent particulièrement sur les avancées méthodologiques récentes dans le domaine de la chimie, qui facilitent la production et l’analyse de ces composés d’origine végétale en laboratoire.

-> Contact : mehdi.beniddir@universite-paris-saclay.fr

Dans une étude publiée dans Journal of the American Society of Nephrology, Goran Stanajic Petrovic et ses collègues du DMTS/SIMoS (CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) et de BioMaps (SHFJ, UMR CEA/CNRS/Inserm/UPSaclay, Orsay) ont développé une molécule peptidique à partir d’une toxine de serpent retrouvée dans le venin de Dendroaspis angusticeps.

La molécule modifiée, MQ232, est dénuée de toxicité mais est capable de se fixer efficacement et durablement sur un récepteur extracellulaire présent au niveau du rein, le récepteur à la vasopressine de type 2 (V2R), qui joue un rôle important dans le maintien de l’homéostasie hydrique de ces mammifères. En s’y fixant, MQ232 empêche son activation par son ligand naturel, la vasopressine, résultant en une diurèse aqueuse rapide et dose-dépendante.

Ce peptide novateur est un puissant antagoniste du V2R d’un nouveau genre, et les résultats présentés dans cette étude montrent qu’il pourrait proposer une alternative pour le traitement de deux maladies faisant intervenir le V2R et actuellement difficilement prises en charge par une classe de molécules chères et d’emploi délicat, les vaptans. La première, l’hyponatrémie, est une maladie causée par une concentration trop faible en ions sodium dans le sang. L’administration de MQ232, en provoquant une perte d'eau sans perte d’électrolytes, permet chez le rongeur modèle un rétablissement d’une natrémie normale. Les secondes sont les polykystoses rénales, un ensemble de maladies chroniques mortelles lors desquelles des kystes remplis de fluide se développent dans le rein. Là encore, l’administration de MQ232 engendre un ralentissant de l’apparition et du développement de ces kystes chez le rongeur modèle.

-> Contact : gsp.mondoctorat@gmail.com

L'émergence du commensalisme et du mutualisme découle souvent d'un parasitisme ancestral. Cependant, dans le cas des interactions rhizobium-légumineuses, des souches bactériennes présentant à la fois des caractéristiques pathogènes et de nodulation sur un même hôte n'avaient pas encore été décrites.

Dans une étude publiée dans Nature Communications, l’équipe SYMUNITY dirigée par Pascal Ratet à l’Institut des Sciences des Plantes Paris-Saclay - IPS2 (CNRS/INRAE/UEVE/UParis/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), en collaboration avec le LIPME (INRAE Toulouse) et la stratup iMean, a isolé une bactérie Ensifer adhaerens (souche T4) présentant ces caractéristiques. Celle-ci a été isolée à partir des nodosités de la légumineuse Medicago et caractérisée comme induisant des nodules non-fixateurs d’azote de manière hautement compétitive, ou comme étant un parasite sévère déclenchant la mort de la plante. Cette double capacité de la souche T4 est conservée sur plusieurs espèces de légumineuses, le résultat de l'interaction dépendant du stade de développement de la plante. Cette étude a aussi montré qu’au-delà de la souche T4, une autre E. adhaerens (souche T173) présente ce double comportement patho-symbiotique.

Au final, ces bactéries pourraient représenter un « chaînon manquant » entre les pathogènes ancestraux et les rhizobia symbiotiques

Légende Figure : Procédure pour le piégeage d’endophytes de nodosités de Medicago littoralis et démonstration du postulat de Koch. Les trois comportements (endophyte, symbiotique, ou pathogénique) de la souche T4, en fonction du développement de la plante, sont indiqués sur la partie basse du schéma.

-> Contact : pascal.ratet@universite-paris-saclay.fr

Les composés organiques volatils (COV) émis par les plantes jouent un rôle dans la communication intra- et interspécifique, assurant ainsi de nombreux services. S’il est établi que les parties aériennes des plantes sont capables d’émettre de grandes quantités de différents COV, la contribution des racines aux émissions de COV biogéniques reste peu documentée.

Dans une récente étude parue dans Science of The Total Environment, des scientifiques des laboratoires EcoSys (Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau) et CEFE (Montpellier) ont quantifié les flux de COV émis par des plantes intactes de colza et de tomate grâce à une chambre de mesure spéciale, permettant de séparer les compartiments aériens et souterrains. Les échanges de COV dans chaque compartiment ont été mesurés en ligne à l'aide d'un spectromètre de masse à réaction par transfert de protons, ce qui a permis de quantifier en temps réel plusieurs centaines de composés différents.

