Biodiversité
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Biodiversité
Revue de presse et du net par la Mission valorisation et documentation de l'Agence française pour la biodiversité
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La géovisualisation, kézako ?

La géovisualisation, kézako ? | Biodiversité | Scoop.it

Sidonie Christophe est chercheuse au sein du Laboratoire en sciences et technologies de l’information géographique (LaSTIG). Dans ce premier billet (d'une série de trois), elle nous explique ce qu'est la géovisualisation, une discipline véritablement interdisciplinaire qui mêle entre autres données géographiques, algorithmes, perception, cognition... autant de notions que nous utilisons quotidiennement... sans toujours le savoir …

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via @Blog_Binaire

Auteur @SidoChristophe

 

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Remote Sensing - Open Access Journal

Remote Sensing - Open Access Journal | Biodiversité | Scoop.it

Papiers récemment mis en ligne dans la revue avant le N° spécial suivie de la biodiversité.

Automatic Inundation Mapping Using Sentinel-2 Data Applicable to Both Camargue and Doñana Biosphere Reserves 2251; https://doi.org/10.3390/rs11192251 - 27 Sep 2019

Potential of Smartphone SfM Photogrammetry to Measure Coastal Morphodynamics

by Marion Jaud ,Matthieu Kervot ,Christophe Delacourt and
 
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via Dynafor : A "Special Issue : Remote Sensing for Biodiversity Mapping and Monitoring" Deadline for manuscript submissions: 30 November 2020.

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StoX: An open source software for marine survey analyses - Johnsen 2019 - Methods in Ecology and Evolution

StoX: An open source software for marine survey analyses - Johnsen 2019 - Methods in Ecology and Evolution | Biodiversité | Scoop.it

Scientists across the globe conduct survey programs to monitor and characterize abundance, population structure, biodiversity and geographical distributions. To assess the state of marine fish and zooplankton, population surveys are often repeated annually using standardized sampling protocols and analysis techniques to establish trustworthy stock status. However, although transparency and repeatability are recognised as important principles of this process, it is often difficult to obtain comprehensive documentation of metadata and data processing steps. This is particularly challenging for workflows that include manual processing steps.

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Apports de la modélisation spatiale pour la gestion de la trame verte et bleue

Apports de la modélisation spatiale pour la gestion de la trame verte et bleue | Biodiversité | Scoop.it

Face à l’inefficacité des zonages classiques de protection pour enrayer la perte de biodiversité, la mise en connexion des habitats naturels pour permettre aux espèces animales et végétales de se déplacer est devenue un enjeu majeur des politiques environnementales. L’identification et la gestion des réseaux écologiques soulève néanmoins des difficultés face à la diversité des méthodes pour analyser la connectivité et le manque de données harmonisées à l’échelle d’un pays. L’objectif de cette étude est d’utiliser la théorie des graphes pour intégrer plus finement la connectivité fonctionnelle du paysage dans la modélisation des réseaux écologiques à différentes échelles spatiales.

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Céline Clauzel et Charlotte Bonnevalle, « Apports de la modélisation spatiale pour la gestion de la trame verte et bleue », Cybergeo : European Journal of Geography [En ligne], Environnement, Nature, Paysage, document 900, mis en ligne le 05 juin 2019, consulté le 05 août 2019. URL : http://journals.openedition.org/cybergeo/32333 ; DOI : 10.4000/cybergeo.32333

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Dépasser sa peur des espèces invasives grâce à la science citoyenne

Dépasser sa peur des espèces invasives grâce à la science citoyenne | Biodiversité | Scoop.it
La crainte que nous inspirent les espèces invasives n’est pas étrangère à notre méconnaissance de la nature.

Dans le contexte du réchauffement climatique et de multiples autres causes humaines (déplacements globalisés en tête), des espèces changent d’aire de répartition avec l’aide de l’homme. La perte globale de biodiversité constatée sur Terre facilite ce processus, rendant les écosystèmes encore plus vulnérables et sensibles aux espèces envahissantes.

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"Cet article est publié en collaboration avec les chercheurs de l’ISYEB (Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité, Muséum national d’Histoire naturelle, Sorbonne Universités). Ils proposent chaque mois une chronique scientifique de la biodiversité : « En direct des espèces ». Objectif : comprendre l’intérêt de décrire de nouvelles espèces et de cataloguer le vivant."

