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September 12, 2024 4:48 PM
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Le dimanche 22 septembre 2024, l'EPA Paris-Saclay organise la troisième édition d’Échappées vertes. Découvrez le programme !

Le dimanche 22 septembre 2024, l'EPA Paris-Saclay organise la troisième édition d’Échappées vertes. Découvrez le programme ! | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Situé à proximité du futur bâtiment PASREL, l’EPA Paris-Saclay vous fait découvrir le domaine de Corbeville le dimanche 22 septembre de 9h à 17h30.

 

Balades à pied ou à vélo à travers un escape game grandeur nature, dégustation de produits locaux, jeux sur l’agriculture, l’alimentation et la transition écologique… :  ces Échappées Vertes sont une occasion à ne pas manquer pour aller à la rencontre d’un patrimoine naturel et culturel local foisonnant au sud du Grand Paris.

 

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March 23, 6:03 PM
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FOCUS PLATEFORME : Nouvel instrument à l’I2BC : le FIDA, les molécules parlent avec leur taille : un nouvel appareil pour l’analyse en solution des interactions entre macromolécules

FOCUS PLATEFORME : Nouvel instrument à l’I2BC : le FIDA, les molécules parlent avec leur taille : un nouvel appareil pour l’analyse en solution des interactions entre macromolécules | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC, Gif-sur-Yvette, Institut Joliot, CEA, Saclay) est une unité mixte de recherche associée ) l'Université Paris-Saclay, au CNRS et au CEA, accueillant une soixantaine d’équipes de recherche et hébergeant 15 plateformes technologiques et 2 plateaux techniques, répartis en 6 pôles. Redécouvrez toutes ces plateformes via un FOCUS PLATEFORME dédié !

 

Aujourd’hui, FOCUS PLATEFORME s’intéresse à un nouvel équipement – le FIDA, pour Flow-Induced-Dispersion-Analysis, récemment acquis chez Fida Biosystems par la plateforme de mesures d'Interactions Macromoléculaires (PIM) (I2BC- plateformes Biologie Structurale). La technologie FIDA utilise la détection de fluorescence des systèmes dispersés en diffusion de Taylor (TDA) dans des capillaires. La mesure des coefficients de diffusion des espèces en solution à partir des taylorgrammes permet de calculer la taille des biomolécules, en déterminant avec précision leur rayon hydrodynamique (Rh). Il est alors possible de caractériser les interactions biomoléculaires en fonction de la taille des complexes formés. Les mesures effectuées à l'aide du FIDA peuvent être réalisées dans des milieux complexes tels que le plasma, le sérum, les lysats cellulaires et les milieux de fermentation.

 

L’appareil dispose de deux détecteurs indépendants pour suivre les molécules en UV (280 nm) lorsqu’il s’agit de détecter la fluorescence intrinsèque des protéines ou en fluorescence (488 nm) pour les protéines marquées. Cette technologie a l’avantage de couvrir une grande gamme de taille de molécules, permettant ainsi de travailler avec des petites molécules ainsi qu’avec des systèmes multivalents sub-nanomètre tels que des liposomes ou capsides de virus. En effet, le FIDA peut mesurer des molécules dont le Rh varie entre 0,5 et 1000 nm. Au sein d’un échantillon, il est possible d’identifier les différentes populations de taille.  Les mesures de caractérisation des complexes biomoléculaires montrent l’évolution du Rh en fonction de la concentration croissante d’analyte (partenaire non marqué). A partir de cette courbe, l’affinité KD peut être déduite. Des variations de 5 % de taille du Rh peuvent être détectées lors d’une interaction avec un partenaire non fluorescent, et les très faibles affinités (de l’ordre du pM) peuvent être mise en évidence. Dans l’exemple ci-dessus (Rodolphe Auger, Equipe de Thierry Touzé, I2BC, dpt Microbio), nous avons caractérisé l’interaction d’un peptide avec une protéine membranaire solubilisée en détergent, ce qui était très compliqué avec les techniques complémentaires de la plateforme, et qui est rendu possible avec le FIDA.  Additionnellement à ces mesures, les données brutes du FIDA fournissent également des informations supplémentaires essentielles au contrôle-qualité des échantillons, notamment des détails sur le fluorophore libre qui n'a pas réagi, l'agrégation des protéines, l'inadéquation du tampon, les changements de viscosité et l'adhésivité des protéines.

 

Plus récemment, le FIDA a été utilisé avec succès pour caractériser en nombre et en taille les condensats : séparations de phase liquide (LLPS, Stender et al., Nat. Commun. 2021) en fonction de la température. L'instrument est entièrement automatisé pour les flacons ou les plaques de 2 x 96 puits avec un contrôle de la température de bout en bout de 4 à 55°C, contrôlable par incréments de 0,1°C. Chaque test ne nécessite que quelques microlitres d'échantillon. La preuve de concept de l’intérêt de la technique sur les systèmes multi-partenaires ou des capsides de virus a été réalisée avec succès. Plusieurs articles scientifiques sont en cours de révision.

 

Contacts : Magali Noiray (Magali.noiray@i2bc.paris-saclay.fr) ; Magali Aumont (magali.aumont-nicaise@i2bc.paris-saclay.fr); Stéphanie Marsin (stephanie.marsin@i2bc.paris-saclay.fr)

 

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

 

Envie de (re)lire les précédents FOCUS PLATEFORME de PIM ?