Les résultats indiquent que les émissions de COV suivent un rythme diurne et sont dominées par le méthanol, puis le méthanethiol dans le cas du colza ou les monoterpènes dans le cas de la tomate. Les émissions de COV par les racines détectées à la surface du sol représentent moins de 5% des émissions totales de la plante en conditions normales. Une fois le sol retiré autour des racines, celles-ci augmentent fortement et contribuent autant que les parties aériennes aux émissions de COV de la plante, en particulier sous forme de méthanol.

Ces résultats suggèrent à la fois un fort potentiel d’émission de COV par les racines et un rôle important du sol comme puits de COV.

-> Contact : raluca.ciuraru@inrae.fr / frederic.rees@inrae.fr

Christopher Dane Fage is a structural biochemist who, in January of 2024, joined the Institute for Integrative Biology of the Cell - I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) as a CNRS CRCN to lead the team Structures and functions of hybrid natural product assembly lines. His research seeks to understand and exploit the biosynthesis of medically relevant bacterial metabolites by multi-family enzyme systems.

In 2014, Chris earned his PhD from the University of Texas at Austin (USA) in the team of Adrian Keatinge-Clay, where his interest in the structural biochemistry of polyketide synthases (PKSs) crystallized (these multi-domain, multi-module enzymatic assembly lines build complex molecules from simple building blocks through the catalytic chemistry of fatty acid synthases (FASs)). For example, from the spinosyn insecticide pathway, he investigated a Diels-Alderase-like enzyme (catalyzes a reaction widely used in chemical synthesis) and a “dimerization element” (organizes the modular architecture of many PKSs).

Subsequently, as a postdoc at Philipps-Universität Marburg (Germany) with Mohamed Marahiel, Chris focused on other types of natural product-forming enzymes, such as non-ribosomal peptide synthetases (NRPSs; these assembly line systems incorporate different building blocks than PKSs using different catalytic domains). For example, he initiated an integrative structure-function study on the inter-subunit “COM” interfaces needed for efficient peptide formation in many NRPSs. He also studied the properties, detection, biosynthesis, and tailoring of the ribosomally synthesized and post-translationally modified lasso peptides, which adopt a remarkably stable lariat knot-like fold. 

From 2017, Chris joined the teams of Greg Challis and Józef Lewandowski at the University of Warwick (UK). There, he investigated trans-AT PKSs, which employ a wide variety of standalone enzymes in place of their subunit-embedded counterparts, as well as hybrid PKS-NRPS systems, which merge the catalytic chemistry of PKSs and NRPSs – thanks to their peculiarities, these machineries build exceptionally diverse compounds. He also clarified the mode of action of the kalimantacin antibiotics against the human pathogen Staphylococcus aureus.

In a brief departure from natural products, Chris worked at the Centre for Medicines Discovery at the University of Oxford (UK) during 2022-2023, where he characterized the structures of three enzymes associated with type 2 diabetes mellitus. He also developed a high-throughput assay for screens against libraries of tens of thousands of inhibitors.

Since arriving at the I2BC, Chris has been pursuing structure-guided studies towards the rational reprogramming of hybrid FAS-NRPS-PKS systems, with particular interest in those of the kalimantacin (antibacterial) and bleomycin (anticancer) drugs.

“The true delight is in the finding out rather than in the knowing.” - Isaac Asimov

-> Contact : christopher.fage@i2bc.paris-saclay.fr

Mardi 26 novembre 2024, l’Académie des sciences a célébré l’excellence scientifique lors d’une deuxième séance de remise des prix, organisée au palais de l’Institut de France.

Cheffe du service de Dermatologie à Gustave Roussy, responsable de l’enseignement de la Dermatologie au sein de la Faculté de Médecine de l’Université Paris-Saclay et codirectrice de l’équipe de recherche Résistance adaptative sur le mélanome de l’unité Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie (PMNCO – Univ. Paris-Saclay/Inserm/Gustave Roussy), Carole Robert est lauréate du prix René Turpin de cancérologie pour ses travaux sur le mélanome. Son activité, aussi bien en clinique qu’au laboratoire a pour objectif d’optimiser la prise en charge des patients atteints de mélanome. A Gustave Roussy, cette Highly Cited Researcher, scientifique la plus citée au monde dans son domaine, met en place des essais cliniques innovants tout en explorant, avec son équipe, les mécanismes de résistance aux immunothérapies et aux thérapies ciblées et développe des modèles expérimentaux dans le but de tester de nouveaux moyens thérapeutiques.

