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SAVE THE DATE ! Journée scientifique et technique dédiée à la transcriptomique, au single cell et à la biologie spatiale - 23 mai 2024

SAVE THE DATE ! Journée scientifique et technique dédiée à la transcriptomique, au single cell et à la biologie spatiale - 23 mai 2024 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L'Université Paris-Saclay, le réseau GENOPS et Labcluster co-organisent un événement dédié à la transcriptomique, au single cell et à la biologie spatiale pour présenter un panorama des technologies et solutions lors de présentations scientifiques et techniques.

 

Un cocktail déjeunatoire permettra aux participants de prolonger les échanges.

 

  • Lieu : Faculté de Pharmacie, Bâtiment Henri Moissan, Amphi Hervé Daniel, 17 avenue des Sciences, 91400 ORSAY
  • Date : Jeudi 23 mai 2024 de 9h30 à 15h30

 

Le programme est en cours de finalisation et les inscriptions seront ouvertes mi-avril.

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FOCUS PLATEFORME : Séquençage en cellule unique, séquençage direct par nanopore, détection de modifications… Des technologies variées au service des ARNs à l’I2BC

FOCUS PLATEFORME : Séquençage en cellule unique, séquençage direct par nanopore, détection de modifications… Des technologies variées au service des ARNs à l’I2BC | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Des technologies variées au service des ARNs à l’I2BC ! Qu’ils soient messagers, petits, d’expression variée entre cellules, modifiés, ou très structurés, les ARN offrent une vision précieuse du fonctionnement cellulaire et de l’expression des gènes. Mais accéder à toute leur diversité nécessite des technologies de pointe et une connaissance avancée de leurs spécificités. Ces technologies sont accessibles aux équipes de recherche du territoire Paris-Saclay et au-delà grâce à l’équipement et à l’expertise des ingénieurs de la plateforme de séquençage à haut débit de l’I2BC.

 

A l’inverse des méthodes classiques de séquençage d’ARN qui ne fournissent qu’une moyenne des profils transcriptomiques d’une population de cellules, le séquençage d’ARN en cellule unique a pour avantage de donner accès à la diversité des profils transcriptomiques entre cellules, ainsi qu’aux profils de coexpression au sein de chaque cellule. S’appuyant sur la technologie 10X Genomics, la plateforme de séquençage à haut débit de l’I2BC a ainsi collaboré avec l’équipe Levraud/Joly (NeuroPSI/TEFOR Paris Saclay) afin de déterminer les mécanismes de réparation à l’œuvre dans certaines cellules du cerveau (Banerjee et al., 2022), ou avec l’équipe Noordermeer (I2BC) pour étudier l’impact de l’organisation de la chromatine sur l’activité des gènes (Moniot-Perron et al., 2023).

 

Autre technologie disponible, le séquençage Nanopore a pris une importance de premier plan en biologie. Cette technologie de séquençage en lecture longue permet d’obtenir des lectures directes de fragments d’ADN ou de molécules d’ARN (van Dijk et al., 2023). Pour ces dernières, elle permet ainsi l’identification des isoformes d’ARN messagers (épissage alternatif) ainsi que la détection directe des bases modifiées. Cette technologie est applicable par exemple à la détection des modifications présentes sur les anti-codons des ARNt. La plateforme est une des seules en France proposant un service de détection directe des modifications d’ARN avec la technologie Oxford Nanopore.

 

Enfin, la plateforme de séquençage à haut débit a une expertise forte en séquençage des petits ARN (lecture courte). Les technologies de séquençage de nouvelle génération ont révolutionné l’étude des petits ARN (small RNA : sRNA). Cependant, les méthodes classiques de préparation de banques à partir de sRNA introduisent de nombreux biais, principalement lors des étapes de ligation de l’adaptateur. Plusieurs types de sRNA contiennent ainsi un 2'-O-méthyle (2'-OMe) au niveau de leur terminaison 3', inhibant la ligation de l’adaptateur et rendant la préparation de la banque particulièrement difficile. Dans ce contexte, la plateforme a comparé les protocoles existants et développé un protocole original réduisant les biais (van Dijk et al., 2021).

 

A noter dans vos agendas : en juin 2024 aura lieu à l’I2BC une formation spécifiquement dédiée à la préparation des banques NGS (Illumina) à partir des petits ARNs. N’hésitez pas à vous y inscrire : https://cnrsformation.cnrs.fr/preparer-des-banques-ngs-a-partir-des-petits-arn-pour-la-technologie-illumina (Attention : il vous faut copier ce lien dans votre navigateur favori … il ne fonctionne pas en cliquant directement dessus !).

 

Contacts : I2BC-sequencage@i2bc.paris-saclay.fr

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

 

I2BC / Plateforme de séquençage à haut débit. La plateforme de séquençage à haut débit de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC, campus CNRS de Gif-sur-Yvette) collabore étroitement avec un grand nombre d’équipes de recherche du territoire Paris-Saclay et au-delà. Accessible à tous les utilisateurs académiques et industriels, son accompagnement couvre non seulement la mise en place de protocoles et technologies avancées en collaboration avec les équipes, mais aussi la réalisation de prestations de services de séquençage. Son expertise porte sur une grande variété de domaines en transcriptomique ou génomique avec les technologies Oxford Nanopore (lectures longues), Illumina (lectures courtes), ou 10X Genomics (cellule unique). Ses services, outre le conseil et l’accompagnement, couvrent toutes les étapes d’un projet de séquençage, de la préparation de librairies au séquençage mais aussi à l’analyse bioinformatique des données. Enfin, elle est membre de l’infrastructure nationale France Génomique, certifiée ISO:9001/NFX:50-900, labellisée IBiSA, et participe au Réseau des plateformes de génomique de Paris-Saclay (GENOPS).