 

I2BC / Plateforme de mesures d'Interactions Macromoléculaires (PIM). La Plateforme de mesures d'Interactions Macromoléculaires (PIM) de l'I2BC offre un large éventail d'équipements et d'expertises en biochimie et biophysique pour réaliser des mesures de contrôles qualités ainsi que des analyses fonctionnelles d'échantillons de protéines : microcalorimétrie, ultracentrifugation analytique (UCA), MST, SEC-RALS-LALS, BLI, SPR, switchSENSE. Les prestations offertes par la plateforme concernent : 1) La caractérisation biophysique de protéines ou de complexes biologiques (SEC-RALS-LALS, UCA), 2) L'analyse d'interactions biologiques (ITC, SPR, BLI, switchSENSE, MST), 3) L'analyse de la stabilité des macromolécules et des complexes biologiques pour notamment aider à la formulation (DSC, DSF). Les appareils et prestations sont mis à disposition de l'ensemble des laboratoires de l'Université Paris-Saclay, des autres laboratoires académiques ainsi qu'aux industriels. Pour plus d'informations concernant ces prestations : plateforme-pim@i2bc.paris-saclay.fr. Cette plateforme fait partie du pôle des plateformes de Biologie Structurale de l'I2BC qui comprend : i) les plateformes de Cristallisation, RMN, CryoEM, Mesures d'Interactions Macromoléculaires, la génération et production de protéines artificielles (αRep) et ii) les plateaux techniques d'Expression de protéines solubles ou membranaires en levures, Expression des protéines en cellules d'insectes.

 

A propos de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC - UMR 9198). L’I2BC est une Unité Mixte de Recherche (CEA, CNRS, Université Paris-Saclay), accueillant une soixantaine d’équipes de recherche et hébergeant 17 plateformes technologiques, réparties en 6 pôles. 2025 est aussi une année clé pour l’I2BC : cette unité fête ses 10 ans cette année.

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March 18, 5:02 PM
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Nouvelles fonctions pour les MAP Kinases dans la perception du nitrate

Nouvelles fonctions pour les MAP Kinases dans la perception du nitrate | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans le cadre d'une collaboration entre l’équipe NUTS de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (UPSaclay/INRAE/AgroParisTech, Versailles) et l’équipe STRESS de l’Institut des Sciences des Plantes Paris-Saclay - IPS2 (CNRS/INRAE/UEVE/UParis/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), des scientifiques ont découvert une nouvelle voie de signalisation impliquée dans le prélèvement d’azote, un nutriment vital pour la croissance des plantes.

 

L’étude publiée dans The Plant Journal, révèle que le nitrate, une forme d’azote extraite du sol, déclenche une cascade d’événements moléculaires impliquant des protéines spécifiques appelées MAP kinases. Cette cascade est initiée par les facteurs de transcription NLP (« NIN-Like Proteins ») et implique MAP3K13 et MAP3K14, deux kinases dont le rôle était mal compris jusqu'à récemment.

 

 Cette découverte enrichit nos connaissances sur l'adaptation des plantes à la disponibilité des nutriments et pourrait conduire à des stratégies visant à améliorer l'efficacité de l'utilisation de l'azote dans les cultures, à réduire l'utilisation d'engrais et à promouvoir une agriculture durable.

 

-> Contact : jean.colcombet@inrae.fr

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March 18, 5:25 PM
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Prilling d'émulsions eau-dans-huile cristallisables : vers la co-encapsulation de substances actives hydrophiles et lipophiles dans des microparticules lipidiques

Prilling d'émulsions eau-dans-huile cristallisables : vers la co-encapsulation de substances actives hydrophiles et lipophiles dans des microparticules lipidiques | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les systèmes multiparticulaires offrent des avantages en termes de flexibilité de doses et de médecine personnalisée entre autres. Le prilling par fusion, un processus qui produit des microparticules sphériques à base de lipides à l'aide de buses vibrantes, présente un grand potentiel pour produire des objets parfaitement sphériques et homogènes en taille à l’échelle industrielle. En première intention, il est toutefois utilisé pour formuler des substances actives lipophiles. Une étude réalisée dans l’équipe Multiphase de l’Institut Galien Paris-Saclay (IGPS, CNRS/UPSaclay, Orsay) en collaboration avec BÜCHI Labortechnik AG (Flawil, Suisse) et le synchrotron Elettra (Trieste, Italie) visait à explorer son utilisation pour cristalliser des émulsions eau dans huile, permettant l'incorporation de substances actives hydrophiles dans ces matrices lipidiques.

 

La première phase du projet a consisté en l’évaluation des excipients lipidiques en fonction de leur aptitude au prilling, afin de garantir l'homogénéité de la forme, de la taille et de la stabilité des microparticules. La deuxième phase s'est concentrée sur la caractérisation des microparticules, notamment en termes d'organisation et d'intégrité structurale.

 

Selon la composition des microparticules, la phase aqueuse s’est soit dispersée sous forme de domaines distincts, soit sous forme d’un réseau aqueux intimement mélangé aux lipides. Quelle que soit l’organisation, la quantité d’eau incorporée est restée stable a minima 14 mois. Les résultats ont aussi démontré l'encapsulation réussie des deux composés modèles, l’un hydrophile, l’autre lipophile, avec une grande efficacité d’encapsulation.

 

Cette étude, publiée dans International Journal of Pharmaceutics, a été réalisée dans le cadre de la thèse de Claire Delmas et a par ailleurs montré des résultats prometteurs quant à l’incorporation de telles particules dans des dispositifs de dosage personnalisé.

