La perte de dystrophine dans la myopathie de Duchenne (DMD) est associée à un large spectre de comorbidités cognitives et neuropsychiatriques. Une hyperréactivité au stress a été décrite chez le patient DMD et dans plusieurs modèles animaux de cette pathologie. Chez la souris modèle de DMD, c’est un phénotype sévère et robuste caractérisé par des réponses anormales de peur inconditionnées en réponse à un léger stress, pouvant conduire à une létalité en situation de stress social chronique. Il s’agit d’une cause légitime d'inquiétude pour les patients atteints de DMD, susceptible d'avoir un impact sur la cognition, le comportement et la physiopathologie de la DMD.

Dans un article publié dans Progress in Neurobiology, Cyrille Vaillend (Institut des Neurosciences Paris-Saclay - NeuroPSI, CNRS/UPSaclay, Orsay) et ses collaborateurs Néo-Zélandais (University of Canterbury, Christchurch, New Zealand), passent en revue les nombreuses études qui ont permis de caractériser la nature de ce phénotype, et d’identifier en partie son étiologie multifactorielle, qui implique des circuits cérébraux spécifiques, des altérations neurochimiques et hormonales, et des facteurs physiologiques associés à une dérégulation de la pression sanguine et du système nerveux autonome.

Contact : cyrille.vaillend@universite-paris-saclay.fr

Les pigments sont largement utilisés dans les industries alimentaire, cosmétique, textile, pharmaceutique et des matériaux. La demande de pigments naturels augmente en raison des préoccupations concernant les problèmes de santé potentiels et la pollution environnementale causée par les pigments synthétiques. La production microbienne de pigments naturels est une alternative prometteuse à la synthèse chimique ou à l'extraction à partir de sources naturelles.

Une revue publiée dans Trends in Biotechnology, par l’équipe Cosynus (Armand Bernard, Tristan Rossignol et Young-Kyoung Park) à l’Institut MICALIS (Inrae/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), fait l’état des lieux des connaissances actuelles sur la production de pigments naturels par les levures comme châssis prometteurs. Les caractéristiques avantageuses des levures telles que la facilité de manipulation génétique, la sécurité, la croissance rapide, la diversité métabolique et la tolérance sont décrits. Les stratégies de l’ingénierie métabolique et les stratégies d'optimisation du processus en aval pour améliorer la production de pigments naturels sont minutieusement examinées. Les auteurs discutent aussi des défis, notamment l'élargissement de la gamme de pigments naturels et l'amélioration de leur faisabilité à l'échelle industrielle, ainsi que des stratégies potentielles pour le développement futur.

Contact : youngkyoung.park@inrae.fr ou tristan.rossignol@inrae.fr

Le transporteur ABCB4 est une protéine transmembranaire appartenant à la superfamille des transporteurs ABC (ATP-binding cassette). Son expression est restreinte aux hépatocytes et son rôle est d’assurer la sécrétion de phospholipides (principalement la phosphatidylcholine) dans la bile. Des mutations du gène ABCB4 sont associées à plusieurs pathologies hépatiques rares dont la forme la plus sévère est la cholestase intrahépatique familiale progressive de type 3 (PFIC3). Cette maladie se déclare durant les premiers mois de vie et en absence de traitement efficace, la transplantation hépatique reste souvent l’unique option pour une majorité des jeunes patients.

Dans le cadre d’un projet de recherche translationnelle visant à identifier de nouveaux médicaments candidats comme alternative à la transplantation hépatique, un groupe de recherche de l’UMR-S 1193 (INSERM/UPSaclay, FHU Hepatinov, Orsay) a développé un système cellulaire permettant d’effectuer un criblage à haut débit (ou High Content Screening - HCS) en utilisant des chimiothèques (collections de plusieurs centaines/milliers de molécules), en collaboration avec l’U1177 et la plateforme de criblage de l’Institut Pasteur de Lille. Cette approche, basée sur une technique d’immunofluorescence indirecte permettant de détecter et quantifier la présence d’un mutant d’ABCB4 à la membrane plasmique (normalement retenu dans le réticulum endoplasmique) a permis aux auteurs d’identifier trois molécules candidates parmi plusieurs milliers de molécules testées.

