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Le contexte… En raison du vieillissement de la population et de la croissance démographique, le nombre de nouveaux cas de cancer devrait augmenter d'environ 60 à 70% au cours des 2 prochaines décennies. Pour lutter contre cette maladie, l’une des armes thérapeutiques les plus efficaces reste la chimiothérapie qui a pour but la destruction des cellules cancéreuses via des mécanismes dits non spécifiques. Les chimiothérapies sont principalement administrées par voie intraveineuse ce qui engendre un certain nombre de contraintes à la fois pour le patient et le système de santé (inconfort, longs séjours hospitaliers, nécessité d'un personnel qualifié pour l’administration du traitement, coût élevé, risques d’infections). Ainsi, la mise au point d'une chimiothérapie efficace, moins coûteuse et plus confortable pour le patient, révolutionnerait ce domaine. Le projet… Dans ce contexte, une étude menée par des chercheurs du CNRS et de l’Université Paris Saclay (Equipes des Drs Julien Nicolas et Nicolas Tsapis, Institut Galien Paris-Saclay) a ouvert la voie vers une approche générale et évolutive permettant l'administration par voie sous-cutanée de médicaments anticancéreux. Cette nouvelle approche est basée sur l’idée de lier chimiquement la molécule anticancéreuse via un lien clivable in vivo à un polymère biocompatible et très hydrophile, le polyacrylamide, en construisant ce que l’on appelle une prodrogue. Cette approche a été exemplifié en utilisant le paclitaxel comme molécule active, un médicament anticancéreux fortement hydrophobe et vésicant et donc inadapté au mode d’injection en sous-cutanée sous sa forme libre. Le rôle unique du tritium et du marquage isotopique dans ce projet… Afin de caractériser le devenir in vivo de ce type de prodrogues, les chercheurs de Institut Galien Paris-Saclay ont fait appel à la plateforme de marquage isotopique du CEA/Paris-Saclay (Institut Joliot, Département Médicaments et Technologies pour la Santé, Service de Chimie Bioorganique et de Marquage, CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette). Forts de leur expertise et de leurs équipements et laboratoires dédiés, la plateforme de marquage isotopique a synthétisé la prodrogue modèle, via du paclitaxel marqué isotopiquement par un atome de tritium (isotope radioactif de l’hydrogène). Cet analogue radioactif a ensuite été utilisé pour évaluer la pharmacocinétique et la biodistribution de la prodrogue en comparaison à l’administration du principe actif seul (à la fois par voie sous-cutanée et intraveineuse). Ces études ont permis de mettre en évidence l’intérêt de la stratégie mise en place qui permet d’augmenter la biodisponibilité du principe actif mais aussi un passage rapide des tissus sous-cutanés vers la circulation générale. En savoir plus ? lire l’info publiée récemment dans nos colonnes. Contacts: Gregory Pieters (gregory.pieters@cea.fr) Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI La plateforme de marquage isotopique du CEA/Paris-Saclay (Institut Joliot, Département Médicaments et Technologies pour la Santé, Service de Chimie Bioorganique et de Marquage, CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) est unique sur le territoire Paris-Saclay. Forte de son expertise dans la préparation (synthèse, contrôle de qualité) et formulation de molécules marqués, elle assure régulièrement des prestations et collaborations, académiques comme industrielles, dans le domaine du (radio)marquage moléculaire. Elle offre également à la demande, son expertise et environnement unique de travail (laboratoires « chauds », équipements dédiés) pour l’analyse et la caractérisation d’échantillons radioactifs : mesure de puretés chimique et radiochimique par HPLC, détermination d'enrichissements isotopiques et d'activités spécifiques par SM, analyse et détermination structurale par RMN liquide comme solide, mesure d’activités radioactives par comptage à scintillation. A propos de l’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot : L’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot (CEA-Joliot) étudie les mécanismes du vivant pour, à la fois, produire des connaissances et répondre à des enjeux sociétaux au cœur de la stratégie du CEA : la santé et la médecine du futur, le numérique et la transition énergétique. Les travaux, fondamentaux ou appliqués, reposent sur des développements méthodologiques et technologiques. Les collaborateurs du CEA-Joliot sont pour moitié impliqués dans des unités mixtes de recherche (UMR), en partenariat avec le CNRS, l'INRAE, l’INRIA, l'Inserm, l’Université Paris-Saclay et l’Université de Paris. Le CEA-Joliot est implanté principalement sur le centre CEA-Paris-Saclay. Des équipes travaillent également à Orsay, Marcoule, Caen, Nice et Bordeaux.
L’appel à projets 2024 du PEPR Agroécologie et Numérique est désormais en ligne sur le site de l'ANR. Un webinaire de présentation sera organisé le 11 décembre entre 10h et 12h avec inscription depuis le site de l'ANR.