 

-> Contact : vincent.faivre@universite-paris-saclay.fr

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March 18, 5:43 PM
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La bithérapie orale initiale améliore les résultats chez les patients atteints d'hypertension artérielle pulmonaire et de comorbidités cardiovasculaires

La bithérapie orale initiale améliore les résultats chez les patients atteints d'hypertension artérielle pulmonaire et de comorbidités cardiovasculaires | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans European Respiratory Journal, les médecins du Service de Pneumologie et Soins Intensifs Respiratoires de l’Hôpital Bicêtre et de l’unité l’UMR-S 999 « Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique » (INSERM/UPSaclay) ont évalué l'efficacité de la bithérapie orale initiale (associant antagoniste des récepteurs de l’endothéline et inhibiteur de la phosphodiestérase 5) chez des patients atteints d'hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) et présentant au moins une comorbidité cardiovasculaire (hypertension, obésité, diabète ou coronaropathie). L’analyse rétrospective de 708 patients du registre français de l'hypertension pulmonaire, appariés sur des critères démographiques et de sévérité de l’HTAP, a comparé la bithérapie à la monothérapie.

 

Les résultats montrent que la bithérapie initiale entraîne une amélioration plus marquée des paramètres fonctionnels (classe fonctionnelle, distance parcourue au test de marche de 6 minutes) et hémodynamiques (mesurés au cathétérisme cardiaque droit), ainsi qu’un meilleur contrôle du risque de mortalité à un an, sans augmentation significative des effets indésirables ni du taux d'arrêt de traitement. L’élévation de la pression capillaire pulmonaire a été plus fréquente dans ce groupe, mais n'a pas eu d'impact négatif sur la survie ou la tolérance au traitement.

 

Ces résultats suggèrent que la bithérapie pourrait être bénéfique pour les patients atteints d’HTAP avec comorbidités cardiovasculaires, remettant en question les recommandations actuelles privilégiant la monothérapie dans cette population.

 

-> Contact : athenais.boucly@aphp.fr

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March 18, 6:11 PM
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Les frontières dans nos chromosomes façonnent les domaines voisins

Les frontières dans nos chromosomes façonnent les domaines voisins | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les chromosomes de l’homme et d’autres mammifères sont subdivisés en « quartiers fonctionnels » qui guident la fidélité des processus biologiques, notamment la régulation des gènes et la réparation de l’ADN. Les perturbations de ces quartiers, entraînant la fusion de domaines adjacents, peuvent conduire à diverses maladies, notamment le cancer et les troubles du développement.

 

Dans une étude publiée dans PNAS, des scientifiques du groupe Noordermeer de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) en collaboration avec leurs collègues de l’École Normale Supérieure de Paris, décrivent comment les éléments de bordure chromosomique influencent l’organisation des quartiers fonctionnels adjacents. En combinant une analyse génomique et des simulations biophysiques de la structure des chromosomes, ils montrent que la taille de ces bordures est très diverse, allant de simples « points » sur le chromosome à des zones de transition très étendues entre les quartiers.

 

Des simulations informatiques du comportement des chromosomes dans des quartiers régulateurs avec différents types de bordures entre eux ont révélé un impact inattendu et de grande portée des bordures sur leurs voisins. Plutôt que de créer une séparation statique, les frontières influencent activement le degré de mélange des voisinages en raison d'un mécanisme jusqu'alors inconnu par lequel les frontières enroulent les voisinages adjacents. Aux frontières étroites, cela favorise activement le mélange et peut provoquer une interférence entre l'activité biologique des deux côtés de la frontière. Les frontières étendues amortissent ce mécanisme en ajoutant une séparation supplémentaire.

 

La structure des frontières peut ainsi constituer un nouveau niveau de régulation dans le génome pour affiner les processus biologiques.

 

-> Contact : daan.noordermeer@i2bc.paris-saclay.fr

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March 23, 12:59 PM
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Découverte d’un gène impliqué dans l’anxiété et la mémoire

Découverte d’un gène impliqué dans l’anxiété et la mémoire | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Des chercheurs de Mircen (CEA/UPSaclay, Fontenay-aux-Roses) participent à une étude publiée dans Brain, montrant sur un modèle souris le rôle d'un gène, DLCK3, dans la modulation de l'anxiété et de la mémoire. Ce résultat est un pas important dans la compréhension de maladies psychiatriques, auxquelles étaient associées jusqu'alors de nombreuses mutations de gènes, dont DLCK3, sans qu'un rôle précis puisse pour autant leur être attribué.

 

Lire la suite de l’Actu CEA-Jacob

 

-> Contact : emmanuel.brouillet@cnrs.fr

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March 23, 5:24 PM
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Franck Courchamp, invité sur la chaire annuelle Biodiversité et écosystèmes du Collège de France

Franck Courchamp, invité sur la chaire annuelle Biodiversité et écosystèmes du Collège de France | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Franck Courchamp (directeur de recherche au CNRS au Laboratoire Écologie, Systématique et Évolution -ESE, CNRS/UPSaclay/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette) est invité sur la chaire annuelle Biodiversité et écosystèmes pour l’année 2024-2025. Il prononcera sa leçon inaugurale intitulée Complexité, paradoxes et holisme, le 27 mars 2025.

 

Résumé

 

L’écologie est la science des interactions entre les êtres vivants et leur milieu ; ce milieu est lui-même constitué d’autres êtres vivants, eux-mêmes en interaction avec leur milieu, et d’autres êtres vivants. On voit bien dès la définition de l’écologie qu’il s’agit là d’une discipline qui traite de phénomènes complexes. Et c’est certainement cette complexité, fascinante et défiante, qui constitue l’un des éléments les plus intéressants des études en écologie. Même lorsque les systèmes semblent simples, ou les interactions logiques, cette complexité souvent discrète nous révèle alors des paradoxes, aussi surprenants que délicieux. La plupart du temps, ces paradoxes ne sont qu’apparents, et dus à notre vision partielle des systèmes étudiés. Au final, quelques décennies d’études nous apprennent que la seule façon d’appréhender la biodiversité, et l’écologie qui l’étudie, est de manière globale, holistique. Au travers des exemples des travaux qui ont jalonné ma carrière de chercheur en écologie, cette leçon inaugurale va cheminer de paradoxe en paradoxe, pour montrer comment la complexité en écologie nécessite une approche holistique. Des chats chassant rats et oiseaux aux lions chassés pour leurs trophées, des combats de fourmis aux scarabées de combat, des feux protecteurs aux espèces à la fois menacées et menaçantes, nous allons explorer ensemble quelques exemples de questions, de systèmes et d’études qui font mon quotidien d’écologue.