 

A propos de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC - UMR 9198). L’I2BC est une Unité Mixte de Recherche (CEA, CNRS, Université Paris-Saclay), constituée de 61 équipes de recherches et 16 plateformes technologiques réparties en 6 pôles. Principalement localisé sur le campus CNRS de Gif-sur-Yvette, l’institut est spécialisé dans les approches transverses en biologie cellulaire et moléculaire.

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Le biocontrôle, vers une alternative durable aux pesticides conventionnels ?

Le biocontrôle, vers une alternative durable aux pesticides conventionnels ? | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les solutions de biocontrôle (macroorganismes, microorganismes, substances naturelles, médiateurs chimiques) sont présentées comme des alternatives aux pesticides conventionnels car elles sont supposées avoir des impacts moindres sur la santé des écosystèmes et de l’Homme. Cependant, pour assurer la durabilité des solutions de biocontrôle, les conséquences de leur utilisation et les enjeux liés à la préservation de l’environnement doivent être documentés.

 

Dans une synthèse bibliographique publiée dans Environmental Science and Pollution Research, des chercheurs INRAE des UMR ECOSYS (Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau), ISA (Sophia Antipolis), Agroécologie (Dijon) et SAVE (Villenave d’Ornon), et de l’Université de Perpignan, font le point sur (1) les solutions de biocontrôle existantes, (2) la contamination de l’environnement par ces solutions, (3) leur devenir dans l’environnement, (4) leurs effets écotoxicologiques sur la biodiversité, et (5) leurs effets par rapport à ceux des pesticides conventionnels.

 

Si de nombreuses solutions insecticides et fongicides de biocontrôle sont disponibles, il ne se dégage pas actuellement de solutions herbicides qui puissent être considérées comme fiables et efficaces malgré l’importance des besoins.

 

Très peu d’études ont été publiées sur la contamination du milieu par les solutions de biocontrôle, leur devenir dans l’environnement et leurs effets. Le nombre de résultats le plus important concerne les organismes utilisés depuis plus de vingt ans (coccinelle Harmonia axyridis, bactérie Bacillus thuringiensis), et le plus souvent sous l’angle de leurs interactions avec d’autres organismes de biocontrôle. En effet, l’utilisation d’organismes vivants (micro et macroorganismes) en biocontrôle apporte une dimension spécifique par rapport aux pesticides conventionnels car ils peuvent s’implanter, se multiplier, se déplacer et coloniser d’autres milieux. Concernant les substances naturelles, les quelques résultats existants indiquent que, si la plupart d’entre elles ont une faible écotoxicité, d’autres (abamectine, phosphonates, spinosad) ont une toxicité équivalente voire supérieure à celle des pesticides conventionnels. Enfin, il n’y a presque aucun résultat concernant les médiateurs chimiques.

 

La connaissance des effets non intentionnels des solutions de biocontrôle s’est avérée très incomplète. Les recherches sur la contamination du milieu par ces solutions et leur écotoxicité doivent être amplifiées pour assurer la durabilité de leur utilisation.

 

Contact : laure.mamy@inrae.fr

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Identification et détection d’un peptide biomarqueur et de son énantiomère par nanopore

Identification et détection d’un peptide biomarqueur et de son énantiomère par nanopore | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les acides aminés lévogyres (L-) sont majoritairement retrouvés dans les tissus animaux. Malgré la faible prévalence des acides aminés dextrogyres (D-), ils peuvent être retrouvés naturellement sous forme libre ou intégrés dans des protéines et peptides. Une altération de la régulation de production de ces acides aminés peut avoir des effets importants sur l’organisme, notamment dans le cas de pathologies liées à l’âge comme Alzheimer, où la production de ces acides aminés D- est exacerbée. Ces énantiomères sont considérés comme biomarqueurs potentiels et aucune technique n’est encore capable de les détecter et quantifier à faible concentration en raison de leurs masses et charges nettes identiques. Le développement d’une nouvelle méthode de détection de ces énantiomères représenterait donc un avancement majeur dans le domaine du diagnostic.

 

Le LAMBE (Laboratoire Analyse, Modélisation, Matériaux pour la Biologie et l'Environnement, UEVE/UPSaclay/CNRS/Cergy Paris Université, Evry‑Courcouronnes) a démontré, grâce à une technique de détection électrique par nanopore, l’identification et la discrimination de deux peptides biomarqueurs différents d’un seul acide aminé énantiomère : la L-Arginine et D-Arginine Vasopressine. Ces travaux ont été publiés dans ACS Central Science. Ces deux peptides ont été discriminés grâce à leurs conformations spécifiques en conditions natives ou réductrices. Afin d’identifier spécifiquement les signaux électriques attribués à chaque énantiomère, une analyse en composante principale puis une approche de Monte Carlo ont été utilisées.

