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Une nouvelle vision du mécanisme d’ouverture du canal ionique du récepteur NMDA

Une nouvelle vision du mécanisme d’ouverture du canal ionique du récepteur NMDA | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les récepteurs NMDA (NMDAR) jouent un rôle primordial dans le système nerveux central, contribuant à la plasticité synaptique, la base fondamentale des processus d’apprentissage et de mémorisation. L’activation du NMDAR par ses ligands, glutamate (E) et glycine (G), déclenche l'ouverture d'un canal ionique perméable aux cations (sodium, potassium, et calcium). La sur-activation du récepteur NMDA, en provoquant un afflux excessif d’ions Ca2+, peut générer une forme d’excitotoxicité impliquée dans certaines maladies neurodégénératives. À l’inverse, un hypofonctionnement des récepteurs NMDA peut altérer la plasticité synaptique.

 

Ces récepteurs sont par ailleurs présents dans des systèmes périphériques non neuronaux et impliqués dans de nombreux autres processus pathologiques, comme le cancer, le diabète ou en encore l’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP), une maladie mortelle pour laquelle il n’existe pas de traitement curatif, et qui a fait l’objet de l’ANR NUTS 2014-2018, coordonnée par Sylvia Cohen-Kaminsky (INSERM/UPSud UMR-S 999, LabEx LERMIT, DHU TORINO). Outre valider le NMDAR comme nouvelle cible thérapeutique dans l’HTAP (Article dans Circulation 2018), et développer de nouveaux composés antagonistes des NMDAR périphériques qui ne passent pas la barrière hémato-encéphalique (BHE), le projet NUTS avait également comme ambition de générer un modèle moléculaire dynamique tout atome du NMDAR, qui puisse être à terme utilisé pour la découverte de nouveaux antagonistes.

 

La complexité de la structure des récepteurs NMDA (un tétramère composé de 4 sous-unités moléculaires de 800-900 résidus chacune), et les difficultés de leur étude expérimentale, font de ces récepteurs membranaires un paradigme pour la modélisation. Dans le cadre du projet NUTS, l’équipe de Luba Tchertanov (CMLA - ENS Paris-Saclay) a relevé ce défi, et a modélisé la structure du NMDAR humain (hNMDAR) et étudié ses propriétés dynamiques et énergétiques, par la simulation de la dynamique moléculaire de deux modèles : hNMDAR-L et hNMDAR, liés et non liés avec ses ligands glycine et glutamate (L= E et G). 

 

Dans un article qui vient de paraitre dans PLoS One, à partir de ces données de simulation, l’équipe a mis en évidence les effets induits par la fixation des ligands sur la plasticité conformationnelle du récepteur, qui se traduisent par une réduction globale de la flexibilité moléculaire et une plus grande régularité et coopérativité dans le déplacement atomique. L’étude montre que la synchronisation du mouvement induite par les ligands à tous les niveaux structurels du hNMDAR modulaire, est apparemment un facteur fondamental, requis pour l’ouverture du canal.

 

Pour la première fois, un modèle dynamique du mécanisme d’ouverture du canal du récepteur NMDAR humain est proposé, avec une nouvelle vision de l’ouverture du canal ionique par la fixation de ses ligands. Lors de la liaison des ligands, les différentes conformations torsadées du récepteur hautement flexible sont stabilisées dans une conformation unique avec un axe moléculaire linéaire, ce qui est optimal pour le développement du canal. Par ailleurs, en examinant la surface du récepteur, l’équipe a identifié trois nouvelles poches, jusqu’ici non décrites dans la littérature comme sites de liaison potentiels de modulateurs allostériques positifs connus, validant ainsi ce modèle.

 

La prochaine étape sera de tester la possibilité d’utiliser ce modèle pour le criblage in silico des nouveaux antagonistes des NMDARs ne passant pas la BHE, mis au point et produits en collaboration avec Mouad Alami (BioCIS, CNRS UMR 8076, Faculté de Pharmacie Paris-Sud) et Alain Pruvost (CEA, LEMM), dans le cadre du LabEx LERMIT et de la SATT Paris Saclay (projet NUTS-MAT), pour le traitement de maladies périphériques impliquant le NMDAR, comme l’Hypertension Artérielle Pulmonaire.

 

Le développement de ce projet à l’interface - Biologie-Santé / Chimie Médicinale / Mathématiques appliquées - est un bel exemple de collaboration pluridisciplinaire au sein de l’Université Paris-Saclay.

