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A l'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC, Gif-sur-Yvette, Institut Joliot, CEA, Saclay), l'équipe « Modélisation et ingénierie des protéines » et la nouvelle plate-forme « Binders » utilisent la biologie combinatoire et l'évolution dirigée pour générer des protéines artificielles à motifs répétés, appelées alphaReps, qui peuvent lier spécifiquement des protéines cibles choisies. Elles ont entrepris l'ingénierie d'assemblages moléculaires utilisant ces alphaReps et récemment ont cherché à mettre au point un système générique permettant de lier toute structure cible sur une structure porteuse et ainsi d'imager la cible par cryo-microscopie électronique. Elles se sont pour cela associées au pôle de « Biologie Structurale » de l'I2BC et en particulier sa plateforme I2BC / Plateforme de cryo-microscopie électronique (CRYO-EM). Il est encore aujourd’hui difficile de résoudre par cryo-microscopie électronique la structure de protéines de petite taille (MM 100 kDa). L’approche développée permettrait en particulier de lever cette limite. Comme preuve de concept, la GFP (green fluorescent protein) a été choisie comme cible pour la résolution de structure en réalisant plusieurs constructions basées sur les alphaReps. Une alphaRep liant la GFP a été fusionnée directement sur une structure porteuse, ou à une autre alphaRep liant la structure porteuse (double alphaRep 'tête-bêche'). Les protéines ainsi conçues ont été produites et les complexes imagés. Des jeux de données de cryo-microscopie électronique ont été collectés pour six de ces assemblages à façon, suivis d'analyses d'images et de reconstructions 3D. Une preuve de concept du potentiel de la stratégie a été apportée pour un assemblage utilisant comme structure porteuse la béta-galactosidase d'E. coli, un tétramère de symétrie D2 de 520 kDa. La reconstruction 3D montre la double alphaRep tête-bêche liant d'un côté la béta-galactosidase, de l'autre la GFP. Ce premier succès montre les perspectives que la démocratisation de la cryo-microscopie électronique peut ouvrir à l'ingénierie des protéines, en permettant de visualiser rapidement et jusqu'à l'échelle atomique des assemblages conçus rationnellement et/ou par évolution dirigée. Contact : Ana-Andreea Arteni & Stéphane Bressanelli (plt-cryoem@i2bc.paris-saclay.fr) Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI Envie de (re)lire son précédent FOCUS PLATEFORME (17 février 2020)? FOCUS PLATEFORME : Des analyses par cryo-microscopie électronique révèlent les mécanismes d'auto-assemblage de l'α-synucléine, une protéine impliquée notamment dans la maladie de Parkinson I2BC / Plateforme de cryo-microscopie électronique (CRYO-EM). La plateforme dispose d’un cryo-microscope électronique 120 kV (Tecnai, FEI (aujourd’hui ThermoFisher Scientific)), équipé d'une caméra à détection directe (K2 Gatan) et d'un porte-objet refroidi (Gatan 626). Courant 2024, Cryo-EM sera aussi équipé d’un instrument dernière génération (Glacios 2, ThermoFisher Scientific), associé à une caméra Falcon 4i (ThermoFisher Scientific). Ces équipements permettent l'observation des objets biologiques (protéines, complexes multi-protéiques, virus, liposomes, assemblages multi-moléculaires, ...) après coloration négative, ou par cryo-microscopie électronique dans leur milieu aqueux naturel. La coloration négative permet de vérifier la qualité et l'homogénéité des échantillons, mais aussi d'avoir une idée de la forme des objets et éventuellement de déterminer la stœchiométrie de certains assemblages. Les images obtenues en cryo-microscopie électronique sur l’équipement à venir (Glacios 2, ThermoFisher Scientific), ainsi que les moyens de calcul déjà disponibles sur la plateforme, permettront le crible de grilles et la détermination de structures 3D à haute résolution (3Å). Ces premières structures permettent d'accéder aux microscopes plus puissants (eg. 300 kV Titan Krios de SOLEIL (Saclay, 2024), de l'ESRF (Grenoble) ou de l'IGBMC (Strasbourg)), menant aux résolutions atomiques. La plateforme permet aussi l'observation de complexes in situ (protéines à la surface d'organites purifiés ou de virus enveloppés, protéines membranaires reconstituées dans des liposomes, etc.) par cryo-tomographie électronique. Cette plateforme fait partie du pôle des plateformes de Biologie Structurale de l'I2BC qui comprend : i) les plateformes de Cristallisation, RMN, CryoEM, Mesures d'Interactions Macromoléculaires, et ii) les plateaux techniques d'Expression de protéines solubles ou membranaires en levures, Expression des protéines en cellules d'insectes et Bioinformatique structurale. D’autre part, cette plateforme, ainsi que trois autres (cristallisation, Mesures d'Interactions Macromoléculaires (PIM) et binders (alphaReps) sont aujourd’hui labélisées IBISA sous la bannière BioStruct@UPSAY. A propos de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC - UMR 9198). L’I2BC est une Unité Mixte de Recherche (CEA, CNRS, Université Paris-Saclay), constituée de 60 équipes de recherches et 15 plateformes technologiques, provenant de 8 unités de recherches (CGM, IBBMC, IGM, ISV, LEBS, VMS, SB2SM, SBiGeM). L’institut est réparti sur 3 sites de recherche (Campus d’Orsay Vallée de l’Université Paris-Saclay, Campus du CNRS de Gif sur Yvette et Campus du CEA / Centre de Saclay) au sein de 14 bâtiments jusqu’au rassemblement programmé sur le campus du CNRS de Gif-sur-Yvette.