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La conservation de la biodiversité Méditerranéenne de la science à l’action - Medwet

La conservation de la biodiversité Méditerranéenne de la science à l’action - Medwet | Biodiversité | Scoop.it

Une plateforme interactive pour le partage de données sur la conservation de la biodiversité en Méditerranée

Grâce au soutien de la Fondation MAVA, le Centre de Coopération pour la Méditerranée de l’UICN (UICN-Med) a lancé une plateforme collaborative pour partager les connaissances et les données du système d’information géographique (SIG) qui permet de raconter des histoires en utilisant des documents consensuels, pour présenter des données interactives sur la conservation et la biodiversité. La nouvelle plateforme « MED CONSERVATION MAPS » vise à accumuler les connaissances générées par les réseaux scientifiques de conservation, toujours sur la base d’une histoire.

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Le Groupe de Spécialistes de la biodiversité (MedWet/STN/GS-Biodiversité) a récemment publié une fiche technique qui présente l’état de la biodiversité dans la région méditerranéenne et les menaces qui pèsent sur les espèces dans la région. https://medwet.org/wp-content/uploads/2018/10/MedWetSTN-biodiversit%C3%A9-fr.pdf

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La technologie connectée au service des tortues marines

La technologie connectée au service des tortues marines | Biodiversité | Scoop.it
Plus petites, plus précises, plus autonomes et… moins chères ! Les balises en cours de test sur l’île d’Europa pour le marquage des tortues marines ouvrent de nouvelles perspectives scientifiques.
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Sur le site de l'Ifremer le 8 avril 2019, Communiqué de Presse concernant la campagne PIOT.

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Best practices for making reliable inferences from citizen science data: case study using eBird to estimate species distributions

Citizen science data are valuable for addressing a wide range of ecological research questions, and there has been a rapid increase in the scope and volume of data available. However, data from large-scale citizen science projects typically present a number of challenges that can inhibit robust ecological inferences. These challenges include: species bias, spatial bias, variation in effort, and variation in observer skill. To demonstrate key challenges in analysing citizen science data, we use the example of estimating species distributions with data from eBird, a large semi-structured citizen science project.

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@ali__johnston l'un des auteurs donne également ce lien " Best Practices for Using eBird Data "Matthew Strimas-Mackey, Alison Johnston, Wesley M. Hochachka, Viviana Ruiz-Gutierrez, Orin J. Robinson, Eliot T. Miller, Tom Auer, Steve Kelling, Daniel Fink

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How to take a census of Earth’s biodiversity? One team of researchers has a plan 

How to take a census of Earth’s biodiversity? One team of researchers has a plan  | Biodiversité | Scoop.it
How do you monitor the number and location of Earth’s plants and animals at any given time? It’s a daunting, planet-sized problem, but an international team of researchers has published a proposal …
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L'étude : Essential biodiversity variables for mapping and monitoring species populations Nature Ecology & Evolution (2019https://www.nature.com/articles/s41559-019-0826-1

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Detecting spatiotemporal interactions between species from camera trapping data

A video by RSEC based on the paper 'Assessing analytical methods for detecting spatiotemporal interactions between species from camera trapping data' by Niedballa et al. 2019 Read the full paper here: https://zslpublications.onlinelibrary...

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A voir ! 4 minutes pour comprendre

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What underwater sounds tell us about marine life

What underwater sounds tell us about marine life | Biodiversité | Scoop.it
The water appeared opaque the deeper we travelled. An occasional peach-coloured butterscotch jellyfish would emerge from the depths, the bell breaking the surface to tread water, with its tentacles swirling below. In seconds, it would disappear from sight, as if pulling shut an undulating, bottle green curtain behind it. In comparison to the activity on …
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Identifying priority conservation areas for recovering large carnivores using citizen science data

Understanding the processes related to wildlife recoveries is not only essential in solving human - wildlife conflicts, but also for identifying priority conservation areas and in turn, for effective conservation planning. We used data from a large citizen science program to study the spatial processes related to the demographic and genetic recovery of brown bears in Greece and to identify new areas for their conservation. This was achieved by visually comparing our data with an estimation of the past distribution of brown bears in Greece and by using a Point Process Model to model habitat suitability, and then comparing our results with the current distribution of brown bear records and with that of protected areas.

