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FOCUS PLATEFORME : Une expertise rare sur Paris-Saclay : La purification de cellules et d’organites par la technique de tri par cytométrie en flux

FOCUS PLATEFORME : Une expertise rare sur Paris-Saclay : La purification de cellules et d’organites par la technique de tri par cytométrie en flux | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Focus sur une expertise relativement rare sur le territoire Paris-Saclay : La purification de cellules ou d’organites par le tri par cytométrie en flux !

 

La cytométrie en flux permet de mesurer, évènement par évènement, des caractéristiques morphologiques (taille, complexité/granularité) et de fluorescence sur une population de cellules ou d’organites en suspension. Le tri par cytométrie en flux rend également possible la séparation physique et donc la purification de ces évènements suivant un ou plusieurs critères définis (morphologie, fluorescence) et à partir de populations hétérogènes.

 

Mais concrètement, étape par étape, comment cela fonctionne-t-il ? Explication illustrée avec l’utilisation du cytomètre « Analyseur-Trieur » MoFlo ASTRIOS® (Beckman-Coulter) disponible sur la plateforme de cytométrie de l’I2BC (Institut de Biologie Intégrative de la Cellule, Imagerie-Gif, campus CNRS de Gif-sur-Yvette).

 

Les cellules (ou autres particules en suspension) préparées dans leur milieu sont introduites dans le trieur (encadré 1) et soumises à une pression, qui permet de les faire circuler dans le système fluidique. Parallèlement, un liquide de gaine salin est également soumis à une pression, inférieure à celle de l’échantillon. La « rencontre » entre l’échantillon et le liquide de gaine soumise à une pression différentielle induit la formation d’un entonnoir virtuel (encadré 2) permettant aux évènements de passer devant les lasers un à un. Chaque évènement est alors identifié selon ses critères morphologiques et/ou fluorescents. Le système fluidique est soumis à une vibration de fréquence et d’amplitude connues, qui va induire la formation de gouttelettes (encadré 3). Les gouttelettes composées de liquide salin (liquide de gaine) et enfermant un évènement (exemple une cellule) vont pouvoir être chargées électriquement, et déviées par des plaques en métal également chargées. La charge apposée à la gouttelette va dépendre de l’identité de l’évènement qu’elle enferme, afin d’être déviée dans la voie de tri choisie. Cette technologie permet une séparation jusqu’à 6 voies simultanément (encadré 4). Il est possible de trier dans des tubes type Eppendorf, des tubes à hémolyse, des tubes de 15 mL ou 50 mL ou encore directement en plaque de 6 à 96 puits, avec le nombre choisi de cellule(s) par puits, ce qui en fait une technique très adaptée au clonage.

 

Le tri peut se faire sur des cellules fixées ou des cellules vivantes, avec une vitesse allant jusqu’à 15 000 évènements par seconde pour des cellules eucaryotes voire 35 000 évènements par seconde pour des micro-organismes. Les cellules triées sont viables, rendant possible la remise en culture. Le tri peut également être couplé à toutes les techniques -omiques en aval, ou à de l’imagerie en dynamique cellulaire. Cette technique ouvre aussi de nombreuses possibilités en séquençage dit sur cellule unique.

 

Vous pouvez également trouver cette technologie sur la plateforme d’imagerie et de cytométrie PFIC (UMS AMMICA, Gustave Roussy, Villejuif), OCCIGEN (Genopole, Evry), et depuis quelques semaines seulement, sur la plateforme PLAIMMO (UMS IPSIT, Châtenay-Malabry) également.

 

Contact : Mickael Bourge (mickael.bourge@i2bc.paris-saclay.fr)

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

 

Aussi, le 20 septembre 2020, la plateforme de cytométrie publiait son premier un Scoop-it® / FOCUS PLATEFORME : La puissance statistique de la cytométrie au service de l’étude de flux ioniques intracellulaires en temps réel. Le lire à nouveau ?

 

I2BC / Plateforme de cytométrie (I2BC - plateformes IMAGERIE-GIF). Plus de 25 ans de service ! la plateforme réalise environ 300 prestations par an pour divers groupes de recherche appartenant à différents organismes de tutelles ou de sociétés privées. Les publications du service traduisent les nombreuses collaborations développées avec les différents instituts de la communauté Paris-Saclay ainsi qu’avec d’autres partenaires tels que l’INRA, l’INSERM, l’IRD, le CIRAD, des universités françaises et étrangères. Son expérience polyvalente et son expertise en sondes fluorescentes permettent d’adapter la cytométrie à des projets très divers issus de laboratoires publics et privés. Son partenariat avec SPS (Labex Saclay Plant Sciences) contribue à une activité importante dans le domaine de la biologie végétale. La plateforme de cytométrie en flux propose la mesure de fluorescence d'un ou plusieurs (> 10) fluorochromes simultanément, cellule par cellule. Cette technologie permet d'étudier: i) le dosage de la quantité d’ADN nucléaire en vue de l’étude de cycles cellulaires et d’endoréplication, ii) le dosage d’ADN à des fins de recherche en écologie et systématique, et d’amélioration des variétés (analyse de ploïdies), iii) le suivi de l’activité génique par l’expression d’un ou plusieurs gènes rapporteurs (tels que celui de la "Green Fluorescent Protein"-GFP et autres protéines fluorescentes), iv) des mesures d’activités métaboliques de la cellule (biosenseurs): dosage de calcium, pH, potentiel membranaire, poussées oxydatives, glutathion..., v) des analyses immunologiques, vi) le tri de cellules animales, de levures, de bactéries, de protoplastes et d’organites cellulaires.

 

A propos de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC - UMR 9198). L’I2BC est une Unité Mixte de Recherche (CEA, CNRS, Université Paris-Saclay), constituée de 70 équipes de recherches et 15 plateformes technologiques, provenant de 8 unités de recherches (CGM, IBBMC, IGM, ISV, LEBS, VMS, SB2SM, SBiGeM). L’institut est réparti sur 3 sites de recherche (Campus d’Orsay Vallée de l’Université Paris-Saclay, Campus du CNRS de Gif sur Yvette et Campus du CEA / Centre de Saclay) au sein de 14 bâtiments jusqu’au rassemblement programmé en 2020 sur le campus du CNRS de Gif-sur-Yvette.