Ces travaux, menés sous la direction du Dr Thomas Falguières (UMR-S 1193), ont permis de montrer l’efficacité des molécules nouvellement identifiées à corriger partiellement le trafic intracellulaire et la fonction de mutants d’ABCB4 retenus dans le réticulum endoplasmique. De plus, par une approche de docking moléculaire in silico en collaboration avec l’UMR 1248 (Limoges), il a été montré que les molécules candidates pourraient interagir avec des résidus d’ABCB4 impliqués dans sa fonction, ce qui expliquerait le faible effet correcteur de ces molécules sur la fonction des mutants du transporteur.

Publiés dans la revue Communications Biology, ces travaux ouvrent la voie vers le développement de nouvelles molécules correctrices qui, à terme, constitueraient une alternative de choix à la transplantation hépatique pour les patients atteints de maladies liées à un déficit d’ABCB4.

Légende Figure : a. Structure d’ABCB4 modifiée utilisé pour le criblage à haut débit (HCS). b. Immunofluorescence indirecte après miniaturisation du système cellulaire pour HCS en utilisant les versions sauvage et mutée d’ABCB4. c. Représentation de l’efficacité de correction des 3200 composés testés lors d’une campagne de HCS. d. Structure des composés identifiés par HCS. e-g. Efficacité de correction de la localisation (e), la maturation (f) et la fonction (g) du variant ABCB4-I541F par les trois composés identifiés par HCS. h. Exemple de docking moléculaire in silico du composé #3 avec ABCB4 sauvage (deux conformations testées).

Contact : thomas.falguieres@inserm.fr

L'aquaculture est le secteur de la production alimentaire qui représente la croissance la plus rapide bien que freinée par les crises environnementales, écologiques ou les épidémies. Le virus de la virémie printanière de la carpe (SVCV) est un pathogène d'intérêt majeur, à déclaration obligatoire pour lequel il n'existe pas de vaccin et dont la maladie peut être modélisée en poisson zèbre (ZF).

Dans une étude récente publiée dans PLoS Pathogens, les chercheurs des unités Virologie et Immunologie Moléculaires – VIM et Infectiologie Expérimentale des Rongeurs et Poissons - IERP (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas) apportent un nouveau regard sur l'étude des interactions hôte - pathogène en ayant levé un verrou technologique par l'obtention de la génétique inverse de ce virus et la production de virus recombinants traçables optiquement. Ces outils de choix ont été exploités pour établir des modèles d'infection par bain en embryon de ZF (3R) et en carpe, hôte naturel du SVCV ; permettant pour la 1ère fois de visualiser les sites de réplication du virus, la cinétique de propagation et d'identifier les organes cibles par imagerie sur corps entier. De façon inattendue, les résultats montrent que le virus entre par les nageoires et non par les branchies comme précédemment rapporté et déclenche une réponse pro-inflammatoire IL1b délétère en l'absence de contrôle de l'infection.

Ce travail ouvre de nouvelles perspectives pour mieux comprendre la physiopathologie de la maladie par une approche multi-échelle et de cribler des stratégies antivirales et immunomodulatrices à haut débit, haut contenu avec le cytomètre à ZF.

Légende Figure : Image de microscopie confocale montrant l'activation de la réponse inflammatoire IL1β en embryon de poisson zèbre (lignée transgénique Tg IL1β:GFP) au niveau d'un foyer infectieux du virus recombinant de la virémie printanière de la carpe exprimant la mCherry (rouge). L'imagerie in vivo a révélé que les nageoires constituaient la principale porte d'entrée du SVCV en poisson zèbre et chez la carpe et que le virus entraine une réaction inflammatoire sévère en l'absence de contrôle de l'infection. Crédit image : Maxence Frétaud.

Contact : christelle.langevin@inrae.fr ou stephane.biacchesi@inrae.fr

Dans une étude publiée dans Cellular and Molecular Life Sciences, les chercheurs de l’unité Virologie et Immunologie Moléculaires - VIM (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec l’hôpital Foch, le CIML-Marseille, le CHU-Caen, ont étudié les phases initiales de l’infection par le SARS-CoV-2 dans le poumon humain, phases importantes de la physiopathologie.