 

Contact : Juan.pelta@univ-evry.fr ou benjamin.cressiot@cyu.fr

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A l’interface entre recherche et pédagogie : des étudiants de licence publient la découverte d’un nouveau virus

A l’interface entre recherche et pédagogie : des étudiants de licence publient la découverte d’un nouveau virus | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les bactériophages sont des virus qui infectent les bactéries et sont considérés comme les entités vivantes les plus abondantes sur la Terre. Plusieurs enseignants-chercheurs appartenant à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule - I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) se sont associés afin de découvrir de nouveaux phages infectant la bactérie Corynebacterium glutamicum, organisme essentiel pour la production mondiale de glutamate. Seuls six phages de C. glutamicum ont été caractérisés jusqu’à présent.

 

Dans le cadre des enseignements de licence de biologie à l’université Paris-Saclay, des prélèvements de sols et d’eau ont été réalisés par douze étudiants de 2ème année. Le phage PSonyx, capable d’infecter C. glutamicum, a ainsi été purifié à partir du bassin de la Tuilerie à Massy. A l’aide du microscope électronique de l’I2BC, les étudiants ont observé que la particule virale était un phage caudé avec une queue flexible. Le matériel génétique qu’ils ont purifié a été séquencé grâce au programme de coopération universitaire international SEA-PHAGES (Science Education Alliance- Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science). Ensuite, 21 étudiants de 3ème année ont pris le relais pour analyser le génome de 80 kb. Les deux tiers des 141 gènes échappent à toute prédiction fonctionnelle et représentent un réservoir de fonctions antibactériennes à haut potentiel en biotechnologies.

 

Les résultats de ces enseignements innovants ont été publiés dans Microbiology Resource Announcements. Les 33 étudiants impliqués dans le projet font partie des auteurs de l’article : un tremplin important pour ces étudiants de licence vers la recherche !

 

Contact : ombeline.rossier@universite-paris-saclay.fr ou christophe.regeard@universite-paris-saclay.fr

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Quand une agressivité supérieure compense un déficit de virulence

Quand une agressivité supérieure compense un déficit de virulence | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Prenant pour cas d’étude la rouille brune du blé, une étude expérimentale conduite à BIOGER (INRAE/UPSaclay, Campus Agro Paris-Saclay, INRAE Palaiseau) a montré qu’une agressivité supérieure (composante quantitative de pathogénicité) peut compenser une absence de virulence, c’est-à-dire l’incapacité à infecter des variétés de blé porteuses d’un gène de résistance pourtant largement déployé.

 

L’utilisation de gènes de résistances impose une forte pression sélective sur les populations pathogènes des végétaux, conduisant à l'émergence de nouvelles virulences et parfois leur généralisation. Le travail mené dans l’équipe ADEP de BIOGER sur la rouille brune du blé a révélé que la fréquence des virulences dans la population française de Puccinia triticina ne s’explique pas totalement par le déploiement des gènes de résistance dans le paysage.

 

L’étude publiée dans Journal of Plant Pathology, troisième article issu de la thèse de Cécilia Fontyn, encadrée par Henriette Goyeau, Frédéric Suffert et Thierry Marcel, est né du constat que deux pathotypes (définis par leur combinaison de virulences) ayant dominé le paysage variétal français entre 2012 et 2015 ont été présents à des fréquences équivalentes, en dépit de l'avantage théorique conféré à l’un d’eux (166 317 0) par la virulence au gène Lr3 tandis que l'autre (106 314 0) était avirulent. Les isolats représentatifs du génotype le plus fréquent au sein du pathotype 106 314 0 (G2) ont été plus agressifs que ceux représentatifs du second 166 317 0 (G1), et ce pour les trois composantes testées sur plantules en serre, à savoir l’efficacité d'infection, la période de latence et la capacité de sporulation.

 

Ces résultats expérimentaux inédits démontrent que l'agressivité est capable de compenser une absence de virulence envers un gène de résistance majeur et peut jouer un rôle significatif dans l'évolution des populations pathogènes.

 

Contact : frederic.suffert@inrae.fr

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Les mutations de RAS dans les hémopathies myéloïdes : de nouvelles perspectives cliniques et thérapeutiques

Les mutations de RAS dans les hémopathies myéloïdes : de nouvelles perspectives cliniques et thérapeutiques | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une revue publiée dans Blood Cancer Journal, des chercheurs de l’UMR-S 1287 « Cellules souches hématopoïétiques et développement des hémopathies myéloïdes » (INSERM/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif) font le point sur les mutations de RAS dans les hémopathies myéloïdes.

 

Les mutations des gènes NRAS et KRAS sont retrouvées dans 10 à 30% des hémopathies malignes myéloïdes. Dans l’ensemble, ces mutations tendent à conférer un pronostic défavorable dans les hémopathies myéloïdes aiguës et chroniques. Plusieurs scores pronostiques récents ont d’ailleurs incorporé le statut mutationnel de RAS. Bien que les mutations de RAS ne se comportent pas toujours comme des facteurs pronostiques indépendants, elles influencent significativement la progression de la maladie et la survie des patients. Cependant, leur impact clinique dépend à la fois du type de mutation, du type d’hémopathie, et de la nature du traitement administré. Des données récentes indiquent également que les mutations de RAS entraînent une résistance aux thérapies ciblées, en particulier aux inhibiteurs de FLT3, IDH1/2 ou JAK2, ainsi qu’à la combinaison azacitidine-vénétoclax.

 

L’étude de nouvelles stratégies et combinaisons thérapeutiques qui ciblent plusieurs composants de la voie RAS, à la fois en amont et en aval, constitue un domaine actif de recherche. Cet article vise à fournir une revue complète des connaissances actuelles sur les mutations de RAS dans les hémopathies malignes myéloïdes, incluant leur prévalence et leur distribution, les événements génétiques de coopération, l’architecture et la dynamique clonales, leurs implications pronostiques et leur ciblage thérapeutique.