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December 1, 4:19 PM
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FOCUS PLATEFORME : Marquage isotopique : Une nouvelle méthode permettant l’incorporation multi-site d’isotopes de l’hydrogène dans des molécules complexes

FOCUS PLATEFORME : Marquage isotopique : Une nouvelle méthode permettant l’incorporation multi-site d’isotopes de l’hydrogène dans des molécules complexes | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Vous avez dit marquage isotopique par le tritium ? Découvrez ci-dessous une nouvelle méthode mise au point au sein du Service de Chimie Bioorganique et de Marquage (SCBM, Département Médicaments et technologies pour la Santé, Institut Joliot, CEA, Centre de Paris-Saclay) et tout particulièrement sa plateforme de marquage isotopique, le tout dans le contexte d’une collaboration internationale, avec des chercheurs de l’Indian Institute of Technology Bombay et de l’Université de Fribourg.

 

Les molécules deutérées et tritiées connaissent une utilisation croissante dans des domaines variés tels que la santé, l'environnement et l'affichage. L'incorporation de deutérium dans les principes actifs permet notamment de ralentir leur vitesse de métabolisation, réduisant ainsi les doses à administrer aux patients et les effets secondaires associés à leur ingestion. Dans le domaine de l'affichage, l'utilisation de molécules deutérées permet d'augmenter significativement la durée de vie et, dans certains cas, les performances des écrans OLED (Organic Light Emitting Diodes). En recherche pharmaceutique, l'incorporation d'atomes de tritium dans un candidat médicament fournit des informations essentielles pour sa mise sur le marché, notamment concernant sa distribution, son absorption et son excrétion in vivo.

 

L'un des défis majeurs pour les chimistes aujourd'hui est de développer des méthodes efficaces et, si possible, à large spectre, permettant d'incorporer des atomes de deutérium et de tritium dans des molécules complexes (médicaments, fluorophores...) en une seule étape de synthèse à partir de la molécule d'intérêt. Dans ce contexte, un travail collaboratif entre des équipes de recherche indiennes et allemandes et des chercheurs de la plateforme de marquage isotopique a permis de mettre au point une nouvelle méthode de marquage efficace et polyvalente. Cette approche permet l'incorporation d'un grand nombre d'atomes de deutérium et de tritium sur des molécules complexes en utilisant l'eau lourde ou l'eau radiomarquée au tritium comme source isotopique. La méthode développée utilise un précatalyseur de palladium et un ligand disponibles commercialement et stables à l'air ce qui facilite sa mise en œuvre. Cette combinaison permet d'échanger plusieurs atomes d'hydrogène par des atomes de deutérium ou de tritium sur des molécules complexes telles que les principes actifs. En savoir plus ? Chitrala et al., Angew. Chem. Int. Ed. 2024.

 

Ces avancées pourraient faciliter l'accès à des molécules à haute valeur ajoutée, notamment des standards internes pour la quantification ou des analogues radiomarqués de candidats médicaments.

 

-> Contact : Grégory Pieters (gregory. pieters@cea.fr)

Plug In Labs Université Paris-Saclay : cliquer ICI

 

Plateforme de marquage isotopique. Cette plateforme possède une expertise (unique sur Paris-Saclay) en synthèse de composés marqués avec des isotopes stables (2H / deutérium et 13C / carbone-13) et par des isotopes radioactifs de type bêta (3H / tritium, 14C / carbone-14 et 125I / iode-125. Forte de son expertise dans la préparation (synthèse, contrôle de qualité) et formulation de molécules marqués, elle assure régulièrement des prestations et collaborations, académiques comme industrielles, dans le domaine du (radio)marquage moléculaire. Elle offre également à la demande, son expertise et environnement unique de travail (laboratoires « chauds », équipements dédiés) pour l’analyse et la caractérisation d’échantillons radioactifs : mesure de puretés chimique et radiochimique par HPLC, détermination d'enrichissements isotopiques et d'activités spécifiques par SM, analyse et détermination structurale par RMN liquide comme solide, mesure d’activités radioactives par comptage à scintillation. Enfin, la plateforme propose des solutions pour le traitement de déchets liquides radioactifs, en particulier ceux contenant du carbone-14 et du tritium.

 

A propos de l’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot : L’Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot (CEA-Joliot) étudie les mécanismes du vivant pour, à la fois, produire des connaissances et répondre à des enjeux sociétaux au cœur de la stratégie du CEA : la santé et la médecine du futur, le numérique et la transition énergétique. Les travaux, fondamentaux ou appliqués, reposent sur des développements méthodologiques et technologiques. Les collaborateurs du CEA-Joliot sont pour moitié impliqués dans des unités mixtes de recherche (UMR), en partenariat avec le CNRS, l'INRAE, l’INRIA, l'Inserm, l’Université Paris-Saclay et l’Université de Paris. Le CEA-Joliot est implanté principalement sur le centre CEA-Paris-Saclay. Des équipes travaillent également à Orsay, Marcoule, Caen, Nice et Bordeaux.

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December 5, 8:00 AM
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RAPPEL ! Participez à une "learning expedition" sur le thème des Sciences Cellulaires - 12 décembre 2024

RAPPEL ! Participez à une "learning expedition" sur le thème des Sciences Cellulaires - 12 décembre 2024 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Chers chercheurs de l'Université Paris-Saclay,

 

Nous sommes ravis de vous inviter à la 2ème Learning Expedition au sein de l'Institut de R&D Servier Paris-Saclay. Cette visite vous offrira l’occasion de plonger dans l'univers de la R&D avec un focus sur les Sciences Cellulaires (validation de cible, développement des modèles cellulaires, évaluation des mécanismes d'action et découverte des biomarqueurs).