SAVE THE DATE ! Jeudi du PSCC#9 - "Focus sur les Vaccins en Oncologie" - 11 janvier 2024
Le prochain jeudi du PSCC (en mode hybride : distanciel / présentiel à la Faculté de Médecine du Kremlin-Bicêtre) aura lieu le jeudi 11 janvier 2024, de 16h30 à 18h et se poursuivra par un temps d’échange convivial. Cet événement portera sur les Vaccins en Oncologie. Nous bénéficierons de trois interventions, par des acteurs issus de la recherche, de l’industrie et des investisseurs. Le programme et le lien d’inscription seront disponibles prochainement.
La Fondation Recherche Cardio-Vasculaire – Institut de France poursuit son engagement et lance pour l’année 2024 un nouvel appel à projets de recherche destiné à promouvoir la recherche biomédicale et en santé sur le « cœur des femmes » (recherche cardiovasculaire fondamentale, translationnelle, clinique, épidémiologique ou sur le système de soins). Dans le cadre de ce programme de recherche, la Fondation attribuera deux subventions (pour une durée d’au plus 2 ans) d’un montant de 30 000 euros chacune. Chacune des subventions pourra compléter un financement de recherche cardio-vasculaire déjà acquis, ou permettre d’initier un nouveau programme spécifique. Les projets soumis doivent documenter clairement une problématique sexe/genre négligée dans le domaine de la recherche cardiovasculaire. Le dossier de candidature doit comprendre : - Le CV du responsable de la recherche comprenant 10 principales publications et la raison de leur sélection
- La composition de l’équipe/laboratoire de recherche
- Une lettre d’intention (≤2 pages)
- Un résumé grand public (1/2 page)
- Un projet de budget faisant apparaître les cofinancements éventuels
Date limite de dépôt des dossiers : jeudi 15 février 2024 Important : L’attention des candidats est attirée sur le fait que les dossiers incomplets ou arrivés après la date limite de dépôt ne seront pas examinés. Les dossiers de candidatures doivent être adressés par courrier électronique en un fichier unique (format PDF) à l’adresse suivante : alice.carron@institutdefrance.fr Pour tous renseignements complémentaires, vous pouvez contacter le Bureau des Fondations : Tél. : 01 44 41 45 08 – E-mail : alice.carron@institutdefrance.fr L’appel à candidatures est également consultable en ligne à l’adresse suivante : www.institutdefrance.fr
Le plan Innovation Santé 2030 vise à restaurer la position de la France dans le champ de l’innovation en Biologie/Santé. Pour revenir au meilleur niveau international, la France doit augmenter son investissement sur toute la chaine de valeur, de la recherche fondamentale en sciences du vivant, à la recherche translationnelle et clinique en santé et soutenir l’innovation. Elle doit aussi se donner les moyens d’attirer ou de maintenir sur le territoire national les meilleurs chercheurs mondiaux dans leur domaine. Leaders de la recherche en Biologie /Santé, ces chercheurs porteront l’ambition nécessaire pour mettre la France en tête des pays capables de générer la connaissance scientifique, à même de produire l’innovation et de favoriser le développement des Biotechs et des Medtechs, dans le but d’améliorer la santé publique et d’attirer les investissements internationaux et les grands industriels de santé. La mesure « Chaire d’excellence en biologie/santé » a ainsi pour objectif d’offrir à des chercheurs de premier plan et de toutes origines des financements conséquents pour mener en France de nouveaux projets d’envergure sur une durée de 5 ans. Ces chaires seront ouvertes soit à des chercheurs travaillant déjà dans une institution française soit à des chercheurs exerçant à l’étranger désirant venir créer une équipe ou rejoindre une structure en France. Elles permettront le développement de leurs programmes de recherche et seront un levier pour candidater aux appels d’offres européens d’envergure. Le budget de cet appel est fixé à 80 M€ pour un montant maximal de 2 M€ par chaire. Cet appel fera l’objet de 3 levées par an, et la sélection des lauréats sera opérée au moyen d’un appel à projets en deux temps. La phase 1 est une étape de présélection à l’issue de laquelle seules les candidatures présélectionnées seront invitées à déposer un dossier complet et seront auditionnées (phase 2). Dates de remise des lettres d’intention (PHASE 1) : 11 janvier 2024 à 11h (heure de Paris) Dates de remise des dossiers complets (PHASE 2) 16 janvier 2024 et 22 mai 2024 à 11h (heure de Paris) Documents de références et site de soumission Documents de de soumission
"Nos belles histoires", première conférence avec Bertrand Serlet Mardi 12 décembre 2023 à 18h30
Grand amphithéâtre de l'Institut Pascal 530 rue André Rivière, 91400 ORSAY Lien d'inscription En cette fin d’année 2023, l’Université Paris-Saclay a le plaisir d'inaugurer un nouveau cycle de conférences d’alumni à destination de sa communauté étudiante. « Nos belles histoires » donneront la parole à des personnalités aux parcours particulièrement inspirants. La conférence de lancement de ce nouveau cycle aura l’honneur d’accueillir l’informaticien et ingénieur logiciel renommé Bertrand Serlet, qui reviendra sur les enseignements tirés de ses mentors. Elle se déroulera le 12 décembre 2023 à 18h30 dans le Grand amphithéâtre de l’Institut Pascal, à Orsay. Diplômé d’un master de mathématiques de l’ENS Paris-Saclay, docteur en informatique de l’Université Paris-Saclay, Bertrand Serlet a commencé sa carrière en tant que chercheur chez Inria. Expatrié aux États-Unis, il a rejoint Xerox PARC, puis les entreprises NeXT et Apple, créées par Steve Jobbs, où il a joué un rôle clé dans le développement de systèmes d'exploitation