 

Contact : luba.tchertanov@ens-cachan.fr ou sylvia.cohen-kaminsky@u-psud.fr

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L'infection par le rotavirus altère l'épissage d'ARN messagers cellulaires codant pour le facteur de transcription XBP-1

L'infection par le rotavirus altère l'épissage d'ARN messagers cellulaires codant pour le facteur de transcription XBP-1 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le rotavirus est la cause majeure de gastroentérites chez les jeunes mammifères, son incidence est particulièrement importante chez les enfants de moins de 5 ans et dans les pays en voie de développement où il est la cause de plus de 250.000 décès chaque année.

 

Dans un article qui vient de paraitre dans le Journal of Virology, l'équipe de Didier Poncet (département de Virologie et interactions hôte-pathogènes à l’I2BC, Gif-sur-Yvette) a montré que l'infection par le rotavirus altère l'épissage d'ARN messagers cellulaires en particulier celui codant pour le facteur de transcription XBP-1. XBP-1 est activé par le stress du réticulum ou par l'immunité innée et permet la transcription de gènes comme ceux de chaperonnes du réticulum. L'infection par certaines souches de rotavirus induit un saut d'exon dans l'ARN codant XBP-1 qui permet la synthèse d'un facteur XBP-1 actif. La capacité d'induire ce saut d'exon est génétiquement liée à la protéine de rotavirus NSP3. L’équipe avait montré précédemment que NSP3 est un substitut viral de la Poly(A) binding protein cytoplasmique (PABPC) qui permettait la traduction efficace des ARNm viraux non poly-adénylés. L'interaction de NSP3 avec le facteur d'initiation de la traduction eIF4G induit la relocalisation de la PABPC du cytoplasme vers le noyau. Dans ce travail les chercheurs montrent que la capacité d'induire le saut d'exon dans XBP-1 est corrélée à l'efficacité de relocalisation de la PABPC et, en utilisant des rotavirus recombinants, à la partie de NSP3 se liant à l'eIF4G.

 

Ce travail montre comment un virus à réplication entièrement cytoplasmique perturbe aussi le fonctionnement du noyau et révèle une possibilité nouvelle d'activer par épissage alternatif un gène essentiel à la réponse au stress.

 

Contact : didier.poncet@i2bc.paris-saclay.fr

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INRA - La maladie d’Alzheimer, une maladie contagieuse ?

INRA - La maladie d’Alzheimer, une maladie contagieuse ? | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Parmi la cinquantaine de démences résultant de maladies neurodégénératives actuellement recensées, la maladie d’Alzheimer est la plus largement répandue. Des travaux récents suggèrent que cette maladie pourrait, dans certaines conditions, se transmettre entre individus. Son mécanisme rappelle en effet celui des maladies à prions comme la maladie de Creutzfeldt-Jakob, dont des dizaines de cas sont survenus suite à la crise de la vache folle. Angélique Égalon, chercheuse au sein de la task-force « Prion » de l’Inra, apporte son éclairage dans un article rédigé pour The Conversation.

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Antibiotic sensitivity reveals that wall teichoic acids mediate DNA binding during competence in Bacillus subtilis

Antibiotic sensitivity reveals that wall teichoic acids mediate DNA binding during competence in Bacillus subtilis | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Despite decades of investigation of genetic transformation in the model Gram-positive bacterium Bacillus subtilis, the factors responsible for exogenous DNA binding at the surface of competent cells remain to be identified. In a recent publication in Nature Communications, Mirouze et al. report that wall teichoic acids (WTAs), cell wall-anchored anionic glycopolymers associated to numerous critical functions in Gram-positive bacteria, are involved in this initial step of transformation. Using a combination of cell wall-targeting antibiotics and fluorescence microscopy, they particularly show that competence-specific WTAs are produced and specifically localized in the competent cells to mediate DNA binding at the proximity of the transformation apparatus. Furthermore, they propose that TuaH, a putative glycosyl transferase induced during competence, modifies competence-induced WTAs in order to promote (directly or indirectly) DNA binding. On the basis of their results and previous knowledge in the field, they propose a model for DNA binding and transport during genetic transformation in B. subtilis.