 

Au programme :

  • Présentation de Servier : Découvrez la R&D de Servier, l'organisation, les grands axes stratégiques, le rationnel de son implantation sur l'Ecosystème Paris-Saclay. (Re)découvrez le parcours de découverte d'un médicament.
  • Visite des locaux : Immergez-vous dans l'univers de la R&D avec une visite des laboratoires.
  • Échange avec des experts : Echangez avec des experts de la Recherche Servier, et découvrez leur périmètre d’activités, les domaines d’application et les interactions avec les parties prenantes dans le secteur des sciences cellulaires.

 

  • Quand? Le 12 décembre 2024, de 14h à 17h
  • Où ? Institut de R&D Servier Paris-Saclay, 22 route 128, 91190 Gif-sur-Yvette
  • Inscriptions en cliquant ici
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December 4, 10:16 AM
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Elle travaille à l'IDEEV : Sabrina Bothorel, zootechnicienne à EGCE

Elle travaille à l'IDEEV : Sabrina Bothorel, zootechnicienne à EGCE | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Titulaire d’un Master 2 en biologie moléculaire spécialisé en génétique animale, Sabrina Bothorel a intégré le laboratoire Evolution Génomes Comportement Ecologie - EGCE (CNRS/UPSaclay/IRD, Gif-sur-Yvette) au sein de l’Institut diversité, écologie et évolution du vivant (IDEEV – UPSaclay/CNRS/INRAE/AgroParisTech/IRD) en 2022 sur un poste CNRS. Elle y partage son temps entre les abeilles du rucher de l’IDEEV, les drosophiles et les Cotesia en laboratoire. Déjà expérimentée avec les drosophiles, les élevages d’insectes et les complexes hôtes-parasites, cette passionnée d’insectes a dû se former pour travailler au contact des abeilles. Suivez son quotidien en images.

 

Lire la suite du portrait sur le site de l’IDEEV

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December 4, 10:01 AM
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RAPPEL ! Appels à projets 2024 - ANSES

RAPPEL ! Appels à projets 2024 - ANSES | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

 

Attention, les dates de clôture de nos Appels à Projets de Recherche approchent :

  • Appel Santé-Environnement et Santé-Travail le 10 décembre 2024 à 12H.
  • Appel Radiofréquences et Santé le 17 décembre 2024 à 12H.

 

Pour rappel, le dépôt des projets se fait maintenant sur Iris, la plateforme de l'Agence Nationale de la Recherche (ANR).

   

APR Santé-Environnement et Santé-Travail

 

Ce premier appel à projets de recherche sur le thème Santé-Environnement et Santé-Travail a pour objectif de générer des connaissances scientifiques utiles pour nourrir les expertises sur les risques sanitaires menées par l’Anses.

 

Je consulte cet appel à projets

        

APR Radiofréquences et Santé

 

Le second appel à projets de recherche est dédié au thème « Radiofréquences et Santé », qui fait l’objet d’une attention particulière compte tenu du besoin en connaissances et de la nécessité d’élargir la communauté scientifique qui s’intéresse à ce sujet.

 

Je consulte cet appel à projets

 

Pour en savoir plus sur le Programme National de Recherche Environnement-Santé-Travail, rendez-vous sur notre site.

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December 4, 9:42 AM
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PSCC Innovation Forum 2025 - 4 février 2025

PSCC Innovation Forum 2025 - 4 février 2025 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

The Paris-Saclay Cancer Cluster (PSCC) is pleased to invite you to the 2nd edition of the PSCC Innovation Forum on the occasion of World Cancer Day (Tuesday, February 4, 2025).

 

The event will take place from 9:15 (coffee reception from 8:30) to 17:15 at Les Esselières in Villejuif, followed by a cocktail reception at Campus Grand Parc (Villejuif).

 

Why join us?

 

Experience a full day dedicated to oncology innovation, scientific discovery, collaboration highlights and exchanges with key players in our ecosystem.

 

What’s on the agenda?

  • Scientific presentations and insights on the latest breakthroughs in oncology
  • Pitches from promising start-ups supported by the PSCC
  • Collaboration testimonials showcasing PSCC support provided to foster groundbreaking innovations.

 

With whom will you meet ?

 

Explore networking opportunities  and connect with academic institutions, industry leaders, startups, service organizations, investors, and institutional stakeholders from our vibrant oncology community.

 

Join us on World Cancer Day to discover, connect, and collaborate with pioneers in the fight against cancer.

 

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December 4, 8:13 AM
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AAP Caractérisation des lésions pré-néoplasiques en cancérologie

AAP Caractérisation des lésions pré-néoplasiques en cancérologie | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L'Inserm soutient la recherche sur la caractérisation des lésions pré-néoplasiques et la stratification de leurs risques évolutifs en cancérologie.

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December 4, 8:02 AM
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Les Lundis de l'IPSIT - Lundi 20 janvier 2025 : « La douleur, circuits centraux et périphériques »

Les Lundis de l'IPSIT - Lundi 20 janvier 2025 : « La douleur, circuits centraux et périphériques » | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans le cadre de l'article 5 de l'arrêté du 1er février 2013 relatif à la validation des compétences des personnels des établissements, utilisateurs d'animaux à des fins scientifiques, la SFR IPSIT organise un séminaire exceptionnel sur :

 

« La douleur, circuits centraux et périphériques »

le lundi 20 janvier 2025 de 09h15 à 12h3.

Université Paris-Saclay, Bâtiment Henri Moissan

17, avenue des Sciences 91400 Orsay (Salle 4000)

 

Organisateurs : Christine Tran et Abdallah Hamze (Laboratoire BioCIS, Equipe CoSMIT, UMR CNRS 8076, Orsay-91).