Des travaux conduits avec des modèles de culture ex vivo avaient donné des résultats discordants quant aux cibles initiales pulmonaires du virus et à la réponse innée induite. Grâce à une approche originale consistant à infecter un poumon humain entier maintenu vivant ex vivo à 37°C selon une technique utilisée couramment en transplantation, l’infection initiale a été analysée pendant 10 heures, en respectant l’architecture spatiale tissulaire. Le RNA-seq sur cellule unique a révélé que les macrophages alvéolaires et les macrophages intestitiels (situés sous les cellules épithéliales) sont les cibles principales virales. Par contre, les cellules épithéliales et les monocytes pulmonaires n’étaient pas significativement associées au virus. Après dissociation de tissus pulmonaire, tri en cytométrie, et culture avec le virus, les monocytes/macrophages du poumon ont exprimé des réponses inflammatoires spécifiques en fonction des sous-types cellulaires, des souches virales et des doses, les macrophages interstitiels étant les plus inflammatoires en réponse au virus.

Ces résultats originaux mettent en lumière le rôle des macrophages à l’étape initiale de l’infection, et suggèrent que leur réponse pourrait conditionner l’apparition des lésions ultérieures associées à la gravité, en fonction de la composition initiale alvéolaire en sous populations de macrophages, de la souche virale et de la dose.

Contact : isabelle.schwartz@inrae.fr ou thien-phong.vu-manh@cnrs.fr ou e.sage@hopital-foch.com

Une équipe de l’I2BC (CNRS/CEA/UPsaclay, Gif-sur-Yvette) a exprimé in vitro la région C-terminale transmembranaire de la protéine nsp3 du SARS-CoV-2, impliquée dans la biogenèse de vésicules à double membrane, sièges de la réplication du génome viral. L'observation en microscopie électronique, complétée par une prédiction structurale avec AlphaFold, révèle une organisation hexamérique de cette région de nsp3, composant principal façonnant les pores moléculaires des vésicules. En facilitant le passage de l'ARN viral vers le cytoplasme de la cellule hôte, Nsp3 apparaît comme une cible thérapeutique prometteuse.

Ces travaux sont publiés dans Journal of Virology. Voir aussi la revue dans Médecine & Sciences.

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Contact : virginie.gervais@i2bc.paris-saclay.fr ou marion.babot@universite-paris-saclay.fr

Professeure des universités-praticienne hospitalier de l'Université Paris-Saclay en radiologie à l Institut Gustave Roussy  et directrice adjointe du Laboratoire d'imagerie biomédicale multimodale Paris Saclay BioMaps (CEA/CNRS UMR9011/Inserm UMR1281/UPSaclay, Orsay), Nathalie Lassau a été nommée au grade de Chevalier de la Légion d’Honneur lors du décret du 3 Juillet 2024.

Cette spécialiste des centres de lutte contre le cancer dirige, depuis 2014, l’Institut de formation supérieure biomédicale (IFSBM), un département de la faculté de médecine de l’Université Paris-Saclay. L'IFSBM permet aux étudiant.es ingénieur.es des grandes écoles de se former au milieu de la santé grâce à une collaboration avec CentraleSupélec, l'Institut d'Optique, l'ENS Paris-Saclay, Polytechnique, AgroParistech et Polytech Paris-Saclay. Nathalie Lassau est Vice-présidente de la Société française de radiologie (SFR) en charge des innovations. Elle est également Membre du conseil pédagogique de CentraleSupélec, membre de la CSS7 de l’INSERM, et nouvellement nommée membre de la commission Recherche de l’Université Paris-Saclay, membre du Collège des enseignants en radiologie (Cerf), Membre de l'American Institute of Ultrasound in Medicine (AIUM) et de la Radiological Society of North America (RSNA). Nathalie Lassau est l’auteur de plus de 180 publications. Elle est également à l’origine du premier data challenge, organisé lors des Journées francophones de radiologie 2018. Cet événement comprenait cinq défis simultanés en intelligence artificielle appliquée à l'IRM, au scanner et aux ultrasons. Plus de 5 000 patients ont été inclus en quatre mois par 50 centres publics et privés, avec la participation de 25 équipes pluridisciplinaires composées d'étudiants, de radiologues, d'ingénieurs et d'entreprises. Elle a à son actif plus de 14 Data challenges en Intelligence artificielle organisés avec la Société française de radiologie. Ses travaux de recherche en Intelligence artificielle lui ont permis durant le COVID de menée l’étude SCanCOVIA incluant 1 000 patients et publiée dans Nature.com.