 

Contact : nicolas.mirouze@i2bc.paris-saclay.fr

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New Innate Lymphoïd Cell (ILC) population in severe allergic asthma

New Innate Lymphoïd Cell (ILC) population in severe allergic asthma | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

ILCs are a new family of immune cells with some similarities with Thelper cells. A collaboration study recently published in Allergy in asthma patients has been developed between INSERM/UPSud UMR-S 996 (Sylvie Chollet-Martin, Faculté de Pharmacie UPSud, Châtenay-Malabry), a member of the LabEx LERMIT, Bichat hospital Pneumology Department (Michel Aubier, Paris) and Stallergenes Greer Research Department (Vincent Lombardi, Antony). The authors previously showed that patients with severe allergic asthma have high numbers of circulating ILC2s expressing the CCR10 chemokine receptor. Herein, when compared to healthy controls, CCR10+ ILC2s are enriched in the blood of both allergic and non‐allergic severe asthmatic patients, and these cells are recruited to the lungs. Plasma concentrations of the CCR10 ligand CCL27 are significantly increased in severe asthmatics when compared to non‐asthmatic patients. CCR10+ ILC2s secrete little TH2 cytokines, but exhibit ILC1‐like properties, including a capacity to produce IFN‐γ. Also, single‐cell analysis reveals that the CCR10+ ILC2 subset is enriched in cells expressing amphiregulin (EGF family). CCR10+ ILC2 depletion, as well as blocking of IFN‐γ activity, exacerbates airway hyperreactivity in allergen‐challenged mice, providing evidence for a protective role of these cells in allergic inflammation. 5

 

In conclusion, this new study shows that the frequencies of circulating CCR10+ ILC2s and CCL27 plasma concentrations represent candidate markers of asthma severity. The characterization of CCR10+ ILC2s with ILC1-like properties in human samples and in mouse asthma models suggests that these cells downregulate allergic inflammation through IFN‐γ production.

 

Contact : sylvie.chollet-martin@u-psud.fr ou vincent_lombardi@hotmail.com

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Doit-on considérer la pirfénidone dans le traitement de l’hypertension artérielle pulmonaire ?

Doit-on considérer la pirfénidone dans le traitement de l’hypertension artérielle pulmonaire ? | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) regroupe un ensemble de désordres cardio-pulmonaires caractérisé par un remodelage obstructif des artères pulmonaires distales de petit calibre, aboutissant à l’augmentation progressive et anormale de la résistance vasculaire pulmonaire (RVP) puis à une défaillance ventriculaire droite. Parmi les acteurs au centre du développement et de la progression de l’HTAP, les perturbations des fonctions de l’endothélium pulmonaire et des processus inflammatoires jouent des rôles critiques, tout comme le remodelage dynamique et inadapté de la matrice extracellulaire (MEC) qui crée un microenvironnement tissulaire favorable promouvant la prolifération, la survie et la migration des cellules musculaires lisses (CML-AP), fibroblastes et cellules endothéliales environnantes.

 

La pirfénidone (PFD ou 5-méthyl-1-phényl-2-(1H)-pyridone) est une molécule approuvée pour le traitement de la fibrose pulmonaire idiopathique et possédant des propriétés anti-inflammatoires, anti-oxydantes et anti-fibrotiques. Cependant, son efficacité dans les modèles précliniques d’étude de l’HTAP n’avait jamais été testée. Dans un travail récemment publié dans le FASEB journal, l’équipe du Dr Christophe Guignabert (INSERM/UPsud UMR_S 999, Le Plessis-Robinson) a donc testé l’efficacité d’un traitement à la PFD (30 mg/kg per os 3 fois par jour (t.i.d.) pendant 3 semaines) contre la progression de l’hypertension pulmonaire expérimentale chez le rat à l’aide du modèle bien établi et reconnu appelé « Sugen/hypoxie chronique » (SuHx) (Figure panel A). Ils ont ainsi pu mettre en évidence un effet bénéfique de ce traitement chronique à la PFD contre la progression de l’hypertension pulmonaire établi chez les rats SuHx, réduisant la résistance vasculaire pulmonaire totale et le remodelage vasculaire pulmonaire (Figure panel B). Conformément à ces observations, ils ont également pu démontrer que la PFD, à forte dose, pouvait non seulement atténuer les pouvoirs migratoires et prolifératifs de CML-AP isolées de patients HTAPi, mais aussi réduire leur production de composés matriciels. Bien que le mécanisme d'action de la PFD ne soit pas très bien connu, ce travail a pu souligner que le PFD augmentait de manière dose-dépendante les niveaux protéiques du facteur de transcription FoxO1, un acteur clé du remodelage vasculaire pulmonaire associé à l’HTAP. Ce travail devrait encourager l’évaluation clinique de l’efficacité de la PFD en addition des thérapies actuelles.