et de technologies logicielles. Il est également le cofondateur de la start-up Fungible et a récemment été vice-président software engineering chez Microsoft. Fait original des conférences de ce cycle, chacune se conçoit comme un dialogue entre une personnalité exceptionnelle issue de l’Université Paris-Saclay et un second interlocuteur ou interlocutrice, également issue de l’Université et évoluant dans un domaine ou un écosystème proche de la personnalité invitée. Le 12 décembre prochain, Bertrand Serlet sera ainsi interviewé par Michel Safars. Diplômé d'un DUT mesures physiques de l'Université Paris-Saclay, Michel Safars est un entrepreneur et professeur en stratégie & entreprenariat à HEC Paris. Il est le fondateur de xCUB, un programme complet de création et de maturation de PME innovantes soutenu par des grandes entreprises souhaitant développer leur activité par des innovations soutenables, dont le marché a besoin et rapidement intégrables. Venez rencontrer ces personnalités et découvrir leurs parcours à l’occasion du lancement de ce nouveau cycle de conférences ! D’autres conférences auront lieu en 2024. Laissez-vous inspirer et porter par nos belles histoires ! Informations pratiques : - Mardi 12 décembre 2023 à 18h30
- Grand amphithéâtre de l’Institut Pascal 530 rue André Rivière, 91400 ORSAY (lien Google Maps)
- Durée approximative de la conférence : 1h30
- L'événement sera suivi d'un cocktail.
- Inscription :l’entrée est gratuite mais le nombre de places dans l’amphithéâtre étant limité, nous vous demandons de bien vouloir vous inscrire en amont de l’événement au lien suivant.
Lire le communiqué de presse UPSaclay
We are pleased to invite you to the first Interdisciplinary Microbes Symposium By Young Researchers that will be held on February 5-6, 2024 in Orsay (Paris area) in France. The symposium aims to join master students, PhD students and post-doc researchers as well as senior scientists interested in microbes in all their forms (bacteria, archaea, viruses, unicellular eukaryotes) and from the perspective of any discipline (biology, chemistry, physics, applied mathematics, engineering). Five thematic sessions are organized: health & disease, ecology & evolution, biotechnology & engineering, agriculture & food and Giving some space to microbes. The sessions will feature cutting-edge presentations on exciting interdisciplinary approaches, new developments and future directions in their area. The symposium will provide a platform to PhD students and post-docs to present their projects and results through oral (20-minute or pitch talk) or poster presentations. Participants will have the opportunity to network with young and senior researchers. Online registration is now open to all researchers and is free for master students. Travel costs and accommodation will be offered to selected applicants for a 20-minute talk and the most accomplished poster presentation will receive a best-poster award. The symposium is organized by members of MICROBES, which is an interdisciplinary center at the Paris-Saclay University, dedicated to training, research and technology transfer in microbial sciences.The objectives of MICROBES are the fundamental understanding of microbial organisms as well as research, training and innovation related to societal challenges including health, environment, climate, energy, biodiversity, agriculture, food and industrial renovation.
Appel à projets MCMP 2024 - Approches interdisciplinaires des processus oncogéniques : Exploration fonctionnelle du microenvironnement des cancers de mauvais pronostic
Objectifs : L'objectif général de cet appel à projets est de financer des projets interdisciplinaires ou multi-intra-disciplinaires (mettant jeu plusieurs sous-disciplines très différentes d'une même discipline) qui permettront la caractérisation fonctionnelle du microenvironnement des cancers de mauvais pronostic. Il s'agit de mieux comprendre le rôle du microenvironnement tumoral dans le développement de cancers pour lesquels les options thérapeutiques sont peu efficaces et se caractérisent par un taux de survie nette standardisée à 5 ans après le diagnostic inférieur à 33%. Quatre axes de recherche nous sont proposés : la caractérisation spatio-temporelle haute définition du microenvironnement conduisant à une étude fonctionnelle ; le décryptage haute définition des réseaux cellulaires et de signalisation locale ; la reprogrammation du microenvironnement tumoral ; la mise au point de modèles in vitro ou ex vivo reproduisant l'évolution spatiotemporelle du couple tumeur/microenvironnement. Un large panorama de spécialités est concerné : incluant notamment biochimie, mécanobiologie, biologie cellulaire, chirurgie, anatomopathologie, infectiologie, immunologie, biologie des systèmes vasculaire et lymphatique, hématologie, bio-ingénierie, analyse d'images, technologies de profilage et technologie spatiale, biologie du cancer, clinique, physique, biophysique, chimie, mathématiques. La proposition doit comporter entre 2 et 4 équipes appartenant à des disciplines ou sous-disciplines différentes. Le même projet ne peut pas être soumis aux appels MIC ou PCSI 2024. Les projets doivent porter sur des tumeurs de mauvais pronostic avec un taux de survie nette standardisée à 5 ans après le diagnostic < 33%, dont il faudra apporter la justification. Une même équipe ne peut déposer qu'un seul projet que ce soit en tant que Coordinateur, Coordinatrice de Projet ou Partenaire. La programmation scientifique de cet appel à projets est réalisée par l'ITMO Cancer d'Aviesan. La gestion opérationnelle est effectuée par nos ami(e) de l'Inserm.