Contact : nathalie.lassau@gustaveroussy.fr

La prochaine séance de la Société de Biologie aura lieu le mardi 24 septembre 2024 à 14h dans l’amphithéâtre Hélène Martel-Massignac à l’Institut Curie, 11-13 rue Pierre et Marie Curie, 75005 Paris. Il sera également possible de la suivre à distance par zoom.

La séance est organisée par Catherine Llorens-Cortes (LPEM CEA-Joliot/UPSaclay SIMoS/DMTS) et aura pour thème « Les nouveaux traitements de l’insuffisance cardiaque ».

Lien Zoom pour participer à la séance en distanciel

Chaque séance de la Société de Biologie fait l’objet de publication d’articles dans la revue « Biologie Aujourd’hui » (EDP Sciences).

-> Nouveau site de la Société de Biologie

SayFood Research Unit (Paris-Saclay Food and Bioproduct Engineering, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau) ce sont 5 équipes de recherche, une halle technologique, des expertises nombreuses, transdisciplinaires et variées … et des travaux en proximité avec les acteurs de la production fromagère !

Pour la première fois la diversité microbienne des fromages AOP et des laits associés à l’échelle du territoire français a été étudiée par une équipe de recherche, composée de chercheurs d’INRAE dont SayFood Research Unit, du CEA, du Conseil National des Appellations d’Origine Laitières (CNAOL) et du Centre National Interprofessionnel de l'Economie Laitière (CNIEL).

C’est dans le cadre du projet MetaPDOcheese*, et grâce à la forte mobilisation des acteurs des filières AOP, que les chercheurs ont analysé des échantillons collectés auprès de 386 producteurs fermiers et fromageries répartis dans toute la France, tout en recueillant des informations détaillées sur les modes de production. Au final, plus de 2 000 échantillons de fromages français portant le label AOP et les 400 laits associés ont été séquencés au CEA par des chercheurs du Genoscope.

En croisant leurs données avec les informations recueillies sur les pratiques de production, les chercheurs ont montré que le facteur AOP (qui englobe aussi bien la zone géographique, la topographie de la région ou encore les facteurs humains) a un impact sur la diversité microbienne retrouvée dans les fromages et les laits. Cela démontre la contribution du savoir-faire régional à l’élaboration du microbiote fromager.

L’ensemble des résultats a été publié le 06 août 2024 dans la revue ISME Communications.

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NeuroPSI / Animalerie, aussi connue sous le nom de code « zootechnie 151 », est la toute nouvelle plateforme d’hébergement en place sur le plateau de Saclay (NeuroPSI, Campus CEA Saclay, 91400 Saclay) ! Cette toute nouvelle installation regroupe maintenant sur un site unique, l’ensemble des prestations autrefois dispersées sur Gif-sur-Yvette et Orsay.

Hier … env. 1200 m2 d’espace, sur deux sites géographiques distincts, pour des espèces « rongeurs » et des espèces « aquatiques » : i) Campus CNRS de Gif-sur-Yvette, bâtiment 32-33, site connu sous l’appellation « Animalerie Centrale » ; ii) Campus de la Faculté des Sciences d’Orsay, bâtiment 440-447. L’animalerie située à Gif-sur-Yvette (env. 800 m2) se trouvait excentrée de la partie laboratoire, sur le côté du bâtiment 32, et datait de 1998. Le site disposait de 12 pièces d’hébergement (3 dites aquatiques et 9 dites rongeurs). L’animalerie était de plein pied, avec le stockage de nourriture et de litière dans le même bâtiment. Les zones à statut sanitaire étaient bien définies, avec notamment pour la zone EOPS, un SAS pour l’entrée des zootechniciens et un autoclave pour l’entrée du matériel. L’animalerie située à Orsay (env. 400 m2), était dispersée sur plusieurs étages du bâtiment dit 440-447, disposait de 14 pièces d’hébergements (3 dites aquatiques et 11 dites rongeurs), toutes de petites tailles, et pour la plupart, démunies de SAS. Les zones à statut sanitaire n’étaient que partiellement définies, mais le site disposait d’un autoclave pour l’entrée du matériel en EOPS. Le site était aussi équipé de 2 laveries : une au 3ème étage et une au 1er étage. Le stock de litière et nourriture se trouvait au RDC, loin des pièces d’animalerie.