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Auteurs : Anne-Sophie Bonnet-Lebrun, Alexandros Karamanlidis, Miguel de Gabriel Hernando, Ian Renner, Olivier Gimenez

bioRxiv 454603; doi: https://doi.org/10.1101/454603
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Bretagne: Mission accomplie! Les mystérieux requins désormais suivis à la trace par des scientifiques

Bretagne: Mission accomplie! Les mystérieux requins désormais suivis à la trace par des scientifiques | Biodiversité | Scoop.it
Une association étudiant le mystérieux requin pèlerin a posé quatre balises sur troi
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via  @BretagneActu 5 juil.

 

ils posent deux balises sur un même #requin pèlerin, une première mondiale https://actu.fr/?p=17621985  via @CoteBrest @AssoAPECS

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Les avancées en imagerie du vivant en Occitanie 2nd Edition !TRI-Genotoul

Les avancées en imagerie du vivant en Occitanie 2nd Edition !TRI-Genotoul | Biodiversité | Scoop.it
Suite au succès de la première édition en 2018, la plateforme Toulouse Réseau Imagerie renouvelle la demi-journée scientifique autour des avancées en imagerie
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via @CNRS_Toulouse

 

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Pete, une fougère du zoo de Londres, est la première plante à prendre un selfie au monde

Pete, une fougère du zoo de Londres, est la première plante à prendre un selfie au monde | Biodiversité | Scoop.it
Une fougère du zoo de Londres, dénommée Pete, est la première plante à prendre un selfie au monde. Les scientifiques de la Société zoologique de Londres ont fait part de leur expérience ce mercredi.
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Le clin d'oeil du jour ;) via @zsllondonzoo

Lire sur le site de la Société zoologique de Londres https://www.zsl.org/zsl-london-zoo/news/say-green-cheese

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Parc naturel de la mer de Corail : mieux connaitre pour mieux gérer

Parc naturel de la mer de Corail : mieux connaitre pour mieux gérer | Biodiversité | Scoop.it

L’acquisition et le renforcement des connaissances dans différentes disciplines doivent permettre de contribuer à la gestion des aires marines protégées, notamment pour l’élaboration et le suivi de mesures de gestion dans le parc naturel de la mer de Corail, en Nouvelle-Calédonie.

Campagne REMMOA (2014/2015) de Recensement des Mammifères Marins et autres mégafaunes pélagiques par Observation Aérienne (Observatoire PELAGIS / Université de la Rochelle / CNRS / AFB)

Campagnes Nectalis pour la caractérisation des écosystèmes pélagiques au sein du parc de la mer de Corail (2011 -2016) (CPS, cofinancé par : l’IRD / l’Australian Overseas Aid Program / le programme LEFE-CYBER / l’AFB / le Fonds Pacifique / le programme ZONECO de la Nouvelle-Calédonie)

Premiers résultats de la récente campagne d’étude des oiseaux marins aux Chesterfield (avril 2019). Étude des déplacements en mer et des stratégies d’alimentation des puffins fouquets. (IRD, soutenu par : la DAM / l’AFB / l’Ecole Doctorale du Pacifique / programme BIOPELAGOS (fonds de l’UE BEST 2.0, porté par la CPS))

Étude du déplacement des tortues marines au sein du PNMC (WWF, en partenariat avec les collectivités et d’autres acteurs impliqués dans la conservation des tortues tels que Bwara Tortues Marines et l’Aquarium des Lagons)

Programme WHERE: Explorer la distribution et les habitats des baleines à bosse pour aider à la gestion spatiale du PNMC (IRD, soutenu par : le gouvernement / le WWF / Opération Cétacés / le Ministère de la Transition Écologique et Solidaire)

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Cinq nouvelles études disponibles !

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Innovation & Biodiversité : L’application de reconnaissance des plantes Pl@ntNet lancée en Amérique centrale

Innovation & Biodiversité : L’application de reconnaissance des plantes Pl@ntNet lancée en Amérique centrale | Biodiversité | Scoop.it

L’application de reconnaissance des plantes Pl@ntNet a été officiellement lancée pour l’Amérique centrale, au Costa Rica, par la vice-Ministre des Sciences et Technologies, a fait savoir le Cirad sur son site. 3800 espèces de la flore méso-américaine sont désormais identifiables dans cette région du monde grâce à cette application mobile.