Documents à télécharger Soumission en ligne : https://www.eva3.inserm.fr Date limite : 8 février 2024 à 17h Contact : cancerinserm.mcmp@inserm.fr
Les scientifiques de l’Institut Jean-Pierre Bourgin – IJPB (NRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) et de la société Core Biogenesis ont développé un nouveau système de production de protéines virales membranaires dans les plantes. Grâce à une approche de biologie de synthèse, ils ont pu produire les protéines membranaires E et M du SARS-CoV-2 et les cibler à la surface des gouttelettes lipidiques végétales. Cette stratégie, publiée dans la revue Biotechnology Journal, permet une purification facilitée de ces protéines par flottaison et pourra être appliquée à d'autres protéines hydrophobes d'intérêt thérapeutique. Contact : marine.froissard@inrae.fr
Avec le développement des méthodes d’apprentissage, des outils sont nécessaires pour capturer et formater les annotations faites par les expérimentateurs sur leurs images. En biologie du développement, les lignages cellulaires sont généralement reconstruits à partir de séquences temporelles d’images. Cependant, la fixation des tissus est parfois nécessaire pour avoir une meilleure visualisation des cellules. Les cellules végétales présentent la particularité d’être entourées de parois rigides. L’historique des divisions cellulaires successives reste ainsi gravé dans l’agencement relatif des cellules au sein des tissus, ce qui permet à l’expérimentateur averti de reconstruire les lignages cellulaires à partir d'images statiques. Des chercheurs de l’Institut Jean-Pierre Bourgin – IJPB (NRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) et de MaIAGE (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas) travaillant sur la variabilité de l'organisation cellulaire des embryons d'Arabidopsis thaliana ont développé une interface pour aider à construire, modifier et sauvegarder un lignage cellulaire. Cette interface permet également une annotation des cellules présentes au sein de l'arbre de filiation des divisions. De plus, des outils de manipulation de l'arbre et d'extraction de sous-ensembles de cellules dans des images séparées sont inclus dans cette interface. L'interface est accessible dans imageJ/Fiji, un logiciel de manipulation d'image très facile d'utilisation et largement utilisé dans la communauté scientifique. Plusieurs exemples d'utilisation sont présentés dans l'article publié dans Plant Methods. Contact : elise.laruelle@gmail.com
Dans une étude publiée dans JCI Insight, une équipe de l’Institut des Neurosciences Paris-Saclay – NeuroPSI (CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), en collaboration avec des équipes de l’Institut des Neurosciences de Montpellier (INM), a démontré l’implication du gène TBC1D32 dans la survenue de rétinites pigmentaires, maladies génétiques dégénératives de la rétine conduisant à une perte de la vision. Actuellement, chez environ 40% des individus affectés par une rétinite pigmentaire, les origines génétiques demeurent indéterminées. La présente étude relate les cas de quatre patients touchés par cette affection, provenant de 3 familles non apparentées, et présentant des variations génétiques au niveau du gène TBC1D32. Afin de savoir si ces mutations pouvaient être à l’origine des dystrophies rétiniennes, une approche in vivo utilisant des embryons de xénope a été combinée à une stratégie in vitro basée sur des organoïdes dérivés d’iPSC provenant d'un patient. Ces travaux ont mis en évidence le rôle central de TBC1D32 dans la ciliogenèse des cellules de l'épithélium pigmentaire rétinien, ainsi que dans le processus de différenciation des photorécepteurs. L’ensemble de cette étude met en lumière le rôle crucial de TBC1D32 dans le développement de la rétine et démontre que des mutations dans ce gène peuvent entraîner la survenue d’une rétinite pigmentaire. Ce travail contribue ainsi à pallier les lacunes diagnostiques actuelles et à recommander l’inclusion du gène TBC1D32 dans la liste des gènes à cribler lors du dépistage de la rétinite pigmentaire, qu'elle soit isolée ou syndromique. Contact : caroline.borday@universite-paris-saclay.fr ou muriel.perron@universite-paris-saclay.fr
Les peptides de signalisation CEP (« C-terminally Encoded Peptides ») sont à la base des voies systémiques régulant l'acquisition d'azote (N) dans différentes plantes, d'Arabidopsis aux légumineuses, en fonction de la disponibilité en N minéral (par exemple le nitrate) et de la demande en N de la plante entière. Des études récentes sur la légumineuse modèle Medicago truncatula ont révélé comment les peptides CEP produits par les racines contrôlent la compétence pour l'endosymbiose avec des bactéries du sol rhizobia fixant l'azote atmosphérique, via le récepteur CRA2 (« Compact Root Architecture ») agissant dans les parties aériennes. Parmi les gènes CEP, MtCEP7 s’est révélé étroitement lié à la nodulation. L'équipe SILEG de l'IPS2 (CNRS/INRAE/UPSaclay/UEVE/UParis, Gif-sur-Yvette) a récemment publié dans New Phytologist que la régulation temporelle dynamique de l'expression de MtCEP7 reflète la capacité de la plante à maintenir en fonction de l'efficacité symbiotique de la souche de rhizobium utilisée une fenêtre différente de compétence racinaire pour la nodulation, et même la capacité à réinitier une nouvelle fenêtre de compétence racinaire. Contact : florian.frugier@universite-paris-saclay.fr