 

Documents et médias

 

-> Contact : franck.courchamp@universite-paris-saclay.fr

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March 18, 6:34 PM
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Yves Gaudin, invité de l'émission "La Science, CQFD" sur France Culture - "Origines du Covid : retour aux sources"

Yves Gaudin, invité de l'émission "La Science, CQFD" sur France Culture - "Origines du Covid : retour aux sources" | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les origines du COVID-19 demeurent un mystère pour la communauté scientifique. Pourtant, comprendre son émergence pourrait nous aider à prévenir de futures pandémies. Comment l’analyse critique des épidémies passées peut-elle nous aider à mieux nous préparer aux prochaines menaces sanitaires ?

 

Avec

 

Il y a cinq ans jour pour jour, le confinement était annoncé en France. Depuis, les origines du Covid-19 restent mystérieuses et continuent de faire débat. Pourquoi est-il crucial de déterminer l’émergence du SARS-CoV2 ?


C’est une question qui alimente un grand nombre de spéculations et de théories du complot. On sait que ce virus n’a pas été créé ex-nihilo, que le marché de Wuhan a joué un rôle et que "l’hôte réservoir" est bien la chauve-souris : mais on ne comprend toujours pas la chaîne de transmission. Quel est le chainon manquant, "l'espèce intermédiaire" entre les chauves-souris et l’humain ? Et s’agit-il d’une fuite de laboratoire ? Pour élucider l’origine de la peste noire, il aura fallu attendre 700 ans, alors aura-t-on le fin mot cette histoire ? Et pourquoi cette information peut-elle nous aider à mieux gérer les épidémies futures ?

 

Réécouter le podcast de l'émission du 17 mars 2025

 

-> Contact : yves.gaudin@i2bc.paris-saclay.fr

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March 23, 5:08 PM
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Journées science ouverte d’AgroParis Tech et de la GS Biosphera - 7 au 11 avril 2025

Journées science ouverte d’AgroParis Tech et de la GS Biosphera - 7 au 11 avril 2025 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Participez à une série de séminaires, ateliers, retours d’expériences et échanges dédiés aux pratiques et enjeux de la science ouverte. Publications, gestion des données, valorisation sur le web, dépôt dans HAL… Découvrez des projets et échangez avec des collègues impliqués sur le terrain.

 

Plus d’info

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March 20, 4:57 PM
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"La pollution : gérer déchets et activités de soins à risque infectieux " - Lundi 7 avril 2025 à Henri Moissan (Orsay)

"La pollution : gérer déchets et activités de soins à risque infectieux " - Lundi 7 avril 2025 à Henri Moissan (Orsay) | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La Graduate School Health and Drug Sciences - HeaDS a lancé une série de conférences sur le développement soutenable avec le Dr Edouard Dossetto

 

Lundi 7 avril 2025 | 16h30 à 18h | Amphi Hervé DANIEL

(Bâtiment HM2)

La pollution : gérer déchets et activités de soins à risque infectieux

 

Aujourd’hui directeur de projet transition écologique à la Direction Générale des Entreprises, Dr Edouard Dossetto a été membre de l’équipe de négociateurs français aux COP25 et COP26 pour le Ministère de la Transition Ecologique et a travaillé avec la Première Ministre pour suivre les négociations relatives à l'environnement en général.

 

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March 19, 5:14 AM
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SAVE THE DATE ! « MSD Advancing Biomarker: Innovations, Applications, and Ultimate Sensitivity » Webinar - 15 mai 2025 de 13h à 14h

SAVE THE DATE ! « MSD Advancing Biomarker: Innovations, Applications, and Ultimate Sensitivity » Webinar - 15 mai 2025 de 13h à 14h | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Join us for an exclusive webinar exploring the latest advancements in MSD technology and our newest product updates. Discover how our solutions support PK/ADA assay development, method validation, and cell-based assays, providing high performance across multiple applications. Learn how MSD enables unparalleled sensitivity, reaching the femtogram per milliliter (fg/mL) range for ultimate biomarker detection. Our experts will showcase real-world applications and case studies to highlight the impact of MSD technology. Don’t miss this opportunity to stay at the forefront of bioanalytical innovation!

 

Animé par Sophie Viel responsible plateforme MSD et Fatima Lamraoui biomarker specialist

 

-> Contact : sophie.viel@universite-paris-saclay.fr

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March 19, 4:16 AM
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RAPPEL ! Les Lundis de l'IPSIT - Lundi 31 mars 2025 : « La Naissance des Idées »

RAPPEL ! Les Lundis de l'IPSIT - Lundi 31 mars 2025 : « La Naissance des Idées » | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les Lundis de l'IPSIT

Lundi 31 mars 2025, de 9h15 à 12h15

Université Paris-Saclay - Bâtiment Henri Moissan

17, avenue des Sciences

91400 ORSAY

(Salle 2004- HM1 recherche - 2e étage)

Pour vous inscrire : envoyer un mail à nadine.belzic@inserm.fr

 

Organisatrice : Sylvia Cohen-Kaminsky (INSERM UMR-S 999 - Université Paris Saclay, Hypertension Pulmonaire : Physiopathologie et Innovation Thérapeutique, Hôpital Marie