Aujourd’hui … env. 2400 m2 d’espace, de plus sur un site unique, et au service exclusivement de rongeurs (souris, rats) et certaines espèces d’oiseaux (canari, diamant mandarin, calopsitte, coq de Bankiva) ; plus de poissons et de xénopes, ces espèces aquatiques sont aujourd’hui gérées par la plateforme TPS-AQUA (ou zootechnie aquatique de TEFOR Paris-Saclay), à quelques mètres seulement puisque également hébergés sur NeuroPSI. Pour la souris, un total de 3 000 cages sont aujourd’hui en service, permettant un hébergement de plus de 10 000 individus (1150 dites conventionnelles ou A1, 1800 réservées en EOPS, une centaine en A2, et près de 250 pour la zone de quarantaine). Pour le rat, ce sont 330 cages avec à nouveau une distribution sous différents statuts sanitaires, permettant l’accueil de près de 900 individus. Enfin, pour les oiseaux, ce sont 7 volières disponibles d’une capacité de 30 individus chacune, et près de 75 cages à taille variable, pour leur reproduction. Le site opère aussi une laverie ultramoderne et de nombreuses annexes (stockage aliments, laboratoires expérimentaux). La laverie dispose de 150 m², avec un zonage en place pour le côté propre et le côté sale. Une pièce donnant sur cette laverie est dédiée au remplissage des cages. La pièce des autoclaves quant à elle, pour l’entrée du matériel en EOPS, donne sur la laverie côté propre. Le stockage de la litière et matériel est située juste à côté de la laverie. Toutes les zones ont deux pièces de stockage dédiées à la zone. La plateforme NeuroPSI / PSI-CO (avec ses pièces dédiées au comportement et chirurgies) est directement reliée par un couloir à la zone conventionnelle où sont hébergés les animaux. Cette plateforme comporte 50 pièces, dont 11 pièces communes qui peuvent être réservées via un logiciel.

Contacts : Valérie Lavallée (valerie.lavallee@cnrs.fr)

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

NeuroPSI / Animalerie (zootechnie 151). Le Service de Zootechnie de NeuroPSI fournit une expertise de haute qualité en technologie des animaux de laboratoire, en particulier pour la recherche en neurosciences. Il est engagé à œuvrer pour faire progresser l’excellence dans la science des soins et du bien-être des animaux de laboratoire, de sorte que ses activités sont dédiées à : i) Assister les chercheurs dans leur mission de recherche de qualité sur l’utilisation des animaux de laboratoire ; ii) Agir en tant que centre de ressources pour les différentes composantes de l’institut sur toutes les questions relatives aux animaux de laboratoire ; iii) Aider les équipes de recherche à atteindre leur objectif de traitement des animaux de laboratoire de manière éthique dans le strict respect des règles ; iv) Fournir une formation et une expertise vétérinaires et du personnel en technologie des animaux de laboratoire.

Dans la revue Cancer Letters, le Dr Julia Delahousse (Service de Pharmacologie - Pr Angelo Paci - Gustave Roussy ; Chaire de Pharmacocinétique – Pharmacie clinique, Faculté de Pharmacie UPSaclay, Orsay) s’est intéressée à l’utilisation des oxazaphosphorines en pratique clinique depuis l’avènement du chef de file, le cyclophosphamide jusqu’à l’exploration de nouveaux analogues, en passant par l’ifosfamide et le trofosfamide. A l’instar du 5-fluouracile, pilier des protocoles de chimiothérapie des traitements des cancers colorectaux, du sein et de l’ovaire notamment, depuis l’optimisation de leur schéma posologique par l’équipe Du Pr A. De Gramont dans les années 80, les oxazaphosphorines ont un profil de tolérance et d’efficacité qui dépend de la dose et du schéma d’administration.