DocBiodiv's insight:

A savoir "Plus de 20 000 espèces de la flore mondiale identifiables sur Pl@ntNet " https://www.cirad.fr/actualites/toutes-les-actualites/communiques-de-presse/2019/plantnet-en-amerique-centrale

Voir : https://plantnet.org/apropos/

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Traque efficace ?

Traque efficace ? | Biodiversité | Scoop.it
La technologie qui consiste à suivre les mouvements des animaux en les équipant de balises satellite tend à se développer pour répondre à des questions de recherche sur la faune sauvage. Si les équ…
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via @ComAuCarre

MPG Hofman et al. (2019) Right on track ? Performance of satellite telemetry in terrestrial wildlife research. PLoS One. 2019 May 9;14(5):e0216223.

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DYNAFOR Info - Mai 2019

DYNAFOR Info - Mai 2019 | Biodiversité | Scoop.it
Dynafor collabore avec les agronomes de l’unité AGIR, les phytosociologues du Conservatoire botanique national des Pyrénées et de Midi-Pyrénées et les agriculteurs pour améliorer la gestion des prairies permanentes, notamment dans les Pyrénées. Crédit photo : Clélia Sirami
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"Dynafor est une unité mixte de recherche (UMR) interdisciplinaire dont l'objectif est de comprendre et de modéliser les relations entre des processus écologiques, des processus techniques et des processus socio-économiques dans la gestion de ressources naturelles renouvelables."

https://www.dynafor.fr/

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Rapport de thèse professionnel - Développement d’une méthode de suivi de la dynamique spatio-temporelle de l’herbier de la lagune du Grand Bagnas

Rapport de thèse professionnel - Développement d’une méthode de suivi de la dynamique spatio-temporelle de l’herbier de la lagune du Grand Bagnas | Biodiversité | Scoop.it
Exploitation des séries temporelles Sentinel-2 Le projet propose une approche concrète de suivi de la dynamique spatio-temporelle de l’herbier de la lagune du Grand Bagnas (Hérault) par télédétection multispectrale. La caractérisation des variations de l’herbier de la lagune, bioindicateur de la qualité du milieu, vise à améliorer les connaissances du site. La compréhension fine du …
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via @Polelagune

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D’importants changements vont bouleverser la biodiversité marine

D’importants changements vont bouleverser la biodiversité marine | Biodiversité | Scoop.it
Une équipe internationale de chercheurs est parvenue, grâce à un modèle numérique inédit, à prédire un an à l’avance les effets attendus du dérèglement climatique sur la biodiversité marine.

Les programmes d’observation de la biodiversité marine couvrent aujourd'hui une très faible superficie des océans et prennent le plus souvent place dans des régions proches des côtes. Difficile donc de déterminer l’évolution de cette biodiversité présente dans l'eau qui recouvre 70 % de la surface de notre planète. C’est pourtant ce qu’a réalisé une équipe internationale de chercheurs, menée par des scientifiques du CNRS.

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Retour sur l'étude  avec Grégory Beaugrand, directeur de recherche au Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences du CNRS 

Pour mémoire : publié le 01 juin 2015 dans Le Monde : "Le réchauffement climatique va bouleverser la biodiversité marine

Une équipe internationale conduite par le CNRS estime qu’au-delà d’un réchauffement de 2 °C, l’adaptation des espèces sera très difficile." https://www.lemonde.fr/biodiversite/article/2015/06/01/le-rechauffement-climatique-va-bouleverser-la-biodiversite-marine_4645108_1652692.html

Et récemment : Marine heatwaves threaten global biodiversity and the provision of ecosystem services

Nature Climate Change (2019) 

https://www.nature.com/articles/s41558-019-0412-1

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Agrodoc Ouest's curator insight, March 13, 12:56 PM

Retour sur l'étude  avec Grégory Beaugrand, directeur de recherche au Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences du CNRS 

Pour mémoire : publié le 01 juin 2015 dans Le Monde : "Le réchauffement climatique va bouleverser la biodiversité marine