Lannelongue, Le Plessis-Robinson-92)

 

Thème : « La Naissance des idées »

 

Intervenants :

  • Erwan Lamy (Epistémologiste, professeur associé de l'ESCP Business School, chercheur associé à l'IDHES Saclay (CNRS, ENS Paris-Saclay) et membre du Groupe de recherche en épistémologie du Collège de France) :
    La naissance des idées
  • Hervé Escriou (Chef de projet Maturation, Direction investissement Sciences de la vie, SATT Paris Saclay) :
    La naissance des idées de rupture”
  • Table ronde et témoignages des participants
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March 23, 5:39 PM
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L'IJPB à la 17ème édition d’Esprit Jardin

L'IJPB à la 17ème édition d’Esprit Jardin | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Initié il y plus de 15 ans, Esprit Jardin rassemble chaque année plus de 20 000 personnes passionnées par les plantes et les jardins. Ce grand rendez-vous offre l'opportunité de sensibiliser les petits et les grands à la science dans un contexte inattendu, de découvrir une autre facette des plantes, d'éveiller et de répondre à la curiosité du grand public.

 

Après le succès de sa première participation à Esprit jardin en 2021 (actu), à l'occasion de ses 10 ans, l’Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal - IJPB (UPSaclay/INRAE/AgroParisTech, Versailles) a renouvelé l'expérience en 2022, 2023 et 2024. Pour 2025, un nouvel atelier est au programme !

 

En savoir plus

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March 18, 4:51 PM
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L’étude d’hypermutateurs de la bactérie Bacillus subtilis dévoile la façon dont la correction sur épreuve biaise le profil des erreurs de réplication de l’ADN

L’étude d’hypermutateurs de la bactérie Bacillus subtilis dévoile la façon dont la correction sur épreuve biaise le profil des erreurs de réplication de l’ADN | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les erreurs de réplication de l’ADN commises par les polymérases constituent une source majeure de mutations ponctuelles dans les génomes. Le taux de mutation spontanée dépend également de l'activité des mécanismes de réparation de l'ADN ; l'apparition de phénotypes mutateurs favorisant des périodes d'évolution rapide dans la nature et en laboratoire.

 

Dans une étude publiée dans Nucleic Acids Research, des scientifiques de l’Institut Micalis (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) et de l’unité MaIAGE (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas) ont étudié comment les taux de mutations dépendent des contributions respectives de la sélectivité initiale des nucléotides par l’ADN polymérase, de la correction sur épreuve des erreurs par l’ADN polymérase, et de la réparation des mésappariements après synthèse du nouveau brin par le système mismatch repair (MMR). Pour cela, ils se sont appuyés sur la construction d’hypermutateurs conditionnels par l’expression d’allèles dominants négatifs de polC et mutL chez la bactérie modèle Bacillus subtilis, puis sur des expériences d'accumulation de mutations.

 

À l'aide de modèles mathématiques, les probabilités avec lesquelles les erreurs échappent au MMR et à l’activité de correction sur épreuve ont été estimées. Ces analyses ont révélé la façon dont la correction sur épreuve distend le profil mutationnel en amplifiant les biais initiaux dans la sélectivité des nucléotides. Cela semble pouvoir être interprété comme un effet secondaire inhérent au mécanisme d’auto-correction.

 

L’étude ouvre aussi la voie à la conception d’approches d’évolution dirigée en laboratoire exploitant de manière rationnelle les hypermutateurs conditionnels.

 

Légende Figure : Biais de l’activité de correction sur épreuve de PolC, qui entraîne une meilleure correction des erreurs pour lesquelles la sélectivité initiale des nucléotides est déjà élevée.

 

-> Contact : matthieu.jules@inrae.fr / pierre.nicolas@inrae.fr

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March 18, 5:10 PM
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Troubles socio-émotionnels chez une souris modèle de myopathie de Duchenne

Troubles socio-émotionnels chez une souris modèle de myopathie de Duchenne | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La myopathie de Duchenne (DMD) est une maladie neuromusculaire associée à un large spectre de comorbidités cognitives et neuropsychiatriques, avec une prévalence élevée pour des troubles du spectre autistique par rapport à la population générale. La position des mutations dans le gène DMD, conduisant à la perte d’une ou plusieurs dystrophines cérébrales, influence la présence et la sévérité de la déficience intellectuelle. Par contre, l’implication spécifique de certaines dystrophines dans les troubles du comportement social n’est pas encore établie.

 

Dans un article publié dans Behavioral and Brain Functions, l’équipe de Cyrille Vaillend (Institut des Neurosciences Paris-Saclay - NeuroPSI, CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvettte), en partie financée par l’Europe (Brain INvolvement in Dystrophinopathies ; EUH2020 grant 83245) et en collaboration avec un chercheur de l’Universidad Complutense de Madrid, a effectué une étude exhaustive de la réactivité émotionnelle, du comportement social et de la communication, chez une souris uniquement déficiente en dystrophine Dp71.

 

L’absence de Dp71, produit majeur du gène DMD dans le cerveau, est relativement rare chez les patients DMD (<10%), mais conduit aux troubles cognitifs et comportementaux les plus sévères. Cette étude chez la souris Dp71-null démontre la présence d’importants troubles du comportement social et de la communication sociale, qui corroborent l’hypothèse d’un lien entre la perte de cette dystrophine et la présence de traits autistiques et de troubles exécutifs dans la DMD.