 

L'inscription au séminaire est GRATUITE mais OBLIGATOIRE, dans la limite des places disponibles et après validation des organisateurs, au plus tard le 9 septembre 2024, à l'adresse suivante : nadine.belzic@inserm.fr

 

Intervenants :

  • Sylvie DUCKI (Université Clermont Auvergne, CNRS,
    Clermont Auvergne INP, ICCF, Clermont-Ferrand) :
    Addressing the opioid crisis by developing non-opioid analgesics for the treatment of chronic pain
  • Jérôme BUSSEROLLES (UMR1107, NeuroDol, Clermont-Ferrand) : Validation d'une stratégie peptidomimétique ciblant les canaux HCN pour traiter la neuropathie induite par l'oxaliplatine
  • Didier BOUHASSIRA (Directeur de l'UMR-S 987 Inserm/UVSQ/UPSaclay/APHP/CHU Ambroise Paré, Boulogne Billancourt) : La neuromodulation analgésique : de l’étude des mécanismes physiologiques aux applications thérapeutiques
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December 4, 5:49 AM
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Portrait Jeune Chercheur – Alaksh Choudhury, Researcher in Molecular and Evolutionary Biology

Portrait Jeune Chercheur – Alaksh Choudhury, Researcher in Molecular and Evolutionary Biology | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Alaksh Choudhury is a molecular biologist specializing in microbial adaptation to new environments and functions, with broad applications in industrial biotechnology. He has been working in the UMR 8030 Génomique Métabolique (Genoscope, CEA/CNRS/UEVE/UPSaclay, Évry) since 2023, where his research focuses on the genetic and molecular mechanisms that enable microorganisms to adapt and evolve under changing conditions, aiming to apply these insights to optimize microbial systems for sustainable production.

 

During his Ph.D., under the co-supervision of Drs. Ryan Gill and Joel Kaar in the Department of Chemical Engineering at University of Colorado in Boulder (USA), Alaksh discovered that essential proteins and protein complexes are critical for microbial adaptation. To address this, he developed CRISPR/Cas9-based technologies to target essential bacterial genes, revealing key mutations that enhance microbial fitness in various industrial contexts. His research highlighted the adaptive roles and molecular mechanisms of proteins like RNA polymerase and global regulators, demonstrating how directed evolution can optimize microbial strains more efficiently than traditional approaches, offering better and more innovative solutions for industrial applications.

 

In his postdoctoral research, Alaksh worked with Dr. Olivier Tenaillon in the Quantitative Evolutionary Microbiology lab (UMR1137, INSERM, Paris). Here he developed a molecular barcoding technique for real-time tracking of microbial evolution in diverse environments. This approach provided new insights into the adaptive landscape of microbes, uncovering evolutionary dynamics for growth in defined media and survival and emergence of antibiotic resistance in ecosystems such as biofilms. Additionally, this method enabled the identification of hundreds of beneficial mutations that enhance microbial fitness under specific conditions.

 

Looking ahead, Alaksh aims to continue developing high-throughput genetic technologies to further understand and predictably control microbial systems. Microbes, with their remarkable ability to perform multi-step conversions of diverse substrates into value-added products at room temperature, hold immense promise for sustainable industrial production. However, the industrialization of microbial bioconversion is limited by the inherent conflict between natural microbial evolution—optimized for growth and survival—and the engineering goals of maximizing product yields. To overcome this, Alaksh focuses on complex traits such as resource regulation and cell morphology, which are key to resolving these conflicts.

 

His ultimate goal is to use high-throughput technologies to understand the molecular determinants of adaptation driven by these cellular traits. By gaining this understanding, Alaksh seeks to facilitate the directed engineering of microbes, optimizing them for bioconversion. This work will provide fundamental insights into core cellular processes and help build a comprehensive dataset of adaptation-promoting mutations across multiple conditions.

 

In the long term, Alaksh plans to leverage this dataset to develop strategies for the predictable control of microbial systems for industrial and medical applications.

 

Ignoring isn’t the same as ignorance, you have to work at it.” - Margaret Atwood

 

-> Contact : achoudhu@genoscope.cns.fr

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December 3, 4:47 PM
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La suppression du gène Fas améliore la persistance des thérapies cellulaires allogéniques

La suppression du gène Fas améliore la persistance des thérapies cellulaires allogéniques | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La thérapie cellulaire par CAR-T, lymphocyte T modifié pour reconnaitre la tumeur, provenant de donneurs sains pourraient offrir une solution rapide et standardisée dans le traitement des leucémies. Cependant, ces cellules peuvent être détruites par le système immunitaire du patient en étant reconnu comme étrangères (greffe allogénique).

 

Dans une étude publiée dans Nature Biomedical Engineering, Silvia Menegatti et les scientifiques des laboratoires de Sébastien Amigorena (Institut Curie, Paris) et Laurie Menger (UMR-S 1015 Immunologie des tumeurs et immunothérapie, INSERM/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif) ont utilisé des ciseaux moléculaires, un criblage CRISPR knock-out à l'échelle du génome in vivo, pour identifier les gènes augmentant la survie des cellules T dans des hôtes allogéniques. Les résultats montrent que la délétion du gène (FAS) dans les cellules T allogéniques améliore leur efficacité et réduit leur rejet/destruction de manière plus efficace que la cible traditionnelle B2M.

 

A terme, cette technologie pourrait permettre de traiter par thérapie cellulaire davantage de patients atteints de cancer.

 

-> Contact : laurie.menger@gustaveroussy.fr

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December 3, 4:29 PM
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Prévalence et facteurs de risque de colonisation néonatale par bactéries résistantes aux antibiotiques dans les pays à bas et moyens revenus: une revue systématique et méta-analyse

Prévalence et facteurs de risque de colonisation néonatale par bactéries résistantes aux antibiotiques dans les pays à bas et moyens revenus: une revue systématique et méta-analyse | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans un article publié dans JAMA Network Open, l’équipe « Épidémiologie et Modélisation de la Résistance aux Antimicrobiens » de l’Institut Pasteur et du CESP (UPSaclay/UVSQ/INSERM, Montigny-le-Bretonneux) présente les résultats d’une revue systématique et méta-analyse sur la colonisation néonatale par des bactéries résistantes aux antibiotiques dans les pays à faible et moyens revenus (PRFI). Ces régions regroupent la quasi-totalité des décès néonataux et le plus lourd fardeau de la résistance aux antibiotiques.

 

Les infections néonatales bactériennes y sont principalement causées par des entérobactéries et par Staphylococcus aureus, bactéries particulièrement concernées par la résistance aux antibiotiques. Ce travail synthétise les données sur la prévalence et les facteurs de risque associés à la colonisation pour trois types de germes résistants : Enterobacterales résistants aux céphalosporines de troisième génération (3GCRE) et aux carbapénèmes (CRE), ainsi que Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM).