 

Contact : aline.renneville@gustaveroussy.fr

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Frédéric Taran : la chimie de la cellule vivante

Frédéric Taran : la chimie de la cellule vivante | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Frédéric Taran est directeur de recherche au CEA et chef du service de chimie bioorganique et de marquage (SCBM) au sein du département Médicaments et technologiques pour la santé (MTS – Univ. Paris-Saclay, CEA, INRAE). À l’interface de la chimie et de la biologie, sa spécialité est la chimie bioorthogonale et ses applications dans le domaine de la santé, en particulier pour le diagnostic et le traitement de cancers. Coordonnant plusieurs projets de recherche aux niveaux national et international, le chercheur est un acteur majeur de cette communauté, distingué en 2023 par le Prix Seqens de l’Académie des sciences.

 

Lire la suite du portrait

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Sylvie Granon, interviewée dans Science&Vie – « De multiples influences derrière chacun de nos choix »

Sylvie Granon, interviewée dans Science&Vie – « De multiples influences derrière chacun de nos choix » | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

S'ils paraissent souvent réfléchis et éclairés, nos choix résultent toujours, en fait, d'un complexe engrenage cérébral gouverné par notre inconscient.

 

Qu’ils soient anodins ou déterminants pour notre futur, tous nos choix résultent d’une opération cérébrale. Les psychologues suspectaient donc l’existence, dans le cerveau, d’un mécanisme évaluant les différentes options et orientant le choix vers celle qui avait notre préférence… Or, ces dernières années, les neuroscientifiques ont prouvé que c’était bien le cas. Mieux : plusieurs des structures cérébrales impliquées dans le processus de décision ont été identifiées (voir infographie). Et contrairement à ce que l’on pourrait croire, certaines d’entre elles prennent racine très profondément dans le cerveau, là où même la lumière de la conscience ne pénètre pas. Nos choix s’appuient donc sur une large part d’inconscient.

 

Dans le cortex orbito-frontal

 

Toutefois, avant de s’aventurer dans les tréfonds de notre encéphale, encore faut-il définir ce qu’est la conscience. Si plusieurs théories s’affrontent à son sujet, toutes la définissent comme la capacité à nous rapporter nos propres états et ressentis mentaux. Et toutes la voient émerger dans le cortex cérébral, c’est-à-dire la couche supérieure des hémisphères cérébraux. Particulièrement développée chez les humains, cette région est désignée comme le siège des “fonctions supérieures”, c’est-à-dire du raisonnement, du langage, de la mémoire, de la commande des mouvements volontaires, etc.

 

Forcément, c’est d’abord là que les neuroscientifiques ont traqué les neurones spécialisés dans la prise de décision. Et qu’ils les ont trouvés ! « Dès qu’il y a un choix à faire, que ce soit chez l’homme ou l’animal, nous voyons que le cortex orbito-frontal s’active », témoigne Sylvie Granon, de l’université Paris-Saclay (Institut des Neurosciences Paris-Saclay - NeuroPSI, UMR 9197, CNRS/UPSaclay). « Cette région semble chargée, entre autres, de représenter la valeur des différentes options. »

 

Lire la suite de l’article dans Science&Vie

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Petit déjeuner de l'écosystème PSCC - du 28 mai 2024 avec Franck Berthier

Petit déjeuner de l'écosystème PSCC - du 28 mai 2024 avec Franck Berthier | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Nous avons le plaisir de vous inviter à participer au « petit-déjeuner de l’écosystème » du PSCC, qui aura lieu mardi 28 mai en mode hybride.

 

A l’occasion de cet événement, nous serons ravis d’accueillir Franck Berthier, Vice Président Life Sciences à Biomérieux. Il nous présentera de nouvelles avancées dans l'exploration de l'immunité cellulaire grâce au test VIDAS Life Sciences.

 

Ne manquez pas cette rencontre dans le cadre d’un petit-déjeuner convivial propice aux échanges.

 

Pour vous inscrire, merci de suivre ce lien.

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Les conférences Hépatinov - in vitro bile duct morphogenesis using 3D biofunctionalized scaffolds - 12 juin 2024

Les conférences Hépatinov - in vitro bile duct morphogenesis using 3D biofunctionalized scaffolds - 12 juin 2024 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La conférence du Pr Viasnoff, prévue le 24 avril, est remise au 12 juin 2024.

 

Pour plus d’informations sur le thème de la conférence et pour faire connaissance avec le Pr Viasnoff, consultez notre site.

 

Un lien de connexion vous sera envoyé prochainement.


Via Life Sciences UPSaclay
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La start-up TheraSonic lève ses premiers fonds

La start-up TheraSonic lève ses premiers fonds | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

​Créée fin 2023 et issue du CEA, la start-up TheraSonic annonce une levée de fonds d'1 million d'euros. Objectif : concrétiser le premier essai clinique de sa technologie qui permet de délivrer dans le cerveau des médicaments grâce à l'utilisation d'ultrasons focalisés.

 

Lire la suite de l'Actu CEA-Joliot

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Viva Technology 2024 : IA, développement soutenable, santé et deeptech physique à l’honneur sur le stand de l’Université Paris-Saclay et de ses partenaires

Viva Technology 2024 : IA, développement soutenable, santé et deeptech physique à l’honneur sur le stand de l’Université Paris-Saclay et de ses partenaires | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Viva Technology, le plus grand évènement européen de l’innovation, des technologies et des start-up revient à Paris Expo – Porte de Versailles (Paris 15e) du 22 au 25 mai 2024.