Une équipe internationale conduite par le CNRS estime qu’au-delà d’un réchauffement de 2 °C, l’adaptation des espèces sera très difficile." https://www.lemonde.fr/biodiversite/article/2015/06/01/le-rechauffement-climatique-va-bouleverser-la-biodiversite-marine_4645108_1652692.html

Et récemment : Marine heatwaves threaten global biodiversity and the provision of ecosystem services

Nature Climate Change (2019) 

https://www.nature.com/articles/s41558-019-0412-1

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Connecting data and expertise: a new alliance for biodiversity knowledge

Connecting data and expertise: a new alliance for biodiversity knowledge | Biodiversité | Scoop.it

There has been major progress over the last two decades in digitising historical knowledge of biodiversity and in making biodiversity data freely and openly accessible. Interlocking efforts bring together international partnerships and networks, national, regional and institutional projects and investments and countless individual contributors, spanning diverse biological and environmental research domains, government agencies and non-governmental organisations, citizen science and commercial enterprise.

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A novel method for using ecoacoustics to monitor post‐translocation behaviour in an endangered passerine - Metcalf - Methods in Ecology and Evolution - Wiley Online Library

A novel method for using ecoacoustics to monitor post‐translocation behaviour in an endangered passerine - Metcalf - Methods in Ecology and Evolution - Wiley Online Library | Biodiversité | Scoop.it

 

Conservation translocations are an important tool in wildlife management, but monitoring of translocations has traditionally suffered from a lack of techniques for effective post‐release monitoring. Increasing understanding of post‐release movements is vital in improving the success of translocations, but few methods exist to efficiently monitor highly mobile and cryptic species post‐release.

We present a novel approach to using dynamic occupancy modelling in combination with data derived from autonomous acoustic recording units to monitor the post‐release behaviour of hihi (Notiomystis cincta), a threatened endemic bird, at a translocation site in New Zealand.

 

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Auteurs : Oliver C. Metcalf, John G. Ewen, Mhairi McCready, Emma M. Williams, J. Marcus Rowcliffe First published: 04 February 2019

Lire aussi : How do you assess if a reintroduced species is thriving? Listen for it by Sue Palminteri on 8 February 2019

https://news.mongabay.com/2019/02/how-do-you-assess-if-a-reintroduced-species-is-thriving-listen-for-it/

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Estimating densities of terrestrial wildlife using passive acoustic recordings: A pragmatic approach using paired human observations

The use of passive using acoustic monitoring is a rapidly growing field in terrestrial ecology, particularly in ornithology. Much recent work has focused on using recording technologies for large-scale occupancy monitoring, while local scale studies have focused on acoustic localization for density estimation. Density estimation offers numerous advantages for answering key conservation questions but may seem impractical to employ at national or continental scales using current acoustic localization techniques.

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The Journal of the Acoustical Society of America 144, 1849 (2018); https://doi.org/10.1121/1.5068142

Steven Van Wilgenburg

Environment and Climate Change Canada, Canadian Wildlife Service

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Maintenir la biodiversité pour stabiliser le fonctionnement des écosystèmes

Maintenir la biodiversité pour stabiliser le fonctionnement des écosystèmes | Biodiversité | Scoop.it

Pour la première fois à l'échelle mondiale, une équipe internationale impliquant un chercheur Inra du Centre d'études biologiques de Chizé (CNRS/Université de La Rochelle) et des scientifiques argentins et espagnols, montre les effets positifs de la biodiversité végétale sur la stabilité et le fonctionnement des écosystèmes terrestres. Grâce à l'analyse de données satellitaires et des observations sur 123 sites dans le monde, les chercheurs révèlent que l'influence de la biodiversité sur les écosystèmes est tout aussi importante que celle du climat ou du sol. Leurs résultats sont publiés dans la revue [i]PNAS.[/i]

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Centre d'études biologiques de Chizé http://www.cebc.cnrs.fr/

Communiqué INRA http://presse.inra.fr/Communiques-de-presse/biodiversite-stabiliser-le-fonctionnement-des-ecosystemes

Climate mediates the biodiversity-ecosystem stability relationship globally. Pablo García-Palacios, Nicolas Gross, Juan Gaitán et Fernando T. Maestre. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 30 juillet 2018. https://doi.org/10.1073/pnas.1800425115

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