Comme la plupart des chimiothérapies, les oxazaphosphorines sont généralement utilisées à la dose maximale tolérée. Depuis plusieurs années, des schémas métronomiques utilisant ces agents cytotoxiques à faibles doses administrées quotidiennement cherchent au contraire une dose minimale afin de limiter les effets toxiques tout en maintenant leur efficacité. Selon la dose, le mécanisme d'action des oxazaphosphorines diffère. Leur activité est duale : à forte dose, le cyclophosphamide est principalement utilisé pour ses propriétés immunosuppressives notamment dans les traitements dits de conditionnements pour greffes de cellules souches hématopoïétiques, tandis qu'à dose métronomique, il est étudié en clinique contre différents types de cancer, seul ou en association avec d'autres médicaments anticancéreux : des anti-angiogéniques, des immuno-modulateurs, des bloqueurs de points de contrôle immunitaire ou en association à la radiothérapie. La plupart des études montrent des résultats intéressants, dans les cancers du sein, de l'ovaire et de la prostate.

Tirer parti du système immunitaire, utiliser une chimiothérapie à double action antitumorale est une stratégie thérapeutique qui mérite d'être approfondie afin d’optimiser la balance efficacité/toxicité de ces traitements anticancéreux qui continuent de faire la preuve de leur utilité dans de nombreux protocoles de polychimiothérapie.

Contact : angelo.paci@universite-paris-saclay.fr

La technologie des organoïdes et organes-sur-puces (« organs-on-chip ») ainsi que les organes artificiels, permettent de créer des modèles d’organes (poumon, cœur ou intestin) ou de tissus qui reproduisent le micro-environnement complexe et les interactions entre les cellules au sein d’un organe. Ces technologies permettent de mimer le fonctionnement des organes pour étudier diverses maladies, accélérer le développement de nouveaux médicaments, évaluer la toxicité de multiples substances ou encore étudier les interactions hôte-pathogène en réduisant le recours aux modèles animaux.

Ces dispositifs sont composés de modèles cellulaires tridimensionnels cultivés sur des membranes intégrées à une plateforme microfluidique qui permet la perfusion des cellules avec des fluides biologiques, de façon à mimer la structure et l’environnement physiologique de l’organe.

Dans une revue publiée dans Lab on Chip, des chercheurs de l’équipe MicrobAdapt de l’Institut MICALIS (Inrae/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) en collaboration avec la société EdenTech de Paris, l’Ecole Polytechnique de Palaiseau, l’Université de Milan (Italie) et l’Université de Novi Sad (Serbie) reviennent sur l’importance des membranes pour développer les dispositifs microfluidiques pour la science biomédicale. En effet, les dispositifs microfluidiques à membranes intégrées permettent de contrôler le transport de masse dans des environnements contraints. Les membranes sont ainsi un élément clé de la miniaturisation et leur intégration dans les dispositifs microfluidiques offre des solutions pour la reproduction des processus biologiques. Les concepts de la technologie des membranes et les lois régissant le transport de masse, ainsi que les propriétés requises, les matériaux disponibles et les défis actuels sont résumés dans la revue.

La revue représente un point de départ pour les chercheurs qui souhaitent reproduire un phénomène biologique sur puce en appliquant la technologie membranaire, pour faire avancer les applications biomédicales.

Contact : jasmina.vidic@inrae.fr

La protéine kinase ARN double brin-dépendante, également appelée PKR, est un facteur clé de l’immunité antivirale innée. Chez les mammifères, elle est connue pour être impliquée dans l'inhibition de la traduction, l'apoptose et l’activation des réponses pro-inflammatoires. La conservation de ces fonctions antivirales chez les vertébrés inférieurs, notamment les poissons, reste en revanche largement inexplorée.

Dans une étude publiée dans Journal of Immunology, les scientifiques de l’unité de recherche de l’unité Virologie et Immunologie Moléculaires - VIM (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas) ont examiné le rôle de la PKR de salmonidés dans la réponse antivirale. Pour ce faire, des approches complémentaires de surexpression et d’invalidation génique ont été mises en œuvre dans une lignée cellulaire de saumon Chinook (Oncorhynchus tshawytscha).