 

Seule université française à y tenir son stand, l’Université Paris-Saclay, ses partenaires et leurs vingt-quatre start-up vous présenteront les technologies les plus en pointe pour répondre aux défis des enjeux sociétaux actuels et à venir, notamment dans les domaines de la physique, de l’intelligence artificielle, de la santé et du développement soutenable.

 

Venez à leur rencontre sur le stand B56.

 

Lire le communiqué de presse de UPSaclay

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Une machine à rayons X compacte lance ses premiers feux

Une machine à rayons X compacte lance ses premiers feux | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le prototype ThomX, installé à l’université Paris-Saclay, est une source de rayons X de petite taille unique au monde. Cette machine pourrait équiper des hôpitaux pour traiter le cancer ou des laboratoires de musées pour étudier leurs pièces.

 

Accélérateur d’électrons de l’installation ThomX au laboratoire IJCLab de l’université Paris-Saclay. Cette machine prototype fait interagir un faisceau d’électrons avec un faisceau laser pour produire des rayons X.

 

A quelques pas des bords de l’Yvette, sur le campus d’Orsay (Essonne) de l’université Paris-Saclay, un bâtiment cylindrique coiffé d’un épais dôme de béton dépasse les laboratoires voisins du haut de ses 22 mètres. A l’intérieur de l’« Igloo », comme il est surnommé, une machine unique est en rodage. ThomX est la source de rayons X la plus brillante et la plus compacte au monde, occupant plus de 100 mètres carrés, soit environ un quart de l’Igloo.

 

L’instrument a de faux airs de modèle réduit de train électrique, avec sa forme circulaire et ses « rails » disposés à 1 mètre au-dessus du sol. Les « wagons » sont des électrons circulant dans des tubes, effectuant un tour du circuit de 18 mètres en 60 nanosecondes, à la vitesse de la lumière. La « gare » est une cavité faite de miroirs dans laquelle la lumière infrarouge d’un laser est amplifiée par des rebonds successifs afin de « percuter » les électrons à chacun de leur tour.

 

Lire la suite de l’article dans Le Monde

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Caractéristiques et pronostic des patients développant une hypertension pulmonaire associée aux inhibiteurs du protéasome

Caractéristiques et pronostic des patients développant une hypertension pulmonaire associée aux inhibiteurs du protéasome | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Certaines drogues et certains médicaments peuvent provoquer une hypertension artérielle pulmonaire (HTAP). La liste de ces médicaments est fréquemment mise à jour et ils sont classés entre « possiblement » et « définitivement » associés à l’HTAP. Le Bortezomib et le Carfilzomib sont des inhibiteurs du protéasome (IP), qui ont récemment été classés comme possiblement associés à l’HTAP dans les dernières recommandations.  

 

Une étude dirigée par le Pr David Montani, de l’UMR-S 999 « Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique » (INSERM/UPSaclay, Le Plessis-Robinson et Le Kremlin-Bicêtre) et du Service de Pneumologie, Centre de Référence de l’Hypertension Pulmonaire (AP-HP, Hôpital Bicêtre), s’est penchée sur les caractéristiques des patients du registre Français développant une HTAP après exposition aux IP, concomitamment à une méta-analyse et une étude de disproportionnalité portant sur la base de données de l’OMS : Vigibase®. Publiée dans le European Respiratory Journal, l’étude a identifiée 11 patients ayant développé une HTAP après exposition aux IP dans le registre Français de l’HTAP : 6 après exposition au Carfilzomib, 5 après exposition au Bortezomib. L’étude de disproportionnalité a identifiée 166 cas d’HTAP après exposition aux IP depuis 2013, et l’étude de disproportionnalité a mis en évidence un signal statistiquement significatif pour le carfilzomib quelle que soit la définition, et le signal était inconstant pour le Bortezomib. La méta-analyse a identifié 17 essais cliniques et le Carfilzomib était associé de manière significative a un plus haut risque de dyspnée, dyspnée sévère et d’HTAP en comparaison au Bortezomib.

 

L’étude conclut que les IP peuvent induire une HTAP et que le Carfilzomib est associé à un signal plus fort que le Bortezomib, et ces patients doivent être surveillés régulièrement. 

 

Légende Figure : 3 méthodes complémentaires utilisées pour l’analyse des cas d’HTAP associés aux inhibiteurs du protéasome. Le Carfilzomib émet un signal plus fort que le Bortezomib.

 

Contact : david.montani@aphp.fr

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Prospectives : les médicaments d’origine naturelle, où en sommes-nous ?

Prospectives : les médicaments d’origine naturelle, où en sommes-nous ? | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les principes actifs d’origine naturelle ont joué un rôle fondamental dans l’évolution de la pharmacie, contribuant à des avancées significatives en matière d’espérance de vie grâce à des traitements tels que les antibiotiques, les antiparasitaires et les anticancéreux. À l’ère des révolutions technologiques, notamment les sciences « omiques » et les sciences des données, ainsi que de l’émergence de nouvelles approches holistiques de la science, la biodiversité continue plus que jamais de fournir aux scientifiques des molécules biologiquement actives.