Les dates à retenir sont les suivantes : - 18 janvier 2024 : date limite de soumission des lettres de manifestation d’intérêt (étape facultative)
- 14 mai 2024 : date limite de soumission des dossiers complets (étape obligatoire)
L’AP-HP, Gustave Roussy et l’Institut Curie, lauréats de l’appel à candidatures de l’Institut national du cancer PEDIACRIEX23, s'associent à plusieurs universités (dont UPSaclay), organismes de recherche et centres partenaires ainsi que trois grandes associations de parents (les associations Imagine for Margo – Children without cancer, Hubert Gouin – Enfance et cancer et Laurette Fugain) pour porter des programmes de recherche intégrés ambitieux, faisant le lien entre la recherche fondamentale et la pratique clinique, afin de mettre au point des traitements innovants et guérir plus de jeunes patients. Lire les infos de l’Institut Curie, de Gustave Roussy et le communiqué de presse
Les partenaires du living lab VivAgriLab (dont C-BASC) ont le plaisir de vous inviter à la Journée de Rencontre annuelle chercheurs acteurs locaux, qui aura lieu le 12 décembre 2023 à l'INRAE Versailles (Route de Saint Cyr 78000 Versailles). L'évènement est ouvert à la communauté scientifique, tous acteurs locaux et partenaires. Veuillez SVP vous inscrire sur ce lien. Le living lab VivAgriLab vise à faire émerger des projets de recherche appliquée en faveur de la transition écologique et agroécologique d'un large territoire autour de l'université. VivAgriLab a été créé en 2019 par 3 associations (menant un programme agriurbain), 3 communautés d'agglomération, INRAE, AgroParisTech, C-BASC, l'Université Paris-Saclay, la Chambre d'agriculture d'IdF et l'Etablissement public d'Aménagement Paris-Saclay. Pour en savoir sur VivAgriLab, veuillez consulter le site de l'association Terre & Cité qui anime la démarche ou celui de C-BASC. En matinée seront présentés les résultats du projet Flux local : "Réancrer les flux alimentaires et boucler les flux de matière organique à l’échelle locale pour contribuer à la durabilité territoriale". Il s'agit du premier projet obtenu par VivAgriLab, financé par la Fondation de France. L'après-midi auront lieu des ateliers thématiques visant à amorcer un processus de coconception de projets de recherche action avec les acteurs locaux. Les ateliers ayant lieu en sessions parallèles, vous pourrez choisir sur place les ateliers selon vos intérêts. Le programme provisoire est disponible via ce lien. Nous restons à votre disposition pour toute question, Paul Leadley, Gwenola Yannou-Le Bris, Philippe Martin et Diane Maurissen (l'équipe de coordination de C-BASC)
Les Fédérations Hospitalo-Universitaires organisent le vendredi 15 décembre 2023 leur prochain workshop Women in Science. Cette deuxième édition, consacrée à la place de la femme dans la recherche et les soins, réunira de nombreux intervenants aux côtés des représentants des fédérations hospitalo-universitaires : médecins exerçant à l'AP-HP, chercheurs, universitaires, etc.
Vous avez en tête une idée d'innovation biotech, en santé ou en bioéconomie ? Vous rêvez de créer votre startup ? Soumettez votre projet à l'appel à candidatures Shaker, le programme qui transforme une idée ingénieuse en une startup innovante. Shaker ouvre l'accès à un laboratoire équipé, offre un accompagnement business, dans une ambiance promo conviviale ! En six mois, vous validez votre technologie et construisez votre startup. L'appel est ouvert du 4 décembre au 4 février 2024. En savoir plus
Objectifs : L'objectif général de cet appel à projets est de financer des projets interdisciplinaires ou multi-intra-disciplinaires (mettant jeu plusieurs sous-disciplines très différentes d'une même discipline) qui permettront la caractérisation fonctionnelle du microenvironnement des cancers de mauvais pronostic. Il s'agit de mieux comprendre le rôle du microenvironnement tumoral dans le développement de cancers pour lesquels les options thérapeutiques sont peu efficaces et se caractérisent par un taux de survie nette standardisée à 5 ans après le diagnostic inférieur à 33%. Quatre axes de recherche sont proposés : la caractérisation spatio-temporelle haute définition du microenvironnement conduisant à une étude fonctionnelle ; le décryptage haute définition des réseaux cellulaires et de signalisation locale ; la reprogrammation du microenvironnement tumoral ; la mise au point de modèles in vitro ou ex vivo reproduisant l'évolution spatiotemporelle du couple tumeur/microenvironnement. Un large panorama de spécialités est concerné : incluant notamment biochimie, mécanobiologie, biologie cellulaire, chirurgie, anatomopathologie, infectiologie, immunologie, biologie des systèmes vasculaire et lymphatique, hématologie, bio-ingénierie, analyse d'images, technologies de profilage et technologie spatiale, biologie du cancer, clinique, physique, biophysique, chimie, mathématiques. La proposition doit comporter entre 2 et 4 équipes appartenant à des disciplines ou sous-disciplines différentes. Le même projet ne peut pas être soumis aux appels MIC ou PCSI 2024. Les projets doivent porter sur des tumeurs de mauvais pronostic avec un taux de survie nette standardisée à 5 ans après le diagnostic < 33%, dont il faudra apporter la justification. Une même équipe ne peut déposer qu'un seul dossier que ce soit en tant que Coordinateur, Coordinatrice de Projet ou Partenaire. La programmation scientifique de cet appel à projets est réalisée par l'ITMO Cancer d'Aviesan. La gestion opérationnelle est effectuée par l'Inserm. Documents à télécharger Rappel des dates : du 30 novembre 2023 au 8 février 2024 à 17h00. Résultats : à partir de fin juillet 2024. Contact : cancerinserm.mcmp@inserm.fr