 

-> Contact : cyrille.vaillend@universite-paris-saclay.fr

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March 18, 5:35 PM
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CYR61 induit la dissémination métastatique des ostéosarcomes via CtBP2 si le microenvironnement est non hypoxique

CYR61 induit la dissémination métastatique des ostéosarcomes via CtBP2 si le microenvironnement est non hypoxique | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L'ostéosarcome est la tumeur osseuse solide la plus fréquente en pédiatrie. Le développement rapide de lésions métastatiques et la résistance à la chimiothérapie restent les principaux mécanismes responsables de l'échec de traitements et du faible taux de survie des patients.

 

Dans une étude publiée dans Journal of Experimental & Clinical Cancer Research, les chercheurs de de l’unité Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie (UMR-S 981 PMNCO – Univ. Paris-Saclay/Inserm/Gustave Roussy) et de l’UMR 9018 METSY (CNRS/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif) ont étudié la signalisation induite par CYR61/CCN1 conduisant à la dissémination tumorale. Par analyses comparatives de transcriptome, ils ont identifié le co-facteur de transcription CtBP2 comme cible de CYR61.

 

Majoritairement décrit comme « sensor » de redox et de statut métabolique cellulaire, les auteurs n’ont observé aucune influence de CtBP2 sur la structure ou l’activité métabolique mitochondriales. En revanche, des analyses in vitro et in vivo ont confirmé le rôle essentiel de CtBP2 dans l’acquisition du caractère souche et de capacités migratoires et invasives accrues. Il est également apparu que l’hypoxie bloque l’induction transcriptionnelle de CtBP2 par CYR61.

 

Ainsi, une régulation spatiale se met en place dans la tumeur : au centre hypoxique, CYR61 exerce sa fonction pro-angiogénique ; au front d’invasion, l’expression de CtBP2 est fortement induite par CYR61 ce qui favorise un processus d’EMT-like et l’envahissement des tissus adjacents.

 

-> Contact : olivia.fromigue@inserm.fr

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March 18, 5:54 PM
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L'irradiation intestinale à faible dose améliore l'efficacité du blocage de PD-L1 chez les patients atteints de cancer métastatique

L'irradiation intestinale à faible dose améliore l'efficacité du blocage de PD-L1 chez les patients atteints de cancer métastatique | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Cancer Cell, les scientifiques l’UMR-S 1030 Radiothérapie Moléculaire et Innovation Thérapeutique et de l’UMR-S 1015 Immunologie des tumeurs et immunothérapie (INSERM/Gustave Roussy/UPSaclay, Villejuif) ont étudié l'effet de l'irradiation intestinale à faible dose (ILDR) chez des patients atteints de cancer métastatique, en association avec le blocage de PD-L1.

 

Ils ont démontré que l'ILDR, lorsqu'elle est combinée à des inhibiteurs de points de contrôle immunitaires, peut améliorer les bénéfices cliniques des patients en fonction de leur microbiote intestinal. Cette synergie est observée grâce à une activation spécifique des cellules T CD8+ sans épuisement, facilitée par des souches bactériennes spécifiques comme Christensenella minuta. L'ILDR permet également la migration de cellules dendritiques PD-L1+ vers les ganglions lymphatiques, renforçant ainsi l'effet anti-tumoral.

 

L’étude montre que les effets à distance "abscopaux" de l’ILDR dépendent de la dosimétrie et de l’interaction entre le microbiote intestinal et le système immunitaire. Un essai clinique de phase 2 confirme le potentiel thérapeutique de l'ILDR pour contourner la résistance aux thérapies immunitaires de première et deuxième ligne. Des essais cliniques supplémentaires sont nécessaires pour affiner les protocoles d’administration de l'ILDR.

 

-> Contact : eric.deutsch@gustaveroussy.fr / laurence.zitvogel@gustaveroussy.fr

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March 18, 6:22 PM
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Séquelles de la radiothérapie du cancer du sein : l’ARN long non codant VIM-AS1 participe au développement de la fibrose

Séquelles de la radiothérapie du cancer du sein : l’ARN long non codant VIM-AS1 participe au développement de la fibrose | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les fibroses se caractérisent par le remplacement progressif de tissus parenchymateux fonctionnels par un tissu conjonctif non fonctionnel, résultant d'une exposition prolongée ou répétée à des facteurs dommageables, ou de syndromes dégénératifs. La fibrose est une complication tardive fréquente de la radiothérapie. Dans la fibrose radio-induite, une dérégulation des processus de réparation se produit, associée à une activation incontrôlée des fibroblastes tissulaires, dont le phénotype se modifie vers celui de myofibroblastes fibrogènes. Ce changement de statut cellulaire entraîne une production anormale de protéines de la matrice extracellulaire (MEC), modifiant ainsi sa composition et sa structure. La boucle d'activation fibrotique implique des facteurs de croissance sécrétés, dont le facteur de croissance TGFB1 comme effecteur principal, capable de favoriser une transition phénotypique d'un état fibroblastique sain à un état myofibroblastique fibrogène, lorsqu'il est présent à fortes doses.

 

Alors que de nombreuses études sur la physiopathologie de la fibrose ont exploré la fonction et la régulation des gènes dans les parties codantes du génome, des recherches récentes soulignent le rôle crucial du transcriptome non codant, en raison de ses multiples fonctions régulatrices. Dans une étude publiée dans International Journal of Radiation Oncology Biology Physics, le Laboratoire de Génomique et Radiobiologie de la Kératinopoïèse – LGRK (Institut de Radiobiologie Cellulaire et Moléculaire – iRCM, CEA-Jacob/UPSaclay, Évry) a documenté une implication de l’ARN long non codant VIM-AS1 dans ce processus physiopathologique.