Malgré l'efficacité prometteuse des bloqueurs des points de contrôle immunitaires (ICB), notamment les anticorps anti-CTLA4 (antigène 4 du lymphocyte T cytotoxique), la résistance tumorale et les effets indésirables auto-immuns liés à l’activation du système immunitaire entravent leur succès dans le traitement du cancer. L'administration locale de l’immunothérapie, directement dans la tumeur, est une approche intéressante pour surmonter ces effets indésirables tout en induisant des réponses durables. Le nombre d'essais cliniques portant sur l'injection intratumorale a considérablement augmenté au cours des dix dernières années, démontrant des résultats prometteurs. Cependant, une compréhension approfondie de la distribution locale et systémique des ICB après une administration intratumorale, ainsi que leur impact sur les tumeurs à distance, reste cruciale pour optimiser leur potentiel thérapeutique. Deux laboratoires de l'Université de Paris-Saclay, en collaboration avec Lambros Tselikas du Service de Radiologie Interventionnelle et du Laboratoire de Recherche Translationnelle en Immunothérapie - LRTI de Gustave Roussy (Villejuif), et Charles Truillet du Laboratoire d'Imagerie Biomédicale Multimodale Paris-Saclay – BioMaps (INSERM/CNRS/CEA-Joliot/UPSaclay, Orsay), ont associé leur expertise en radiologie interventionnelle et en immuno-tomographie par émission de positons (immunoTEP) pour évaluer de manière dynamique l'impact des anti-CTLA4 sur le site d'injection et les lésions tumorales à distance. Le monitoring par ImmunoPET d'anti-CTLA4 radiomarqués a démontré une biodisponibilité locale supérieure du médicament avec une injection intratumorale, une exposition systémique réduite dans les tissus sains avec une accumulation équivalente, et une efficacité accrue dans les tumeurs à distance, non injectées, par rapport aux souris traitées par voie intraveineuse. Ces résultats, publiés dans Journal for ImmunoTherapy of Cancer, soulignent l'importance de l'imagerie ImmunoPET et de la modélisation pharmacocinétique en tant qu'outils précieux pour améliorer la radiologie interventionnelle, largement utilisée dans les protocoles cliniques, et pour offrir un biomarqueur prédictif puissant. Légende Figure : Étude pharmacocinétique corps entier de l'injection d'anti-CTLA4. Avec des comportements pharmacocinétiques issus de la linéarisation Patlak du groupe intraveineux utilisé comme voie d'injection de référence et du groupe intratumoral, en particulier avec les lésions tumorales à distance Contact : charles.truillet@universite-paris-saclay.fr ou lambros.tselikas@gustaveroussy.fr
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Dans le cadre de sa mission de transfert de technologies, la SATT Paris–Saclay organise, à intervalles réguliers, des appels à candidatures auprès des laboratoires de recherche de l’Université Paris-Saclay et de l’Institut Polytechnique de Paris. Les 3 dispositifs d’accompagnement Prochaines dates de clôture : 23 janvier 2024 | 5 avril 2024 | 18 septembre 2024 Pour plus d’informations : maturation@satt-paris-saclay.fr Télécharger le calendrier 2024
The EU4Health work programme for 2024 focuses on: - Crisis preparedness (budget: € 485 517 000);
- Health promotion & disease prevention (budget: € 70 900 000);
- Health systems & healthcare workforce (budget: € 41 404 000);
- Digital (budget: € 25 750 000).
- Cancer (€ 117 600 000)
Colloque sous l'impulsion du Conseil Scientifique de la Faculté de Médecine Paris-Saclay Régulations épigénétiques et post-transcriptionnelles : de la physiopathologie à l’innovation thérapeutique Lundi 25 mars 2024 de 9h à 17h30 Auditorium du bâtiment recherche
Faculté de Médecine Paris-Saclay
Le Kremlin-Bicêtre Appel à communications L'appel à communications est ouvert à tous les doctorants, enseignants-chercheurs, chercheurs et praticiens hospitaliers ayant des projets de recherche en lien avec les thématiques du colloque. Les résumés retenus pourront faire l'objet d'une présentation lors du colloque sous forme d’une communication orale (7 minutes de présentation et 3 minutes de discussion) ou d’un poster (espace de 85 cm de largeur et 130 cm de hauteur). Les résumés sont à soumettre par mail à recherche-faculte.medecine@universite-paris-saclay.fr jusqu'au lundi 5 février 2024. N’oubliez pas de préciser si vous candidatez pour une communication orale, un poster ou les deux et la thématique concernée. Le programme du colloque est articulé autour des thématiques suivantes: - Épigénétique et régulation post-transcriptionnelle en endocrinologie et métabolisme
- Épigénétique et régulation post-transcriptionnelle en inflammation et autoimmunité
- Épigénétique et régulation post-transcriptionnelle en cancérologie
Contact : recherche-faculte.medecine@universite-paris-saclay.fr