 

Contact : guignabert@gmail.com

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Séquençage et annotation des génomes de Leptosphaeria maculans et Leptosphaeria biglobosa, agents pathogènes du colza

Séquençage et annotation des génomes de Leptosphaeria maculans et Leptosphaeria biglobosa, agents pathogènes du colza | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Qu’ils soient saprophytes, symbiontes ou pathogènes, les champignons ont un rôle économique et environnemental majeur. Ainsi les champignons phytopathogènes peuvent être dévastateurs pour les plantes cultivées ou avoir des incidences sur la santé via la production de mycotoxines.

 

Les premiers génomes de champignons filamenteux, obtenus au début des années 2000, souffraient d’assemblages génomiques fragmentaires et d’annotations géniques imprécises, tant en ce qui concerne la structure que la fonction des gènes. En particulier les gènes impliqués dans les interactions avec l’hôte (codant pour des protéines appelées « effecteurs ») étaient mal annotés voire omis. La compréhension des interactions plante-champignon bénéficie désormais d’outils de génomique et transcriptomique puissants, mais nécessite l’obtention préalable de génomes de référence et d’annotations géniques fiables.

 

Le Genoscope et l’équipe EPLM de Bioger publient dans Scientific Data une version de référence du génome de Leptosphaeria maculans, agent pathogène du colza, et d’une espèce associée, Leptosphaeria biglobosa. Cette nouvelle version intègre des données de séquence « long-read » (Nanopore), des séquences Illumina, une carte optique et une cartographie génétique haute densité, générant un assemblage du génome à l’échelle chromosomique. Un programme de « grand séquençage » France Génomique a permis en parallèle la génération d’un grand jeu de données RNAseq, dont une partie a été utilisée pour annoter les gènes, améliorant ainsi la prédiction des effecteurs fongiques.

Ces données ouvrent la voie à l’analyse fonctionnelle des interactions tripartites colza-L. maculans-L. biglobosa.

 

Contact : marie-helene.balesdent@inra.fr ou Jmaury@Genoscope.Cns.Fr ou thierry.rouxel@inra.fr

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À la rencontre des petites bêtes des toitures végétalisées

À la rencontre des petites bêtes des toitures végétalisées | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Sophie Joimel, Claire Chenu et Baptiste Grard, chercheurs au sein du laboratoire Écologie fonctionnelle et écotoxicologie des sols d’agrosystèmes (AgroParisTech/Inra), dévoilent leurs recherches sur la biodiversité des sols toitures végétalisées.

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Nos intestins résistent aux antibiotiques

Nos intestins résistent aux antibiotiques | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Un article publié dans la revue Nature Microbiology, dont les premiers auteurs sont des chercheurs de l’Université Paris-Saclay, présente un travail original d’identification de plus de 6000 gènes de résistance aux antibiotiques dans les bactéries de notre microbiote intestinal.

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La mécanique des fleurs | Université Paris Saclay

La mécanique des fleurs | Université Paris Saclay | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Melon, concombre, tomate ou pois… Abdelhafid Bendahmane, directeur de recherche au sein de l’Institut des sciences des plantes de Paris-Saclay (IPS2-CNRS/Inra/Université Evry Val-d'Essonne/Université Paris-Diderot/Université Paris-Sud) du Centre Inra Ile-de-France – Versailles-Grignon, a trouvé là ses objets de recherche. Entre déterminisme du sexe et sélection variétale, il y avait un pas qu’il a franchi avec audace et stratégie combinant avec succès génomique et post-génomique. Il reçoit le Laurier Inra 2018 « Défi scientifique ».