 

Parmi 3147 articles analysés, 67 études incluant 17 152 individus ont été inclus. La prévalence globale de colonisation par 3GCRE était de 30,2%, variant de 18,2% chez les non-hospitalisés à 48,2% chez les hospitalisés. La colonisation par CRE et SARM était moins fréquente, avec des prévalences respectives de 2,6% et 2,7%. Les principaux facteurs de risque de colonisation à 3GCRE incluent la naissance à l’hôpital (OR 1,87), l’administration d’antibiotiques (OR 2,96) et une rupture prolongée des membranes (OR 3,86).

 

Malgré une grande hétérogénéité des données reflétant les disparités régionales, ces résultats mettent en lumière l’importance de l’acquisition de bactéries résistantes aux antibiotiques dès la naissance et la nécessité de mieux comprendre les voies de transmission et d’élaborer des stratégies de prévention ciblées.

 

Légende Figure : Forest plot : Prévalence de la colonisation par des entérobactéries résistantes aux céphalosporines de troisième génération stratifiée par le statut d'hospitalisation.

 

-> Contact : anne-lise.beaumont@pasteur.fr

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December 3, 3:57 PM
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Une nouvelle fonction de la protéine ciliaire B9D2 dans la polarité épithéliale et son implication dans les dysgénésies biliaires

Une nouvelle fonction de la protéine ciliaire B9D2 dans la polarité épithéliale et son implication dans les dysgénésies biliaires | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les ciliopathies, comme les syndromes de Meckel-Gruber et Joubert, sont des maladies rares qui perturbent le développement embryonnaire en raison de dysfonctions du cil primaire. Une étude récente menée par l’équipe de Pascale Dupuis-Williams au sein de l’UMR-S 1193 (INSERM/UPSaclay, FHU Hepatinov, Orsay) publiée dans Scientific Reports, apporte un nouvel éclairage sur l’origine des anomalies biliaires provoquées par les mutations d’une protéine préalablement identifiée pour son rôle dans la signalisation ciliaire.

 

Les auteurs ont montré qu’avant même que les cils ne se forment, la protéine B9D2 joue un rôle crucial dans la cohésion et l'étanchéité des cellules dans les tissus épithéliaux. Grâce à la microscopie haute résolution, Chloé Caenen-Braz et ses collègues ont découvert que B9D2 se trouve localisée au niveau des jonctions serrées d’épithéliums biliaires ou rénaux. En l'absence de B9D2, des protéines clés comme ZO1 et Claudin 4, qui assurent la polarité et la cohésion des cellules, sont délocalisées, perturbant la structure des jonctions serrées, comme l'ont confirmé des observations en microscopie électronique. Les chercheurs ont également montré que le knock-down de B9D2 affecte la fonction barrière des cellules épithéliales et perturbe le développement des organoïdes biliaires, plus spécifiquement l’expansion du lumen, modélisant les dysgénésies biliaires observées chez les patients atteints de ces maladies.

 

Ces découvertes offrent une nouvelle perspective sur les ciliopathies. Elles suggèrent que, au-delà de son rôle dans les cils, B9D2 est essentielle pour organiser les jonctions cellulaires et permettre le développement normal des tissus. Mieux comprendre ces mécanismes pourrait ouvrir la voie à de nouvelles approches thérapeutiques pour traiter les maladies du foie, comme les cholestases hépatiques.

 

-> Contact : pascale.dupuis-williams@universite-paris-saclay.fr

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December 3, 12:25 PM
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Un kit portable utilisant la technique de résonance plasmonique de surface pour détecter des traces de composés

Un kit portable utilisant la technique de résonance plasmonique de surface pour détecter des traces de composés | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La diffusion Raman exaltée par surface (SERS, pour Surface-Enhanced Raman Scattering) est un phénomène qui intensifie le signal Raman d'une molécule lorsqu'elle interagit avec une surface métallique composée de nanoparticules. Ce signal Raman résulte de l'interaction entre un faisceau laser et les vibrations moléculaires, ce qui permet d'analyser la composition chimique d'un échantillon. La méthode SERS amplifie ce signal en plaçant la molécule cible sur une surface métallique rugueuse (comme dans la technique de Biacore) ou sur des nanoparticules. Cette amplification est due à des effets électromagnétiques, liés aux plasmons de surface, ainsi qu'à des effets chimiques qui renforcent l'intensité de la diffusion lumineuse.

 

Des chercheurs de BioCIS (Biomolécules : conception, isolement, synthèse – CNRS/UPSaclay, Orsay) et de l’Université Xidian (Shaanxi, Chine) ont mis au point un appareil économique utilisant un spectromètre Raman portable adapté à la technique SERS, accompagné d’un kit de test à faible coût. Ils ont réussi à concentrer des agrégats de nanoparticules d’or et d’argent responsables de l'excitation plasmonique, afin d'atteindre la limite de détection la plus basse possible. Ces amas ont ensuite été déposés sur un support en papier, permettant d’acheminer la molécule à analyser par simple capillarité. Cette approche rend la méthode totalement automatisée et facile à utiliser. En appliquant cette technique, les chercheurs ont pu détecter des concentrations très faibles (10⁻¹⁰ M) de malachite verte et de bleu de méthylène, deux polluants courants dans les rivières chinoises.

 

Ces résultats, publiés dans Biosensors and Bioelectronics, démontrent la possibilité d’utiliser la résonance plasmonique de surface pour détecter des traces de composés d’intérêt sans avoir recours à des méthodes complexes de préparation d’échantillons. Le dispositif développé sera désormais testé en dehors des environnements de laboratoire pour identifier d’autres polluants, tels que des résidus pharmaceutiques.

 

-> Contact : bruno.figadere@cnrs.fr

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December 3, 11:27 AM
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Loïc Josseran est élu Président de l’UVSQ

Loïc Josseran est élu Président de l’UVSQ | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le Conseil d'administration de l’Université s’est réuni le lundi 2 décembre 2024 afin d’élire le nouveau Président de l’Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines. Le Professeur Loïc Josseran a été élu pour un mandat de 4 ans, au premier tour, avec 23 voix sur 36.