 

Mehdi Beniddir et Erwan Poupon, membres de l’équipe « Chimie des Substances Naturelles » de BioCIS – Biomolécules : Conception, Isolement, Synthèse (UMR 8076 CNRS/UPSaclay, Orsay), présentent dans un article prospectif publié dans les Comptes Rendus de l’Académie des Sciences, leur analyse de la situation et des défis en 2024 concernant les médicaments « issus de la nature ». Ils dressent également un panorama des différentes initiatives qui visent à fédérer le domaine de la chimie des substances naturelles notamment dans le cadre de l’université Paris-Saclay.

 

Contacts : erwan.poupon@universite-paris-saclay.fr ou mehdi.beniddir@universite-paris-saclay.fr

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Un mécanisme de détection de l’hème par le biosenseur HssS : une nouvelle piste antibiotique ?

Un mécanisme de détection de l’hème par le biosenseur HssS : une nouvelle piste antibiotique ? | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les globules rouges du sang des mammifères contiennent, en grande quantité, une molécule appelée hème (qui donne sa couleur rouge au sang). Cette molécule qui permet notamment la fixation de l’oxygène est aussi très réactive et très toxique. Lors de l’infection, des bactéries pathogènes, comme le staphylocoque doré, envahissent le sang et provoquent une hémolyse des globules rouges. L’hème toxique libéré peut alors rentrer en contact avec le pathogène.

 

Le staphylocoque est capable de détecter l’hème grâce à un senseur d’un système à deux composants spécifique baptisé HssS présent sur sa membrane. La détection de l’hème par ce capteur déclenche un mécanisme de défense aboutissant à la synthèse d’une pompe d’efflux de l’hème, lui permettant de survivre dans le sang et de progresser dans l’infection.

 

Dans une étude publiée dans mBio, des scientifiques de de l'Institut Micalis (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec l’unité BIAM (Université Aix Marseille/CEA/CNRS, Cadarache) ont découvert par quel mécanisme le staphylocoque doré détecte l’hème. La modélisation structurale de HssS et de son interaction avec l’hème a permis de proposer un site de fixation unique pour ce type de senseur à l’interface de la membrane et de la partie extracellulaire du capteur. Une mutagenèse de HssS associée à une étude de sa fonction et de sa capacité à lier l’hème ont permis de vérifier ce modèle.

 

Ce système de défense du staphylocoque lui est indispensable pour survivre dans le sang. Face aux enjeux de l’antibiorésistance, ces résultats ouvrent de nouvelles pistes de stratégies antibiotiques par la recherche d'inhibiteurs de ce biosenseur.

 

Contact : delphine.lechardeur@inrae.fr

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Trutticulture biologique versus conventionnelle : quels impacts environnementaux ?

Trutticulture biologique versus conventionnelle : quels impacts environnementaux ? | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

En France, l’élevage de truite arc-en-ciel se fait majoritairement dans des systèmes conventionnels où l’eau est dérivée d’une rivière pour ensuite circuler à travers les bassins d’élevage avant de retourner à son cours naturel. Le manque d'espace, la disponibilité limitée en eau douce et les préoccupations environnementales notamment concernant la durabilité des aliments aquacoles sont autant d’obstacles à l’expansion de la production conventionnelle de truite. Dans ce contexte, l’aquaculture biologique suscite un intérêt croissant car potentiellement moins impactante pour l’environnement. Toutefois, les évaluations objectives comparant les impacts environnementaux de systèmes piscicoles biologiques et conventionnels sont rares, et n’existent pas pour la trutticulture.

 

Dans une étude publiée dans Journal of Cleaner Production, les chercheurs de l’unité de Génétique Animale et Biologie Intégrative – GABI (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec des collègues rennais, ont utilisé l’Analyse du Cycle de Vie (ACV), approche holistique d’évaluation des impacts environnementaux, pour comparer le bilan environnemental d’une production de truites basée sur des pratiques d’élevage conventionnelles ou biologiques. Pour cela, ils ont développé un modèle réaliste de ferme piscicole, basé sur des données recueillies auprès de fermes aquacoles bretonnes en intégrant les contraintes associées à une production conventionnelle versus celles du cahier des charges de la pisciculture biologique.

 

Ainsi, les chercheurs ont pu montrer que la production de truite biologique réduit considérablement les impacts environnementaux par tonne de truite produite pour la plupart des catégories d'impact étudiées, avec notamment une réduction de 11% pour les émissions de gaz à effet de serre ou encore 35% de l’écotoxicité de l’eau douce. Les seules exceptions sont l’eutrophisation des eaux douces et la dépendance à l’eau, où la production biologique entraîne des impacts plus élevés par tonne de truite. Les bénéfices environnementaux de la production biologique s’avèrent plus importants quand les impacts sont exprimés par unité de surface de production plutôt que par quantité de truite produite.

 

En conclusion, cette étude démontre clairement les avantages environnementaux de la production de truite biologique par des approches de modélisation. Cependant, les chercheurs soulignent la nécessité d'une interprétation prudente des comparaisons d'ACV, pouvant être influencées par les choix méthodologiques d'analyse. Les généticiens travaillent maintenant à l’utilisation des ACV pour la revisite des objectifs de sélection truiticole qui prennent en compte les impacts environnementaux de cette production.