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Conférence sur les « Enjeux de la Révision de la Loi de Bioéthique en Génétique et en Reproduction »,  Pr Jean-François Delfraissy, Mercredi 16 janvier 17h30-19h Faculté de Médecine Paris Sud amphi A

Pr Jean-François Delfraissy
Président du Comité Consultatif National d’Ethique
« Enjeux de la Révision de la Loi de Bioéthique en Génétique et en Reproduction »
  
Mercredi 16 janvier 17h30-19h
Faculté de Médecine Paris Sud
amphi A
 
 
Renseignements : Pr Micheline Misrahi
 
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Visite privée de l'exposition "Une vie dans l'Univers"

Visite privée de l'exposition "Une vie dans l'Univers" | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Les 18 et 19 décembre, le CNRS en Ile-de-France Sud vous invite à une visite privée de l'exposition "Une vie dans l’Univers" réalisée par l’association S[cube], dont le CNRS est membre fondateur.
 

A cette occasion, vous pourrez visiter des exoplanètes en réalité virtuelle, explorer le système solaire et découvrir la vie dans l’Univers !

 

Horaires : 18 et 19 décembre, de 11h30 à 14h30 - accès libre
Lieu : Château de Button, campus du CNRS de Gif-sur-Yvette

  

Contact : communication@dr4.cnrs.fr

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Ambassade de France en Russie : appel PTRus

Ambassade de France en Russie : appel PTRus | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’Ambassade de France en Russie lance un programme de missions exploratoires Partenariats technologiques Russie (PTRus) visant à créer des partenariats technologiques entre la France et la Russie.

 

Date limite de candidature : 31 janvier 2019

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Appel à projets de coopération scientifique France/Finlande

Appel à projets de coopération scientifique France/Finlande | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it
Ouverture du programme Maupertuis : financement bilatéral de la coopération scientifique entre la France et la Finlande - Date limite de proposition : 25 janvier 2019
* Série de conférences de scientifiques français
* Programme de mobilité courte de chercheurs
* Ateliers "enseignement supérieur, recherche et innovation"
* Bourse de doctorat en cotutelle
 
Date limite : 25 janvier 2019
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Damer le prion : La task force « Prion » est distinguée par le Laurier d’impact de la recherche agronomique 2018

Damer le prion : La task force « Prion » est distinguée par le Laurier d’impact de la recherche agronomique 2018 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Damer le prion
La task force « Prion » est distinguée par le Laurier d’impact de la recherche agronomique 2018. Les recherches qu’elle mène depuis vingt ans ont contribué à sécuriser l’alimentation et la santé humaine vis-à-vis des encéphalopathies spongiformes transmissibles (EST) dont la « vache folle » est emblématique. Ces travaux ont aussi permis de préserver les élevages de ces maladies et de sauver les filières économiques.

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Prédiction des gènes de résistance aux antibiotiques du microbiote intestinal par une méthode de prédiction basée sur la structure tri-dimensionnelle

Prédiction des gènes de résistance aux antibiotiques du microbiote intestinal par une méthode de prédiction basée sur la structure tri-dimensionnelle | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Afin d’établir le recensement des gènes de résistance aux antibiotiques dans le microbiote intestinal, il n’était pas possible de se baser seulement sur la similarité de séquence de l’ADN. En effet, l’ADN des bactéries intestinales est bien différent de celui des bactéries connues, ce qui n’est pas sans poser des difficultés aux outils de prédiction des fonctions des gènes basés sur la similarité avec les séquences d’ADN connues (représentées par des lettres). Ainsi, des équipes des hôpitaux Beaujon et Bichat Claude-Bernard AP-HP, de l’Inra (MetaGenoPolis), de l’Institut Pasteur, de l’Inserm, des universités Paris Diderot et Paris-Saclay ont développé une nouvelle méthode bioinformatique de prédiction de fonction des gènes basée sur la structure tridimensionnelle des protéines qu’ils codent. Publiée dans la revue Nature Microbiology, cette méthode de prédiction originale a permis de prédire plus de 6000 gènes de résistance aux antibiotiques, avec une moyenne de plus de 1000 par individu. De plus, la composition en gènes de résistance était très liée à la composition en espèces bactériennes, et les chercheurs ont ainsi pu identifier six groupes d’individus en fonction de leurs gènes de résistance. Cependant, la majorité de ces gènes n’ont jamais été retrouvés ni sur des éléments génétiques mobiles, ni dans des bactéries pathogènes, soutenant que leur transfert vers ces dernières est un évènement rare. Ces résultats ouvrent de nouvelles perspectives quant au rôle des gènes de résistance du microbiote intestinal qui semblent, dans leur majorité, peu à risque d’être transférés vers des bactéries pathogènes, et qui pourraient être bénéfiques en protégeant leurs hôtes de l’impact des antibiotiques dans le microbiote intestinal puisque des bactéries non pathogènes seraient ainsi protégées.