Cette étude confirme que la PKR de poisson est impliquée dans l'activation de l'apoptose et l'inhibition de la synthèse protéique. Dans un contexte d’infection par le virus de la septicémie hémorragique virale (VSHV), la situation s’avère cependant plus complexe : la PKR ne joue pas de rôle majeur dans l'arrêt de la traduction provoquée par l’infection et n'inhibe pas directement la réplication virale. Au contraire, la PKR semble favoriser la libération des virions dans le surnageant, vraisemblablement en déclenchant une apoptose tardive.

Dans l'ensemble, ces données confirment que la PKR des salmonidés a des fonctions moléculaires similaires à ses homologues mammaliens. En revanche, cette protéine ne semble pas avoir d'effet antiviral majeur contre le VSHV. Cette étude est un exemple en modèle poisson d’évasion des mécanismes antiviraux médiés par la PKR, déjà décrits chez les mammifères.

Légende Figure : Validation par western blot d’une lignée cellulaire de saumon Chinook invalidée pour le gène pkr.

Contact : bertrand.collet@inrae.fr

Dans une étude publiée dans American Journal of Epidemiology, des équipes du Centre d’Epidémiologie et de Santé des Populations - CESP (UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Villejuif), de Santé Publique France, de l’Unité des Virus Emergents, de l’Institut Pierre Louis d’Epidémiologie et de Santé Publique, et de l’Institut de recherche interdisciplinaire sur les enjeux sociaux ont comparé le risque de symptômes post-covid selon la période de première infection aiguë : première (mars-mai 2020) ou deuxième vague épidémique (septembre-novembre 2020, voir Figure).

Leur étude s’est appuyée sur l’enquête Epidémiologie et Conditions de Vie (EpiCov), une cohorte socio-épidémiologique représentative de la population générale vivant en France lancée en mai 2020. Elles ont montré un risque plus élevé de symptômes post-covid six mois après une première infection ayant eu lieu en première vague (14,6%) plutôt qu’en deuxième vague épidémique (7,0%). Cette différence s’observait indépendamment de plusieurs caractéristiques liées à l’appartenance sociale, à l’état de santé et à la gravité de l’infection aiguë des personnes concernées.

Les deux premières vagues épidémiques ayant eu lieu avant la diffusion de vaccins contre le SARS-Cov-2 et avant l’apparition de nouveaux variants du virus en France, la différence observée ne peut s’expliquer par aucun de ces deux phénomènes. Le contexte de l’infection aiguë au SARS-Cov-2, en revanche, pourrait jouer un rôle dans la persistance de symptômes à long terme. En particulier, le manque de connaissances sur l’infection et sur son traitement, ainsi que les conséquences sanitaires et sociales d’un confinement strict, ont pu retarder la rémission de certaines personnes infectées au début de la pandémie.

Contact : anne.pastorello@inserm.fr

Une équipe du Laboratoire d'imagerie biomédicale multimodale Paris Saclay BioMaps (CEA/CNRS UMR9011/Inserm UMR1281/UPSaclay, Orsay), en collaboration avec des immunologistes de l'Université Paris-Cité, a suivi, en imagerie TEP, le métabolisme du glucose comme marqueur de l'impact cérébral de l'exposition à la fumée de cigarette et du sevrage, ainsi que les effets du NFL-101, un candidat-médicament prometteur pour le traitement du sevrage tabagique. En révélant chez un modèle murin la restauration de l'activité normale de la zone cérébrale associée à l'envie de fumer en situation de sevrage, ces résultats sont porteurs d'espoir pour l'arrêt du tabac chez l'Homme.

Ces travaux sont publiés dans ACS Chemical Neuroscience.

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Contact : sebastien.goutal@universite-paris-saclay.fr ou n.tournier@universite-paris-saclay.fr

Lorenzo Sala est chercheur au sein de l'unité Mathématiques et Informatique Appliquées de Génome à l'Environnement – MaIAGE (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas) depuis janvier 2023. Il s'intéresse particulièrement à la synergie entre les mathématiques appliquées et les sciences de la vie, notamment à travers la modélisation de la dynamique des populations et le développement de jumeaux numériques.