 

Dans le but de rechercher des marqueurs prédictifs de la susceptibilité à la fibrose, l’expression de VIM-AS1 a été étudiée dans des cellules de peau de patientes ayant développé ou non une fibrose mammaire suite une radiothérapie. Cette expression a pu être corrélée à l’observation d’une fibrose radio-induite. Sur un plan mécanistique, l’équipe a décrit une implication de VIM-AS1 dans l’axe profibrosant TGFB1/vimentine dans des fibroblastes cutanés, ainsi que dans la capacité des myofibroblastes à contracter un tissu cicatriciel. Le ciblage de VIM-AS1 par une approche d'interférence ARN utilisant des oligonucléotides antisens a permis d’atténuer les traits associés à l'état fibrogène des myofibroblastes.

 

Cette étude pointe donc sur VIM-AS1 comme un possible biomarqueur de susceptibilité au développement de fibroses séquelles de radiothérapie. Cet ARN long non codant constitue également une cible candidate pour la conception d’approches préventives et/ou correctives de la fibrose après radiothérapie.

 

-> Contact : nicolas.fortunel@cea.fr / michele.martin@cea.fr

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March 18, 4:39 PM
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Portrait Jeune Chercheuse – Athénaïs Boucly, Maitre de Conférences - Praticien Hospitalier en pneumologie

Portrait Jeune Chercheuse – Athénaïs Boucly, Maitre de Conférences - Praticien Hospitalier en pneumologie | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Athénaïs Boucly est médecin spécialiste en pneumologie et médecine intensive réanimation, maitre de conférence des universités – praticien hospitalier depuis septembre 2024. Elle exerce au sein du Service de Pneumologie et Soins Intensifs Respiratoires de l’Hôpital Bicêtre, centre coordonnateur du centre de référence de l’hypertension pulmonaire (PulmoTension), et est rattachée à l’unité l’UMR-S 999 « Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique » (INSERM/UPSaclay). L’hypertension pulmonaire est un syndrome caractérisé par l’augmentation de la pression dans les artères pulmonaires, pouvant aboutir à de l’insuffisance cardiaque voire au décès.

 

Après obtention de son Doctorat de médecine et du Diplôme d’Etudes Spécialisées en Pneumologie en 2015, elle a poursuivi son parcours académique par un Master 2 portant sur la caractérisation de la limitation fonctionnelle à l’exercice dans l’hypertension pulmonaire. Elle a ensuite exercé dans le service de pneumologie et soins intensifs respiratoires de l’hôpital Bicêtre ainsi qu’en médecine intensive réanimation à la Pitié Salpêtrière.

 

Elle a réalisé sa thèse de doctorat au sein de l’unité UMR-S 999 dirigée par le Pr Marc Humbert. Ses travaux de recherche ont porté sur l’évaluation du risque de mortalité, l’identification de biomarqueurs pronostiques et la stratégie thérapeutique dans l’hypertension artérielle pulmonaire. Sa thèse a été récompensée d’un prix du département Val de Marne, ainsi que du prix Guy et Suzy Halimi du prix de la Chancellerie des Universités.

 

Après sa thèse de doctorat, soutenue en 2021, elle a poursuivi ses travaux de recherche autour des biomarqueurs dans l’hypertension pulmonaire. Au cours de son parcours post-doctoral au Royaume Uni, au National Heart and Lung Institute de l’Imperial College London, en tant que Marie Sklodowska-Curie Fellowship researcher de 2022 à 2024, elle s’est intéressée aux études omiques et plus particulièrement protéomiques dans l’hypertension pulmonaire. Elle a publié plus de 70 articles dans des revues à haut facteur d’impact telles que Circulation, American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, et European Respiratory Journal.

 

De retour à l’Université Paris-Saclay dans l’unité UMR-S 999 depuis septembre 2024, elle poursuit ses travaux de recherche afin d’identifier des biomarqueurs théranostiques, c’est-à-dire prédictifs de la réponse au traitement.

 

« Il faut toujours viser la lune, car même en cas d’échec, on atterrit dans les étoiles. » - Oscar Wilde

 

-> Contact : athenais.boucly@aphp.fr

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March 20, 12:36 PM
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Ghislaine Dehaene-Lambertz dans l'Express : "TDAH, autistes, dys… plus on stimule ces enfants, plus ils apprennent"

Ghislaine Dehaene-Lambertz dans l'Express : "TDAH, autistes, dys… plus on stimule ces enfants, plus ils apprennent" | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Ghislaine Dehaene-Lambertz est directrice de recherche CNRS, directrice de l’équipe Neuroimagerie du développement, NeuroSpin (Unicog, Inserm/CEA/UPSaclay). Elle va prendre la direction d’un nouvel IHU dédié aux troubles du neurodéveloppement. L’occasion de revenir sur les causes du retard français dans la prise en charge de ces affections.

 

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March 23, 5:31 PM
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SAVE THE DATE ! Les Journées Omiques 2025 – 23-24 juin 2025

SAVE THE DATE ! Les Journées Omiques 2025 – 23-24 juin 2025 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les plateformes omiques végétales du plateau de Saclay organisent les 23 et 24 juin 2025 un colloque dédié aux approches qu’elles développent : "Les Journées des Omiques Végétales".

 

Ces journées, qui se dérouleront cette année pour la première fois à l'IDEEV, sont ouvertes à toutes les personnes intéressées par ces approches et les outils développés par nos plateformes.

 

Ce colloque sera articulé autour de présentations entre le 23 juin après-midi et le 24 juin, couvrant les différentes technologies proposées par les plateformes, des projets innovants menés par des utilisateurs en collaboration avec nos plateformes et aussi les derniers développements technologiques du domaine. Une visite des Plateformes et des discussions avec leurs membres vous sont proposées le 24 juin après-midi.