 

Légende de la figure : structures tri-dimensionnelle des protéines codées par les gènes de résistance des 20 familles analysées dans l’article.

 

Contact : etienne.ruppe@gmail.com

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Heterogeneity and its multiscale integration in plant morphogenesis

Heterogeneity and its multiscale integration in plant morphogenesis | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Members from the Transcription Factor and Architecture and the Modeling and Digital Imaging teams in IJPB, INRA Versailles have recently published a review in Current Opinion in Plant Biology

on the various roles of heterogeneity in plant morphogenesis.

 

Heterogeneity is an inherent feature of all living organisms. It is observed at all organization levels and contributes to the function of higher-level structures: diverse molecules interact to form specialized sub-cellular structures that together build cells which, in multicellular organisms, can acquire different identities and form complex organs. Recently, another type of heterogeneity within specific structures, which could at first sight appear homogeneous, has gained attention. For instance, at the organ level, seemingly identical lateral root primordia can be formed by heterogeneous contributions of founder cells; at the tissue level, Arabidopsis leaf epidermal pavement cells are heterogeneous in their size and shape; and at the cellular level cortical microtubules (CMT) and cellulose synthase trajectories vary between the different sides of epidermal cells of etiolated hypocotyls.

In this review, authors discuss some recent insights gained from reports of heterogeneity at different scales and its integration between different functional levels within a plant.

 

Contact: leo.serra@inra.fr ou patrick.laufs@inra.fr

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Tests rapides pour la détection de l’antibiorésistance

Tests rapides pour la détection de l’antibiorésistance | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

La découverte des antibiotiques a révolutionné la Médecine en rendant possible le traitement des infections bactériennes. Les β-lactamines, de par leurs propriétés bactéricides, de leur bonne tolérance, et de leur efficacité clinique, sont parmi les antibiotiques les plus prescrits pour traiter des infections bactériennes. Cependant, leur utilisation est menacée par la dissémination mondiale des β-lactamases (BLs) capables de les hydrolyser et ainsi de les inactiver, tout particulièrement chez les entérobactéries. Ainsi des ß-lactamases à spectre élargi (BLSE) de type CTXM (plus de 98% des BLSEs circulant en France) sont responsables de la résistance aux céphalosporines de troisième génération fréquemment utilisées pour traiter des infections. La résistance n’épargne pas les dernières générations de β-lactamines au spectre d’activité le plus large, les carbapénèmes, qui sont hydrolysés par les carbapénèmases. La dissémination d’Entérobactéries productrices de carbapénèmases (EPC) est extrêmement inquiétante étant donné que ces bactéries sont une des premières causes d’infections nosocomiales (et communautaires pour E. coli).

 

La lutte contre la dissémination de ces bactéries en milieu hospitalier nécessite une identification rapide des patients porteurs afin de mettre en place des mesures d’hygiènes renforcées et de limiter la dissémination à d’autres patients hospitalisés, mais aussi pour pouvoir initier un traitement approprié, si besoin.

 

Le Laboratoire d’Etudes et de Recherches en Immunoanalyse du CEA (DRF/JOLIOT/SPI) en collaboration avec l’équipe de recherche EA7361 dédiée à l’étude des mécanismes de résistance émergents aux antibiotiques (Université de Paris-Sud/AP-HP/CNR associé Entérobactéries résistantes aux carbapénèmes), ont développé et validé le premier test rapide (type test de grossesse) permettant la détection simultanée des 5 principales carbapénémases en moins de 15 minutes. La future commercialisation de ce test par la société NG Biotech (Guipry) en parallèle d’un test de détection rapide de CTX-M est une avancée majeure pour tous les laboratoires de microbiologie de France, d’Europe mais aussi pour les pays à faibles ressources. En effet contrairement aux tests existants ces tests combinent plusieurs avantages : faible coût (quelques euros), grande simplicité, excellentes performances biologiques (rapidité, spécificité et sensibilité) et grand nombre de cibles testées (multiparamétrique).

 

Contact : herve.volland@cea.fr ou thierry.naas@aphp.fr

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Deux biomarqueurs valent mieux qu’un !