En 2013, après avoir étudié l'ingénierie mathématique au Politecnico de Milan, il poursuit ses études avec un master en science et ingénierie computationnelles, toujours au Politecnico, qu'il achève en 2016. Sa passion pour la recherche en biomathématiques se manifeste lors de son mémoire de master intitulé "A Cellular Scale Model of Aqueous Humour Production". Sa thèse de doctorat, soutenue en 2019 à l'Université de Strasbourg (IRMA), porte sur la modélisation mathématique du flux sanguin oculaire et le développement de techniques d'analyse numérique avancées pour la résolution de ce modèle.

De 2019 à 2020, il est Research Associate au département de mathématiques de l'Imperial College London, où il travaille sur un modèle mathématique multi-échelle décrivant l'interaction sperme-mucus. Il rejoint ensuite l'équipe SIMBIOTX à l’INRIA Saclay pour deux ans, où il se concentre sur l'analyse de sensibilité d’un jumeau numérique représentant l'hémodynamique hépatique lors d'opérations chirurgicales telles que la résection du foie.

En janvier 2023, Lorenzo Sala rejoint l'équipe Dynenvie au sein de MaIAGE en tant que chercheur. Son travail actuel porte sur la relation hôte-microbiote, avec pour objectif de développer un jumeau numérique intestinal multi-échelle afin d'étudier le microbiote digestif humain et animal. Ses recherches visent à approfondir l'intégration des données expérimentales dans la modélisation mathématique, contribuant ainsi à une meilleure compréhension des systèmes biologiques complexes.

“The book of nature is written in the language of mathematics.” - Galileo Galilei

Contact : lorenzo.sala@inrae.fr

Cerebral cortex activity is determined not only by local connectivity but also by connections between different cortical « columns », via horizontal connections (in the same brain area) or longer range cortico-cortical connections (between distant areas). In this workshop, we aim at mixing experimental and modeling contributions to understand these different connections and role in computations, in different animal species. Experiments show how cortico-cortical connectivity shapes cortical dynamics, and that this occurs at different scales, from propagating wave patterns in visual or somatosensory cortex, up to large-scale interactions over the whole brain. Models show what types of connectivity and mechanisms are needed to understand these phenomena and their possible role in cortical computations.

Finally, the workshop will give a special place to PhD students, who will constitute the majority of speakers.

Registration is free but mandatory. Please email your intention to attend to Alain Destexhe or Diego Contreras

Address: Institut des Neurosciences Paris-Saclay - NeuroPSI (CNRS/UPSaclay), 151 route de la Rotonde, 91400 Saclay, France. Albe-Fessard auditorium, ground floor.

List of speakers

• Pablo Castro (NeuroSpin, Saclay)
• Diego Contreras (U Penn, Philadelphia)
• Fred Chavane (AMU, Marseille)
• Alain Destexhe (NeuroPSI, Saclay)
• Luc Estebanez (NeuroPSI, Saclay)
• Pavel Haman (Prague University)
• Mathis Millet (ENS Lyon)
• Cyril Monier (NeuroPSI, Saclay)
• Feycal Rezaig (NeuroPSI, Saclay)
• and more to come !

Hôpital Bicêtre, Faculté de Médecine Paris-Saclay,

Bâtiment Recherche

Vendredi 24 septembre 2024

10h-16h

Entrée gratuite mais inscription obligatoire par mail : tristan.verdelet@aphp.fr ou en ligne

MICROBES and the GS Biosphera are joining forces to provide Starting Packages to newly recruited researchers and (assistant) professors joining the MICROBES community.

Deadline for applications: October 15th, 2024

MICROBES and the GS Biosphera call for interdisciplinary research proposals from researchers and (assistant) professors recruited in 2022 or later in a team contributing to MICROBES and/or Biosphera. The Starting Package of up to 15 k€ is intended to generate preliminary data allowing the applicant to apply to other national or international granting organizations. Four to five projects will be funded. The criteria for funding will be the scientific quality of the project, its interdisciplinary character, its potential for priming other funding and the collaboration with MICROBES teams other than the hosting team of the applicant.

For more information, the full text of the call and the application form, write to: peter.mergaert@i2bc.paris-saclay.fr and matthieu.jules@agroparistech.fr, mentioning in the subject line “Starting Package MICROBES – Biosphera”