Séminaire Pr Dan PEER - lundi 18 décembre 2023 - amphi Hervé Daniel - bât. Henri Moissan - 10h
le Professeur Dan Peer, Directeur du Laboratoire de Nanomédecine de précision à l'Université de Tel Aviv, fera une conférence intitulée "Modulating cells function with RNA". Cette conférence est ouverte à toutes et tous. Nous vous donnons rendez-vous en amphithéâtre Hervé Daniel - bâtiment Henri Moissan - le lundi 18 décembre 2023 à 10h. Dan Peer is a Professor and the Director of the Laboratory of Precision NanoMedicine at Tel Aviv University (TAU). He is also the Vice President for Research and Development at Tel Aviv University. From 2017 - Present, he is the Founding and Managing Director of the SPARK program of Translational Medicine at TAU. Prof. Peer’s work was among the first to demonstrate systemic delivery of RNA molecules using targeted nanocarriers to the immune system and he pioneered the use of RNA interference (RNAi) in immune cells. His lab was the first to show systemic, cell specific delivery of mRNA in an animal to induce therapeutic gene expression of desired proteins. This has enormous implications in cancer, inflammation and infection diseases (e.g. COVID 19 mRNA vaccines). In addition, his lab was the first to show systemic high efficiency, cell specific therapeutic genome editing in cancer. Prof. Peer has more than 130 pending and granted patents. Some of them have been licensed to several pharmaceutical companies and one is currently under registration (as a new biological drug in Inflammatory Bowel Disease). In addition, based on his work, four spin-off companies were generated aiming to bring innovative personalized medicine into clinical practice. Prof. Peer received more than 30 awards and honors and he serves on the scientific advisory board and as Board Member of more than 15 companies, and on the editorial board of more than 20 journals. In 2014, he was elected to the Israel Young Academy and in 2023 he was elected to the US National Academy of Engineers (NAE).
L’athérosclérose se caractérise par le dépôt d’une plaque lipidique sur la paroi des artères qui peut évoluer vers l’obstruction des vaisseaux ou se rompre avec des conséquences graves. Dans une étude parue dans Nanoscale, des chercheurs du Département Médicaments et Technologies pour la santé - DMTS (CEA-Joliot/UPSaclay, Gif-sur-Yvette), en collaboration avec l’Institut de Cardiométabolisme et Nutrition (Sorbonne Université), ont mis en place une approche micellaire pour la prise en charge la vectorisation d’un agoniste du LXR (récepteur nucléaire des oxystérols) vers les lésions athérosclérotiques. Ce récepteur intervient dans la régulation de voies métaboliques du cholestérol qui joue un rôle clé dans la formation de la plaque d’athérome. Il existe déjà des molécules agonistes du LXR, comme le GW3965 qui possède une activité anti-athéromateuse mais aussi hypocholestérolémiante. Bien qu’actif, le GW3965 n'a jamais été mis sur le marché en raison d'effets indésirables qui résultent principalement d'une biodistribution non spécifique. Dans le contexte de cette étude, des vecteurs micellaires stabilisés capables : i) de prendre en charge (encapsulation) un agoniste synthétique du LXR dérivé du GW3965, ii) de l’emmener (ciblage passif) vers les lésions athérosclérotiques, et iii) d’induire un effet thérapeutique en activant LXR, ont été développés. Des expériences sur des modèles de souris ont montré que les micelles chargées en principe actif présentaient une pharmacocinétique et une biodistribution favorables vers la plaque d’athérome et qu'elles étaient capables de réguler à la hausse l'expression des promoteurs d'efflux du cholestérol, sans altérer le métabolisme des lipides (un effet secondaire classiquement observé avec GW3965). Contact : philippe.lesnik@sorbonne-universite.fr ou laurent.devel@cea.fr ou edmond.gravel@cea.fr ou eric.doris@cea.fr
Le passage des anticorps à travers la barrière hémato-encéphalique (BHE) et la barrière hémato-tumorale (BHT) revêt une importance cruciale pour accroître l'efficacité des immunothérapies, mais également pour surveiller les biomarqueurs pronostiques et prédictifs tels que le ligand de mort programmée 1 (PD-L1) via l’immuno-tomographie par émission de positons (immunoTEP). Il a été montré récemment que les ultrasons focalisés (FUS) permettent de perméabiliser transitoirement ces barrières biologiques et améliorent le passage d’anticorps (Tran et al., 2020 et notre précédente info). Bien que l'implication du récepteur néonatal Fc (FcRn) dans la distribution des anticorps soit bien établie, sa fonction au niveau de la BHE reste controversée, tandis qu'elle demeure inconnue au niveau de la