Deux biomarqueurs valent mieux qu’un ! | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le cytosquelette de microtubules joue un rôle majeur dans la division cellulaire. Les protéines régulatrices des microtubules sont fréquemment altérées dans le cancer et constituent des biomarqueurs pronostics de la survie des patients. L’identification de biomarqueurs pronostics et prédictifs est essentielle pour le développement d’une médecine personnalisée. Dans ce contexte, une équipe de l’unité INSERM/UPsud UMR-S 981 (Gustave Roussy, Villejuif, membre du LabEx LERMIT), en collaboration avec l’Institut Curie (Paris), vient de publier un article dans Breast Cancer Research and Treatment sur la valeur pronostique de la combinaison de biomarqueurs dans le cancer du sein. L’équipe a montré pour la première fois que l’expression combinée des biomarqueurs ATIP3 et EB1, deux protéines associées aux microtubules, permet d’affiner à la fois le diagnostic et le pronostic des patientes atteintes de cancer du sein. Cette combinaison permet en outre d’identifier une nouvelle sous-population de tumeurs particulièrement agressives et ouvre la voie au développement de nouvelles stratégies thérapeutiques.

 

Contact : clara.nahmias@inserm.fr

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A male-expressed rice embryogenic trigger redirected for asexual propagation through seeds (Sundaresan's lab and coll R. Mercier IJPB, SPS)

A male-expressed rice embryogenic trigger redirected for asexual propagation through seeds (Sundaresan's lab and coll R. Mercier IJPB, SPS) | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Misexpression of the sperm-cell-expressed transcription factor BABY BOOM1 in the rice egg cell induces embryo development without fertilization, establishing the feasibility of asexual reproduction in crops and potentially enabling the clonal propagation of hybrids through seeds. Great work of 

Venkatesan Sundaresan's lab and coll R. Mercier (IJPB, SPS)


Via Loïc Lepiniec, Saclay Plant Sciences
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Agriculture urbaine en France, le jeu des sept familles

Agriculture urbaine en France, le jeu des sept familles | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Agnès Lelièvre, maître de conférences en agronomie à AgroParisTech, Baptiste Grard, chercheur postdoctoral au laboratoire Écologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (AgroParisTech/INRA), Christine Aubry, responsable de l’équipe de recherche Agricultures urbaines à AgroParisTech, et Véronique Saint-Ges, économiste à l’INRA, présentent les différentes formes que peut prendre l’agriculture urbaine.

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Philippe Ciais : Absorption du carbone et changement climatique | Université Paris Saclay

Philippe Ciais : Absorption du carbone et changement climatique | Université Paris Saclay | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

En décernant le prestigieux prix Dolomieu à Philippe Ciais, l’Académie des sciences souligne l’importance de la compréhension des cycles biogéochimiques des gaz à effet de serre. Une double reconnaissance pour ce chercheur du Laboratoire des sciences du climat et de l’environnement (LSCE – CEA/CNRS/Université Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines) : celle de sa discipline, qui a émergé dans les années 90, et celle de ses nombreux travaux de recherche concernant l’impact du carbone sur les écosystèmes de notre planète.

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Le Génopole fête 20 ans d'innovation dans la génomique

Le Génopole fête 20 ans d'innovation dans la génomique | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Le Génopole, pour lequel tout est parti de l’Association française contre les myopathies (AFM), fête ses vingt ans cette année. Vingt ans après son ouverture en 1998 avec pour objectif d’accélérer la découverte de médicaments innovants contre les maladies rares, le premier « biocluster » français piloté par Pierre Tambourin jusqu’en 2017, continue d’innover, souligne Lequotidiendumedecin.fr. Le Génopole, qui vise l’aménagement de 15 000 m² supplémentaires d’ici à 2021, a annoncé vouloir développer 4 filières de biotechnologies en santé et en environnement : la médecine personnalisée, les thérapies génique et cellulaire, les biotechnologies industrielles pour favoriser la transition écologique, la génomique numérique. Au cœur du biocluster, le GIP (Groupement d’intérêt public) soutient la recherche génomique des 17 laboratoires académiques. L’unité Inserm InteGrare, créée et dirigée à Généthon par Anne Galy, est dédiée à la correction génique de maladies rares du système immunitaire, du métabolisme ou du muscle squelettique. Des essais cliniques sont en cours, notamment dans la maladie de Wiskott-Aldrich.