Le président Macron installe ce jeudi 7 décembre une nouvelle instance : un conseil présidentiel de la science, composé de 12 chercheurs qui l'éclaireront sur les grands enjeux scientifiques. Après une longue séquence internationale, Emmanuel Macron a ouvert cette semaine plusieurs rendez-vous autour de la science, de la recherche et du plan d’investissements France 2030 pour lequel il va effectuer un déplacement à Toulouse lundi 11 décembre. Ce jeudi, il doit recevoir à l'Elysée plusieurs centaines de chercheurs et d’entrepreneurs pour parler d'avenir et d'innovation. Emmanuel Macron installera également ce jeudi le « Conseil présidentiel de la Science », une nouvelle instance placée auprès de lui et composée de douze chercheurs qui auront vocation à le conseiller sur les sujets scientifiques et l’aider dans la mise en œuvre des politiques publiques, selon l’Élysée. Ce nouveau conseil scientifique rappelle autant le Conseil scientifique Covid créé au moment de la pandémie et présidé par le professeur Delfraissy que le Council for Science and Technology qui conseille le Premier ministre britannique sur les questions scientifiques et sur l’innovation. Le nouveau conseil n'aura pas de président et il ne concurrencera pas les autres instances comme l'Académie des sciences qui éclairent le débat public. Le Conseil présidentiel de la Science donnera des avis au Président qui ne sont pas rendus publics. L'Élysée a détaillé ce mercredi soir la composition de cette instance composée de 12 chercheurs de renoms représentants un large panel de disciplines. Parmi ceux-ci figure Fabrice André, Directeur de la recherche de Gustave Roussy depuis 2020. Oncologue, professeur de médecine à l’université Paris-Saclay, ses travaux mettent en œuvre différents axes complémentaires de la recherche en oncologie, notamment la bio-informatique et les biotechnologies. Il est classé parmi les 25 personnalités les plus influentes dans le domaine de la médecine de précision par le think tank BIS Research. Il a été distingué par les prix Young Investigator et Career Development Award de l’American Society of Clinical Oncology (ASCO). Il est rédacteur en chef de la prestigieuse revue internationale Annals of Oncology. En 2021, il est lauréat du Outstanding Investigator Award for Breast Cancer Research décerné par le SABCS et l’American Association for Cancer Research (AACR). Plus d’infos dans les articles de La Dépêche, Le Figaro, le JDD, TFI Info
Séminaire 2024 du Centre d'Alembert Qu’apportent les sciences participatives aux pratiques de recherche ? Mardi 16 janvier 2024 de 14 h à 16 h À l’Institut Pascal – Petit Amphithéâtre 530 rue André Rivière 91400 Orsay (entrée libre) Plan d'accès et en visioconférence, sur inscription pour obtenir le lien de connexion : centre.dalembert@universite-paris-saclay.fr Séance 1 : "La diffusion croissante des sciences participatives : facteur ou produit des transformations des pratiques de recherche ?" Suivi d'un débat avec les intervenants « Sciences participatives en sciences de la Terre » avec Patrick De Wever, Géologue, Professeur émérite Muséum National Histoire Naturelle, longtemps chercheur en micropaléontologie, il s'est particulièrement intéressé aux relations biosphère-géosphère. Aujourd'hui très impliqué dans la diffusion des Sciences de la Terre, dont le géopatrimoine. « Esquisser une sociologie politique des sciences participatives » avec Aymeric Luneau, Sociologue au Sesstim (Aix-Marseille Université) et au médialab de Sciences Po Paris. Contact et information sur notre site web
Le Centre de recherche de CentraleSupélec est très heureux de vous inviter à son prochain café science. 👉 Jeudi 14 décembre de 13h à 14h
Nous recevrons Marc Sciamanna, professeur au sein du Laboratoire LMOPS à Metz et directeur de la Chaire Photonique.
Lumière sur la Photonique La photonique est la science et la technologie utilisant la lumière. Le mot "photonique" reste mystérieux pour beaucoup d'entre nous. Pourtant, aucune communication moderne sur nos réseaux sociaux, aucun système audiovisuel, aucun contrôle de bagage, aucune analyse médicale ne se feraient sans photonique. Aucune transition énergétique compatible avec nos objectifs de développement durable ne se fera sans photonique. La photonique est au coeur des plus grandes révolutions scientifiques et technologiques. CentraleSupélec héberge la Chaire Photonique, unique structure en France pour la promotion et le développement de la formation et de la recherche en photonique. Organisés avec la Fondation CentraleSupélec, les cafés science sont ouverts à tous et nous offrent l'occasion de découvrir un sujet de recherche mené dans l'un des laboratoires de l'Ecole. Le concept : une présentation de ses travaux par un chercheur, auquel vous pourrez ensuite échanger autour d'un café. Je m'inscris ! Inscription obligatoire 💡En présentiel ou en visio ? Vous pouvez participer à la conférence en présentiel ou en visio selon votre choix. - En présentiel : CentraleSupélec. Salle VI.118, bâtiment Eiffel - 8-10 rue Joliot-Curie, 91190 Gif-sur-Yvette.
- En visioconférence : Un lien teams sera transmis 48h avant l'événement.