BHT. Dans cette perspective, le Laboratoire d'Imagerie Biomédicale Multimodale Paris-Saclay – BioMaps (INSERM/CNRS/CEA-Joliot/UPSaclay, Orsay), avec les groupes de Charles Truillet (Immuno-imagerie) et d'Anthony Novell (Ultrasons), en collaboration étroite avec le DMTS (CEA/UPSaclay, Département « Médicaments et technologies pour la santé », SIMoS) avec Hervé Nozac’h ont mené une évaluation approfondie du rôle du FcRn dans le passage des anticorps dans le cadre de l’optimisation de l’imagerie de PD-L1. Cette évaluation a été réalisée en combinant l'imagerie en immunoTEP avec des FUS, en utilisant des IgG non modifiées ou à faible affinité pour le FcRn, ciblant le PD-L1 dans un modèle préclinique de glioblastome orthotopique. Les résultats de cette étude publiée dans Theranostics mettent en lumière que l'abolition de l'interaction Fc-FcRn confère de meilleures propriétés cinétiques pour l'imagerie par immunoTEP. Les ultrasons facilitent une distribution cérébrale adéquate des radioligands à base d'IgG, fournissant ainsi un outil robuste en immunoTEP. Cette approche, peu invasive, offre la possibilité de prédire et de surveiller la réponse aux immunothérapies de manière efficace. Légende Figure : Les ultrasons ont significativement amélioré la captation cérébrale des deux IgG radiomarquées (sans et avec mutation au niveau du Fc) par rapport à l'imagerie sans perturbation de la barrière hémato-encéphalique (BHE). La modélisation cinétique a révélé que le protocole a permis de discriminer l’impact des ultrasons et du FcRn dans la distribution des anticorps. Contact : charles.truillet@universite-paris-saclay.fr
Dans une étude publiée dans Nature Plants, les scientifiques du laboratoire MeioMe de l’Institut Jean-Pierre Bourgin - IJPB (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Versailles) et de l’I2BC (CEA/CNRS/UPsaclay, Gif-sur-Yvette), en collaboration avec une équipe du Max Planck Institute de Cologne (Allemagne), ont identifié et caractérisé deux nouvelles petites protéines appelées, SCEP1 et SCEP2, qui jouent un rôle clé lors de la méiose de la plante Arabidopsis thaliana. La méiose est au cœur de la reproduction sexuée des eucaryotes. Elle permet la formation de gamètes qui véhiculent la moitié de l’information génétique d’un individu. Les gamètes mâle et femelle fusionnent ensuite lors de la fécondation pour créer un nouvel individu. Lors de la méiose, les paires de chromosomes homologues forment des “crossovers”, qui échangent réciproquement des fragments de chromosomes et qui sont essentiels pour que chaque gamète reçoive une copie et une seule de chaque chromosome. Le nombre et la position de ces crossovers sont régulés par un ensemble de protéines dont certaines forment une structure appelée le complexe synaptonémal qui se présente comme une sorte de fermeture éclair qui attache les paires de chromosomes homologues. Les chercheurs ont montré que les deux nouvelles protéines SCEP1 et SCEP2 sont localisées au centre du complexe synaptonémal. Lorsque SCEP1 et/ou SCEP2 ne sont pas exprimées, le complexe synaptonémal n’est plus formé, il y a plus de crossovers par paires de chromosomes mais certains chromosomes ne reçoivent pas de crossovers engendrant des défauts dans la formation des gamètes et une baisse de la fertilité des plantes. Ces deux protéines jouent ainsi un rôle central dans la méiose, et donc dans la reproduction sexuée. Des protéines similaires à SCEP1 et SCEP2 ont été trouvées et prédites comme formant un complexe de structure similaire à celui des protéines d’Arabidopsis dans la majorité des espèces représentatives des plantes à fleurs. Légende Figure : SCEP1 et SCEP2 co-localisent au centre du Complexe Synaptonémal. A: En méiose, chaque paire de chromosomes homologues est associée physiquement par un crossover et par une structure protéique appelée le Complexe Synaptonémal. B: Structure de SCEP1 et SCEP2 prédite par l'AI Alphafold2. C: SCEP1 (Magenta) est visualisée au centre du complexe synaptonémal (gris). D: SCEP1 (Magenta) et SCEP2 (Bleu) colocalisent au centre du complexe synaptonémal. Contact : christine.mezard@inrae.fr
Dans le cadre de la Chaire Blaise Pascal de l’Université Paris-Saclay attribuée au primatologue américain William Hopkins (Université du Texas, MD AndersonCancer Center), l’équipe Ginkgo du laboratoire laboratoire GAIA (UMR BAOBAB / NeuroSpin, CEA/CNRS/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) a exploré pour la première fois la connectivité superficielle du cerveau du chimpanzé à partir de données d’IRM de diffusion acquises par l’équipe américaine sur une quarantaine d’individus. Les chercheurs de NeuroSpin ont ainsi pu établir la cartographie la plus complète à ce jour des connexions cérébrales profondes et superficielles de cet Hominidé avec lequel l’homme partage un ancêtre commun et de nombreux traits comportementaux. Ce travail fondateur qui a fait l’objet d’une publication de Maëlig Chauvel dans le journal NeuroImage va permettre aux chercheurs des équipes française et américaine d’étudier si les différences de connectivité anatomique du cerveau humain et du cerveau du chimpanzé peuvent expliquer les différences de comportement entre les deux espèces. Lien Zenodo pour accéder à l’atlas Contact : cyril.poupon@cea.fr