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March 21, 5:58 PM
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Rendez-vous mensuel du Club Biblio en Immunologie Transdisciplinaire avec Adrien Mouren - Jeudi 27 mars 2025 à 17h

Rendez-vous mensuel du Club Biblio en Immunologie Transdisciplinaire avec Adrien Mouren - Jeudi 27 mars 2025 à 17h | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

FHU CARE-2 vous invite à rejoindre son webinaire mensuel du Club Biblio Immunologie Transdisciplinaire #TIJC.
Date : Jeudi 27 mars 2025, 17h
Sujet : Vaccins à néoantigènes : une nouvelle ère de la médecine de précision en oncologie
Avec : Dr Adrien Mouren, spécialisé en essais cliniques en oncologie et onco-dermatologie (UPSaclay, GR, FHU CARE²).


Inscrivez-vous ici pour recevoir le lien Zoom

 

Découvrez les Replay du Club TIJC

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March 19, 6:48 PM
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Séminaire 2025 du Centre d'Alembert : Penser et agir autrement avec l'Intelligence Artificielle ? - 31 mars 2025

Séminaire 2025 du Centre d'Alembert : Penser et agir autrement avec l'Intelligence Artificielle ? - 31 mars 2025 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
La troisième séance du séminaire "Penser et agir autrement avec l’Intelligence Artificielle ?" se déroulera le lundi 31 mars 2025, de 10 h à 12 h, à l’Institut Pascal, 530 rue André Rivière, 91400 Orsay. Elle sera également diffusée en visioconférence.
 
Cette séance, consacrée à l'impact de l'IA sur la recherche en médecine, sera présentée par :
 
  • Stéphanie Allassonnière, Professeur de mathématiques appliquées à l’UFR de médecine de l’université Paris Cité et Vice-Présidente en charge de l’innovation et la valorisation.
     
  • Pierre-Antoine Gourraud, Professeur des universités en médecine à Nantes Université et praticien-hospitalier au CHU de Nantes. Enseignant versé dans la bio-informatique et la biologie cellulaire, il pratique les ressources éducatives libres depuis plus de 10 ans.
 
Les présentations seront ensuite suivies d'un débat animé par Julien Gargani, Directeur du Centre d’Alembert et Pierre Nicolas, Directeur de Recherche, INRAE.
 
Pour plus d’informations sur le contenu de la séance et pour vous inscrire, veuillez consulter ce lien.
 
La séance est ouverte à toutes et à tous.
 
N'hésitez pas à partager cette invitation.
 
Nous restons à votre disposition pour toute question :  centre.dalembert@universite-paris-saclay.fr
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March 20, 4:48 PM
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RAPPEL ! "La biodiversité : aller vers des soins écoresponsables" - Jeudi 27 mars 2025 à Henri Moissan (Orsay)

RAPPEL ! "La biodiversité : aller vers des soins écoresponsables" - Jeudi 27 mars 2025 à Henri Moissan (Orsay) | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La Graduate School Health and Drug Sciences - HeaDS a lancé une série de conférences sur le développement soutenable avec le Dr Edouard Dossetto

 

Jeudi 27 mars 2025 | 17h à 19h | Amphi Hervé DANIEL

(Bâtiment HM2)

La biodiversité : aller vers des soins écoresponsables 

 

Aujourd’hui directeur de projet transition écologique à la Direction Générale des Entreprises, Dr Edouard Dossetto a été membre de l’équipe de négociateurs français aux COP25 et COP26 pour le Ministère de la Transition Ecologique et a travaillé avec la Première Ministre pour suivre les négociations relatives à l'environnement en général.

 

Liens à visionner avant :

Via Life Sciences UPSaclay
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March 19, 4:13 AM
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RAPPEL ! L’IA générative à l'Université Paris-Saclay : un outil du quotidien pour les chercheur·euses - Lundi 24 mars 2025

RAPPEL ! L’IA générative à l'Université Paris-Saclay : un outil du quotidien pour les chercheur·euses - Lundi 24 mars 2025 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Rendez-vous le 24 mars prochain pour une journée dédiée aux usages de l’IA générative en recherche à l'Université Paris-Saclay

 

Cette journée sera consacrée aux usages de l’IA générative comme outil pour le chercheur ou la chercheuse, dans toutes les disciplines (sciences, technologies, ingénierie et mathématiques, sciences humaines et sociales). L'essor de ces nouveaux outils transforme les pratiques, et certains usages se révèlent particulièrement utiles et prometteurs, tandis que d’autres interrogent voire font l'objet de restrictions imposées par des revues et des conférences scientifiques. La journée vise à mieux cerner ces transformations et contribuer à accompagner les chercheurs et chercheuses dans l’appropriation éclairée de ces outils.

 

 

Parmi les sujets abordés durant la journée :

  • Applications en recherche : de l’astrophysique au droit, en passant par l’économie, comment l’IA générative transforme-t-elle les méthodes et les productions scientifiques ?
  • Enjeux et régulations : certains usages se révèlent particulièrement utiles et prometteurs, tandis que d’autres font l’objet de restrictions strictes, voire d’interdictions imposées par des revues et des conférences scientifiques.
  • Guides et recommandations : face aux enjeux, plusieurs institutions de recherche ont pris position en élaborant des guides de bonnes pratiques. Ces recommandations seront présentées et discutées par leurs co-auteur·rices.
  • Retours d’expérience : témoignages de chercheur·euses ayant développé des outils d'IA générative adaptés à leur domaine.

 

Un évènement organisé par :

  • L'Institut DATAIA
  • La Graduate School Métiers de la Recherche et de l'Enseignement Supérieur (MRES) de l'Université Paris-Saclay
  • Et Serge Pajak (Research Center in Economics & Management, RITM - Univ. Paris-Saclay).
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