Les étudiants et les personnels de l’UVSQ se sont mobilisés du 12 au 14 novembre pour élire leurs représentants aux conseils centraux de l’université : Conseil d’Administration, Commission Formation et Vie Universitaire, Commission Recherche.
Ces élections se sont démarquées par leurs taux de participation élevés avec près de 70% de votants parmi les personnels et près de 26 % chez les étudiants et étudiantes.

En tant que Président de l’UVSQ j’invite toute la communauté universitaire à se rassembler pour construire, en phase avec nos valeurs, l’Université de demain. Forte de ses formations et de sa recherche de pointe, l’UVSQ bénéficie d'un rayonnement national et international. Notre université est aussi insérée dans un territoire socioéconomique dynamique, qui a le souhait clair de l'accompagner vers le plus haut niveau. Notre université porte haut les valeurs du service public, pour la réussite et le bien-être de tous et toutes. Mon projet a pour ambition de construire collectivement des politiques et des stratégies de recherche, de formation et de vie universitaire qui traceront une trajectoire claire et cohérente pour les années à venir. Nos actions seront à écrire dans le cadre de notre intégration au futur Grand Établissement Paris-Saclay. Avec à mes côtés une équipe de femmes et d’hommes pleinement investis, représentatifs de l'ensemble de notre communauté, nous nous donnons 4 années pour faire de notre université un lieu d’excellence, d’innovation, et de rayonnement. Un lieu où l’ensemble des personnels et des étudiants se sent valorisé, reconnu, et où les talents s’épanouissent.»

 

Loïc Josseran est professeur en santé publique à l'UFR Simone Veil-Santé de l'UVSQ et praticien hospitalier à l'hôpital Raymond Poincaré de l'AP-HP. Egalement président d'Alliance contre le tabac.

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Today, 8:52 AM
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Quel est votre niveau de satisfaction par rapport à la SATT Paris-Saclay ?

Quel est votre niveau de satisfaction par rapport à la SATT Paris-Saclay ? | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

En tant que chercheur/responsable scientifique, quel est votre niveau de connaissances et votre satisfaction vis-à-vis des services rendus par la SATT Paris-Saclay ?

   

Depuis 2010, le Fonds national de valorisation, mis en œuvre par le Secrétariat général pour l’investissement (SGPI) en coordination avec le Ministère de la recherche et le Ministère de l’industrie, a été destiné à financer des actions de soutien de la valorisation de la recherche publique.

 

Un peu plus de 80% de ce fonds a été consacré à la création et au soutien de sociétés d’accélération de transfert de technologie (les SATT) adossées aux établissements d’enseignement supérieur et organismes de recherche.

 

A ce jour, 13 SATT sont établies sur le territoire national.

 

Dans le cadre de l’évaluation ex-post du financement octroyé pour cette action, le SGPI a mandaté l’ANR pour exécuter un bilan et identifier les principaux résultats des SATT.

 

Une étude économétrique est actuellement en cours de réalisation pour mesurer l’effet de l’achat d’une licence par les entreprises sur leurs performances économiques.

 

En complément, des questionnaires ont été produits à destination des différentes parties prenantes des SATT pour mesurer en quoi les SATT répondent aux besoins des établissements d’enseignement supérieur, des chercheurs et des entreprises.

 

Plus précisément, l’ANR souhaite connaître votre niveau de connaissances, en tant que chercheur/responsable scientifique, et votre satisfaction vis-à-vis des services rendus par la SATT Paris-Saclay.

 

Répondre au questionnaire pour la SATT Paris-Saclay

Maximum 2 min

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December 4, 5:28 PM
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L’inquiétude des universités – Reportage à l’université d’Evry-Paris-Saclay dans le JT ICI 19/20 - Paris Ile-de-France

L’inquiétude des universités – Reportage à l’université d’Evry-Paris-Saclay dans le JT ICI 19/20 - Paris Ile-de-France | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Reportage réalisé à l’UEVE. Avec les interventions de Vincent Bouhier, président de l’université d’Evry-Paris-Saclay, et de Régis Daniel, Matthieu Bourderioux et Clément Campillo du LAMBE (Laboratoire Analyse, Modélisation, Matériaux pour la Biologie et l'Environnement).

 

Revoir le JT ICI 19/20 Paris Ile-de-France du 3 décembre 2024 (1’06’’-3’08’’)

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December 4, 10:08 AM
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Assemblée générale annuelle de la Graduate School HeaDS - Vendredi 10 janvier 2025 12h-14h

Assemblée générale annuelle de la Graduate School HeaDS - Vendredi 10 janvier 2025 12h-14h | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Nous avons le plaisir de vous convier à l’Assemblée Générale annuelle de la Graduate School Health and Drug Sciences de l’Université Paris-Saclay. Elle se tiendra le :

 

Vendredi 10 janvier 2025 | 12h30 à 13h30

Amphithéâtre Hervé Daniel

Bâtiment Henri Moissan

17 avenue des sciences

91 400 ORSAY

 

ou

 

En visioconférence via ce lien

Merci de nous confirmer votre présence avant le lundi 16 décembre 2024 via le formulaire d'inscription.

 

L’Assemblée Générale sera suivie d’un moment de convivialité autour d’un café.

 

L'équipe de Direction de la GS HeaDS.

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December 4, 9:55 AM
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AAP FEDER 2024 - Grands projets de recherche, développement et innovation liés aux filières prioritaires | L’Europe en Île-de-France

La Région Île-de-France lance un appel à projets "Grands projets de recherche, développement et innovation, liés aux filières prioritaires", financé par le Fonds européen de développement régional. Cet appel à projets mobilisera une dotation de 4 à 6 millions d’euros au titre de l'action "Soutien aux grands projets de recherche, de développement et d’innovation des filières prioritaires de la stratégie de spécialisation intelligente".

 

 

Pour vous aider dans l’élaboration de vos candidatures, des réunions de présentation de cet appel à projets nous seront proposées, pendant la période de publication. Les dates de ces réunions seront publiées ultérieurement.