Une étude publiée dans la revue Genetics par des scientifiques de l’unité Génétique Quantitative et Evolution – GQE-Le Moulon (UPSaclay/CNRS/INRAE/AgroParisTech, Gif-sur-Yvette) au sein de l’IDEEV (Institut Diversité, Écologie et Évolution du Vivant) montre le rôle de mutations de novo dans la réponse de long terme à la sélection chez le maïs et comment leurs effets varient avec l’environnement et affectent simultanément plusieurs caractères. L’étude s’appuie sur les expériences de sélection divergente de Saclay sur la date de floraison (Saclay-DSEs). Deux lots de semence issus de deux lignées de maïs ont été sélectionnées durant plus de 20 générations sur le domaine agricole de la ferme du Moulon (Plateau de Saclay) pour une floraison tardive ou précoce. Après 20 générations de sélection, un écart d’environ 15 jours est observé entre populations tardives et précoces issues du même lot de semence. En combinant des approches de génomique, de génétique quantitative, et l’évaluation phénotypique les mêmes années des plantes sélectionnées à différentes générations, les auteurs ont étudié le rôle des mutations dans l’adaptation des populations. Cette étude valide l’existence de deux phases successives dans la réponse à la sélection, qui avaient été prédites par des simulations (Desbiez-Piat et al., 2021) : la première phase consiste en la fixation d’allèles favorables préexistants dans la population ancestrale ; la seconde phase est permise par la fixation de mutations de novo (A). Comme prédit par les simulations, les mutations avantageuses se fixent plus vite qu’attendu en l’absence de sélection (B). Cependant, des mutations favorables dans l’environnement de sélection s’avèrent défavorables dans l’environnement utilisé pour l’évaluation. La généralité des interactions génotype x environnement combinée à la généralité des effets pléiotropes des mutations sur différents caractères de phénologie et d’architecture des plantes explique l’impression d’exploration aléatoire de l’espace phénotypique en réponse à la sélection (C). Les résultats de l’étude permettent de mieux comprendre la complexité des interactions entre forces évolutives dans les processus d’adaptation des populations et soulignent l’intérêt des approches d’évolution expérimentale. Contact : christine.dillmann@universite-paris-saclay.fr
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Le livre « The Wheat Genome », disponible en accès libre, est le premier ouvrage complet sur le génome du blé, génome ô combien complexe. Le livre met en lumière les recherches innovantes sur le blé, une culture essentielle pour la sécurité alimentaire. Il illustre la valeur et l'impact des génomes de référence de haute qualité pour l'amélioration globale des cultures, afin de relever le double défi de la production sûre et durable, tout en faisant face à un changement climatique rapide. L'ouvrage comprend des articles décrivant le développement de la séquence de référence, de nouveaux assemblages de variétés commerciales, des études à l'échelle du génome et le clonage accéléré de gènes importants sur le plan agronomique. Il constitue une ressource précieuse pour la recherche fondamentale, la recherche appliquée, l'amélioration des cultures et l'enseignement. Une attention particulière sur le chapitre « Wheat Data Integration and FAIRification: IWGSC, GrainGenes, Ensembl and Other Data Repositories » : Ce chapitre écrit par Michael Alaux et al. de l’Unité de recherche en Génomique-Info - URGI (INRAE/UPSaclay, Versailles), décrit l’intégration des données blé et les outils bioinformatiques mis en place à l’échelle internationale pour faciliter leurs recherches et analyses en suivant les principes FAIR (Findable Accessible Interoperable Reusable). Contact : michael.alaux@inrae.fr
Chaque année, le Collège de France récompense et encourage, à travers plusieurs prix, des chercheuses et chercheurs prometteurs. Cette année, Florent Ginhoux s’est vu décerner le prix Antoine Lacassagne. Florent Ginhoux, directeur du laboratoire Cellules myéloïdes et cancer au sein de l’unité de recherche Immunologie anti-tumorale et immunothérapie des cancers (ITIC - Univ. Paris-Saclay, Inserm, Gustave Roussy), est spécialiste de l’ontogénie et de la différenciation des macrophages. Il figure sur la liste des scientifiques les plus cités au monde (Highly Cited Scientists) de Clarivate depuis 2016. Il consacre actuellement ses travaux à la mise en lumière de différents types de macrophages associés aux tumeurs en vue de développer de nouvelles immunothérapies ciblant ces populations cellulaires. Le prix Antoine Lacassagne, qui lui est décerné, couronne les travaux et encourage la carrière de jeunes chercheuses et chercheurs en biologie, qu’elles ou ils soient de nationalité française ou et étrangère. En plus d’une récompense de 6 000 euros, ce prix s’accompagne d’une invitation pour le lauréat ou la lauréate à venir communiquer ses recherches lors d’un séminaire au Collège de France, qui coïncide traditionnellement avec la tenue de la Journée François Jacob, organisée à chaque rentrée académique par l’Institut de biologie.