 

Contact : simon.pouil@inrae.fr

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Plasticité cellulaire et co-option vasculaire : mécanismes clés dans la résistance à la chimioradiothérapie du glioblastome

Plasticité cellulaire et co-option vasculaire : mécanismes clés dans la résistance à la chimioradiothérapie du glioblastome | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’équipe « microenvironnement tumoral » dirigée par Giorgio Seano au sein de l’unité Signalisation, Radiobiologie et Cancer (U1021/UMR3347/Institut Curie/ UPSaclay, Orsay) s’intéresse au glioblastome (GBM), un cancer du cerveau très agressif et de très mauvais pronostic afin d’identifier les mécanismes de résistance au traitement.

 

Dans une étude récemment parue dans Nature Communications des scientifiques de l’équipe ont pu mettre en évidence que la chimio et radiothérapie favorisent l’expansion d’un état cellulaire (nommé VC-resist).

 

En utilisant une combinaison d’approches innovantes (analyses transcriptomiques, protéomiques et phosphoprotéomiques, imagerie longitudinale et cultures organotypiques) l’équipe a pu démontrer que les cellules VC-resist sont préférentiellement localisées au contact des vaisseaux sanguins et sont capables de migrer le long des vaisseaux (co-option) permettant ainsi l’infiltration du GBM au sein du tissu cérébral environnant. Le contact de la cellule tumorael avec le vaisseau sanguin mais également les facteurs secrétés par ces vaisseaux sont capables d’induire l’état cellulaire VC-resist.

 

Enfin l’équipe a pu mettre en évidence que la radio et chimiothérapie induisent la co-option des vaisseaux sanguins.

 

Au niveau moléculaire l’équipe a pu montrer que les cellules VC-resist sont induites par l’activation de YAP1 et caractérisées par une résistance aux lésions de l’ADN, un enrichissement en phase G2M du cycle cellulaire et une activation des voies de senescence.

 

Ces résultats démontrent comment la co-option des vaisseaux, la niche périvasculaire et la plasticité des cellules du GBM conduisent conjointement à la résistance à la thérapie pendant la récurrence du GBM.

 

Contact : giorgio.seano@curie.fr

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Portrait Jeune Chercheuse - Clémentine Chirol, chercheuse en imagerie des microhabitats du sol

Portrait Jeune Chercheuse - Clémentine Chirol, chercheuse en imagerie des microhabitats du sol | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Clémentine Chirol est chargée de recherche à l’INRAE au sein de l’UMR ECOSYS (Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau) depuis janvier 2023. L’équipe s’intéresse au fonctionnement des systèmes agricoles face aux changements globaux et explore le levier de l’agroécologie pour l’atténuation et l’adaptation au changement climatique.

 

Clémentine est passée par plusieurs méandres avant de s’intéresser aux sols des systèmes agricoles. Elle a suivi une formation en Géosciences à l’université Pierre et Marie Curie. Des stages Erasmus à l’université de Southampton en Angleterre lui ont apporté une spécialisation en sédimentologie et géomorphologie du littoral. Ses premières recherches se sont centrées sur le fonctionnement et la restauration d’habitats littoraux. Son doctorat suivait l’évolution de marais littoraux restaurés en Angleterre en comparant, par télédétection, la morphologie des systèmes de chenaux irrigant ces systèmes avec ceux présents dans les marais littoraux naturels non perturbés.

 

Au cours de deux projets postdoctoraux en Angleterre (Queen Mary University, Londres) et en France (Laboratoire Sols et Environnement, Nancy), elle s’est ouverte à de nouvelles méthodes et thématiques, en particulier l’utilisation de la tomographie à rayons X pour visualiser et caractériser l’organisation spatiale 3D des sols. Cela l’a conduite à explorer les nombreux liens entre structure et fonctionnalités des sols, telles que leur stabilité, leur capacité de rétention en eau ou leur capacité à stocker du carbone. Elle a effectué des simulations de dynamique du carbone et produit des cartographies de services écosystémiques à l’échelle d’une région aux sols contrastés comprenant forêts, prairies et cultures.

 

Son poste de chargée de recherche à ECOSYS lui offre l’opportunité de considérer le sol comme théâtre d’activité des microorganismes. De même qu’une forêt comporte de nombreuses niches écologiques, le sol peut être considéré comme une mosaïque dynamique de microhabitats dans lesquels les microorganismes vivent et interagissent. L’exploration de ces micro-paysages nécessite de combiner plusieurs techniques d’imagerie (tomographie à rayons X, microscopie optique, microscopie électronique…) pour caractériser leur diversité physico-chimique et structurale. Comprendre les microhabitats du sol permettrait alors de mieux appréhender la fonctionnalité des agroécosystèmes soumis aux changements globaux.

 

All you have is what you are, and what you give.” - Ursula K. Leguin, The Dispossessed

 

Contact : clementine.chirol@inrae.fr

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Rencontre avec Sylvain Fisson, Professeur d'Immunologie à l'Université d'Évry

Rencontre avec Sylvain Fisson, Professeur d'Immunologie à l'Université d'Évry | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Sylvain Fisson est Professeur en immunologie et spécialiste des thérapies géniques oculaires à l’Université d’Évry Paris-Saclay. Il effectue sa recherche à la fois au sein de Généthon à Évry et de l’Institut de la Vision à Paris, toutes deux unités INSERM. Portrait d’un chercheur engagé dans les thérapies innovantes.