 

-> Contact : AAP-FEDER@iledefrance.fr / europe@iledefrance.fr

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December 4, 8:19 AM
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Fondation Lefoulon-Delalande - Bourses de Recherche 2025

Fondation Lefoulon-Delalande - Bourses de Recherche 2025 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Créées en 2001, les Bourses de Recherche de la Fondation Lefoulon-Delalande ont pour but de promouvoir les activités d’un chercheur post-doctorant travaillant à plein temps dans le domaine cardio-vasculaire au sein d’une structure de recherche française ; les stages de recherche correspondant à un premier post-doctorat au sein de la même structure, et les stages de recherche à l’étranger n’étant pas recevables.


Le sujet de recherche peut porter sur le développement, la physiologie, les pathologies, l’épidémiologie, les thérapeutiques médicales ou chirurgicales cardio-vasculaires à l’exclusion des recherches portant sur la cancérologie.

 

Le candidat doit être titulaire d’un doctorat en médecine, sciences, pharmacie ou vétérinaire ou d’un diplôme équivalent.

 

Des bourses d’une durée de deux ans, d’un montant de 100 000 euros chacune toutes charges comprises (cotisations retraites, charges sociales), seront attribuées au titre de 2024. Ce montant pourra être porté à 115 000 euros selon l’ancienneté du bénéficiaire et l’appartenance institutionnelle de son laboratoire de recherche. Chaque candidature doit être parrainée par un laboratoire d’accueil qui recevra le montant de la bourse, à charge pour lui de la servir au bénéficiaire et d’établir avec lui un contrat à durée déterminée (CDD) de deux ans.

 


Via Life Sciences UPSaclay
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December 4, 8:11 AM
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Sanofi iDEA-iTECH Awards

Sanofi iDEA-iTECH Awards | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Sanofi, en partenariat avec l'Inserm, ouvre un appel à projets destiné aux chercheurs académiques, start-ups et biotechs européennes développant des technologies nouvelles en immunologie, oncologie, maladies rares, vaccins, IA, et modèles translationnels. Les projets retenus bénéficieront d’un financement d’amorçage de 120 000 € et d’une collaboration scientifique d’un an avec Sanofi.

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December 4, 6:30 AM
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SAVE THE DATE ! 8th International ISEKI-Food Conference "Innovation in Research and Education for the transition to sustainable food systems" - 2-4 juillet 2025 à Timisoara (Roumanie)

SAVE THE DATE ! 8th International ISEKI-Food Conference "Innovation in Research and Education for the transition to sustainable food systems" - 2-4 juillet 2025 à Timisoara (Roumanie) | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

The 8th International ISEKI-Food Conference "Innovation in Research and Education for the transition to sustainable food systems" will take place at the University of Life Sciences "King Mihai I" in Timisoara, Romania, on 2-4 July 2025.

 

Marwen MOUSSA (UMR SayFood, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau)

Chair of the Scientific Committee

-> Contact : marwen.moussa@inrae.fr

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December 3, 5:09 PM
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Comment les adaptations structurelles contrôlent la fonction du facteur von Willebrand

Comment les adaptations structurelles contrôlent la fonction du facteur von Willebrand | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une revue publiée dans Blood, des chercheurs de l’unité Hémostase Inflammation Thrombose (UMR-S 1176 INSERM/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre) font un point sur les relations structure-fonction du facteur von Willebrand (VWF) à l'aide de structures tridimensionnelles.

 

Le VWF est une protéine multimérique avec une structure en domaines discrète qui joue un rôle critique dans l'hémostase. Pour remplir ce rôle, le VWF interagit avec un large spectre de ligands, notamment le facteur de coagulation VIII, le collagène, la protéase ADAMTS13 et les récepteurs plaquettaires glycoprotéine Ib-α et intégrine α-IIb/β-3. Il est important de noter que les interactions sont régulées différemment pour chacun de ces ligands.

 

Dans cette revue, les auteurs décrivent comment ces événements de liaison s’accomplissent et se coordonnent. Un regard plus détaillé sur la structure du domaine du VWF nous apprend que ces structures se retrouvent dans des centaines d'autres protéines d'origine pro- et eucaryote. Il est intéressant de noter que la détermination des structures tridimensionnelles des domaines VWF individuels, seuls ou en complexe avec leur ligand, révèle que des adaptations structurelles exclusives et spécifiques au VWF ont été incorporées. Elles expliquent comment le VWF lie ses ligands de manière synchronisée et opportune. En outre, les auteurs utilisent ces informations pour décrire comment les mutations de ces domaines, qui sont associées à la maladie de von Willebrand, modulent l'interaction entre le VWF et ses ligands.

 

Légende Figure : Le facteur Von Willebrand (VWF) se lie à de multiples ligands, dont les interactions sont régulées différemment pour chacun d'entre eux. La liaison des ligands est contrôlée et coordonnée par des adaptations structurelles uniques dans les domaines qui constituent le VWF.

 

-> Contact : peter.lenting@inserm.fr

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December 3, 4:37 PM
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Association positive entre l'exposition alimentaire aux PCB et le risque d'obésité observée dans la cohorte E3N Générations

Association positive entre l'exposition alimentaire aux PCB et le risque d'obésité observée dans la cohorte E3N Générations | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les polychlorobiphényles (PCB) et les dioxines sont des polluants organiques persistants présents dans notre alimentation et connus pour leur capacité à se bioaccumuler. Des études animales suggèrent des effets obésogènes, mais à ce jour, très peu d’études ont été réalisées dans des populations humaines.

 

Dans une étude publiée dans Science of The Total Environment, les chercheurs de l’équipe Exposome et hérédité du Centre d’Epidémiologie et de Santé des Populations - CESP (UMR-S 1018 INSERM/UVSQ/UPSaclay, Villejuif) ont étudié les associations entre les apports alimentaires en PCB et en dioxines et le risque de prise de poids, de surpoids et d’obésité dans la cohorte E3N Générations. Cette cohorte prospective comprend 98 995 femmes adultes suivies depuis 1990 par le biais de questionnaires sur les habitudes de vie et la santé. Cette étude a mis en évidence une association positive, linéaire et statistiquement significative entre les apports alimentaires en non-dioxine-like PCB et le risque de prise de poids, de surpoids et d’obésité chez les femmes adultes.