Dans une étude publiée dans Molecular Cancer, l’équipe d’oncologie médicale du service de gynécologie de Gustave Roussy (UMR-S 981 INSERM/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif) rapporte pour la première fois la possibilité d’évaluer le statut de la recombinaison homologue sur le cfDNA présent dans le liquide péritonéal (LP) des patientes avec un cancer avancé de l’ovaire. Les auteurs ont prélevé du tissu tumoral (TT) et 20 ml de LP de 53 patientes lors de la chirurgie ou d’une ponction de LP à la rechute. Ils ont ensuite réalisé un séquençage de nouvelle génération pour détecter des mutations des gènes impliqués dans la recombinaison homologue ainsi qu’une mesure du score d’instabilité génomique. Ils ont pu mettre en évidence un taux de détection, une qualité et une quantité très importante de cfDNA dans le LP avec un rendu de résultats plus rapide d’environ 3 semaines comparé à l’analyse tissulaire. 86% des patientes présentaient une mutation de TP53, 13 (24%) une mutation de BRCA1 ou 2 confirmant l’origine tumorale du cfDNA. La concordance entre l’analyse du TT et du LP était de 95%. 1 patiente présentait une mutation de BRCA2 sur cfDNA non détectée sur le TT. Enfin, l’analyse du score d’instabilité génomique a pu être réalisé dans 100% des cas sur cfDNA (contre 76% sur l’analyse du TT). En conclusion, cette étude montre que l’analyse du cfDNA dans l’ascite est une source majeure d’ADN tumoral et permet d’avoir un résultat fiable et rapide du statut moléculaire des patientes avec un cancer de l’ovaire. Contact : cyril.roussel-simonin@gustaveroussy.fr
Dans un article récemment publié dans la revue américaine Diabetes, Technology & Therapeutics, spécialisée dans les nouvelles technologies de prise en charge du diabète, l’équipe du service d’endocrinologie et diabétologie de l’hôpital sud francilien (UPSaclay, Corbeil Essonnes) a rapporté les résultats d’une étude réalisée chez des patients vivant avec un diabète de type 1 chroniquement déséquilibré (hémoglobine glyquée >11%). Il a été proposé à ces participants de bénéficier d’une pompe à insuline connectée à une mesure continue du glucose, le tout fonctionnant en boucle semi-fermée grâce à un algorithme d’adaptation de la délivrance d’insuline en temps réel (« pancréas artificiel »). Cette technologie est remboursée en France depuis 2021 pour les patients atteints d’un diabète de type 1, avec certaines conditions. Malheureusement, les patients présentant un diabète très déséquilibré sont peu représentés dans les essais cliniques, de même que dans les études observationnelles sur les boucles semi-fermées. Ainsi, beaucoup de professionnels de santé hésitent à équiper ces patients de peur qu’ils puissent présenter des complications aigues en cas de mauvaise utilisation de ces nouveaux systèmes. Les résultats de l’étude sont tout à fait rassurants. Chez les patients qui ont accepté de faire l’essai (50%), 78% ont continué à utiliser la boucle semi-fermée plus d’un an avec une amélioration signification de leur équilibre glycémique et sans augmentation des évènements indésirables redoutés par les soignants. Ces résultats devraient encourager les professionnels du diabète à proposer ce type de technologie à plus de patients atteints de diabète de type 1. Légende Figure : évolution de l’HbA1c et des paramètres de mesure continue du glucose pendant un an chez les participants atteints de diabète de type 1 chroniquement très déséquilibré et ayant accepté d’utiliser un « pancréas artificiel » Contact : coralie.amadou@universite-paris-saclay.fr
Le SARS-CoV-2, le virus responsable de la récente pandémie de COVID-19, est largement connu pour sa transmission aérienne, affectant principalement le système respiratoire et conduisant, dans certains cas, à des manifestations graves de la maladie. Cependant, la COVID-19 ne se limite pas au tractus respiratoire ; elle perturbe également les fonctions d'autres organes. Des troubles gastro-intestinaux, tels que nausées, vomissements, douleurs abdominales et diarrhées, ont été documentés chez près de 30% des patients atteints de COVID-19 au début de la maladie. Ces symptômes ont été associés à un pronostic clinique plus défavorable, et des symptômes gastro-intestinaux persistants ont été observés chez certains patients plusieurs mois après l'infection par le SARS-CoV-2. Des chercheurs de l'IDMIT (CEA/UPSaclay, Fontenay-aux-Roses) ont mené une étude impliquant des macaques exposés au SARS-CoV-2 par voie respiratoire. Ils ont analysé les changements des cellules immunitaires intestinales à des moments proches de la transmission du virus (7 à 9 jours post-infection) et après l'élimination virale (43 jours post-infection). Les résultats, publiés dans Mucosal Immunology, révèlent des perturbations immunologiques dans l'intestin grêle et le gros intestin associées à une barrière intestinale altérée lors des phases d'infection aiguë et résolue. L'infection aiguë a entraîné une libération de l'ARN viral à partir des tissus respiratoires et intestinaux, avec une perturbation des compartiments myéloïdes et lymphoïdes dans le tractus gastro-intestinal persistant dans certains cas jusqu'à 43 jours après l'infection. Les premiers stades de l'infection ont montré le fonctionnement actif des cellules immunitaires adaptatives telles que les lymphocytes T et B, facilitant l'élimination virale observée aux points de temps plus tardifs. Cependant, les lymphocytes T étaient dans un état activé, et la fréquence des cellules B de mémoire a augmenté de manière significative après le contrôle de l'infection. De plus, l'intégrité de la barrière intestinale était compromise, comme indiqué par la diminution des populations myéloïdes, l'augmentation des marqueurs de dommages intestinaux, avec des associations significatives entre l'IFABP, un marqueur de lésion intestinale, et une sous-population de macrophages pro-inflammatoires. L'étude a montré qu’une infection même légère par le SARS-CoV-2, similaire à celle développée chez les macaques et représentative de la majorité des infections chez les patients, peut entraîner des perturbations à long terme du système immunitaire intestinal et des lésions de la barrière intestinale. Par conséquent, les futures thérapies pour le SARS-CoV-2 devraient également se concentrer sur la restauration de la fonction immunitaire intestinale. Contact : mariangela.cavarelli@cea.fr