Le prix René Turpin de cancérologie – Fondation de l’Institut de France est un prix biennal de cancérologie, décerné sur proposition de l’Académie des sciences.

Mardi 26 novembre 2024, l’Académie des sciences a célébré l’excellence scientifique lors d’une deuxième séance de remise des prix, organisée au palais de l’Institut de France.

Directeur de recherche CNRS au Laboratoire Écologie, Systématique et Évolution -ESE (CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette), Franck Courchamp est lauréat de la subvention Emile Blutet en reconnaissance de ses nombreuses actions de communication et de vulgarisation scientifique. Auteur de trois livres et de plus de 220 publications internationales, il fait partie des Highly Cited Researchers, les scientifiques les plus cités au monde dans leurs domaines. Spécialiste de la dynamique des populations et de l’impact du réchauffement climatique sur la biodiversité, Franck Courchamp est également auteur de plusieurs rapports dans des panels intergouvernementaux tels que le GIEC ou l’IPBES. Il dirige actuellement une équipe de recherche sur la dynamique de la biodiversité et les impacts de l’homme sur les écosystèmes et les espèces à l’Université Paris Saclay.

La subvention Emile Blutet est destinée à récompenser un, une ou plusieurs autrices ou auteurs d’une œuvre de vulgarisation scientifique datant de moins de 10 ans.

• Thème : « Biomédicaments, leur place dans l’arsenal thérapeutique »
• Date :10 décembre 2024
• Horaire : 14:00 à 17:00
• Lieu : Amphithéâtre Hélène Martel-Massignac, Institut Curie, 11-13 rue Pierre et Marie Curie, 75005 Paris
• Egalement en distanciel via la connexion zoom
• Organisateur(s) : Laurent Pradier
• Programme

Avec Nathalie Chaput-Gras du laboratoire d’immunomonitoring en oncologie de Gustave Roussy (INSERM US23, CNRS UMS 3655, UPSaclay, Villejuif).

Chaque séance de la Société de Biologie fait l’objet de publication d’articles dans la revue « Biologie Aujourd’hui » (EDP Sciences).

Nouveau site de la Société de Biologie

La Graduate School Life Sciences and Health (GS LSH) organise sa 9ème journée scientifique intitulée "GS LSH Organoids day" le mercredi 22 janvier 2025 à Henri Moissan, 17 avenue des Sciences, 91400 Orsay.

Ce colloque se déroulera en présentiel et distanciel de 8h45 à 17h45 et comptera avec la présente de trois conférenciers d’honneur :

• Charles Baroud, Institut Pasteur
• Olivier Goureau, Institut de la Vision
• Hervé Chneiweiss, Comité d’éthique de l’Inserm

La GS LSH invite les jeunes chercheurs (doctorants et Post-Doc) à présenter leurs travaux de recherche sous forme de poster.

La présentation d'un poster vous offre la possibilité de dialoguer avec d'autres participants, de partager vos recherches et d'entamer des conversations susceptibles de mener à de futures collaborations.

Pour présenter un poster veillez envoyer le résumé avant le 8 janvier 2025 à : gs.lsh@universite-paris-saclay.fr

Les résumés seront évalués et certains posters seront sélectionnés pour des Flash Talks. Ainsi, vous aurez la possibilité de faire une courte présentation orale de votre poster (2-3 min) afin d’inciter les participants à venir voir votre poster pour plus de détails.

Les résultats de l’évaluation et sélection vous sera adressé au plus tard le 15 janvier 2025.

Pour plus d’information et inscription

Le 22 novembre 2024, le Paris-Saclay Cancer Cluster (PSCC) et son groupe de travail sur le cancer de l'enfant (Imagine for Margo, LifeArc, Sanofi, ITCC, Institut Gustave Roussy, Institut Curie, Servier, ITCC-P4 et Owkin) ont organisé Hack4Hope, le premier hackathon dédié à relever les grands défis des cancers pédiatriques.

Cet événement a reçu le soutien institutionnel de l’Agence de l’Innovation en Santé, chargée de la mise en œuvre du Plan Innovation Santé 2030. Ce plan prévoit des investissements significatifs pour des bioclusters tels que le PSCC, dans le but de créer des pôles d’excellence internationaux dans leur domaine. Organisé à Futur4care à Paris, cet événement unique en son genre a rassemblé une communauté inspirante de chercheurs, cliniciens, experts en biotechnologie et représentants des patients, tous engagés à faire la différence dans les soins et le traitement des jeunes patients atteints de cancer.

Lire la suite avec une petite vidéo si vous souhaitez avoir un aperçu de cette journée.