 

Ces résultats, combinés à d’autres études, pourraient être utiles aux évaluateurs des risques et aux décideurs politiques pour réviser ou mettre en œuvre des réglementations sur les niveaux de contamination des aliments afin de garantir la sécurité des consommateurs.

 

-> Contact : francesca.mancini@gustaveroussy.fr

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December 3, 4:10 PM
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Le ribosome profiling de la levure dévoile une grande diversité de patterns de traduction non-canonique

Le ribosome profiling de la levure dévoile une grande diversité de patterns de traduction non-canonique | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La traduction « pervasive » est un phénomène très répandu qui joue un rôle clé dans l'émergence de nouvelles microprotéines. Cependant la diversité des patterns de traduction pouvant être associés à leur production demeure inconnue. À partir de 54 jeux de données de « Ribosome profiling » (Ribo-Seq), les scientifiques de l’équipe d’Anne Lopes au sein de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) ont exploré le paysage de Ribo-Seq de la levure à l’aide d’un système de représentation permettant l’inventaire exhaustif et la classification de toute la diversité des patterns de Ribo-Seq, incluant les patterns non-canoniques.

 

Dans leur étude parue dans Genome Biology, les auteurs montrent que si les régions codantes occupent des zones spécifiques du paysage de Ribo-Seq, les régions non-codantes présentent une grande diversité de patterns de Ribo-Seq, occupant l’ensemble du paysage de Ribo-Seq. Ils montrent cependant que la traduction « pervasive » peut être associée à une grande spécificité de traduction, avec l’identification de 1055 ORFs non-codantes présentant des patterns de Ribo-Seq typiques des régions codantes. En utilisant la spectrométrie de masse dans des conditions standards ou après inhibition du protéasome, ils ont pu identifier 239 microprotéines issues d’ORFs non-codantes présentant des patterns de Ribo-Seq canoniques mais aussi non-canoniques. Chaque condition dévoile des dizaines de candidats supplémentaires, suggérant une population plus importante de microprotéines difficiles à détecter.

 

Ces résultats indiquent que les patterns de traduction non-canoniques peuvent recéler des informations précieuses et soulignent l’importance de leur prise en compte dans les études de protéogénomique. L’étude montre également que la traduction d’une ORF non-codante dépend simplement du codon d’initiation et de la distribution des codons dans ses deux cadres alternatifs, plutôt que de caractéristiques reflétant une potentielle fonction.

 

Ces résultats permettent de proposer une topologie du paysage Ribo-Seq d’une espèce, ouvrant la voie à de nouvelles analyses comparatives sous différentes conditions.

 

-> Contact : anne.lopes@i2bc.paris-saclay.fr

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December 3, 12:33 PM
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Nanocapteur pour mesurer les interactions à l'échelle nanomoléculaire

Nanocapteur pour mesurer les interactions à l'échelle nanomoléculaire | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Dans une étude publiée dans Angewandte Chemie les scientifiques de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) quantifient avec une précision sub-nanométrique les distances entre les biomolécules au sein de la machinerie adhésive de la cellule. En effet, les cellules forment les points d’ancrage macromoléculaires via lesquels elles se lient à la matrice qui l’entoure (matrice extracellulaire). Les adhésions sont alors responsables de la transmission des stimuli de l’intérieur vers l’extérieur de la cellule (ou inversement), afin que les cellules puissent construire ou réparer des tissus. Cependant, les interactions entre les biomolécules de l’adhésion restent incomprises, car ces plateformes macromoléculaires sont extrêmement denses et complexes et les outils permettant de suivre la dynamique moléculaire ne sont pas suffisamment résolus dans l'espace.

 

Ainsi, les auteurs développent une méthode pour résoudre les interactions intermoléculaires dans la machinerie adhésive cellulaire, en utilisant des nanocapteurs à base de nanoparticules appelés boîtes quantiques (quantum dots). Ils ont pu quantifier la distance qui sépare une composante protéique (taline) de la membrane et ont mesuré la variation de cette distance lorsque la protéine répond à un stimulus mécanique (initié par la contraction du cytosquelette). Ils ont pu démontrer que leurs nanocapteurs peuvent être utilisés pour la quantification des interactions biomoléculaires avec une précision inférieure au nanomètre.

 

-> Contact : marcelina.cardoso-dos-santos@i2bc.paris-saclay.fr

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December 3, 11:45 AM
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L'enrichissement local de MatP retarde la ségrégation indépendamment de la formation de tétramères et de l'ancrage septal chez Vibrio cholerae

L'enrichissement local de MatP retarde la ségrégation indépendamment de la formation de tétramères et de l'ancrage septal chez Vibrio cholerae | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Vibrio cholerae possède deux chromosomes, un chromosome primaire dérivé de l'ancêtre monochromosomique des Vibrionales (ChrI) et un chromosome secondaire dérivé d'un mégaplasmide (ChrII). La ségrégation du terminus de réplication des deux chromosomes (TerI et TerII) est coordonnée à la division cellulaire. ChrI code pour un homologue de Escherichia coli MatP, une protéine qui se lie à un motif d'ADN (matS) surreprésenté dans les termini de réplication.

 

Dans une étude publiée dans Nature Communications, l’équipe Evolution and Maintenance of Circular Chromosomes de l’I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) a utilisé une combinaison de techniques de séquençage massif et de microscopie à fluorescence pour montrer que chez V. cholerae MatP structure TerI et TerII en macrodomaines, les cible au milieu de la cellule pendant la réplication et retarde leur ségrégation.

 

Ces résultats indiquent que ChrII se comporte comme un véritable chromosome. Ces résultats montrent également que l'ampleur du retard de ségrégation médié par MatP dépend du nombre et de la densité locale des sites matS, et qu'il est indépendant de l'assemblage en tétramères de MatP et de toute interaction de MatP avec le divisome, contrairement à ce qui a été observé précédemment chez E. coli.

 

-> Contact : francois-xavier.barre@i2bc.paris-saclay.fr / elisa.galli@i2bc.paris-saclay.fr

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