FORMATION EN LIGNE Intelligence Artificielle et Sciences du Médicament - Du 9 Février 2024 au 28 Juin 2024
Formation hybride: présentiel et distanciel : - 2 sessions par mois, de Février à Juin 2024, les vendredis de 14h – 17h / 17h30
- 2 cours de 1h30 à 2h par session, 18 cours sur 4 modules obligatoires (31 heures)
Objectif : Comprendre les applications de l’IA en support des sciences du médicament Cible : Etudiants de master, doctorants, post-doctorants, ingénieurs, enseignants-chercheurs, chercheurs du public et privé, professionnels de santé Intervenants : Experts académiques et industriels spécialisés en IA et ses applications aux métiers du médicament Inscription : Du 30 novembre 2023 au 15 janvier 2024 Calendrier : Du 9 février au 28 juin 2024 Frais d’inscriptions : - Gratuit pour les étudiants de niveau master, doctorants, post-doctorants et personnels associés à l’Université Paris-Saclay
- 50€ pour les étudiants de niveau master et doctorants externes à l’Université Paris-Saclay
- 250€ pour le personnel académique externe à l’Université Paris-Saclay
- 1 000€ pour les cadres du secteur privé
Responsables : - Pr Marc PALLARDY, Professeur de l’Université Paris-Saclay, Faculté de Pharmacie, Directeur de l’Objet Interdisciplinaire Health and Therapeutic Innovation (HEALTHI)
- Pr Philippe MOINGEON, Professeur associé en Intelligence artificielle et santé numérique, Université Paris-Saclay & Recherche et Développement, Servier
Le prochain Café GS LSH, qui aura lieu vendredi 1 décembre de 13h30 à 14h00. Nous aurons le plaisir d'accueillir Patricia Uguen (UMR 3348/INSERM U1278 CNRS/INSERM/UPSaclay/Institut Curie, Orsay) qui nous présentera son projet de recherche intitulé: « Depletion of 53BP1 activates innate immune response ». L'objectif de ces réunions informelles est de mieux connaître et fluidifier les échanges d'information entre membres de la communauté de la GS LSH. Si vous aussi souhaitez présenter votre equipe/plateforme ou projet de recherche lors d'un Café GS LSH, merci de complèter le formulaire d'inscription pour les orateurs. Pour vous connecter au café GS LSH veillez utiliser ce lien.
Le groupe de bioinfomatique dirigé par Fariza Tahi au sein du laboratoire génopolitain Informatique, BioInformatique, Systèmes Complexes - IBISC (UEVE/UPSaclay, Evry) a créé le modèle C-RCPred qui prédit l'organisation spatiale de complexes formés de plusieurs ARN, aux fonctions importantes dans la cellule. Il s'agit du premier algorithme qui intègre des données biochimiques de liaison, expérimentales ou prédites, ainsi que les connaissances ponctuelles acquises sur le complexe par le biologiste utilisateur. En savoir plus
La cellule Europe de l'Inserm organise un webinaire le 12 décembre 2023 pour présenter cinq appels à projets du partenariat Innovative Health Initiative. Ces appels portent sur des thématiques en lien avec le développement et la mise sur le marché de nouvelles technologies, de thérapies et de services qui améliorent la durabilité des systèmes de santé. Le webinaire abordera les modalités de participation, les structures d'accompagnement disponibles, et les thématiques des appels.
La Graduate School Life Sciences and Health (GS LSH) organise sa 6ème journée scientifique intitulé "Exploring the brain" le vendredi 2 février 2024 à NeuroPSI (151 route de la Rotonde, 91400 Saclay) et en visioconférence de 9h00 à 18h00. La GS LSH invite les jeunes chercheurs à présenter leurs travaux de recherche sous forme de poster. Les inscriptions sont gratuites mais obligatoires avant le 12 janvier 2024 : inscriptions Le programme scientifique est en cours de préparation et sera publié prochainement. Plus d'informations
Les maladies des plantes sont souvent causées par des complexes parasitaires d’espèces proches. L’existence de tels complexes a longtemps été insoupçonnée car les espèces sont souvent difficiles à distinguer les unes des autres, et nous manquions d’outils d’identification et de diagnostic. De plus, une fois l’existence de complexes reconnue, la contribution de chacune des espèces à la symptomatologie ou à la gravité de la maladie restait souvent inaccessible par manque de connaissance de la biologie, de l’épidémiologie et de la nuisibilité de chaque espèce prise séparément ou des relations qui peuvent se lier entre les différentes espèces du complexe in planta pour augmenter ou réduire la gravité de la maladie. Dans une étude publiée dans BMC Biology, les scientifiques de l’unité BIOGER (INRAE/UPSaclay, Campus Agro Paris-Saclay, INRAE Palaiseau) ont étudié de telles interactions entre deux espèces de champignons phytopathogènes, Leptosphaeria maculans (Lm) et L. biglobosa (Lb), responsables du Phoma du colza. Les interactions multipartenaires ont été analysées à l’aide d’approches de microbiologie et de transcriptomique (RNAseq) en culture axénique ou lors de l’infection de la plante. Ces travaux montrent un antagonisme fort entre Lb et Lm in vitro comme in planta. Le cycle parasitaire de Lm est bloqué à un stade très précoce de l’infection en présence de Lb, alors que Lm ne semble pas avoir d’effet notable sur le programme parasitaire de Lb. L’inhibition du cycle parasitaire de Lm est dû à une combinaison de causes, incluant une compétition pour les ressources trophiques, la génération par Lb d’un environnement inapproprié pour la croissance de Lm et/ou l’effet des réponses de défense de la plante induites par Lb sur Lm. Cet antagonisme unidirectionnel n’agit toutefois que dans des conditions particulières s’amenuisant voire disparaissant lors d’inoculations séparées dans l’espace ou le temps et modulé par la quantité d’inoculum apportée au point de co-inoculation. Cela explique pourquoi, au champ, les deux espèces continuent à être systématiquement présentes sur les mêmes plantes et que cette présence commune ne les empêche pas de compléter leur cycle de vie. Contact : thierry.rouxel@inrae.fr