 

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Que peut apporter l’électrophorèse capillaire couplée à la détection fluorescente multi-longueurs d’onde dans nos recherches ? - Séminaire le 7 juin 2024 à l'ENS Paris-Saclay

Que peut apporter l’électrophorèse capillaire couplée à la détection fluorescente multi-longueurs d’onde dans nos recherches ? - Séminaire le 7 juin 2024 à l'ENS Paris-Saclay | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’Institut Galien Paris Saclay (IGPS - faculté de pharmacie Paris-Saclay) et l’Institut d’Alembert (IDA-ENS Paris-Saclay) ont récemment acquis un appareil d’Electrophorèse Capillaire (EC) couplé à une détection fluorescente multi-longueurs d’onde (EC-MFD). Cet équipement a été cofinancé par l’Université Paris Saclay (ERM) et de l’ENS Paris-Saclay. Il est composé d’un module d’EC et quatre modules de détection fluorescente LED (LEDIF) permettant de détecter des molécules excitables à 365 nm, 450 nm, 480 nm et 530 nm.

 

Un séminaire de présentation aura lieu à l'ENS Paris-Saclay le vendredi 7 juin 2024 à 11h (salle 1Z31).

4 avenue des sciences, 91190 - GIF-SUR-YVETTE

 

Au cours de ce séminaire nous souhaitons vous présenter cet instrument et son potentiel, son accès et décrire quelques applications possibles dans les domaines de nanoscience, médecine, diagnostics, et sciences (bio)analytiques.

 

La participation au séminaire est gratuite. Pour l’inscription et pour toutes informations complémentaires, veuillez contacter :

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RAPPEL ! Journée scientifique et technique dédiée à la transcriptomique, au single cell et à la biologie spatiale - Jeudi 23 mai 2024

RAPPEL ! Journée scientifique et technique dédiée à la transcriptomique, au single cell et à la biologie spatiale - Jeudi 23 mai 2024 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Vous êtes invités à participer au premier LabCluster sur le plateau de Saclay qui permettra de découvrir les dernières technologies autours de la Microgénomique (single cell et biologie spatiale).

 

Jeudi 23 mai de 9h30 à 15h30 -  Faculté de Pharmacie - Bâtiment Henri Moissan

 

Ces journées d'information, dédiées à la démarche qualité en recherche et aux conseils et astuces techniques, sont conçues autour de conférences et d'ateliers thématiques, animés par des scientifiques et des ingénieurs.

 

Cette manifestation est ouverte à tous chercheurs, ingénieurs et doctorants des laboratoires de science du vivant et de chimie.

En marge des conférences et des ateliers, les participants peuvent aborder leurs problématiques spécifiques au niveau de stands thématiques.

 

Inscrivez-vous gratuitement et consultez la dernière mise à jour du programme sur : www.labcluster.com

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SAVE THE DATE ! Journée de l'École Doctorale Innovation Thérapeutique le jeudi 20 juin 2024

L’Association des Doctorants en Innovation Thérapeutique (ADIT), l’Ecole Doctorale Innovation Thérapeutique : du Fondamental à l'Appliqué (ITFA) et la Graduate School Health and Drug Sciences organisent une nouvelle JED - Journée de l'École Doctorale, le jeudi 20 juin 2024.

 

Celle-ci aura lieu à la :

 

Faculté de Pharmacie- Bâtiment Henri Moissan, le

Jeudi 20 juin 2024

Amphi Olivier Kahn

 

Cette année, nous aurons le plaisir d’accueillir le Pr Yves Lévy (virologue, spécialiste de l’infection par le VIH) qui nous fera l’honneur de partager son savoir-faire scientifique. Nous organisons également une table ronde "career development" avec 3 jeunes diplômés (carrière < 15 ans) qui nous présenteront leur parcours et nous ferons un retour d'expérience.

 

Pour que nous nous organisions au mieux, nous vous demandons de remplir ce google form pour nous signaler votre présence lors de la journée et si vous voulez participer au buffet. 

 

En espérant vous voir nombreux le 20 juin 2024 !

Les membres de l'ADIT

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Vivre avec les insectes : regards croisés

Vivre avec les insectes : regards croisés | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Fascinants et délicieux pour certaines et certains, parasites pour d’autres, les insectes constituent un sujet d’étude aux multiples facettes. Des chercheurs et chercheuses de l’Université Paris-Saclay dévoilent leurs différentes approches sur cette thématique.

Avec plus d’un million d’espèces déjà décrites et environ 10 000 nouvelles espèces inventoriées chaque année, les insectes constituent l’un des groupes les plus complexes et diversifiés du monde animal. Beaucoup de zones d’ombre résident cependant au sein de ce groupe majeur, constituant un formidable terrain d’étude transdisciplinaire.

 

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INSERM - Zoom sur le référent scientifique de site

INSERM - Zoom sur le référent scientifique de site | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’Inserm a mis en place un réseau de 25 référents scientifiques de site (RSS).

 

À la croisée des enjeux locaux et nationaux, le référent scientifique de site représente l'Inserm dans les discussions réunissant les CHU, les agences de programmes, les universités, les écoles et les organismes de recherche. En étroite coopération avec le délégué régional, il veille à ce que la structuration de la recherche en santé du site soit en phase avec la feuille de route définie par l'Institut.

 

Le référent scientifique de l’Inserm pour le site Paris-Saclay (UPSaclay et Polytechnique) est Rodolphe Fischmeister, Directeur de recherche émérite INSERM, Laboratoire de signalisation et physiopathologie cardiovasculaire (UMR-S 1180 Inserm/UPSaclay, Orsay).

 

Lire la suite de l’article sur les missions des RSS

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