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Initiation à la cytométrie en flux - 1er Février 2019

Initiation à la cytométrie en flux - 1er Février 2019 | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

Cette année encore la plateforme PLAIMMO de l'IPSIT propose une formation d'initiation à la cytométrie dans les locaux de l'INSERM à Clamart.

 

Contact : marie-laure.aknin@u-psud.fr

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Appel à participation aux Lab’Oratoires, cycle de 80 rencontres chercheurs-lycéens

Appel à participation aux Lab’Oratoires, cycle de 80 rencontres chercheurs-lycéens | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

A l'occasion de la célébration des 80 ans du CNRS, la Délégation Ile-de-France Gif-sur-Yvette organise, en partenariat avec l'Académie de Versailles, les Lab'Oratoires, cycle de 80 rencontres chercheurs-lycéens qui s'échelonneront sur toute l'année 2019.
 

Cette opération de médiation scientifique menée en Essonne et dans les Yvelines a pour objectif de faire découvrir aux lycéens les recherches et les métiers issus des laboratoires de la circonscription et de leur expliquer, de débattre, de partager avec eux les passions, les belles histoires, les énergies et les projets qui animent notre communauté scientifique depuis 80 ans.


Que ce soit sous la forme d'un dialogue initié à partir d'un objet scientifique pour susciter intérêt et échanges, ou d'un « vrai ou faux » pour amorcer un débat d'idées de manière ludique, chaque conférence pourra bénéficier d'un format adaptable au vu du domaine de recherche et du thème abordés.


Déjà près de 40 membres de notre communauté scientifique ont accepté de participer aux Lab'Oratoires, pourquoi pas vous ?


Une formation en médiation scientifique orale pourra vous être proposée afin de renforcer l'implication des lycéens et/ou de vous permettre d'expliquer un sujet complexe de façon attractive, explicite et accessible à des lycéens. 

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Programmes de mobilité avec l'Australie

Programmes de mobilité avec l'Australie | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it

L’ambassade de France en Australie relance cette année encore ses deux programmes de soutien à la mobilité courte « Stages en France » et « Creative France Australia short program ». Par rapport à l’année dernière, les dates de clôture des candidatures ont été avancées d’un mois, au 31 janvier 2019.

 

1)      Initiative Stages en France (Programme Nicolas Baudin)

 Ce programme consiste à envoyer des étudiants australiens pour des stages de recherche « hybrides » dans un établissement français, sur des sujets élaborés conjointement par un laboratoire académique avec un partenaire industriel.

 

Les séjours en France sont cofinancés par l’ambassade de France en Australie, les établissements d’accueil en France et les établissements d’origine en Australie, selon le schéma suivant. 

  • L’ambassade finance le voyage aller/retour de l’Australie vers la France et la couverture sociale pendant la durée du stage (jusqu’à 6 mois).
  • L’université d’accueil du stagiaire en France lui accorde une gratification obligatoire de stage (554 € / mois minimum)
  • L’université d’origine en Australie accorde au lauréat une bourse complémentaire ($2500).

Universités australiennes participantes : institutions membres du Group of EightAustralian Technology Network of UniversitiesInnovative Research UniversitiesMacquarie University and Deakin University.

 

Les chercheurs sont vivement encouragés à établir le sujet du stage en collaboration étroite avec leur partenaire académique australien et leur partenaire industriel français.

 

Plus d’infos : https://au.ambafrance.org/Initiative-stages-en-France.

Envoi des propositions de sujets de stage via le formulaire en ligne suivant :

Date limite : 31 janvier 2019.

 

2)      « Creative France Australia short program »

Ce programme consiste à cofinancer la mise en place d’écoles thématiques (écoles d’été/d’hiver) co-organisées par des établissements d’enseignement supérieur français et australiens et réunissant des étudiants des deux pays autour d’une thématique d’intérêt commun.
Le(s) projet(s) retenu(s) bénéficie(nt) du label « Creative France Australia » ainsi que d’un soutien financier de l’ambassade pouvant atteindre 4000 €.

Plus d’infos : https://au.ambafrance.org/Creative-France-Australia-short-program-summer-school-7480.
Envoi des candidatures : envoyer le dossier de candidature téléchargeable en ligne (voir lien ci-dessous) à education.canberra-amba@diplomatie.gouv.fr.  
Date limite : 31 janvier 2019

 

Contact : amandine.duraz@universite-paris-saclay.fr

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