La composition de lait est affectée par de nombreux facteurs, dont l'alimentation. Les microARNs, petits ARN non codants d’environ 22 nucléotides qui jouent un rôle important dans l’expression génique, sont présents en grande quantité dans le lait. L’effet de la restriction alimentaire sur les miRNomes ont été très peu étudiés. Dans une étude publiée dans BMC Genomics, les scientifiques de l’UMR de Génétique Animale et Biologie Intégrative – GABI (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) décrivent les effets de deux essais de restriction alimentaire d'intensité différente sur la composition en microARNs du lait de vaches Holstein. Un essai de restriction était d'intensité élevée (CI) et le second d'intensité modérée (LM). La répartition des microARNs dans les différents compartiments du lait étant peu connus, les auteurs ont séquencé les microARNs dans le lait entier, les globules gras (GG) du lait, les vésicules extracellulaires (VE) et les cellules épithéliales mammaires (CEM) purifiées à partir du lait, avant et pendant la restriction alimentaire. Une grande variabilité de concentration selon les compartiments a été observée. 2 896 microARN ont été détectés dont 1 493 déjà connus dans l’espèce bovine. Un miRNome spécifique pour chaque fraction du lait a été observé. La restriction alimentaire a affecté l’abondance de 159 microARNs (Figure), les compartiments des vésicules extracellulaires et du lait entier étant les plus touchés, tandis que les globules gras et les CEM ont été peu ou pas affectés. Aucun microARN différentiellement présent en fonction de l’alimentation n’a été détecté en commun dans un même compartiment, ce qui démontre un effet fort de l’intensité de la restriction. Pour les microARNs connus qui ont varié lors des restrictions, une analyse in silico a permis la prédiction de leurs cibles et l’étude des voies métaboliques dans lesquelles elles sont impliquées. Les 17 microARNs variables, connus et en quantité suffisante ont permis de prédire 1 378 gènes cibles dont 14 codants pour des protéines dont la quantité est affectée par la restriction alimentaire dans l’essai CI (Leduc et al., 2022 et notre précédente info). Les 41 voies métaboliques impliquées reflètent la modification de certaines voies clés de la lactation liées aux métabolismes lipidique et protéique, au cycle cellulaire et à la réponse aux stress. Ces travaux rapportent pour la première fois des modifications du miRNome dans plusieurs compartiments du lait lors de restriction alimentaire entrainant un déficit énergétique chez l’animal. Ils ouvrent ainsi la voie vers leur utilisation comme biomarqueurs de cet état chez les vaches laitières. Légende Figure : Répartition des 159 microARN dont l’abondance varie avec le régime alimentaire selon le protocole de restriction et le compartiment du lait Contact : fabienne.le-provost@inrae.fr
Les organismes photosynthétiques ont besoin de mécanismes de régulation pour faire face à l'excès d'énergie lumineuse. PTOX contrôle le niveau d'oxydation du pool de plastoquinone dans la membrane des thylakoïdes et agit comme une soupape de sécurité en cas de stress abiotique. Les chercheurs ont utilisé des mutants PTOX dans deux plantes modèles, Arabidopsis thaliana et Marchantia polymorpha. Chez Arabidopsis, l'absence de PTOX entraîne un grave défaut de pigmentation, un phénotype dit panaché, lorsque les plantes sont cultivées à des intensités lumineuses standard. Ils ont créé un mutant PTOX vert d'Arabidopsis exprimant la caroténoïde désaturase bactérienne CRTI et un double mutant de Marchantia dépourvu des enzymes PTOX de type plante et de type algue. Chez les deux espèces, l'absence de PTOX a affecté l'état redox du pool de plastoquinone. L'exposition des plantes à une forte intensité lumineuse a montré, en l'absence de PTOX, une plus grande sensibilité du photosystème I aux dommages induits par la lumière, tandis que le photosystème II était plus stable, ce qui démontre que la PTOX joue à la fois un rôle pro-oxydant et un rôle anti-oxydant in vivo. Ces résultats jettent une lumière nouvelle sur la fonction de PTOX dans la protection des photosystèmes I et II contre le stress photo-oxydant. Légende Figure : Schéma montrant que l'activité de la PTOX permet la destruction préférentielle du photosystème II (PSII) et protège le photosystème I (PSI). Le PSII peut être réparé efficacement alors que les dommages causés au PSI sont mortels pour la plante. Contact : anja.liszkay@i2bc.paris-saclay.fr