Bacillus subtilis peut former divers types de communautés organisées spatialement sur les surfaces, telles que des colonies, des pellicules et des biofilms immergés. Ces communautés présentent des similitudes et des différences, et une hétérogénéité phénotypique a été signalée pour chaque type de communauté. Dans une étude parue dans Nature Communications, fruit d’une collaboration entre les laboratoire laboratoires Micalis et MaIAGE (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), les scientifiques ont étudié l'hétérogénéité transcriptionnelle spatiale à travers les trois types de communautés associées à la surface. En utilisant une analyse RNA-seq de différentes régions ou sous-populations pour chaque type de communauté, les auteurs ont identifié les gènes spécifiquement exprimés dans chaque sous-population sélectionnée. Ils ont construit des fusions transcriptionnelles fluorescentes pour 17 de ces gènes et observé leur expression dans les biofilms immergés en utilisant la microscopie confocale à balayage laser en temps réel. Ils ont observé des schémas d'expression en mosaïque pour certains gènes ; en particulier, ils ont observé des cellules spatialement séparées présentant une régulation opposée des gènes du métabolisme du carbone (gapA et gapB), indicatifs de régimes glycolytiques ou gluconéogéniques distincts coexistant dans la même région du biofilm. Dans l'ensemble, cette étude offre une comparaison directe de l'hétérogénéité transcriptionnelle spatiale, à différentes échelles, pour les trois principaux modèles de communautés associées à la surface de B. subtilis. Contact : romain.briandet@inrae.fr
Portrait Jeune Chercheur - Julien Lemaitre, chercheur en immunologie
Julien Lemaitre est vétérinaire clinicien et immunologue au CEA dans l’UMR1184 Center for Immunology of Viral, Auto-immune, Hematological and Bacterial diseases (CEA- IDMIT/UPSaclay/INSERM). Il s’intéresse aux rôles des polynucléaires neutrophiles dans la physiopathologie des infections chroniques comme la tuberculose et le VIH. Cette cellule immunitaire innée est la plus abondante dans le sang et elle est impliquée dans la physiopathologie de nombreuses maladies. Paradoxalement, les mécanismes d’action des neutrophiles dans les infections sont mal compris, alors qu’ils représentent une cible thérapeutique intéressante. Après son cursus vétérinaire à Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse, Julien rejoint les équipes de l’UMR1184. Durant son Master 2 puis son doctorat en immunologie, sous la direction d’Olivier Lambotte et Roger Le Grand, il se focalise sur le rôle des polynucléaires neutrophiles dans l’infection par le VIH. Il met en évidence, dans un modèle d’infection par le SIV chez le macaque, que de nouvelles sous-populations de neutrophiles apparaissent dès la primo-infection. Ces neutrophiles possèdent un rôle immunomodulateur envers les lymphocytes T et participeraient à l’inflammation chronique de manière directe et indirecte en perturbant les lymphocytes T. En octobre 2019, à l’issue de sa thèse, il est recruté dans le département IDMIT comme vétérinaire clinicien et immunologue au sein du laboratoire Animal Science and Welfare. Il a pour première mission de diriger le développement des modèles préclinique de tuberculose, afin d’évaluer l’efficacité de nouvelles stratégies thérapeutiques dans le cadre du programme européen ERA4TB. L’initiation du projet sera finalement reportée à 2021 en raison de la pandémie de COVID-19. En effet, les autres axes de recherche sont temporairement ralentis et l’ensemble de l’unité focalise ses efforts sur le développement d’un modèle macaque d’infection au SARS-CoV-2, qui jouera un rôle primordial dans le développement de vaccins et dans l’évaluation de traitements contre la COVID-19. Enfin en 2021, Julien contribue à la mise en place du premier modèle de tuberculose chez le macaque à IDMIT. Il poursuit ses travaux initiés en thèse sur le rôle des polynucléaires neutrophiles dans les infections chroniques, en s’intéressant dorénavant à la tuberculose. Il étudie plus particulièrement la réponse immunitaire innée (neutrophiles et lymphocytes Tγδ), ses dysfonctionnements et son impact dans la progression de la tuberculose. Les laboratoires de recherche technologique présents au sein du département IDMIT l’accompagnent et lui permettent de combiner des technologies de pointes pour répondre à cette question scientifique. Ainsi, l’imagerie in vivo de l’infection (scanner TEP-TDM), la caractérisation immunitaire fine par cytométrie de masse et par transcriptomique, combiné à l’analyse histologique, permettent de mieux comprendre le rôle des neutrophiles dans la pathophysiologie de la tuberculose. Julien et son équipe seront également impliqués dans le développement de modèles précliniques de sepsis associés aux infections respiratoires au sein de l’IHU Prometheus. Thématique pour laquelle le rôle modulateur des neutrophiles pourra être explorée avec une stratégie similaire à la tuberculose. « If everything is under control, you are going too slow. » - Mario Andretti (pilote de course) Contact: Julien.lemaitre@cea.fr
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