La phosphorylation des facteurs de transcription joue un rôle clé dans la signalisation cellulaire et dans les mécanismes pathologiques, mais a été très peu étudiée dans les thérapies utilisant les nanomédicaments. La connaissance des mécanismes par lesquels les nanomédicaments contrôlent la dynamique spatio-temporelle de la phosphorylation du CREB [cyclic AMP-response element binding protein] pourrait améliorer les traitements des maladies neurologiques, par exemple celles causées par un déficit en plasmalogène. Dans un article récent publié dans Communications Chemistry, Yu Wu et Angelina Angelova de l’Institut Galien Paris-Saclay – IGPS (UMR 8612 CNRS/UPSaclay, Orsay) émettent l'hypothèse de l'importance de la phosphorylation des facteurs de transcription pour la régénération des séquelles neurologiques du syndrome du long COVID et soulignent le rôle de l'organisation structurelle des nanoparticules pour l'interaction avec les membranes cellulaires. Les auteurs ont conçu des assemblages nanométriques de lipides et de peptides, avec différentes organisations structurelles (cubosomes, hexosomes et liposomes), caractérisés par la diffusion des rayons X aux petits angles (SAXS) à haute résolution et par l’imagerie Cryo-TEM. Le traitement des cellules neuronales par des nanoassemblages a démontré que le temps de traitement est un paramètre critique pour la phosphorylation de CREB dans les cellules normales par rapport aux cellules exposées au stress oxydatif dans un modèle in vitro de la maladie de Parkinson. Les nanoassemblages à base de plasmalogène contrôlent la cinétique de l'activation de CREB de manière prolongée et pourraient conduire à des traitements plus efficaces des troubles neurodégénératifs. Contact : angelina.angelova@universite-paris-saclay.fr
Dans une revue publiée récemment dans Brain, Damien Ricard (Centre Borelli UMR 9010 UPSaclay/ENS Paris-Saclay/CNRS/SSA, Université de Paris Cité, Inserm) et collaborateurs font le point sur les liens entre faisceaux de substance blanche et fonctions exécutives. Ces fonctions permettent de planifier, contrôler et exécuter des activités complexes orientées vers un objectif. Elles sont indispensables à l’adaptation à des situations nouvelles et incluent, entre autres, mémoire de travail, flexibilité mentale et inhibition. Comme toute fonction cognitive complexe, les fonctions exécutives résultent de l’interaction permanente et dynamique entre réseaux neuraux, assurée par les faisceaux de substance blanche. Dans cette revue, les auteurs ont fait la synthèse d’études incluant des patients opérés de tumeur cérébrale en condition éveillée avec stimulation cérébrale directe, d’études de corrélation « lésion-déficit » en imagerie cérébrale, et de tractographie chez des adultes sains et des patients. Pour les fonctions exécutives étudiées, l’intégrité de certains faisceaux de substance blanche semble indispensable : - La mémoire de travail dépendrait du corps calleux, et notamment sa partie antérieure, du faisceau longitudinal supérieur (FLS), du cingulum, et du faisceau frontal « oblique ».
- La flexibilité mentale reposerait essentiellement sur le deuxième segment du FLS, mais aussi le corps calleux, notamment son genou.
- Quant à l’inhibition, l’intégrité des faisceaux cortico-sous-corticaux hémisphériques droits, notamment les radiations thalamiques antérieures, semble cruciale, outre celle du corps calleux, du cingulum, et du FLS.
- En résumé, en plus du corps calleux, le FLS notamment son deuxième segment, apparaît indispensable pour le fonctionnement exécutif.
Plus globalement, une latéralisation hémisphérique gauche a été observée pour les tâches verbales, et droite pour les tâches exécutives avec des demandes visuelles. Contact : crmonica@gmail.com ou yn.yordanova@gmail.com ou damien.ricard@m4x.org
Portrait Jeune Chercheur - Morgan Gaïa, chercheur en biologie de l’évolution des virus
Morgan Gaïa est chercheur CEA au Genoscope (UMR 8030 CEA/CNRS/UEVE-UPSaclay, Evry) au sein du LAGE (Laboratoire d’Analyses Génomiques des Eucaryotes) depuis décembre 2021. Ses sujets de recherche portent sur les interactions évolutives et fonctionnelles entre les eucaryotes et leurs virus, à partir de grandes ressources de données environnementales, telles que celles générées dans le cadre des expéditions Tara. Il s’intéresse en particulier aux rôles que les virus géants ont pu jouer dans l’émergence et l’évolution précoce des eucaryotes. Ces virus sont en effet non seulement étonnant pour les dimensions de leur particule et de leur génome, mais aussi pour leur contenu en gènes qui évoque de nombreux liens co-évolutifs avec leurs hôtes. Après des études en microbiologie, spécialisées en maladies infectieuses, il défend en 2013 sa thèse sous la direction du Pr. Bernard La Scola à l’Université Aix-Marseille, sur l’isolement et la caractérisation de nouveaux virus géants et de leurs virophages. Il poursuit sa carrière par un postdoc dans l’équipe du Pr. Patrick Forterre à l’Institut Pasteur jusqu’en 2019. Il y développe ses compétences en phylogénomique et phylogénétique, en travaillant notamment sur la topologie de l’arbre du vivant et en co-supervisant un projet sur la co-évolution entre virus géants et eucaryotes. Il rejoint ensuite le LAGE du Dr. Patrick Wincker en tant que postdoc afin d’étudier la biogéographie et l’évolution des eucaryotes et des virus géants à l’échelle de la génomique océanique, au travers des données produites à partir des expéditions Tara. Il est ensuite recruté par le CEA en tant que chercheur au sein de la même équipe afin d’y développer sa thématique de recherche actuelle. “When you’ve got’em by the curiosity, their hearts and minds will follow.” - Terry Pratchett, Small Gods. Contact : mgaia@genoscope.cns.fr
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